CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 131549 793743 14.22 925292 2 162578 1034691 13.58 1197269 3 133563 973861 12.06 1107424 4 138015 1028813 11.83 1166828 5 157182 1157789 11.95 1314971 6 163596 1171947 12.25 1335543 7 152530 1039505 12.80 1192035 8 151997 1058514 12.56 1210511 9 150360 1051652 12.51 1202012 10 147560 1045133 12.37 1192693 11 149241 1052771 12.42 1202012 12 152250 1046551 12.70 1198801 13 150830 1052733 12.53 1203563 14 153564 1061701 12.64 1215265 15 153191 1054958 12.68 1208149 16 152872 1061697 12.59 1214569 17 153642 1068307 12.57 1221949 18 154477 1072071 12.59 1226548 19 153948 1075045 12.53 1228993 20 155423 1074983 12.63 1230406 21 155345 1074512 12.63 1229857 22 155655 1072445 12.67 1228100 23 154181 1072340 12.57 1226521 24 156357 1070674 12.74 1227031 25 154580 1071638 12.61 1226218 26 154881 1079708 12.55 1234589 27 155503 1082825 12.56 1238328 28 154435 1078844 12.52 1233279 29 156002 1084975 12.57 1240977 30 155927 1083458 12.58 1239385 31 155217 1082429 12.54 1237646 32 155510 1083498 12.55 1239008 33 154971 1080087 12.55 1235058 34 155677 1078679 12.61 1234356 35 155259 1079768 12.57 1235027 36 156677 1083598 12.63 1240275 37 155057 1085617 12.50 1240674 38 155675 1089359 12.50 1245034 39 156378 1090226 12.54 1246604 40 156178 1084673 12.59 1240851 41 156396 1088267 12.57 1244663 42 156797 1091432 12.56 1248229 43 155445 1083133 12.55 1238578 44 155179 1084746 12.52 1239925 45 156587 1084329 12.62 1240916 46 156002 1083624 12.58 1239626 47 155630 1090059 12.49 1245689 48 156410 1090245 12.55 1246655 49 154758 1088133 12.45 1242891 50 155418 1086560 12.51 1241978 51 155970 1087694 12.54 1243664 52 155544 1087217 12.52 1242761 53 156130 1088065 12.55 1244195 54 156422 1086465 12.59 1242887 55 154965 1085726 12.49 1240691 56 155235 1086396 12.50 1241631 57 155625 1087217 12.52 1242842 58 156081 1087692 12.55 1243773 59 154348 1085977 12.44 1240325 60 155719 1088031 12.52 1243750 61 155365 1086066 12.51 1241431 62 154879 1089211 12.45 1244090 63 155341 1091134 12.46 1246475 64 154756 1085782 12.47 1240538 65 154108 1085164 12.44 1239272 66 154311 1087775 12.42 1242086 67 155593 1086589 12.53 1242182 68 154715 1086836 12.46 1241551 69 154788 1087068 12.46 1241856 70 155650 1085723 12.54 1241373 71 154712 1088972 12.44 1243684 72 154792 1089185 12.44 1243977 73 153646 1084928 12.41 1238574 74 153723 1083642 12.42 1237365 75 154772 1085437 12.48 1240209 76 153670 1083227 12.42 1236897 77 153378 1085280 12.38 1238658 78 154542 1087632 12.44 1242174 79 153853 1085090 12.42 1238943 80 154448 1084061 12.47 1238509 81 153574 1085740 12.39 1239314 82 154127 1084883 12.44 1239010 83 153341 1084304 12.39 1237645 84 154087 1086188 12.42 1240275 85 152536 1083668 12.34 1236204 86 152659 1086265 12.32 1238924 87 153374 1085307 12.38 1238681 88 153012 1080978 12.40 1233990 89 152580 1084226 12.34 1236806 90 152972 1084737 12.36 1237709 91 152213 1084086 12.31 1236299 92 151823 1083726 12.29 1235549 93 153090 1085637 12.36 1238727 94 151909 1082910 12.30 1234819 95 152073 1083183 12.31 1235256 96 151418 1082884 12.27 1234302 97 151951 1080768 12.33 1232719 98 151264 1081400 12.27 1232664 99 152074 1082441 12.32 1234515 100 150360 1079627 12.22 1229987 101 150322 1080046 12.22 1230368 102 149935 1077621 12.21 1227556 103 150264 1077589 12.24 1227853 104 149943 1078549 12.21 1228492 105 150204 1080200 12.21 1230404 106 149550 1077880 12.18 1227430 107 149762 1077294 