CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 42466 621092 6.40 663558 2 91976 707116 11.51 799092 3 84800 510279 14.25 595079 4 76869 676041 10.21 752910 5 84305 640222 11.64 724527 6 91876 733625 11.13 825501 7 87043 636308 12.03 723351 8 81782 615057 11.74 696839 9 78347 607192 11.43 685539 10 77153 590362 11.56 667515 11 75563 604547 11.11 680110 12 74233 579464 11.36 653697 13 73539 582219 11.21 655758 14 74764 591772 11.22 666536 15 75227 598995 11.16 674222 16 75111 603405 11.07 678516 17 75875 608359 11.09 684234 18 77424 616211 11.16 693635 19 77235 611676 11.21 688911 20 77157 614601 11.15 691758 21 77483 613965 11.21 691448 22 76323 613412 11.07 689735 23 76676 614464 11.09 691140 24 78310 618129 11.24 696439 25 76932 614512 11.13 691444 26 76645 610789 11.15 687434 27 76813 615541 11.09 692354 28 76926 614819 11.12 691745 29 77067 616232 11.12 693299 30 76768 617717 11.05 694485 31 76173 616322 11.00 692495 32 76387 614597 11.05 690984 33 76879 615754 11.10 692633 34 75623 613106 10.98 688729 35 76647 616014 11.07 692661 36 76992 617982 11.08 694974 37 75702 614465 10.97 690167 38 76287 616056 11.02 692343 39 76620 619290 11.01 695910 40 76635 616000 11.06 692635 41 76414 615671 11.04 692085 42 76774 620609 11.01 697383 43 76273 616522 11.01 692795 44 77028 617402 11.09 694430 45 76568 615537 11.06 692105 46 75467 613727 10.95 689194 47 76056 614690 11.01 690746 48 76909 619354 11.05 696263 49 75860 615943 10.97 691803 50 76478 614638 11.07 691116 51 76400 618430 11.00 694830 52 76000 616245 10.98 692245 53 76326 615142 11.04 691468 54 75766 617028 10.94 692794 55 75946 614015 11.01 689961 56 76435 612062 11.10 688497 57 76405 614828 11.05 691233 58 75067 614289 10.89 689356 59 76036 613347 11.03 689383 60 76100 614697 11.02 690797 61 75951 613364 11.02 689315 62 76299 612502 11.08 688801 63 76162 616653 10.99 692815 64 75895 614886 10.99 690781 65 75544 612338 10.98 687882 66 76242 614346 11.04 690588 67 75285 611072 10.97 686357 68 75482 612329 10.97 687811 69 75599 612625 10.98 688224 70 75508 612138 10.98 687646 71 75633 611622 11.01 687255 72 75497 615157 10.93 690654 73 75515 611442 10.99 686957 74 75559 611275 11.00 686834 75 75794 614122 10.99 689916 76 75276 612749 10.94 688025 77 75496 610340 11.01 685836 78 75324 612011 10.96 687335 79 75349 609702 11.00 685051 80 75471 611045 10.99 686516 81 75619 612315 10.99 687934 82 74934 610195 10.94 685129 83 75376 609880 11.00 685256 84 75300 612175 10.95 687475 85 74707 609481 10.92 684188 86 75133 612163 10.93 687296 87 75478 610701 11.00 686179 88 74923 610489 10.93 685412 89 74977 608116 10.98 683093 90 75054 610502 10.95 685556 91 74909 608892 10.95 683801 92 75585 607049 11.07 682634 93 75116 610681 10.95 685797 94 75087 608901 10.98 683988 95 74669 609818 10.91 684487 96 75360 610869 10.98 686229 97 75008 609312 10.96 684320 98 74620 610854 10.89 685474 99 74688 611768 10.88 686456 100 74800 609081 10.94 683881 101 74949 608189 10.97 683138 102 74844 607522 10.97 682366 103 74567 605738 10.96 680305 104 74657 607751 10.94 682408 105 74222 609076 10.86 683298 106 74451 606683 10.93 681134 107 74118 607484 10.87 681602 108 73928 608553 10.83 682481 109 74491 606331 10.94 680822 110 73853 605927 10.86 679780 111 74023 606348 10.88 680371 112 74062 606903 10.88 680965 