CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 101798 558419 15.42 660217 2 65630 298022 18.05 363652 3 88266 555505 13.71 643771 4 95234 612691 13.45 707925 5 95089 606101 13.56 701190 6 100439 626308 13.82 726747 7 94519 583791 13.93 678310 8 97458 611497 13.75 708955 9 97520 608942 13.80 706462 10 95236 604692 13.61 699928 11 93684 595347 13.60 689031 12 94098 594893 13.66 688991 13 93928 596577 13.60 690505 14 94163 595674 13.65 689837 15 95006 597813 13.71 692819 16 96187 600406 13.81 696593 17 95006 600991 13.65 695997 18 96794 605693 13.78 702487 19 97118 611617 13.70 708735 20 97353 613888 13.69 711241 21 98358 614687 13.79 713045 22 97431 611819 13.74 709250 23 97884 614141 13.75 712025 24 98373 619086 13.71 717459 25 97759 617040 13.68 714799 26 98154 618380 13.70 716534 27 98017 620300 13.65 718317 28 98003 623635 13.58 721638 29 98482 622132 13.67 720614 30 98403 624304 13.62 722707 31 98083 625502 13.56 723585 32 97756 623846 13.55 721602 33 98296 624295 13.60 722591 34 98150 625533 13.56 723683 35 98342 623886 13.62 722228 36 98502 625610 13.60 724112 37 97887 625160 13.54 723047 38 98253 626704 13.55 724957 39 98232 626994 13.55 725226 40 98789 626911 13.61 725700 41 98349 627006 13.56 725355 42 99089 630742 13.58 729831 43 98052 627260 13.52 725312 44 98124 625300 13.56 723424 45 98876 627421 13.61 726297 46 97752 626016 13.51 723768 47 98528 625038 13.62 723566 48 97912 627873 13.49 725785 49 98242 626798 13.55 725040 50 98555 625434 13.61 723989 51 98608 625863 13.61 724471 52 98071 626172 13.54 724243 53 98139 626886 13.54 725025 54 98235 626769 13.55 725004 55 97643 628335 13.45 725978 56 98152 625429 13.56 723581 57 97840 625935 13.52 723775 58 97874 625799 13.52 723673 59 97533 624646 13.51 722179 60 98423 626773 13.57 725196 61 97875 625260 13.53 723135 62 97649 625708 13.50 723357 63 98694 626750 13.60 725444 64 97726 624814 13.53 722540 65 97723 624820 13.52 722543 66 97633 626008 13.49 723641 67 97980 626614 13.52 724594 68 97607 624855 13.51 722462 69 97570 624734 13.51 722304 70 97610 624210 13.52 721820 71 97890 624314 13.55 722204 72 98020 625664 13.54 723684 73 97551 622606 13.55 720157 74 98298 622098 13.64 720396 75 97641 625265 13.51 722906 76 97617 624301 13.52 721918 77 97348 622705 13.52 720053 78 97190 621913 13.52 719103 79 97712 623976 13.54 721688 80 97498 624553 13.50 722051 81 97190 623789 13.48 720979 82 97551 624919 13.50 722470 83 96952 622429 13.48 719381 84 96962 623200 13.46 720162 85 97423 625380 13.48 722803 86 97722 624056 13.54 721778 87 97350 623427 13.51 720777 88 96839 624560 13.42 721399 89 97956 621223 13.62 719179 90 97087 623709 13.47 720796 91 97357 622102 13.53 719459 92 97695 621989 13.57 719684 93 97703 622084 13.57 719787 94 97993 622678 13.60 720671 95 97729 621439 13.59 719168 96 97729 622150 13.58 719879 97 97689 621405 13.59 719094 98 96628 621553 13.45 718181 99 97656 623125 13.55 720781 100 97064 620670 13.52 717734 101 96562 618877 13.50 715439 102 97651 620508 13.60 718159 103 96430 620637 13.45 717067 104 97004 620207 13.53 717211 105 96466 620005 13.46 716471 106 96667 619407 13.50 716074 107 96482 619468 13.48 715950 108 96348 621211 13.43 717559 109 96509 620077 13.47 716586 110 97368 618729 13.60 716097 111 96345 620555 13.44 716900 