CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 39179 841856 4.45 881035 2 122838 1009789 10.85 1132627 3 97899 657893 12.95 755792 4 90059 913008 8.98 1003067 5 103303 902872 10.27 1006175 6 120336 1097937 9.88 1218273 7 110079 895828 10.94 1005907 8 103098 872689 10.57 975787 9 95093 841770 10.15 936863 10 91471 808524 10.16 899995 11 88330 829231 9.63 917561 12 87306 783440 10.03 870746 13 87126 794381 9.88 881507 14 90098 823758 9.86 913856 15 89980 835568 9.72 925548 16 90840 853449 9.62 944289 17 93197 860685 9.77 953882 18 95189 875746 9.80 970935 19 94632 869670 9.81 964302 20 94540 872820 9.77 967360 21 94715 871701 9.80 966416 22 94233 867626 9.80 961859 23 93977 864718 9.80 958695 24 95137 870150 9.86 965287 25 92934 861891 9.73 954825 26 92981 858476 9.77 951457 27 93998 865379 9.80 959377 28 92971 866209 9.69 959180 29 93789 865266 9.78 959055 30 93667 868421 9.74 962088 31 93225 864576 9.73 957801 32 93072 861554 9.75 954626 33 93591 867979 9.73 961570 34 92616 860860 9.71 953476 35 93519 864424 9.76 957943 36 93666 869296 9.73 962962 37 92532 861931 9.69 954463 38 93411 864861 9.75 958272 39 93091 870235 9.66 963326 40 93275 867101 9.71 960376 41 93403 865437 9.74 958840 42 94583 873492 9.77 968075 43 93484 862381 9.78 955865 44 94097 862766 9.83 956863 45 93370 863375 9.76 956745 46 92445 863604 9.67 956049 47 93134 862430 9.75 955564 48 93910 871921 9.72 965831 49 93215 867177 9.71 960392 50 94173 867498 9.79 961671 51 93930 867436 9.77 961366 52 93569 865694 9.75 959263 53 93534 861352 9.80 954886 54 94023 869268 9.76 963291 55 92806 860070 9.74 952876 56 93933 863411 9.81 957344 57 93059 865088 9.71 958147 58 92792 859218 9.75 952010 59 93261 862151 9.76 955412 60 93193 865294 9.72 958487 61 93182 859798 9.78 952980 62 94240 863741 9.84 957981 63 93950 865511 9.79 959461 64 93659 862790 9.79 956449 65 93662 857095 9.85 950757 66 93716 860824 9.82 954540 67 93019 853947 9.82 946966 68 93346 859138 9.80 952484 69 93438 859308 9.81 952746 70 93698 857401 9.85 951099 71 93505 859261 9.81 952766 72 93603 860338 9.81 953941 73 93332 857279 9.82 950611 74 93782 859854 9.83 953636 75 93279 859188 9.79 952467 76 93252 858144 9.80 951396 77 94458 858600 9.91 953058 78 93782 855435 9.88 949217 79 93463 855103 9.85 948566 80 93140 854405 9.83 947545 81 94157 856510 9.90 950667 82 92944 854759 9.81 947703 83 94005 855040 9.91 949045 84 93891 857325 9.87 951216 85 93569 855664 9.86 949233 86 93586 852874 9.89 946460 87 93350 853074 9.86 946424 88 93162 850552 9.87 943714 89 93468 845509 9.95 938977 90 93239 851281 9.87 944520 91 93027 849393 9.87 942420 92 92961 846933 9.89 939894 93 93353 850009 9.90 943362 94 93407 846652 9.94 940059 95 93324 846007 9.94 939331 96 94776 849485 10.04 944261 97 94084 845722 10.01 939806 98 94115 846454 10.01 940569 99 94378 846630 10.03 941008 100 93472 845038 9.96 938510 101 93324 838527 10.01 931851 102 93842 843460 10.01 937302 103 92892 835902 10.00 928794 104 93276 837423 10.02 930699 105 94167 840972 10.07 935139 106 93758 836110 10.08 929868 107 93333 835492 10.05 928825 108 93676 837068 10.06 930744 109 93319 831624 10.09 924943 110 93317 832392 10.08 925709 111 93714 832986 10.11 926700 112 93911 828856 10.18 922767 113 94294 830787 10.19 925081 114 94313 831977 10.18 926290 115 93953 823625 10.24 917578 116 