CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 79686 463983 14.66 543669 2 54854 282258 16.27 337112 3 69169 475076 12.71 544245 4 75480 519612 12.68 595092 5 75352 525184 12.55 600536 6 81180 548942 12.88 630122 7 75292 506401 12.94 581693 8 78653 535388 12.81 614041 9 78231 528164 12.90 606395 10 76382 523832 12.73 600214 11 74815 515408 12.68 590223 12 75284 517049 12.71 592333 13 75847 515794 12.82 591641 14 75695 516298 12.79 591993 15 75886 518216 12.77 594102 16 76753 519906 12.86 596659 17 76962 522291 12.84 599253 18 77895 527961 12.86 605856 19 77654 529074 12.80 606728 20 78836 531427 12.92 610263 21 78344 532178 12.83 610522 22 78336 532256 12.83 610592 23 78686 531491 12.90 610177 24 79159 536179 12.86 615338 25 79450 535860 12.91 615310 26 78847 535050 12.84 613897 27 79111 537696 12.83 616807 28 78967 540061 12.76 619028 29 78837 540564 12.73 619401 30 79713 541689 12.83 621402 31 79154 540817 12.77 619971 32 79086 538557 12.80 617643 33 79171 540294 12.78 619465 34 78964 541241 12.73 620205 35 78723 541102 12.70 619825 36 79122 540281 12.77 619403 37 79239 540483 12.79 619722 38 78891 541817 12.71 620708 39 79186 541422 12.76 620608 40 79837 541152 12.86 620989 41 79329 540441 12.80 619770 42 79197 543109 12.73 622306 43 79403 541851 12.78 621254 44 78752 539449 12.74 618201 45 79068 541690 12.74 620758 46 78292 541072 12.64 619364 47 79210 538724 12.82 617934 48 78830 542805 12.68 621635 49 78958 540890 12.74 619848 50 78802 538971 12.76 617773 51 79270 539476 12.81 618746 52 79689 540909 12.84 620598 53 78819 540645 12.72 619464 54 79250 540965 12.78 620215 55 78788 539824 12.74 618612 56 78577 538289 12.74 616866 57 78414 539337 12.69 617751 58 78895 539367 12.76 618262 59 79090 539977 12.78 619067 60 79126 540065 12.78 619191 61 78858 539660 12.75 618518 62 78653 540621 12.70 619274 63 79391 539073 12.84 618464 64 78840 539255 12.76 618095 65 78201 538194 12.69 616395 66 78964 538635 12.79 617599 67 78554 538617 12.73 617171 68 77751 536787 12.65 614538 69 78901 538027 12.79 616928 70 78767 539079 12.75 617846 71 79224 538411 12.83 617635 72 78623 539252 12.72 617875 73 78501 537908 12.74 616409 74 78601 535463 12.80 614064 75 78703 537728 12.77 616431 76 78323 535921 12.75 614244 77 78081 534637 12.74 612718 78 77592 535926 12.65 613518 79 78246 536479 12.73 614725 80 77861 536645 12.67 614506 81 77628 535974 12.65 613602 82 77637 536479 12.64 614116 83 78428 537277 12.74 615705 84 77892 537194 12.66 615086 85 77751 537113 12.65 614864 86 77571 536548 12.63 614119 87 78149 535788 12.73 613937 88 78378 537332 12.73 615710 89 77825 535545 12.69 613370 90 77340 535584 12.62 612924 91 77945 536331 12.69 614276 92 77934 535925 12.70 613859 93 78185 536397 12.72 614582 94 78097 535833 12.72 613930 95 77853 533642 12.73 611495 96 78289 533330 12.80 611619 97 77357 533905 12.66 611262 98 77474 532864 12.69 610338 99 77404 535556 12.63 612960 100 77899 532864 12.75 610763 101 76923 532562 12.62 609485 102 77701 534461 12.69 612162 103 77305 531935 12.69 609240 104 77895 534726 12.72 612621 105 77429 532780 12.69 610209 106 76928 532690 12.62 609618 107 77055 531127 12.67 608182 108 77213 531839 12.68 609052 109 77161 532005 12.67 609166 110 77399 532720 12.69 610119 111 76636 