112 96183 619645 13.44 715828 113 96179 619978 13.43 716157 114 97096 620860 13.52 717956 115 96976 619922 13.53 716898 116 96239 619222 13.45 715461 117 97052 619307 13.55 716359 118 95995 618569 13.43 714564 119 95898 617340 13.45 713238 120 95977 619697 13.41 715674 121 96032 617625 13.46 713657 122 96373 617194 13.51 713567 123 95968 618572 13.43 714540 124 96216 619132 13.45 715348 125 96263 619404 13.45 715667 126 95905 616181 13.47 712086 127 95601 615967 13.44 711568 128 95946 616219 13.47 712165 129 95250 616718 13.38 711968 130 95411 615659 13.42 711070 131 95983 613527 13.53 709510 132 95320 615105 13.42 710425 133 95398 614038 13.45 709436 134 95264 613193 13.45 708457 135 95115 615278 13.39 710393 136 95437 615631 13.42 711068 137 95123 612859 13.44 707982 138 94621 613862 13.36 708483 139 94642 612272 13.39 706914 140 94627 610699 13.42 705326 141 94721 611486 13.41 706207 142 94419 610191 13.40 704610 143 93792 610354 13.32 704146 144 93545 609821 13.30 703366 145 92865 611005 13.19 703870 146 92773 609279 13.21 702052 147 92241 610103 13.13 702344 148 91348 606289 13.09 697637 149 89945 603750 12.97 693695 150 79096 561259 12.35 640355 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4212 877904 0.48 882116 2 2103 711668 0.29 713771 3 2400 953465 0.25 955865 4 2509 993677 0.25 996186 5 2369 980454 0.24 982823 6 2389 971574 0.25 973963 7 2423 985860 0.25 988283 8 2578 996257 0.26 998835 9 2409 986864 0.24 989273 10 2328 965852 0.24 968180 11 2434 965803 0.25 968237 12 2288 968637 0.24 970925 13 2307 970714 0.24 973021 14 2354 969459 0.24 971813 15 2256 973426 0.23 975682 16 2336 972199 0.24 974535 17 2434 977070 0.25 979504 18 2470 987001 0.25 989471 19 2363 991570 0.24 993933 20 2308 993275 0.23 995583 21 2406 996814 0.24 999220 22 2313 994029 0.23 996342 23 2370 1000147 0.24 1002517 24 2394 1003531 0.24 1005925 25 2372 998620 0.24 1000992 26 2535 1001355 0.25 1003890 27 2499 1008670 0.25 1011169 28 2458 1007092 0.24 1009550 29 2539 1010588 0.25 1013127 30 2676 1010643 0.26 1013319 31 2436 1009797 0.24 1012233 32 2618 1012022 0.26 1014640 33 2542 1013587 0.25 1016129 34 2545 1011725 0.25 1014270 35 2439 1010361 0.24 1012800 36 2512 1013411 0.25 1015923 37 2462 1011124 0.24 1013586 38 2402 1009536 0.24 1011938 39 2539 1011312 0.25 1013851 40 2534 1012537 0.25 1015071 41 2581 1013817 0.25 1016398 42 2526 1013409 0.25 1015935 43 2488 1011818 0.25 1014306 44 2525 1013492 0.25 1016017 45 2455 1012550 0.24 1015005 46 2523 1012232 0.25 1014755 47 2587 1010636 0.26 1013223 48 2496 1014022 0.25 1016518 49 2644 1008917 0.26 1011561 50 2596 1008491 0.26 1011087 51 2513 1009096 0.25 1011609 52 2590 1009597 0.26 1012187 53 2506 1008330 0.25 1010836 54 2446 1010119 0.24 1012565 55 2596 1007889 0.26 1010485 56 2657 1005743 0.26 1008400 57 2600 1006841 0.26 1009441 58 2635 1007213 0.26 1009848 59 2563 1007408 0.25 1009971 60 2511 1009613 0.25 1012124 61 2580 1009349 0.25 1011929 62 2502 1006192 0.25 1008694 63 2631 1008125 0.26 1010756 64 2695 1007052 0.27 1009747 65 2624 1006110 0.26 1008734 66 2612 1008580 0.26 1011192 67 2681 1004892 0.27 1007573 68 2661 1002363 0.26 1005024 69 2576 1006903 0.26 1009479 70 2566 1004269 0.25 1006835 71 2725 1004088 0.27 1006813 72 2627 1004819 0.26 1007446 73 2648 1003700 0.26 