CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 98480 540623 15.41 639103 2 51700 212448 19.57 264148 3 74926 487166 13.33 562092 4 85502 575044 12.94 660546 5 86683 574772 13.10 661455 6 92726 588957 13.60 681683 7 84895 529128 13.83 614023 8 90299 568328 13.71 658627 9 89415 568883 13.58 658298 10 87097 566343 13.33 653440 11 86362 559848 13.36 646210 12 86087 557566 13.37 643653 13 86756 559633 13.42 646389 14 86100 557020 13.39 643120 15 87341 560743 13.48 648084 16 87231 561347 13.45 648578 17 86987 558594 13.47 645581 18 88068 563296 13.52 651364 19 88597 568435 13.48 657032 20 88369 570614 13.41 658983 21 89479 572872 13.51 662351 22 89347 570688 13.54 660035 23 89225 570539 13.52 659764 24 90309 574301 13.59 664610 25 90106 575021 13.55 665127 26 89480 574019 13.49 663499 27 89753 576596 13.47 666349 28 89584 578695 13.41 668279 29 89193 579062 13.35 668255 30 89413 582749 13.30 672162 31 89559 581223 13.35 670782 32 89784 580898 13.39 670682 33 89272 580655 13.33 669927 34 89715 581281 13.37 670996 35 89275 580487 13.33 669762 36 89289 583122 13.28 672411 37 89891 579312 13.43 669203 38 88882 580493 13.28 669375 39 89378 583557 13.28 672935 40 90266 583045 13.41 673311 41 89872 581339 13.39 671211 42 90196 584707 13.36 674903 43 89741 581744 13.36 671485 44 89351 580796 13.33 670147 45 89555 582714 13.32 672269 46 89688 580359 13.39 670047 47 89839 579589 13.42 669428 48 89410 583097 13.30 672507 49 89589 580306 13.37 669895 50 89502 580336 13.36 669838 51 89415 580608 13.35 670023 52 89120 580866 13.30 669986 53 89509 579400 13.38 668909 54 89431 580199 13.36 669630 55 88811 579648 13.29 668459 56 89341 579009 13.37 668350 57 89164 580574 13.31 669738 58 88818 580473 13.27 669291 59 89068 579641 13.32 668709 60 88902 580256 13.29 669158 61 89227 581041 13.31 670268 62 89091 580739 13.30 669830 63 89294 580269 13.34 669563 64 89377 581854 13.32 671231 65 89340 577996 13.39 667336 66 89459 580274 13.36 669733 67 88480 579247 13.25 667727 68 89205 579512 13.34 668717 69 88888 581140 13.27 670028 70 89200 578681 13.36 667881 71 88949 579626 13.30 668575 72 88531 579460 13.25 667991 73 88857 577255 13.34 666112 74 88328 576904 13.28 665232 75 89176 577223 13.38 666399 76 88859 577771 13.33 666630 77 88280 577055 13.27 665335 78 88506 577515 13.29 666021 79 89292 578614 13.37 667906 80 88590 577841 13.29 666431 81 88373 578019 13.26 666392 82 88449 578193 13.27 666642 83 88650 577757 13.30 666407 84 89080 578148 13.35 667228 85 88830 579792 13.29 668622 86 88695 578446 13.29 667141 87 88944 578135 13.33 667079 88 88591 577335 13.30 665926 89 88738 578201 13.31 666939 90 88598 576716 13.32 665314 91 88516 577022 13.30 665538 92 88198 575688 13.29 663886 93 88060 577421 13.23 665481 94 88429 577396 13.28 665825 95 88440 574752 13.34 663192 96 88384 575902 13.31 664286 97 88527 576514 13.31 665041 98 88219 575756 13.29 663975 99 88660 576321 13.33 664981 100 88534 575807 13.33 664341 101 88917 574364 13.41 663281 102 88287 573322 13.34 661609 103 88397 573501 13.36 661898 104 87736 575120 13.24 662856 105 88488 574577 13.35 663065 106 87791 574265 13.26 662056 107 88143 573640 13.32 661783 108 87669 575762 13.21 663431 109 88375 576446 13.29 664821 110 87606 573633 13.25 661239 111 87789 