CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 152368 935070 14.01 1087438 2 196228 1243264 13.63 1439492 3 151535 1138991 11.74 1290526 4 161549 1245204 11.48 1406753 5 187022 1400946 11.78 1587968 6 194115 1429718 11.95 1623833 7 178894 1251832 12.50 1430726 8 178556 1272406 12.31 1450962 9 177098 1265414 12.28 1442512 10 175109 1259036 12.21 1434145 11 176873 1272405 12.20 1449278 12 180473 1269001 12.45 1449474 13 177486 1261462 12.33 1438948 14 179242 1274278 12.33 1453520 15 180547 1269828 12.45 1450375 16 181177 1280212 12.40 1461389 17 181561 1284953 12.38 1466514 18 182336 1292877 12.36 1475213 19 182539 1292653 12.37 1475192 20 183617 1294892 12.42 1478509 21 183011 1290760 12.42 1473771 22 183516 1287761 12.47 1471277 23 183690 1285126 12.51 1468816 24 183630 1283916 12.51 1467546 25 182007 1281274 12.44 1463281 26 183315 1296348 12.39 1479663 27 183034 1301337 12.33 1484371 28 182698 1295050 12.36 1477748 29 184076 1306195 12.35 1490271 30 184152 1302033 12.39 1486185 31 182782 1294789 12.37 1477571 32 184352 1299747 12.42 1484099 33 184551 1297702 12.45 1482253 34 183551 1291979 12.44 1475530 35 183137 1296773 12.37 1479910 36 184251 1299486 12.42 1483737 37 183171 1300067 12.35 1483238 38 183834 1306162 12.34 1489996 39 184946 1308507 12.38 1493453 40 184332 1304864 12.38 1489196 41 183526 1309071 12.30 1492597 42 185254 1309837 12.39 1495091 43 183719 1302317 12.36 1486036 44 182880 1299428 12.34 1482308 45 184554 1300821 12.42 1485375 46 182645 1298315 12.33 1480960 47 184482 1310094 12.34 1494576 48 184984 1308670 12.38 1493654 49 184365 1303187 12.39 1487552 50 183150 1307019 12.29 1490169 51 184213 1305950 12.36 1490163 52 183460 1304996 12.33 1488456 53 184803 1307866 12.38 1492669 54 183451 1301420 12.35 1484871 55 182830 1298026 12.35 1480856 56 183090 1302223 12.33 1485313 57 183099 1302818 12.32 1485917 58 183245 1302305 12.34 1485550 59 182603 1303952 12.28 1486555 60 182749 1306047 12.27 1488796 61 181693 1302918 12.24 1484611 62 183298 1308606 12.29 1491904 63 183089 1304197 12.31 1487286 64 181923 1301889 12.26 1483812 65 182216 1302294 12.27 1484510 66 182308 1302997 12.27 1485305 67 182618 1302506 12.30 1485124 68 181941 1301891 12.26 1483832 69 181276 1300916 12.23 1482192 70 182118 1302260 12.27 1484378 71 181336 1305300 12.20 1486636 72 182083 1305038 12.24 1487121 73 181396 1300155 12.24 1481551 74 181162 1302594 12.21 1483756 75 181013 1299693 12.22 1480706 76 179609 1297074 12.16 1476683 77 180446 1300555 12.18 1481001 78 180865 1304287 12.18 1485152 79 180298 1301813 12.16 1482111 80 179866 1299382 12.16 1479248 81 180232 1300755 12.17 1480987 82 179925 1299850 12.16 1479775 83 180190 1300759 12.17 1480949 84 179272 1299542 12.12 1478814 85 179714 1294263 12.19 1473977 86 179427 1299824 12.13 1479251 87 179602 1298243 12.15 1477845 88 179130 1293617 12.16 1472747 89 179468 1298401 12.14 1477869 90 177942 1301091 12.03 1479033 91 177671 1298838 12.03 1476509 92 178378 1299539 12.07 1477917 93 178071 