12.20 1227056 108 148690 1076156 12.14 1224846 109 149316 1074523 12.20 1223839 110 148842 1077698 12.14 1226540 111 148690 1077284 12.13 1225974 112 148512 1073983 12.15 1222495 113 148098 1077250 12.09 1225348 114 148846 1077410 12.14 1226256 115 147779 1074583 12.09 1222362 116 148267 1074506 12.13 1222773 117 147265 1074064 12.06 1221329 118 146540 1070246 12.04 1216786 119 147040 1073833 12.04 1220873 120 146673 1075482 12.00 1222155 121 145546 1071534 11.96 1217080 122 146009 1074073 11.97 1220082 123 146059 1073075 11.98 1219134 124 145811 1070020 11.99 1215831 125 145215 1070656 11.94 1215871 126 145020 1070447 11.93 1215467 127 144566 1067038 11.93 1211604 128 145376 1067479 11.99 1212855 129 144500 1065633 11.94 1210133 130 143965 1062639 11.93 1206604 131 143146 1066067 11.84 1209213 132 143643 1065385 11.88 1209028 133 143326 1061637 11.89 1204963 134 143014 1064498 11.84 1207512 135 143305 1063263 11.88 1206568 136 140881 1058280 11.75 1199161 137 141257 1060211 11.76 1201468 138 141009 1058297 11.76 1199306 139 141340 1057993 11.78 1199333 140 140608 1056975 11.74 1197583 141 140632 1055912 11.75 1196544 142 139578 1055028 11.68 1194606 143 139247 1054483 11.66 1193730 144 138313 1054697 11.59 1193010 145 138347 1052051 11.62 1190398 146 139098 1054728 11.65 1193826 147 138463 1051833 11.63 1190296 148 136292 1048799 11.50 1185091 149 133406 1044041 11.33 1177447 150 117352 966825 10.82 1084177 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3884 2913832 0.13 2917716 2 4122 1527244 0.27 1531366 3 3123 1461614 0.21 1464737 4 3225 1655110 0.19 1658335 5 4042 1886980 0.21 1891022 6 3900 1802881 0.22 1806781 7 3855 1688153 0.23 1692008 8 4038 1682182 0.24 1686220 9 4046 1681872 0.24 1685918 10 3906 1661977 0.23 1665883 11 3986 1669381 0.24 1673367 12 3979 1670191 0.24 1674170 13 4263 1687340 0.25 1691603 14 4316 1680024 0.26 1684340 15 4305 1671445 0.26 1675750 16 4470 1687868 0.26 1692338 17 4550 1690076 0.27 1694626 18 4638 1686912 0.27 1691550 19 4589 1702458 0.27 1707047 20 4592 1692441 0.27 1697033 21 4547 1695930 0.27 1700477 22 4698 1703368 0.28 1708066 23 4639 1699149 0.27 1703788 24 4737 1697037 0.28 1701774 25 4573 1702391 0.27 1706964 26 4791 1703231 0.28 1708022 27 4738 1707668 0.28 1712406 28 4806 1721355 0.28 1726161 29 4857 1711632 0.28 1716489 30 4689 1709011 0.27 1713700 31 4762 1714017 0.28 1718779 32 4787 1712825 0.28 1717612 33 4605 1717062 0.27 1721667 34 4907 1714292 0.29 1719199 35 4889 1714260 0.28 1719149 36 4764 1717031 0.28 1721795 37 4922 1722375 0.28 1727297 38 4773 1719942 0.28 1724715 39 4745 1721161 0.27 1725906 40 4888 1723584 0.28 1728472 41 4878 1723388 0.28 1728266 42 5002 1717305 0.29 1722307 43 4752 1726729 0.27 1731481 44 4851 1719324 0.28 1724175 45 4760 1717654 0.28 1722414 46 4843 1722945 0.28 1727788 47 4869 1724727 0.28 1729596 48 4825 1720414 0.28 1725239 49 4765 1723974 0.28 1728739 50 4906 1722761 0.28 1727667 51 4992 1722479 0.29 1727471 52 4849 1724018 0.28 1728867 53 4969 1727109 0.29 1732078 54 4910 1720441 0.28 1725351 55 4851 1725776 0.28 1730627 56 4962 1724516 0.29 1729478 57 4963 1722683 0.29 1727646 58 4829 1721600 0.28 1726429 59 4895 1727429 0.28 1732324 60 5016 1721204 0.29 1726220 61 4866 1726028 0.28 1730894 62 4820 1722984 0.28 1727804 63 5004 1722773 0.29 1727777 64 4963 1726221 0.29 1731184 65 4973 1725968 0.29 1730941 66 4985 1721342 0.29 1726327 67 4933 1725921 0.29 1730854 68 5031 1722193 0.29 1727224 69 5045 