CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 38002 794262 4.57 832264 2 115228 962813 10.69 1078041 3 93527 605111 13.39 698638 4 85387 849020 9.14 934407 5 96808 856888 10.15 953696 6 118069 1046306 10.14 1164375 7 105902 843392 11.16 949294 8 99155 818814 10.80 917969 9 90363 771351 10.49 861714 10 86172 731621 10.54 817793 11 82548 757409 9.83 839957 12 80977 702987 10.33 783964 13 81186 716446 10.18 797632 14 83968 746792 10.11 830760 15 83598 761619 9.89 845217 16 85569 782137 9.86 867706 17 88197 796936 9.96 885133 18 89967 814049 9.95 904016 19 90086 811493 9.99 901579 20 90417 811857 10.02 902274 21 90194 808770 10.03 898964 22 90761 804911 10.13 895672 23 90113 798174 10.14 888287 24 90303 804629 10.09 894932 25 89027 797081 10.05 886108 26 89161 794960 10.08 884121 27 89635 803430 10.04 893065 28 89806 803722 10.05 893528 29 89454 803818 10.01 893272 30 89891 806244 10.03 896135 31 89284 802948 10.01 892232 32 89203 801386 10.02 890589 33 89612 805270 10.01 894882 34 88628 799556 9.98 888184 35 89162 803136 9.99 892298 36 90361 806287 10.08 896648 37 88168 799389 9.93 887557 38 89299 804393 9.99 893692 39 89810 810873 9.97 900683 40 89065 806187 9.95 895252 41 89267 805603 9.98 894870 42 89849 810530 9.98 900379 43 88795 803280 9.95 892075 44 89640 802126 10.05 891766 45 89747 801842 10.07 891589 46 89019 799048 10.02 888067 47 88859 802582 9.97 891441 48 88939 808086 9.91 897025 49 88898 807337 9.92 896235 50 89218 804895 9.98 894113 51 90031 804801 10.06 894832 52 89530 804694 10.01 894224 53 89710 804164 10.04 893874 54 89252 804389 9.99 893641 55 89266 800808 10.03 890074 56 88956 799916 10.01 888872 57 89149 803132 9.99 892281 58 88287 800476 9.93 888763 59 89057 800979 10.01 890036 60 89232 804191 9.99 893423 61 88441 801074 9.94 889515 62 88939 801473 9.99 890412 63 89258 805900 9.97 895158 64 89367 805537 9.99 894904 65 88960 801508 9.99 890468 66 89102 803643 9.98 892745 67 88261 799101 9.95 887362 68 88640 801037 9.96 889677 69 89045 800080 10.01 889125 70 89003 799319 10.02 888322 71 89219 800374 10.03 889593 72 88976 803612 9.97 892588 73 88849 800953 9.99 889802 74 89177 801272 10.01 890449 75 88930 803391 9.97 892321 76 88448 800853 9.95 889301 77 88943 801773 9.99 890716 78 89298 800189 10.04 889487 79 88521 797463 9.99 885984 80 88532 800654 9.96 889186 81 88966 802416 9.98 891382 82 88847 800716 9.99 889563 83 89468 801437 10.04 890905 84 88533 803250 9.93 891783 85 88757 799696 9.99 888453 86 88681 800736 9.97 889417 87 89266 802348 10.01 891614 88 88816 800265 9.99 889081 89 88358 797544 9.97 885902 90 89203 800164 10.03 889367 91 88843 799532 10.00 888375 92 88909 800016 10.00 888925 93 88849 802729 9.97 891578 94 88669 798112 10.00 886781 95 88612 799874 9.97 888486 96 88621 801599 9.95 890220 97 89153 801844 10.01 890997 98 88527 800934 9.95 889461 99 88970 801425 9.99 890395 100 88420 797937 9.98 886357 101 88159 796588 9.96 884747 102 88664 800515 9.97 889179 103 87846 794056 9.96 881902 104 88319 797482 9.97 885801 105 88494 799957 9.96 888451 106 88406 798717 9.97 887123 107 88572 798425 9.99 886997 108 88233 797680 9.96 885913 109 87527 794889 9.92 882416 110 87682 795714 9.93 883396 111 87916 797788 9.93 885704 112 88824 796917 10.03 885741 113 88193 799479 9.94 887672 114 88238 799237 9.94 887475 115 87336 796455 9.88 883791 116 