1298706 12.06 1476777 94 177453 1298163 12.03 1475616 95 177322 1296164 12.03 1473486 96 177455 1291870 12.08 1469325 97 177359 1292854 12.06 1470213 98 176804 1295099 12.01 1471903 99 177401 1297902 12.02 1475303 100 175585 1292716 11.96 1468301 101 175018 1293088 11.92 1468106 102 175028 1290861 11.94 1465889 103 174630 1290174 11.92 1464804 104 175799 1292928 11.97 1468727 105 173974 1291187 11.87 1465161 106 174949 1286623 11.97 1461572 107 174182 1287379 11.92 1461561 108 173637 1286774 11.89 1460411 109 173083 1285743 11.86 1458826 110 173545 1290631 11.85 1464176 111 174136 1288873 11.90 1463009 112 172636 1285737 11.84 1458373 113 172439 1286717 11.82 1459156 114 172597 1285266 11.84 1457863 115 172920 1282731 11.88 1455651 116 170811 1282331 11.75 1453142 117 171379 1280927 11.80 1452306 118 170386 1278778 11.76 1449164 119 170926 1282268 11.76 1453194 120 170331 1282521 11.72 1452852 121 168989 1282069 11.65 1451058 122 168936 1280402 11.66 1449338 123 169241 1281337 11.67 1450578 124 169201 1276254 11.71 1445455 125 167993 1279826 11.60 1447819 126 168707 1275207 11.68 1443914 127 166947 1272173 11.60 1439120 128 167460 1273522 11.62 1440982 129 167294 1270535 11.64 1437829 130 166689 1267516 11.62 1434205 131 165424 1269799 11.53 1435223 132 165763 1270200 11.54 1435963 133 165337 1265850 11.55 1431187 134 165494 1267991 11.54 1433485 135 164902 1266370 11.52 1431272 136 163833 1263135 11.48 1426968 137 163122 1262118 11.45 1425240 138 162767 1264982 11.40 1427749 139 163320 1259817 11.48 1423137 140 163117 1258160 11.48 1421277 141 162335 1259266 11.42 1421601 142 161769 1255957 11.41 1417726 143 160458 1255739 11.33 1416197 144 160242 1254138 11.33 1414380 145 159084 1252457 11.27 1411541 146 159834 1257596 11.28 1417430 147 158469 1251627 11.24 1410096 148 156897 1248586 11.16 1405483 149 152959 1245126 10.94 1398085 150 134494 1154935 10.43 1289429 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4916 3549892 0.14 3554808 2 5965 1754473 0.34 1760438 3 4508 1694823 0.27 1699331 4 5096 1982247 0.26 1987343 5 6691 2290702 0.29 2297393 6 6372 2165400 0.29 2171772 7 6019 2006052 0.30 2012071 8 6096 2014472 0.30 2020568 9 5994 2003267 0.30 2009261 10 6133 2001432 0.31 2007565 11 6125 2008525 0.30 2014650 12 6092 2003301 0.30 2009393 13 6446 2009750 0.32 2016196 14 6359 2005336 0.32 2011695 15 6492 2000904 0.32 2007396 16 6671 2021797 0.33 2028468 17 6685 2025176 0.33 2031861 18 6812 2012957 0.34 2019769 19 6771 2034169 0.33 2040940 20 6858 2025452 0.34 2032310 21 6844 2027738 0.34 2034582 22 6850 2034467 0.34 2041317 23 6875 2029280 0.34 2036155 24 6979 2024840 0.34 2031819 25 6928 2032043 0.34 2038971 26 6908 2037689 0.34 2044597 27 6712 2037041 0.33 2043753 28 6905 2055305 0.33 2062210 29 7121 2045859 0.35 2052980 30 6775 2036618 0.33 2043393 31 6789 2047898 0.33 2054687 32 6942 2045392 0.34 2052334 33 6749 2048281 0.33 2055030 34 7118 2043665 0.35 2050783 35 6984 2043244 0.34 2050228 36 6996 2045866 0.34 2052862 37 7218 2055266 