CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 43045 932490 4.41 975535 2 124910 1100125 10.20 1225035 3 94591 721083 11.60 815674 4 85922 994009 7.96 1079931 5 99762 978006 9.26 1077768 6 116035 1197353 8.83 1313388 7 107107 978924 9.86 1086031 8 99351 957979 9.40 1057330 9 92246 925502 9.06 1017748 10 89572 892684 9.12 982256 11 86091 918114 8.57 1004205 12 84192 869552 8.83 953744 13 85387 875638 8.88 961025 14 87791 908029 8.82 995820 15 86681 919512 8.61 1006193 16 88006 936543 8.59 1024549 17 89266 944235 8.64 1033501 18 91846 958434 8.74 1050280 19 91116 949737 8.75 1040853 20 91245 958746 8.69 1049991 21 91611 958740 8.72 1050351 22 90776 950796 8.72 1041572 23 91209 948427 8.77 1039636 24 91461 953674 8.75 1045135 25 89787 946901 8.66 1036688 26 89679 941503 8.70 1031182 27 89994 947193 8.68 1037187 28 90529 952184 8.68 1042713 29 90335 948613 8.69 1038948 30 91014 951401 8.73 1042415 31 89672 950216 8.62 1039888 32 90082 942690 8.72 1032772 33 89888 951597 8.63 1041485 34 89347 943613 8.65 1032960 35 89975 945801 8.69 1035776 36 89374 953620 8.57 1042994 37 89199 944648 8.63 1033847 38 89316 944998 8.64 1034314 39 89862 955860 8.59 1045722 40 89423 946469 8.63 1035892 41 90173 947644 8.69 1037817 42 90669 958718 8.64 1049387 43 89350 944205 8.64 1033555 44 89862 947747 8.66 1037609 45 89565 949339 8.62 1038904 46 88863 948133 8.57 1036996 47 89427 945042 8.64 1034469 48 90257 954982 8.64 1045239 49 89495 948835 8.62 1038330 50 89966 948716 8.66 1038682 51 89681 953124 8.60 1042805 52 89701 949103 8.64 1038804 53 90013 943691 8.71 1033704 54 89763 956143 8.58 1045906 55 89006 942446 8.63 1031452 56 88818 947232 8.57 1036050 57 89419 949703 8.61 1039122 58 89005 945368 8.60 1034373 59 88998 945292 8.60 1034290 60 89450 950689 8.60 1040139 61 88899 941489 8.63 1030388 62 89018 946991 8.59 1036009 63 90167 951301 8.66 1041468 64 89361 945455 8.64 1034816 65 89040 941998 8.64 1031038 66 88938 945316 8.60 1034254 67 88687 935776 8.66 1024463 68 89234 944695 8.63 1033929 69 89335 943683 8.65 1033018 70 89070 941796 8.64 1030866 71 89334 940778 8.67 1030112 72 89728 946720 8.66 1036448 73 89529 939277 8.70 1028806 74 89855 942756 8.70 1032611 75 89796 943280 8.69 1033076 76 89440 938933 8.70 1028373 77 90613 944264 8.76 1034877 78 90001 939976 8.74 1029977 79 89307 938349 8.69 1027656 80 88824 937071 8.66 1025895 81 89673 939594 8.71 1029267 82 89037 936105 8.69 1025142 83 89653 937671 8.73 1027324 84 89685 942313 8.69 1031998 85 90073 940190 8.74 1030263 86 89746 935247 8.76 1024993 87 89910 935204 8.77 1025114 88 89234 931072 8.75 1020306 89 89472 928288 8.79 1017760 90 90049 933138 8.80 1023187 91 89224 930760 8.75 1019984 92 89798 927987 8.82 1017785 93 89611 933293 8.76 1022904 94 89683 925854 8.83 1015537 95 89901 925439 8.85 1015340 96 89906 929182 8.82 1019088 97 90062 926331 8.86 1016393 98 90502 926347 8.90 1016849 99 90247 927922 8.86 1018169 100 89716 922810 8.86 1012526 101 89588 918269 8.89 1007857 102 89892 921684 8.89 1011576 103 89208 913454 8.90 1002662 104 89587 913514 8.93 1003101 105 90550 919609 8.96 1010159 106 90322 913775 9.00 1004097 107 89457 908976 8.96 998433 108 90284 915274 8.98 1005558 109 89829 905180 9.03 995009 110 90181 908517 9.03 998698 111 90410 908238 9.05 998648 112 90979 900963 9.17 