CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 38731 829953 4.46 868684 2 119799 1006540 10.64 1126339 3 91692 641080 12.51 732772 4 83862 893740 8.58 977602 5 95722 879560 9.81 975282 6 113980 1086335 9.50 1200315 7 103939 878858 10.58 982797 8 96489 857505 10.11 953994 9 89003 824858 9.74 913861 10 85628 790260 9.78 875888 11 82518 812599 9.22 895117 12 81103 764588 9.59 845691 13 81621 772512 9.56 854133 14 82890 804406 9.34 887296 15 83619 815796 9.30 899415 16 84694 832537 9.23 917231 17 85874 844000 9.24 929874 18 88352 857836 9.34 946188 19 88526 852909 9.40 941435 20 88249 858670 9.32 946919 21 87779 857973 9.28 945752 22 87449 852653 9.30 940102 23 88380 849518 9.42 937898 24 88761 851780 9.44 940541 25 86947 845287 9.33 932234 26 87058 842967 9.36 930025 27 87488 849041 9.34 936529 28 87731 852932 9.33 940663 29 87282 849863 9.31 937145 30 87989 852285 9.36 940274 31 86472 848133 9.25 934605 32 86983 844039 9.34 931022 33 87309 849873 9.32 937182 34 86839 844178 9.33 931017 35 86982 844461 9.34 931443 36 87668 850697 9.34 938365 37 86143 843777 9.26 929920 38 87469 848459 9.35 935928 39 87993 851267 9.37 939260 40 87002 848038 9.30 935040 41 86879 846993 9.30 933872 42 87908 854838 9.32 942746 43 86981 842357 9.36 929338 44 87546 844031 9.40 931577 45 87090 845636 9.34 932726 46 86704 845211 9.30 931915 47 87166 846010 9.34 933176 48 87125 854299 9.25 941424 49 87176 848898 9.31 936074 50 87605 847702 9.37 935307 51 87330 849363 9.32 936693 52 87112 846268 9.33 933380 53 87375 843988 9.38 931363 54 87716 852199 9.33 939915 55 86004 840252 9.29 926256 56 86833 843308 9.34 930141 57 87378 846788 9.35 934166 58 86158 841467 9.29 927625 59 87121 839843 9.40 926964 60 87377 846950 9.35 934327 61 86525 839353 9.35 925878 62 87023 843560 9.35 930583 63 87549 845296 9.39 932845 64 86865 842178 9.35 929043 65 86690 839678 9.36 926368 66 87042 840919 9.38 927961 67 87207 834494 9.46 921701 68 86792 839245 9.37 926037 69 87091 839742 9.40 926833 70 87041 837430 9.42 924471 71 87733 834068 9.52 921801 72 87506 838885 9.45 926391 73 87333 834488 9.47 921821 74 87586 837407 9.47 924993 75 87305 837204 9.44 924509 76 87275 834178 9.47 921453 77 87578 837951 9.46 925529 78 86988 835592 9.43 922580 79 87203 832370 9.48 919573 80 87097 831913 9.48 919010 81 87915 832798 9.55 920713 82 87542 831066 9.53 918608 83 87331 832850 9.49 920181 84 87584 833647 9.51 921231 85 87749 832773 9.53 920522 86 87528 827835 9.56 915363 87 86916 829381 9.49 916297 88 87093 825911 9.54 913004 89 87396 821387 9.62 908783 90 87587 826270 9.58 913857 91 87248 823065 9.58 910313 92 86651 821224 9.54 907875 93 87612 825699 9.59 913311 94 86879 822025 9.56 908904 95 87640 819463 9.66 907103 96 87728 823698 9.63 911426 97 87710 821310 9.65 909020 98 87859 820043 9.68 907902 99 87530 819879 9.65 907409 100 87366 817843 9.65 905209 101 86771 812333 9.65 899104 102 87368 816247 9.67 903615 103 87148 809862 9.72 897010 104 86969 811112 9.68 898081 105 87438 814240 9.70 901678 106 87745 809324 9.78 897069 107 87214 809065 9.73 896279 108 87323 810746 9.72 898069 109 86838 801449 9.78 888287 110 87012 803343 9.77 890355 111 87044 803778 9.77 890822 112 87124 800298 9.82 887422 113 87291 800259 9.84 887550 114 87106 800513 9.81 887619 115 87309 796192 9.88 883501 116 87495 796238 