1006348 74 2589 1005152 0.26 1007741 75 2706 1006889 0.27 1009595 76 2584 1006137 0.26 1008721 77 2486 1002869 0.25 1005355 78 2480 1006330 0.25 1008810 79 2585 1005037 0.26 1007622 80 2461 1002905 0.24 1005366 81 2462 1005198 0.24 1007660 82 2570 1005234 0.26 1007804 83 2640 1002462 0.26 1005102 84 2465 1006503 0.24 1008968 85 2473 1003915 0.25 1006388 86 2516 1003430 0.25 1005946 87 3030 1000629 0.30 1003659 88 2684 998445 0.27 1001129 89 2514 1001452 0.25 1003966 90 2550 1002296 0.25 1004846 91 2816 1001165 0.28 1003981 92 2550 997231 0.26 999781 93 2488 1001100 0.25 1003588 94 2539 1001231 0.25 1003770 95 2646 997916 0.26 1000562 96 2552 1000517 0.25 1003069 97 2717 1000540 0.27 1003257 98 2789 999251 0.28 1002040 99 2660 998307 0.27 1000967 100 2694 997915 0.27 1000609 101 2756 996727 0.28 999483 102 2631 998508 0.26 1001139 103 2731 997111 0.27 999842 104 2674 998691 0.27 1001365 105 2709 996730 0.27 999439 106 2709 998123 0.27 1000832 107 2954 996815 0.30 999769 108 2727 999647 0.27 1002374 109 2642 994251 0.27 996893 110 2606 995498 0.26 998104 111 2657 997539 0.27 1000196 112 2776 994032 0.28 996808 113 2772 996070 0.28 998842 114 2685 996334 0.27 999019 115 2820 991940 0.28 994760 116 2690 993309 0.27 995999 117 2806 995036 0.28 997842 118 2824 995450 0.28 998274 119 2782 993789 0.28 996571 120 2827 993102 0.28 995929 121 2856 992664 0.29 995520 122 2819 991512 0.28 994331 123 2849 993138 0.29 995987 124 2853 994218 0.29 997071 125 2887 991117 0.29 994004 126 2771 993199 0.28 995970 127 2835 991406 0.29 994241 128 2867 989827 0.29 992694 129 2919 990646 0.29 993565 130 2892 989932 0.29 992824 131 3030 987623 0.31 990653 132 2971 990970 0.30 993941 133 2871 987865 0.29 990736 134 3029 987698 0.31 990727 135 2886 989455 0.29 992341 136 3061 987592 0.31 990653 137 3117 982765 0.32 985882 138 2968 987093 0.30 990061 139 2998 984653 0.30 987651 140 3125 984563 0.32 987688 141 2997 984808 0.30 987805 142 3078 983211 0.31 986289 143 3007 980670 0.31 983677 144 3028 983164 0.31 986192 145 3082 982611 0.31 985693 146 3046 979687 0.31 982733 147 3013 978350 0.31 981363 148 3252 971696 0.33 974948 149 2915 963650 0.30 966565 150 2256 905697 0.25 907953 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 18640 4247482 0.44 4266122 2 9045 3553495 0.25 3562540 3 9788 4336265 0.23 4346053 4 9474 4455049 0.21 4464523 5 9186 4364124 0.21 4373310 6 9586 4443534 0.22 4453120 7 8894 4406314 0.20 4415208 8 8871 4434100 0.20 4442971 9 8850 4386836 0.20 4395686 10 8743 4375350 0.20 4384093 11 8696 4376542 0.20 4385238 12 8311 4362132 0.19 4370443 13 8486 4359611 0.19 4368097 14 8413 4353563 0.19 4361976 15 8440 4362891 0.19 4371331 16 8297 4366320 0.19 4374617 17 8354 4382315 0.19 4390669 18 8491 4416047 0.19 4424538 19 8527 4428205 0.19 4436732 20 8448 4431112 0.19 4439560 21 8337 4435074 0.19 4443411 22 8507 4426199 0.19 4434706 23 8374 4429193 0.19 4437567 24 8522 4441329 0.19 4449851 25 8553 4449165 0.19 4457718 26 8636 4452596 0.19 4461232 27 8851 4449574 0.20 4458425 28 8847 4457079 0.20 4465926 29 8718 4455995 0.20 4464713 30 9069 4465362 0.20 4474431 31 8581 4462073 0.19 4470654 32 8695 4456601 0.19 4465296 33 8742 4454965 0.20 4463707 34 8689 4462381 0.19 4471070 35 8712 4461565 0.19 4470277 36 8660 4461880 0.19 4470540 37 