532517 12.58 609153 112 76914 532437 12.62 609351 113 77137 532550 12.65 609687 114 76617 533002 12.57 609619 115 76912 532652 12.62 609564 116 77333 530074 12.73 607407 117 76494 531114 12.59 607608 118 76475 530753 12.59 607228 119 76762 530332 12.64 607094 120 76600 530031 12.63 606631 121 76807 528184 12.70 604991 122 76537 529034 12.64 605571 123 76420 530188 12.60 606608 124 75882 530748 12.51 606630 125 76474 530473 12.60 606947 126 76443 528591 12.63 605034 127 75901 529740 12.53 605641 128 75903 530140 12.52 606043 129 75998 528710 12.57 604708 130 76240 528873 12.60 605113 131 75587 527419 12.54 603006 132 76054 528064 12.59 604118 133 75837 527034 12.58 602871 134 75657 528068 12.53 603725 135 75496 525655 12.56 601151 136 75850 526083 12.60 601933 137 76255 526401 12.65 602656 138 75528 524908 12.58 600436 139 75327 524878 12.55 600205 140 74988 525106 12.50 600094 141 74581 524085 12.46 598666 142 74658 524059 12.47 598717 143 74444 523830 12.44 598274 144 74104 522099 12.43 596203 145 74022 522622 12.41 596644 146 73860 521968 12.40 595828 147 72798 521792 12.24 594590 148 72044 519061 12.19 591105 149 71187 517151 12.10 588338 150 63233 484161 11.55 547394 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3577 836275 0.43 839852 2 1770 622147 0.28 623917 3 1945 786526 0.25 788471 4 2065 844175 0.24 846240 5 2096 854948 0.24 857044 6 2032 843360 0.24 845392 7 2020 849365 0.24 851385 8 2032 859245 0.24 861277 9 2034 846669 0.24 848703 10 1934 830881 0.23 832815 11 1888 831832 0.23 833720 12 1886 834404 0.23 836290 13 1833 835061 0.22 836894 14 1873 833144 0.22 835017 15 1909 835606 0.23 837515 16 1985 835206 0.24 837191 17 1940 841826 0.23 843766 18 1934 847868 0.23 849802 19 1938 850588 0.23 852526 20 1977 850750 0.23 852727 21 1939 852962 0.23 854901 22 1912 854952 0.22 856864 23 1926 857030 0.22 858956 24 1926 859144 0.22 861070 25 1886 856457 0.22 858343 26 2054 857350 0.24 859404 27 2141 861354 0.25 863495 28 2070 865925 0.24 867995 29 2023 863861 0.23 865884 30 2009 864344 0.23 866353 31 2043 863055 0.24 865098 32 1947 865257 0.22 867204 33 2023 866741 0.23 868764 34 1990 866754 0.23 868744 35 2019 864059 0.23 866078 36 2068 864786 0.24 866854 37 2066 862716 0.24 864782 38 1987 865971 0.23 867958 39 2159 866847 0.25 869006 40 2092 865050 0.24 867142 41 2166 866887 0.25 869053 42 2040 866001 0.24 868041 43 2033 866728 0.23 868761 44 2008 865720 0.23 867728 45 2092 867383 0.24 869475 46 2042 864539 0.24 866581 47 2094 863256 0.24 865350 48 2088 863535 0.24 865623 49 2086 861037 0.24 863123 50 2070 863007 0.24 865077 51 2060 862762 0.24 864822 52 2055 861634 0.24 863689 53 2085 863630 0.24 865715 54 2002 862844 0.23 864846 55 2017 859914 0.23 861931 56 2066 859746 0.24 861812 57 2007 857840 0.23 859847 58 2135 861374 0.25 863509 59 2132 858956 0.25 861088 60 2009 860765 0.23 862774 61 2155 862897 0.25 865052 62 2089 858533 0.24 860622 63 2142 858294 0.25 860436 64 2099 856598 0.24 858697 65 2154 857830 0.25 859984 66 2098 860576 0.24 862674 67 2087 857911 0.24 859998 68 2125 857281 0.25 859406 69 2162 857501 0.25 859663 70 2070 857309 0.24 859379 71 2278 856769 0.27 859047 72 2062 855899 0.24 857961 73 2175 856049 0.25 858224 74 2134 856732 0.25 858866 75 2158 856126 0.25 858284 