CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 79410 473129 14.37 552539 2 44150 185185 19.25 229335 3 62269 424918 12.78 487187 4 70715 501790 12.35 572505 5 72575 509752 12.46 582327 6 78094 527141 12.90 605235 7 71201 469592 13.17 540793 8 75542 502696 13.06 578238 9 75432 501670 13.07 577102 10 73893 500388 12.87 574281 11 72338 495772 12.73 568110 12 72362 492683 12.81 565045 13 71432 492681 12.66 564113 14 72484 491214 12.86 563698 15 72611 495541 12.78 568152 16 73333 495612 12.89 568945 17 73126 493366 12.91 566492 18 73113 498662 12.79 571775 19 74005 501429 12.86 575434 20 74362 503982 12.86 578344 21 74777 505704 12.88 580481 22 74571 502406 12.92 576977 23 74207 502111 12.88 576318 24 75382 506846 12.95 582228 25 74934 508036 12.85 582970 26 74306 505990 12.80 580296 27 74732 508479 12.81 583211 28 75005 508918 12.85 583923 29 74281 509367 12.73 583648 30 74998 512202 12.77 587200 31 74564 512202 12.71 586766 32 75016 509433 12.84 584449 33 74505 512239 12.70 586744 34 73859 509899 12.65 583758 35 74434 511398 12.71 585832 36 74716 513420 12.70 588136 37 74219 511940 12.66 586159 38 74244 510253 12.70 584497 39 74417 512601 12.68 587018 40 74655 513029 12.70 587684 41 75122 510983 12.82 586105 42 74426 514753 12.63 589179 43 74762 512792 12.72 587554 44 74280 509942 12.71 584222 45 75013 511869 12.78 586882 46 74611 512547 12.71 587158 47 74312 509711 12.72 584023 48 74185 510957 12.68 585142 49 74249 511010 12.69 585259 50 74572 510461 12.75 585033 51 74111 511964 12.65 586075 52 74413 512709 12.67 587122 53 74204 510244 12.70 584448 54 74764 511432 12.75 586196 55 74468 510050 12.74 584518 56 74174 510226 12.69 584400 57 74182 511615 12.66 585797 58 74384 510094 12.73 584478 59 74571 508790 12.78 583361 60 74040 510322 12.67 584362 61 73796 510046 12.64 583842 62 73871 511879 12.61 585750 63 74699 511373 12.75 586072 64 74578 509531 12.77 584109 65 73753 507788 12.68 581541 66 73786 510511 12.63 584297 67 74125 507963 12.73 582088 68 73924 508028 12.70 581952 69 74349 509595 12.73 583944 70 73758 506948 12.70 580706 71 73719 509330 12.64 583049 72 73865 509762 12.66 583627 73 73924 509261 12.68 583185 74 74078 506496 12.76 580574 75 74448 507356 12.80 581804 76 73882 507816 12.70 581698 77 73814 506528 12.72 580342 78 73753 506051 12.72 579804 79 73889 508639 12.68 582528 80 74313 506958 12.78 581271 81 74045 507269 12.74 581314 82 73502 508920 12.62 582422 83 74139 507763 12.74 581902 84 73587 509410 12.62 582997 85 73839 508609 12.68 582448 86 74496 507764 12.79 582260 87 74046 507755 12.73 581801 88 73523 507297 12.66 580820 89 73925 506920 12.73 580845 90 73666 507637 12.67 581303 91 73147 505900 12.63 579047 92 73527 506747 12.67 580274 93 73686 506264 12.71 579950 94 73923 508115 12.70 582038 95 73657 506357 12.70 580014 96 73410 507002 12.65 580412 97 73841 506489 12.72 580330 98 73577 506195 12.69 579772 99 73527 506602 12.67 580129 100 73205 506871 12.62 580076 101 73524 505221 12.70 578745 102 72769 506555 12.56 579324 103 73368 504309 12.70 577677 104 73133 505059 12.65 578192 105 73564 506358 12.69 579922 106 73591 504505 12.73 578096 107 73305 505490 12.67 578795 108 73307 505665 12.66 578972 109 73111 505098 12.64 578209 110 73653 503854 12.75 577507 111 73214 