CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 46581 903753 4.90 950334 2 108318 1031656 9.50 1139974 3 86855 721268 10.75 808123 4 79042 965479 7.57 1044521 5 92138 953118 8.81 1045256 6 103416 1133033 8.36 1236449 7 95702 940851 9.23 1036553 8 89975 933604 8.79 1023579 9 84615 900099 8.59 984714 10 82048 873723 8.58 955771 11 78833 899151 8.06 977984 12 78015 855411 8.36 933426 13 78646 862880 8.35 941526 14 79611 892309 8.19 971920 15 80260 901275 8.18 981535 16 80335 917631 8.05 997966 17 81677 921973 8.14 1003650 18 83204 937264 8.15 1020468 19 83011 928160 8.21 1011171 20 83107 936545 8.15 1019652 21 83598 937920 8.18 1021518 22 83322 932293 8.20 1015615 23 82536 930186 8.15 1012722 24 83438 932563 8.21 1016001 25 81379 926048 8.08 1007427 26 81470 921323 8.12 1002793 27 82299 927941 8.15 1010240 28 81630 932591 8.05 1014221 29 81719 928986 8.09 1010705 30 82140 933131 8.09 1015271 31 81551 931446 8.05 1012997 32 81644 925384 8.11 1007028 33 81958 934444 8.06 1016402 34 81052 927299 8.04 1008351 35 81027 926625 8.04 1007652 36 81725 935272 8.04 1016997 37 81103 929443 8.03 1010546 38 81050 927762 8.03 1008812 39 81470 935892 8.01 1017362 40 81665 930326 8.07 1011991 41 81389 929027 8.05 1010416 42 81890 940939 8.01 1022829 43 80984 926823 8.04 1007807 44 81346 930593 8.04 1011939 45 81063 931023 8.01 1012086 46 80649 930254 7.98 1010903 47 80518 929361 7.97 1009879 48 81058 940033 7.94 1021091 49 80933 933323 7.98 1014256 50 81622 932120 8.05 1013742 51 81379 937152 7.99 1018531 52 81003 932766 7.99 1013769 53 81390 929800 8.05 1011190 54 81238 943276 7.93 1024514 55 80706 928664 8.00 1009370 56 80567 933305 7.95 1013872 57 81681 935027 8.03 1016708 58 80656 931221 7.97 1011877 59 81272 932398 8.02 1013670 60 81546 936639 8.01 1018185 61 80708 929490 7.99 1010198 62 81310 937800 7.98 1019110 63 81251 935917 7.99 1017168 64 80994 933527 7.98 1014521 65 80872 930692 7.99 1011564 66 80838 934261 7.96 1015099 67 80584 923742 8.02 1004326 68 81445 934190 8.02 1015635 69 81170 934215 7.99 1015385 70 80894 928653 8.01 1009547 71 81797 931997 8.07 1013794 72 81121 935432 7.98 1016553 73 80920 928223 8.02 1009143 74 81852 933131 8.06 1014983 75 81855 933892 8.06 1015747 76 81763 931305 8.07 1013068 77 81283 934497 8.00 1015780 78 81544 931891 8.05 1013435 79 81225 927760 8.05 1008985 80 81043 928107 8.03 1009150 81 81446 930681 8.05 1012127 82 81552 930657 8.06 1012209 83 81145 930431 8.02 1011576 84 81534 933800 8.03 1015334 85 81062 930212 8.02 1011274 86 81532 927929 8.08 1009461 87 81891 929478 8.10 1011369 88 81523 925636 8.09 1007159 89 81694 919735 8.16 1001429 90 82027 926574 8.13 1008601 91 81527 924888 8.10 1006415 92 81709 920151 8.16 1001860 93 81562 926762 8.09 1008324 94 81690 920736 8.15 1002426 95 81571 921609 8.13 1003180 96 82214 926011 8.15 1008225 97 82014 923245 8.16 1005259 98 82149 921879 8.18 1004028 99 82345 923351 8.19 1005696 100 82507 920646 8.22 1003153 101 81827 914238 8.22 996065 102 81940 918993 8.19 1000933 103 81709 912133 8.22 993842 104 82152 912695 8.26 994847 105 82363 917752 8.24 1000115 106 81280 913973 8.17 995253 107 82716 909279 8.34 991995 108 82253 916358 8.24 998611 109 82450 904729 8.35 987179 110 82288 906077 8.33 988365 111 82861 907008 8.37 989869 112 82751 902148 8.40 