94776 826502 10.29 921278 117 93906 824263 10.23 918169 118 94079 820550 10.29 914629 119 95194 818581 10.42 913775 120 94501 821654 10.31 916155 121 94478 816619 10.37 911097 122 94047 812708 10.37 906755 123 94116 813355 10.37 907471 124 94615 810054 10.46 904669 125 94588 808466 10.47 903054 126 95367 809578 10.54 904945 127 94103 802989 10.49 897092 128 95031 802169 10.59 897200 129 94068 802873 10.49 896941 130 94998 797039 10.65 892037 131 94859 798940 10.61 893799 132 95656 796852 10.72 892508 133 95422 791458 10.76 886880 134 94974 790499 10.73 885473 135 95011 789105 10.75 884116 136 95352 785643 10.82 880995 137 95055 783471 10.82 878526 138 95874 778713 10.96 874587 139 95136 777465 10.90 872601 140 95912 772614 11.04 868526 141 94666 769017 10.96 863683 142 95229 764092 11.08 859321 143 95648 761744 11.16 857392 144 95883 762641 11.17 858524 145 95765 756899 11.23 852664 146 95880 753038 11.29 848918 147 96932 752392 11.41 849324 148 95333 746881 11.32 842214 149 96020 740723 11.48 836743 150 95847 708192 11.92 804039 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 11610 1707557 0.68 1719167 2 11663 1190695 0.97 1202358 3 7389 996513 0.74 1003902 4 6832 1255178 0.54 1262010 5 8403 1480660 0.56 1489063 6 7965 1363567 0.58 1371532 7 7431 1169370 0.63 1176801 8 6620 1154592 0.57 1161212 9 6377 1126574 0.56 1132951 10 6120 1130381 0.54 1136501 11 6192 1157939 0.53 1164131 12 6009 1169006 0.51 1175015 13 5933 1172901 0.50 1178834 14 6027 1178700 0.51 1184727 15 6007 1200361 0.50 1206368 16 6295 1215382 0.52 1221677 17 6327 1231554 0.51 1237881 18 6348 1226470 0.51 1232818 19 6488 1228030 0.53 1234518 20 6461 1229648 0.52 1236109 21 6570 1236257 0.53 1242827 22 6644 1227391 0.54 1234035 23 6566 1222101 0.53 1228667 24 6565 1218712 0.54 1225277 25 6411 1219046 0.52 1225457 26 6696 1220041 0.55 1226737 27 6847 1228528 0.55 1235375 28 6589 1225763 0.53 1232352 29 6714 1225015 0.55 1231729 30 6805 1230540 0.55 1237345 31 6886 1227774 0.56 1234660 32 6921 1232042 0.56 1238963 33 6774 1229458 0.55 1236232 34 6848 1226992 0.56 1233840 35 6805 1226153 0.55 1232958 36 6958 1233037 0.56 1239995 37 7048 1230321 0.57 1237369 38 6908 1236338 0.56 1243246 39 6998 1235747 0.56 1242745 40 6954 1233432 0.56 1240386 41 7144 1231905 0.58 1239049 42 6961 1236716 0.56 1243677 43 7046 1230352 0.57 1237398 44 7170 1229184 0.58 1236354 45 7149 1229575 0.58 1236724 46 7136 1224846 0.58 1231982 47 7197 1225576 0.58 1232773 48 7344 1232772 0.59 1240116 49 7519 1230000 0.61 1237519 50 7341 1225042 0.60 1232383 51 7444 1230110 0.60 1237554 52 7513 1229288 0.61 1236801 53 7609 1229979 0.61 1237588 54 7696 1230895 0.62 1238591 55 7605 1225659 0.62 1233264 56 7740 1225987 0.63 1233727 57 7781 1227227 0.63 1235008 58 7867 1226355 0.64 1234222 59 7881 1222788 0.64 1230669 60 8177 1232111 0.66 1240288 61 8131 1231319 0.66 1239450 62 8295 1229968 0.67 1238263 63 8137 1232192 0.66 1240329 64 8187 1223610 0.66 1231797 65 8221 1221110 0.67 1229331 66 8227 1222413 0.67 1230640 67 8385 1218197 0.68 1226582 68 8253 1221623 0.67 1229876 69 8554 1226382 0.69 1234936 70 8554 1222307 0.69 1230861 71 8649 1219026 0.70 1227675 72 8711 1220016 0.71 1228727 73 8772 1219246 0.71 1228018 74 8754 1217359 0.71 1226113 75 9118 1222795 0.74 1231913 76 8964 1221311 0.73 1230275 77 9074 1215434 0.74 1224508 