505627 12.65 578841 112 73155 504675 12.66 577830 113 73199 503378 12.70 576577 114 73037 504754 12.64 577791 115 73084 504323 12.66 577407 116 73198 504236 12.68 577434 117 73073 505415 12.63 578488 118 72780 504745 12.60 577525 119 72736 502211 12.65 574947 120 72495 502616 12.61 575111 121 72755 502053 12.66 574808 122 72708 503016 12.63 575724 123 72326 502348 12.59 574674 124 72841 504055 12.63 576896 125 72322 501877 12.60 574199 126 72670 501589 12.65 574259 127 72863 502460 12.66 575323 128 72828 501996 12.67 574824 129 72053 501679 12.56 573732 130 72548 501280 12.64 573828 131 72049 499912 12.60 571961 132 72154 499491 12.62 571645 133 71586 500452 12.51 572038 134 72393 499687 12.65 572080 135 71989 501493 12.55 573482 136 71873 499505 12.58 571378 137 71702 498561 12.57 570263 138 71854 500145 12.56 571999 139 71554 498317 12.56 569871 140 71598 498590 12.56 570188 141 71294 498042 12.52 569336 142 71455 497822 12.55 569277 143 70760 497107 12.46 567867 144 70861 497233 12.47 568094 145 70343 494890 12.44 565233 146 69921 496413 12.35 566334 147 69890 496293 12.34 566183 148 69017 492573 12.29 561590 149 68491 491513 12.23 560004 150 60163 458440 11.60 518603 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3446 777206 0.44 780652 2 1417 496202 0.28 497619 3 1797 754468 0.24 756265 4 2042 806976 0.25 809018 5 2009 800963 0.25 802972 6 1918 774392 0.25 776310 7 1783 788133 0.23 789916 8 1995 802444 0.25 804439 9 1855 797342 0.23 799197 10 1832 779645 0.23 781477 11 1773 781555 0.23 783328 12 1805 781692 0.23 783497 13 1845 782472 0.24 784317 14 1814 780298 0.23 782112 15 1879 783773 0.24 785652 16 1872 783964 0.24 785836 17 1818 784111 0.23 785929 18 1870 790144 0.24 792014 19 1782 793001 0.22 794783 20 1801 796565 0.23 798366 21 1809 797444 0.23 799253 22 1850 795183 0.23 797033 23 1737 799026 0.22 800763 24 1907 800760 0.24 802667 25 1833 798236 0.23 800069 26 1874 801124 0.23 802998 27 1926 804282 0.24 806208 28 1921 804584 0.24 806505 29 1944 806361 0.24 808305 30 1905 807370 0.24 809275 31 1831 805532 0.23 807363 32 1921 808842 0.24 810763 33 1887 806815 0.23 808702 34 1936 805493 0.24 807429 35 1821 804118 0.23 805939 36 1903 806527 0.24 808430 37 1915 806044 0.24 807959 38 1984 808079 0.24 810063 39 1990 808172 0.25 810162 40 1991 805746 0.25 807737 41 1948 806924 0.24 808872 42 1970 808919 0.24 810889 43 1899 806541 0.23 808440 44 1950 808912 0.24 810862 45 1868 807060 0.23 808928 46 2002 806765 0.25 808767 47 2008 805909 0.25 807917 48 1897 807002 0.23 808899 49 1959 805864 0.24 807823 50 1923 804701 0.24 806624 51 2035 805254 0.25 807289 52 1949 806044 0.24 807993 53 1931 804613 0.24 806544 54 1899 804416 0.24 806315 55 2011 803296 0.25 805307 56 1921 803193 0.24 805114 57 1899 801289 0.24 803188 58 1979 800296 0.25 802275 59 1906 802119 0.24 804025 60 1955 804252 0.24 806207 61 1876 805019 0.23 806895 62 1919 801392 0.24 803311 63 1934 802322 0.24 804256 64 1905 800865 0.24 802770 65 2014 800256 0.25 802270 66 1957 801455 0.24 803412 67 2015 798992 0.25 801007 68 1992 799581 0.25 801573 69 2046 802880 0.25 804926 70 2071 802712 0.26 804783 71 2005 799599 0.25 801604 72 2036 800685 0.25 802721 73 2033 800411 0.25 802444 74 1974 799697 0.25 801671 75 2035 799963 0.25 801998 