0.35 2062484 38 6962 2050321 0.34 2057283 39 7054 2051500 0.34 2058554 40 7056 2054244 0.34 2061300 41 6970 2054689 0.34 2061659 42 7046 2045953 0.34 2052999 43 7125 2057784 0.35 2064909 44 6997 2049401 0.34 2056398 45 6937 2045524 0.34 2052461 46 6854 2058456 0.33 2065310 47 6852 2056563 0.33 2063415 48 6921 2050411 0.34 2057332 49 6911 2056832 0.33 2063743 50 7002 2054267 0.34 2061269 51 6839 2052540 0.33 2059379 52 6958 2057661 0.34 2064619 53 7003 2059463 0.34 2066466 54 6902 2048778 0.34 2055680 55 6777 2058162 0.33 2064939 56 6913 2056944 0.33 2063857 57 6911 2052973 0.34 2059884 58 6834 2052577 0.33 2059411 59 6909 2061311 0.33 2068220 60 6932 2051701 0.34 2058633 61 6843 2058763 0.33 2065606 62 6858 2056428 0.33 2063286 63 6804 2052749 0.33 2059553 64 6825 2060705 0.33 2067530 65 6925 2059325 0.34 2066250 66 6763 2052739 0.33 2059502 67 6883 2061938 0.33 2068821 68 7035 2054508 0.34 2061543 69 7061 2053553 0.34 2060614 70 6948 2057222 0.34 2064170 71 6909 2059925 0.33 2066834 72 6843 2055835 0.33 2062678 73 6902 2057583 0.33 2064485 74 7058 2058237 0.34 2065295 75 6927 2058538 0.34 2065465 76 7082 2060270 0.34 2067352 77 7058 2056851 0.34 2063909 78 6886 2058248 0.33 2065134 79 6918 2059390 0.33 2066308 80 6972 2057522 0.34 2064494 81 6904 2050277 0.34 2057181 82 7113 2054918 0.34 2062031 83 6986 2059110 0.34 2066096 84 6874 2050954 0.33 2057828 85 6907 2062871 0.33 2069778 86 6899 2054557 0.33 2061456 87 6923 2047879 0.34 2054802 88 6982 2051794 0.34 2058776 89 6857 2049672 0.33 2056529 90 7021 2043127 0.34 2050148 91 6797 2053977 0.33 2060774 92 6812 2054600 0.33 2061412 93 6792 2047043 0.33 2053835 94 6758 2049436 0.33 2056194 95 7115 2047973 0.35 2055088 96 6895 2038988 0.34 2045883 97 6881 2048965 0.33 2055846 98 6909 2044749 0.34 2051658 99 6780 2041852 0.33 2048632 100 6818 2045490 0.33 2052308 101 6957 2039740 0.34 2046697 102 6833 2035157 0.33 2041990 103 6836 2042161 0.33 2048997 104 6630 2037891 0.32 2044521 105 6785 2039610 0.33 2046395 106 6733 2041192 0.33 2047925 107 6707 2036255 0.33 2042962 108 6897 2030913 0.34 2037810 109 6777 2033660 0.33 2040437 110 6993 2036729 0.34 2043722 111 6827 2028550 0.34 2035377 112 6631 2033055 0.33 2039686 113 6798 2028854 0.33 2035652 114 6628 2025508 0.33 2032136 115 6676 2028053 0.33 2034729 116 6653 2021287 0.33 2027940 117 6726 2019719 0.33 2026445 118 6608 2029950 0.32 2036558 119 6735 2026537 0.33 2033272 120 6769 2016293 0.33 2023062 121 6634 2020777 0.33 2027411 122 6708 2018944 0.33 2025652 123 6403 2011431 0.32 2017834 124 6634 2013300 0.33 2019934 125 6680 2008086 0.33 2014766 126 6588 2003499 0.33 2010087 127 6433 2008319 0.32 2014752 128 6568 2000103 0.33 2006671 129 6613 1996804 0.33 2003417 130 6714 1997286 0.34 2004000 131 6663 1997323 0.33 2003986 132 6617 1992320 0.33 1998937 133 6675 1994087 0.33 2000762 134 6592 1994074 0.33 2000666 135 6470 1990448 0.32 1996918 136 6531 1985737 0.33 1992268 137 6676 1984508 0.34 1991184 138 6659 1974518 0.34 1981177 139 6720 1985362 