9.90 883733 117 87425 797154 9.88 884579 118 88219 792745 10.01 880964 119 87631 791292 9.97 878923 120 87896 791144 10.00 879040 121 87118 785823 9.98 872941 122 87400 784714 10.02 872114 123 86969 783138 10.00 870107 124 87195 779995 10.05 867190 125 87205 778502 10.07 865707 126 87765 779823 10.12 867588 127 87496 773521 10.16 861017 128 86946 773050 10.11 859996 129 87483 772424 10.17 859907 130 87628 768414 10.24 856042 131 87448 767694 10.23 855142 132 87999 766468 10.30 854467 133 87648 762111 10.31 849759 134 87382 761839 10.29 849221 135 88349 760405 10.41 848754 136 88015 757325 10.41 845340 137 88214 755148 10.46 843362 138 88477 750885 10.54 839362 139 88019 748052 10.53 836071 140 87810 741559 10.59 829369 141 87876 741602 10.59 829478 142 87521 736392 10.62 823913 143 87613 734474 10.66 822087 144 86932 733400 10.60 820332 145 87788 728614 10.75 816402 146 88136 726460 10.82 814596 147 89020 727559 10.90 816579 148 87830 719623 10.88 807453 149 87717 715914 10.92 803631 150 88947 682556 11.53 771503 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 15059 1692135 0.88 1707194 2 13739 1170164 1.16 1183903 3 7747 973751 0.79 981498 4 6918 1223277 0.56 1230195 5 8534 1462736 0.58 1471270 6 7989 1337649 0.59 1345638 7 7459 1140886 0.65 1148345 8 6388 1127341 0.56 1133729 9 6116 1093807 0.56 1099923 10 5945 1100790 0.54 1106735 11 5559 1127741 0.49 1133300 12 5688 1137110 0.50 1142798 13 5251 1140203 0.46 1145454 14 5497 1142778 0.48 1148275 15 5603 1165855 0.48 1171458 16 5581 1181743 0.47 1187324 17 5790 1198158 0.48 1203948 18 6003 1197805 0.50 1203808 19 5891 1198584 0.49 1204475 20 5945 1200611 0.49 1206556 21 5942 1204604 0.49 1210546 22 5903 1198481 0.49 1204384 23 5955 1190028 0.50 1195983 24 5866 1187835 0.49 1193701 25 5981 1188254 0.50 1194235 26 6027 1188309 0.50 1194336 27 6163 1195473 0.51 1201636 28 6178 1192854 0.52 1199032 29 6468 1191236 0.54 1197704 30 6675 1199655 0.55 1206330 31 6343 1196880 0.53 1203223 32 6462 1197484 0.54 1203946 33 6475 1197202 0.54 1203677 34 6396 1196376 0.53 1202772 35 6503 1195283 0.54 1201786 36 6466 1198578 0.54 1205044 37 6580 1199143 0.55 1205723 38 6527 1203791 0.54 1210318 39 6667 1205367 0.55 1212034 40 6704 1201006 0.56 1207710 41 6612 1198971 0.55 1205583 42 6710 1203278 0.55 1209988 43 6605 1195264 0.55 1201869 44 6868 1193705 0.57 1200573 45 6871 1196746 0.57 1203617 46 6871 1191176 0.57 1198047 47 6990 1192287 0.58 1199277 48 7015 1198080 0.58 1205095 49 7237 1197331 0.60 1204568 50 7199 1190965 0.60 1198164 51 7252 1197104 0.60 1204356 52 7176 1194773 0.60 1201949 53 7423 1196475 0.62 1203898 54 7464 1195620 0.62 1203084 55 7501 1191123 0.63 1198624 56 7634 1189276 0.64 1196910 57 7591 1188846 0.63 1196437 58 7656 1191482 0.64 1199138 59 7929 1189755 0.66 1197684 60 7975 1196532 0.66 1204507 61 8005 1196252 0.66 1204257 62 8374 1194710 0.70 1203084 63 8192 1196232 0.68 1204424 64 8175 1189659 0.68 1197834 65 8288 1185088 0.69 1193376 66 8475 1187188 0.71 1195663 67 8519 1182636 0.72 1191155 68 8540 1184555 0.72 1193095 69 8654 1189530 0.72 1198184 70 8737 1182370 0.73 1191107 71 8794 1179302 0.74 1188096 72 8903 1182018 0.75 1190921 73 8836 1181669 0.74 1190505 74 8897 1179656 0.75 1188553 75 9205 1184608 0.77 1193813 76 9334 1180386 0.78 1189720 77 9195 1174192 0.78 1183387 