87751 795250 9.94 883001 117 88311 799217 9.95 887528 118 88574 795992 10.01 884566 119 88216 795476 9.98 883692 120 88247 798474 9.95 886721 121 87935 794476 9.97 882411 122 87301 794753 9.90 882054 123 87431 794309 9.92 881740 124 87021 794630 9.87 881651 125 87769 795958 9.93 883727 126 87909 796622 9.94 884531 127 87370 793900 9.91 881270 128 87875 793703 9.97 881578 129 87953 796354 9.95 884307 130 87068 792488 9.90 879556 131 86949 794223 9.87 881172 132 87588 796091 9.91 883679 133 87416 791887 9.94 879303 134 87235 793379 9.91 880614 135 87283 794517 9.90 881800 136 87538 794349 9.93 881887 137 87303 791876 9.93 879179 138 87364 792155 9.93 879519 139 87432 789543 9.97 876975 140 87178 790925 9.93 878103 141 86534 791790 9.85 878324 142 86811 787100 9.93 873911 143 86195 788634 9.85 874829 144 86808 791931 9.88 878739 145 86934 788092 9.94 875026 146 87314 789699 9.96 877013 147 87308 789711 9.96 877019 148 86746 787483 9.92 874229 149 85199 785774 9.78 870973 150 79967 745165 9.69 825132 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 10924 1780394 0.61 1791318 2 9680 1195454 0.80 1205134 3 6577 980688 0.67 987265 4 5993 1246910 0.48 1252903 5 6981 1492591 0.47 1499572 6 7040 1351870 0.52 1358910 7 6357 1167144 0.54 1173501 8 5540 1132575 0.49 1138115 9 5330 1070626 0.50 1075956 10 4993 1080862 0.46 1085855 11 4931 1110586 0.44 1115517 12 4909 1119534 0.44 1124443 13 4928 1127961 0.43 1132889 14 4858 1135464 0.43 1140322 15 5050 1159631 0.43 1164681 16 5185 1179339 0.44 1184524 17 5417 1201790 0.45 1207207 18 5473 1200517 0.45 1205990 19 5472 1203340 0.45 1208812 20 5218 1205327 0.43 1210545 21 5484 1203375 0.45 1208859 22 5224 1197039 0.43 1202263 23 5386 1191900 0.45 1197286 24 5285 1187497 0.44 1192782 25 5440 1190040 0.46 1195480 26 5262 1189218 0.44 1194480 27 5420 1195773 0.45 1201193 28 5420 1197923 0.45 1203343 29 5440 1192778 0.45 1198218 30 5372 1199760 0.45 1205132 31 5336 1199241 0.44 1204577 32 5400 1199062 0.45 1204462 33 5283 1197254 0.44 1202537 34 5452 1196887 0.45 1202339 35 5459 1194726 0.45 1200185 36 5376 1198404 0.45 1203780 37 5420 1202074 0.45 1207494 38 5470 1209930 0.45 1215400 39 5295 1202042 0.44 1207337 40 5263 1203675 0.44 1208938 41 5416 1199688 0.45 1205104 42 5378 1204982 0.44 1210360 43 5469 1200142 0.45 1205611 44 5581 1198046 0.46 1203627 45 5313 1197041 0.44 1202354 46 5538 1197204 0.46 1202742 47 5480 1196438 0.46 1201918 48 5467 1199862 0.45 1205329 49 5301 1200159 0.44 1205460 50 5407 1197071 0.45 1202478 51 5415 1201952 0.45 1207367 52 5461 1200956 0.45 1206417 53 5418 1200630 0.45 1206048 54 5454 1202232 0.45 1207686 55 5410 1196231 0.45 1201641 56 5450 1197367 0.45 1202817 57 5464 1195466 0.45 1200930 58 5369 1198414 0.45 1203783 59 5562 1195931 0.46 1201493 60 5572 1201961 0.46 1207533 61 5501 1208355 0.45 1213856 62 5459 1204544 0.45 1210003 63 5606 1206294 0.46 1211900 64 5354 1200856 0.44 1206210 65 5502 1195612 0.46 1201114 66 5418 1195725 0.45 1201143 67 5558 1194120 0.46 1199678 68 5514 1194280 0.46 1199794 69 5565 1201748 0.46 1207313 70 5478 1197930 0.46 1203408 71 5503 1195090 0.46 1200593 72 5519 1196874 0.46 1202393 73 5431 1195534 0.45 1200965 74 5486 1197876 0.46 1203362 75 5545 1200957 0.46 1206502 76 5571 1200846 0.46 1206417 77 5611 1196164 0.47 1201775 78 5554 1200108 0.46 1205662 79 5529 1196677 0.46 1202206 