0.34 1992082 140 6635 1977876 0.33 1984511 141 6601 1972176 0.33 1978777 142 6544 1970366 0.33 1976910 143 6701 1965205 0.34 1971906 144 6699 1962703 0.34 1969402 145 7138 1973945 0.36 1981083 146 7555 1964109 0.38 1971664 147 7644 1962699 0.39 1970343 148 7603 1953922 0.39 1961525 149 6932 1945233 0.36 1952165 150 6250 1772448 0.35 1778698 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 13156 8472890 0.16 8486046 2 18282 6786584 0.27 6804866 3 19266 7419394 0.26 7438660 4 21309 9016064 0.24 9037373 5 24470 10032413 0.24 10056883 6 23664 10000920 0.24 10024584 7 21984 9127923 0.24 9149907 8 22452 9048193 0.25 9070645 9 21947 8869649 0.25 8891596 10 21936 8788649 0.25 8810585 11 22258 8826386 0.25 8848644 12 22537 8788317 0.26 8810854 13 22468 8744922 0.26 8767390 14 23243 8775971 0.26 8799214 15 23470 8779227 0.27 8802697 16 23505 8841580 0.27 8865085 17 23800 8845721 0.27 8869521 18 23956 8879558 0.27 8903514 19 24238 8875674 0.27 8899912 20 24337 8863083 0.27 8887420 21 24375 8846501 0.27 8870876 22 24465 8827608 0.28 8852073 23 24428 8820628 0.28 8845056 24 24364 8834240 0.28 8858604 25 24831 8831504 0.28 8856335 26 24621 8844659 0.28 8869280 27 25280 8878328 0.28 8903608 28 25366 8899950 0.28 8925316 29 25298 8906222 0.28 8931520 30 25081 8917978 0.28 8943059 31 25351 8918495 0.28 8943846 32 25224 8888174 0.28 8913398 33 25586 8880034 0.29 8905620 34 25185 8874557 0.28 8899742 35 25135 8864821 0.28 8889956 36 25364 8880501 0.28 8905865 37 25188 8884422 0.28 8909610 38 25368 8894892 0.28 8920260 39 25514 8916798 0.29 8942312 40 25152 8917378 0.28 8942530 41 25050 8906395 0.28 8931445 42 25197 8908021 0.28 8933218 43 25401 8894424 0.28 8919825 44 25088 8887029 0.28 8912117 45 25159 8885229 0.28 8910388 46 24659 8888383 0.28 8913042 47 25272 8897203 0.28 8922475 48 25141 8899467 0.28 8924608 49 25325 8919109 0.28 8944434 50 25435 8930678 0.28 8956113 51 25456 8929861 0.28 8955317 52 25104 8932145 0.28 8957249 53 25312 8936064 0.28 8961376 54 25541 8925400 0.29 8950941 55 25045 8910911 0.28 8935956 56 25116 8916393 0.28 8941509 57 25254 8901789 0.28 8927043 58 25249 8903499 0.28 8928748 59 24998 8899607 0.28 8924605 60 25074 8926870 0.28 8951944 61 25201 8928425 0.28 8953626 62 25291 8931243 0.28 8956534 63 25170 8935559 0.28 8960729 64 24965 8942864 0.28 8967829 65 25199 8931846 0.28 8957045 66 24799 8933348 0.28 8958147 67 24890 8934746 0.28 8959636 68 25248 8941310 0.28 8966558 69 25114 8926382 0.28 8951496 70 25044 8950679 0.28 8975723 71 25154 8951375 0.28 8976529 72 25265 8945348 0.28 8970613 73 25356 8941644 0.28 8967000 74 25241 8934586 0.28 8959827 75 25300 8929144 0.28 8954444 76 25309 8940343 0.28 8965652 77 24917 8941139 0.28 8966056 78 24993 8932200 0.28 8957193 79 24980 8930782 0.28 8955762 80 25136 8928227 0.28 8953363 81 25223 8940776 0.28 8965999 82 24976 8944358 0.28 8969334 83 24730 8945286 0.28 8970016 84 24877 8941696 0.28 8966573 85 24749 8936950 0.28 8961699 86 24783 8922520 0.28 8947303 87 24948 8907634 0.28 