76 2021 857184 0.24 859205 77 2059 855140 0.24 857199 78 2051 858101 0.24 860152 79 2037 856462 0.24 858499 80 2051 854555 0.24 856606 81 2034 855221 0.24 857255 82 2031 855577 0.24 857608 83 2113 856345 0.25 858458 84 2089 856521 0.24 858610 85 2050 856225 0.24 858275 86 2076 852599 0.24 854675 87 2479 853528 0.29 856007 88 2156 851583 0.25 853739 89 2145 850467 0.25 852612 90 2073 854862 0.24 856935 91 2309 852227 0.27 854536 92 2110 850585 0.25 852695 93 2012 852344 0.24 854356 94 2135 853719 0.25 855854 95 2189 849806 0.26 851995 96 2145 850737 0.25 852882 97 2139 851642 0.25 853781 98 2221 850337 0.26 852558 99 2070 848824 0.24 850894 100 2136 850454 0.25 852590 101 2099 849023 0.25 851122 102 2148 849437 0.25 851585 103 2169 850342 0.25 852511 104 2170 849112 0.25 851282 105 2074 849496 0.24 851570 106 2201 848080 0.26 850281 107 2288 848155 0.27 850443 108 2133 849652 0.25 851785 109 2153 847434 0.25 849587 110 2098 848305 0.25 850403 111 2172 846509 0.26 848681 112 2159 845600 0.25 847759 113 2148 844772 0.25 846920 114 2106 846199 0.25 848305 115 2138 845326 0.25 847464 116 2089 843713 0.25 845802 117 2240 845505 0.26 847745 118 2174 846343 0.26 848517 119 2276 845167 0.27 847443 120 2180 845127 0.26 847307 121 2284 844266 0.27 846550 122 2355 844314 0.28 846669 123 2189 842204 0.26 844393 124 2209 843451 0.26 845660 125 2312 844305 0.27 846617 126 2256 843416 0.27 845672 127 2349 842777 0.28 845126 128 2245 840285 0.27 842530 129 2370 841434 0.28 843804 130 2317 841471 0.27 843788 131 2349 841614 0.28 843963 132 2275 841389 0.27 843664 133 2371 841248 0.28 843619 134 2448 840004 0.29 842452 135 2285 839455 0.27 841740 136 2390 840557 0.28 842947 137 2504 837210 0.30 839714 138 2419 837334 0.29 839753 139 2449 839359 0.29 841808 140 2332 838963 0.28 841295 141 2350 837921 0.28 840271 142 2500 836016 0.30 838516 143 2439 833754 0.29 836193 144 2291 834310 0.27 836601 145 2332 835030 0.28 837362 146 2410 834413 0.29 836823 147 2472 831297 0.30 833769 148 2591 827971 0.31 830562 149 2317 822337 0.28 824654 150 1762 775536 0.23 777298 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 14495 3565666 0.40 3580161 2 6988 2921647 0.24 2928635 3 7283 3500592 0.21 3507875 4 7523 3711200 0.20 3718723 5 7381 3697277 0.20 3704658 6 7480 3771621 0.20 3779101 7 7113 3697961 0.19 3705074 8 7368 3733594 0.20 3740962 9 7045 3686116 0.19 3693161 10 6932 3678479 0.19 3685411 11 6828 3670708 0.19 3677536 12 6899 3659145 0.19 3666044 13 6784 3654184 0.19 3660968 14 6759 3645137 0.19 3651896 15 6801 3654706 0.19 3661507 16 6816 3663271 0.19 3670087 17 6698 3671945 0.18 3678643 18 6912 3700665 0.19 3707577 19 6730 3707001 0.18 3713731 20 6871 3705808 0.19 3712679 21 6768 3706485 0.18 3713253 22 6878 3711663 0.18 3718541 23 6763 3705382 0.18 3712145 24 6881 3714995 0.18 3721876 25 6910 3719395 0.19 3726305 26 7033 3721017 0.19 3728050 27 7244 3722774 0.19 3730018 28 7042 3724010 0.19 3731052 29 6955 3724049 0.19 3731004 30 7259 3731118 0.19 3738377 31 6953 3728409 0.19 3735362 32 7007 3722128 0.19 3729135 33 6967 3727542 0.19 3734509 34 6935 3728950 0.19 3735885 35 7129 3725876 0.19 3733005 36 7139 3730996 0.19 3738135 37 6933 3724525 0.19 3731458 38 7120 3727105 0.19 3734225 39 7383 3729266 0.20 3736649 40 