80 5512 1196240 0.46 1201752 81 5618 1197528 0.47 1203146 82 5565 1197373 0.46 1202938 83 5484 1196293 0.46 1201777 84 5704 1199736 0.47 1205440 85 5476 1201067 0.45 1206543 86 5582 1196467 0.46 1202049 87 5569 1194676 0.46 1200245 88 5514 1193900 0.46 1199414 89 5702 1192920 0.48 1198622 90 5649 1196770 0.47 1202419 91 5670 1193154 0.47 1198824 92 5572 1193582 0.46 1199154 93 5629 1198996 0.47 1204625 94 5701 1198306 0.47 1204007 95 5723 1196594 0.48 1202317 96 5656 1198699 0.47 1204355 97 5554 1192580 0.46 1198134 98 5743 1191062 0.48 1196805 99 5818 1194817 0.48 1200635 100 5612 1191699 0.47 1197311 101 5753 1189286 0.48 1195039 102 5613 1191211 0.47 1196824 103 5680 1191433 0.47 1197113 104 5814 1188398 0.49 1194212 105 5761 1192187 0.48 1197948 106 5671 1192339 0.47 1198010 107 5719 1187028 0.48 1192747 108 5951 1191288 0.50 1197239 109 5872 1192187 0.49 1198059 110 5991 1189264 0.50 1195255 111 5849 1190698 0.49 1196547 112 5904 1193943 0.49 1199847 113 5872 1189432 0.49 1195304 114 5948 1189358 0.50 1195306 115 5787 1186279 0.49 1192066 116 6074 1187297 0.51 1193371 117 6045 1185895 0.51 1191940 118 6061 1188149 0.51 1194210 119 6178 1189989 0.52 1196167 120 6171 1190682 0.52 1196853 121 6256 1184090 0.53 1190346 122 6101 1183799 0.51 1189900 123 6227 1187698 0.52 1193925 124 6267 1190998 0.52 1197265 125 6494 1185501 0.54 1191995 126 6398 1187680 0.54 1194078 127 6410 1186480 0.54 1192890 128 6540 1183045 0.55 1189585 129 6616 1185500 0.55 1192116 130 6636 1184090 0.56 1190726 131 6713 1179978 0.57 1186691 132 6649 1185499 0.56 1192148 133 6884 1182553 0.58 1189437 134 6779 1182961 0.57 1189740 135 6914 1182961 0.58 1189875 136 6987 1178703 0.59 1185690 137 7057 1175406 0.60 1182463 138 7121 1179469 0.60 1186590 139 7037 1177605 0.59 1184642 140 7106 1177939 0.60 1185045 141 7415 1175635 0.63 1183050 142 7240 1175411 0.61 1182651 143 7499 1175757 0.63 1183256 144 7695 1176058 0.65 1183753 145 7799 1179269 0.66 1187068 146 8068 1175858 0.68 1183926 147 8236 1175733 0.70 1183969 148 8487 1171821 0.72 1180308 149 9490 1167391 0.81 1176881 150 8525 1094818 0.77 1103343 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 23317 5078062 0.46 5101379 2 40785 4171637 0.97 4212422 3 23691 3558803 0.66 3582494 4 22959 4569554 0.50 4592513 5 23901 4802677 0.50 4826578 6 24456 4740086 0.51 4764542 7 23391 4193146 0.55 4216537 8 21512 4339989 0.49 4361501 9 21496 4422657 0.48 4444153 10 19757 4521540 0.44 4541297 11 19899 4807223 0.41 4827122 12 19228 4831613 0.40 4850841 13 18607 4845225 0.38 4863832 14 18986 4857922 0.39 4876908 15 19263 4832704 0.40 4851967 16 20227 4783096 0.42 4803323 17 21034 4770807 0.44 4791841 18 20792 4812185 0.43 4832977 19 21146 4814225 0.44 4835371 20 21198 4814128 0.44 4835326 21 20849 4802578 0.43 4823427 22 20584 4759773 0.43 4780357 23 20922 4745808 0.44 4766730 24 21023 4766266 0.44 4787289 25 20891 4765703 0.44 4786594 26 20916 4765502 0.44 4786418 27 21123 4779397 0.44 4800520 28 21290 4772622 0.44 4793912 29 21160 4792932 0.44 4814092 30 21158 4815203 0.44 4836361 31 21011 4800105 0.44 4821116 32 21287 4786672 0.44 4807959 33 21085 4813746 0.44 4834831 34 21068 4789567 0.44 4810635 35 20810 4791262 0.43 4812072 36 21134 4804862 0.44 4825996 37 20760 4796270 0.43 4817030 38 20994 4795657 0.44 4816651 39 21011 4812164 0.43 4833175 40 21054 