984899 113 83288 903837 8.44 987125 114 83261 903254 8.44 986515 115 83206 897353 8.49 980559 116 82925 900380 8.43 983305 117 83580 896408 8.53 979988 118 84191 891549 8.63 975740 119 83502 891221 8.57 974723 120 84042 893897 8.59 977939 121 83797 886420 8.64 970217 122 83814 883683 8.66 967497 123 84224 885895 8.68 970119 124 84514 880935 8.75 965449 125 84226 875539 8.78 959765 126 84641 875538 8.82 960179 127 84215 869110 8.83 953325 128 85464 871167 8.93 956631 129 85079 868206 8.92 953285 130 85224 860773 9.01 945997 131 85126 863396 8.97 948522 132 86559 860078 9.14 946637 133 86027 855079 9.14 941106 134 86026 854328 9.15 940354 135 86379 851500 9.21 937879 136 86611 849518 9.25 936129 137 86394 843023 9.30 929417 138 87177 838473 9.42 925650 139 87095 835865 9.44 922960 140 86862 830258 9.47 917120 141 87158 828245 9.52 915403 142 86683 819938 9.56 906621 143 87419 819156 9.64 906575 144 87526 818676 9.66 906202 145 87266 809830 9.73 897096 146 87919 803065 9.87 890984 147 89358 806251 9.98 895609 148 88691 795963 10.03 884654 149 88916 789092 10.13 878008 150 94857 757782 11.13 852639 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 16376 1580647 1.03 1597023 2 13004 1156364 1.11 1169368 3 7953 1029375 0.77 1037328 4 7271 1264697 0.57 1271968 5 8707 1460571 0.59 1469278 6 7906 1345793 0.58 1353699 7 7506 1182292 0.63 1189798 8 6501 1178570 0.55 1185071 9 6247 1158198 0.54 1164445 10 6004 1165946 0.51 1171950 11 6021 1195088 0.50 1201109 12 5722 1202484 0.47 1208206 13 5628 1199736 0.47 1205364 14 5736 1204696 0.47 1210432 15 5785 1222530 0.47 1228315 16 5817 1235327 0.47 1241144 17 6008 1248557 0.48 1254565 18 5973 1244995 0.48 1250968 19 5878 1244587 0.47 1250465 20 5900 1251298 0.47 1257198 21 5915 1259364 0.47 1265279 22 5873 1250911 0.47 1256784 23 5729 1245909 0.46 1251638 24 5778 1243176 0.46 1248954 25 5731 1240494 0.46 1246225 26 5905 1242297 0.47 1248202 27 5888 1253769 0.47 1259657 28 5777 1249989 0.46 1255766 29 5821 1249852 0.46 1255673 30 6140 1258290 0.49 1264430 31 5969 1255865 0.47 1261834 32 6164 1259022 0.49 1265186 33 5977 1257773 0.47 1263750 34 5982 1255842 0.47 1261824 35 6083 1254440 0.48 1260523 36 6045 1261283 0.48 1267328 37 5869 1257111 0.46 1262980 38 6041 1262103 0.48 1268144 39 5972 1264531 0.47 1270503 40 6022 1263353 0.47 1269375 41 6137 1263544 0.48 1269681 42 5977 1267480 0.47 1273457 43 6068 1260743 0.48 1266811 44 6111 1258207 0.48 1264318 45 6164 1261181 0.49 1267345 46 6147 1253709 0.49 1259856 47 6163 1254399 0.49 1260562 48 6275 1263863 0.49 1270138 49 6242 1259167 0.49 1265409 50 6273 1257185 0.50 1263458 51 6175 1263684 0.49 1269859 52 6309 1259620 0.50 1265929 53 6439 1262980 0.51 1269419 54 6375 1263326 0.50 1269701 55 6471 1258477 0.51 1264948 56 6486 1258301 0.51 1264787 57 6485 1259030 0.51 1265515 58 6640 1262042 0.52 1268682 59 6645 1255626 0.53 1262271 60 6734 1267257 0.53 1273991 61 6751 1265436 0.53 1272187 62 6663 1265842 0.52 1272505 63 6808 1270110 0.53 1276918 64 6883 1263494 0.54 1270377 65 6678 1255703 0.53 1262381 66 6899 1256981 0.55 1263880 67 6887 1254978 0.55 1261865 68 6913 1256657 0.55 1263570 69 7214 1262361 0.57 1269575 70 7125 1257603 0.56 1264728 71 7152 1256092 0.57 1263244 72 7166 1259506 0.57 1266672 73 7332 1256003 0.58 1263335 74 7378 