78 9303 1179695 0.78 1188998 79 9345 1175107 0.79 1184452 80 9477 1173474 0.80 1182951 81 9896 1175347 0.83 1185243 82 9726 1170459 0.82 1180185 83 9955 1169886 0.84 1179841 84 10068 1175386 0.85 1185454 85 10326 1170816 0.87 1181142 86 10241 1167800 0.87 1178041 87 10308 1167212 0.88 1177520 88 10136 1164378 0.86 1174514 89 10443 1165232 0.89 1175675 90 10696 1166853 0.91 1177549 91 10752 1159903 0.92 1170655 92 10850 1157336 0.93 1168186 93 11080 1163003 0.94 1174083 94 11039 1161194 0.94 1172233 95 11190 1158655 0.96 1169845 96 11344 1157974 0.97 1169318 97 11354 1154392 0.97 1165746 98 11363 1149609 0.98 1160972 99 11729 1152980 1.01 1164709 100 11796 1149254 1.02 1161050 101 12170 1143244 1.05 1155414 102 12051 1145577 1.04 1157628 103 12452 1142219 1.08 1154671 104 12525 1138376 1.09 1150901 105 12622 1143926 1.09 1156548 106 12617 1139464 1.10 1152081 107 13072 1132555 1.14 1145627 108 13168 1137298 1.14 1150466 109 13399 1134506 1.17 1147905 110 13542 1134280 1.18 1147822 111 13848 1133574 1.21 1147422 112 13943 1130579 1.22 1144522 113 14181 1123636 1.25 1137817 114 14365 1121912 1.26 1136277 115 14676 1117022 1.30 1131698 116 14966 1115979 1.32 1130945 117 15380 1116585 1.36 1131965 118 15516 1114510 1.37 1130026 119 15863 1112636 1.41 1128499 120 16219 1113427 1.44 1129646 121 16749 1104507 1.49 1121256 122 16661 1103136 1.49 1119797 123 17135 1102305 1.53 1119440 124 17453 1099629 1.56 1117082 125 17455 1096244 1.57 1113699 126 18017 1096814 1.62 1114831 127 18204 1091792 1.64 1109996 128 18779 1087644 1.70 1106423 129 19321 1084885 1.75 1104206 130 19223 1078217 1.75 1097440 131 19563 1075734 1.79 1095297 132 20047 1074288 1.83 1094335 133 20525 1069444 1.88 1089969 134 20842 1067892 1.91 1088734 135 21491 1064081 1.98 1085572 136 21579 1054630 2.01 1076209 137 22136 1053170 2.06 1075306 138 22299 1050452 2.08 1072751 139 22773 1044804 2.13 1067577 140 22998 1041127 2.16 1064125 141 23369 1038672 2.20 1062041 142 23856 1034654 2.25 1058510 143 24286 1029030 2.31 1053316 144 25054 1030617 2.37 1055671 145 25614 1025396 2.44 1051010 146 26888 1020833 2.57 1047721 147 27023 1017578 2.59 1044601 148 28191 1011836 2.71 1040027 149 36480 1011664 3.48 1048144 150 33057 949090 3.37 982147 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 26341 4592092 0.57 4618433 2 57372 3993804 1.42 4051176 3 27853 3465900 0.80 3493753 4 26624 4421461 0.60 4448085 5 28068 4595639 0.61 4623707 6 26583 4553591 0.58 4580174 7 26663 4029645 0.66 4056308 8 23989 4204417 0.57 4228406 9 23961 4316728 0.55 4340689 10 21879 4372763 0.50 4394642 11 21762 4585187 0.47 4606949 12 21367 4588351 0.46 4609718 13 20432 4579201 0.44 4599633 14 20454 4598994 0.44 4619448 15 21299 4589508 0.46 4610807 16 21542 4545772 0.47 4567314 17 22535 4538198 0.49 4560733 18 23085 4581421 0.50 4604506 19 23704 4581258 0.51 4604962 20 23910 4594890 0.52 4618800 21 24248 4605339 0.52 4629587 22 24610 4560469 0.54 4585079 23 25077 4547681 0.55 4572758 24 25557 4573461 0.56 4599018 25 25970 4583252 0.56 4609222 26 26695 4591430 0.58 4618125 27 26749 4616572 0.58 4643321 28 27264 4611340 0.59 4638604 29 27558 4630937 0.59 4658495 30 27647 4660658 0.59 4688305 31 27344 4644134 0.59 4671478 32 26900 4636957 0.58 4663857 33 26776 4657268 0.57 4684044 34 26417 4631743 0.57 4658160 35 26492 