1720306 0.29 1725351 70 5004 1727259 0.29 1732263 71 5018 1725724 0.29 1730742 72 4904 1725047 0.28 1729951 73 5049 1723431 0.29 1728480 74 5081 1726891 0.29 1731972 75 4917 1725932 0.28 1730849 76 5151 1728726 0.30 1733877 77 5124 1725036 0.30 1730160 78 4906 1728122 0.28 1733028 79 5063 1726600 0.29 1731663 80 4899 1725628 0.28 1730527 81 5046 1722031 0.29 1727077 82 4956 1724253 0.29 1729209 83 5078 1727494 0.29 1732572 84 5133 1720689 0.30 1725822 85 5008 1727569 0.29 1732577 86 4942 1723595 0.29 1728537 87 5074 1721131 0.29 1726205 88 4955 1722386 0.29 1727341 89 5063 1720874 0.29 1725937 90 5066 1720121 0.29 1725187 91 5049 1724955 0.29 1730004 92 5125 1722267 0.30 1727392 93 4971 1719883 0.29 1724854 94 5088 1718967 0.30 1724055 95 5061 1720816 0.29 1725877 96 4989 1717157 0.29 1722146 97 5167 1719651 0.30 1724818 98 5217 1720211 0.30 1725428 99 4898 1712028 0.29 1716926 100 5217 1717937 0.30 1723154 101 5080 1715096 0.30 1720176 102 5022 1710244 0.29 1715266 103 5061 1717496 0.29 1722557 104 4908 1710627 0.29 1715535 105 5190 1713425 0.30 1718615 106 4995 1714670 0.29 1719665 107 4917 1713024 0.29 1717941 108 4998 1708996 0.29 1713994 109 5046 1713129 0.29 1718175 110 5037 1713267 0.29 1718304 111 5018 1707711 0.29 1712729 112 5051 1711793 0.29 1716844 113 4828 1706491 0.28 1711319 114 5046 1705085 0.30 1710131 115 4858 1705686 0.28 1710544 116 4922 1703475 0.29 1708397 117 4951 1704518 0.29 1709469 118 4961 1705781 0.29 1710742 119 4883 1707106 0.29 1711989 120 4865 1702116 0.29 1706981 121 5014 1700784 0.29 1705798 122 4864 1702491 0.28 1707355 123 4962 1696146 0.29 1701108 124 5094 1695547 0.30 1700641 125 4967 1695506 0.29 1700473 126 4767 1689339 0.28 1694106 127 4788 1692768 0.28 1697556 128 4813 1690569 0.28 1695382 129 4873 1686546 0.29 1691419 130 4978 1686804 0.29 1691782 131 4919 1683900 0.29 1688819 132 4820 1684306 0.29 1689126 133 4846 1682407 0.29 1687253 134 4957 1682062 0.29 1687019 135 4968 1680698 0.29 1685666 136 4952 1680322 0.29 1685274 137 4924 1676700 0.29 1681624 138 4853 1670438 0.29 1675291 139 4995 1678460 0.30 1683455 140 4837 1672357 0.29 1677194 141 4996 1666837 0.30 1671833 142 5001 1664904 0.30 1669905 143 5026 1662511 0.30 1667537 144 5141 1660316 0.31 1665457 145 5157 1668003 0.31 1673160 146 5533 1662954 0.33 1668487 147 5574 1660489 0.33 1666063 148 5677 1653774 0.34 1659451 149 5316 1644792 0.32 1650108 150 4698 1494302 0.31 1499000 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 10775 7161349 0.15 7172124 2 11786 5804559 0.20 5816345 3 11307 6243229 0.18 6254536 4 12026 7344690 0.16 7356716 5 13481 8201669 0.16 8215150 6 13670 8222571 0.17 8236241 7 13215 7560916 0.17 7574131 8 13300 7504008 0.18 7517308 9 13198 7387706 0.18 7400904 10 13310 7287733 0.18 7301043 11 13664 7327129 0.19 7340793 12 13781 7307076 0.19 7320857 13 13977 7299311 0.19 7313288 14 14635 7316612 0.20 7331247 15 14692 7312310 0.20 7327002 16 14852 7354883 0.20 7369735 17 14927 7366804 0.20 7381731 18 14890 7399032 0.20 7413922 19 15217 7395447 0.21 7410664 20 15309 7381676 0.21 7396985 21 15362 7376298 0.21 7391660 22 15372 7371822 0.21 7387194 23 15568 7365220 0.21 7380788 24 15714 7378743 0.21 7394457 25 15801 7379895 0.21 7395696 26 15836 7391375 0.21 7407211 27 16119 7409972 0.22 7426091 28 16369 7429016 0.22 7445385 29 16222 7424944 0.22 7441166 30 16080 7436511 0.22 7452591 31 16045 7435561 0.22 7451606 32 16371 7424059 0.22 7440430 33 16428 7422290 0.22 7438718 34 