574625 13.25 662414 112 87770 575380 13.24 663150 113 87403 572489 13.25 659892 114 87690 574154 13.25 661844 115 88087 574304 13.30 662391 116 88062 574561 13.29 662623 117 88311 573390 13.35 661701 118 88279 573706 13.34 661985 119 87415 573123 13.23 660538 120 87627 574637 13.23 662264 121 87714 573200 13.27 660914 122 87541 572910 13.25 660451 123 86978 573055 13.18 660033 124 86811 572369 13.17 659180 125 86868 570999 13.20 657867 126 86764 572631 13.16 659395 127 87480 571283 13.28 658763 128 87590 571676 13.29 659266 129 86961 570366 13.23 657327 130 86335 570409 13.15 656744 131 87203 568041 13.31 655244 132 86632 568412 13.23 655044 133 86334 569998 13.15 656332 134 86302 567993 13.19 654295 135 87031 569948 13.25 656979 136 86748 569086 13.23 655834 137 86788 568523 13.24 655311 138 86360 568355 13.19 654715 139 86938 569194 13.25 656132 140 86214 566663 13.21 652877 141 85548 567712 13.10 653260 142 86074 567153 13.18 653227 143 85795 566436 13.15 652231 144 85350 565360 13.12 650710 145 85042 564592 13.09 649634 146 84619 563924 13.05 648543 147 84616 563525 13.06 648141 148 82775 561584 12.85 644359 149 82161 558448 12.83 640609 150 73690 524367 12.32 598057 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3859 853468 0.45 857327 2 1571 592209 0.26 593780 3 2104 881221 0.24 883325 4 2253 928952 0.24 931205 5 2282 907424 0.25 909706 6 2267 879032 0.26 881299 7 2061 903515 0.23 905576 8 2232 916264 0.24 918496 9 2202 908113 0.24 910315 10 2032 889871 0.23 891903 11 2063 890097 0.23 892160 12 2123 891193 0.24 893316 13 2081 894741 0.23 896822 14 2060 891998 0.23 894058 15 2116 894304 0.24 896420 16 2062 894468 0.23 896530 17 2156 894657 0.24 896813 18 2162 904101 0.24 906263 19 2129 907548 0.23 909677 20 2216 909248 0.24 911464 21 2155 912263 0.24 914418 22 2060 908957 0.23 911017 23 2261 912598 0.25 914859 24 2204 916213 0.24 918417 25 2182 912552 0.24 914734 26 2368 914223 0.26 916591 27 2070 918387 0.22 920457 28 2215 919436 0.24 921651 29 2128 922638 0.23 924766 30 2236 923613 0.24 925849 31 2161 920483 0.23 922644 32 2170 925417 0.23 927587 33 2153 924086 0.23 926239 34 2153 925703 0.23 927856 35 2253 921517 0.24 923770 36 2193 921091 0.24 923284 37 2230 922114 0.24 924344 38 2207 923326 0.24 925533 39 2238 924650 0.24 926888 40 2178 923595 0.24 925773 41 2120 924427 0.23 926547 42 2154 926424 0.23 928578 43 2349 924695 0.25 927044 44 2210 924425 0.24 926635 45 2178 926107 0.23 928285 46 2410 921173 0.26 923583 47 2234 925248 0.24 927482 48 2184 921930 0.24 924114 49 2428 920090 0.26 922518 50 2258 920460 0.24 922718 51 2278 922996 0.25 925274 52 2359 919764 0.26 922123 53 2254 920926 0.24 923180 54 2209 920518 0.24 922727 55 2418 918715 0.26 921133 56 2256 920520 0.24 922776 57 2566 916028 0.28 918594 58 2228 917280 0.24 919508 59 2139 917640 0.23 919779 60 2177 921655 0.24 923832 61 2234 922419 0.24 924653 62 2260 917640 0.25 919900 63 2231 919840 0.24 922071 64 2192 917858 0.24 920050 65 2380 917423 0.26 919803 66 2272 918666 0.25 920938 67 2386 917048 0.26 919434 68 2234 918997 0.24 921231 69 2287 919307 0.25 921594 70 2278 920271 0.25 922549 71 2448 914861 0.27 917309 72 2294 920130 0.25 922424 73 2305 917730 0.25 920035 74 2246 915782 0.24 918028 75 2331 917052 0.25 919383 