4631717 0.57 4658209 36 26069 4658001 0.56 4684070 37 26396 4644270 0.57 4670666 38 26383 4643913 0.56 4670296 39 26799 4667326 0.57 4694125 40 26733 4655722 0.57 4682455 41 26772 4646342 0.57 4673114 42 26853 4662542 0.57 4689395 43 26963 4634406 0.58 4661369 44 27205 4630793 0.58 4657998 45 27702 4641792 0.59 4669494 46 27297 4630687 0.59 4657984 47 28165 4629931 0.60 4658096 48 28276 4651317 0.60 4679593 49 28458 4627621 0.61 4656079 50 28820 4626970 0.62 4655790 51 29110 4639782 0.62 4668892 52 29193 4629518 0.63 4658711 53 29644 4618130 0.64 4647774 54 30238 4630116 0.65 4660354 55 30146 4617944 0.65 4648090 56 30875 4625629 0.66 4656504 57 30852 4643022 0.66 4673874 58 31067 4629748 0.67 4660815 59 31572 4617165 0.68 4648737 60 32041 4638693 0.69 4670734 61 31952 4609531 0.69 4641483 62 32468 4612120 0.70 4644588 63 32360 4620604 0.70 4652964 64 32958 4600115 0.71 4633073 65 33133 4594834 0.72 4627967 66 33366 4602131 0.72 4635497 67 34138 4590700 0.74 4624838 68 34159 4594899 0.74 4629058 69 35112 4605222 0.76 4640334 70 34768 4602633 0.75 4637401 71 35586 4593402 0.77 4628988 72 35990 4608040 0.77 4644030 73 35805 4589580 0.77 4625385 74 36340 4589067 0.79 4625407 75 36617 4595719 0.79 4632336 76 37014 4575677 0.80 4612691 77 37628 4573883 0.82 4611511 78 37997 4583051 0.82 4621048 79 38304 4565468 0.83 4603772 80 38435 4555651 0.84 4594086 81 38855 4573258 0.84 4612113 82 39256 4555053 0.85 4594309 83 39376 4551689 0.86 4591065 84 40523 4569424 0.88 4609947 85 40254 4533899 0.88 4574153 86 40789 4536119 0.89 4576908 87 41485 4547054 0.90 4588539 88 41588 4537374 0.91 4578962 89 42351 4532150 0.93 4574501 90 42774 4545936 0.93 4588710 91 42850 4521690 0.94 4564540 92 43946 4514562 0.96 4558508 93 44150 4524403 0.97 4568553 94 44804 4504897 0.98 4549701 95 45259 4500459 1.00 4545718 96 46581 4508152 1.02 4554733 97 46216 4487786 1.02 4534002 98 46680 4485791 1.03 4532471 99 47993 4497676 1.06 4545669 100 48234 4483073 1.06 4531307 101 49139 4482227 1.08 4531366 102 49641 4481665 1.10 4531306 103 50469 4461656 1.12 4512125 104 51169 4458928 1.13 4510097 105 52008 4461511 1.15 4513519 106 52654 4447523 1.17 4500177 107 53417 4443184 1.19 4496601 108 54505 4446157 1.21 4500662 109 54894 4430553 1.22 4485447 110 55844 4424164 1.25 4480008 111 56678 4424602 1.26 4481280 112 57386 4407400 1.29 4464786 113 58987 4392418 1.33 4451405 114 60269 4394732 1.35 4455001 115 61198 4377988 1.38 4439186 116 62151 4371943 1.40 4434094 117 63399 4374873 1.43 4438272 118 64541 4354396 1.46 4418937 119 65762 4345637 1.49 4411399 120 67227 4341774 1.52 4409001 121 68813 4327573 1.57 4396386 122 69573 4325718 1.58 4395291 123 71347 4334057 1.62 4405404 124 72865 4312051 1.66 4384916 125 74106 4296700 1.70 4370806 126 75676 4299775 1.73 4375451 127 76966 4271146 1.77 4348112 128 78448 4258951 1.81 4337399 129 80253 4257130 1.85 4337383 130 81450 4243122 1.88 4324572 131 83175 4236112 1.93 4319287 132 85149 4228060 1.97 4313209 133 86347 4206014 2.01 4292361 134 88061 4189297 2.06 4277358 135 90253 4183193 2.11 4273446 136 91498 4161937 2.15 4253435 137 92964 4144420 2.19 4237384 138 94928 4141255 2.24 4236183 139 96020 4114299 2.28 4210319 140 97810 4112718 2.32 4210528 141 99425 4098020 2.37 4197445 142 101086 4079235 2.42 4180321 143 103308 4063471 2.48 4166779 