CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 89810 534288 14.39 624098 2 103801 664079 13.52 767880 3 76479 609208 11.15 685687 4 91113 702962 11.47 794075 5 100901 752841 11.82 853742 6 104609 788644 11.71 893253 7 96466 680680 12.41 777146 8 95872 688746 12.22 784618 9 95581 689103 12.18 784684 10 94530 684827 12.13 779357 11 94880 690869 12.08 785749 12 96732 688549 12.32 785281 13 96343 687287 12.29 783630 14 96931 689524 12.33 786455 15 96642 685813 12.35 782455 16 97268 694491 12.29 791759 17 97599 696307 12.29 793906 18 97611 700533 12.23 798144 19 97298 701429 12.18 798727 20 98170 700408 12.29 798578 21 97628 698156 12.27 795784 22 99095 696064 12.46 795159 23 97586 692590 12.35 790176 24 97131 691385 12.32 788516 25 97807 693612 12.36 791419 26 98201 699842 12.31 798043 27 97603 702383 12.20 799986 28 98277 701424 12.29 799701 29 98452 705904 12.24 804356 30 97879 702812 12.22 800691 31 97792 698339 12.28 796131 32 98242 699634 12.31 797876 33 97556 698645 12.25 796201 34 98293 698426 12.34 796719 35 97592 696376 12.29 793968 36 97900 700761 12.26 798661 37 98230 699446 12.31 797676 38 98032 703255 12.23 801287 39 98348 703063 12.27 801411 40 98301 705791 12.23 804092 41 98167 706004 12.21 804171 42 98938 705420 12.30 804358 43 98760 700959 12.35 799719 44 97887 698541 12.29 796428 45 97185 696822 12.24 794007 46 97712 699696 12.25 797408 47 97715 705593 12.16 803308 48 98080 703926 12.23 802006 49 97410 705049 12.14 802459 50 97193 701886 12.16 799079 51 97438 702310 12.18 799748 52 97391 700902 12.20 798293 53 97824 701632 12.24 799456 54 96945 700637 12.15 797582 55 97408 700212 12.21 797620 56 96899 700189 12.16 797088 57 97272 702014 12.17 799286 58 97520 702517 12.19 800037 59 97020 701747 12.15 798767 60 96458 700994 12.10 797452 61 96576 703010 12.08 799586 62 95913 704245 11.99 800158 63 96448 702252 12.08 798700 64 96389 700645 12.09 797034 65 96548 699231 12.13 795779 66 96113 700558 12.06 796671 67 95912 700218 12.05 796130 68 95825 700013 12.04 795838 69 95883 700895 12.03 796778 70 95649 699093 12.04 794742 71 95972 703154 12.01 799126 72 95535 703196 11.96 798731 73 95919 700169 12.05 796088 74 95395 698473 12.02 793868 75 94601 697947 11.94 792548 76 95193 697020 12.02 792213 77 95233 699547 11.98 794780 78 94516 700945 11.88 795461 79 95963 701527 12.03 797490 80 94835 698714 11.95 793549 81 94640 699177 11.92 793817 82 94224 698998 11.88 793222 83 94457 697105 11.93 791562 84 94043 697610 11.88 791653 85 94104 695751 11.91 789855 86 93151 695453 11.81 788604 87 94365 696114 11.94 790479 88 93649 693836 11.89 787485 89 93263 697966 11.79 791229 90 92885 697236 11.76 790121 91 93392 697852 11.80 791244 92 92992 697973 11.76 790965 93 93874 697234 11.87 791108 94 92795 695174 11.78 787969 95 92235 695648 11.71 787883 96 92324 694463 11.73 786787 97 92452 695439 11.73 787891 98 92346 696058 11.71 788404 99 92033 694748 11.70 786781 100 91893 694861 11.68 786754 101 91649 693821 11.67 785470 102 91409 692670 11.66 784079 103 90834 692042 11.60 782876 104 91317 694440 11.62 785757 105 90941 693122 11.60 784063 106 90791 690706 11.62 781497 107 90222 688617 11.58 778839 108 90572 688674 11.62 779246 109 89819 690712 11.51 780531 110 90574 689804 11.61 780378 111 90349 690997 11.56 781346 112 89919 689577 11.54 