1258168 0.58 1265546 75 7388 1260843 0.58 1268231 76 7344 1262271 0.58 1269615 77 7644 1255705 0.61 1263349 78 7580 1260630 0.60 1268210 79 7701 1254600 0.61 1262301 80 7736 1256478 0.61 1264214 81 7831 1257557 0.62 1265388 82 7830 1251980 0.62 1259810 83 8005 1254408 0.63 1262413 84 8068 1262123 0.64 1270191 85 8237 1254334 0.65 1262571 86 8149 1249604 0.65 1257753 87 8292 1253390 0.66 1261682 88 8628 1247704 0.69 1256332 89 8565 1250522 0.68 1259087 90 8779 1253362 0.70 1262141 91 8805 1243468 0.70 1252273 92 9067 1243319 0.72 1252386 93 9100 1248955 0.72 1258055 94 9242 1248665 0.73 1257907 95 9336 1245905 0.74 1255241 96 9395 1249331 0.75 1258726 97 9795 1241510 0.78 1251305 98 10025 1241771 0.80 1251796 99 10196 1242930 0.81 1253126 100 10211 1239400 0.82 1249611 101 10382 1234037 0.83 1244419 102 10712 1234520 0.86 1245232 103 10924 1230765 0.88 1241689 104 10991 1232853 0.88 1243844 105 11385 1234424 0.91 1245809 106 11640 1229817 0.94 1241457 107 11900 1225860 0.96 1237760 108 12019 1228167 0.97 1240186 109 12410 1224495 1.00 1236905 110 12678 1223885 1.03 1236563 111 12900 1223938 1.04 1236838 112 13414 1218452 1.09 1231866 113 13679 1215210 1.11 1228889 114 14068 1213413 1.15 1227481 115 14397 1208811 1.18 1223208 116 14832 1206803 1.21 1221635 117 15195 1208819 1.24 1224014 118 15552 1206072 1.27 1221624 119 16133 1202893 1.32 1219026 120 16457 1201748 1.35 1218205 121 16584 1194602 1.37 1211186 122 17396 1191886 1.44 1209282 123 17809 1191370 1.47 1209179 124 18376 1188635 1.52 1207011 125 18700 1182464 1.56 1201164 126 19532 1182431 1.63 1201963 127 20075 1177060 1.68 1197135 128 20169 1170912 1.69 1191081 129 21122 1167205 1.78 1188327 130 21647 1163859 1.83 1185506 131 22081 1160696 1.87 1182777 132 22552 1159505 1.91 1182057 133 23134 1148782 1.97 1171916 134 23958 1144302 2.05 1168260 135 24749 1143393 2.12 1168142 136 24963 1135783 2.15 1160746 137 25396 1128355 2.20 1153751 138 26101 1124887 2.27 1150988 139 26826 1118245 2.34 1145071 140 27659 1114775 2.42 1142434 141 27948 1109824 2.46 1137772 142 29182 1101801 2.58 1130983 143 29654 1094970 2.64 1124624 144 30494 1097232 2.70 1127726 145 31498 1088180 2.81 1119678 146 33253 1083765 2.98 1117018 147 34562 1079056 3.10 1113618 148 34903 1071019 3.16 1105922 149 46900 1073250 4.19 1120150 150 43833 1006854 4.17 1050687 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 29006 4178462 0.69 4207468 2 50459 3702019 1.34 3752478 3 26880 3434452 0.78 3461332 4 25255 4251315 0.59 4276570 5 26905 4385781 0.61 4412686 6 25054 4356552 0.57 4381606 7 24754 3944009 0.62 3968763 8 22692 4134034 0.55 4156726 9 22161 4242587 0.52 4264748 10 21022 4278229 0.49 4299251 11 21187 4446196 0.47 4467383 12 20362 4431221 0.46 4451583 13 19763 4422858 0.44 4442621 14 19510 4434804 0.44 4454314 15 20592 4432149 0.46 4452741 16 20532 4397683 0.46 4418215 17 21076 4394610 0.48 4415686 18 21250 4433552 0.48 4454802 19 21408 4436817 0.48 4458225 20 21447 4452496 0.48 4473943 21 22089 4476990 0.49 4499079 22 22106 4446190 0.49 4468296 23 22199 4440039 0.50 4462238 24 22485 4477180 0.50 4499665 25 22530 4484872 0.50 4507402 26 22988 4498641 0.51 4521629 27 23279 4530487 0.51 4553766 28 23240 4525461 0.51 4548701 29 23394 4543893 0.51 4567287 30 23481 4575306 0.51 4598787 31 22906 4558455 