16604 7415993 0.22 7432597 35 16501 7417173 0.22 7433674 36 16508 7426501 0.22 7443009 37 16805 7420045 0.23 7436850 38 16727 7436383 0.22 7453110 39 16581 7451288 0.22 7467869 40 16908 7436747 0.23 7453655 41 16536 7441307 0.22 7457843 42 16879 7444363 0.23 7461242 43 16601 7432987 0.22 7449588 44 16468 7432642 0.22 7449110 45 16349 7431503 0.22 7447852 46 16423 7434314 0.22 7450737 47 16569 7445864 0.22 7462433 48 16921 7446353 0.23 7463274 49 16801 7452471 0.22 7469272 50 17000 7459990 0.23 7476990 51 16702 7457133 0.22 7473835 52 16732 7456551 0.22 7473283 53 16852 7458974 0.23 7475826 54 16939 7461849 0.23 7478788 55 16824 7446142 0.23 7462966 56 16996 7456061 0.23 7473057 57 16714 7447609 0.22 7464323 58 17043 7451637 0.23 7468680 59 17006 7442064 0.23 7459070 60 17191 7462429 0.23 7479620 61 16979 7459150 0.23 7476129 62 17159 7462975 0.23 7480134 63 17278 7471532 0.23 7488810 64 17192 7470505 0.23 7487697 65 17085 7471842 0.23 7488927 66 17396 7474721 0.23 7492117 67 17235 7468538 0.23 7485773 68 17479 7474919 0.23 7492398 69 17112 7467430 0.23 7484542 70 17222 7487729 0.23 7504951 71 17332 7478192 0.23 7495524 72 17204 7476164 0.23 7493368 73 17029 7474638 0.23 7491667 74 17395 7478288 0.23 7495683 75 17264 7471653 0.23 7488917 76 17132 7480847 0.23 7497979 77 17359 7475579 0.23 7492938 78 17389 7481017 0.23 7498406 79 17577 7468641 0.23 7486218 80 17296 7469657 0.23 7486953 81 17321 7482212 0.23 7499533 82 17366 7484775 0.23 7502141 83 17267 7480315 0.23 7497582 84 17201 7478112 0.23 7495313 85 17229 7475830 0.23 7493059 86 17100 7470231 0.23 7487331 87 17155 7461535 0.23 7478690 88 17254 7465823 0.23 7483077 89 17220 7472307 0.23 7489527 90 17193 7480254 0.23 7497447 91 17601 7474723 0.23 7492324 92 17144 7471553 0.23 7488697 93 17344 7475452 0.23 7492796 94 17469 7483699 0.23 7501168 95 17482 7484966 0.23 7502448 96 17285 7477411 0.23 7494696 97 17268 7466364 0.23 7483632 98 17469 7462283 0.23 7479752 99 17527 7466850 0.23 7484377 100 17387 7474939 0.23 7492326 101 17347 7479277 0.23 7496624 102 17115 7472460 0.23 7489575 103 17281 7471242 0.23 7488523 104 17411 7475074 0.23 7492485 105 17218 7463522 0.23 7480740 106 17287 7466902 0.23 7484189 107 17238 7457605 0.23 7474843 108 17354 7446517 0.23 7463871 109 17236 7448720 0.23 7465956 110 17421 7450080 0.23 7467501 111 17259 7455375 0.23 7472634 112 17147 7447952 0.23 7465099 113 17185 7453898 0.23 7471083 114 17329 7444642 0.23 7461971 115 17300 7447956 0.23 7465256 116 17603 7446153 0.24 7463756 117 17423 7441557 0.23 7458980 118 17321 7442148 0.23 7459469 119 17367 7422667 0.23 7440034 120 17476 7409884 0.24 7427360 121 17349 7415126 0.23 7432475 122 17417 7414228 0.23 7431645 123 17394 7416123 0.23 7433517 124 17265 7412848 0.23 7430113 125 17498 7404915 0.24 7422413 126 17209 7398413 0.23 7415622 127 17116 7389905 0.23 7407021 128 17485 7380724 0.24 7398209 129 17371 7378574 0.23 7395945 130 17223 7375924 0.23 7393147 131 17125 7371270 0.23 7388395 132 17073 7362698 0.23 7379771 133 17140 7355573 0.23 7372713 134 17284 7357129 0.23 7374413 135 17434 7351928 0.24 7369362 136 17384 7333370 0.24 7350754 137 17367 7325295 0.24 7342662 138 17470 7331119 0.24 7348589 139 17274 7323362 0.24 7340636 140 17504 7318594 0.24 7336098 141 17386 7301224 0.24 7318610 142 17452 7295048 0.24 7312500 143 17727 7285289 0.24 7303016 144 17894 7284539 0.25 7302433 145 18296 7288695 0.25 7306991 146 18978 7291382 0.26 7310360 147 19110 7284998 0.26 