991942 113 90927 902515 9.15 993442 114 90602 903675 9.11 994277 115 91360 896794 9.25 988154 116 91018 895274 9.23 986292 117 91361 895268 9.26 986629 118 91487 892216 9.30 983703 119 90977 885957 9.31 976934 120 91490 888676 9.33 980166 121 91124 884417 9.34 975541 122 91530 880450 9.42 971980 123 91799 880145 9.44 971944 124 91268 876175 9.43 967443 125 91831 872005 9.53 963836 126 92386 872168 9.58 964554 127 92284 864514 9.65 956798 128 92663 864705 9.68 957368 129 92740 862449 9.71 955189 130 92249 857125 9.72 949374 131 92653 855991 9.77 948644 132 92857 852349 9.82 945206 133 92724 848802 9.85 941526 134 93577 844442 9.98 938019 135 93179 844024 9.94 937203 136 93307 840048 10.00 933355 137 93869 835580 10.10 929449 138 93916 831002 10.15 924918 139 93050 827718 10.11 920768 140 93137 820073 10.20 913210 141 93096 817732 10.22 910828 142 93509 811660 10.33 905169 143 93798 807708 10.40 901506 144 93014 806086 10.35 899100 145 93915 798024 10.53 891939 146 94879 795603 10.65 890482 147 96091 796124 10.77 892215 148 93915 784599 10.69 878514 149 94963 778657 10.87 873620 150 98421 746903 11.64 845324 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 15355 1791131 0.85 1806486 2 14336 1233249 1.15 1247585 3 7974 1044201 0.76 1052175 4 7197 1313432 0.54 1320629 5 8930 1562585 0.57 1571515 6 8306 1437417 0.57 1445723 7 7671 1230206 0.62 1237877 8 6961 1221312 0.57 1228273 9 6599 1201991 0.55 1208590 10 6486 1205588 0.54 1212074 11 6439 1231541 0.52 1237980 12 6121 1241714 0.49 1247835 13 6005 1242327 0.48 1248332 14 6076 1246999 0.48 1253075 15 6177 1270158 0.48 1276335 16 6174 1283487 0.48 1289661 17 6612 1296608 0.51 1303220 18 6498 1295527 0.50 1302025 19 6459 1294307 0.50 1300766 20 6400 1297460 0.49 1303860 21 6451 1303573 0.49 1310024 22 6409 1296235 0.49 1302644 23 6535 1289393 0.50 1295928 24 6640 1286717 0.51 1293357 25 6509 1285890 0.50 1292399 26 6660 1286999 0.51 1293659 27 6869 1298527 0.53 1305396 28 6871 1292376 0.53 1299247 29 6997 1292960 0.54 1299957 30 7042 1301016 0.54 1308058 31 6900 1300862 0.53 1307762 32 7041 1299458 0.54 1306499 33 7073 1299005 0.54 1306078 34 7026 1296583 0.54 1303609 35 7006 1295447 0.54 1302453 36 6959 1304149 0.53 1311108 37 6909 1298755 0.53 1305664 38 7077 1306161 0.54 1313238 39 7011 1304977 0.53 1311988 40 6933 1304895 0.53 1311828 41 7235 1300643 0.55 1307878 42 7104 1305369 0.54 1312473 43 6914 1296758 0.53 1303672 44 7144 1297368 0.55 1304512 45 7089 1299501 0.54 1306590 46 7172 1291675 0.55 1298847 47 7346 1292913 0.56 1300259 48 7245 1302623 0.55 1309868 49 7367 1298515 0.56 1305882 50 7493 1295333 0.58 1302826 51 7286 1301442 0.56 1308728 52 7461 1297669 0.57 1305130 53 7560 1299297 0.58 1306857 54 7629 1302323 0.58 1309952 55 7650 1297220 0.59 1304870 56 7741 1297778 0.59 1305519 57 7698 1296836 0.59 1304534 58 7819 1299659 0.60 1307478 59 7884 1293470 0.61 1301354 60 7980 1302343 0.61 1310323 61 8056 1300954 0.62 1309010 62 8029 1300179 0.61 1308208 63 8232 1305347 0.63 1313579 64 8282 1296185 0.63 1304467 65 8256 1292097 0.63 1300353 66 8233 1291944 0.63 1300177 67 8334 1289004 0.64 1297338 68 8167 1292442 0.63 1300609 69 8584 1295439 0.66 1304023 70 8510 1289316 0.66 1297826 71 8651 1288064 0.67 1296715 72 8787 1291101 0.68 1299888 73 8709 1289121 0.67 1297830 74 