8623 4463667 0.19 4472290 38 8745 4463848 0.20 4472593 39 9018 4468549 0.20 4477567 40 9028 4466930 0.20 4475958 41 9019 4464952 0.20 4473971 42 8871 4469772 0.20 4478643 43 8764 4462484 0.20 4471248 44 8662 4469852 0.19 4478514 45 8737 4472279 0.19 4481016 46 8807 4464426 0.20 4473233 47 8778 4462549 0.20 4471327 48 8736 4458027 0.20 4466763 49 8670 4457500 0.19 4466170 50 8699 4456113 0.19 4464812 51 8717 4462604 0.19 4471321 52 8840 4465693 0.20 4474533 53 8761 4459506 0.20 4468267 54 8670 4466056 0.19 4474726 55 8775 4461074 0.20 4469849 56 8926 4463455 0.20 4472381 57 8898 4466949 0.20 4475847 58 8746 4464329 0.20 4473075 59 8846 4458265 0.20 4467111 60 8869 4461643 0.20 4470512 61 8895 4462579 0.20 4471474 62 8858 4460686 0.20 4469544 63 8851 4460524 0.20 4469375 64 8957 4452932 0.20 4461889 65 9003 4455228 0.20 4464231 66 9126 4456821 0.20 4465947 67 8919 4459396 0.20 4468315 68 8987 4458670 0.20 4467657 69 8882 4459448 0.20 4468330 70 8956 4459120 0.20 4468076 71 8900 4458194 0.20 4467094 72 9173 4460009 0.21 4469182 73 9046 4456778 0.20 4465824 74 9159 4453561 0.21 4462720 75 9125 4462773 0.20 4471898 76 8808 4457391 0.20 4466199 77 8672 4455360 0.19 4464032 78 8753 4464024 0.20 4472777 79 8771 4457927 0.20 4466698 80 8738 4455653 0.20 4464391 81 8864 4459182 0.20 4468046 82 8747 4458578 0.20 4467325 83 8716 4454438 0.20 4463154 84 8927 4463106 0.20 4472033 85 8842 4460761 0.20 4469603 86 8852 4459394 0.20 4468246 87 10710 4452749 0.24 4463459 88 9124 4454681 0.20 4463805 89 8841 4454273 0.20 4463114 90 8788 4463782 0.20 4472570 91 9677 4455570 0.22 4465247 92 8946 4456608 0.20 4465554 93 8931 4458403 0.20 4467334 94 9011 4457765 0.20 4466776 95 9369 4458045 0.21 4467414 96 9216 4463295 0.21 4472511 97 9049 4455290 0.20 4464339 98 9778 4452766 0.22 4462544 99 9099 4463077 0.20 4472176 100 9246 4463143 0.21 4472389 101 9318 4461674 0.21 4470992 102 9098 4467875 0.20 4476973 103 9280 4460797 0.21 4470077 104 9112 4455478 0.20 4464590 105 9185 4459254 0.21 4468439 106 9469 4458134 0.21 4467603 107 10312 4451665 0.23 4461977 108 9293 4459185 0.21 4468478 109 8979 4454674 0.20 4463653 110 9180 4456994 0.21 4466174 111 9253 4458791 0.21 4468044 112 9294 4459359 0.21 4468653 113 9377 4451741 0.21 4461118 114 9114 4457434 0.20 4466548 115 9472 4452839 0.21 4462311 116 9376 4453681 0.21 4463057 117 9510 4461803 0.21 4471313 118 9369 4456234 0.21 4465603 119 9373 4455368 0.21 4464741 120 9657 4452609 0.22 4462266 121 10035 4449320 0.23 4459355 122 9765 4451880 0.22 4461645 123 9434 4458946 0.21 4468380 124 9697 4456136 0.22 4465833 125 9880 4453511 0.22 4463391 126 9717 4458159 0.22 4467876 127 9883 4451911 0.22 4461794 128 9740 4452057 0.22 4461797 129 9921 4449196 0.22 4459117 130 10025 4449424 0.22 4459449 131 10149 4445611 0.23 4455760 132 10099 4449750 0.23 4459849 133 10084 4446739 0.23 4456823 134 10166 4442686 0.23 4452852 135 10164 4438333 0.23 4448497 136 10478 4440558 0.24 4451036 137 10943 4439304 0.25 4450247 138 10284 4440883 0.23 4451167 139 10198 4437298 0.23 4447496 140 10631 4431004 0.24 4441635 141 10357 4436096 0.23 4446453 142 10451 4436602 0.24 4447053 143 10214 4433881 0.23 4444095 144 10227 4433600 0.23 4443827 145 10334 4437823 0.23 4448157 146 10426 4437846 0.23 4448272 147 10635 4434160 0.24 