7279 3729589 0.19 3736868 41 7265 3726993 0.19 3734258 42 7142 3729008 0.19 3736150 43 7012 3727192 0.19 3734204 44 7001 3724319 0.19 3731320 45 7133 3729858 0.19 3736991 46 7151 3727686 0.19 3734837 47 7081 3723181 0.19 3730262 48 7005 3721566 0.19 3728571 49 7133 3719741 0.19 3726874 50 7018 3718966 0.19 3725984 51 7194 3723397 0.19 3730591 52 7173 3724498 0.19 3731671 53 7067 3719757 0.19 3726824 54 6943 3727819 0.19 3734762 55 7193 3725510 0.19 3732703 56 7252 3722338 0.19 3729590 57 7096 3725022 0.19 3732118 58 7148 3721226 0.19 3728374 59 6980 3724086 0.19 3731066 60 7149 3724596 0.19 3731745 61 7048 3720260 0.19 3727308 62 7163 3720419 0.19 3727582 63 7152 3718930 0.19 3726082 64 7158 3717052 0.19 3724210 65 7158 3721863 0.19 3729021 66 7238 3720561 0.19 3727799 67 7140 3721438 0.19 3728578 68 7296 3714050 0.20 3721346 69 7347 3721513 0.20 3728860 70 7138 3717883 0.19 3725021 71 7274 3719256 0.20 3726530 72 7096 3720497 0.19 3727593 73 7302 3720660 0.20 3727962 74 7296 3716338 0.20 3723634 75 7244 3724726 0.19 3731970 76 7092 3722649 0.19 3729741 77 7018 3719869 0.19 3726887 78 7034 3720286 0.19 3727320 79 7119 3720929 0.19 3728048 80 7089 3718140 0.19 3725229 81 6986 3718903 0.19 3725889 82 7208 3723966 0.19 3731174 83 7092 3717335 0.19 3724427 84 7127 3721082 0.19 3728209 85 7060 3721457 0.19 3728517 86 7269 3719396 0.20 3726665 87 8779 3716205 0.24 3724984 88 7359 3720321 0.20 3727680 89 7280 3715614 0.20 3722894 90 7029 3716874 0.19 3723903 91 8164 3711918 0.22 3720082 92 7300 3716864 0.20 3724164 93 7197 3719072 0.19 3726269 94 7005 3717543 0.19 3724548 95 7343 3716806 0.20 3724149 96 7288 3723370 0.20 3730658 97 7169 3716784 0.19 3723953 98 7981 3717470 0.21 3725451 99 7280 3718506 0.20 3725786 100 7399 3719781 0.20 3727180 101 7480 3721443 0.20 3728923 102 7369 3724224 0.20 3731593 103 7257 3718701 0.19 3725958 104 7264 3716808 0.20 3724072 105 7641 3720329 0.20 3727970 106 7659 3717631 0.21 3725290 107 8230 3712825 0.22 3721055 108 7364 3718616 0.20 3725980 109 7421 3715399 0.20 3722820 110 7308 3716192 0.20 3723500 111 7438 3719675 0.20 3727113 112 7568 3715080 0.20 3722648 113 7245 3716239 0.19 3723484 114 7401 3712966 0.20 3720367 115 7469 3713952 0.20 3721421 116 7604 3720363 0.20 3727967 117 7497 3721277 0.20 3728774 118 7420 3718165 0.20 3725585 119 7568 3719186 0.20 3726754 120 7761 3714553 0.21 3722314 121 8145 3713263 0.22 3721408 122 7777 3713323 0.21 3721100 123 7648 3715665 0.21 3723313 124 7902 3715014 0.21 3722916 125 7900 3716981 0.21 3724881 126 7795 3714654 0.21 3722449 127 7986 3709602 0.21 3717588 128 7749 3709488 0.21 3717237 129 7918 3710302 0.21 3718220 130 7878 3712137 0.21 3720015 131 8152 3709371 0.22 3717523 132 7839 3709849 0.21 3717688 133 7958 3704127 0.21 3712085 134 8096 3707015 0.22 3715111 135 7972 3703597 0.21 3711569 136 8393 3702578 0.23 3710971 137 8662 3704204 0.23 3712866 138 8120 3702930 0.22 3711050 139 8099 3702842 0.22 3710941 140 8276 3701454 0.22 3709730 141 8022 3699282 0.22 3707304 142 8239 3697956 0.22 3706195 143 8310 3698065 0.22 3706375 144 7999 3700543 0.22 3708542 145 8181 3704005 0.22 3712186 146 8317 3700589 0.22 3708906 147 8477 3703407 0.23 3711884 148 8747 3684806 0.24 3693553 149 7950 3654936 0.22 3662886 150 5991 3488141 