78 9148 1216917 0.75 1226065 79 9177 1215949 0.75 1225126 80 9356 1214408 0.76 1223764 81 9519 1216830 0.78 1226349 82 9579 1212486 0.78 1222065 83 9408 1211881 0.77 1221289 84 9376 1218865 0.76 1228241 85 9721 1213450 0.79 1223171 86 9654 1210364 0.79 1220018 87 9859 1208330 0.81 1218189 88 9935 1206347 0.82 1216282 89 9944 1206739 0.82 1216683 90 10093 1209196 0.83 1219289 91 10268 1203360 0.85 1213628 92 10096 1201068 0.83 1211164 93 10413 1206946 0.86 1217359 94 10524 1208448 0.86 1218972 95 10613 1203052 0.87 1213665 96 10583 1204205 0.87 1214788 97 10757 1199264 0.89 1210021 98 11042 1196519 0.91 1207561 99 10912 1198586 0.90 1209498 100 11214 1194839 0.93 1206053 101 11340 1190050 0.94 1201390 102 11632 1190319 0.97 1201951 103 11794 1187950 0.98 1199744 104 11651 1186897 0.97 1198548 105 11926 1188000 0.99 1199926 106 12331 1186851 1.03 1199182 107 12351 1183013 1.03 1195364 108 12648 1185041 1.06 1197689 109 12979 1182864 1.09 1195843 110 12913 1180425 1.08 1193338 111 13482 1182905 1.13 1196387 112 13629 1178955 1.14 1192584 113 13710 1173784 1.15 1187494 114 14019 1172424 1.18 1186443 115 14333 1169572 1.21 1183905 116 14420 1165755 1.22 1180175 117 15059 1167915 1.27 1182974 118 15040 1165893 1.27 1180933 119 15528 1164190 1.32 1179718 120 16052 1164257 1.36 1180309 121 16200 1157290 1.38 1173490 122 16623 1151384 1.42 1168007 123 16945 1152702 1.45 1169647 124 17535 1152570 1.50 1170105 125 17984 1146919 1.54 1164903 126 18361 1146494 1.58 1164855 127 18708 1143183 1.61 1161891 128 18851 1135286 1.63 1154137 129 19551 1134675 1.69 1154226 130 19918 1131182 1.73 1151100 131 20100 1127012 1.75 1147112 132 20856 1126715 1.82 1147571 133 20999 1119823 1.84 1140822 134 21830 1117129 1.92 1138959 135 22147 1112892 1.95 1135039 136 22941 1106840 2.03 1129781 137 23120 1102225 2.05 1125345 138 23883 1098087 2.13 1121970 139 24256 1094324 2.17 1118580 140 24667 1089417 2.21 1114084 141 25247 1087262 2.27 1112509 142 25610 1082450 2.31 1108060 143 26337 1076522 2.39 1102859 144 27464 1075682 2.49 1103146 145 28016 1072117 2.55 1100133 146 29134 1067085 2.66 1096219 147 30168 1063580 2.76 1093748 148 31184 1055643 2.87 1086827 149 39770 1057962 3.62 1097732 150 35920 992653 3.49 1028573 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 21453 4631100 0.46 4652553 2 49144 3977458 1.22 4026602 3 27071 3509543 0.77 3536614 4 25998 4481279 0.58 4507277 5 28642 4664128 0.61 4692770 6 27998 4650364 0.60 4678362 7 27814 4134319 0.67 4162133 8 25499 4317520 0.59 4343019 9 25222 4441672 0.56 4466894 10 23686 4495322 0.52 4519008 11 23547 4709440 0.50 4732987 12 22951 4708268 0.49 4731219 13 22675 4709405 0.48 4732080 14 22834 4720313 0.48 4743147 15 23508 4710115 0.50 4733623 16 23764 4667037 0.51 4690801 17 24878 4663312 0.53 4688190 18 25285 4701519 0.53 4726804 19 25623 4701613 0.54 4727236 20 26060 4714467 0.55 4740527 21 25953 4726491 0.55 4752444 22 26287 4684395 0.56 4710682 23 26302 4677111 0.56 4703413 24 27105 4706076 0.57 4733181 25 26826 4711316 0.57 4738142 26 27526 4722006 0.58 4749532 27 27771 4742995 0.58 4770766 28 28060 4738414 0.59 4766474 29 28123 4754033 0.59 4782156 30 28374 4789704 0.59 4818078 31 28237 4769326 0.59 4797563 32 28439 4765754 0.59 4794193 33 27718 4787981 0.58 4815699 34 27739 4753021 0.58 4780760 35 27528 4765770 0.57 4793298 36 