4444795 148 10814 4414759 0.24 4425573 149 9878 4376418 0.23 4386296 150 7764 4166192 0.19 4173956 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2534 941632 0.27 944166 2 11781 639056 1.81 650837 3 48101 333184 12.62 381285 4 72749 569214 11.33 641963 5 79580 623437 11.32 703017 6 77957 620504 11.16 698461 7 79395 639285 11.05 718680 8 72578 594999 10.87 667577 9 77010 623729 10.99 700739 10 77733 615152 11.22 692885 11 77565 608559 11.30 686124 12 77837 599768 11.49 677605 13 79960 597877 11.80 677837 14 80620 598672 11.87 679292 15 80960 594914 11.98 675874 16 82749 597621 12.16 680370 17 84695 599359 12.38 684054 18 85918 599916 12.53 685834 19 86798 604089 12.56 690887 20 87899 606098 12.67 693997 21 89364 611101 12.76 700465 22 90046 610720 12.85 700766 23 90202 608841 12.90 699043 24 89691 606844 12.88 696535 25 91279 613309 12.95 704588 26 91145 614993 12.91 706138 27 91622 611615 13.03 703237 28 91748 613780 13.00 705528 29 91790 614384 13.00 706174 30 91414 615249 12.94 706663 31 92642 615598 13.08 708240 32 92437 615330 13.06 707767 33 91756 614665 12.99 706421 34 91951 613261 13.04 705212 35 91952 612931 13.05 704883 36 91692 613721 13.00 705413 37 92461 613843 13.09 706304 38 92115 613420 13.06 705535 39 92419 612403 13.11 704822 40 92265 613288 13.08 705553 41 92645 613739 13.12 706384 42 92650 611429 13.16 704079 43 93147 612350 13.20 705497 44 92459 611897 13.13 704356 45 92018 607977 13.15 699995 46 92902 608564 13.24 701466 47 92103 608000 13.16 700103 48 92387 607160 13.21 699547 49 92603 607181 13.23 699784 50 92274 605467 13.22 697741 51 91903 604543 13.20 696446 52 92855 604330 13.32 697185 53 92110 604602 13.22 696712 54 91762 601475 13.24 693237 55 91733 600541 13.25 692274 56 91080 600922 13.16 692002 57 91119 598863 13.21 689982 58 91064 599862 13.18 690926 59 91219 597601 13.24 688820 60 90912 596091 13.23 687003 61 91789 596408 13.34 688197 62 91258 594276 13.31 685534 63 90769 592375 13.29 683144 64 90870 591426 13.32 682296 65 90703 588750 13.35 679453 66 89863 587052 13.28 676915 67 89648 588388 13.22 678036 68 89506 585499 13.26 675005 69 89079 584001 13.23 673080 70 89149 581233 13.30 670382 71 89618 580112 13.38 669730 72 88645 578345 13.29 666990 73 88780 577723 13.32 666503 74 88943 575876 13.38 664819 75 88133 573261 13.33 661394 76 88215 573342 13.33 661557 77 87575 569155 13.34 656730 78 87165 567810 13.31 654975 79 86925 564251 13.35 651176 80 86458 562712 13.32 649170 81 86563 558926 13.41 645489 82 85627 559250 13.28 644877 83 85221 556853 13.27 642074 84 85565 553935 13.38 639500 85 84752 551250 13.33 636002 86 84513 549721 13.33 634234 87 84389 546999 13.37 631388 88 83943 544696 13.35 628639 89 83960 541981 13.41 625941 90 83046 538724 13.36 621770 91 82491 534782 13.36 617273 92 82219 533191 13.36 615410 93 81455 527971 13.37 609426 94 81480 526629 13.40 608109 95 80668 524298 13.33 604966 96 80591 520681 13.40 601272 97 79578 518736 13.30 598314 98 78860 512839 13.33 591699 99 78537 509732 13.35 588269 100 78607 507687 13.41 586294 101 77445 504982 13.30 582427 102 76267 499413 13.25 575680 103 77121 497469 13.42 574590 104 76063 492571 13.38 568634 105 75081 487926 13.34 563007 106 74823 485642 13.35 560465 107 74182 481412 13.35 555594 108 73067 477785 13.26 550852 