779496 113 90247 690513 11.56 780760 114 89692 687608 11.54 777300 115 89121 687933 11.47 777054 116 88801 685704 11.47 774505 117 89026 684651 11.51 773677 118 88984 686957 11.47 775941 119 87597 686874 11.31 774471 120 88426 685465 11.43 773891 121 88500 685816 11.43 774316 122 88176 685804 11.39 773980 123 88165 686116 11.39 774281 124 87443 685004 11.32 772447 125 87293 686862 11.28 774155 126 87551 680512 11.40 768063 127 86577 680857 11.28 767434 128 86292 677879 11.29 764171 129 86872 676695 11.38 763567 130 86250 678719 11.27 764969 131 85751 677257 11.24 763008 132 85103 677474 11.16 762577 133 85812 674159 11.29 759971 134 84549 676785 11.11 761334 135 84700 674948 11.15 759648 136 84307 674027 11.12 758334 137 84488 674181 11.14 758669 138 83512 672215 11.05 755727 139 84186 671761 11.14 755947 140 83444 670624 11.07 754068 141 82790 671473 10.98 754263 142 83325 668032 11.09 751357 143 83085 668705 11.05 751790 144 82089 666193 10.97 748282 145 81505 665558 10.91 747063 146 82525 669114 10.98 751639 147 81204 666733 10.86 747937 148 80127 662334 10.79 742461 149 78827 663079 10.62 741906 150 72332 622546 10.41 694878 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2557 1898754 0.13 1901311 2 2548 902372 0.28 904920 3 1805 897057 0.20 898862 4 2175 1087054 0.20 1089229 5 2626 1247818 0.21 1250444 6 2684 1177301 0.23 1179985 7 2372 1072738 0.22 1075110 8 2503 1102211 0.23 1104714 9 2519 1083510 0.23 1086029 10 2457 1079811 0.23 1082268 11 2429 1086239 0.22 1088668 12 2606 1082563 0.24 1085169 13 2663 1084571 0.24 1087234 14 2661 1084310 0.24 1086971 15 2741 1079345 0.25 1082086 16 2857 1091850 0.26 1094707 17 2972 1092472 0.27 1095444 18 2950 1086758 0.27 1089708 19 2841 1096215 0.26 1099056 20 2784 1088177 0.26 1090961 21 2977 1092167 0.27 1095144 22 2874 1090840 0.26 1093714 23 2984 1088785 0.27 1091769 24 3051 1087909 0.28 1090960 25 2942 1092397 0.27 1095339 26 2944 1096891 0.27 1099835 27 2941 1093059 0.27 1096000 28 3012 1103325 0.27 1106337 29 3010 1100083 0.27 1103093 30 2962 1092538 0.27 1095500 31 2955 1099543 0.27 1102498 32 3037 1099757 0.28 1102794 33 2990 1100875 0.27 1103865 34 3148 1098034 0.29 1101182 35 2960 1101813 0.27 1104773 36 3080 1098052 0.28 1101132 37 3153 1102343 0.29 1105496 38 3072 1099915 0.28 1102987 39 3013 1100282 0.27 1103295 40 3169 1101782 0.29 1104951 41 3128 1103440 0.28 1106568 42 3260 1095901 0.30 1099161 43 3093 1104519 0.28 1107612 44 3094 1100981 0.28 1104075 45 2949 1098472 0.27 1101421 46 3048 1102468 0.28 1105516 47 2945 1103248 0.27 1106193 48 3115 1101919 0.28 1105034 49 3163 1101234 0.29 1104397 50 3113 1099436 0.28 1102549 51 3102 1099688 0.28 1102790 52 3024 1100040 0.27 1103064 53 3014 1107667 0.27 1110681 54 3045 1098320 0.28 1101365 55 3004 1102241 0.27 1105245 56 2980 1101874 0.27 1104854 57 3075 1098997 0.28 1102072 58 3070 1099355 0.28 1102425 59 3120 1104702 0.28 1107822 60 3038 1099175 0.28 1102213 61 3054 1099727 0.28 1102781 62 3009 1100061 0.27 1103070 63 3064 1099837 0.28 1102901 64 3055 1103536 0.28 1106591 65 3158 1105181 0.28 1108339 66 3098 1099833 0.28 1102931 67 3108 1107253 0.28 1110361 68 3172 1101367 0.29 1104539 69 3169 1098046 0.29 1101215 70 3229 1103473 0.29 1106702 71 3056 1105251 0.28 1108307 72 3122 1100048 0.28 1103170 73 3129 1102861 0.28 1105990 74 