27693 4783450 0.58 4811143 37 27449 4772345 0.57 4799794 38 27353 4770373 0.57 4797726 39 28040 4792247 0.58 4820287 40 27703 4784175 0.58 4811878 41 27569 4774307 0.57 4801876 42 27864 4792472 0.58 4820336 43 28072 4767504 0.59 4795576 44 28293 4764073 0.59 4792366 45 28268 4776034 0.59 4804302 46 28718 4765025 0.60 4793743 47 28756 4764362 0.60 4793118 48 28899 4774718 0.60 4803617 49 29233 4756381 0.61 4785614 50 29441 4754552 0.62 4783993 51 29519 4777210 0.61 4806729 52 29539 4764508 0.62 4794047 53 29893 4755650 0.62 4785543 54 30327 4777121 0.63 4807448 55 30530 4758870 0.64 4789400 56 30720 4769917 0.64 4800637 57 30919 4784035 0.64 4814954 58 30719 4767544 0.64 4798263 59 31306 4756319 0.65 4787625 60 31613 4771438 0.66 4803051 61 31843 4752949 0.67 4784792 62 32039 4749163 0.67 4781202 63 32154 4757432 0.67 4789586 64 32535 4741080 0.68 4773615 65 32499 4731437 0.68 4763936 66 32965 4750440 0.69 4783405 67 33038 4736038 0.69 4769076 68 33235 4743148 0.70 4776383 69 33493 4756831 0.70 4790324 70 33767 4749979 0.71 4783746 71 34404 4741477 0.72 4775881 72 34572 4756389 0.72 4790961 73 35110 4734693 0.74 4769803 74 35011 4739826 0.73 4774837 75 35695 4748150 0.75 4783845 76 35693 4731078 0.75 4766771 77 36147 4725573 0.76 4761720 78 36164 4740463 0.76 4776627 79 36384 4722377 0.76 4758761 80 36742 4713519 0.77 4750261 81 36513 4728247 0.77 4764760 82 37353 4708133 0.79 4745486 83 37678 4707024 0.79 4744702 84 37916 4726202 0.80 4764118 85 38265 4694165 0.81 4732430 86 38853 4695008 0.82 4733861 87 39097 4710451 0.82 4749548 88 39160 4700257 0.83 4739417 89 39797 4701463 0.84 4741260 90 40790 4706189 0.86 4746979 91 40722 4682490 0.86 4723212 92 40945 4681313 0.87 4722258 93 41475 4692852 0.88 4734327 94 42146 4669261 0.89 4711407 95 42585 4668928 0.90 4711513 96 42995 4681604 0.91 4724599 97 43782 4661058 0.93 4704840 98 43924 4654208 0.93 4698132 99 44689 4666748 0.95 4711437 100 46024 4653003 0.98 4699027 101 45979 4651937 0.98 4697916 102 46905 4661969 1.00 4708874 103 46993 4641015 1.00 4688008 104 48175 4638313 1.03 4686488 105 49489 4646840 1.05 4696329 106 49734 4632295 1.06 4682029 107 50887 4624950 1.09 4675837 108 51448 4625804 1.10 4677252 109 52470 4611452 1.13 4663922 110 53309 4605670 1.14 4658979 111 54036 4603364 1.16 4657400 112 55160 4596515 1.19 4651675 113 56863 4578722 1.23 4635585 114 58004 4578671 1.25 4636675 115 59226 4569304 1.28 4628530 116 60388 4561914 1.31 4622302 117 61703 4564623 1.33 4626326 118 63030 4546659 1.37 4609689 119 64689 4533613 1.41 4598302 120 65579 4531546 1.43 4597125 121 67101 4517945 1.46 4585046 122 69030 4515829 1.51 4584859 123 70654 4529806 1.54 4600460 124 72184 4506528 1.58 4578712 125 73581 4492195 1.61 4565776 126 76211 4488071 1.67 4564282 127 77793 4459246 1.71 4537039 128 79467 4452763 1.75 4532230 129 81837 4447521 1.81 4529358 130 83755 4428351 1.86 4512106 131 86023 4422474 1.91 4508497 132 87446 4422111 1.94 4509557 133 89256 4394819 1.99 4484075 134 91360 4382022 2.04 4473382 135 93873 4371907 2.10 4465780 136 95024 4346700 2.14 4441724 137 97443 4332821 2.20 4430264 138 100548 4328208 2.27 4428756 139 102235 4302310 2.32 4404545 140 103991 4291419 2.37 4395410 141 106571 4279522 2.43 4386093 142 109537 4258007 2.51 4367544 143 111669 4239335 2.57 4351004 144 115259 4247977 2.64 4363236 145 