144 106142 4069765 2.54 4175907 145 109047 4050927 2.62 4159974 146 112032 4042373 2.70 4154405 147 118699 4035630 2.86 4154329 148 119240 4004919 2.89 4124159 149 115886 3953569 2.85 4069455 150 112252 3768440 2.89 3880692 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1441759 221088 86.70 1662847 2 496113 112058 81.57 608171 3 371536 173809 68.13 545345 4 430486 290805 59.68 721291 5 292350 326370 47.25 618720 6 222732 361007 38.16 583739 7 171864 444111 27.90 615975 8 150692 513648 22.68 664340 9 130357 570794 18.59 701151 10 111847 610158 15.49 722005 11 97159 646991 13.06 744150 12 88255 655145 11.87 743400 13 81880 653308 11.14 735188 14 77044 651733 10.57 728777 15 73504 649547 10.17 723051 16 71083 642882 9.96 713965 17 70482 638814 9.94 709296 18 70219 632773 9.99 702992 19 70009 629474 10.01 699483 20 69433 626823 9.97 696256 21 69795 624422 10.05 694217 22 68532 622971 9.91 691503 23 69275 620502 10.04 689777 24 68819 616796 10.04 685615 25 67451 615782 9.87 683233 26 67715 614081 9.93 681796 27 67575 611245 9.95 678820 28 66994 609991 9.90 676985 29 66267 606719 9.85 672986 30 65544 602674 9.81 668218 31 65628 598845 9.88 664473 32 65027 598330 9.80 663357 33 64441 591937 9.82 656378 34 63748 588103 9.78 651851 35 63035 584280 9.74 647315 36 62846 579452 9.78 642298 37 62476 574750 9.80 637226 38 61253 571121 9.69 632374 39 60930 565271 9.73 626201 40 60213 561652 9.68 621865 41 60162 556898 9.75 617060 42 58969 552666 9.64 611635 43 58768 547187 9.70 605955 44 58150 541629 9.70 599779 45 57764 538187 9.69 595951 46 56897 532976 9.65 589873 47 56598 528227 9.68 584825 48 56106 523588 9.68 579694 49 55525 519359 9.66 574884 50 54685 513715 9.62 568400 51 54084 508431 9.61 562515 52 53797 503290 9.66 557087 53 53115 498783 9.62 551898 54 52375 493403 9.60 545778 55 52179 488643 9.65 540822 56 51771 483720 9.67 535491 57 50644 478073 9.58 528717 58 50700 474252 9.66 524952 59 49879 467336 9.64 517215 60 49390 462196 9.65 511586 61 48961 459017 9.64 507978 62 48079 453947 9.58 502026 63 47423 447824 9.58 495247 64 46923 443401 9.57 490324 65 46887 438126 9.67 485013 66 46111 433230 9.62 479341 67 45772 428362 9.65 474134 68 44905 424116 9.57 469021 69 44407 418473 9.59 462880 70 43891 412948 9.61 456839 71 43195 409927 9.53 453122 72 43068 403594 9.64 446662 73 42173 399606 9.55 441779 74 41796 394479 9.58 436275 75 41339 390190 9.58 431529 76 40698 383594 9.59 424292 77 40628 379223 9.68 419851 78 40055 374952 9.65 415007 79 39379 370602 9.61 409981 80 38971 365068 9.65 404039 81 38622 363016 9.62 401638 82 38078 356286 9.66 394364 83 37215 352914 9.54 390129 84 37331 347184 9.71 384515 85 36580 343787 9.62 380367 86 35933 336569 9.65 372502 87 35850 333660 9.70 369510 88 35124 329937 9.62 365061 89 34816 326190 9.64 361006 90 34172 321090 9.62 355262 91 34042 317268 9.69 351310 92 33477 312984 9.66 346461 93 32882 309803 9.60 342685 94 32507 304307 9.65 336814 95 32021 300441 9.63 332462 96 31437 295554 9.61 326991 97 31072 293224 9.58 324296 98 30886 287599 9.70 318485 99 30163 283982 9.60 314145 100 29909 281411 9.61 311320 101 29286 276666 9.57 305952 102 29304 273812 9.67 303116 103 28764 269685 9.64 298449 104 28044 265450 9.56 293494 105 28108 262388 9.68 290496 106 27664 258115 9.68 285779 107 27300 253967 9.71 281267 108 