3172 1103273 0.29 1106445 75 3133 1103575 0.28 1106708 76 3205 1104491 0.29 1107696 77 3264 1102181 0.30 1105445 78 3188 1105418 0.29 1108606 79 3140 1103758 0.28 1106898 80 3093 1104391 0.28 1107484 81 3136 1098466 0.28 1101602 82 3145 1102063 0.28 1105208 83 3216 1101840 0.29 1105056 84 3189 1098685 0.29 1101874 85 3170 1103127 0.29 1106297 86 3071 1099866 0.28 1102937 87 3075 1096381 0.28 1099456 88 3076 1097200 0.28 1100276 89 3218 1099437 0.29 1102655 90 3135 1092709 0.29 1095844 91 3222 1099640 0.29 1102862 92 3153 1099934 0.29 1103087 93 3092 1093870 0.28 1096962 94 3224 1094708 0.29 1097932 95 3167 1095709 0.29 1098876 96 3017 1089185 0.28 1092202 97 3198 1097206 0.29 1100404 98 3192 1094392 0.29 1097584 99 3193 1092667 0.29 1095860 100 3144 1093808 0.29 1096952 101 3080 1092757 0.28 1095837 102 3068 1087490 0.28 1090558 103 3060 1090533 0.28 1093593 104 3074 1087287 0.28 1090361 105 3156 1086809 0.29 1089965 106 3032 1087044 0.28 1090076 107 3078 1086034 0.28 1089112 108 3088 1080968 0.28 1084056 109 3175 1085820 0.29 1088995 110 3118 1084894 0.29 1088012 111 3072 1082237 0.28 1085309 112 3013 1082806 0.28 1085819 113 3052 1083086 0.28 1086138 114 2986 1079015 0.28 1082001 115 2985 1078992 0.28 1081977 116 2996 1075445 0.28 1078441 117 3053 1077884 0.28 1080937 118 3019 1078804 0.28 1081823 119 3046 1078914 0.28 1081960 120 2949 1072072 0.27 1075021 121 3048 1075972 0.28 1079020 122 3049 1076778 0.28 1079827 123 2941 1070984 0.27 1073925 124 3053 1072458 0.28 1075511 125 2984 1070567 0.28 1073551 126 2979 1065679 0.28 1068658 127 3054 1067201 0.29 1070255 128 2964 1062568 0.28 1065532 129 2881 1059670 0.27 1062551 130 2963 1060983 0.28 1063946 131 2991 1060316 0.28 1063307 132 3038 1052979 0.29 1056017 133 2969 1061406 0.28 1064375 134 2994 1057416 0.28 1060410 135 2957 1052379 0.28 1055336 136 2973 1055707 0.28 1058680 137 2866 1053211 0.27 1056077 138 2864 1049534 0.27 1052398 139 3020 1052353 0.29 1055373 140 2989 1047275 0.28 1050264 141 2962 1044185 0.28 1047147 142 3013 1044750 0.29 1047763 143 2958 1042749 0.28 1045707 144 3003 1037215 0.29 1040218 145 3189 1043636 0.30 1046825 146 3388 1040050 0.32 1043438 147 3523 1035955 0.34 1039478 148 3431 1031938 0.33 1035369 149 3193 1029104 0.31 1032297 150 2967 954474 0.31 957441 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 6888 4646103 0.15 4652991 2 7302 3634139 0.20 3641441 3 6866 4093872 0.17 4100738 4 7957 5135510 0.15 5143467 5 8515 5491297 0.15 5499812 6 8916 5435717 0.16 5444633 7 8219 4969360 0.17 4977579 8 8440 4951154 0.17 4959594 9 8507 4797675 0.18 4806182 10 8437 4749714 0.18 4758151 11 8570 4756416 0.18 4764986 12 8728 4736959 0.18 4745687 13 8880 4719678 0.19 4728558 14 9107 4727048 0.19 4736155 15 9139 4723576 0.19 4732715 16 9350 4756023 0.20 4765373 17 9471 4752150 0.20 4761621 18 9450 4769925 0.20 4779375 19 9631 4774159 0.20 4783790 20 9697 4764338 0.20 4774035 21 9794 4747280 0.21 4757074 22 9887 4745382 0.21 4755269 23 9736 4740009 0.20 4749745 24 9996 4744238 0.21 4754234 25 10022 4742840 0.21 4752862 26 10023 4746172 0.21 4756195 27 10291 4757560 0.22 4767851 28 10516 4779488 0.22 4790004 29 10204 4785124 0.21 4795328 30 10277 4787794 0.21 4798071 31 10466 4794769 0.22 4805235 32 10455 4768003 0.22 4778458 33 10461 4759207 0.22 4769668 34 10470 4760556 