7304108 148 19016 7257381 0.26 7276397 149 18476 7184802 0.26 7203278 150 16643 6729888 0.25 6746531 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3959 1452550 0.27 1456509 2 47177 1131195 4.00 1178372 3 89006 1031917 7.94 1120923 4 88540 961083 8.44 1049623 5 93238 1018311 8.39 1111549 6 103580 1153477 8.24 1257057 7 110950 1166276 8.69 1277226 8 103633 1034997 9.10 1138630 9 107025 1050203 9.25 1157228 10 109476 1037755 9.54 1147231 11 109405 1025971 9.64 1135376 12 110571 1029824 9.70 1140395 13 112417 1026525 9.87 1138942 14 114588 1031337 10.00 1145925 15 115620 1037435 10.03 1153055 16 115734 1030970 10.09 1146704 17 116984 1038115 10.13 1155099 18 116660 1038759 10.10 1155419 19 118757 1042454 10.23 1161211 20 119139 1040601 10.27 1159740 21 120353 1037629 10.39 1157982 22 120101 1033678 10.41 1153779 23 121128 1035967 10.47 1157095 24 121353 1029410 10.55 1150763 25 121611 1030795 10.55 1152406 26 121546 1032327 10.53 1153873 27 122634 1035728 10.59 1158362 28 122126 1034094 10.56 1156220 29 121879 1029335 10.59 1151214 30 122934 1034997 10.62 1157931 31 122607 1026596 10.67 1149203 32 123507 1025675 10.75 1149182 33 123307 1024087 10.75 1147394 34 123752 1021958 10.80 1145710 35 123694 1021207 10.80 1144901 36 123682 1017313 10.84 1140995 37 123814 1016699 10.86 1140513 38 123744 1020305 10.82 1144049 39 123952 1017996 10.85 1141948 40 124799 1016897 10.93 1141696 41 124506 1011934 10.96 1136440 42 124470 1011747 10.95 1136217 43 125183 1011956 11.01 1137139 44 125449 1008222 11.07 1133671 45 124408 1004709 11.02 1129117 46 125355 1004638 11.09 1129993 47 124950 1000721 11.10 1125671 48 124630 1002250 11.06 1126880 49 125511 1000817 11.14 1126328 50 125074 995709 11.16 1120783 51 124622 994565 11.14 1119187 52 125027 990741 11.21 1115768 53 125567 989875 11.26 1115442 54 124889 986555 11.24 1111444 55 125595 985488 11.30 1111083 56 125175 982301 11.30 1107476 57 124409 979701 11.27 1104110 58 124428 979837 11.27 1104265 59 124708 979926 11.29 1104634 60 124054 974222 11.30 1098276 61 125012 973933 11.38 1098945 62 124325 969474 11.37 1093799 63 124090 967785 11.36 1091875 64 124606 968536 11.40 1093142 65 124216 963956 11.42 1088172 66 124495 962725 11.45 1087220 67 123708 958850 11.43 1082558 68 124493 957648 11.50 1082141 69 123898 954901 11.48 1078799 70 124495 952648 11.56 1077143 71 123778 951522 11.51 1075300 72 123082 948699 11.48 1071781 73 122761 947367 11.47 1070128 74 122756 942293 11.53 1065049 75 122524 939885 11.53 1062409 76 122998 937558 11.60 1060556 77 122274 936668 11.55 1058942 78 122321 932899 11.59 1055220 79 122638 933629 11.61 1056267 80 121836 930727 11.58 1052563 81 122066 928165 11.62 1050231 82 121960 927171 11.62 1049131 83 121609 924474 11.63 1046083 84 121113 918185 11.65 1039298 85 121870 917011 11.73 1038881 86 121098 912638 11.71 1033736 87 121569 913731 11.74 1035300 88 120742 911528 11.70 1032270 89 120178 906020 11.71 1026198 90 120024 906447 11.69 1026471 91 119673 901568 11.72 1021241 92 119946 901564 11.74 1021510 93 119239 900423 11.69 1019662 94 119606 895422 11.78 1015028 95 119167 894345 11.76 1013512 96 118846 891508 11.76 1010354 97 119020 885652 11.85 1004672 98 118042 884252 11.78 1002294 99 118216 881899 11.82 1000115 100 118446 878461 11.88 996907 101 116771 874765 11.78 991536 102 116422 873898 11.76 990320 103 116381 872437 11.77 988818 104 116101 866183 11.82 982284 105 116252 867165 11.82 983417 106 115659 862447 11.82 978106 