0.17 3494132 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1867 743094 0.25 744961 2 8770 532129 1.62 540899 3 37638 312302 10.76 349940 4 55176 486511 10.19 541687 5 61581 530028 10.41 591609 6 60000 536048 10.07 596048 7 62528 559931 10.05 622459 8 56732 514996 9.92 571728 9 61015 544349 10.08 605364 10 61768 533228 10.38 594996 11 61295 525699 10.44 586994 12 61162 517007 10.58 578169 13 62500 515449 10.81 577949 14 63227 515702 10.92 578929 15 63610 515395 10.99 579005 16 65360 516795 11.23 582155 17 66443 520430 11.32 586873 18 67572 517982 11.54 585554 19 68725 524923 11.58 593648 20 69143 524255 11.65 593398 21 69988 527356 11.72 597344 22 70321 527590 11.76 597911 23 70414 524561 11.83 594975 24 71088 527043 11.89 598131 25 71573 528363 11.93 599936 26 71734 530658 11.91 602392 27 71803 525799 12.02 597602 28 72307 528879 12.03 601186 29 72178 529518 12.00 601696 30 72657 531660 12.02 604317 31 72931 532388 12.05 605319 32 72820 529993 12.08 602813 33 72620 530689 12.04 603309 34 72903 528877 12.11 601780 35 72450 529755 12.03 602205 36 72383 529419 12.03 601802 37 73130 528736 12.15 601866 38 73194 528152 12.17 601346 39 72655 527666 12.10 600321 40 73083 527952 12.16 601035 41 73496 528076 12.22 601572 42 73161 527586 12.18 600747 43 73429 527562 12.22 600991 44 72750 526770 12.13 599520 45 73296 523260 12.29 596556 46 72798 523859 12.20 596657 47 72338 524359 12.12 596697 48 72762 523489 12.20 596251 49 73038 522501 12.26 595539 50 72958 523484 12.23 596442 51 72277 521261 12.18 593538 52 72827 521940 12.24 594767 53 73477 521549 12.35 595026 54 72560 517851 12.29 590411 55 72910 519355 12.31 592265 56 72590 517257 12.31 589847 57 72326 516300 12.29 588626 58 72698 515651 12.36 588349 59 72079 514572 12.29 586651 60 72280 511915 12.37 584195 61 72142 512595 12.34 584737 62 72418 511749 12.40 584167 63 71957 510558 12.35 582515 64 72047 510443 12.37 582490 65 72264 509040 12.43 581304 66 71274 506914 12.33 578188 67 70881 505898 12.29 576779 68 71295 506283 12.34 577578 69 70743 502305 12.35 573048 70 70987 500764 12.42 571751 71 70801 500019 12.40 570820 72 70983 499567 12.44 570550 73 70320 499976 12.33 570296 74 70160 495522 12.40 565682 75 69766 494591 12.36 564357 76 69798 493290 12.40 563088 77 69304 490699 12.38 560003 78 69505 489648 12.43 559153 79 68823 488779 12.34 557602 80 68962 485320 12.44 554282 81 68370 483719 12.38 552089 82 68623 482622 12.45 551245 83 68216 481196 12.42 549412 84 67794 477659 12.43 545453 85 67610 477739 12.40 545349 86 67511 475911 12.42 543422 87 67320 472664 12.47 539984 88 66701 471525 12.39 538226 89 66380 469036 12.40 535416 90 65992 465106 12.43 531098 91 65583 463732 12.39 529315 92 65574 461165 12.45 526739 93 64968 457927 12.42 522895 94 64714 456196 12.42 520910 95 63969 454434 12.34 518403 96 63577 449839 12.38 513416 97 63481 449210 12.38 512691 98 62837 446573 12.34 509410 99 62988 442011 12.47 504999 100 62512 441245 12.41 503757 101 62210 436861 12.47 499071 102 61557 432920 12.45 494477 103 61637 430779 12.52 492416 104 60249 427398 12.36 487647 105 60056 422666 12.44 482722 106 59810 420835 12.44 480645 107 59504 419234 12.43 478738 108 58994 414722 12.45 473716 109 58325 413464 12.36 471789 110 57678 408770 12.37 466448 111 