76 1890 800631 0.24 802521 77 1924 798187 0.24 800111 78 1902 800893 0.24 802795 79 1882 800543 0.23 802425 80 1961 799524 0.24 801485 81 1894 801759 0.24 803653 82 1905 800886 0.24 802791 83 1939 799441 0.24 801380 84 1890 799619 0.24 801509 85 1986 801408 0.25 803394 86 2016 797656 0.25 799672 87 2299 796694 0.29 798993 88 2062 796948 0.26 799010 89 1938 793595 0.24 795533 90 1983 798481 0.25 800464 91 2207 797227 0.28 799434 92 1905 796781 0.24 798686 93 2000 796962 0.25 798962 94 1920 798191 0.24 800111 95 1993 795178 0.25 797171 96 2060 796712 0.26 798772 97 1944 795612 0.24 797556 98 2114 794390 0.27 796504 99 1967 797707 0.25 799674 100 2022 795035 0.25 797057 101 2088 794716 0.26 796804 102 2104 796632 0.26 798736 103 2082 796248 0.26 798330 104 2053 794452 0.26 796505 105 2049 796629 0.26 798678 106 2053 793155 0.26 795208 107 2279 794276 0.29 796555 108 2072 795261 0.26 797333 109 2136 794646 0.27 796782 110 2060 794138 0.26 796198 111 2064 795692 0.26 797756 112 2052 792999 0.26 795051 113 2007 792114 0.25 794121 114 1985 792550 0.25 794535 115 2062 792253 0.26 794315 116 2073 792591 0.26 794664 117 2048 791754 0.26 793802 118 2026 792889 0.25 794915 119 2081 792694 0.26 794775 120 2113 790685 0.27 792798 121 2192 792492 0.28 794684 122 2258 792139 0.28 794397 123 2008 790464 0.25 792472 124 2121 789743 0.27 791864 125 2177 789818 0.27 791995 126 2150 790930 0.27 793080 127 2181 790100 0.28 792281 128 2149 789533 0.27 791682 129 2169 788367 0.27 790536 130 2250 788786 0.28 791036 131 2148 787639 0.27 789787 132 2251 788531 0.28 790782 133 2294 789353 0.29 791647 134 2121 787639 0.27 789760 135 2241 788504 0.28 790745 136 2333 786180 0.30 788513 137 2454 787092 0.31 789546 138 2231 788106 0.28 790337 139 2266 786479 0.29 788745 140 2413 785865 0.31 788278 141 2310 785801 0.29 788111 142 2308 787281 0.29 789589 143 2227 783442 0.28 785669 144 2210 784722 0.28 786932 145 2301 782367 0.29 784668 146 2248 781955 0.29 784203 147 2307 781259 0.29 783566 148 2479 774363 0.32 776842 149 2044 770324 0.26 772368 150 1623 724405 0.22 726028 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 16605 3639018 0.45 3655623 2 7421 2683926 0.28 2691347 3 8347 3472846 0.24 3481193 4 8468 3617047 0.23 3625515 5 8120 3565109 0.23 3573229 6 8334 3634050 0.23 3642384 7 7529 3549718 0.21 3557247 8 7446 3559407 0.21 3566853 9 7197 3513706 0.20 3520903 10 7181 3508962 0.20 3516143 11 6861 3514977 0.19 3521838 12 6880 3497178 0.20 3504058 13 6742 3494270 0.19 3501012 14 6737 3480004 0.19 3486741 15 6526 3488147 0.19 3494673 16 6722 3487344 0.19 3494066 17 6678 3497530 0.19 3504208 18 6624 3521532 0.19 3528156 19 6705 3527162 0.19 3533867 20 6600 3526389 0.19 3532989 21 6555 3530023 0.19 3536578 22 6643 3519543 0.19 3526186 23 6550 3515198 0.19 3521748 24 6579 3527352 0.19 3533931 25 6481 3533513 0.18 3539994 26 6533 3532212 0.18 3538745 27 6867 3529413 0.19 3536280 28 6521 3530033 0.18 3536554 29 6508 3530826 0.18 3537334 30 6646 3538180 0.19 3544826 31 6669 3536806 0.19 3543475 32 6779 3528659 0.19 3535438 33 6738 3533306 0.19 3540044 34 6611 3535555 0.19 3542166 35 6637 3528275 0.19 3534912 36 6547 3533018 0.18 3539565 37 6581 3535663 0.19 3542244 38 6691 3527093 0.19 3533784 39 6886 3537603 0.19 3544489 40 