107 115533 858692 11.86 974225 108 114707 857346 11.80 972053 109 114456 850698 11.86 965154 110 113943 848929 11.83 962872 111 114465 846604 11.91 961069 112 113429 844333 11.84 957762 113 113412 840083 11.89 953495 114 113053 838513 11.88 951566 115 112394 836326 11.85 948720 116 111357 832970 11.79 944327 117 112059 829720 11.90 941779 118 110780 825632 11.83 936412 119 111201 823133 11.90 934334 120 110328 820197 11.86 930525 121 110244 817625 11.88 927869 122 110280 814658 11.92 924938 123 109353 811941 11.87 921294 124 108704 807213 11.87 915917 125 108458 804880 11.87 913338 126 108456 802269 11.91 910725 127 107768 796918 11.91 904686 128 107178 793711 11.90 900889 129 106267 791714 11.83 897981 130 107221 785380 12.01 892601 131 105885 783624 11.90 889509 132 105483 780816 11.90 886299 133 105126 776749 11.92 881875 134 104386 772200 11.91 876586 135 103997 770269 11.90 874266 136 103595 765773 11.92 869368 137 102887 761981 11.90 864868 138 102681 758008 11.93 860689 139 101987 755456 11.89 857443 140 101772 750281 11.94 852053 141 100794 747070 11.89 847864 142 101094 743322 11.97 844416 143 99993 740034 11.90 840027 144 98977 736219 11.85 835196 145 98998 731719 11.92 830717 146 97598 727493 11.83 825091 147 97794 721172 11.94 818966 148 96784 710439 11.99 807223 149 94474 644251 12.79 738725 150 83744 0 100.00 83744 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1557 1618467 0.10 1620024 2 2495 1550584 0.16 1553079 3 7584 3220154 0.23 3227738 4 9357 1532949 0.61 1542306 5 3141 1426266 0.22 1429407 6 3296 1578050 0.21 1581346 7 3770 1784291 0.21 1788061 8 3797 1711150 0.22 1714947 9 3678 1604936 0.23 1608614 10 3535 1594198 0.22 1597733 11 3636 1593042 0.23 1596678 12 3443 1574165 0.22 1577608 13 3650 1573598 0.23 1577248 14 3693 1572819 0.23 1576512 15 3732 1593265 0.23 1596997 16 3754 1587189 0.24 1590943 17 3632 1578999 0.23 1582631 18 3824 1595702 0.24 1599526 19 3847 1591913 0.24 1595760 20 3738 1586726 0.24 1590464 21 3853 1599546 0.24 1603399 22 3753 1584741 0.24 1588494 23 3798 1592408 0.24 1596206 24 3808 1597419 0.24 1601227 25 3823 1588660 0.24 1592483 26 3787 1591199 0.24 1594986 27 3931 1599259 0.25 1603190 28 3913 1593210 0.25 1597123 29 3896 1583575 0.25 1587471 30 3992 1596708 0.25 1600700 31 3958 1588038 0.25 1591996 32 4044 1579221 0.26 1583265 33 4010 1589412 0.25 1593422 34 3865 1580722 0.24 1584587 35 4002 1582368 0.25 1586370 36 4050 1583873 0.26 1587923 37 4125 1574129 0.26 1578254 38 3981 1573240 0.25 1577221 39 3923 1578852 0.25 1582775 40 4128 1570937 0.26 1575065 41 4120 1569974 0.26 1574094 42 4162 1566307 0.27 1570469 43 4072 1563688 0.26 1567760 44 4098 1558312 0.26 1562410 45 4179 1564112 0.27 1568291 46 4155 1558996 0.27 1563151 47 4013 1552090 0.26 1556103 48 4087 1557874 0.26 1561961 49 4165 1551925 0.27 1556090 50 4173 1547094 0.27 1551267 51 3969 1549592 0.26 1553561 52 4108 1538340 0.27 1542448 53 4062 1537620 0.26 1541682 54 4101 1540031 0.27 1544132 55 4111 1537015 0.27 1541126 56 4020 1529526 0.26 1533546 57 4003 1530317 0.26 1534320 58 4033 1527035 0.26 1531068 59 3983 1521356 0.26 1525339 60 4132 1520470 0.27 1524602 61 3970 1519998 0.26 1523968 62 4079 1511296 0.27 1515375 63 3855 1513249 0.25 1517104 64 3966 1506711 0.26 1510677 65 4028 1501343 0.27 1505371 66 4145 1505215 0.27 1509360 67 3895 1501916 0.26 1505811 68 4003 1493769 0.27 1497772 69 3978 1498390 0.26 1502368 70 4048 1486394 0.27 1490442 71 4106 1485940 0.28 1490046 72 