109 73142 474367 13.36 547509 110 72374 469730 13.35 542104 111 71636 465035 13.35 536671 112 71090 461691 13.34 532781 113 70484 459146 13.31 529630 114 69722 454737 13.29 524459 115 69178 448502 13.36 517680 116 68625 445219 13.36 513844 117 67597 440542 13.30 508139 118 67724 437192 13.41 504916 119 66067 431961 13.27 498028 120 65128 427580 13.22 492708 121 65380 423350 13.38 488730 122 64670 417057 13.42 481727 123 63699 414207 13.33 477906 124 62707 408570 13.31 471277 125 62312 404427 13.35 466739 126 61370 400317 13.29 461687 127 60610 395638 13.28 456248 128 60222 389918 13.38 450140 129 59274 385816 13.32 445090 130 58253 380993 13.26 439246 131 57596 376162 13.28 433758 132 57042 370910 13.33 427952 133 56356 365666 13.35 422022 134 56119 361135 13.45 417254 135 54728 355722 13.33 410450 136 53877 353039 13.24 406916 137 53345 347753 13.30 401098 138 52273 341935 13.26 394208 139 51800 336441 13.34 388241 140 50944 331586 13.32 382530 141 50344 325957 13.38 376301 142 49264 321315 13.29 370579 143 48777 316173 13.37 364950 144 47405 311157 13.22 358562 145 46692 305215 13.27 351907 146 45983 299531 13.31 345514 147 44847 292294 13.30 337141 148 43842 282742 13.42 326584 149 42061 262837 13.80 304898 150 39739 0 100.00 39739 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1929 841964 0.23 843893 2 2101 1258328 0.17 1260429 3 1905 943309 0.20 945214 4 1741 713155 0.24 714896 5 2134 928973 0.23 931107 6 2609 985841 0.26 988450 7 2586 975444 0.26 978030 8 2364 957922 0.25 960286 9 2422 970557 0.25 972979 10 2358 983418 0.24 985776 11 2359 973419 0.24 975778 12 2215 956913 0.23 959128 13 2346 952862 0.25 955208 14 2281 952979 0.24 955260 15 2308 955886 0.24 958194 16 2359 954699 0.25 957058 17 2334 958532 0.24 960866 18 2397 960127 0.25 962524 19 2444 964623 0.25 967067 20 2635 972292 0.27 974927 21 2438 981280 0.25 983718 22 2579 979802 0.26 982381 23 3142 979023 0.32 982165 24 2476 982341 0.25 984817 25 2437 984837 0.25 987274 26 2461 990228 0.25 992689 27 3233 988141 0.33 991374 28 2457 989274 0.25 991731 29 2660 990990 0.27 993650 30 2504 991471 0.25 993975 31 2561 991541 0.26 994102 32 2433 995426 0.24 997859 33 2667 993280 0.27 995947 34 2517 990477 0.25 992994 35 2564 991404 0.26 993968 36 2611 991673 0.26 994284 37 2693 988654 0.27 991347 38 2536 989455 0.26 991991 39 2464 989468 0.25 991932 40 2479 988877 0.25 991356 41 2512 989514 0.25 992026 42 2438 987591 0.25 990029 43 2475 983407 0.25 985882 44 2589 986695 0.26 989284 45 2520 984603 0.26 987123 46 2483 982599 0.25 985082 47 2463 983206 0.25 985669 48 2565 981060 0.26 983625 49 2495 978933 0.25 981428 50 2425 981702 0.25 984127 51 2529 975646 0.26 978175 52 2355 972351 0.24 974706 53 2572 973912 0.26 976484 54 2443 971801 0.25 974244 55 2521 968977 0.26 971498 56 2478 968843 0.26 971321 57 2501 968197 0.26 970698 58 2441 964200 0.25 966641 59 2421 963349 0.25 965770 60 2439 960873 0.25 963312 61 2404 958075 0.25 960479 62 2507 959103 0.26 961610 63 2348 956557 0.24 958905 64 2547 950682 0.27 953229 65 2548 950999 0.27 953547 66 2522 949148 0.27 951670 67 2451 945718 0.26 948169 68 2346 943493 0.25 945839 69 2440 942076 0.26 944516 70 2499 936651 0.27 939150 71 2430 934844 0.26 937274 72 2360 932623 0.25 934983 73 2435 927052 0.26 929487 74 2465 