113 74220 607071 10.89 681291 114 74195 608574 10.87 682769 115 74213 607177 10.89 681390 116 73602 607186 10.81 680788 117 74248 607015 10.90 681263 118 74254 605703 10.92 679957 119 73856 605966 10.86 679822 120 73632 606822 10.82 680454 121 73568 605857 10.83 679425 122 73576 603446 10.87 677022 123 73228 604498 10.80 677726 124 73333 605843 10.80 679176 125 73141 604632 10.79 677773 126 73624 605656 10.84 679280 127 73098 604541 10.79 677639 128 73390 605561 10.81 678951 129 73203 606495 10.77 679698 130 72924 604396 10.77 677320 131 73009 603452 10.79 676461 132 73357 604481 10.82 677838 133 72998 603734 10.79 676732 134 73007 605800 10.76 678807 135 73931 606589 10.86 680520 136 72695 605198 10.72 677893 137 73016 604568 10.78 677584 138 72946 605466 10.75 678412 139 72641 601293 10.78 673934 140 72287 603771 10.69 676058 141 72354 603012 10.71 675366 142 72416 600353 10.76 672769 143 72515 601747 10.75 674262 144 72304 602627 10.71 674931 145 71156 602442 10.56 673598 146 71861 602716 10.65 674577 147 71914 603458 10.65 675372 148 71361 602729 10.59 674090 149 68212 599324 10.22 667536 150 56217 573617 8.93 629834 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 8929 1222205 0.73 1231134 2 8569 951650 0.89 960219 3 6599 807365 0.81 813964 4 5668 953255 0.59 958923 5 6730 1036752 0.64 1043482 6 7186 1010874 0.71 1018060 7 6732 899249 0.74 905981 8 6131 896552 0.68 902683 9 6060 890289 0.68 896349 10 6062 887733 0.68 893795 11 6039 901455 0.67 907494 12 6023 905882 0.66 911905 13 5923 906663 0.65 912586 14 6007 913242 0.65 919249 15 6004 918689 0.65 924693 16 6053 926104 0.65 932157 17 6280 935532 0.67 941812 18 6231 935411 0.66 941642 19 6202 936755 0.66 942957 20 6216 937141 0.66 943357 21 6207 944530 0.65 950737 22 6266 945180 0.66 951446 23 6222 941002 0.66 947224 24 6291 941215 0.66 947506 25 6447 936536 0.68 942983 26 6261 936744 0.66 943005 27 6260 943994 0.66 950254 28 6271 941136 0.66 947407 29 6315 939991 0.67 946306 30 6489 946153 0.68 952642 31 6272 944271 0.66 950543 32 6351 946420 0.67 952771 33 6394 947088 0.67 953482 34 6281 945104 0.66 951385 35 6326 943180 0.67 949506 36 6433 947842 0.67 954275 37 6349 945641 0.67 951990 38 6369 948996 0.67 955365 39 6368 948137 0.67 954505 40 6271 947401 0.66 953672 41 6319 946898 0.66 953217 42 6364 950759 0.66 957123 43 6437 946594 0.68 953031 44 6456 945732 0.68 952188 45 6325 944500 0.67 950825 46 6431 942625 0.68 949056 47 6366 943137 0.67 949503 48 6411 945764 0.67 952175 49 6332 943866 0.67 950198 50 6452 943339 0.68 949791 51 6456 946125 0.68 952581 52 6339 944008 0.67 950347 53 6417 944292 0.67 950709 54 6461 944546 0.68 951007 55 6380 941970 0.67 948350 56 6412 942131 0.68 948543 57 6286 941567 0.66 947853 58 6346 942848 0.67 949194 59 6405 941012 0.68 947417 60 6339 948570 0.66 954909 61 6452 945318 0.68 951770 62 6275 945456 0.66 951731 63 6487 948488 0.68 954975 64 6451 944158 0.68 950609 65 6361 940029 0.67 946390 66 6502 938126 0.69 944628 67 6319 940053 0.67 946372 68 6286 940342 0.66 946628 69 6400 940236 0.68 946636 70 6226 941983 0.66 948209 71 6411 939357 0.68 945768 72 6284 943521 0.66 949805 73 6327 940447 0.67 946774 74 6356 941382 0.67 947738 75 6318 944004 0.66 950322 76 6261 942121 0.66 948382 77 6397 939733 0.68 946130 78 6315 943577 0.66 949892 79 6423 