0.50 4581361 32 23302 4556091 0.51 4579393 33 22902 4579589 0.50 4602491 34 22670 4549476 0.50 4572146 35 22636 4563449 0.49 4586085 36 22418 4580793 0.49 4603211 37 22395 4570566 0.49 4592961 38 22529 4570514 0.49 4593043 39 22994 4597442 0.50 4620436 40 22446 4578517 0.49 4600963 41 22542 4579011 0.49 4601553 42 22797 4593579 0.49 4616376 43 22693 4565141 0.49 4587834 44 22694 4561878 0.50 4584572 45 23073 4575947 0.50 4599020 46 22968 4566944 0.50 4589912 47 23377 4562535 0.51 4585912 48 23249 4585583 0.50 4608832 49 23205 4564730 0.51 4587935 50 23326 4568670 0.51 4591996 51 23562 4581405 0.51 4604967 52 23491 4573199 0.51 4596690 53 23664 4560913 0.52 4584577 54 24149 4575004 0.53 4599153 55 24157 4566643 0.53 4590800 56 24162 4574319 0.53 4598481 57 24469 4593773 0.53 4618242 58 24270 4571270 0.53 4595540 59 24480 4563487 0.53 4587967 60 25125 4590185 0.54 4615310 61 25190 4561792 0.55 4586982 62 24739 4564165 0.54 4588904 63 25404 4577035 0.55 4602439 64 25173 4553189 0.55 4578362 65 25585 4547743 0.56 4573328 66 25559 4568806 0.56 4594365 67 26029 4554957 0.57 4580986 68 26076 4559254 0.57 4585330 69 26527 4574779 0.58 4601306 70 26651 4567176 0.58 4593827 71 27103 4561415 0.59 4588518 72 27450 4578867 0.60 4606317 73 27332 4558994 0.60 4586326 74 27458 4560608 0.60 4588066 75 28036 4567717 0.61 4595753 76 28222 4554204 0.62 4582426 77 28537 4546972 0.62 4575509 78 28981 4563568 0.63 4592549 79 29378 4542988 0.64 4572366 80 29666 4537103 0.65 4566769 81 29995 4552374 0.65 4582369 82 30059 4541893 0.66 4571952 83 30584 4540623 0.67 4571207 84 31001 4558438 0.68 4589439 85 31504 4527554 0.69 4559058 86 31925 4520893 0.70 4552818 87 32252 4540129 0.71 4572381 88 32635 4531947 0.71 4564582 89 33563 4528778 0.74 4562341 90 34183 4538425 0.75 4572608 91 34590 4518760 0.76 4553350 92 34915 4515644 0.77 4550559 93 35569 4531409 0.78 4566978 94 35911 4509422 0.79 4545333 95 36333 4503715 0.80 4540048 96 36931 4518307 0.81 4555238 97 38367 4494221 0.85 4532588 98 38689 4499527 0.85 4538216 99 40013 4506411 0.88 4546424 100 40085 4493647 0.88 4533732 101 41075 4492695 0.91 4533770 102 42417 4502693 0.93 4545110 103 42974 4481434 0.95 4524408 104 43897 4476461 0.97 4520358 105 45629 4486096 1.01 4531725 106 45964 4464482 1.02 4510446 107 47530 4460014 1.05 4507544 108 48981 4466578 1.08 4515559 109 49943 4448189 1.11 4498132 110 51149 4445151 1.14 4496300 111 52401 4443472 1.17 4495873 112 53518 4432368 1.19 4485886 113 54989 4419373 1.23 4474362 114 57134 4427163 1.27 4484297 115 58384 4409722 1.31 4468106 116 59812 4396706 1.34 4456518 117 61795 4402982 1.38 4464777 118 63624 4379441 1.43 4443065 119 65684 4370957 1.48 4436641 120 67505 4372206 1.52 4439711 121 69152 4352299 1.56 4421451 122 71446 4349483 1.62 4420929 123 73799 4358688 1.66 4432487 124 75640 4335944 1.71 4411584 125 78112 4318997 1.78 4397109 126 80624 4319315 1.83 4399939 127 82040 4292046 1.88 4374086 128 84945 4278247 1.95 4363192 129 86886 4276209 1.99 4363095 130 89735 4253735 2.07 4343470 131 91928 4244043 2.12 4335971 132 94635 4240915 2.18 4335550 133 97492 4214825 2.26 4312317 134 99936 4196143 2.33 4296079 135 102743 4184168 2.40 4286911 136 104847 4160261 2.46 4265108 137 107541 4142760 2.53 4250301 138 110619 4135319 2.61 4245938 139 112778 