4802940 0.44 4823994 41 21140 4797370 0.44 4818510 42 21249 4818950 0.44 4840199 43 21063 4794357 0.44 4815420 44 20862 4786143 0.43 4807005 45 21275 4797743 0.44 4819018 46 20926 4786407 0.44 4807333 47 21002 4783644 0.44 4804646 48 21103 4794866 0.44 4815969 49 20991 4778616 0.44 4799607 50 21360 4783821 0.44 4805181 51 21087 4797791 0.44 4818878 52 20964 4787607 0.44 4808571 53 21113 4786131 0.44 4807244 54 21021 4799730 0.44 4820751 55 21316 4791012 0.44 4812328 56 21226 4795906 0.44 4817132 57 21560 4808008 0.45 4829568 58 21295 4797611 0.44 4818906 59 21355 4791045 0.44 4812400 60 21090 4811618 0.44 4832708 61 21379 4790078 0.44 4811457 62 21219 4793110 0.44 4814329 63 21136 4795321 0.44 4816457 64 21199 4785508 0.44 4806707 65 21209 4770790 0.44 4791999 66 21213 4786510 0.44 4807723 67 21266 4780453 0.44 4801719 68 21400 4786748 0.45 4808148 69 21344 4798702 0.44 4820046 70 21366 4798175 0.44 4819541 71 21488 4793242 0.45 4814730 72 21517 4801814 0.45 4823331 73 21383 4792835 0.44 4814218 74 21165 4793211 0.44 4814376 75 21406 4803217 0.44 4824623 76 21473 4787530 0.45 4809003 77 21669 4784542 0.45 4806211 78 21362 4804150 0.44 4825512 79 21548 4788832 0.45 4810380 80 21564 4777500 0.45 4799064 81 21540 4793247 0.45 4814787 82 21832 4782960 0.45 4804792 83 21554 4780594 0.45 4802148 84 21667 4800240 0.45 4821907 85 21587 4783431 0.45 4805018 86 21731 4780434 0.45 4802165 87 21698 4790062 0.45 4811760 88 21832 4783290 0.45 4805122 89 21688 4787408 0.45 4809096 90 22199 4798637 0.46 4820836 91 22108 4782773 0.46 4804881 92 21978 4780390 0.46 4802368 93 21924 4787549 0.46 4809473 94 21833 4780744 0.45 4802577 95 22102 4772508 0.46 4794610 96 22347 4783113 0.47 4805460 97 22113 4776026 0.46 4798139 98 22087 4773003 0.46 4795090 99 22186 4786501 0.46 4808687 100 22331 4780761 0.46 4803092 101 22548 4781068 0.47 4803616 102 22424 4791196 0.47 4813620 103 22453 4775125 0.47 4797578 104 22721 4781525 0.47 4804246 105 22736 4789929 0.47 4812665 106 22729 4780289 0.47 4803018 107 23021 4779510 0.48 4802531 108 22716 4787891 0.47 4810607 109 22952 4776897 0.48 4799849 110 23002 4773337 0.48 4796339 111 23122 4780403 0.48 4803525 112 23150 4773404 0.48 4796554 113 22972 4769682 0.48 4792654 114 23543 4767845 0.49 4791388 115 23509 4765728 0.49 4789237 116 23513 4759359 0.49 4782872 117 23862 4775388 0.50 4799250 118 23972 4762264 0.50 4786236 119 24159 4760408 0.50 4784567 120 24070 4764401 0.50 4788471 121 24436 4762034 0.51 4786470 122 24783 4765750 0.52 4790533 123 24807 4778334 0.52 4803141 124 24908 4765791 0.52 4790699 125 25032 4763150 0.52 4788182 126 25596 4768886 0.53 4794482 127 25565 4752438 0.54 4778003 128 25728 4751718 0.54 4777446 129 25923 4753806 0.54 4779729 130 26283 4755933 0.55 4782216 131 26926 4757955 0.56 4784881 132 26905 4759277 0.56 4786182 133 26961 4750634 0.56 4777595 134 27612 4745320 0.58 4772932 135 27708 4747272 0.58 4774980 136 28028 4739980 0.59 4768008 137 28342 4738531 0.59 4766873 138 28747 4744103 0.60 4772850 139 29036 4735678 0.61 4764714 140 29692 4726676 0.62 4756368 141 29693 4733174 0.62 4762867 142 30515 4727263 0.64 4757778 143 30997 4728418 0.65 4759415 144 31848 4738873 0.67 4770721 145 32559 4737591 0.68 4770150 146 33017 4741870 0.69 4774887 147 33801 4743302 0.71 4777103 148 34908 4714648 0.73 4749556 149 33484 4676585 0.71 4710069 150 