939246 0.68 945669 80 6480 941771 0.68 948251 81 6430 941556 0.68 947986 82 6276 940013 0.66 946289 83 6439 938423 0.68 944862 84 6341 942169 0.67 948510 85 6359 941684 0.67 948043 86 6498 942255 0.68 948753 87 6529 939009 0.69 945538 88 6302 935120 0.67 941422 89 6315 937062 0.67 943377 90 6417 937928 0.68 944345 91 6259 936497 0.66 942756 92 6468 933372 0.69 939840 93 6445 941134 0.68 947579 94 6510 939579 0.69 946089 95 6336 936680 0.67 943016 96 6327 939407 0.67 945734 97 6310 935448 0.67 941758 98 6480 934751 0.69 941231 99 6330 937187 0.67 943517 100 6434 935500 0.68 941934 101 6320 932063 0.67 938383 102 6490 933616 0.69 940106 103 6361 933252 0.68 939613 104 6349 933552 0.68 939901 105 6453 936111 0.68 942564 106 6343 934974 0.67 941317 107 6471 933981 0.69 940452 108 6518 937083 0.69 943601 109 6396 934822 0.68 941218 110 6321 934175 0.67 940496 111 6471 936071 0.69 942542 112 6263 935037 0.67 941300 113 6428 931434 0.69 937862 114 6472 935320 0.69 941792 115 6571 930244 0.70 936815 116 6391 932225 0.68 938616 117 6519 933125 0.69 939644 118 6447 933603 0.69 940050 119 6435 932610 0.69 939045 120 6477 933782 0.69 940259 121 6388 928675 0.68 935063 122 6584 929988 0.70 936572 123 6562 931875 0.70 938437 124 6594 932725 0.70 939319 125 6481 929917 0.69 936398 126 6532 934536 0.69 941068 127 6586 931651 0.70 938237 128 6404 929199 0.68 935603 129 6451 931536 0.69 937987 130 6595 929056 0.70 935651 131 6691 931083 0.71 937774 132 6655 928969 0.71 935624 133 6713 928571 0.72 935284 134 6688 930998 0.71 937686 135 6697 929414 0.72 936111 136 6670 924610 0.72 931280 137 6754 925190 0.72 931944 138 6616 928295 0.71 934911 139 6708 926631 0.72 933339 140 6753 927502 0.72 934255 141 6759 927538 0.72 934297 142 6769 923587 0.73 930356 143 6761 922435 0.73 929196 144 6833 927041 0.73 933874 145 6727 926690 0.72 933417 146 6976 927102 0.75 934078 147 7033 926740 0.75 933773 148 6843 922745 0.74 929588 149 7095 923752 0.76 930847 150 5617 874413 0.64 880030 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 19497 3765842 0.52 3785339 2 36910 3210206 1.14 3247116 3 23960 2833739 0.84 2857699 4 23138 3498345 0.66 3521483 5 25311 3630440 0.69 3655751 6 26971 3735900 0.72 3762871 7 26242 3450497 0.75 3476739 8 25200 3570013 0.70 3595213 9 24932 3681176 0.67 3706108 10 24589 3698050 0.66 3722639 11 24862 3834652 0.64 3859514 12 24602 3836098 0.64 3860700 13 23876 3826404 0.62 3850280 14 24257 3847448 0.63 3871705 15 24687 3845948 0.64 3870635 16 25061 3829018 0.65 3854079 17 25739 3835625 0.67 3861364 18 25903 3869109 0.67 3895012 19 25908 3863538 0.67 3889446 20 25543 3874607 0.65 3900150 21 25690 3885141 0.66 3910831 22 25483 3858904 0.66 3884387 23 25479 3847895 0.66 3873374 24 25950 3864791 0.67 3890741 25 25736 3865445 0.66 3891181 26 25906 3867763 0.67 3893669 27 25900 3883653 0.66 3909553 28 26234 3878014 0.67 3904248 29 26117 3883576 0.67 3909693 30 26126 3909538 0.66 3935664 31 26093 3896724 0.67 3922817 32 26150 3895937 0.67 3922087 33 26022 3908144 0.66 3934166 34 26336 3889149 0.67 3915485 35 25788 3895520 0.66 3921308 36 25899 3910582 0.66 3936481 37 25974 3901593 0.66 3927567 38 26071 3899678 0.66 3925749 39 26172 3916756 0.66 3942928 40 26051 3910061 0.66 3936112 41 26233 3906485 0.67 3932718 42 26115 3913560 0.66 3939675 43 26328 