4110636 2.67 4223414 140 115599 4095876 2.74 4211475 141 118622 4081371 2.82 4199993 142 121352 4055170 2.91 4176522 143 124479 4040216 2.99 4164695 144 129396 4040262 3.10 4169658 145 132410 4017380 3.19 4149790 146 137894 4006759 3.33 4144653 147 147040 4003241 3.54 4150281 148 148525 3960681 3.61 4109206 149 144979 3907743 3.58 4052722 150 143064 3724423 3.70 3867487 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1488251 226357 86.80 1714608 2 516098 118016 81.39 634114 3 386553 181230 68.08 567783 4 437884 303815 59.04 741699 5 292559 342223 46.09 634782 6 222544 378096 37.05 600640 7 171164 468678 26.75 639842 8 149218 541165 21.61 690383 9 126802 600119 17.44 726921 10 107619 635023 14.49 742642 11 92565 674606 12.07 767171 12 83239 681697 10.88 764936 13 75690 684018 9.96 759708 14 71474 686496 9.43 757970 15 66405 685288 8.83 751693 16 64252 682788 8.60 747040 17 64058 675189 8.67 739247 18 62488 670566 8.52 733054 19 62345 664014 8.58 726359 20 61603 660681 8.53 722284 21 62145 656663 8.65 718808 22 61011 653346 8.54 714357 23 60757 649815 8.55 710572 24 60311 645853 8.54 706164 25 59423 642308 8.47 701731 26 58982 638181 8.46 697163 27 58554 636271 8.43 694825 28 58124 630919 8.44 689043 29 57043 625099 8.36 682142 30 56755 621869 8.36 678624 31 55868 615036 8.33 670904 32 55237 608402 8.32 663639 33 54206 602167 8.26 656373 34 53638 597007 8.24 650645 35 52956 590735 8.23 643691 36 52701 583300 8.29 636001 37 52041 576514 8.28 628555 38 51221 570515 8.24 621736 39 50326 562345 8.21 612671 40 49744 556074 8.21 605818 41 49076 550512 8.18 599588 42 48185 539576 8.20 587761 43 47770 533281 8.22 581051 44 46999 525377 8.21 572376 45 46248 517814 8.20 564062 46 45340 511387 8.14 556727 47 45150 505621 8.20 550771 48 44264 497156 8.18 541420 49 43401 491267 8.12 534668 50 43014 482369 8.19 525383 51 42200 475556 8.15 517756 52 41429 468248 8.13 509677 53 40453 459997 8.08 500450 54 39695 453196 8.05 492891 55 39131 446236 8.06 485367 56 38743 438221 8.12 476964 57 38147 432054 8.11 470201 58 37342 423975 8.09 461317 59 36708 417589 8.08 454297 60 36281 410186 8.13 446467 61 35322 403286 8.05 438608 62 34859 395264 8.10 430123 63 34101 388222 8.07 422323 64 33612 381504 8.10 415116 65 33191 374779 8.14 407970 66 32340 368629 8.07 400969 67 31787 360430 8.10 392217 68 31243 354394 8.10 385637 69 30833 349130 8.11 379963 70 29745 341041 8.02 370786 71 29368 334565 8.07 363933 72 28694 328929 8.02 357623 73 28329 322978 8.06 351307 74 27925 315764 8.13 343689 75 27119 310561 8.03 337680 76 26767 304199 8.09 330966 77 26046 297211 8.06 323257 78 25536 292128 8.04 317664 79 24945 285887 8.03 310832 80 24464 281163 8.00 305627 81 24328 275167 8.12 299495 82 23331 270177 7.95 293508 83 23027 264103 8.02 287130 84 22597 259126 8.02 281723 85 22420 252979 8.14 275399 86 21840 248237 8.09 270077 87 21338 243861 8.05 265199 88 20876 238180 8.06 259056 89 20437 234279 8.02 254716 90 19956 228891 8.02 248847 91 19395 222908 8.00 242303 92 19068 218988 8.01 238056 93 18754 214711 8.03 233465 94 18535 209669 8.12 228204 95 17975 205001 8.06 222976 96 17648 200741 8.08 218389 97 17154 197024 8.01 214178 98 16756 193000 7.99 209756 99 16612 187502 8.14 204114 100 16148 184262 8.06 200410 101 15727 179802 8.04 195529 102 15541 176338 