32083 4463972 0.71 4496055 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1621977 256860 86.33 1878837 2 564325 128393 81.47 692718 3 413517 196130 67.83 609647 4 482864 326948 59.63 809812 5 326573 368115 47.01 694688 6 247378 402043 38.09 649421 7 191777 507620 27.42 699397 8 170701 593365 22.34 764066 9 149895 666202 18.37 816097 10 130310 718434 15.35 848744 11 113572 763503 12.95 877075 12 106189 771158 12.10 877347 13 98990 767027 11.43 866017 14 94282 762758 11.00 857040 15 89647 759377 10.56 849024 16 87907 751883 10.47 839790 17 89002 749970 10.61 838972 18 87671 748476 10.49 836147 19 87865 748882 10.50 836747 20 88801 749451 10.59 838252 21 89108 750086 10.62 839194 22 89119 752411 10.59 841530 23 89861 753529 10.65 843390 24 89419 753253 10.61 842672 25 89469 756716 10.57 846185 26 89082 756936 10.53 846018 27 89285 760290 10.51 849575 28 90064 761163 10.58 851227 29 89589 761097 10.53 850686 30 89538 762841 10.50 852379 31 88887 764342 10.42 853229 32 88956 763532 10.43 852488 33 88995 763782 10.44 852777 34 89040 763881 10.44 852921 35 88160 760511 10.39 848671 36 88834 761645 10.45 850479 37 87581 762141 10.31 849722 38 87706 762304 10.32 850010 39 87744 759946 10.35 847690 40 87813 759007 10.37 846820 41 87281 758482 10.32 845763 42 86919 757327 10.30 844246 43 86866 756443 10.30 843309 44 86612 752222 10.33 838834 45 86189 753286 10.27 839475 46 86091 752407 10.27 838498 47 85699 750992 10.24 836691 48 85449 748139 10.25 833588 49 85192 746700 10.24 831892 50 85276 745290 10.27 830566 51 84907 742535 10.26 827442 52 84147 742443 10.18 826590 53 83688 739642 10.16 823330 54 83235 737707 10.14 820942 55 83036 736303 10.13 819339 56 83134 732058 10.20 815192 57 82725 730765 10.17 813490 58 82940 728420 10.22 811360 59 82040 727915 10.13 809955 60 81900 724769 10.15 806669 61 82057 722320 10.20 804377 62 81561 717763 10.20 799324 63 81213 716784 10.18 797997 64 80591 715408 10.12 795999 65 80656 710834 10.19 791490 66 80105 709327 10.15 789432 67 79954 707442 10.15 787396 68 79310 703364 10.13 782674 69 79058 701094 10.13 780152 70 78707 697792 10.14 776499 71 78416 695127 10.14 773543 72 77465 692791 10.06 770256 73 77430 689054 10.10 766484 74 77197 687499 10.10 764696 75 76963 682848 10.13 759811 76 76304 678990 10.10 755294 77 75736 676314 10.07 752050 78 75915 674069 10.12 749984 79 74740 671068 10.02 745808 80 75181 667365 10.12 742546 81 74551 664280 10.09 738831 82 73992 660372 10.08 734364 83 73963 655446 10.14 729409 84 72943 652818 10.05 725761 85 72837 649944 10.08 722781 86 72282 646916 10.05 719198 87 71765 642854 10.04 714619 88 71604 639469 10.07 711073 89 71375 636873 10.08 708248 90 71279 633181 10.12 704460 91 70284 630034 10.04 700318 92 70462 625136 10.13 695598 93 69989 621746 10.12 691735 94 69032 618208 10.04 687240 95 68561 615016 10.03 683577 96 68513 609124 10.11 677637 97 67978 605960 10.09 673938 98 67249 602734 10.04 669983 99 66991 597690 10.08 664681 100 66752 596585 10.06 663337 101 66122 590485 10.07 656607 102 65631 586717 10.06 652348 103 65055 582757 10.04 647812 104 64223 579235 9.98 643458 105 64017 575084 10.02 639101 106 63770 570915 10.05 634685 107 63673 565190 10.13 628863 108 62460 562482 9.99 624942 109 61804 558455 9.96 620259 110 61660 553638 10.02 615298 111 60668 551052 9.92 611720 112 60686 545120 10.02 605806 