4003 1487823 0.27 1491826 73 4158 1479392 0.28 1483550 74 3993 1476759 0.27 1480752 75 4025 1475937 0.27 1479962 76 4061 1470684 0.28 1474745 77 3992 1468151 0.27 1472143 78 3983 1467284 0.27 1471267 79 4003 1460753 0.27 1464756 80 4062 1457503 0.28 1461565 81 4090 1455685 0.28 1459775 82 4052 1452038 0.28 1456090 83 3990 1442382 0.28 1446372 84 4024 1445676 0.28 1449700 85 4021 1440011 0.28 1444032 86 3917 1433133 0.27 1437050 87 3985 1435672 0.28 1439657 88 4001 1429307 0.28 1433308 89 3934 1421813 0.28 1425747 90 3874 1418357 0.27 1422231 91 3872 1414912 0.27 1418784 92 3772 1411456 0.27 1415228 93 3943 1410740 0.28 1414683 94 3761 1406863 0.27 1410624 95 3849 1399658 0.27 1403507 96 3958 1397962 0.28 1401920 97 3849 1394524 0.28 1398373 98 3887 1384898 0.28 1388785 99 3918 1388527 0.28 1392445 100 3951 1380934 0.29 1384885 101 3827 1375076 0.28 1378903 102 3902 1374837 0.28 1378739 103 3822 1367942 0.28 1371764 104 3845 1360572 0.28 1364417 105 3932 1358406 0.29 1362338 106 3793 1354880 0.28 1358673 107 3762 1350617 0.28 1354379 108 3817 1347628 0.28 1351445 109 3870 1342073 0.29 1345943 110 3756 1334217 0.28 1337973 111 3771 1334450 0.28 1338221 112 3742 1326353 0.28 1330095 113 3660 1320717 0.28 1324377 114 3745 1319322 0.28 1323067 115 3674 1313097 0.28 1316771 116 3720 1307125 0.28 1310845 117 3668 1302741 0.28 1306409 118 3723 1297449 0.29 1301172 119 3628 1292186 0.28 1295814 120 3704 1290176 0.29 1293880 121 3648 1284506 0.28 1288154 122 3719 1278248 0.29 1281967 123 3678 1276197 0.29 1279875 124 3549 1267997 0.28 1271546 125 3675 1260383 0.29 1264058 126 3585 1258559 0.28 1262144 127 3622 1251967 0.29 1255589 128 3661 1244896 0.29 1248557 129 3568 1242706 0.29 1246274 130 3578 1236615 0.29 1240193 131 3607 1228792 0.29 1232399 132 3554 1227874 0.29 1231428 133 3582 1217314 0.29 1220896 134 3568 1212592 0.29 1216160 135 3650 1205863 0.30 1209513 136 3600 1199402 0.30 1203002 137 3555 1197544 0.30 1201099 138 3516 1190667 0.29 1194183 139 3564 1183234 0.30 1186798 140 3586 1173761 0.30 1177347 141 3595 1173624 0.31 1177219 142 3515 1165110 0.30 1168625 143 3586 1157267 0.31 1160853 144 3514 1155855 0.30 1159369 145 3517 1145769 0.31 1149286 146 3566 1137198 0.31 1140764 147 3607 1127841 0.32 1131448 148 3584 1117260 0.32 1120844 149 3360 1027474 0.33 1030834 150 2465 0 100.00 2465 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 6876 7533537 0.09 7540413 2 8634 6116247 0.14 6124881 3 12854 8221053 0.16 8233907 4 14164 8391548 0.17 8405712 5 12232 7471194 0.16 7483426 6 11669 6963537 0.17 6975206 7 11800 7037960 0.17 7049760 8 11868 6905950 0.17 6917818 9 12262 7017896 0.17 7030158 10 12302 6965095 0.18 6977397 11 12613 7006909 0.18 7019522 12 12640 7012750 0.18 7025390 13 13070 6959617 0.19 6972687 14 13210 6974091 0.19 6987301 15 13213 6980743 0.19 6993956 16 13273 6981602 0.19 6994875 17 13508 6995411 0.19 7008919 18 13587 6977755 0.19 6991342 19 13872 6973997 0.20 6987869 20 13744 6951875 0.20 6965619 21 14017 6956758 0.20 6970775 22 14011 6937181 0.20 6951192 23 14071 6925002 0.20 6939073 24 14414 6931521 0.21 6945935 25 14267 6926651 0.21 6940918 26 14399 6916825 0.21 6931224 27 14264 6933176 0.21 6947440 28 14323 6933391 0.21 6947714 29 14495 6901495 0.21 6915990 30 14371 6907592 0.21 6921963 31 14672 6899646 0.21 6914318 32 14732 6868433 0.21 6883165 33 14489 6866204 0.21 6880693 34 14529 6843112 0.21 6857641 35 14772 6848341 0.22 6863113 36 14602 6848803 0.21 6863405 37 