6770 3529601 0.19 3536371 41 6843 3531344 0.19 3538187 42 6590 3536089 0.19 3542679 43 6635 3537427 0.19 3544062 44 6596 3531399 0.19 3537995 45 6673 3537018 0.19 3543691 46 6693 3531075 0.19 3537768 47 6618 3527764 0.19 3534382 48 6662 3528855 0.19 3535517 49 6659 3524494 0.19 3531153 50 6519 3524026 0.18 3530545 51 6623 3529011 0.19 3535634 52 6541 3530934 0.18 3537475 53 6650 3525996 0.19 3532646 54 6699 3533903 0.19 3540602 55 6529 3533982 0.18 3540511 56 6573 3529793 0.19 3536366 57 6575 3529885 0.19 3536460 58 6752 3526148 0.19 3532900 59 6607 3524538 0.19 3531145 60 6760 3531501 0.19 3538261 61 6643 3528415 0.19 3535058 62 6756 3526438 0.19 3533194 63 6717 3526754 0.19 3533471 64 6768 3526719 0.19 3533487 65 6767 3525661 0.19 3532428 66 6757 3527982 0.19 3534739 67 6853 3527750 0.19 3534603 68 6752 3527432 0.19 3534184 69 6881 3530549 0.19 3537430 70 6828 3526592 0.19 3533420 71 6968 3529384 0.20 3536352 72 6780 3528900 0.19 3535680 73 6890 3528401 0.19 3535291 74 6772 3523635 0.19 3530407 75 6870 3528681 0.19 3535551 76 6651 3529773 0.19 3536424 77 6484 3525758 0.18 3532242 78 6435 3531547 0.18 3537982 79 6480 3523171 0.18 3529651 80 6627 3525678 0.19 3532305 81 6620 3527516 0.19 3534136 82 6610 3527168 0.19 3533778 83 6637 3527229 0.19 3533866 84 6703 3531656 0.19 3538359 85 6664 3527146 0.19 3533810 86 6503 3524205 0.18 3530708 87 8323 3520177 0.24 3528500 88 7150 3522786 0.20 3529936 89 6619 3518553 0.19 3525172 90 6735 3524985 0.19 3531720 91 7452 3521674 0.21 3529126 92 6744 3522322 0.19 3529066 93 6744 3523265 0.19 3530009 94 6564 3524329 0.19 3530893 95 6967 3522299 0.20 3529266 96 7057 3529962 0.20 3537019 97 6805 3527013 0.19 3533818 98 7514 3521332 0.21 3528846 99 6912 3527783 0.20 3534695 100 6884 3528330 0.19 3535214 101 7068 3528999 0.20 3536067 102 6939 3534221 0.20 3541160 103 6975 3529682 0.20 3536657 104 6948 3521540 0.20 3528488 105 6962 3526008 0.20 3532970 106 7146 3525312 0.20 3532458 107 7701 3519420 0.22 3527121 108 7091 3525887 0.20 3532978 109 6950 3521683 0.20 3528633 110 6782 3526019 0.19 3532801 111 7029 3528222 0.20 3535251 112 7100 3524813 0.20 3531913 113 6826 3522173 0.19 3528999 114 6956 3524198 0.20 3531154 115 7202 3526487 0.20 3533689 116 7156 3527151 0.20 3534307 117 7003 3527854 0.20 3534857 118 7132 3523866 0.20 3530998 119 7225 3523068 0.20 3530293 120 7445 3523072 0.21 3530517 121 7641 3518337 0.22 3525978 122 7287 3518066 0.21 3525353 123 7321 3526106 0.21 3533427 124 7217 3523503 0.20 3530720 125 7511 3518275 0.21 3525786 126 7319 3521244 0.21 3528563 127 7650 3518485 0.22 3526135 128 7332 3518787 0.21 3526119 129 7299 3519627 0.21 3526926 130 7504 3519124 0.21 3526628 131 7622 3519956 0.22 3527578 132 7567 3518257 0.21 3525824 133 7726 3516132 0.22 3523858 134 7845 3512490 0.22 3520335 135 7693 3513396 0.22 3521089 136 7925 3512196 0.23 3520121 137 8345 3509938 0.24 3518283 138 7796 3510949 0.22 3518745 139 7796 3508745 0.22 3516541 140 7935 3502737 0.23 3510672 141 7934 3506410 0.23 3514344 142 7950 3506542 0.23 3514492 143 7674 3500716 0.22 3508390 144 7728 3508280 0.22 3516008 145 7980 3506961 0.23 3514941 146 7766 3509257 0.22 3517023 147 7978 3509454 0.23 3517432 148 8353 3492168 0.24 3500521 149 7444 3461216 0.21 3468660 150 5659 3297096 