118477 4229101 2.73 4347578 146 121702 4218201 2.80 4339903 147 129754 4216934 2.99 4346688 148 130293 4172638 3.03 4302931 149 127303 4122929 3.00 4250232 150 122321 3923853 3.02 4046174 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1491318 234049 86.43 1725367 2 520482 118501 81.45 638983 3 387915 181866 68.08 569781 4 446178 305240 59.38 751418 5 302168 343639 46.79 645807 6 229378 379037 37.70 608415 7 177122 466427 27.52 643549 8 155523 535641 22.50 691164 9 135749 593387 18.62 729136 10 117584 632704 15.67 750288 11 102112 670997 13.21 773109 12 92918 677665 12.06 770583 13 86853 673881 11.42 760734 14 82356 673479 10.90 755835 15 77965 668480 10.44 746445 16 75472 662816 10.22 738288 17 75582 656974 10.32 732556 18 74677 652324 10.27 727001 19 74544 645169 10.36 719713 20 74464 640831 10.41 715295 21 74258 640623 10.39 714881 22 73924 635632 10.42 709556 23 74527 632844 10.54 707371 24 73708 630754 10.46 704462 25 72625 627688 10.37 700313 26 71797 624560 10.31 696357 27 71802 622538 10.34 694340 28 70653 620095 10.23 690748 29 70594 615962 10.28 686556 30 69946 611881 10.26 681827 31 70035 607114 10.34 677149 32 68816 603254 10.24 672070 33 68064 600231 10.18 668295 34 67930 595575 10.24 663505 35 66841 589325 10.19 656166 36 66461 583485 10.23 649946 37 65720 580627 10.17 646347 38 65823 575154 10.27 640977 39 64179 569562 10.13 633741 40 63443 562710 10.13 626153 41 62908 558798 10.12 621706 42 62118 553229 10.09 615347 43 61857 548164 10.14 610021 44 60856 542643 10.08 603499 45 59793 536917 10.02 596710 46 59610 531875 10.08 591485 47 59109 525439 10.11 584548 48 57907 520830 10.01 578737 49 57890 515253 10.10 573143 50 56979 510047 10.05 567026 51 56117 504694 10.01 560811 52 55658 498240 10.05 553898 53 55112 492091 10.07 547203 54 54574 487747 10.06 542321 55 53606 480149 10.04 533755 56 53250 475009 10.08 528259 57 52339 470493 10.01 522832 58 51145 465127 9.91 516272 59 50919 460078 9.96 510997 60 50134 453757 9.95 503891 61 49974 448653 10.02 498627 62 49329 442855 10.02 492184 63 49005 437681 10.07 486686 64 48027 432640 9.99 480667 65 47937 426886 10.10 474823 66 47037 421827 10.03 468864 67 46494 416111 10.05 462605 68 45943 411479 10.04 457422 69 45313 405454 10.05 450767 70 44492 401126 9.98 445618 71 44463 395676 10.10 440139 72 43585 391562 10.02 435147 73 42983 386055 10.02 429038 74 42463 381192 10.02 423655 75 42054 376895 10.04 418949 76 41253 371944 9.98 413197 77 40900 367061 10.03 407961 78 40299 362093 10.01 402392 79 39762 356821 10.03 396583 80 39311 353253 10.01 392564 81 38638 347186 10.01 385824 82 38055 342003 10.01 380058 83 37919 339307 10.05 377226 84 37432 335434 10.04 372866 85 36864 328944 10.08 365808 86 36189 324386 10.04 360575 87 35731 319887 10.05 355618 88 35197 315709 10.03 350906 89 35249 312510 10.14 347759 90 34538 307808 10.09 342346 91 33886 304046 10.03 337932 92 33492 299825 10.05 333317 93 33207 295823 10.09 329030 94 32681 291078 10.09 323759 95 32097 287301 10.05 319398 96 31721 282120 10.11 313841 97 31110 278972 10.03 310082 98 30734 276173 10.01 306907 99 30551 271268 10.12 301819 100 30015 268306 10.06 298321 101 29555 265301 10.02 294856 102 29182 259826 10.10 289008 103 28675 257306 10.03 285981 104 28513 254538 10.07 283051 105 27932 250545 10.03 278477 106 27519 246840 10.03 274359 107 