27050 251095 9.73 278145 109 26406 247672 9.63 274078 110 26184 244460 9.67 270644 111 25535 240874 9.58 266409 112 25372 237937 9.64 263309 113 25074 235000 9.64 260074 114 24746 231427 9.66 256173 115 24173 228209 9.58 252382 116 23966 224856 9.63 248822 117 23637 221073 9.66 244710 118 23266 218695 9.62 241961 119 23292 215904 9.74 239196 120 22633 211875 9.65 234508 121 22444 209288 9.69 231732 122 21906 205738 9.62 227644 123 21931 203109 9.75 225040 124 21515 200683 9.68 222198 125 20954 197424 9.60 218378 126 20754 194872 9.62 215626 127 20434 191733 9.63 212167 128 20355 189599 9.69 209954 129 20089 186963 9.70 207052 130 19787 184212 9.70 203999 131 19459 182287 9.65 201746 132 19143 179251 9.65 198394 133 18589 176192 9.54 194781 134 18493 174313 9.59 192806 135 18216 171200 9.62 189416 136 17811 168360 9.57 186171 137 17597 166057 9.58 183654 138 17409 163581 9.62 180990 139 17138 161184 9.61 178322 140 17329 158684 9.85 176013 141 16740 157104 9.63 173844 142 16373 154583 9.58 170956 143 16170 152630 9.58 168800 144 16067 150171 9.67 166238 145 15657 147780 9.58 163437 146 15349 145466 9.54 160815 147 15329 142424 9.72 157753 148 14969 139620 9.68 154589 149 14484 127613 10.19 142097 150 13145 0 100.00 13145 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1675692 257338 86.69 1933030 2 1479050 369752 80.00 1848802 3 443893 202908 68.63 646801 4 431524 302934 58.75 734458 5 358955 449774 44.39 808729 6 237476 442049 34.95 679525 7 177140 494547 26.37 671687 8 121027 597098 16.85 718125 9 86736 703404 10.98 790140 10 59401 785357 7.03 844758 11 40512 857806 4.51 898318 12 26538 887540 2.90 914078 13 18062 891054 1.99 909116 14 12803 894577 1.41 907380 15 9087 900431 1.00 909518 16 7281 905616 0.80 912897 17 6938 899470 0.77 906408 18 5727 894932 0.64 900659 19 5962 883978 0.67 889940 20 5531 874088 0.63 879619 21 5349 871329 0.61 876678 22 5619 870374 0.64 875993 23 5133 867619 0.59 872752 24 4746 865125 0.55 869871 25 4805 860425 0.56 865230 26 4723 857947 0.55 862670 27 4527 855639 0.53 860166 28 4620 852190 0.54 856810 29 4352 849746 0.51 854098 30 4297 845342 0.51 849639 31 4222 841341 0.50 845563 32 4170 835451 0.50 839621 33 4074 833637 0.49 837711 34 3942 826255 0.47 830197 35 4100 819828 0.50 823928 36 4005 813426 0.49 817431 37 3882 808341 0.48 812223 38 3859 804804 0.48 808663 39 3767 796040 0.47 799807 40 3760 794043 0.47 797803 41 3842 785815 0.49 789657 42 3823 778286 0.49 782109 43 3842 773943 0.49 777785 44 3734 765725 0.49 769459 45 3632 759745 0.48 763377 46 3633 752769 0.48 756402 47 3637 745799 0.49 749436 48 3488 737731 0.47 741219 49 3491 732921 0.47 736412 50 3531 725398 0.48 728929 51 3456 719271 0.48 722727 52 3444 711412 0.48 714856 53 3331 703933 0.47 707264 54 3409 697632 0.49 701041 55 3350 688071 0.48 691421 56 3268 683658 0.48 686926 57 3217 676229 0.47 679446 58 3177 669194 0.47 672371 59 3230 662550 0.49 665780 60 3184 656355 0.48 659539 61 3096 646668 0.48 649764 62 3091 642375 0.48 645466 63 3063 634187 0.48 637250 64 2975 626844 0.47 629819 65 3036 622274 0.49 625310 66 3004 613218 0.49 616222 67 2959 608235 0.48 611194 68 2860 600877 0.47 603737 69 2895 593056 0.49 595951 70 2765 586680 0.47 589445 71 2792 579330 0.48 582122 72 2767 573910 0.48 576677 73 2686 566811 0.47 569497 74 2645 559942 0.47 