113 59918 540963 9.97 600881 114 59817 538023 10.01 597840 115 58727 533455 9.92 592182 116 58654 528960 9.98 587614 117 57760 525056 9.91 582816 118 57629 521059 9.96 578688 119 57302 515480 10.00 572782 120 56353 512070 9.91 568423 121 56162 507736 9.96 563898 122 55705 502915 9.97 558620 123 54982 499312 9.92 554294 124 54757 493542 9.99 548299 125 54007 490911 9.91 544918 126 53545 486349 9.92 539894 127 53040 481652 9.92 534692 128 52779 477854 9.95 530633 129 52134 473854 9.91 525988 130 51694 469621 9.92 521315 131 51302 464825 9.94 516127 132 50656 460412 9.91 511068 133 50028 456796 9.87 506824 134 50189 452467 9.98 502656 135 49233 447218 9.92 496451 136 48272 442620 9.83 490892 137 47762 438072 9.83 485834 138 47225 434734 9.80 481959 139 47182 430248 9.88 477430 140 46911 425325 9.93 472236 141 45914 421210 9.83 467124 142 45545 416146 9.86 461691 143 44960 412719 9.82 457679 144 44566 407926 9.85 452492 145 44093 403184 9.86 447277 146 43323 399114 9.79 442437 147 43046 394428 9.84 437474 148 42527 387087 9.90 429614 149 41094 349566 10.52 390660 150 37363 0 100.00 37363 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1941858 308651 86.29 2250509 2 1715425 429235 79.99 2144660 3 518118 239035 68.43 757153 4 499439 354088 58.51 853527 5 414297 530294 43.86 944591 6 271695 516142 34.49 787837 7 199063 585961 25.36 785024 8 135522 741240 15.46 876762 9 95955 868158 9.95 964113 10 64461 990260 6.11 1054721 11 42897 1082489 3.81 1125386 12 28262 1114239 2.47 1142501 13 18436 1117895 1.62 1136331 14 12683 1117123 1.12 1129806 15 8991 1116122 0.80 1125113 16 7127 1118508 0.63 1125635 17 6754 1112965 0.60 1119719 18 5950 1109858 0.53 1115808 19 6070 1107581 0.55 1113651 20 5985 1106591 0.54 1112576 21 5752 1104976 0.52 1110728 22 6303 1108210 0.57 1114513 23 5847 1110803 0.52 1116650 24 5430 1113389 0.49 1118819 25 5536 1115276 0.49 1120812 26 5427 1120245 0.48 1125672 27 5545 1118452 0.49 1123997 28 5686 1122211 0.50 1127897 29 5379 1122528 0.48 1127907 30 5324 1125177 0.47 1130501 31 5351 1125391 0.47 1130742 32 5185 1126296 0.46 1131481 33 5210 1126557 0.46 1131767 34 5151 1127427 0.45 1132578 35 5098 1127547 0.45 1132645 36 5132 1125038 0.45 1130170 37 5217 1127018 0.46 1132235 38 5088 1125268 0.45 1130356 39 5026 1125391 0.44 1130417 40 5018 1122194 0.45 1127212 41 5154 1123532 0.46 1128686 42 5098 1121189 0.45 1126287 43 4995 1116308 0.45 1121303 44 5111 1116344 0.46 1121455 45 5029 1113884 0.45 1118913 46 4984 1110724 0.45 1115708 47 5010 1107759 0.45 1112769 48 4948 1106970 0.44 1111918 49 4960 1105141 0.45 1110101 50 4846 1101247 0.44 1106093 51 4893 1098446 0.44 1103339 52 4973 1096489 0.45 1101462 53 5038 1093032 0.46 1098070 54 4998 1088799 0.46 1093797 55 4834 1087045 0.44 1091879 56 4880 1085563 0.45 1090443 57 4735 1079374 0.44 1084109 58 4862 1074285 0.45 1079147 59 4775 1074797 0.44 1079572 60 4726 1068594 0.44 1073320 61 4795 1066153 0.45 1070948 62 4845 1061898 0.45 1066743 63 4702 1056839 0.44 1061541 64 4795 1054299 0.45 1059094 65 4806 1053334 0.45 1058140 66 4756 1047569 0.45 1052325 67 4642 1044528 0.44 1049170 68 4638 1038670 0.44 1043308 69 4753 1034676 0.46 1039429 70 4544 1030632 0.44 1035176 71 4614 1026762 0.45 1031376 72 4507 1020303 0.44 1024810 73 4623 1017570 0.45 1022193 74 4689 1013952 0.46 1018641 75 4703 1008987 0.46 1013690 76 