0.17 3302755 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2288 807048 0.28 809336 2 11648 528734 2.16 540382 3 32485 209289 13.44 241774 4 50882 430190 10.58 481072 5 58871 509721 10.35 568592 6 60045 517434 10.40 577479 7 63198 532788 10.60 595986 8 56738 475071 10.67 531809 9 61148 507656 10.75 568804 10 61733 502760 10.94 564493 11 60645 498081 10.85 558726 12 61197 494561 11.01 555758 13 62309 491354 11.25 553663 14 62228 492622 11.22 554850 15 62788 490085 11.36 552873 16 64450 492310 11.58 556760 17 65128 492888 11.67 558016 18 65714 492300 11.78 558014 19 66124 494504 11.79 560628 20 67182 496113 11.93 563295 21 68155 500113 11.99 568268 22 68136 501233 11.97 569369 23 68194 497580 12.05 565774 24 68525 498615 12.08 567140 25 69357 502423 12.13 571780 26 69738 503117 12.17 572855 27 70123 500633 12.29 570756 28 69180 502854 12.09 572034 29 69466 503831 12.12 573297 30 69332 503294 12.11 572626 31 69898 504394 12.17 574292 32 69819 502374 12.20 572193 33 69782 502972 12.18 572754 34 69912 501217 12.24 571129 35 69787 501533 12.22 571320 36 70575 502130 12.32 572705 37 70208 502722 12.25 572930 38 70503 501748 12.32 572251 39 70330 500601 12.32 570931 40 70088 503370 12.22 573458 41 70773 501467 12.37 572240 42 70379 503100 12.27 573479 43 70796 501224 12.38 572020 44 70436 501715 12.31 572151 45 70418 497912 12.39 568330 46 70138 499211 12.32 569349 47 70148 498342 12.34 568490 48 70227 497677 12.37 567904 49 71269 498204 12.51 569473 50 70280 498011 12.37 568291 51 70078 496828 12.36 566906 52 70439 497323 12.41 567762 53 70147 495821 12.39 565968 54 69786 495385 12.35 565171 55 70656 494262 12.51 564918 56 69874 493560 12.40 563434 57 69896 492233 12.43 562129 58 70215 493283 12.46 563498 59 69691 490437 12.44 560128 60 70113 490599 12.50 560712 61 69608 490330 12.43 559938 62 69749 488611 12.49 558360 63 69042 487807 12.40 556849 64 69210 488505 12.41 557715 65 69323 486936 12.46 556259 66 68917 483915 12.47 552832 67 69103 484402 12.48 553505 68 68772 484685 12.43 553457 69 68826 482188 12.49 551014 70 69033 482362 12.52 551395 71 68806 481154 12.51 549960 72 68914 478868 12.58 547782 73 67795 477910 12.42 545705 74 68089 476423 12.50 544512 75 68129 475396 12.53 543525 76 67744 475187 12.48 542931 77 67503 472291 12.51 539794 78 67283 470826 12.50 538109 79 66665 469732 12.43 536397 80 67295 469958 12.53 537253 81 66828 467468 12.51 534296 82 66530 467059 12.47 533589 83 66687 465048 12.54 531735 84 66647 463067 12.58 529714 85 66493 462627 12.57 529120 86 65828 461230 12.49 527058 87 65775 458646 12.54 524421 88 65570 456742 12.55 522312 89 64780 454644 12.47 519424 90 64771 452712 12.52 517483 91 64769 451120 12.55 515889 92 64347 449214 12.53 513561 93 64101 445887 12.57 509988 94 63660 445474 12.50 509134 95 63358 443216 12.51 506574 96 62701 441572 12.43 504273 97 62955 440106 12.51 503061 98 62240 435142 12.51 497382 99 61937 433314 12.51 495251 100 61804 433494 12.48 495298 101 61611 430217 12.53 491828 102 61111 427189 12.52 488300 103 60945 423750 12.57 484695 104 60518 422326 12.53 482844 105 59827 418329 12.51 478156 106 59939 416993 12.57 476932 107 59446 414268 12.55 473714 108 58526 411639 12.45 470165 109 58738 410786 12.51 469524 110 58316 405518 12.57 463834 111 