76 2204 917218 0.24 919422 77 2184 915517 0.24 917701 78 2185 920635 0.24 922820 79 2214 915759 0.24 917973 80 2283 918958 0.25 921241 81 2362 916260 0.26 918622 82 2191 918134 0.24 920325 83 2088 916448 0.23 918536 84 2220 919492 0.24 921712 85 2154 917254 0.23 919408 86 2490 914662 0.27 917152 87 2613 913291 0.29 915904 88 2424 913430 0.26 915854 89 2202 912610 0.24 914812 90 2234 913618 0.24 915852 91 2214 911688 0.24 913902 92 2270 912226 0.25 914496 93 2316 913458 0.25 915774 94 2199 911956 0.24 914155 95 2330 912984 0.25 915314 96 2237 914103 0.24 916340 97 2282 914737 0.25 917019 98 2181 911202 0.24 913383 99 2333 913105 0.25 915438 100 2263 912355 0.25 914618 101 2281 908321 0.25 910602 102 2738 910395 0.30 913133 103 2488 910255 0.27 912743 104 2282 911821 0.25 914103 105 2244 909895 0.25 912139 106 2268 910384 0.25 912652 107 2352 908945 0.26 911297 108 2273 912461 0.25 914734 109 2228 910148 0.24 912376 110 2224 909879 0.24 912103 111 2437 910631 0.27 913068 112 2252 907613 0.25 909865 113 2637 907430 0.29 910067 114 2382 908130 0.26 910512 115 2574 907796 0.28 910370 116 2409 909637 0.26 912046 117 2297 908658 0.25 910955 118 2529 907511 0.28 910040 119 2386 907554 0.26 909940 120 2347 909280 0.26 911627 121 2342 908201 0.26 910543 122 2379 906644 0.26 909023 123 2407 907539 0.26 909946 124 2345 906346 0.26 908691 125 2458 905514 0.27 907972 126 2486 905071 0.27 907557 127 2568 903122 0.28 905690 128 2491 904829 0.27 907320 129 2552 904896 0.28 907448 130 2397 902360 0.26 904757 131 2588 903132 0.29 905720 132 2377 904720 0.26 907097 133 2508 902003 0.28 904511 134 2461 904531 0.27 906992 135 2454 904636 0.27 907090 136 2637 902477 0.29 905114 137 2446 900954 0.27 903400 138 2465 901793 0.27 904258 139 2407 900521 0.27 902928 140 2483 900737 0.27 903220 141 2468 899805 0.27 902273 142 2567 899490 0.28 902057 143 2560 896261 0.28 898821 144 2581 897512 0.29 900093 145 2398 898067 0.27 900465 146 2521 894276 0.28 896797 147 2395 891135 0.27 893530 148 2682 886324 0.30 889006 149 2627 882008 0.30 884635 150 2082 834100 0.25 836182 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 18983 4260975 0.44 4279958 2 8181 3211918 0.25 3220099 3 9366 4077573 0.23 4086939 4 9696 4167990 0.23 4177686 5 9024 4062736 0.22 4071760 6 9270 4136110 0.22 4145380 7 8252 4071292 0.20 4079544 8 8547 4084246 0.21 4092793 9 8246 4028560 0.20 4036806 10 8188 4019377 0.20 4027565 11 7896 4029650 0.20 4037546 12 7875 4002122 0.20 4009997 13 7864 4004941 0.20 4012805 14 7865 3991149 0.20 3999014 15 7833 3998916 0.20 4006749 16 7754 4001208 0.19 4008962 17 7745 4006518 0.19 4014263 18 7663 4030773 0.19 4038436 19 7644 4046323 0.19 4053967 20 7559 4043996 0.19 4051555 21 7701 4043467 0.19 4051168 22 7869 4035195 0.19 4043064 23 8582 4027677 0.21 4036259 24 7611 4049569 0.19 4057180 25 7693 4053191 0.19 4060884 26 7662 4052072 0.19 4059734 27 7735 4052251 0.19 4059986 28 7709 4048638 0.19 4056347 29 7561 4054294 0.19 4061855 30 7851 4060467 0.19 4068318 31 7640 4057352 0.19 4064992 32 7863 4054337 0.19 4062200 33 7747 4050372 0.19 4058119 34 7689 4055398 0.19 4063087 35 7729 4052157 0.19 4059886 36 7727 4057782 0.19 4065509 37 7665 4058135 0.19 4065800 38 7565 4052440 0.19 4060005 39 7627 4056316 0.19 4063943 40 