4553 1005046 0.45 1009599 77 4461 998195 0.44 1002656 78 4526 995313 0.45 999839 79 4476 992167 0.45 996643 80 4394 986498 0.44 990892 81 4394 982026 0.45 986420 82 4399 977465 0.45 981864 83 4352 972121 0.45 976473 84 4353 965531 0.45 969884 85 4232 960294 0.44 964526 86 4286 956173 0.45 960459 87 4397 949916 0.46 954313 88 4114 944961 0.43 949075 89 4126 939950 0.44 944076 90 4216 933410 0.45 937626 91 4220 931476 0.45 935696 92 4175 923867 0.45 928042 93 4132 917230 0.45 921362 94 4172 909736 0.46 913908 95 4173 906794 0.46 910967 96 4182 901334 0.46 905516 97 3973 893154 0.44 897127 98 4035 889186 0.45 893221 99 3946 883700 0.44 887646 100 4015 876116 0.46 880131 101 3904 872575 0.45 876479 102 3835 866785 0.44 870620 103 3909 860764 0.45 864673 104 3819 855353 0.44 859172 105 3823 846473 0.45 850296 106 3877 841482 0.46 845359 107 3782 835630 0.45 839412 108 3778 828257 0.45 832035 109 3787 822067 0.46 825854 110 3668 815890 0.45 819558 111 3764 812129 0.46 815893 112 3745 806169 0.46 809914 113 3636 799088 0.45 802724 114 3586 792689 0.45 796275 115 3609 787456 0.46 791065 116 3584 779641 0.46 783225 117 3338 773110 0.43 776448 118 3548 768300 0.46 771848 119 3502 759344 0.46 762846 120 3378 753547 0.45 756925 121 3341 747457 0.44 750798 122 3357 739758 0.45 743115 123 3294 733833 0.45 737127 124 3187 729119 0.44 732306 125 3314 722021 0.46 725335 126 3374 712670 0.47 716044 127 3177 709397 0.45 712574 128 3239 701401 0.46 704640 129 3087 695536 0.44 698623 130 3117 688630 0.45 691747 131 3035 683541 0.44 686576 132 3144 675660 0.46 678804 133 3029 668500 0.45 671529 134 3049 661909 0.46 664958 135 3031 656897 0.46 659928 136 2970 649555 0.46 652525 137 2944 641976 0.46 644920 138 2901 635426 0.45 638327 139 2855 630565 0.45 633420 140 2891 623246 0.46 626137 141 2882 616259 0.47 619141 142 2903 608102 0.48 611005 143 2778 602617 0.46 605395 144 2737 594925 0.46 597662 145 2708 589282 0.46 591990 146 2620 584421 0.45 587041 147 2743 575872 0.47 578615 148 2514 566008 0.44 568522 149 2211 522677 0.42 524888 150 1733 0 100.00 1733 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 5677317 897842 86.34 6575159 2 4749480 1171824 80.21 5921304 3 4086963 2150469 65.52 6237432 4 3518880 2650212 57.04 6169092 5 2357129 3071397 43.42 5428526 6 1738626 3286683 34.60 5025309 7 1233005 3428278 26.45 4661283 8 870451 3516604 19.84 4387055 9 591268 3707687 13.75 4298955 10 389752 3940699 9.00 4330451 11 246733 4267336 5.47 4514069 12 156437 4404451 3.43 4560888 13 98362 4464596 2.16 4562958 14 61894 4498210 1.36 4560104 15 41531 4525654 0.91 4567185 16 30925 4556436 0.67 4587361 17 26602 4571193 0.58 4597795 18 23851 4577077 0.52 4600928 19 23124 4581333 0.50 4604457 20 23661 4575997 0.51 4599658 21 23628 4566055 0.51 4589683 22 24236 4573277 0.53 4597513 23 25097 4568841 0.55 4593938 24 24599 4565635 0.54 4590234 25 23829 4562196 0.52 4586025 26 23141 4560096 0.50 4583237 27 22707 4557283 0.50 4579990 28 22400 4558626 0.49 4581026 29 22050 4558210 0.48 4580260 30 21796 4554371 0.48 4576167 31 21142 4552925 0.46 4574067 32 21101 4547092 0.46 4568193 33 20800 4534084 0.46 4554884 34 20542 4523332 0.45 4543874 35 20042 4518161 0.44 4538203 36 19757 4510555 0.44 4530312 37 19903 4506549 0.44 4526452 38 19664 4502093 0.43 4521757 39 19758 4495084 0.44 4514842 40 19599 4488547 0.43 4508146 