0.22 4771026 35 10149 4752827 0.21 4762976 36 10525 4753926 0.22 4764451 37 10472 4754063 0.22 4764535 38 10445 4767062 0.22 4777507 39 10566 4780815 0.22 4791381 40 10510 4781322 0.22 4791832 41 10380 4769583 0.22 4779963 42 10387 4777005 0.22 4787392 43 10504 4771376 0.22 4781880 44 10298 4763235 0.22 4773533 45 10156 4755418 0.21 4765574 46 10285 4760400 0.22 4770685 47 10682 4765013 0.22 4775695 48 10434 4769645 0.22 4780079 49 10576 4780890 0.22 4791466 50 10795 4786832 0.23 4797627 51 10619 4781257 0.22 4791876 52 10438 4795880 0.22 4806318 53 10633 4785220 0.22 4795853 54 10590 4779047 0.22 4789637 55 10391 4770976 0.22 4781367 56 10655 4770545 0.22 4781200 57 10754 4761331 0.23 4772085 58 10851 4771753 0.23 4782604 59 10583 4767344 0.22 4777927 60 10654 4773017 0.22 4783671 61 10638 4786895 0.22 4797533 62 10701 4782975 0.22 4793676 63 10757 4789662 0.22 4800419 64 10720 4790867 0.22 4801587 65 10666 4787689 0.22 4798355 66 10577 4785456 0.22 4796033 67 10533 4791138 0.22 4801671 68 10681 4789240 0.22 4799921 69 10676 4782890 0.22 4793566 70 10737 4796891 0.22 4807628 71 10709 4796845 0.22 4807554 72 10736 4787761 0.22 4798497 73 10712 4789355 0.22 4800067 74 10960 4787311 0.23 4798271 75 10641 4780674 0.22 4791315 76 10817 4787595 0.23 4798412 77 10643 4789137 0.22 4799780 78 10927 4782516 0.23 4793443 79 10945 4782766 0.23 4793711 80 10856 4783995 0.23 4794851 81 10919 4789456 0.23 4800375 82 10692 4793350 0.22 4804042 83 10780 4794312 0.22 4805092 84 10583 4792597 0.22 4803180 85 10590 4783047 0.22 4793637 86 10605 4772411 0.22 4783016 87 10519 4767843 0.22 4778362 88 10629 4768637 0.22 4779266 89 10714 4775751 0.22 4786465 90 10752 4776643 0.22 4787395 91 10660 4778763 0.22 4789423 92 10794 4781261 0.23 4792055 93 10660 4774677 0.22 4785337 94 10596 4785033 0.22 4795629 95 10617 4781770 0.22 4792387 96 10589 4769721 0.22 4780310 97 10690 4761990 0.22 4772680 98 10570 4770778 0.22 4781348 99 10780 4764965 0.23 4775745 100 10608 4773379 0.22 4783987 101 10680 4771378 0.22 4782058 102 10464 4766195 0.22 4776659 103 10527 4765141 0.22 4775668 104 10607 4764704 0.22 4775311 105 10719 4756630 0.22 4767349 106 10614 4757728 0.22 4768342 107 10526 4747000 0.22 4757526 108 10455 4731431 0.22 4741886 109 10609 4738351 0.22 4748960 110 10403 4743742 0.22 4754145 111 10502 4741470 0.22 4751972 112 10427 4745735 0.22 4756162 113 10493 4748540 0.22 4759033 114 10613 4730740 0.22 4741353 115 10686 4730589 0.23 4741275 116 10484 4733979 0.22 4744463 117 10527 4719851 0.22 4730378 118 10500 4720166 0.22 4730666 119 10494 4711353 0.22 4721847 120 10347 4701273 0.22 4711620 121 10495 4706388 0.22 4716883 122 10463 4707055 0.22 4717518 123 10575 4699999 0.22 4710574 124 10600 4698097 0.23 4708697 125 10539 4690835 0.22 4701374 126 10591 4679012 0.23 4689603 127 10687 4677778 0.23 4688465 128 10483 4670269 0.22 4680752 129 10296 4662259 0.22 4672555 130 10474 4658683 0.22 4669157 131 10530 4655411 0.23 4665941 132 10290 4645127 0.22 4655417 133 10513 4647249 0.23 4657762 134 10395 4644443 0.22 4654838 135 10406 4635670 0.22 4646076 136 10458 4635796 0.23 4646254 137 10514 4625850 0.23 4636364 138 10650 4624784 0.23 4635434 139 10561 4615814 0.23 4626375 140 10466 4600829 0.23 4611295 141 10421 4588144 0.23 4598565 142 10732 4582804 0.23 4593536 143 10740 