7625 4056830 0.19 4064455 41 7813 4058987 0.19 4066800 42 7665 4059259 0.19 4066924 43 8672 4057598 0.21 4066270 44 7729 4057228 0.19 4064957 45 7627 4061010 0.19 4068637 46 8552 4053155 0.21 4061707 47 7792 4049684 0.19 4057476 48 7636 4053718 0.19 4061354 49 8392 4051265 0.21 4059657 50 7820 4049613 0.19 4057433 51 7568 4055006 0.19 4062574 52 8341 4052478 0.21 4060819 53 7789 4050358 0.19 4058147 54 7745 4057782 0.19 4065527 55 8336 4054489 0.21 4062825 56 7740 4059213 0.19 4066953 57 9189 4053846 0.23 4063035 58 7555 4056275 0.19 4063830 59 7719 4053720 0.19 4061439 60 7813 4052591 0.19 4060404 61 7687 4054771 0.19 4062458 62 7675 4052521 0.19 4060196 63 7680 4050275 0.19 4057955 64 7806 4051271 0.19 4059077 65 8220 4046787 0.20 4055007 66 7617 4053290 0.19 4060907 67 7768 4050726 0.19 4058494 68 7792 4051184 0.19 4058976 69 7821 4054128 0.19 4061949 70 7771 4051840 0.19 4059611 71 8687 4050182 0.21 4058869 72 7804 4050828 0.19 4058632 73 7827 4047363 0.19 4055190 74 7816 4048696 0.19 4056512 75 7875 4051750 0.19 4059625 76 7786 4050357 0.19 4058143 77 7577 4053584 0.19 4061161 78 7612 4058119 0.19 4065731 79 7615 4053312 0.19 4060927 80 8105 4047475 0.20 4055580 81 8440 4047082 0.21 4055522 82 7751 4051066 0.19 4058817 83 7703 4050479 0.19 4058182 84 7592 4054374 0.19 4061966 85 7641 4054456 0.19 4062097 86 9381 4047158 0.23 4056539 87 9182 4050883 0.23 4060065 88 8533 4045651 0.21 4054184 89 7683 4045908 0.19 4053591 90 7705 4056240 0.19 4063945 91 7707 4049161 0.19 4056868 92 8212 4048366 0.20 4056578 93 7823 4050867 0.19 4058690 94 7676 4051125 0.19 4058801 95 8133 4051673 0.20 4059806 96 7821 4056419 0.19 4064240 97 7937 4054314 0.20 4062251 98 7833 4052892 0.19 4060725 99 8188 4052830 0.20 4061018 100 7916 4054638 0.19 4062554 101 7871 4059988 0.19 4067859 102 10016 4054300 0.25 4064316 103 8481 4054886 0.21 4063367 104 7902 4053987 0.19 4061889 105 7896 4055355 0.19 4063251 106 7853 4052751 0.19 4060604 107 8583 4050596 0.21 4059179 108 7893 4053926 0.19 4061819 109 7925 4048928 0.20 4056853 110 7965 4049578 0.20 4057543 111 8015 4056581 0.20 4064596 112 7903 4054825 0.19 4062728 113 9450 4047018 0.23 4056468 114 7922 4056941 0.19 4064863 115 8969 4051374 0.22 4060343 116 7998 4049593 0.20 4057591 117 7891 4054294 0.19 4062185 118 8480 4054197 0.21 4062677 119 8063 4048810 0.20 4056873 120 7907 4048793 0.19 4056700 121 7936 4048692 0.20 4056628 122 7978 4050047 0.20 4058025 123 8120 4054524 0.20 4062644 124 8165 4054184 0.20 4062349 125 8685 4049453 0.21 4058138 126 8633 4049180 0.21 4057813 127 9472 4040106 0.23 4049578 128 8741 4044940 0.22 4053681 129 9110 4045564 0.22 4054674 130 8275 4047407 0.20 4055682 131 8644 4045140 0.21 4053784 132 8097 4050502 0.20 4058599 133 8672 4042664 0.21 4051336 134 8379 4040583 0.21 4048962 135 8981 4037622 0.22 4046603 136 9161 4032712 0.23 4041873 137 8543 4043043 0.21 4051586 138 8476 4040525 0.21 4049001 139 8510 4036775 0.21 4045285 140 8682 4036014 0.21 4044696 141 8395 4034100 0.21 4042495 142 9076 4029756 0.22 4038832 143 8333 4027352 0.21 4035685 144 9061 4029859 0.22 4038920 145 8421 4033132 0.21 4041553 146 8685 4037745 0.21 4046430 147 8627 4035631 0.21 4044258 148 9230 4019346 0.23 4028576 149 9128 3978855 0.23 3987983 150 6698 3808612 