8870 1287190 0.68 1296060 75 9020 1291394 0.69 1300414 76 9136 1289876 0.70 1299012 77 9128 1282950 0.71 1292078 78 9303 1289979 0.72 1299282 79 9177 1285998 0.71 1295175 80 9529 1284141 0.74 1293670 81 9410 1286353 0.73 1295763 82 9642 1279298 0.75 1288940 83 9731 1279461 0.75 1289192 84 9950 1290540 0.77 1300490 85 9795 1282516 0.76 1292311 86 9949 1278171 0.77 1288120 87 10284 1279149 0.80 1289433 88 10397 1274779 0.81 1285176 89 10582 1274434 0.82 1285016 90 10560 1277005 0.82 1287565 91 10911 1269816 0.85 1280727 92 11097 1268272 0.87 1279369 93 11286 1273136 0.88 1284422 94 11420 1273631 0.89 1285051 95 11528 1268398 0.90 1279926 96 11770 1273390 0.92 1285160 97 11848 1264604 0.93 1276452 98 12134 1260668 0.95 1272802 99 12463 1264751 0.98 1277214 100 12503 1260466 0.98 1272969 101 12799 1252336 1.01 1265135 102 13007 1256843 1.02 1269850 103 13115 1250728 1.04 1263843 104 13549 1249972 1.07 1263521 105 14039 1249601 1.11 1263640 106 14236 1246014 1.13 1260250 107 14309 1240708 1.14 1255017 108 14852 1245782 1.18 1260634 109 15201 1239725 1.21 1254926 110 15503 1239348 1.24 1254851 111 15805 1238393 1.26 1254198 112 16075 1235669 1.28 1251744 113 16538 1229111 1.33 1245649 114 17067 1228743 1.37 1245810 115 17204 1220513 1.39 1237717 116 17880 1217932 1.45 1235812 117 18032 1220870 1.46 1238902 118 18716 1215302 1.52 1234018 119 19058 1214606 1.54 1233664 120 20043 1213921 1.62 1233964 121 19955 1206502 1.63 1226457 122 20653 1198699 1.69 1219352 123 20929 1199578 1.71 1220507 124 21734 1194267 1.79 1216001 125 22249 1189632 1.84 1211881 126 22894 1190934 1.89 1213828 127 23594 1185525 1.95 1209119 128 23956 1176178 2.00 1200134 129 24624 1174964 2.05 1199588 130 25163 1165831 2.11 1190994 131 25955 1162090 2.18 1188045 132 26359 1159171 2.22 1185530 133 26764 1152538 2.27 1179302 134 27319 1148174 2.32 1175493 135 27991 1145698 2.38 1173689 136 28672 1134443 2.47 1163115 137 29215 1129547 2.52 1158762 138 29792 1126436 2.58 1156228 139 30481 1119016 2.65 1149497 140 30964 1111710 2.71 1142674 141 31663 1110063 2.77 1141726 142 32338 1101718 2.85 1134056 143 33248 1093194 2.95 1126442 144 34302 1092636 3.04 1126938 145 35155 1088617 3.13 1123772 146 36690 1082603 3.28 1119293 147 37917 1079113 3.39 1117030 148 38976 1067180 3.52 1106156 149 51165 1070366 4.56 1121531 150 46328 1004653 4.41 1050981 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 25447 4565028 0.55 4590475 2 59459 3993575 1.47 4053034 3 27911 3557590 0.78 3585501 4 26579 4532847 0.58 4559426 5 28672 4716890 0.60 4745562 6 26928 4681584 0.57 4708512 7 27221 4150752 0.65 4177973 8 24592 4342950 0.56 4367542 9 24276 4476933 0.54 4501209 10 22864 4509523 0.50 4532387 11 22784 4704345 0.48 4727129 12 22063 4696356 0.47 4718419 13 21248 4685476 0.45 4706724 14 21446 4704129 0.45 4725575 15 22357 4696679 0.47 4719036 16 22886 4653065 0.49 4675951 17 23891 4646615 0.51 4670506 18 24407 4689760 0.52 4714167 19 24943 4690977 0.53 4715920 20 25514 4707659 0.54 4733173 21 26057 4730165 0.55 4756222 22 26334 4684713 0.56 4711047 23 26677 4682342 0.57 4709019 24 27505 4721801 0.58 4749306 25 28198 4724728 0.59 4752926 26 28746 4740163 0.60 4768909 27 29047 4767340 0.61 4796387 28 29095 4766260 0.61 4795355 29 29293 4779147 0.61 4808440 30 29492 4813200 0.61 4842692 31 28849 