4582435 0.23 4593175 144 10768 4580488 0.23 4591256 145 10950 4578506 0.24 4589456 146 11647 4580636 0.25 4592283 147 11716 4568021 0.26 4579737 148 11857 4567094 0.26 4578951 149 11474 4522619 0.25 4534093 150 10691 4300926 0.25 4311617 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1952 800897 0.24 802849 2 30099 748436 3.87 778535 3 49270 642170 7.13 691440 4 43926 589542 6.93 633468 5 51535 684130 7.01 735665 6 56684 736831 7.14 793515 7 60851 768041 7.34 828892 8 57240 662868 7.95 720108 9 58095 671478 7.96 729573 10 59192 668349 8.14 727541 11 59612 663647 8.24 723259 12 60669 666026 8.35 726695 13 62097 663440 8.56 725537 14 61688 659169 8.56 720857 15 62502 661428 8.63 723930 16 63599 658395 8.81 721994 17 64126 662691 8.82 726817 18 63791 664266 8.76 728057 19 64938 665173 8.89 730111 20 64595 663849 8.87 728444 21 65968 661602 9.07 727570 22 65575 656326 9.08 721901 23 66653 655765 9.23 722418 24 66446 651051 9.26 717497 25 66416 647762 9.30 714178 26 66956 649915 9.34 716871 27 66538 650745 9.28 717283 28 67490 650945 9.39 718435 29 67285 649050 9.39 716335 30 67541 651447 9.39 718988 31 67728 644453 9.51 712181 32 68225 641235 9.62 709460 33 67892 640214 9.59 708106 34 68029 637795 9.64 705824 35 68214 633997 9.71 702211 36 68076 632994 9.71 701070 37 68039 634012 9.69 702051 38 68617 633311 9.78 701928 39 68444 631828 9.77 700272 40 68703 630976 9.82 699679 41 69138 630051 9.89 699189 42 69159 628430 9.91 697589 43 68908 626498 9.91 695406 44 69121 621584 10.01 690705 45 68592 618338 9.99 686930 46 69015 615050 10.09 684065 47 68716 616064 10.03 684780 48 69294 616266 10.11 685560 49 69353 614304 10.14 683657 50 69003 614701 10.09 683704 51 68713 611010 10.11 679723 52 68531 606385 10.15 674916 53 68787 606669 10.18 675456 54 69629 604432 10.33 674061 55 69135 601312 10.31 670447 56 69038 599639 10.32 668677 57 69059 597131 10.37 666190 58 69041 596508 10.37 665549 59 68486 595862 10.31 664348 60 68672 593648 10.37 662320 61 68439 591666 10.37 660105 62 68746 591420 10.41 660166 63 68098 588320 10.37 656418 64 68608 586498 10.47 655106 65 68259 584152 10.46 652411 66 68069 580022 10.50 648091 67 68399 579869 10.55 648268 68 68442 577975 10.59 646417 69 68178 575479 10.59 643657 70 67621 574201 10.54 641822 71 67966 571889 10.62 639855 72 67252 571812 10.52 639064 73 67563 569821 10.60 637384 74 66943 565518 10.58 632461 75 67295 561588 10.70 628883 76 67364 559887 10.74 627251 77 67169 558359 10.74 625528 78 66771 557115 10.70 623886 79 67217 557252 10.76 624469 80 67023 556381 10.75 623404 81 66421 551262 10.75 617683 82 66604 551181 10.78 617785 83 66646 550511 10.80 617157 84 65913 545208 10.79 611121 85 65894 543088 10.82 608982 86 65877 542169 10.83 608046 87 65849 540377 10.86 606226 88 66046 537094 10.95 603140 89 65497 535550 10.90 601047 90 65230 534855 10.87 600085 91 65433 532053 10.95 597486 92 65095 531477 10.91 596572 93 64816 530069 10.90 594885 94 65007 525562 11.01 590569 95 64540 523707 10.97 588247 96 63881 521171 10.92 585052 97 64138 518066 11.02 582204 98 63951 517379 11.00 581330 99 63384 515121 10.96 578505 100 63404 514899 10.96 578303 101 62995 512293 10.95 575288 102 63138 508711 11.04 571849 103 62582 506294 11.00 568876 104 62379 504777 11.00 567156 105 62288 502135 11.04 564423 106 62660 500508 