0.18 3815310 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2481 934710 0.26 937191 2 12658 621319 2.00 633977 3 38297 241141 13.71 279438 4 60976 496863 10.93 557839 5 70784 586990 10.76 657774 6 70473 587215 10.72 657688 7 73406 599686 10.91 673092 8 65369 541492 10.77 606861 9 71698 577071 11.05 648769 10 71967 571326 11.19 643293 11 70937 567630 11.11 638567 12 71566 560679 11.32 632245 13 72782 556091 11.57 628873 14 73735 558182 11.67 631917 15 74226 555751 11.78 629977 16 76041 555846 12.03 631887 17 77065 558848 12.12 635913 18 77712 557656 12.23 635368 19 78297 558931 12.29 637228 20 78812 563783 12.26 642595 21 80591 566796 12.45 647387 22 81035 566046 12.52 647081 23 80714 565361 12.49 646075 24 81372 565574 12.58 646946 25 82784 568468 12.71 651252 26 82489 568743 12.67 651232 27 82485 567086 12.70 649571 28 82163 568560 12.63 650723 29 82505 568358 12.68 650863 30 82466 569641 12.65 652107 31 83605 570304 12.79 653909 32 82975 569699 12.71 652674 33 83202 569733 12.74 652935 34 83041 567925 12.76 650966 35 82813 566665 12.75 649478 36 83174 569664 12.74 652838 37 84222 569043 12.89 653265 38 83660 569254 12.81 652914 39 83314 566326 12.82 649640 40 84066 567706 12.90 651772 41 83741 568687 12.84 652428 42 83932 566540 12.90 650472 43 84180 568174 12.90 652354 44 84174 566836 12.93 651010 45 84036 562593 13.00 646629 46 83772 563066 12.95 646838 47 83295 564556 12.86 647851 48 83767 562770 12.96 646537 49 83843 562889 12.96 646732 50 83467 564433 12.88 647900 51 82743 559190 12.89 641933 52 83026 561569 12.88 644595 53 83076 560435 12.91 643511 54 83361 557119 13.02 640480 55 82598 555281 12.95 637879 56 82852 555873 12.97 638725 57 82569 555262 12.95 637831 58 82952 554342 13.02 637294 59 82913 552111 13.06 635024 60 82517 550495 13.04 633012 61 82251 550912 12.99 633163 62 82351 548997 13.04 631348 63 81852 549510 12.96 631362 64 82677 549959 13.07 632636 65 81812 546630 13.02 628442 66 81515 543894 13.03 625409 67 81750 544345 13.06 626095 68 81268 543752 13.00 625020 69 81624 541264 13.10 622888 70 81524 540270 13.11 621794 71 80751 539467 13.02 620218 72 81190 537528 13.12 618718 73 80520 536313 13.05 616833 74 80076 533616 13.05 613692 75 80576 533445 13.12 614021 76 79952 530938 13.09 610890 77 79251 528301 13.04 607552 78 79008 527431 13.03 606439 79 78790 526533 13.02 605323 80 78835 523510 13.09 602345 81 78282 521479 13.05 599761 82 77750 519534 13.02 597284 83 78083 518496 13.09 596579 84 78259 516177 13.17 594436 85 77599 514327 13.11 591926 86 77178 513336 13.07 590514 87 77101 509454 13.14 586555 88 76367 509370 13.04 585737 89 76327 504949 13.13 581276 90 75788 502520 13.11 578308 91 75523 500624 13.11 576147 92 75390 497328 13.16 572718 93 74691 494770 13.12 569461 94 74204 494682 13.04 568886 95 74078 491768 13.09 565846 96 73785 487766 13.14 561551 97 73315 485988 13.11 559303 98 72745 482425 13.10 555170 99 73042 479928 13.21 552970 100 72489 478282 13.16 550771 101 71808 473940 13.16 545748 102 71236 469767 13.17 541003 103 70488 468844 13.07 539332 104 69873 464672 13.07 534545 105 69764 459976 13.17 529740 106 69327 458179 13.14 527506 107 68544 454408 13.11 522952 108 68067 451644 13.10 519711 109 67518 449154 13.07 516672 110 67145 444319 13.13 511464 111 