4796405 0.60 4825254 32 28859 4793843 0.60 4822702 33 28278 4821027 0.58 4849305 34 27675 4787679 0.57 4815354 35 27209 4799425 0.56 4826634 36 27034 4815365 0.56 4842399 37 27027 4801101 0.56 4828128 38 26737 4804954 0.55 4831691 39 27227 4826946 0.56 4854173 40 27124 4810322 0.56 4837446 41 27349 4810240 0.57 4837589 42 27215 4828855 0.56 4856070 43 26883 4798006 0.56 4824889 44 27705 4793413 0.57 4821118 45 27436 4811893 0.57 4839329 46 27669 4799623 0.57 4827292 47 28114 4797198 0.58 4825312 48 27926 4814801 0.58 4842727 49 28256 4792165 0.59 4820421 50 28371 4792652 0.59 4821023 51 28444 4810204 0.59 4838648 52 28753 4796950 0.60 4825703 53 29032 4785829 0.60 4814861 54 28899 4800966 0.60 4829865 55 29103 4788980 0.60 4818083 56 29295 4798717 0.61 4828012 57 29719 4812784 0.61 4842503 58 29705 4798268 0.62 4827973 59 30018 4787590 0.62 4817608 60 30445 4805375 0.63 4835820 61 30567 4779638 0.64 4810205 62 30956 4786218 0.64 4817174 63 31016 4795105 0.64 4826121 64 31539 4773866 0.66 4805405 65 31682 4763743 0.66 4795425 66 32021 4786694 0.66 4818715 67 32291 4770726 0.67 4803017 68 32352 4773979 0.67 4806331 69 33080 4785199 0.69 4818279 70 33229 4781518 0.69 4814747 71 33625 4772394 0.70 4806019 72 34353 4793296 0.71 4827649 73 34248 4767202 0.71 4801450 74 34763 4774467 0.72 4809230 75 34817 4774534 0.72 4809351 76 35456 4760706 0.74 4796162 77 35343 4756306 0.74 4791649 78 36145 4769602 0.75 4805747 79 36424 4749364 0.76 4785788 80 37168 4741044 0.78 4778212 81 37178 4757578 0.78 4794756 82 37585 4740906 0.79 4778491 83 38013 4737590 0.80 4775603 84 38865 4758156 0.81 4797021 85 39322 4722880 0.83 4762202 86 40116 4723574 0.84 4763690 87 40658 4738399 0.85 4779057 88 41185 4723864 0.86 4765049 89 41338 4718856 0.87 4760194 90 42471 4733685 0.89 4776156 91 42489 4703775 0.90 4746264 92 43527 4701576 0.92 4745103 93 44515 4713832 0.94 4758347 94 45078 4694043 0.95 4739121 95 45930 4688929 0.97 4734859 96 46918 4704027 0.99 4750945 97 47366 4678103 1.00 4725469 98 48795 4677292 1.03 4726087 99 49536 4687174 1.05 4736710 100 50155 4669865 1.06 4720020 101 51449 4669805 1.09 4721254 102 52752 4678120 1.12 4730872 103 53026 4646923 1.13 4699949 104 55217 4645226 1.17 4700443 105 56455 4658434 1.20 4714889 106 57269 4633046 1.22 4690315 107 58684 4626946 1.25 4685630 108 59913 4635870 1.28 4695783 109 61695 4611827 1.32 4673522 110 62882 4604648 1.35 4667530 111 64319 4607485 1.38 4671804 112 65977 4591220 1.42 4657197 113 67616 4574573 1.46 4642189 114 69476 4576134 1.50 4645610 115 70780 4560704 1.53 4631484 116 73356 4547729 1.59 4621085 117 74986 4548291 1.62 4623277 118 77113 4530932 1.67 4608045 119 78714 4518665 1.71 4597379 120 81731 4510826 1.78 4592557 121 83667 4496357 1.83 4580024 122 85632 4487737 1.87 4573369 123 88345 4493994 1.93 4582339 124 90229 4469038 1.98 4559267 125 92558 4453812 2.04 4546370 126 94921 4448598 2.09 4543519 127 97313 4414454 2.16 4511767 128 98755 4405577 2.19 4504332 129 102274 4393243 2.28 4495517 130 104725 4375626 2.34 4480351 131 107624 4365290 2.41 4472914 132 110679 4351394 2.48 4462073 133 112055 4326226 2.52 4438281 134 115358 4305769 2.61 4421127 135 117783 4290364 2.67 4408147 136 119882 4263750 2.73 4383632 137 122875 4244017 2.81 4366892 138 125673 4237511 2.88 4363184 139 127331 