11.13 563168 107 62047 496754 11.10 558801 108 61305 494514 11.03 555819 109 61311 492432 11.07 553743 110 61418 491126 11.12 552544 111 61538 490085 11.16 551623 112 60806 486780 11.10 547586 113 60485 484251 11.10 544736 114 60751 483735 11.16 544486 115 60362 480408 11.16 540770 116 60240 478590 11.18 538830 117 59286 473700 11.12 532986 118 59323 472508 11.15 531831 119 59066 470088 11.16 529154 120 58921 469300 11.15 528221 121 58582 466587 11.15 525169 122 58247 465566 11.12 523813 123 58214 464280 11.14 522494 124 57795 461000 11.14 518795 125 57816 458309 11.20 516125 126 57439 454875 11.21 512314 127 57395 449990 11.31 507385 128 56957 448926 11.26 505883 129 56220 445475 11.21 501695 130 56325 443948 11.26 500273 131 56387 442442 11.30 498829 132 55655 439560 11.24 495215 133 55845 436629 11.34 492474 134 54898 433155 11.25 488053 135 54685 432456 11.23 487141 136 54628 428561 11.31 483189 137 53546 426951 11.14 480497 138 54280 424995 11.33 479275 139 53975 421829 11.34 475804 140 53249 419870 11.25 473119 141 52835 416652 11.25 469487 142 52271 413918 11.21 466189 143 51905 411350 11.20 463255 144 52018 407997 11.31 460015 145 51858 406157 11.32 458015 146 51608 402587 11.36 454195 147 51017 400538 11.30 451555 148 50489 392246 11.40 442735 149 49402 357879 12.13 407281 150 43673 0 100.00 43673 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1233 1199308 0.10 1200541 2 1379 833042 0.17 834421 3 4863 2009712 0.24 2014575 4 4684 882619 0.53 887303 5 1717 847033 0.20 848750 6 2015 998517 0.20 1000532 7 2326 1137672 0.20 1139998 8 2320 1085836 0.21 1088156 9 2165 983313 0.22 985478 10 2160 1007807 0.21 1009967 11 2065 992776 0.21 994841 12 2080 988679 0.21 990759 13 2133 992562 0.21 994695 14 2130 990007 0.21 992137 15 2041 992401 0.21 994442 16 2021 988979 0.20 991000 17 2189 985154 0.22 987343 18 2164 996883 0.22 999047 19 2163 994711 0.22 996874 20 2195 987497 0.22 989692 21 2168 991144 0.22 993312 22 2157 982414 0.22 984571 23 2223 984389 0.23 986612 24 2262 983797 0.23 986059 25 2304 981524 0.23 983828 26 2208 976849 0.23 979057 27 2303 979341 0.23 981644 28 2177 979044 0.22 981221 29 2345 975770 0.24 978115 30 2279 982054 0.23 984333 31 2257 977046 0.23 979303 32 2256 966274 0.23 968530 33 2329 970501 0.24 972830 34 2278 968051 0.23 970329 35 2286 966539 0.24 968825 36 2331 966203 0.24 968534 37 2326 959950 0.24 962276 38 2365 958643 0.25 961008 39 2219 960559 0.23 962778 40 2459 954621 0.26 957080 41 2291 953120 0.24 955411 42 2275 953648 0.24 955923 43 2356 950535 0.25 952891 44 2373 943946 0.25 946319 45 2419 947684 0.25 950103 46 2259 943536 0.24 945795 47 2355 935432 0.25 937787 48 2303 940584 0.24 942887 49 2298 937835 0.24 940133 50 2338 933350 0.25 935688 51 2248 934236 0.24 936484 52 2325 927871 0.25 930196 53 2287 924862 0.25 927149 54 2298 927276 0.25 929574 55 2307 926004 0.25 928311 56 2399 919633 0.26 922032 57 2269 920495 0.25 922764 58 2311 916046 0.25 918357 59 2253 911514 0.25 913767 60 2256 907982 0.25 910238 61 2252 910855 0.25 913107 62 2223 902854 0.25 905077 63 2180 902594 0.24 904774 64 2203 900229 0.24 902432 65 2397 893885 0.27 896282 66 2328 896778 0.26 899106 67 2241 896382 0.25 898623 68 2250 888304 0.25 890554 69 2354 890118 0.26 892472 70 2325 884850 0.26 887175 71 2153 880339 0.24 882492 72 2249 