57418 404067 12.44 461485 112 57388 401195 12.51 458583 113 57163 397983 12.56 455146 114 56471 394674 12.52 451145 115 55972 391995 12.49 447967 116 55809 389122 12.54 444931 117 55485 385614 12.58 441099 118 54606 383288 12.47 437894 119 54848 379241 12.64 434089 120 53823 375104 12.55 428927 121 53466 372177 12.56 425643 122 52769 369727 12.49 422496 123 52307 366212 12.50 418519 124 51541 363601 12.42 415142 125 51964 359598 12.63 411562 126 50621 355415 12.47 406036 127 50000 351709 12.45 401709 128 50294 349166 12.59 399460 129 49070 343677 12.49 392747 130 49077 341585 12.56 390662 131 48065 337834 12.46 385899 132 47992 332912 12.60 380904 133 47090 329663 12.50 376753 134 46849 326583 12.55 373432 135 46102 322707 12.50 368809 136 45788 318487 12.57 364275 137 44769 315868 12.41 360637 138 44656 310390 12.58 355046 139 43733 306849 12.47 350582 140 43027 302114 12.47 345141 141 42647 298227 12.51 340874 142 42287 295763 12.51 338050 143 41638 290876 12.52 332514 144 40811 286253 12.48 327064 145 40046 282408 12.42 322454 146 39225 276484 12.42 315709 147 38336 270523 12.41 308859 148 37557 263470 12.48 301027 149 35902 244080 12.82 279982 150 34202 0 100.00 34202 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1768 720477 0.24 722245 2 1685 1020702 0.16 1022387 3 1570 828778 0.19 830348 4 1171 497603 0.23 498774 5 1535 726784 0.21 728319 6 1981 793561 0.25 795542 7 1990 793085 0.25 795075 8 1781 761314 0.23 763095 9 1919 766363 0.25 768282 10 1901 783496 0.24 785397 11 1724 777171 0.22 778895 12 1751 767368 0.23 769119 13 1762 764638 0.23 766400 14 1708 764686 0.22 766394 15 1764 765541 0.23 767305 16 1823 765192 0.24 767015 17 1815 768814 0.24 770629 18 1807 769157 0.23 770964 19 1883 769961 0.24 771844 20 1937 775042 0.25 776979 21 1925 782475 0.25 784400 22 1827 782033 0.23 783860 23 2414 780740 0.31 783154 24 1889 783530 0.24 785419 25 1844 784254 0.23 786098 26 1921 787292 0.24 789213 27 2486 785901 0.32 788387 28 1841 785310 0.23 787151 29 1973 788966 0.25 790939 30 1874 794093 0.24 795967 31 1921 790232 0.24 792153 32 1873 792600 0.24 794473 33 1919 792033 0.24 793952 34 1882 789584 0.24 791466 35 1914 792620 0.24 794534 36 2103 790111 0.27 792214 37 2018 790442 0.25 792460 38 1872 792162 0.24 794034 39 1955 791683 0.25 793638 40 1924 787272 0.24 789196 41 1965 790118 0.25 792083 42 1931 790269 0.24 792200 43 1854 787411 0.23 789265 44 1856 788555 0.23 790411 45 1843 788161 0.23 790004 46 1886 785836 0.24 787722 47 1884 788575 0.24 790459 48 1856 785489 0.24 787345 49 1954 781785 0.25 783739 50 1879 785088 0.24 786967 51 1871 783627 0.24 785498 52 1831 781681 0.23 783512 53 1914 781408 0.24 783322 54 1819 779894 0.23 781713 55 1920 776929 0.25 778849 56 1874 778457 0.24 780331 57 1823 778002 0.23 779825 58 1889 774459 0.24 776348 59 1733 773305 0.22 775038 60 1825 772158 0.24 773983 61 1802 768978 0.23 770780 62 1885 770508 0.24 772393 63 1821 769276 0.24 771097 64 1880 765401 0.25 767281 65 1908 765900 0.25 767808 66 1797 764039 0.23 765836 67 1759 760855 0.23 762614 68 1816 762983 0.24 764799 69 1854 759146 0.24 761000 70 1868 757450 0.25 759318 71 1854 757128 0.24 758982 72 1891 754819 0.25 756710 73 1771 750700 0.24 752471 74 1854 749989 0.25 751843 75 1793 747926 0.24 