926242 0.27 928707 75 2443 923350 0.26 925793 76 2301 921838 0.25 924139 77 2212 919172 0.24 921384 78 2358 913742 0.26 916100 79 2289 909824 0.25 912113 80 2419 908653 0.27 911072 81 2265 904324 0.25 906589 82 2339 899483 0.26 901822 83 2242 898372 0.25 900614 84 2328 893847 0.26 896175 85 2237 886724 0.25 888961 86 2270 883092 0.26 885362 87 2274 879459 0.26 881733 88 2277 875606 0.26 877883 89 2245 873636 0.26 875881 90 2257 866078 0.26 868335 91 2350 858353 0.27 860703 92 2254 857567 0.26 859821 93 2270 853327 0.27 855597 94 2214 846817 0.26 849031 95 2264 842744 0.27 845008 96 2364 838345 0.28 840709 97 2199 830118 0.26 832317 98 2264 828990 0.27 831254 99 2123 822119 0.26 824242 100 2142 814487 0.26 816629 101 2249 810549 0.28 812798 102 2202 805766 0.27 807968 103 2104 797809 0.26 799913 104 2094 792945 0.26 795039 105 2356 783915 0.30 786271 106 1963 780151 0.25 782114 107 1990 776574 0.26 778564 108 2010 768515 0.26 770525 109 2069 761756 0.27 763825 110 2028 757720 0.27 759748 111 2097 749402 0.28 751499 112 1910 741953 0.26 743863 113 1945 736424 0.26 738369 114 2006 729029 0.27 731035 115 2060 719821 0.29 721881 116 2080 713197 0.29 715277 117 1883 707916 0.27 709799 118 2019 699616 0.29 701635 119 1921 692097 0.28 694018 120 1908 686763 0.28 688671 121 1988 677481 0.29 679469 122 1881 672379 0.28 674260 123 1852 663468 0.28 665320 124 1811 655611 0.28 657422 125 1886 650077 0.29 651963 126 1986 640519 0.31 642505 127 1784 633910 0.28 635694 128 1799 628238 0.29 630037 129 1788 619308 0.29 621096 130 1813 611561 0.30 613374 131 1788 602461 0.30 604249 132 1733 595562 0.29 597295 133 1758 586728 0.30 588486 134 1679 580742 0.29 582421 135 1638 572361 0.29 573999 136 1879 563905 0.33 565784 137 1681 557968 0.30 559649 138 1707 549019 0.31 550726 139 1649 540962 0.30 542611 140 1835 532914 0.34 534749 141 1564 524235 0.30 525799 142 1564 515974 0.30 517538 143 1549 509212 0.30 510761 144 1462 500180 0.29 501642 145 1500 489244 0.31 490744 146 1432 481468 0.30 482900 147 1406 467283 0.30 468689 148 1343 456773 0.29 458116 149 1109 422562 0.26 423671 150 791 0 100.00 791 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 8340 3794541 0.22 3802881 2 7344 4406199 0.17 4413543 3 7508 4349142 0.17 4356650 4 8356 4528151 0.18 4536507 5 8040 4417479 0.18 4425519 6 9244 4360276 0.21 4369520 7 9315 4492925 0.21 4502240 8 8842 4261013 0.21 4269855 9 8773 4367807 0.20 4376580 10 8698 4390977 0.20 4399675 11 8733 4393516 0.20 4402249 12 8585 4350778 0.20 4359363 13 8352 4342601 0.19 4350953 14 8530 4348494 0.20 4357024 15 8484 4352756 0.19 4361240 16 9092 4358605 0.21 4367697 17 8847 4364410 0.20 4373257 18 8925 4368015 0.20 4376940 19 9090 4378877 0.21 4387967 20 9576 4387208 0.22 4396784 21 9045 4400318 0.21 4409363 22 9372 4402622 0.21 4411994 23 12008 4401058 0.27 4413066 24 9176 4411476 0.21 4420652 25 8900 4419169 0.20 4428069 26 9214 4415930 0.21 4425144 27 12200 4411154 0.28 4423354 28 9183 4424346 0.21 4433529 29 9440 4426672 0.21 4436112 30 9096 4432342 0.20 4441438 31 9013 4428199 0.20 4437212 32 8871 4431936 0.20 4440807 33 9489 4433098 0.21 4442587 34 9560 4435043 0.22 4444603 35 9218 4432930 0.21 4442148 36 10362 4428275 0.23 4438637 37 9543 4425225 0.22 4434768 38 9130 4428314 0.21 4437444 39 9082 4421438 