4211975 2.93 4339306 140 130423 4191716 3.02 4322139 141 133570 4172287 3.10 4305857 142 136244 4147810 3.18 4284054 143 139274 4129581 3.26 4268855 144 144158 4129795 3.37 4273953 145 147437 4106748 3.47 4254185 146 152317 4090435 3.59 4242752 147 161777 4081766 3.81 4243543 148 163435 4038662 3.89 4202097 149 159226 3982625 3.84 4141851 150 152156 3790535 3.86 3942691 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1509071 227692 86.89 1736763 2 525484 119136 81.52 644620 3 393437 183947 68.14 577384 4 452117 308916 59.41 761033 5 301115 350628 46.20 651743 6 226652 385151 37.05 611803 7 173529 476730 26.69 650259 8 151496 546821 21.69 698317 9 129108 605256 17.58 734364 10 110680 639696 14.75 750376 11 95241 680231 12.28 775472 12 85930 684538 11.15 770468 13 79157 685100 10.36 764257 14 74578 685289 9.81 759867 15 70583 682391 9.37 752974 16 68175 676618 9.15 744793 17 67708 673357 9.14 741065 18 66540 664277 9.10 730817 19 66284 657995 9.15 724279 20 65771 653943 9.14 719714 21 65309 652184 9.10 717493 22 64959 646723 9.13 711682 23 64910 643058 9.17 707968 24 63597 638574 9.06 702171 25 63277 634549 9.07 697826 26 63236 631364 9.10 694600 27 61944 625709 9.01 687653 28 61706 621964 9.03 683670 29 60891 617437 8.98 678328 30 60351 612997 8.96 673348 31 59558 606865 8.94 666423 32 59118 600503 8.96 659621 33 58582 595337 8.96 653919 34 57493 589295 8.89 646788 35 56622 581517 8.87 638139 36 56574 575914 8.94 632488 37 55433 569514 8.87 624947 38 54458 562323 8.83 616781 39 53593 554920 8.81 608513 40 53448 547717 8.89 601165 41 52661 541005 8.87 593666 42 51964 535075 8.85 587039 43 50618 528577 8.74 579195 44 50539 519882 8.86 570421 45 49160 512142 8.76 561302 46 48843 506926 8.79 555769 47 48363 500188 8.82 548551 48 47757 492467 8.84 540224 49 46599 486737 8.74 533336 50 46328 480163 8.80 526491 51 45323 471872 8.76 517195 52 44464 465580 8.72 510044 53 43736 458102 8.72 501838 54 42943 450800 8.70 493743 55 42272 444772 8.68 487044 56 41676 438425 8.68 480101 57 41025 431274 8.69 472299 58 40363 425569 8.66 465932 59 40037 418755 8.73 458792 60 39232 410287 8.73 449519 61 38439 405075 8.67 443514 62 37912 397305 8.71 435217 63 36972 390201 8.66 427173 64 36629 384224 8.70 420853 65 35833 377957 8.66 413790 66 35088 371345 8.63 406433 67 34564 365710 8.64 400274 68 33921 358704 8.64 392625 69 33263 352760 8.62 386023 70 32769 346567 8.64 379336 71 31811 340003 8.56 371814 72 31621 334158 8.64 365779 73 31016 328182 8.63 359198 74 30438 323158 8.61 353596 75 29787 315962 8.62 345749 76 29179 309542 8.61 338721 77 28486 304432 8.56 332918 78 28373 297084 8.72 325457 79 27733 293753 8.63 321486 80 27325 287514 8.68 314839 81 26323 282694 8.52 309017 82 26009 277921 8.56 303930 83 25345 271162 8.55 296507 84 24779 265265 8.54 290044 85 24494 260883 8.58 285377 86 24106 254070 8.67 278176 87 23449 250389 8.56 273838 88 23295 245563 8.66 268858 89 22548 240991 8.56 263539 90 22177 236280 8.58 258457 91 21730 231545 8.58 253275 92 21216 226251 8.57 247467 93 20790 221847 8.57 242637 94 20504 216525 8.65 237029 95 20047 212637 8.62 232684 96 19371 207585 8.54 226956 97 19133 204037 8.57 223170 98 18838 199879 8.61 218717 99 18329 195135 8.59 213464 100 17996 191689 8.58 209685 101 17553 187111 8.58 204664 102 17349 183181 8.65 