749719 76 1892 746368 0.25 748260 77 1790 746637 0.24 748427 78 1869 744334 0.25 746203 79 1795 738546 0.24 740341 80 1839 737998 0.25 739837 81 1847 736804 0.25 738651 82 1779 734056 0.24 735835 83 1765 731018 0.24 732783 84 1838 728444 0.25 730282 85 1714 727010 0.24 728724 86 1781 724868 0.25 726649 87 1749 721014 0.24 722763 88 1749 719493 0.24 721242 89 1828 716263 0.25 718091 90 1766 712700 0.25 714466 91 1840 707952 0.26 709792 92 1801 706135 0.25 707936 93 1788 705138 0.25 706926 94 1767 700597 0.25 702364 95 1664 698793 0.24 700457 96 1731 694363 0.25 696094 97 1776 690859 0.26 692635 98 1830 687432 0.27 689262 99 1787 684220 0.26 686007 100 1672 678844 0.25 680516 101 1631 678026 0.24 679657 102 1770 674004 0.26 675774 103 1645 669368 0.25 671013 104 1655 664257 0.25 665912 105 1859 659168 0.28 661027 106 1620 655893 0.25 657513 107 1613 651582 0.25 653195 108 1667 647828 0.26 649495 109 1602 643836 0.25 645438 110 1662 640663 0.26 642325 111 1669 635905 0.26 637574 112 1588 629092 0.25 630680 113 1565 626595 0.25 628160 114 1682 620836 0.27 622518 115 1668 616856 0.27 618524 116 1591 612059 0.26 613650 117 1539 606318 0.25 607857 118 1592 601592 0.26 603184 119 1544 595589 0.26 597133 120 1610 590643 0.27 592253 121 1549 584952 0.26 586501 122 1541 580200 0.26 581741 123 1521 575776 0.26 577297 124 1523 569872 0.27 571395 125 1559 564963 0.28 566522 126 1670 559555 0.30 561225 127 1509 553385 0.27 554894 128 1454 548722 0.26 550176 129 1376 541528 0.25 542904 130 1453 535799 0.27 537252 131 1540 530832 0.29 532372 132 1443 525314 0.27 526757 133 1469 518104 0.28 519573 134 1379 512455 0.27 513834 135 1418 507798 0.28 509216 136 1597 500975 0.32 502572 137 1377 496478 0.28 497855 138 1436 488927 0.29 490363 139 1421 482051 0.29 483472 140 1640 475523 0.34 477163 141 1225 470688 0.26 471913 142 1378 463475 0.30 464853 143 1367 458142 0.30 459509 144 1238 449226 0.27 450464 145 1245 443027 0.28 444272 146 1215 435865 0.28 437080 147 1220 425529 0.29 426749 148 1116 413825 0.27 414941 149 891 383470 0.23 384361 150 659 0 100.00 659 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 7785 3297757 0.24 3305542 2 5752 3520426 0.16 3526178 3 5641 3369700 0.17 3375341 4 6500 3673664 0.18 3680164 5 6460 3590694 0.18 3597154 6 7359 3489216 0.21 3496575 7 7510 3593908 0.21 3601418 8 6557 3317029 0.20 3323586 9 7003 3423060 0.20 3430063 10 6814 3454751 0.20 3461565 11 6678 3467199 0.19 3473877 12 6499 3443620 0.19 3450119 13 6451 3429023 0.19 3435474 14 6650 3433854 0.19 3440504 15 6659 3438350 0.19 3445009 16 7037 3443045 0.20 3450082 17 6714 3447896 0.19 3454610 18 6764 3449532 0.20 3456296 19 6875 3455435 0.20 3462310 20 7412 3460831 0.21 3468243 21 6754 3468807 0.19 3475561 22 6958 3475380 0.20 3482338 23 9351 3475023 0.27 3484374 24 6928 3479550 0.20 3486478 25 7003 3486013 0.20 3493016 26 7019 3487116 0.20 3494135 27 9165 3479153 0.26 3488318 28 6983 3497732 0.20 3504715 29 7097 3497014 0.20 3504111 30 6960 3501041 0.20 3508001 31 6787 3495889 0.19 3502676 32 6740 3501554 0.19 3508294 33 7048 3504132 0.20 3511180 34 7261 3505551 0.21 3512812 35 6997 3502847 0.20 3509844 36 7650 3504311 0.22 3511961 37 7215 3503067 0.21 3510282 38 6900 3504090 0.20 3510990 39 6893 3504284 0.20 3511177 40 6985 