0.20 4430520 40 9028 4421670 0.20 4430698 41 9021 4416183 0.20 4425204 42 9060 4412737 0.20 4421797 43 9356 4408985 0.21 4418341 44 9063 4410416 0.21 4419479 45 9027 4402274 0.20 4411301 46 9148 4398209 0.21 4407357 47 9100 4392612 0.21 4401712 48 9054 4389670 0.21 4398724 49 9044 4383925 0.21 4392969 50 9077 4376546 0.21 4385623 51 8795 4370548 0.20 4379343 52 8775 4368184 0.20 4376959 53 9072 4360223 0.21 4369295 54 9041 4355306 0.21 4364347 55 9111 4346989 0.21 4356100 56 8953 4340887 0.21 4349840 57 8774 4330716 0.20 4339490 58 8891 4325034 0.21 4333925 59 8580 4315454 0.20 4324034 60 8569 4310233 0.20 4318802 61 8835 4298894 0.21 4307729 62 8896 4287481 0.21 4296377 63 8764 4286739 0.20 4295503 64 8860 4276241 0.21 4285101 65 8856 4265156 0.21 4274012 66 8869 4254139 0.21 4263008 67 8611 4243768 0.20 4252379 68 8847 4231946 0.21 4240793 69 9169 4219849 0.22 4229018 70 9240 4208173 0.22 4217413 71 8772 4197443 0.21 4206215 72 8613 4181687 0.21 4190300 73 8728 4172989 0.21 4181717 74 8718 4159390 0.21 4168108 75 8740 4140941 0.21 4149681 76 9027 4129338 0.22 4138365 77 8559 4122219 0.21 4130778 78 8800 4102289 0.21 4111089 79 8095 4090329 0.20 4098424 80 8652 4069424 0.21 4078076 81 8329 4057489 0.20 4065818 82 8476 4041598 0.21 4050074 83 8094 4020246 0.20 4028340 84 8342 4001306 0.21 4009648 85 8079 3987821 0.20 3995900 86 8254 3969282 0.21 3977536 87 8265 3947558 0.21 3955823 88 8114 3931374 0.21 3939488 89 8263 3907679 0.21 3915942 90 8177 3888120 0.21 3896297 91 9003 3869056 0.23 3878059 92 8567 3845678 0.22 3854245 93 7997 3828183 0.21 3836180 94 7977 3802086 0.21 3810063 95 7788 3784030 0.21 3791818 96 8378 3758492 0.22 3766870 97 8195 3734363 0.22 3742558 98 8276 3709339 0.22 3717615 99 7989 3685017 0.22 3693006 100 7797 3662896 0.21 3670693 101 7701 3637089 0.21 3644790 102 8500 3605661 0.24 3614161 103 7731 3584530 0.22 3592261 104 7703 3558116 0.22 3565819 105 9021 3522253 0.26 3531274 106 7390 3505405 0.21 3512795 107 7390 3477276 0.21 3484666 108 7486 3446273 0.22 3453759 109 7338 3420764 0.21 3428102 110 7302 3394758 0.21 3402060 111 7395 3361550 0.22 3368945 112 7263 3333339 0.22 3340602 113 7090 3303179 0.21 3310269 114 7179 3273789 0.22 3280968 115 7659 3241738 0.24 3249397 116 7561 3211218 0.23 3218779 117 7240 3178266 0.23 3185506 118 7264 3148330 0.23 3155594 119 7074 3115370 0.23 3122444 120 6993 3082937 0.23 3089930 121 7214 3050392 0.24 3057606 122 7241 3018886 0.24 3026127 123 6816 2988744 0.23 2995560 124 6858 2954515 0.23 2961373 125 7325 2923145 0.25 2930470 126 7264 2884347 0.25 2891611 127 6754 2855190 0.24 2861944 128 6620 2818435 0.23 2825055 129 6545 2790464 0.23 2797009 130 6416 2751924 0.23 2758340 131 6539 2718222 0.24 2724761 132 6366 2681720 0.24 2688086 133 6419 2651139 0.24 2657558 134 6315 2614467 0.24 2620782 135 6155 2578248 0.24 2584403 136 7156 2541923 0.28 2549079 137 6166 2513080 0.24 2519246 138 6177 2470606 0.25 2476783 139 6140 2437717 0.25 2443857 140 6972 2400896 0.29 2407868 141 5712 2367875 0.24 2373587 142 5942 2329632 0.25 2335574 143 5976 2291594 0.26 2297570 144 5705 2255083 0.25 2260788 145 5538 2214571 0.25 2220109 146 5183 2170838 0.24 2176021 147 5447 2122564 0.26 2128011 148 4975 2070587 0.24 2075562 149 4205 1928436 0.22 1932641 150 2717 0 100.00 2717