200530 103 17029 180341 8.63 197370 104 16622 175193 8.67 191815 105 16162 172388 8.57 188550 106 15899 168327 8.63 184226 107 15523 165160 8.59 180683 108 15100 160518 8.60 175618 109 14893 157919 8.62 172812 110 14492 154597 8.57 169089 111 14276 151132 8.63 165408 112 13912 147431 8.62 161343 113 13641 144616 8.62 158257 114 13347 141486 8.62 154833 115 12809 138289 8.48 151098 116 12452 136413 8.36 148865 117 12490 133026 8.58 145516 118 12200 129893 8.59 142093 119 11981 127758 8.57 139739 120 11331 124623 8.33 135954 121 11382 121833 8.54 133215 122 11115 119542 8.51 130657 123 10813 117177 8.45 127990 124 10648 114020 8.54 124668 125 10400 111179 8.55 121579 126 10133 109091 8.50 119224 127 10089 107006 8.62 117095 128 9859 105251 8.56 115110 129 9405 102619 8.40 112024 130 9389 100294 8.56 109683 131 9037 98150 8.43 107187 132 9033 95965 8.60 104998 133 8730 93898 8.51 102628 134 8612 90913 8.65 99525 135 8254 90105 8.39 98359 136 8256 87881 8.59 96137 137 7939 85971 8.45 93910 138 7776 84158 8.46 91934 139 7580 83034 8.37 90614 140 7528 80487 8.55 88015 141 7317 79016 8.48 86333 142 7310 77332 8.64 84642 143 6948 75889 8.39 82837 144 6889 74155 8.50 81044 145 6739 72504 8.50 79243 146 6560 70765 8.48 77325 147 6518 69372 8.59 75890 148 6263 66689 8.59 72952 149 5895 59726 8.98 65621 150 5455 0 100.00 5455 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1725181 261929 86.82 1987110 2 1528021 382493 79.98 1910514 3 462441 213327 68.43 675768 4 447725 322043 58.16 769768 5 369970 476846 43.69 846816 6 242486 467732 34.14 710218 7 179097 523806 25.48 702903 8 122068 628716 16.26 750784 9 88415 734542 10.74 822957 10 59615 810872 6.85 870487 11 40753 875531 4.45 916284 12 27074 905707 2.90 932781 13 18526 907347 2.00 925873 14 12956 912178 1.40 925134 15 9316 915705 1.01 925021 16 7639 916967 0.83 924606 17 7090 914484 0.77 921574 18 6006 907306 0.66 913312 19 6191 896384 0.69 902575 20 5670 881018 0.64 886688 21 5277 875521 0.60 880798 22 5821 873902 0.66 879723 23 5260 868732 0.60 873992 24 4645 861145 0.54 865790 25 4772 856495 0.55 861267 26 4603 849797 0.54 854400 27 4460 845560 0.52 850020 28 4582 839457 0.54 844039 29 4251 832578 0.51 836829 30 4132 825236 0.50 829368 31 4154 819204 0.50 823358 32 4102 810264 0.50 814366 33 3898 802813 0.48 806711 34 3846 796502 0.48 800348 35 3850 786898 0.49 790748 36 3809 778385 0.49 782194 37 3747 769931 0.48 773678 38 3639 760265 0.48 763904 39 3632 751821 0.48 755453 40 3693 742661 0.49 746354 41 3546 734154 0.48 737700 42 3632 724605 0.50 728237 43 3459 715546 0.48 719005 44 3431 705972 0.48 709403 45 3374 694695 0.48 698069 46 3384 685865 0.49 689249 47 3196 676380 0.47 679576 48 3194 667699 0.48 670893 49 3264 656954 0.49 660218 50 3212 648127 0.49 651339 51 3051 638505 0.48 641556 52 2940 628988 0.47 631928 53 3052 619501 0.49 622553 54 2867 610640 0.47 613507 55 2949 600731 0.49 603680 56 2746 591235 0.46 593981 57 2753 582128 0.47 584881 58 2837 573621 0.49 576458 59 2702 561819 0.48 564521 60 2673 554982 0.48 557655 61 2615 544239 0.48 546854 62 2684 536266 0.50 538950 63 2512 526561 0.47 529073 64 2540 519214 0.49 521754 65 2527 509967 0.49 512494 66 2329 501197 0.46 503526 67 2356 492842 0.48 495198 68 2361 485718 0.48 488079 69 2242 475542 0.47 477784 70 2245 467953 