66436 440717 13.10 507153 112 66228 436725 13.17 502953 113 65767 435891 13.11 501658 114 64873 431119 13.08 495992 115 64837 427684 13.16 492521 116 64292 424148 13.16 488440 117 63893 417362 13.28 481255 118 62953 415612 13.15 478565 119 62526 411577 13.19 474103 120 61685 406302 13.18 467987 121 61233 403570 13.17 464803 122 60691 399572 13.19 460263 123 60153 396684 13.17 456837 124 58977 390364 13.13 449341 125 58590 387797 13.13 446387 126 57794 382781 13.12 440575 127 57192 380002 13.08 437194 128 56255 375394 13.03 431649 129 55563 370985 13.03 426548 130 55271 367745 13.07 423016 131 54644 361933 13.12 416577 132 54089 357149 13.15 411238 133 54073 353908 13.25 407981 134 52983 348441 13.20 401424 135 51983 345356 13.08 397339 136 51554 340403 13.15 391957 137 50523 336038 13.07 386561 138 49762 331735 13.04 381497 139 49162 327925 13.04 377087 140 48848 321836 13.18 370684 141 48088 317083 13.17 365171 142 47280 313053 13.12 360333 143 46727 308425 13.16 355152 144 45532 303833 13.03 349365 145 44923 298470 13.08 343393 146 43937 293123 13.04 337060 147 42817 287466 12.96 330283 148 42454 278868 13.21 321322 149 40230 259523 13.42 299753 150 38715 0 100.00 38715 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1779 826447 0.21 828226 2 1956 1204613 0.16 1206569 3 1725 914214 0.19 915939 4 1407 579489 0.24 580896 5 1922 848121 0.23 850043 6 2339 916809 0.25 919148 7 2193 900217 0.24 902410 8 2053 866536 0.24 868589 9 2185 880435 0.25 882620 10 2172 899604 0.24 901776 11 2030 891501 0.23 893531 12 1972 876798 0.22 878770 13 2072 872926 0.24 874998 14 2146 873054 0.25 875200 15 1988 876607 0.23 878595 16 2117 875011 0.24 877128 17 2135 878818 0.24 880953 18 2117 877800 0.24 879917 19 2253 879976 0.26 882229 20 2276 885594 0.26 887870 21 2194 891940 0.25 894134 22 2205 894891 0.25 897096 23 2197 893965 0.25 896162 24 2139 892153 0.24 894292 25 2392 895529 0.27 897921 26 2300 900008 0.25 902308 27 2219 902517 0.25 904736 28 2184 899226 0.24 901410 29 2221 901511 0.25 903732 30 2224 903961 0.25 906185 31 2098 901231 0.23 903329 32 2153 906000 0.24 908153 33 2330 903772 0.26 906102 34 2291 902559 0.25 904850 35 2283 902223 0.25 904506 36 2089 904829 0.23 906918 37 2137 900514 0.24 902651 38 2259 903880 0.25 906139 39 2126 902220 0.24 904346 40 2278 899590 0.25 901868 41 2209 899532 0.24 901741 42 2116 897956 0.24 900072 43 2198 895235 0.24 897433 44 2187 901284 0.24 903471 45 2251 898089 0.25 900340 46 2263 894492 0.25 896755 47 2180 897864 0.24 900044 48 2138 894400 0.24 896538 49 2225 891098 0.25 893323 50 2196 892262 0.25 894458 51 2201 891884 0.25 894085 52 2228 886707 0.25 888935 53 2255 887424 0.25 889679 54 2100 886019 0.24 888119 55 2179 882705 0.25 884884 56 2187 882865 0.25 885052 57 2124 883182 0.24 885306 58 2192 879545 0.25 881737 59 2165 877904 0.25 880069 60 2103 876014 0.24 878117 61 2132 875407 0.24 877539 62 2071 875847 0.24 877918 63 2206 873117 0.25 875323 64 2215 868417 0.25 870632 65 2094 868974 0.24 871068 66 2154 864851 0.25 867005 67 2207 864025 0.25 866232 68 2212 862913 0.26 865125 69 2095 861585 0.24 863680 70 2268 857441 0.26 859709 71 2141 857029 0.25 859170 72 2208 853616 0.26 855824 73 2153 847996 0.25 850149 74 2180 847197 0.26 849377 75 2199 844251 0.26 