3894499 0.67 3920827 44 25951 3894196 0.66 3920147 45 26043 3906386 0.66 3932429 46 25775 3893728 0.66 3919503 47 26066 3896172 0.66 3922238 48 25982 3902398 0.66 3928380 49 25944 3889339 0.66 3915283 50 25773 3893527 0.66 3919300 51 26131 3910968 0.66 3937099 52 26258 3901603 0.67 3927861 53 26037 3893959 0.66 3919996 54 25959 3906211 0.66 3932170 55 26320 3902045 0.67 3928365 56 26271 3904789 0.67 3931060 57 26053 3918829 0.66 3944882 58 26264 3911087 0.67 3937351 59 26121 3904040 0.66 3930161 60 26195 3911444 0.67 3937639 61 26297 3898420 0.67 3924717 62 26110 3901595 0.66 3927705 63 26095 3904446 0.66 3930541 64 26376 3895252 0.67 3921628 65 26221 3895203 0.67 3921424 66 25941 3903652 0.66 3929593 67 26333 3895682 0.67 3922015 68 25804 3900412 0.66 3926216 69 26067 3914399 0.66 3940466 70 26308 3910975 0.67 3937283 71 26291 3905373 0.67 3931664 72 26280 3917488 0.67 3943768 73 26050 3904929 0.66 3930979 74 26212 3906667 0.67 3932879 75 26243 3911929 0.67 3938172 76 25933 3905582 0.66 3931515 77 25847 3903722 0.66 3929569 78 26141 3913261 0.66 3939402 79 26278 3898304 0.67 3924582 80 25921 3893190 0.66 3919111 81 26161 3903377 0.67 3929538 82 26314 3896624 0.67 3922938 83 26065 3901142 0.66 3927207 84 26205 3912573 0.67 3938778 85 26143 3895268 0.67 3921411 86 26262 3897602 0.67 3923864 87 26353 3904678 0.67 3931031 88 26193 3903168 0.67 3929361 89 25928 3902875 0.66 3928803 90 26349 3908026 0.67 3934375 91 26069 3896538 0.66 3922607 92 26179 3896691 0.67 3922870 93 25837 3909027 0.66 3934864 94 26200 3895785 0.67 3921985 95 26276 3899144 0.67 3925420 96 26323 3905203 0.67 3931526 97 26365 3894522 0.67 3920887 98 26132 3894967 0.67 3921099 99 26645 3906493 0.68 3933138 100 26221 3901244 0.67 3927465 101 26202 3905415 0.67 3931617 102 26508 3910251 0.67 3936759 103 26584 3901310 0.68 3927894 104 26325 3905551 0.67 3931876 105 26583 3909198 0.68 3935781 106 26453 3906498 0.67 3932951 107 26410 3905484 0.67 3931894 108 26349 3909617 0.67 3935966 109 26571 3901765 0.68 3928336 110 26646 3901654 0.68 3928300 111 26444 3908277 0.67 3934721 112 26675 3904219 0.68 3930894 113 26497 3900797 0.67 3927294 114 26503 3904709 0.67 3931212 115 26716 3898248 0.68 3924964 116 26914 3896245 0.69 3923159 117 26844 3909813 0.68 3936657 118 26819 3902232 0.68 3929051 119 26719 3895037 0.68 3921756 120 27027 3901686 0.69 3928713 121 27007 3897456 0.69 3924463 122 26685 3896911 0.68 3923596 123 27135 3915392 0.69 3942527 124 26949 3905322 0.69 3932271 125 27055 3896882 0.69 3923937 126 27247 3906392 0.69 3933639 127 26950 3892662 0.69 3919612 128 27377 3892492 0.70 3919869 129 27523 3900255 0.70 3927778 130 27368 3897024 0.70 3924392 131 27437 3898307 0.70 3925744 132 27498 3903825 0.70 3931323 133 27469 3898631 0.70 3926100 134 27390 3897254 0.70 3924644 135 27472 3900791 0.70 3928263 136 27422 3887768 0.70 3915190 137 27325 3889914 0.70 3917239 138 28177 3899090 0.72 3927267 139 27934 3891889 0.71 3919823 140 27778 3887007 0.71 3914785 141 27821 3890869 0.71 3918690 142 28228 3894279 0.72 3922507 143 28339 3891095 0.72 3919434 144 28129 3901968 0.72 3930097 145 28263 3899548 0.72 3927811 146 28531 3901872 0.73 3930403 147 29064 3907344 0.74 3936408 148 28683 3889548 0.73 3918231 149 27968 3863575 0.72 3891543 150 21597 3709653 0.58 3731250 