27147 243553 10.03 270700 108 26537 239701 9.97 266238 109 26580 237409 10.07 263989 110 26250 233470 10.11 259720 111 25724 229879 10.06 255603 112 25723 226926 10.18 252649 113 24788 224475 9.94 249263 114 24552 220500 10.02 245052 115 24110 217274 9.99 241384 116 24067 215601 10.04 239668 117 23518 212106 9.98 235624 118 23341 209608 10.02 232949 119 22797 205913 9.97 228710 120 22809 203901 10.06 226710 121 22150 200748 9.94 222898 122 21955 196926 10.03 218881 123 21747 194683 10.05 216430 124 21507 193053 10.02 214560 125 21141 188920 10.06 210061 126 20965 186398 10.11 207363 127 20205 183676 9.91 203881 128 20299 181849 10.04 202148 129 19684 179417 9.89 199101 130 19525 176908 9.94 196433 131 19302 174597 9.95 193899 132 19168 171794 10.04 190962 133 18862 169404 10.02 188266 134 18538 166748 10.01 185286 135 18099 164268 9.92 182367 136 18083 162556 10.01 180639 137 17841 160172 10.02 178013 138 17366 157691 9.92 175057 139 17137 155511 9.93 172648 140 16922 152422 9.99 169344 141 16759 150387 10.03 167146 142 16541 149245 9.98 165786 143 16222 146421 9.97 162643 144 16090 144442 10.02 160532 145 15796 142272 9.99 158068 146 15408 140004 9.91 155412 147 15252 137272 10.00 152524 148 14986 134396 10.03 149382 149 14346 120525 10.64 134871 150 12658 0 100.00 12658 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1736292 272498 86.43 2008790 2 1533044 388322 79.79 1921366 3 463885 214714 68.36 678599 4 446107 321009 58.15 767116 5 367982 475719 43.62 843701 6 240742 467334 34.00 708076 7 177935 522008 25.42 699943 8 120780 631999 16.04 752779 9 86661 738199 10.51 824860 10 58539 828432 6.60 886971 11 39339 899027 4.19 938366 12 26076 928596 2.73 954672 13 17357 934015 1.82 951372 14 12291 933769 1.30 946060 15 8994 937917 0.95 946911 16 7205 940356 0.76 947561 17 6852 934704 0.73 941556 18 5699 926356 0.61 932055 19 6037 916056 0.65 922093 20 5834 905833 0.64 911667 21 5524 899742 0.61 905266 22 6066 899382 0.67 905448 23 5287 897318 0.59 902605 24 5083 891680 0.57 896763 25 5069 887433 0.57 892502 26 5169 883001 0.58 888170 27 4853 878560 0.55 883413 28 5062 875397 0.57 880459 29 4814 872241 0.55 877055 30 4751 864057 0.55 868808 31 4559 858734 0.53 863293 32 4492 855240 0.52 859732 33 4435 847901 0.52 852336 34 4504 840804 0.53 845308 35 4354 837534 0.52 841888 36 4299 829386 0.52 833685 37 4225 823503 0.51 827728 38 4299 816769 0.52 821068 39 4324 810030 0.53 814354 40 4131 802436 0.51 806567 41 4114 796012 0.51 800126 42 4033 788327 0.51 792360 43 3983 779656 0.51 783639 44 4000 772761 0.51 776761 45 3908 764981 0.51 768889 46 3831 758723 0.50 762554 47 3891 749840 0.52 753731 48 3912 741451 0.52 745363 49 3890 734875 0.53 738765 50 3633 726481 0.50 730114 51 3749 718235 0.52 721984 52 3716 710257 0.52 713973 53 3630 703099 0.51 706729 54 3630 692855 0.52 696485 55 3603 687766 0.52 691369 56 3581 680438 0.52 684019 57 3500 670292 0.52 673792 58 3444 664026 0.52 667470 59 3409 655225 0.52 658634 60 3338 647776 0.51 651114 61 3258 640954 0.51 644212 62 3279 633720 0.51 636999 63 3233 624071 0.52 627304 64 3188 619782 0.51 622970 65 3264 611333 0.53 614597 66 3150 603890 0.52 607040 67 3101 597804 0.52 600905 68 3007 588770 0.51 591777 69 3005 582729 0.51 585734 70 2923 574805 0.51 577728 71 2881 566890 0.51 569771 72 2912 560483 0.52 563395 73 2834 