57028 405192 12.34 462220 112 57103 401455 12.45 458558 113 56470 398996 12.40 455466 114 55664 395688 12.33 451352 115 55181 391620 12.35 446801 116 55188 387266 12.47 442454 117 54435 383397 12.43 437832 118 53866 381075 12.38 434941 119 53309 376559 12.40 429868 120 52641 373085 12.36 425726 121 52316 369526 12.40 421842 122 51907 364513 12.47 416420 123 51464 359838 12.51 411302 124 50751 355338 12.50 406089 125 50310 352643 12.49 402953 126 49637 348194 12.48 397831 127 48797 345048 12.39 393845 128 48654 341814 12.46 390468 129 47797 337111 12.42 384908 130 46993 332674 12.38 379667 131 46247 328971 12.33 375218 132 46030 323720 12.45 369750 133 45556 320703 12.44 366259 134 44431 317109 12.29 361540 135 44061 312857 12.34 356918 136 43882 306202 12.53 350084 137 42889 303329 12.39 346218 138 42352 299952 12.37 342304 139 41746 294955 12.40 336701 140 40975 289456 12.40 330431 141 40243 286454 12.32 326697 142 39578 281209 12.34 320787 143 39291 277348 12.41 316639 144 38701 272651 12.43 311352 145 37625 267730 12.32 305355 146 36697 262052 12.28 298749 147 36098 255683 12.37 291781 148 34953 248879 12.31 283832 149 33411 231388 12.62 264799 150 32043 0 100.00 32043 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1424 697505 0.20 698929 2 1624 1017629 0.16 1019253 3 1544 886400 0.17 887944 4 1408 626832 0.22 628240 5 1644 769473 0.21 771117 6 2080 836453 0.25 838533 7 2033 847340 0.24 849373 8 1879 831711 0.23 833590 9 1962 834928 0.23 836890 10 1939 847323 0.23 849262 11 1980 833150 0.24 835130 12 1843 819572 0.22 821415 13 1797 815683 0.22 817480 14 1932 819525 0.24 821457 15 1903 820546 0.23 822449 16 1989 819274 0.24 821263 17 1901 821001 0.23 822902 18 2015 821358 0.24 823373 19 2111 827716 0.25 829827 20 2107 832962 0.25 835069 21 1951 837243 0.23 839194 22 2071 837232 0.25 839303 23 2594 835903 0.31 838497 24 2044 841145 0.24 843189 25 2089 843385 0.25 845474 26 2083 844032 0.25 846115 27 2561 845013 0.30 847574 28 2035 841277 0.24 843312 29 2072 846452 0.24 848524 30 2161 849870 0.25 852031 31 2047 845520 0.24 847567 32 2050 848297 0.24 850347 33 2085 846024 0.25 848109 34 2041 845791 0.24 847832 35 1995 846086 0.24 848081 36 2267 846852 0.27 849119 37 2087 842430 0.25 844517 38 2043 843629 0.24 845672 39 2117 844985 0.25 847102 40 1997 840792 0.24 842789 41 1981 841841 0.23 843822 42 2112 842034 0.25 844146 43 2079 839169 0.25 841248 44 1992 840346 0.24 842338 45 2029 837601 0.24 839630 46 2058 835844 0.25 837902 47 2038 839152 0.24 841190 48 1988 835673 0.24 837661 49 2033 833965 0.24 835998 50 2097 833605 0.25 835702 51 2001 831609 0.24 833610 52 2044 831248 0.25 833292 53 2087 829740 0.25 831827 54 2048 828629 0.25 830677 55 1988 824526 0.24 826514 56 1981 826113 0.24 828094 57 1959 823844 0.24 825803 58 1993 821277 0.24 823270 59 1959 818970 0.24 820929 60 2015 819117 0.25 821132 61 1974 816516 0.24 818490 62 1947 818129 0.24 820076 63 1982 814922 0.24 816904 64 1994 811445 0.25 813439 65 2033 809361 0.25 811394 66 1979 806844 0.24 808823 67 1900 805391 0.24 807291 68 2018 802830 0.25 804848 69 1973 802344 0.25 804317 70 2131 799356 0.27 801487 71 1988 796772 0.25 798760 72 1967 796866 0.25 798833 73 1982 790985 0.25 792967 74 1956 788651 0.25 790607 75 1845 786751 0.23 