8.10 191879 103 14790 172033 7.92 186823 104 14876 168439 8.11 183315 105 14668 165281 8.15 179949 106 14009 161959 7.96 175968 107 13903 158369 8.07 172272 108 13368 154552 7.96 167920 109 13197 150768 8.05 163965 110 12838 148136 7.98 160974 111 12785 144629 8.12 157414 112 12332 142144 7.98 154476 113 12105 139124 8.00 151229 114 11835 135992 8.01 147827 115 11475 132523 7.97 143998 116 11367 129303 8.08 140670 117 11089 126743 8.05 137832 118 10847 124652 8.01 135499 119 10643 122045 8.02 132688 120 10434 119124 8.05 129558 121 10106 116694 7.97 126800 122 9871 113314 8.01 123185 123 9691 111668 7.99 121359 124 9309 108808 7.88 118117 125 9288 106795 8.00 116083 126 9083 104940 7.97 114023 127 9019 102101 8.12 111120 128 8645 100324 7.93 108969 129 8526 98210 7.99 106736 130 8140 96255 7.80 104395 131 8214 93642 8.06 101856 132 8068 92379 8.03 100447 133 7874 89846 8.06 97720 134 7749 88599 8.04 96348 135 7509 86295 8.00 93804 136 7445 84842 8.07 92287 137 7256 83286 8.01 90542 138 7124 81180 8.07 88304 139 6802 79579 7.87 86381 140 6761 78562 7.92 85323 141 6616 76502 7.96 83118 142 6397 74845 7.87 81242 143 6460 73723 8.06 80183 144 6173 71632 7.93 77805 145 5982 70303 7.84 76285 146 5974 68207 8.05 74181 147 5747 66904 7.91 72651 148 5572 65147 7.88 70719 149 5525 59044 8.56 64569 150 5158 0 100.00 5158 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1700499 258685 86.80 1959184 2 1504395 375517 80.02 1879912 3 451225 209154 68.33 660379 4 430329 310577 58.08 740906 5 352848 456177 43.61 809025 6 233566 449894 34.17 683460 7 174310 507893 25.55 682203 8 120620 617419 16.34 738039 9 87683 723199 10.81 810882 10 60335 801924 7.00 862259 11 41489 865685 4.57 907174 12 27829 894337 3.02 922166 13 18838 897465 2.06 916303 14 13771 905357 1.50 919128 15 9839 910976 1.07 920815 16 7957 914649 0.86 922606 17 7350 914977 0.80 922327 18 6094 907358 0.67 913452 19 6230 894255 0.69 900485 20 5716 881757 0.64 887473 21 5478 877642 0.62 883120 22 5512 876138 0.63 881650 23 4938 871321 0.56 876259 24 4508 865178 0.52 869686 25 4657 857012 0.54 861669 26 4586 854178 0.53 858764 27 4285 849516 0.50 853801 28 4438 843818 0.52 848256 29 4202 837086 0.50 841288 30 3935 830436 0.47 834371 31 3844 822435 0.47 826279 32 3818 815028 0.47 818846 33 3802 806493 0.47 810295 34 3691 797764 0.46 801455 35 3642 790119 0.46 793761 36 3612 781798 0.46 785410 37 3494 772410 0.45 775904 38 3429 763786 0.45 767215 39 3343 753921 0.44 757264 40 3383 746596 0.45 749979 41 3398 735652 0.46 739050 42 3231 726122 0.44 729353 43 3263 715907 0.45 719170 44 3154 706224 0.44 709378 45 3235 697340 0.46 700575 46 3067 684586 0.45 687653 47 3168 674914 0.47 678082 48 2975 667469 0.44 670444 49 2868 656644 0.43 659512 50 2923 646918 0.45 649841 51 2853 636340 0.45 639193 52 2849 625925 0.45 628774 53 2885 615790 0.47 618675 54 2886 607162 0.47 610048 55 2658 596768 0.44 599426 56 2696 585879 0.46 588575 57 2656 577189 0.46 579845 58 2659 567912 0.47 570571 59 2674 558142 0.48 560816 60 2495 547296 0.45 549791 61 2349 538528 0.43 540877 62 2405 530018 0.45 532423 63 2357 520332 0.45 522689 64 2265 510868 0.44 513133 65 2224 502032 0.44 504256 66 2230 493687 0.45 495917 67 2185 485486 0.45 487671 68 2129 476229 0.45 478358 69 2157 466256 0.46 468413 70 2034 458642 