562587 75 2621 553271 0.47 555892 76 2631 546624 0.48 549255 77 2556 539833 0.47 542389 78 2613 534072 0.49 536685 79 2547 528050 0.48 530597 80 2504 521650 0.48 524154 81 2499 514535 0.48 517034 82 2523 509608 0.49 512131 83 2427 501387 0.48 503814 84 2441 496693 0.49 499134 85 2258 489778 0.46 492036 86 2325 484749 0.48 487074 87 2267 476289 0.47 478556 88 2316 471616 0.49 473932 89 2281 465276 0.49 467557 90 2266 460836 0.49 463102 91 2124 454470 0.47 456594 92 2115 449449 0.47 451564 93 2117 442370 0.48 444487 94 2091 437095 0.48 439186 95 2055 430487 0.48 432542 96 2078 424901 0.49 426979 97 2084 420348 0.49 422432 98 2060 412952 0.50 415012 99 2040 409155 0.50 411195 100 1929 403820 0.48 405749 101 1973 399403 0.49 401376 102 1945 392350 0.49 394295 103 1844 387567 0.47 389411 104 1794 382631 0.47 384425 105 1736 377949 0.46 379685 106 1780 373060 0.47 374840 107 1781 368032 0.48 369813 108 1739 362442 0.48 364181 109 1712 357907 0.48 359619 110 1789 352134 0.51 353923 111 1704 347796 0.49 349500 112 1683 344904 0.49 346587 113 1593 339241 0.47 340834 114 1652 334640 0.49 336292 115 1536 329811 0.46 331347 116 1552 326817 0.47 328369 117 1573 321587 0.49 323160 118 1475 315680 0.47 317155 119 1537 311726 0.49 313263 120 1533 306991 0.50 308524 121 1484 303623 0.49 305107 122 1470 299088 0.49 300558 123 1434 294749 0.48 296183 124 1398 290285 0.48 291683 125 1431 287282 0.50 288713 126 1326 282770 0.47 284096 127 1272 279635 0.45 280907 128 1393 275533 0.50 276926 129 1293 272315 0.47 273608 130 1235 267456 0.46 268691 131 1271 262996 0.48 264267 132 1189 259984 0.46 261173 133 1209 256060 0.47 257269 134 1285 252128 0.51 253413 135 1197 248873 0.48 250070 136 1234 243682 0.50 244916 137 1215 240924 0.50 242139 138 1181 238255 0.49 239436 139 1135 234022 0.48 235157 140 1139 232116 0.49 233255 141 1134 227598 0.50 228732 142 1105 223674 0.49 224779 143 1124 221460 0.50 222584 144 1084 218310 0.49 219394 145 1078 215236 0.50 216314 146 1028 210780 0.49 211808 147 1052 207921 0.50 208973 148 888 204022 0.43 204910 149 771 188122 0.41 188893 150 618 0 100.00 618 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4886561 745653 86.76 5632214 2 4041532 995734 80.23 5037266 3 3493087 1803624 65.95 5296711 4 2996472 2220211 57.44 5216683 5 2013820 2565132 43.98 4578952 6 1498276 2757981 35.20 4256257 7 1072664 2865863 27.24 3938527 8 763495 2919097 20.73 3682592 9 524844 3046967 14.69 3571811 10 353554 3184021 9.99 3537575 11 227474 3406526 6.26 3634000 12 146599 3504277 4.02 3650876 13 95477 3540128 2.63 3635605 14 62053 3568323 1.71 3630376 15 43198 3595345 1.19 3638543 16 32946 3615188 0.90 3648134 17 27681 3625712 0.76 3653393 18 24738 3626751 0.68 3651489 19 23096 3611467 0.64 3634563 20 22779 3585466 0.63 3608245 21 22327 3561780 0.62 3584107 22 22337 3536702 0.63 3559039 23 22220 3514307 0.63 3536527 24 21728 3486525 0.62 3508253 25 20746 3459006 0.60 3479752 26 19932 3438741 0.58 3458673 27 19459 3416489 0.57 3435948 28 18634 3392854 0.55 3411488 29 18384 3369532 0.54 3387916 30 17776 3347610 0.53 3365386 31 17412 3323817 0.52 3341229 32 16684 3303495 0.50 3320179 33 16258 3277049 0.49 3293307 34 16060 3249548 0.49 3265608 35 15705 3227654 0.48 3243359 36 15627 3205135 0.49 3220762 37 15155 3181204 0.47 3196359 38 15064 3161431 0.47 