3507261 0.20 3514246 41 6916 3496902 0.20 3503818 42 6868 3496395 0.20 3503263 43 7036 3494616 0.20 3501652 44 6754 3494713 0.19 3501467 45 6861 3486644 0.20 3493505 46 7000 3485837 0.20 3492837 47 6916 3485375 0.20 3492291 48 6961 3482963 0.20 3489924 49 6981 3480537 0.20 3487518 50 6854 3478782 0.20 3485636 51 6648 3473282 0.19 3479930 52 6623 3472656 0.19 3479279 53 6937 3464881 0.20 3471818 54 6742 3458929 0.19 3465671 55 6917 3461797 0.20 3468714 56 6822 3451628 0.20 3458450 57 6788 3446558 0.20 3453346 58 6734 3447548 0.19 3454282 59 6553 3436431 0.19 3442984 60 6595 3435530 0.19 3442125 61 6738 3428320 0.20 3435058 62 6720 3420109 0.20 3426829 63 6753 3421827 0.20 3428580 64 6861 3414983 0.20 3421844 65 6741 3407369 0.20 3414110 66 6756 3403315 0.20 3410071 67 6484 3393557 0.19 3400041 68 6732 3384790 0.20 3391522 69 6886 3378598 0.20 3385484 70 7032 3372352 0.21 3379384 71 6651 3367701 0.20 3374352 72 6729 3357673 0.20 3364402 73 6786 3350388 0.20 3357174 74 6626 3344452 0.20 3351078 75 6607 3330573 0.20 3337180 76 6934 3324732 0.21 3331666 77 6496 3317324 0.20 3323820 78 6835 3308253 0.21 3315088 79 6311 3302447 0.19 3308758 80 6592 3291873 0.20 3298465 81 6640 3279262 0.20 3285902 82 6454 3270051 0.20 3276505 83 6362 3260010 0.19 3266372 84 6542 3246741 0.20 3253283 85 6167 3237556 0.19 3243723 86 6357 3224652 0.20 3231009 87 6387 3212613 0.20 3219000 88 6362 3204893 0.20 3211255 89 6501 3186929 0.20 3193430 90 6452 3173576 0.20 3180028 91 6774 3162054 0.21 3168828 92 6748 3148445 0.21 3155193 93 6391 3139508 0.20 3145899 94 6287 3122958 0.20 3129245 95 6040 3107233 0.19 3113273 96 6515 3093422 0.21 3099937 97 6396 3076380 0.21 3082776 98 6698 3062115 0.22 3068813 99 6318 3047067 0.21 3053385 100 6128 3030021 0.20 3036149 101 6106 3015343 0.20 3021449 102 6560 2994573 0.22 3001133 103 6073 2977902 0.20 2983975 104 6097 2960721 0.21 2966818 105 7154 2938074 0.24 2945228 106 5766 2923278 0.20 2929044 107 5813 2908973 0.20 2914786 108 5973 2884633 0.21 2890606 109 5908 2870971 0.21 2876879 110 6029 2852865 0.21 2858894 111 5782 2827068 0.20 2832850 112 5585 2807615 0.20 2813200 113 5437 2788458 0.19 2793895 114 5811 2766152 0.21 2771963 115 6050 2746915 0.22 2752965 116 6069 2724939 0.22 2731008 117 5842 2699974 0.22 2705816 118 5843 2678345 0.22 2684188 119 5929 2656943 0.22 2662872 120 5578 2633502 0.21 2639080 121 5884 2610235 0.22 2616119 122 5843 2587622 0.23 2593465 123 5461 2568410 0.21 2573871 124 5699 2542757 0.22 2548456 125 5888 2520039 0.23 2525927 126 6104 2490233 0.24 2496337 127 5468 2468971 0.22 2474439 128 5541 2443328 0.23 2448869 129 5632 2420992 0.23 2426624 130 5340 2395041 0.22 2400381 131 5501 2369760 0.23 2375261 132 5281 2343164 0.22 2348445 133 5319 2317729 0.23 2323048 134 5441 2293149 0.24 2298590 135 5115 2267790 0.23 2272905 136 5956 2242107 0.26 2248063 137 5203 2211995 0.23 2217198 138 5081 2186265 0.23 2191346 139 5004 2160498 0.23 2165502 140 6040 2130270 0.28 2136310 141 4940 2102773 0.23 2107713 142 5096 2076298 0.24 2081394 143 5238 2047612 0.26 2052850 144 4811 2015342 0.24 2020153 145 4744 1981874 0.24 1986618 146 4561 1949759 0.23 1954320 147 4741 1909678 0.25 1914419 148 4108 1865670 0.22 1869778 149 3475 1739056 0.20 1742531 150 2280 0 100.00 2280