0.44 460676 71 2056 449220 0.46 451276 72 2029 440925 0.46 442954 73 1921 433882 0.44 435803 74 1870 423625 0.44 425495 75 1923 415742 0.46 417665 76 1916 407726 0.47 409642 77 1816 399816 0.45 401632 78 1854 391905 0.47 393759 79 1819 385168 0.47 386987 80 1757 377251 0.46 379008 81 1652 369081 0.45 370733 82 1693 362703 0.46 364396 83 1612 354536 0.45 356148 84 1597 347654 0.46 349251 85 1583 340990 0.46 342573 86 1472 332622 0.44 334094 87 1561 326333 0.48 327894 88 1448 321150 0.45 322598 89 1454 314104 0.46 315558 90 1460 307742 0.47 309202 91 1400 301798 0.46 303198 92 1278 294331 0.43 295609 93 1289 288475 0.44 289764 94 1261 282580 0.44 283841 95 1274 276248 0.46 277522 96 1262 271015 0.46 272277 97 1247 265032 0.47 266279 98 1187 260504 0.45 261691 99 1167 254666 0.46 255833 100 1172 248310 0.47 249482 101 1104 243303 0.45 244407 102 1114 239164 0.46 240278 103 973 233776 0.41 234749 104 985 228408 0.43 229393 105 1029 223924 0.46 224953 106 994 218714 0.45 219708 107 961 215081 0.44 216042 108 924 210149 0.44 211073 109 961 204338 0.47 205299 110 929 201323 0.46 202252 111 868 196842 0.44 197710 112 852 193173 0.44 194025 113 824 187783 0.44 188607 114 859 184592 0.46 185451 115 792 180992 0.44 181784 116 829 178096 0.46 178925 117 808 173385 0.46 174193 118 788 169420 0.46 170208 119 724 165804 0.43 166528 120 742 163232 0.45 163974 121 780 159459 0.49 160239 122 704 155792 0.45 156496 123 746 152751 0.49 153497 124 675 149625 0.45 150300 125 710 146076 0.48 146786 126 672 143243 0.47 143915 127 621 140204 0.44 140825 128 637 137144 0.46 137781 129 574 134007 0.43 134581 130 612 131829 0.46 132441 131 546 128996 0.42 129542 132 560 126181 0.44 126741 133 586 123968 0.47 124554 134 546 121396 0.45 121942 135 575 119416 0.48 119991 136 534 116863 0.45 117397 137 499 113774 0.44 114273 138 534 112498 0.47 113032 139 507 109315 0.46 109822 140 486 106910 0.45 107396 141 489 104809 0.46 105298 142 443 103436 0.43 103879 143 490 100701 0.48 101191 144 470 98714 0.47 99184 145 437 97289 0.45 97726 146 445 95190 0.47 95635 147 427 92898 0.46 93325 148 409 91116 0.45 91525 149 348 84315 0.41 84663 150 277 0 100.00 277 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4813569 729499 86.84 5543068 2 3983423 985818 80.16 4969241 3 3437349 1781895 65.86 5219244 4 2913210 2198356 56.99 5111566 5 1931695 2522511 43.37 4454206 6 1435657 2704495 34.68 4140152 7 1032142 2803412 26.91 3835554 8 743405 2849013 20.69 3592418 9 516322 2976336 14.78 3492658 10 351737 3092221 10.21 3443958 11 230757 3288329 6.56 3519086 12 150783 3367610 4.29 3518393 13 100196 3407450 2.86 3507646 14 66185 3421931 1.90 3488116 15 46747 3444580 1.34 3491327 16 35553 3461870 1.02 3497423 17 29225 3472671 0.83 3501896 18 25886 3470255 0.74 3496141 19 23756 3450650 0.68 3474406 20 22491 3413862 0.65 3436353 21 21751 3377666 0.64 3399417 22 21353 3346327 0.63 3367680 23 20875 3314930 0.63 3335805 24 20097 3277787 0.61 3297884 25 19005 3240538 0.58 3259543 26 17827 3203121 0.55 3220948 27 17177 3164111 0.54 3181288 28 16847 3134166 0.53 3151013 29 16184 3104237 0.52 3120421 30 15556 3069043 0.50 3084599 31 15041 3038088 0.49 3053129 32 14493 3000668 0.48 3015161 33 14069 2968264 0.47 2982333 34 13723 2933735 0.47 2947458 35 13667 2899547 0.47 2913214 36 