788596 76 1906 785480 0.24 787386 77 1968 784311 0.25 786279 78 1942 779494 0.25 781436 79 1853 776127 0.24 777980 80 1845 774217 0.24 776062 81 1962 771253 0.25 773215 82 1859 766479 0.24 768338 83 1794 765391 0.23 767185 84 1874 763718 0.24 765592 85 1898 757297 0.25 759195 86 1901 756252 0.25 758153 87 1809 751708 0.24 753517 88 1897 748627 0.25 750524 89 1918 745849 0.26 747767 90 1897 741764 0.26 743661 91 1917 735439 0.26 737356 92 1987 734123 0.27 736110 93 1769 731200 0.24 732969 94 1794 727453 0.25 729247 95 1879 722896 0.26 724775 96 1922 716569 0.27 718491 97 1841 712290 0.26 714131 98 1866 710863 0.26 712729 99 1782 704882 0.25 706664 100 1800 699411 0.26 701211 101 1737 695157 0.25 696894 102 1799 690481 0.26 692280 103 1771 684803 0.26 686574 104 1692 682529 0.25 684221 105 1983 676150 0.29 678133 106 1743 670936 0.26 672679 107 1681 666613 0.25 668294 108 1595 659822 0.24 661417 109 1712 656323 0.26 658035 110 1742 651738 0.27 653480 111 1673 644267 0.26 645940 112 1623 639305 0.25 640928 113 1583 634162 0.25 635745 114 1636 627498 0.26 629134 115 1787 622942 0.29 624729 116 1727 617145 0.28 618872 117 1600 611570 0.26 613170 118 1619 605711 0.27 607330 119 1699 599959 0.28 601658 120 1518 594104 0.25 595622 121 1652 586955 0.28 588607 122 1585 580421 0.27 582006 123 1511 574022 0.26 575533 124 1535 567661 0.27 569196 125 1564 562011 0.28 563575 126 1602 554992 0.29 556594 127 1460 547935 0.27 549395 128 1540 543722 0.28 545262 129 1468 536065 0.27 537533 130 1391 529436 0.26 530827 131 1410 522736 0.27 524146 132 1433 514406 0.28 515839 133 1381 509480 0.27 510861 134 1402 503855 0.28 505257 135 1379 496640 0.28 498019 136 1538 487297 0.31 488835 137 1364 482995 0.28 484359 138 1350 476429 0.28 477779 139 1365 469685 0.29 471050 140 1519 462379 0.33 463898 141 1252 454096 0.27 455348 142 1389 446857 0.31 448246 143 1286 440372 0.29 441658 144 1239 433272 0.29 434511 145 1230 426580 0.29 427810 146 1147 418077 0.27 419224 147 1188 406730 0.29 407918 148 1099 396356 0.28 397455 149 964 367496 0.26 368460 150 639 0 100.00 639 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 6330 3099366 0.20 3105696 2 5641 3619481 0.16 3625122 3 5998 3751668 0.16 3757666 4 6685 3888621 0.17 3895306 5 6430 3723008 0.17 3729438 6 7396 3652920 0.20 3660316 7 7523 3777314 0.20 3784837 8 7025 3594615 0.20 3601640 9 7228 3701960 0.19 3709188 10 7119 3696724 0.19 3703843 11 6922 3696020 0.19 3702942 12 6851 3668088 0.19 3674939 13 6884 3658065 0.19 3664949 14 6779 3667048 0.18 3673827 15 6997 3667928 0.19 3674925 16 7516 3676205 0.20 3683721 17 6853 3676550 0.19 3683403 18 7234 3674106 0.20 3681340 19 7472 3688764 0.20 3696236 20 7854 3686568 0.21 3694422 21 7086 3699870 0.19 3706956 22 7433 3701653 0.20 3709086 23 9945 3695231 0.27 3705176 24 7382 3704269 0.20 3711651 25 7438 3707002 0.20 3714440 26 7541 3707194 0.20 3714735 27 9973 3698841 0.27 3708814 28 7675 3712684 0.21 3720359 29 7761 3710783 0.21 3718544 30 7301 3716332 0.20 3723633 31 7368 3710070 0.20 3717438 32 7146 3714980 0.19 3722126 33 7721 3713284 0.21 3721005 34 7690 3712900 0.21 3720590 35 7443 3711382 0.20 3718825 36 8158 3707020 0.22 3715178 37 7659 3703296 0.21 3710955 38 7287 3697354 0.20 3704641 39 7313 3697375 0.20 3704688 40 7186 