846450 76 2152 843507 0.25 845659 77 2072 842130 0.25 844202 78 2004 837969 0.24 839973 79 2014 835272 0.24 837286 80 2143 832632 0.26 834775 81 2217 830795 0.27 833012 82 1936 825387 0.23 827323 83 2192 823961 0.27 826153 84 2350 819343 0.29 821693 85 2053 815011 0.25 817064 86 1985 812882 0.24 814867 87 2067 808885 0.25 810952 88 2078 804849 0.26 806927 89 1968 801434 0.24 803402 90 1958 797932 0.24 799890 91 2144 791839 0.27 793983 92 2034 791546 0.26 793580 93 1960 785864 0.25 787824 94 1903 780876 0.24 782779 95 1977 779016 0.25 780993 96 1931 774263 0.25 776194 97 2115 768649 0.27 770764 98 1976 766363 0.26 768339 99 2070 760029 0.27 762099 100 1971 754623 0.26 756594 101 2012 752035 0.27 754047 102 2079 747562 0.28 749641 103 1820 740806 0.25 742626 104 1842 736498 0.25 738340 105 1798 730821 0.25 732619 106 1895 724844 0.26 726739 107 1815 720814 0.25 722629 108 1908 715678 0.27 717586 109 1889 711101 0.26 712990 110 1896 707229 0.27 709125 111 1884 699664 0.27 701548 112 1892 692361 0.27 694253 113 1731 688546 0.25 690277 114 1740 683377 0.25 685117 115 1737 677439 0.26 679176 116 1843 670803 0.27 672646 117 1796 664989 0.27 666785 118 1957 657112 0.30 659069 119 1717 652505 0.26 654222 120 1908 647045 0.29 648953 121 1990 638614 0.31 640604 122 1704 632809 0.27 634513 123 1732 626626 0.28 628358 124 1727 620075 0.28 621802 125 1672 614057 0.27 615729 126 1619 608505 0.27 610124 127 1576 600431 0.26 602007 128 1639 593037 0.28 594676 129 1698 587595 0.29 589293 130 1661 578435 0.29 580096 131 1613 573204 0.28 574817 132 1638 566125 0.29 567763 133 1658 559976 0.30 561634 134 1692 552966 0.31 554658 135 1670 546934 0.30 548604 136 1630 538579 0.30 540209 137 1487 531954 0.28 533441 138 1561 524667 0.30 526228 139 1574 519513 0.30 521087 140 1695 512554 0.33 514249 141 1431 503471 0.28 504902 142 1574 496883 0.32 498457 143 1548 489505 0.32 491053 144 1427 481750 0.30 483177 145 1355 472484 0.29 473839 146 1432 464103 0.31 465535 147 1411 454249 0.31 455660 148 1281 442496 0.29 443777 149 1058 409759 0.26 410817 150 729 0 100.00 729 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 8361 3780392 0.22 3788753 2 6546 4133857 0.16 4140403 3 6557 3833707 0.17 3840264 4 7620 4166600 0.18 4174220 5 8053 4091770 0.20 4099823 6 8243 4008124 0.21 4016367 7 8227 4129313 0.20 4137540 8 7602 3819010 0.20 3826612 9 8448 3950509 0.21 3958957 10 7940 3983321 0.20 3991261 11 7470 4007981 0.19 4015451 12 7348 3969953 0.18 3977301 13 7266 3945715 0.18 3952981 14 7959 3955943 0.20 3963902 15 7459 3954610 0.19 3962069 16 8247 3966989 0.21 3975236 17 7935 3967651 0.20 3975586 18 7687 3968714 0.19 3976401 19 8178 3976290 0.21 3984468 20 8269 3979511 0.21 3987780 21 8058 3995837 0.20 4003895 22 8091 4004192 0.20 4012283 23 7700 4003348 0.19 4011048 24 7977 4005808 0.20 4013785 25 9020 4007700 0.22 4016720 26 8622 4002212 0.21 4010834 27 8092 4009542 0.20 4017634 28 7933 4014996 0.20 4022929 29 8380 4018668 0.21 4027048 30 7954 4022517 0.20 4030471 31 7919 4017075 0.20 4024994 32 7786 4023979 0.19 4031765 33 8575 4025317 0.21 4033892 34 8066 4024153 0.20 4032219 35 7998 4020918 0.20 4028916 36 7915 4019027 0.20 4026942 37 7675 4024507 0.19 4032182 38 7944 4023521 0.20 4031465 39 7613 4020426 0.19 4028039 40 8014 