41 19553 4483472 0.43 4503025 42 19373 4472053 0.43 4491426 43 19255 4463189 0.43 4482444 44 19415 4449628 0.43 4469043 45 19162 4435183 0.43 4454345 46 19256 4423352 0.43 4442608 47 19276 4419041 0.43 4438317 48 19256 4406202 0.44 4425458 49 18800 4396894 0.43 4415694 50 18987 4390550 0.43 4409537 51 19215 4380397 0.44 4399612 52 18952 4363637 0.43 4382589 53 18940 4350204 0.43 4369144 54 18942 4337741 0.43 4356683 55 18840 4325002 0.43 4343842 56 18722 4308733 0.43 4327455 57 18674 4298560 0.43 4317234 58 18685 4282539 0.43 4301224 59 18593 4271167 0.43 4289760 60 18637 4254923 0.44 4273560 61 18275 4241737 0.43 4260012 62 18258 4230454 0.43 4248712 63 18238 4214893 0.43 4233131 64 18293 4195451 0.43 4213744 65 18363 4179821 0.44 4198184 66 18258 4163757 0.44 4182015 67 18204 4147754 0.44 4165958 68 18079 4137392 0.44 4155471 69 17817 4119541 0.43 4137358 70 18009 4104056 0.44 4122065 71 17716 4085078 0.43 4102794 72 17722 4068872 0.43 4086594 73 17745 4050767 0.44 4068512 74 17637 4033818 0.44 4051455 75 17512 4013372 0.43 4030884 76 17307 3997258 0.43 4014565 77 17386 3973254 0.44 3990640 78 17275 3955015 0.43 3972290 79 16864 3935402 0.43 3952266 80 16933 3918719 0.43 3935652 81 16981 3899587 0.43 3916568 82 17053 3882661 0.44 3899714 83 16828 3864400 0.43 3881228 84 16590 3841940 0.43 3858530 85 16568 3820792 0.43 3837360 86 16643 3803681 0.44 3820324 87 16330 3783347 0.43 3799677 88 16419 3758603 0.43 3775022 89 16173 3739325 0.43 3755498 90 16270 3714157 0.44 3730427 91 16097 3693157 0.43 3709254 92 16124 3675112 0.44 3691236 93 15749 3648867 0.43 3664616 94 15770 3629065 0.43 3644835 95 15547 3609016 0.43 3624563 96 15596 3585465 0.43 3601061 97 15390 3563898 0.43 3579288 98 15205 3539669 0.43 3554874 99 15207 3513826 0.43 3529033 100 15358 3490683 0.44 3506041 101 15035 3468601 0.43 3483636 102 14963 3442617 0.43 3457580 103 14818 3420708 0.43 3435526 104 14755 3393764 0.43 3408519 105 14855 3374774 0.44 3389629 106 14471 3344650 0.43 3359121 107 14404 3323617 0.43 3338021 108 14440 3299794 0.44 3314234 109 14323 3271523 0.44 3285846 110 14067 3251010 0.43 3265077 111 14077 3224617 0.43 3238694 112 13809 3200637 0.43 3214446 113 13759 3178513 0.43 3192272 114 13635 3149247 0.43 3162882 115 13688 3124956 0.44 3138644 116 13353 3100821 0.43 3114174 117 13425 3073214 0.43 3086639 118 13205 3047486 0.43 3060691 119 13120 3023620 0.43 3036740 120 13243 2992538 0.44 3005781 121 12964 2969475 0.43 2982439 122 12718 2944283 0.43 2957001 123 12673 2917006 0.43 2929679 124 12485 2893840 0.43 2906325 125 12478 2869842 0.43 2882320 126 12347 2842910 0.43 2855257 127 12175 2816629 0.43 2828804 128 12243 2787472 0.44 2799715 129 12069 2764285 0.43 2776354 130 12094 2735563 0.44 2747657 131 11960 2713416 0.44 2725376 132 11647 2683777 0.43 2695424 133 11775 2662963 0.44 2674738 134 11624 2634424 0.44 2646048 135 11436 2607088 0.44 2618524 136 11381 2581293 0.44 2592674 137 11304 2555185 0.44 2566489 138 11252 2527544 0.44 2538796 139 11134 2503918 0.44 2515052 140 10964 2476285 0.44 2487249 141 10862 2449387 0.44 2460249 142 10736 2422322 0.44 2433058 143 10663 2396965 0.44 2407628 144 10443 2370188 0.44 2380631 145 10329 2344712 0.44 2355041 146 10169 2318602 0.44 2328771 147 10006 2287323 0.44 2297329 148 9286 2250025 0.41 2259311 149 8235 2083865 0.39 2092100 150 6276 0 100.00 6276