8932582 88 24733 8914801 0.28 8939534 89 24861 8930882 0.28 8955743 90 24827 8943768 0.28 8968595 91 24504 8933959 0.27 8958463 92 24717 8926061 0.28 8950778 93 24783 8934607 0.28 8959390 94 24479 8939088 0.27 8963567 95 24984 8936456 0.28 8961440 96 24652 8923934 0.28 8948586 97 24770 8922168 0.28 8946938 98 24531 8918740 0.27 8943271 99 24940 8911601 0.28 8936541 100 24965 8923321 0.28 8948286 101 24606 8927956 0.27 8952562 102 24517 8918329 0.27 8942846 103 24653 8917596 0.28 8942249 104 24485 8917246 0.27 8941731 105 24285 8900644 0.27 8924929 106 24567 8903424 0.28 8927991 107 24154 8890869 0.27 8915023 108 24144 8868988 0.27 8893132 109 24467 8877572 0.27 8902039 110 24381 8884570 0.27 8908951 111 24111 8884180 0.27 8908291 112 24233 8884262 0.27 8908495 113 24048 8891113 0.27 8915161 114 24333 8866838 0.27 8891171 115 24272 8878178 0.27 8902450 116 24434 8865308 0.27 8889742 117 24321 8853886 0.27 8878207 118 24220 8855587 0.27 8879807 119 24344 8834408 0.27 8858752 120 24381 8826580 0.28 8850961 121 24202 8828417 0.27 8852619 122 24003 8828569 0.27 8852572 123 24270 8828330 0.27 8852600 124 24265 8823442 0.27 8847707 125 24144 8812036 0.27 8836180 126 24211 8794951 0.27 8819162 127 24096 8790066 0.27 8814162 128 24033 8777671 0.27 8801704 129 24256 8771764 0.28 8796020 130 24209 8762944 0.28 8787153 131 23924 8763215 0.27 8787139 132 23835 8743322 0.27 8767157 133 23987 8746088 0.27 8770075 134 24155 8747466 0.28 8771621 135 24193 8736830 0.28 8761023 136 23976 8713815 0.27 8737791 137 24070 8709097 0.28 8733167 138 23917 8710132 0.27 8734049 139 24077 8695062 0.28 8719139 140 24030 8686424 0.28 8710454 141 24272 8657027 0.28 8681299 142 24388 8650618 0.28 8675006 143 24303 8648843 0.28 8673146 144 24713 8646298 0.29 8671011 145 25395 8649734 0.29 8675129 146 26341 8651599 0.30 8677940 147 26754 8638261 0.31 8665015 148 26552 8606849 0.31 8633401 149 25642 8523031 0.30 8548673 150 23095 7989434 0.29 8012529 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 5311 1662309 0.32 1667620 2 52042 1338115 3.74 1390157 3 102117 1224720 7.70 1326837 4 97607 1117146 8.04 1214753 5 106556 1233541 7.95 1340097 6 118721 1393920 7.85 1512641 7 126150 1420117 8.16 1546267 8 119049 1244338 8.73 1363387 9 121807 1258543 8.82 1380350 10 124050 1245966 9.05 1370016 11 123547 1235167 9.09 1358714 12 126423 1244272 9.22 1370695 13 129379 1234219 9.49 1363598 14 129018 1235823 9.45 1364841 15 130378 1241819 9.50 1372197 16 130945 1235772 9.58 1366717 17 133061 1245343 9.65 1378404 18 133026 1245545 9.65 1378571 19 134816 1249271 9.74 1384087 20 134961 1247254 9.76 1382215 21 136750 1243142 9.91 1379892 22 136499 1239059 9.92 1375558 23 137585 1237246 10.01 1374831 24 137497 1232643 10.04 1370140 25 137380 1228993 10.05 1366373 26 137899 1228860 10.09 1366759 27 138407 1232893 10.09 1371300 28 138963 1234769 10.12 1373732 29 138737 1230586 10.13 1369323 30 139331 1234807 10.14 1374138 31 139786 1226962 10.23 1366748 32 139924 1222540 10.27 1362464 33 140789 