4016530 0.20 4024544 41 8105 4011000 0.20 4019105 42 7796 4007921 0.19 4015717 43 8256 4009328 0.21 4017584 44 8168 4003287 0.20 4011455 45 8053 3999098 0.20 4007151 46 8085 3994002 0.20 4002087 47 7888 3995926 0.20 4003814 48 7712 3993137 0.19 4000849 49 8264 3984067 0.21 3992331 50 7706 3979971 0.19 3987677 51 7981 3973404 0.20 3981385 52 8302 3971842 0.21 3980144 53 8059 3966371 0.20 3974430 54 7641 3962373 0.19 3970014 55 7888 3955220 0.20 3963108 56 7769 3949057 0.20 3956826 57 7644 3944332 0.19 3951976 58 7942 3938807 0.20 3946749 59 8118 3924878 0.21 3932996 60 7791 3924218 0.20 3932009 61 7878 3915820 0.20 3923698 62 7657 3907762 0.20 3915419 63 7723 3902250 0.20 3909973 64 7805 3891606 0.20 3899411 65 7436 3885794 0.19 3893230 66 7983 3877226 0.21 3885209 67 8034 3866886 0.21 3874920 68 7909 3857825 0.20 3865734 69 7861 3848887 0.20 3856748 70 8228 3837364 0.21 3845592 71 7929 3833119 0.21 3841048 72 8114 3816763 0.21 3824877 73 8109 3804251 0.21 3812360 74 7904 3797792 0.21 3805696 75 7904 3786137 0.21 3794041 76 7941 3775913 0.21 3783854 77 7374 3765442 0.20 3772816 78 7244 3753983 0.19 3761227 79 7214 3740701 0.19 3747915 80 7888 3729121 0.21 3737009 81 7631 3711532 0.21 3719163 82 7294 3701564 0.20 3708858 83 7759 3684352 0.21 3692111 84 8934 3661921 0.24 3670855 85 7462 3656996 0.20 3664458 86 7284 3640196 0.20 3647480 87 7661 3620849 0.21 3628510 88 7682 3610225 0.21 3617907 89 7203 3591511 0.20 3598714 90 7321 3577156 0.20 3584477 91 7968 3553546 0.22 3561514 92 7205 3543245 0.20 3550450 93 6963 3523980 0.20 3530943 94 7020 3504358 0.20 3511378 95 6832 3485695 0.20 3492527 96 6857 3468812 0.20 3475669 97 7428 3447432 0.22 3454860 98 6975 3426664 0.20 3433639 99 7610 3404583 0.22 3412193 100 7311 3385329 0.22 3392640 101 7352 3367060 0.22 3374412 102 7799 3337196 0.23 3344995 103 6688 3322242 0.20 3328930 104 6696 3298696 0.20 3305392 105 6702 3278840 0.20 3285542 106 6798 3247172 0.21 3253970 107 6572 3228996 0.20 3235568 108 7062 3201777 0.22 3208839 109 6651 3181849 0.21 3188500 110 6882 3158588 0.22 3165470 111 6804 3131661 0.22 3138465 112 7112 3107913 0.23 3115025 113 6530 3082668 0.21 3089198 114 6521 3055782 0.21 3062303 115 6256 3030776 0.21 3037032 116 6744 3002907 0.22 3009651 117 6748 2979097 0.23 2985845 118 7192 2950148 0.24 2957340 119 6143 2924155 0.21 2930298 120 7047 2890344 0.24 2897391 121 7392 2864202 0.26 2871594 122 6140 2838763 0.22 2844903 123 6477 2808525 0.23 2815002 124 6164 2782099 0.22 2788263 125 6032 2755168 0.22 2761200 126 6207 2725471 0.23 2731678 127 5716 2697187 0.21 2702903 128 6125 2666657 0.23 2672782 129 6209 2636674 0.23 2642883 130 6209 2606954 0.24 2613163 131 5767 2578170 0.22 2583937 132 6103 2545844 0.24 2551947 133 5995 2514725 0.24 2520720 134 6221 2487522 0.25 2493743 135 6293 2452287 0.26 2458580 136 6343 2425862 0.26 2432205 137 5564 2395589 0.23 2401153 138 5689 2362034 0.24 2367723 139 5412 2334357 0.23 2339769 140 6344 2297405 0.28 2303749 141 5426 2267481 0.24 2272907 142 5980 2232680 0.27 2238660 143 5618 2202534 0.25 2208152 144 5382 2166783 0.25 2172165 145 5020 2130366 0.24 2135386 146 5281 2093161 0.25 2098442 147 5202 2045273 0.25 2050475 148 4962 2001034 0.25 2005996 149 3877 1872094 0.21 1875971 150 2615 0 100.00 2615