0.48 470198 71 2253 459714 0.49 461967 72 2224 449968 0.49 452192 73 2101 443033 0.47 445134 74 2097 434419 0.48 436516 75 2126 427630 0.49 429756 76 1968 418911 0.47 420879 77 2001 411365 0.48 413366 78 1990 403332 0.49 405322 79 1958 396492 0.49 398450 80 1810 387932 0.46 389742 81 1794 381458 0.47 383252 82 1810 374604 0.48 376414 83 1766 367381 0.48 369147 84 1777 358886 0.49 360663 85 1754 353072 0.49 354826 86 1669 345267 0.48 346936 87 1583 338518 0.47 340101 88 1580 332526 0.47 334106 89 1558 326344 0.48 327902 90 1552 319369 0.48 320921 91 1508 312799 0.48 314307 92 1461 307025 0.47 308486 93 1460 300818 0.48 302278 94 1374 294080 0.47 295454 95 1465 288284 0.51 289749 96 1358 282590 0.48 283948 97 1305 275845 0.47 277150 98 1339 271811 0.49 273150 99 1213 265187 0.46 266400 100 1277 260622 0.49 261899 101 1245 254787 0.49 256032 102 1246 250844 0.49 252090 103 1173 244601 0.48 245774 104 1180 239528 0.49 240708 105 1122 233077 0.48 234199 106 1093 230275 0.47 231368 107 1121 224931 0.50 226052 108 1070 219607 0.48 220677 109 1057 214848 0.49 215905 110 973 211418 0.46 212391 111 969 207185 0.47 208154 112 985 202801 0.48 203786 113 992 198223 0.50 199215 114 911 194461 0.47 195372 115 967 189750 0.51 190717 116 825 185297 0.44 186122 117 901 181611 0.49 182512 118 841 177898 0.47 178739 119 822 175018 0.47 175840 120 843 170701 0.49 171544 121 762 167222 0.45 167984 122 809 163561 0.49 164370 123 788 160428 0.49 161216 124 751 157259 0.48 158010 125 742 153190 0.48 153932 126 727 150362 0.48 151089 127 692 146684 0.47 147376 128 725 143925 0.50 144650 129 737 140791 0.52 141528 130 668 138612 0.48 139280 131 707 135810 0.52 136517 132 633 132706 0.47 133339 133 662 129831 0.51 130493 134 572 126977 0.45 127549 135 633 124390 0.51 125023 136 629 122462 0.51 123091 137 642 118690 0.54 119332 138 548 116077 0.47 116625 139 553 114156 0.48 114709 140 577 111452 0.52 112029 141 545 109289 0.50 109834 142 556 106403 0.52 106959 143 547 104625 0.52 105172 144 551 102842 0.53 103393 145 540 100585 0.53 101125 146 515 98716 0.52 99231 147 503 96622 0.52 97125 148 466 93044 0.50 93510 149 368 83725 0.44 84093 150 277 0 100.00 277 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4958152 745979 86.92 5704131 2 4103018 1011807 80.22 5114825 3 3537739 1829470 65.91 5367209 4 3013656 2267300 57.07 5280956 5 2003835 2618090 43.35 4621925 6 1476003 2813115 34.41 4289118 7 1053594 2910544 26.58 3964138 8 749718 2950337 20.26 3700055 9 516340 3066238 14.41 3582578 10 346813 3182515 9.83 3529328 11 222897 3384654 6.18 3607551 12 145257 3457175 4.03 3602432 13 94703 3489364 2.64 3584067 14 61931 3505765 1.74 3567696 15 43395 3521921 1.22 3565316 16 33139 3535795 0.93 3568934 17 27801 3540191 0.78 3567992 18 24547 3535714 0.69 3560261 19 23214 3513552 0.66 3536766 20 22604 3475483 0.65 3498087 21 21906 3439211 0.63 3461117 22 21572 3403060 0.63 3424632 23 21637 3365081 0.64 3386718 24 20634 3326365 0.62 3346999 25 19583 3288007 0.59 3307590 26 19281 3254404 0.59 3273685 27 18179 3212856 0.56 3231035 28 17694 3184266 0.55 3201960 29 16864 3148051 0.53 3164915 30 16980 3114233 0.54 3131213 31 16165 3078589 0.52 3094754 32 15601 3048579 0.51 3064180 33 15297 3013226 0.51 3028523 34 14763 2977811 0.49 2992574 35 14664 2945779 0.50 2960443 36 14063 