553316 0.51 556150 74 2842 547026 0.52 549868 75 2729 539054 0.50 541783 76 2755 532190 0.52 534945 77 2776 526504 0.52 529280 78 2668 517355 0.51 520023 79 2628 512657 0.51 515285 80 2652 506308 0.52 508960 81 2613 500412 0.52 503025 82 2486 494221 0.50 496707 83 2587 487428 0.53 490015 84 2511 481352 0.52 483863 85 2338 474411 0.49 476749 86 2378 468336 0.51 470714 87 2367 462138 0.51 464505 88 2338 455951 0.51 458289 89 2313 450613 0.51 452926 90 2298 444993 0.51 447291 91 2284 436653 0.52 438937 92 2231 431830 0.51 434061 93 2169 426204 0.51 428373 94 2194 421189 0.52 423383 95 2141 415605 0.51 417746 96 2057 410698 0.50 412755 97 2088 404048 0.51 406136 98 2038 398838 0.51 400876 99 2014 394059 0.51 396073 100 2031 388580 0.52 390611 101 1916 384235 0.50 386151 102 1968 379066 0.52 381034 103 1962 373124 0.52 375086 104 1911 369290 0.51 371201 105 1914 362783 0.52 364697 106 1923 358116 0.53 360039 107 1829 353797 0.51 355626 108 1783 349261 0.51 351044 109 1879 343917 0.54 345796 110 1801 339633 0.53 341434 111 1787 334409 0.53 336196 112 1655 328518 0.50 330173 113 1691 326459 0.52 328150 114 1729 321333 0.54 323062 115 1656 316688 0.52 318344 116 1628 311753 0.52 313381 117 1581 308121 0.51 309702 118 1610 304203 0.53 305813 119 1607 299859 0.53 301466 120 1611 296590 0.54 298201 121 1528 292016 0.52 293544 122 1553 287660 0.54 289213 123 1543 284227 0.54 285770 124 1476 280467 0.52 281943 125 1455 276461 0.52 277916 126 1482 272414 0.54 273896 127 1414 268693 0.52 270107 128 1456 264650 0.55 266106 129 1366 261446 0.52 262812 130 1334 257480 0.52 258814 131 1305 254703 0.51 256008 132 1288 250708 0.51 251996 133 1323 246562 0.53 247885 134 1325 243002 0.54 244327 135 1220 239344 0.51 240564 136 1244 236852 0.52 238096 137 1262 233339 0.54 234601 138 1145 229970 0.50 231115 139 1300 226975 0.57 228275 140 1162 224064 0.52 225226 141 1113 220234 0.50 221347 142 1172 216423 0.54 217595 143 1126 214256 0.52 215382 144 1093 210793 0.52 211886 145 1091 206672 0.53 207763 146 1089 204446 0.53 205535 147 1116 200997 0.55 202113 148 965 196503 0.49 197468 149 957 178795 0.53 179752 150 639 0 100.00 639 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 5055266 788363 86.51 5843629 2 4198476 1041893 80.12 5240369 3 3613879 1885845 65.71 5499724 4 3082381 2336161 56.89 5418542 5 2050224 2689201 43.26 4739425 6 1511709 2885099 34.38 4396808 7 1074593 2995133 26.40 4069726 8 761850 3048682 19.99 3810532 9 519249 3180707 14.03 3699956 10 345107 3322090 9.41 3667197 11 220567 3554628 5.84 3775195 12 141010 3649017 3.72 3790027 13 91192 3690409 2.41 3781601 14 58778 3714335 1.56 3773113 15 40477 3732484 1.07 3772961 16 31197 3743661 0.83 3774858 17 26693 3748981 0.71 3775674 18 24104 3742812 0.64 3766916 19 23087 3723480 0.62 3746567 20 23082 3697281 0.62 3720363 21 23044 3671660 0.62 3694704 22 23336 3639028 0.64 3662364 23 23347 3610098 0.64 3633445 24 22535 3584418 0.62 3606953 25 21539 3556388 0.60 3577927 26 21192 3529870 0.60 3551062 27 20545 3498951 0.58 3519496 28 20105 3475628 0.58 3495733 29 19705 3448753 0.57 3468458 30 19112 3418269 0.56 3437381 31 18723 3392777 0.55 3411500 32 18079 3365673 0.53 3383752 33 17871 3336198 0.53 3354069 34 17525 3308012 0.53 3325537 35 17108 3281263 0.52 3298371 36 16952 3253505 0.52 3270457 37 16667 3224129 0.51 3240796 38 