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1250407 269713 82.26 1520120 2 446318 81424 84.57 527742 3 374584 101303 78.71 475887 4 453463 176623 71.97 630086 5 325582 224851 59.15 550433 6 245754 270663 47.59 516417 7 185561 361666 33.91 547227 8 158639 428256 27.03 586895 9 134648 486630 21.67 621278 10 115781 537568 17.72 653349 11 99545 581784 14.61 681329 12 90088 574599 13.55 664687 13 85306 570316 13.01 655622 14 80962 578691 12.27 659653 15 77477 576412 11.85 653889 16 75595 574664 11.63 650259 17 74931 572226 11.58 647157 18 74820 573005 11.55 647825 19 75497 572767 11.65 648264 20 75279 575370 11.57 650649 21 75553 576937 11.58 652490 22 75487 577892 11.55 653379 23 76300 580024 11.63 656324 24 75845 583070 11.51 658915 25 75801 583872 11.49 659673 26 75829 584789 11.48 660618 27 76152 587517 11.47 663669 28 76110 589248 11.44 665358 29 76293 593238 11.39 669531 30 76485 592935 11.43 669420 31 75829 595896 11.29 671725 32 76422 597162 11.35 673584 33 76417 597254 11.34 673671 34 76260 597615 11.32 673875 35 76304 598126 11.31 674430 36 76231 597146 11.32 673377 37 76066 600394 11.24 676460 38 76420 598469 11.32 674889 39 76443 601263 11.28 677706 40 76194 600417 11.26 676611 41 75702 599348 11.21 675050 42 75649 599266 11.21 674915 43 76036 599167 11.26 675203 44 75632 601106 11.18 676738 45 75534 599460 11.19 674994 46 75367 600289 11.15 675656 47 76288 599178 11.29 675466 48 76139 599958 11.26 676097 49 75387 599303 11.17 674690 50 75008 598463 11.14 673471 51 75098 597756 11.16 672854 52 75147 596641 11.19 671788 53 75187 596997 11.19 672184 54 75139 596622 11.19 671761 55 74290 596254 11.08 670544 56 74682 594198 11.17 668880 57 74761 593183 11.19 667944 58 74088 594887 11.07 668975 59 74157 594436 11.09 668593 60 73783 593192 11.06 666975 61 74511 590862 11.20 665373 62 74093 591339 11.13 665432 63 73873 590433 11.12 664306 64 73696 590255 11.10 663951 65 74117 588919 11.18 663036 66 73302 587464 11.09 660766 67 73708 587494 11.15 661202 68 73637 587485 11.14 661122 69 73231 585521 11.12 658752 70 73371 584926 11.15 658297 71 73315 585762 11.12 659077 72 73060 583230 11.13 656290 73 73003 582950 11.13 655953 74 73098 582217 11.15 655315 75 72937 578464 11.20 651401 76 72465 577478 11.15 649943 77 72519 579018 11.13 651537 78 72335 576222 11.15 648557 79 71926 575157 11.12 647083 80 71639 573761 11.10 645400 81 71711 571971 11.14 643682 82 71207 571224 11.08 642431 83 71210 570124 11.10 641334 84 71410 568786 11.15 640196 85 70744 566931 11.09 637675 86 71182 565910 11.17 637092 87 70476 564047 11.11 634523 88 70701 562453 11.17 633154 89 70749 561285 11.19 632034 90 70127 558817 11.15 628944 91 70482 558928 11.20 629410 92 69520 556976 11.10 626496 93 69607 555584 11.13 625191 94 69630 552115 11.20 621745 95 68613 552194 11.05 620807 96 68575 549039 11.10 617614 97 68842 548513 11.15 617355 98 68453 546103 11.14 614556 99 68106 543938 11.13 612044 100 67797 542832 11.10 610629 101 67963 540124 11.18 608087 102 67328 539134 11.10 606462 103 67294 536991 11.14 604285 104 67076 533943 11.16 601019 105 66487 530286 11.14 596773 106 66573 529171 11.17 595744 107 65424 526110 11.06 591534 108 66048 524987 11.17 591035 109 65056 522095 11.08 587151 110 65568 520937 11.18 586505 111 64730 517365 11.12 582095 112 64616 516284 11.12 580900 113 64123 