3697397 0.19 3704583 41 7148 3692784 0.19 3699932 42 7433 3691432 0.20 3698865 43 7363 3688744 0.20 3696107 44 7260 3684216 0.20 3691476 45 7088 3679353 0.19 3686441 46 7246 3673719 0.20 3680965 47 7199 3673348 0.20 3680547 48 7200 3666226 0.20 3673426 49 7290 3665212 0.20 3672502 50 7443 3658355 0.20 3665798 51 7227 3649304 0.20 3656531 52 7117 3650659 0.19 3657776 53 7254 3647794 0.20 3655048 54 7039 3641032 0.19 3648071 55 7268 3636465 0.20 3643733 56 7156 3628870 0.20 3636026 57 7167 3619669 0.20 3626836 58 7168 3615583 0.20 3622751 59 6883 3604799 0.19 3611682 60 6980 3598900 0.19 3605880 61 7067 3592005 0.20 3599072 62 7186 3586665 0.20 3593851 63 7108 3581285 0.20 3588393 64 7227 3573349 0.20 3580576 65 7163 3563347 0.20 3570510 66 7047 3555278 0.20 3562325 67 6873 3549911 0.19 3556784 68 7100 3540783 0.20 3547883 69 7418 3529690 0.21 3537108 70 7365 3514379 0.21 3521744 71 7226 3511756 0.21 3518982 72 6747 3500615 0.19 3507362 73 7007 3490467 0.20 3497474 74 6959 3482772 0.20 3489731 75 7077 3465799 0.20 3472876 76 6899 3456410 0.20 3463309 77 6888 3447463 0.20 3454351 78 7250 3434049 0.21 3441299 79 6612 3424355 0.19 3430967 80 6933 3413817 0.20 3420750 81 6737 3396669 0.20 3403406 82 6785 3385108 0.20 3391893 83 6429 3374010 0.19 3380439 84 6742 3358490 0.20 3365232 85 6429 3343725 0.19 3350154 86 6698 3330605 0.20 3337303 87 6856 3310858 0.21 3317714 88 6597 3299163 0.20 3305760 89 6745 3278992 0.21 3285737 90 6604 3269000 0.20 3275604 91 7166 3250194 0.22 3257360 92 7063 3231874 0.22 3238937 93 6660 3220342 0.21 3227002 94 6478 3202524 0.20 3209002 95 6452 3185036 0.20 3191488 96 6770 3166909 0.21 3173679 97 6796 3144640 0.22 3151436 98 6832 3124397 0.22 3131229 99 6407 3107697 0.21 3114104 100 6229 3087922 0.20 3094151 101 6396 3068042 0.21 3074438 102 7038 3045346 0.23 3052384 103 6359 3022663 0.21 3029022 104 6348 3004342 0.21 3010690 105 7472 2976537 0.25 2984009 106 6103 2959365 0.21 2965468 107 5815 2937150 0.20 2942965 108 6130 2912706 0.21 2918836 109 6016 2894411 0.21 2900427 110 6018 2872647 0.21 2878665 111 5947 2842237 0.21 2848184 112 5817 2821507 0.21 2827324 113 5701 2797220 0.20 2802921 114 5971 2776392 0.21 2782363 115 6437 2750559 0.23 2756996 116 6129 2723963 0.22 2730092 117 5819 2698162 0.22 2703981 118 5910 2667728 0.22 2673638 119 6136 2645919 0.23 2652055 120 5693 2616317 0.22 2622010 121 5884 2591846 0.23 2597730 122 5823 2566904 0.23 2572727 123 5548 2541834 0.22 2547382 124 5508 2508273 0.22 2513781 125 5796 2483062 0.23 2488858 126 6203 2454325 0.25 2460528 127 5412 2429302 0.22 2434714 128 5475 2399515 0.23 2404990 129 5378 2372068 0.23 2377446 130 5352 2343439 0.23 2348791 131 5260 2314795 0.23 2320055 132 5187 2286528 0.23 2291715 133 5256 2254424 0.23 2259680 134 5103 2228251 0.23 2233354 135 5063 2199159 0.23 2204222 136 5819 2167849 0.27 2173668 137 4910 2140311 0.23 2145221 138 4851 2109476 0.23 2114327 139 4959 2076107 0.24 2081066 140 5794 2043995 0.28 2049789 141 4682 2020002 0.23 2024684 142 5009 1988255 0.25 1993264 143 4948 1954547 0.25 1959495 144 4737 1920055 0.25 1924792 145 4455 1890911 0.24 1895366 146 4245 1855374 0.23 1859619 147 4483 1813018 0.25 1817501 148 3941 1769204 0.22 1773145 149 3296 1650086 0.20 1653382 150 2093 0 100.00 2093