2910702 0.48 2924765 37 14086 2878848 0.49 2892934 38 13781 2844485 0.48 2858266 39 13736 2810251 0.49 2823987 40 13424 2777324 0.48 2790748 41 13101 2741046 0.48 2754147 42 13151 2704512 0.48 2717663 43 12730 2669259 0.47 2681989 44 12600 2633438 0.48 2646038 45 12491 2597587 0.48 2610078 46 12339 2559956 0.48 2572295 47 12161 2524645 0.48 2536806 48 11927 2491945 0.48 2503872 49 11907 2456053 0.48 2467960 50 11591 2421663 0.48 2433254 51 11561 2389679 0.48 2401240 52 11187 2352490 0.47 2363677 53 11140 2314435 0.48 2325575 54 11092 2278170 0.48 2289262 55 10780 2244885 0.48 2255665 56 10577 2207654 0.48 2218231 57 10289 2174002 0.47 2184291 58 10296 2142182 0.48 2152478 59 9942 2107688 0.47 2117630 60 9851 2071039 0.47 2080890 61 9787 2038791 0.48 2048578 62 9686 2007770 0.48 2017456 63 9400 1974620 0.47 1984020 64 9410 1939738 0.48 1949148 65 9241 1907356 0.48 1916597 66 8852 1874469 0.47 1883321 67 8860 1842913 0.48 1851773 68 8549 1810742 0.47 1819291 69 8586 1781057 0.48 1789643 70 8376 1750141 0.48 1758517 71 8238 1715369 0.48 1723607 72 8000 1688341 0.47 1696341 73 8076 1658299 0.48 1666375 74 7701 1628605 0.47 1636306 75 7471 1599052 0.47 1606523 76 7709 1566641 0.49 1574350 77 7358 1539327 0.48 1546685 78 7218 1510715 0.48 1517933 79 7073 1482270 0.47 1489343 80 7104 1453494 0.49 1460598 81 6871 1426314 0.48 1433185 82 6734 1401952 0.48 1408686 83 6695 1374179 0.48 1380874 84 6419 1349137 0.47 1355556 85 6217 1322702 0.47 1328919 86 6140 1297924 0.47 1304064 87 5996 1271897 0.47 1277893 88 5825 1245602 0.47 1251427 89 5876 1222554 0.48 1228430 90 5617 1199097 0.47 1204714 91 5499 1175289 0.47 1180788 92 5435 1151438 0.47 1156873 93 5304 1128335 0.47 1133639 94 5325 1105156 0.48 1110481 95 5028 1084481 0.46 1089509 96 5098 1061449 0.48 1066547 97 5059 1040604 0.48 1045663 98 5000 1018363 0.49 1023363 99 4642 998377 0.46 1003019 100 4748 979721 0.48 984469 101 4644 958383 0.48 963027 102 4500 938915 0.48 943415 103 4310 918724 0.47 923034 104 4198 898203 0.47 902401 105 4248 881536 0.48 885784 106 4019 862150 0.46 866169 107 3944 844394 0.46 848338 108 3978 826694 0.48 830672 109 3856 811247 0.47 815103 110 3864 793871 0.48 797735 111 3815 777757 0.49 781572 112 3562 760451 0.47 764013 113 3584 744294 0.48 747878 114 3459 729706 0.47 733165 115 3385 714053 0.47 717438 116 3212 699361 0.46 702573 117 3259 682272 0.48 685531 118 3317 669440 0.49 672757 119 3137 655388 0.48 658525 120 2988 642305 0.46 645293 121 3114 628647 0.49 631761 122 3052 614092 0.49 617144 123 2801 602475 0.46 605276 124 2867 589402 0.48 592269 125 2726 577926 0.47 580652 126 2806 566341 0.49 569147 127 2684 554024 0.48 556708 128 2593 542014 0.48 544607 129 2594 530888 0.49 533482 130 2434 518332 0.47 520766 131 2468 508226 0.48 510694 132 2395 497492 0.48 499887 133 2403 486919 0.49 489322 134 2288 477227 0.48 479515 135 2375 467148 0.51 469523 136 2250 457762 0.49 460012 137 2092 448450 0.46 450542 138 2177 438507 0.49 440684 139 2077 429529 0.48 431606 140 2061 419560 0.49 421621 141 2061 410875 0.50 412936 142 1929 402456 0.48 404385 143 1930 394293 0.49 396223 144 1848 385144 0.48 386992 145 1904 378897 0.50 380801 146 1868 371010 0.50 372878 147 1807 361599 0.50 363406 148 1673 350759 0.47 352432 149 1445 317192 0.45 318637 150 1093 0 100.00 1093