513249 11.11 577372 114 64283 511035 11.17 575318 115 63487 508339 11.10 571826 116 63424 504892 11.16 568316 117 62731 501851 11.11 564582 118 62226 501218 11.04 563444 119 62278 497057 11.13 559335 120 62115 494366 11.16 556481 121 61385 491831 11.10 553216 122 61149 488793 11.12 549942 123 61118 485672 11.18 546790 124 60492 484035 11.11 544527 125 60336 481464 11.14 541800 126 59919 478963 11.12 538882 127 59480 475118 11.13 534598 128 58691 472837 11.04 531528 129 58509 469431 11.08 527940 130 58157 465178 11.11 523335 131 57749 463785 11.07 521534 132 56943 460449 11.01 517392 133 57215 456628 11.13 513843 134 56510 452610 11.10 509120 135 56131 449621 11.10 505752 136 55815 447396 11.09 503211 137 55375 443602 11.10 498977 138 54716 440728 11.04 495444 139 54872 437158 11.15 492030 140 53839 432298 11.07 486137 141 53696 429986 11.10 483682 142 53482 426915 11.13 480397 143 52936 423017 11.12 475953 144 52506 419091 11.13 471597 145 51633 415011 11.06 466644 146 51212 411053 11.08 462265 147 50746 406343 11.10 457089 148 49633 398976 11.06 448609 149 48068 365859 11.61 413927 150 42105 0 100.00 42105 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1516413 323968 82.40 1840381 2 1444292 287469 83.40 1731761 3 460989 117732 79.66 578721 4 474901 189529 71.47 664430 5 416686 317308 56.77 733994 6 272278 341574 44.36 613852 7 200590 402799 33.24 603389 8 137061 532715 20.46 669776 9 99256 633790 13.54 733046 10 69431 748383 8.49 817814 11 49240 848808 5.48 898048 12 33406 856392 3.75 889798 13 23198 844589 2.67 867787 14 16548 855188 1.90 871736 15 12333 868868 1.40 881201 16 9907 874894 1.12 884801 17 8442 873203 0.96 881645 18 7736 872309 0.88 880045 19 7327 874685 0.83 882012 20 7120 877386 0.80 884506 21 6596 878095 0.75 884691 22 6863 878694 0.77 885557 23 6586 883292 0.74 889878 24 6313 888539 0.71 894852 25 6323 892941 0.70 899264 26 6245 894359 0.69 900604 27 6211 898112 0.69 904323 28 6139 899612 0.68 905751 29 6237 904381 0.68 910618 30 6076 908006 0.66 914082 31 6102 908127 0.67 914229 32 6209 911168 0.68 917377 33 6196 912123 0.67 918319 34 6217 915294 0.67 921511 35 6140 915439 0.67 921579 36 6021 916026 0.65 922047 37 6058 916146 0.66 922204 38 6089 919282 0.66 925371 39 6101 918112 0.66 924213 40 6183 918618 0.67 924801 41 6043 921834 0.65 927877 42 6108 920095 0.66 926203 43 6165 920626 0.67 926791 44 6143 921095 0.66 927238 45 6175 918895 0.67 925070 46 6079 919567 0.66 925646 47 6146 919159 0.66 925305 48 6376 918021 0.69 924397 49 6205 917599 0.67 923804 50 6083 916390 0.66 922473 51 6064 915713 0.66 921777 52 6089 913152 0.66 919241 53 6182 913828 0.67 920010 54 6297 912152 0.69 918449 55 6053 911043 0.66 917096 56 6187 913784 0.67 919971 57 6053 911902 0.66 917955 58 6181 907505 0.68 913686 59 6220 909209 0.68 915429 60 6138 906896 0.67 913034 61 6065 904452 0.67 910517 62 6081 904645 0.67 910726 63 6067 904833 0.67 910900 64 6021 902499 0.66 908520 65 6185 901773 0.68 907958 66 5996 899572 0.66 905568 67 6046 899738 0.67 905784 68 5873 898101 0.65 903974 69 6050 897366 0.67 903416 70 6026 892556 0.67 898582 71 6115 894648 0.68 900763 72 6071 892046 0.68 898117 73 5835 889454 0.65 895289 74 6092 886949 0.68 893041 75 5977 887416 0.67 893393 76 6018 884185 0.68 890203 77 5905 883479 0.66 889384 78 5929 881395 0.67 