13067 2865046 0.45 2878113 37 12937 2831956 0.45 2844893 38 12528 2799051 0.45 2811579 39 12457 2763023 0.45 2775480 40 12373 2730600 0.45 2742973 41 12237 2694853 0.45 2707090 42 12144 2658438 0.45 2670582 43 11727 2620356 0.45 2632083 44 11741 2587403 0.45 2599144 45 11363 2542933 0.44 2554296 46 11463 2511218 0.45 2522681 47 11206 2476618 0.45 2487824 48 10773 2435737 0.44 2446510 49 10942 2402063 0.45 2413005 50 10532 2364919 0.44 2375451 51 10425 2333329 0.44 2343754 52 10230 2293368 0.44 2303598 53 9939 2259112 0.44 2269051 54 10010 2222646 0.45 2232656 55 9726 2185807 0.44 2195533 56 9554 2149284 0.44 2158838 57 9650 2112595 0.45 2122245 58 9371 2078347 0.45 2087718 59 9222 2044513 0.45 2053735 60 9117 2008038 0.45 2017155 61 8801 1973125 0.44 1981926 62 8788 1940974 0.45 1949762 63 8454 1908918 0.44 1917372 64 8525 1872112 0.45 1880637 65 8201 1839402 0.44 1847603 66 8123 1807236 0.45 1815359 67 7954 1772519 0.45 1780473 68 7736 1742106 0.44 1749842 69 7598 1709814 0.44 1717412 70 7526 1678669 0.45 1686195 71 7444 1650102 0.45 1657546 72 7323 1617769 0.45 1625092 73 7155 1585981 0.45 1593136 74 6899 1556313 0.44 1563212 75 6850 1526298 0.45 1533148 76 6842 1496475 0.46 1503317 77 6557 1467891 0.44 1474448 78 6411 1438436 0.44 1444847 79 6358 1408953 0.45 1415311 80 6115 1382596 0.44 1388711 81 6182 1356553 0.45 1362735 82 6005 1330600 0.45 1336605 83 5875 1304431 0.45 1310306 84 5810 1277703 0.45 1283513 85 5493 1250626 0.44 1256119 86 5571 1224692 0.45 1230263 87 5454 1201063 0.45 1206517 88 5347 1175895 0.45 1181242 89 5246 1153602 0.45 1158848 90 5022 1129638 0.44 1134660 91 5011 1104369 0.45 1109380 92 4857 1083210 0.45 1088067 93 4831 1061346 0.45 1066177 94 4710 1040167 0.45 1044877 95 4465 1017115 0.44 1021580 96 4493 997352 0.45 1001845 97 4414 976648 0.45 981062 98 4239 954877 0.44 959116 99 4102 934702 0.44 938804 100 4181 915526 0.45 919707 101 4097 896006 0.46 900103 102 3973 878831 0.45 882804 103 3816 859460 0.44 863276 104 3703 843118 0.44 846821 105 3698 823974 0.45 827672 106 3629 806060 0.45 809689 107 3561 789648 0.45 793209 108 3449 773403 0.44 776852 109 3376 756667 0.44 760043 110 3307 742238 0.44 745545 111 3293 726631 0.45 729924 112 3214 710765 0.45 713979 113 3132 694159 0.45 697291 114 3041 679755 0.45 682796 115 3094 665633 0.46 668727 116 2977 651938 0.45 654915 117 2924 638662 0.46 641586 118 2690 627234 0.43 629924 119 2765 612065 0.45 614830 120 2659 598447 0.44 601106 121 2654 586781 0.45 589435 122 2547 574261 0.44 576808 123 2546 563293 0.45 565839 124 2471 551413 0.45 553884 125 2392 539463 0.44 541855 126 2438 529554 0.46 531992 127 2301 517441 0.44 519742 128 2257 506805 0.44 509062 129 2195 496383 0.44 498578 130 2148 487074 0.44 489222 131 2176 477534 0.45 479710 132 2057 466667 0.44 468724 133 2023 456933 0.44 458956 134 2095 447726 0.47 449821 135 1924 438769 0.44 440693 136 1873 430466 0.43 432339 137 1903 420335 0.45 422238 138 1797 411063 0.44 412860 139 1819 405254 0.45 407073 140 1801 396003 0.45 397804 141 1748 387632 0.45 389380 142 1669 379689 0.44 381358 143 1721 373510 0.46 375231 144 1624 365200 0.44 366824 145 1534 357922 0.43 359456 146 1549 349503 0.44 351052 147 1555 343211 0.45 344766 148 1448 335058 0.43 336506 149 1323 309676 0.43 310999 150 941 0 100.00 941