16426 3196305 0.51 3212731 39 16315 3168640 0.51 3184955 40 16069 3143803 0.51 3159872 41 15698 3111887 0.50 3127585 42 15701 3079445 0.51 3095146 43 15705 3049406 0.51 3065111 44 15391 3021150 0.51 3036541 45 15340 2989849 0.51 3005189 46 15094 2958323 0.51 2973417 47 14974 2930959 0.51 2945933 48 14819 2897343 0.51 2912162 49 14791 2869862 0.51 2884653 50 14526 2844570 0.51 2859096 51 14201 2811098 0.50 2825299 52 13741 2778174 0.49 2791915 53 13956 2751224 0.50 2765180 54 13947 2717006 0.51 2730953 55 13481 2689381 0.50 2702862 56 13385 2660073 0.50 2673458 57 13404 2626635 0.51 2640039 58 13199 2597312 0.51 2610511 59 12795 2567539 0.50 2580334 60 12876 2536689 0.51 2549565 61 12771 2509669 0.51 2522440 62 12408 2481749 0.50 2494157 63 12500 2451152 0.51 2463652 64 12346 2420731 0.51 2433077 65 12316 2396044 0.51 2408360 66 12098 2366500 0.51 2378598 67 11696 2337977 0.50 2349673 68 11737 2310730 0.51 2322467 69 11546 2283272 0.50 2294818 70 11484 2256390 0.51 2267874 71 11221 2227225 0.50 2238446 72 11088 2200329 0.50 2211417 73 10774 2173521 0.49 2184295 74 10978 2145224 0.51 2156202 75 10867 2118015 0.51 2128882 76 10698 2093464 0.51 2104162 77 10373 2065877 0.50 2076250 78 10515 2039078 0.51 2049593 79 10242 2012959 0.51 2023201 80 10338 1989350 0.52 1999688 81 9891 1961361 0.50 1971252 82 9939 1942259 0.51 1952198 83 9683 1912631 0.50 1922314 84 9687 1890332 0.51 1900019 85 9577 1866685 0.51 1876262 86 9517 1844255 0.51 1853772 87 9272 1818661 0.51 1827933 88 9189 1794477 0.51 1803666 89 9004 1770869 0.51 1779873 90 8824 1749764 0.50 1758588 91 8848 1728287 0.51 1737135 92 8594 1705885 0.50 1714479 93 8564 1681428 0.51 1689992 94 8129 1660118 0.49 1668247 95 8273 1637142 0.50 1645415 96 8251 1615907 0.51 1624158 97 8088 1592046 0.51 1600134 98 8251 1574354 0.52 1582605 99 8032 1553822 0.51 1561854 100 7906 1531146 0.51 1539052 101 7738 1511882 0.51 1519620 102 7511 1493091 0.50 1500602 103 7541 1471826 0.51 1479367 104 7489 1454290 0.51 1461779 105 7339 1433069 0.51 1440408 106 7154 1412367 0.50 1419521 107 7054 1394995 0.50 1402049 108 6962 1374195 0.50 1381157 109 6791 1354688 0.50 1361479 110 6844 1338873 0.51 1345717 111 6685 1320585 0.50 1327270 112 6680 1304115 0.51 1310795 113 6444 1284098 0.50 1290542 114 6271 1267796 0.49 1274067 115 6352 1250591 0.51 1256943 116 6268 1235188 0.50 1241456 117 6151 1216374 0.50 1222525 118 6045 1200641 0.50 1206686 119 5884 1183508 0.49 1189392 120 5860 1166673 0.50 1172533 121 5870 1148845 0.51 1154715 122 5714 1135336 0.50 1141050 123 5736 1121539 0.51 1127275 124 5622 1103376 0.51 1108998 125 5587 1090834 0.51 1096421 126 5671 1075911 0.52 1081582 127 5450 1058728 0.51 1064178 128 5345 1046044 0.51 1051389 129 5231 1030623 0.50 1035854 130 5306 1015789 0.52 1021095 131 5130 1002199 0.51 1007329 132 5242 988638 0.53 993880 133 4944 974534 0.50 979478 134 4922 964115 0.51 969037 135 4916 948103 0.52 953019 136 4857 933571 0.52 938428 137 4771 919826 0.52 924597 138 4676 908079 0.51 912755 139 4519 893840 0.50 898359 140 4555 883317 0.51 887872 141 4507 869683 0.52 874190 142 4350 857969 0.50 862319 143 4417 845594 0.52 850011 144 4420 833331 0.53 837751 145 4292 820389 0.52 824681 146 4133 807794 0.51 811927 147 4190 793968 0.52 798158 148 3852 775524 0.49 779376 149 3348 707459 0.47 710807 150 2382 0 100.00 2382