887324 79 6031 880546 0.68 886577 80 6024 879597 0.68 885621 81 5878 875145 0.67 881023 82 5892 873169 0.67 879061 83 5805 872114 0.66 877919 84 5979 871626 0.68 877605 85 5915 868131 0.68 874046 86 5785 866978 0.66 872763 87 5710 863755 0.66 869465 88 5746 861654 0.66 867400 89 5814 860117 0.67 865931 90 5845 855375 0.68 861220 91 5760 853998 0.67 859758 92 5748 852093 0.67 857841 93 5699 849497 0.67 855196 94 5747 847885 0.67 853632 95 5512 843973 0.65 849485 96 5644 839633 0.67 845277 97 5634 836981 0.67 842615 98 5671 835223 0.67 840894 99 5735 830458 0.69 836193 100 5544 828609 0.66 834153 101 5473 826212 0.66 831685 102 5552 824516 0.67 830068 103 5759 820643 0.70 826402 104 5563 818443 0.68 824006 105 5639 813028 0.69 818667 106 5322 810701 0.65 816023 107 5371 808023 0.66 813394 108 5513 802104 0.68 807617 109 5353 801546 0.66 806899 110 5435 796478 0.68 801913 111 5287 793794 0.66 799081 112 5322 788189 0.67 793511 113 5316 785457 0.67 790773 114 5352 781673 0.68 787025 115 5259 777570 0.67 782829 116 5313 774295 0.68 779608 117 5269 769657 0.68 774926 118 5265 764254 0.68 769519 119 5196 761986 0.68 767182 120 5155 756469 0.68 761624 121 5173 753782 0.68 758955 122 5225 748131 0.69 753356 123 5057 743655 0.68 748712 124 5023 739186 0.67 744209 125 5109 735865 0.69 740974 126 5105 729945 0.69 735050 127 4934 726229 0.67 731163 128 4989 723482 0.68 728471 129 4806 718285 0.66 723091 130 4951 711855 0.69 716806 131 4922 706678 0.69 711600 132 4924 701746 0.70 706670 133 4849 699066 0.69 703915 134 4751 692843 0.68 697594 135 4911 687446 0.71 692357 136 4787 683731 0.70 688518 137 4644 678262 0.68 682906 138 4784 671250 0.71 676034 139 4705 667429 0.70 672134 140 4569 662688 0.68 667257 141 4651 656262 0.70 660913 142 4524 650946 0.69 655470 143 4503 646184 0.69 650687 144 4384 642026 0.68 646410 145 4454 636883 0.69 641337 146 4545 629636 0.72 634181 147 4223 621531 0.67 625754 148 3917 611281 0.64 615198 149 3528 558154 0.63 561682 150 2529 0 100.00 2529 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4459818 938852 82.61 5398670 2 3992607 774896 83.75 4767503 3 3893175 1151307 77.18 5044482 4 3469865 1486495 70.01 4956360 5 2450066 1914809 56.13 4364875 6 1802405 2224634 44.76 4027039 7 1278099 2444356 34.33 3722455 8 907063 2631516 25.63 3538579 9 630788 2846505 18.14 3477293 10 434765 3108335 12.27 3543100 11 290020 3513527 7.62 3803547 12 194723 3638076 5.08 3832799 13 129606 3638127 3.44 3767733 14 88398 3654802 2.36 3743200 15 62689 3687370 1.67 3750059 16 47623 3723751 1.26 3771374 17 39497 3749201 1.04 3788698 18 34884 3760401 0.92 3795285 19 32201 3768647 0.85 3800848 20 30052 3771983 0.79 3802035 21 29175 3775108 0.77 3804283 22 28790 3783259 0.76 3812049 23 28604 3784747 0.75 3813351 24 28198 3784136 0.74 3812334 25 28131 3793610 0.74 3821741 26 27590 3792002 0.72 3819592 27 26703 3796018 0.70 3822721 28 26424 3796337 0.69 3822761 29 26270 3803503 0.69 3829773 30 25576 3803929 0.67 3829505 31 25923 3814059 0.68 3839982 32 25720 3810196 0.67 3835916 33 25479 3810736 0.66 3836215 34 25312 3810180 0.66 3835492 35 25317 3813866 0.66 3839183 36 25040 3815012 0.65 3840052 37 25290 3813837 0.66 3839127 38 25138 3811261 0.66 3836399 39 24962 3811257 0.65 3836219 40 25256 3808657 0.66 3833913 41 24992 3811078 0.65 3836070 42 24973 