881038 0.25 883287 73 2267 878616 0.26 880883 74 2288 874771 0.26 877059 75 2291 871343 0.26 873634 76 2310 870692 0.26 873002 77 2282 867426 0.26 869708 78 2188 863154 0.25 865342 79 2272 860994 0.26 863266 80 2168 859426 0.25 861594 81 2300 856796 0.27 859096 82 2118 851043 0.25 853161 83 2323 847849 0.27 850172 84 2238 845285 0.26 847523 85 2204 843800 0.26 846004 86 2177 837122 0.26 839299 87 2198 839006 0.26 841204 88 2168 835712 0.26 837880 89 2198 830108 0.26 832306 90 2163 827418 0.26 829581 91 2151 825482 0.26 827633 92 2135 820179 0.26 822314 93 2146 820486 0.26 822632 94 2031 817160 0.25 819191 95 2189 811473 0.27 813662 96 2129 809432 0.26 811561 97 2155 806874 0.27 809029 98 2041 798710 0.25 800751 99 2058 802403 0.26 804461 100 2117 796099 0.27 798216 101 2153 792008 0.27 794161 102 2058 792773 0.26 794831 103 2080 785624 0.26 787704 104 1981 779533 0.25 781514 105 1985 781133 0.25 783118 106 1977 774160 0.25 776137 107 1951 770903 0.25 772854 108 1976 770238 0.26 772214 109 2049 766335 0.27 768384 110 2099 761205 0.27 763304 111 2035 760195 0.27 762230 112 2048 756910 0.27 758958 113 2087 750885 0.28 752972 114 1964 748844 0.26 750808 115 2033 746185 0.27 748218 116 1978 741698 0.27 743676 117 1908 739257 0.26 741165 118 1929 733689 0.26 735618 119 1920 728912 0.26 730832 120 1984 729558 0.27 731542 121 1881 725707 0.26 727588 122 2000 721256 0.28 723256 123 1986 717851 0.28 719837 124 1868 712307 0.26 714175 125 1962 707298 0.28 709260 126 1897 705957 0.27 707854 127 2010 700073 0.29 702083 128 1836 695274 0.26 697110 129 1915 693174 0.28 695089 130 1840 688515 0.27 690355 131 1927 683525 0.28 685452 132 1904 680536 0.28 682440 133 1880 676407 0.28 678287 134 1877 671289 0.28 673166 135 1906 668754 0.28 670660 136 1866 665302 0.28 667168 137 1865 658108 0.28 659973 138 1888 658773 0.29 660661 139 1779 654260 0.27 656039 140 1851 648324 0.28 650175 141 1849 645016 0.29 646865 142 1906 640266 0.30 642172 143 1798 637304 0.28 639102 144 1773 632136 0.28 633909 145 1824 626094 0.29 627918 146 1761 622524 0.28 624285 147 1760 616539 0.28 618299 148 1868 609342 0.31 611210 149 1741 562678 0.31 564419 150 1264 0 100.00 1264 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 5319 5459432 0.10 5464751 2 6645 4364283 0.15 4370928 3 8308 5332203 0.16 5340511 4 8403 5201865 0.16 5210268 5 7093 4545021 0.16 4552114 6 6621 4193547 0.16 4200168 7 7200 4440414 0.16 4447614 8 7013 4349432 0.16 4356445 9 7118 4308957 0.16 4316075 10 7193 4328005 0.17 4335198 11 7536 4341599 0.17 4349135 12 7444 4353891 0.17 4361335 13 7535 4341522 0.17 4349057 14 7446 4334535 0.17 4341981 15 7627 4332976 0.18 4340603 16 7633 4332372 0.18 4340005 17 8082 4349216 0.19 4357298 18 7861 4335694 0.18 4343555 19 8117 4336699 0.19 4344816 20 8083 4320244 0.19 4328327 21 8015 4312180 0.19 4320195 22 8112 4280389 0.19 4288501 23 8113 4269495 0.19 4277608 24 8177 4258457 0.19 4266634 25 8135 4256057 0.19 4264192 26 8549 4252324 0.20 4260873 27 8440 4260222 0.20 4268662 28 8242 4258722 0.19 4266964 29 8474 4245752 0.20 4254226 30 8412 4234496 0.20 4242908 31 8368 4226854 0.20 4235222 32 8479 4200695 0.20 4209174 33 8386 4187165 0.20 4195551 34 8376 4168460 0.20 4176836 35 8585 4172768 0.21 4181353 36 8375 4167949 0.20 4176324 37 8531 4171679 0.20 4180210 38 8431 4168263 