14616 6838347 0.21 6852963 38 14732 6843689 0.21 6858421 39 14869 6832065 0.22 6846934 40 14812 6831284 0.22 6846096 41 15232 6801252 0.22 6816484 42 14653 6796640 0.22 6811293 43 14837 6786084 0.22 6800921 44 14944 6765113 0.22 6780057 45 14957 6766458 0.22 6781415 46 15088 6753797 0.22 6768885 47 15142 6741600 0.22 6756742 48 15069 6753533 0.22 6768602 49 15268 6735352 0.23 6750620 50 15071 6724639 0.22 6739710 51 14922 6712545 0.22 6727467 52 14914 6690783 0.22 6705697 53 14762 6674865 0.22 6689627 54 15083 6664384 0.23 6679467 55 15042 6664675 0.23 6679717 56 15074 6647985 0.23 6663059 57 14921 6637007 0.22 6651928 58 14576 6639617 0.22 6654193 59 14833 6614450 0.22 6629283 60 14759 6597739 0.22 6612498 61 15048 6592657 0.23 6607705 62 15218 6571538 0.23 6586756 63 14882 6562817 0.23 6577699 64 14825 6551708 0.23 6566533 65 14906 6527957 0.23 6542863 66 14803 6524118 0.23 6538921 67 14818 6519513 0.23 6534331 68 15050 6497020 0.23 6512070 69 14570 6483026 0.22 6497596 70 14621 6471721 0.23 6486342 71 14727 6453136 0.23 6467863 72 15087 6445969 0.23 6461056 73 14809 6434308 0.23 6449117 74 14513 6408278 0.23 6422791 75 14532 6401008 0.23 6415540 76 14494 6387205 0.23 6401699 77 14552 6367952 0.23 6382504 78 14582 6362375 0.23 6376957 79 14659 6358087 0.23 6372746 80 14314 6328727 0.23 6343041 81 14411 6323023 0.23 6337434 82 14254 6309677 0.23 6323931 83 14212 6286619 0.23 6300831 84 14312 6273193 0.23 6287505 85 14267 6260423 0.23 6274690 86 14131 6242354 0.23 6256485 87 14172 6231504 0.23 6245676 88 14039 6219136 0.23 6233175 89 14318 6209794 0.23 6224112 90 13978 6195667 0.23 6209645 91 14069 6175228 0.23 6189297 92 14009 6150291 0.23 6164300 93 14135 6138481 0.23 6152616 94 13928 6127380 0.23 6141308 95 13992 6094926 0.23 6108918 96 13751 6078314 0.23 6092065 97 13668 6067377 0.22 6081045 98 13842 6041455 0.23 6055297 99 13854 6038899 0.23 6052753 100 13655 6021659 0.23 6035314 101 13591 5995235 0.23 6008826 102 13718 5986517 0.23 6000235 103 13724 5965022 0.23 5978746 104 13683 5944786 0.23 5958469 105 13535 5928532 0.23 5942067 106 13679 5903693 0.23 5917372 107 13309 5877677 0.23 5890986 108 13480 5863306 0.23 5876786 109 13742 5853503 0.23 5867245 110 13375 5829698 0.23 5843073 111 13282 5818346 0.23 5831628 112 13394 5797822 0.23 5811216 113 13111 5779401 0.23 5792512 114 13100 5764527 0.23 5777627 115 13197 5737977 0.23 5751174 116 12945 5714928 0.23 5727873 117 13008 5694610 0.23 5707618 118 12924 5668382 0.23 5681306 119 12908 5641630 0.23 5654538 120 12902 5630037 0.23 5642939 121 12908 5615312 0.23 5628220 122 12905 5589258 0.23 5602163 123 13064 5571723 0.23 5584787 124 12992 5544701 0.23 5557693 125 12825 5518242 0.23 5531067 126 12775 5496093 0.23 5508868 127 12940 5473115 0.24 5486055 128 12903 5445442 0.24 5458345 129 12903 5429975 0.24 5442878 130 12560 5409161 0.23 5421721 131 12606 5382533 0.23 5395139 132 12912 5362367 0.24 5375279 133 12830 5337829 0.24 5350659 134 13034 5305446 0.25 5318480 135 12905 5285312 0.24 5298217 136 12652 5263958 0.24 5276610 137 12976 5237160 0.25 5250136 138 12793 5213595 0.24 5226388 139 12647 5183612 0.24 5196259 140 12745 5151226 0.25 5163971 141 12668 5132136 0.25 5144804 142 12778 5106749 0.25 5119527 143 12796 5082558 0.25 5095354 144 12774 5053417 0.25 5066191 145 12832 5025923 0.25 5038755 146 12988 4987443 0.26 5000431 147 13185 4942612 0.27 4955797 148 13362 4890286 0.27 4903648 149 12481 4503186 0.28 4515667 150 8768 0 100.00 8768