3810227 0.65 3835200 43 24913 3806571 0.65 3831484 44 25004 3807773 0.65 3832777 45 25105 3803650 0.66 3828755 46 24852 3801840 0.65 3826692 47 25359 3797850 0.66 3823209 48 26267 3791750 0.69 3818017 49 24863 3791891 0.65 3816754 50 24823 3799821 0.65 3824644 51 25027 3791695 0.66 3816722 52 24861 3783973 0.65 3808834 53 24998 3785527 0.66 3810525 54 24941 3779594 0.66 3804535 55 25245 3774414 0.66 3799659 56 24798 3774714 0.65 3799512 57 25011 3768568 0.66 3793579 58 24777 3763028 0.65 3787805 59 24708 3758737 0.65 3783445 60 24944 3756012 0.66 3780956 61 24926 3751518 0.66 3776444 62 24944 3745135 0.66 3770079 63 24842 3743886 0.66 3768728 64 24593 3739131 0.65 3763724 65 25014 3736401 0.67 3761415 66 25062 3730718 0.67 3755780 67 24844 3728313 0.66 3753157 68 24590 3720155 0.66 3744745 69 24558 3718134 0.66 3742692 70 24422 3710030 0.65 3734452 71 24501 3705314 0.66 3729815 72 24706 3701930 0.66 3726636 73 24211 3695612 0.65 3719823 74 24680 3686990 0.66 3711670 75 24367 3681358 0.66 3705725 76 23916 3676696 0.65 3700612 77 24227 3664762 0.66 3688989 78 24300 3657885 0.66 3682185 79 23874 3649110 0.65 3672984 80 24156 3647783 0.66 3671939 81 24222 3638543 0.66 3662765 82 23902 3634516 0.65 3658418 83 24112 3627206 0.66 3651318 84 24131 3620381 0.66 3644512 85 23819 3609164 0.66 3632983 86 23934 3599986 0.66 3623920 87 23670 3592718 0.65 3616388 88 23787 3582043 0.66 3605830 89 23746 3580298 0.66 3604044 90 23929 3567086 0.67 3591015 91 23598 3556486 0.66 3580084 92 23417 3545693 0.66 3569110 93 23498 3534189 0.66 3557687 94 23336 3528579 0.66 3551915 95 23554 3514260 0.67 3537814 96 23186 3507347 0.66 3530533 97 23148 3492454 0.66 3515602 98 23335 3483909 0.67 3507244 99 23267 3472119 0.67 3495386 100 22900 3458290 0.66 3481190 101 23123 3450449 0.67 3473572 102 22694 3433770 0.66 3456464 103 22639 3421707 0.66 3444346 104 22927 3411896 0.67 3434823 105 22548 3396358 0.66 3418906 106 22526 3382854 0.66 3405380 107 22459 3366963 0.66 3389422 108 22412 3354182 0.66 3376594 109 22094 3341623 0.66 3363717 110 22230 3328432 0.66 3350662 111 21967 3308555 0.66 3330522 112 21651 3295021 0.65 3316672 113 21995 3281702 0.67 3303697 114 21591 3265833 0.66 3287424 115 21666 3249176 0.66 3270842 116 21717 3233215 0.67 3254932 117 21919 3217473 0.68 3239392 118 21415 3198244 0.67 3219659 119 21332 3179128 0.67 3200460 120 21147 3166243 0.66 3187390 121 21131 3148753 0.67 3169884 122 20840 3130740 0.66 3151580 123 20703 3111377 0.66 3132080 124 20549 3091732 0.66 3112281 125 20806 3071948 0.67 3092754 126 20606 3057740 0.67 3078346 127 20308 3036409 0.66 3056717 128 20275 3022339 0.67 3042614 129 20260 3002087 0.67 3022347 130 20074 2982171 0.67 3002245 131 20030 2961744 0.67 2981774 132 19889 2942984 0.67 2962873 133 19737 2921431 0.67 2941168 134 19755 2904069 0.68 2923824 135 19579 2878580 0.68 2898159 136 19482 2860382 0.68 2879864 137 19307 2838533 0.68 2857840 138 19369 2815718 0.68 2835087 139 19051 2793811 0.68 2812862 140 18674 2776188 0.67 2794862 141 18885 2751176 0.68 2770061 142 18688 2730836 0.68 2749524 143 18448 2710368 0.68 2728816 144 18120 2685365 0.67 2703485 145 18364 2661874 0.69 2680238 146 18247 2638102 0.69 2656349 147 17710 2605255 0.68 2622965 148 16743 2556714 0.65 2573457 149 14090 2331902 0.60 2345992 150 9596 0 100.00 9596