0.20 4176694 39 8415 4162781 0.20 4171196 40 8264 4157739 0.20 4166003 41 8666 4139861 0.21 4148527 42 8491 4127535 0.21 4136026 43 8463 4114725 0.21 4123188 44 8348 4098756 0.20 4107104 45 8445 4090860 0.21 4099305 46 8531 4084977 0.21 4093508 47 8689 4081513 0.21 4090202 48 8584 4086098 0.21 4094682 49 8519 4073200 0.21 4081719 50 8614 4064049 0.21 4072663 51 8455 4046072 0.21 4054527 52 8453 4035433 0.21 4043886 53 8708 4027275 0.22 4035983 54 8477 4009763 0.21 4018240 55 8529 3997891 0.21 4006420 56 8588 3990776 0.21 3999364 57 8494 3980403 0.21 3988897 58 8604 3980588 0.22 3989192 59 8605 3972463 0.22 3981068 60 8594 3955862 0.22 3964456 61 8482 3953326 0.21 3961808 62 8645 3936367 0.22 3945012 63 8496 3919716 0.22 3928212 64 8326 3910785 0.21 3919111 65 8286 3891419 0.21 3899705 66 8433 3882602 0.22 3891035 67 8530 3885030 0.22 3893560 68 8448 3869537 0.22 3877985 69 8399 3853913 0.22 3862312 70 8231 3847364 0.21 3855595 71 8373 3838617 0.22 3846990 72 8398 3827786 0.22 3836184 73 8387 3816157 0.22 3824544 74 8223 3798643 0.22 3806866 75 8074 3791046 0.21 3799120 76 8376 3777137 0.22 3785513 77 8222 3768371 0.22 3776593 78 8397 3761942 0.22 3770339 79 8240 3754865 0.22 3763105 80 8098 3742439 0.22 3750537 81 8093 3730279 0.22 3738372 82 8095 3716372 0.22 3724467 83 7867 3695030 0.21 3702897 84 8015 3677347 0.22 3685362 85 7808 3675875 0.21 3683683 86 7959 3662969 0.22 3670928 87 7849 3656063 0.21 3663912 88 7842 3644995 0.21 3652837 89 7885 3639555 0.22 3647440 90 7770 3626490 0.21 3634260 91 7714 3611638 0.21 3619352 92 7647 3593527 0.21 3601174 93 7562 3584285 0.21 3591847 94 7720 3571716 0.22 3579436 95 7644 3545515 0.22 3553159 96 7645 3532146 0.22 3539791 97 7642 3520577 0.22 3528219 98 7635 3511184 0.22 3518819 99 7407 3505193 0.21 3512600 100 7320 3494129 0.21 3501449 101 7451 3476536 0.21 3483987 102 7468 3465238 0.22 3472706 103 7303 3446970 0.21 3454273 104 7427 3433651 0.22 3441078 105 7377 3419574 0.22 3426951 106 7266 3398446 0.21 3405712 107 7300 3385597 0.22 3392897 108 7395 3374249 0.22 3381644 109 7296 3361076 0.22 3368372 110 7195 3348761 0.21 3355956 111 7054 3340360 0.21 3347414 112 7183 3324908 0.22 3332091 113 7158 3305938 0.22 3313096 114 6999 3291959 0.21 3298958 115 7173 3274483 0.22 3281656 116 7078 3255557 0.22 3262635 117 6877 3241432 0.21 3248309 118 6983 3222468 0.22 3229451 119 6876 3207503 0.21 3214379 120 6897 3194555 0.22 3201452 121 6917 3186433 0.22 3193350 122 6866 3170424 0.22 3177290 123 6897 3158103 0.22 3165000 124 6859 3137766 0.22 3144625 125 6913 3117784 0.22 3124697 126 6853 3100656 0.22 3107509 127 6822 3079168 0.22 3085990 128 6792 3062338 0.22 3069130 129 6734 3053819 0.22 3060553 130 6815 3036214 0.22 3043029 131 6832 3017938 0.23 3024770 132 6542 3007406 0.22 3013948 133 6707 2991832 0.22 2998539 134 6718 2975605 0.23 2982323 135 6630 2955309 0.22 2961939 136 6756 2936544 0.23 2943300 137 6953 2914006 0.24 2920959 138 6583 2898053 0.23 2904636 139 6473 2883027 0.22 2889500 140 6620 2869695 0.23 2876315 141 6584 2852779 0.23 2859363 142 6597 2832768 0.23 2839365 143 6665 2818816 0.24 2825481 144 6640 2798056 0.24 2804696 145 6704 2779870 0.24 2786574 146 6743 2757774 0.24 2764517 147 6830 2726591 0.25 2733421 148 6825 2693956 0.25 2700781 149 6408 2498030 0.26 2504438 150 4703 0 100.00 4703