3176495 39 14970 3132989 0.48 3147959 40 14657 3109934 0.47 3124591 41 14742 3086979 0.48 3101721 42 14537 3060067 0.47 3074604 43 14465 3030691 0.48 3045156 44 14241 3005947 0.47 3020188 45 14100 2976521 0.47 2990621 46 14047 2949952 0.47 2963999 47 13950 2928430 0.47 2942380 48 13678 2898943 0.47 2912621 49 13660 2876645 0.47 2890305 50 13350 2853002 0.47 2866352 51 13493 2820951 0.48 2834444 52 13351 2795522 0.48 2808873 53 13081 2764490 0.47 2777571 54 12971 2738249 0.47 2751220 55 12908 2709336 0.47 2722244 56 12769 2687000 0.47 2699769 57 12547 2656831 0.47 2669378 58 12451 2630662 0.47 2643113 59 12258 2603539 0.47 2615797 60 12128 2576749 0.47 2588877 61 12000 2550707 0.47 2562707 62 11880 2520724 0.47 2532604 63 11706 2498868 0.47 2510574 64 11694 2473001 0.47 2484695 65 11558 2444127 0.47 2455685 66 11230 2419064 0.46 2430294 67 11229 2391892 0.47 2403121 68 11216 2364652 0.47 2375868 69 11024 2338032 0.47 2349056 70 10904 2314306 0.47 2325210 71 10885 2288831 0.47 2299716 72 10834 2262109 0.48 2272943 73 10335 2236136 0.46 2246471 74 10522 2207236 0.47 2217758 75 10196 2183886 0.46 2194082 76 10117 2158519 0.47 2168636 77 10096 2132962 0.47 2143058 78 10014 2104510 0.47 2114524 79 9612 2082850 0.46 2092462 80 9659 2058243 0.47 2067902 81 9433 2034076 0.46 2043509 82 9478 2010971 0.47 2020449 83 9447 1988961 0.47 1998408 84 9091 1962164 0.46 1971255 85 9087 1939903 0.47 1948990 86 9074 1916500 0.47 1925574 87 8956 1891136 0.47 1900092 88 8894 1866380 0.47 1875274 89 8532 1843238 0.46 1851770 90 8516 1822476 0.47 1830992 91 8492 1798642 0.47 1807134 92 8317 1776282 0.47 1784599 93 8030 1756039 0.46 1764069 94 8170 1733253 0.47 1741423 95 7915 1711624 0.46 1719539 96 7875 1688347 0.46 1696222 97 7790 1666029 0.47 1673819 98 7732 1645833 0.47 1653565 99 7588 1623389 0.47 1630977 100 7600 1602492 0.47 1610092 101 7337 1580318 0.46 1587655 102 7232 1560255 0.46 1567487 103 7152 1540230 0.46 1547382 104 7093 1519002 0.46 1526095 105 6919 1501197 0.46 1508116 106 6833 1479074 0.46 1485907 107 6805 1459875 0.46 1466680 108 6707 1441187 0.46 1447894 109 6748 1421107 0.47 1427855 110 6485 1403806 0.46 1410291 111 6564 1385081 0.47 1391645 112 6484 1366369 0.47 1372853 113 6337 1346938 0.47 1353275 114 6172 1330316 0.46 1336488 115 6105 1311811 0.46 1317916 116 6090 1292205 0.47 1298295 117 5924 1274924 0.46 1280848 118 5832 1259706 0.46 1265538 119 5740 1241086 0.46 1246826 120 5716 1224191 0.46 1229907 121 5686 1207389 0.47 1213075 122 5647 1190485 0.47 1196132 123 5527 1176072 0.47 1181599 124 5464 1156623 0.47 1162087 125 5353 1141233 0.47 1146586 126 5163 1125145 0.46 1130308 127 5245 1110616 0.47 1115861 128 5064 1095417 0.46 1100481 129 5074 1080798 0.47 1085872 130 5002 1064975 0.47 1069977 131 4967 1049844 0.47 1054811 132 4946 1035686 0.48 1040632 133 4689 1021727 0.46 1026416 134 4707 1005389 0.47 1010096 135 4656 990564 0.47 995220 136 4585 978866 0.47 983451 137 4528 964664 0.47 969192 138 4348 948194 0.46 952542 139 4489 937835 0.48 942324 140 4402 922361 0.47 926763 141 4316 910367 0.47 914683 142 4203 895149 0.47 899352 143 4152 883897 0.47 888049 144 4053 869498 0.46 873551 145 4121 858403 0.48 862524 146 4023 844327 0.47 848350 147 3917 830553 0.47 834470 148 3684 813254 0.45 816938 149 3222 753588 0.43 756810 150 2366 0 100.00 2366