1219964 10.35 1360753 34 140482 1215639 10.36 1356121 35 140639 1210205 10.41 1350844 36 140750 1211268 10.41 1352018 37 140779 1209409 10.43 1350188 38 141958 1210907 10.49 1352865 39 141282 1210801 10.45 1352083 40 141543 1209130 10.48 1350673 41 142723 1208353 10.56 1351076 42 141682 1203149 10.54 1344831 43 142068 1203104 10.56 1345172 44 142856 1195795 10.67 1338651 45 141634 1187546 10.66 1329180 46 142127 1185482 10.71 1327609 47 142552 1186515 10.73 1329067 48 142111 1188881 10.68 1330992 49 142846 1185947 10.75 1328793 50 142318 1180328 10.76 1322646 51 141943 1177316 10.76 1319259 52 141413 1172806 10.76 1314219 53 142179 1172348 10.82 1314527 54 142526 1171912 10.84 1314438 55 142597 1162802 10.92 1305399 56 142508 1160113 10.94 1302621 57 142795 1159258 10.97 1302053 58 142655 1158809 10.96 1301464 59 142393 1156172 10.97 1298565 60 142609 1153457 11.00 1296066 61 142043 1153264 10.97 1295307 62 141722 1146468 11.00 1288190 63 142406 1143510 11.07 1285916 64 142536 1142759 11.09 1285295 65 141718 1137872 11.08 1279590 66 141011 1134447 11.06 1275458 67 141307 1131118 11.11 1272425 68 140978 1127042 11.12 1268020 69 141286 1124482 11.16 1265768 70 140342 1123082 11.11 1263424 71 141381 1119719 11.21 1261100 72 140505 1117170 11.17 1257675 73 140200 1116020 11.16 1256220 74 140938 1111136 11.26 1252074 75 140686 1105607 11.29 1246293 76 139878 1101591 11.27 1241469 77 139815 1097181 11.30 1236996 78 138806 1095590 11.24 1234396 79 139305 1097569 11.26 1236874 80 138477 1091566 11.26 1230043 81 138594 1088751 11.29 1227345 82 139039 1087653 11.33 1226692 83 138271 1084699 11.31 1222970 84 137810 1080515 11.31 1218325 85 137956 1074085 11.38 1212041 86 137863 1070832 11.41 1208695 87 137652 1066700 11.43 1204352 88 137306 1065453 11.42 1202759 89 136318 1062554 11.37 1198872 90 136023 1060850 11.36 1196873 91 136139 1059298 11.39 1195437 92 136270 1054737 11.44 1191007 93 135328 1052289 11.39 1187617 94 135670 1049544 11.45 1185214 95 135494 1043982 11.49 1179476 96 133920 1039591 11.41 1173511 97 133959 1035102 11.46 1169061 98 134113 1033070 11.49 1167183 99 134292 1032834 11.51 1167126 100 133833 1027448 11.52 1161281 101 132496 1024624 11.45 1157120 102 132265 1019595 11.48 1151860 103 132143 1016187 11.51 1148330 104 131466 1012558 11.49 1144024 105 131651 1008684 11.54 1140335 106 130869 1004669 11.52 1135538 107 131167 1002048 11.57 1133215 108 129652 995290 11.53 1124942 109 129984 992635 11.58 1122619 110 129394 988884 11.57 1118278 111 129117 987066 11.57 1116183 112 128455 983962 11.55 1112417 113 128056 980383 11.55 1108439 114 129087 977395 11.67 1106482 115 127437 973620 11.57 1101057 116 126722 970379 11.55 1097101 117 126073 964052 11.57 1090125 118 125462 960150 11.56 1085612 119 124999 957019 11.55 1082018 120 125018 954990 11.58 1080008 121 124819 952088 11.59 1076907 122 124122 947803 11.58 1071925 123 123799 943796 11.60 1067595 124 122954 939546 11.57 1062500 125 123299 934645 11.65 1057944 126 122026 932553 11.57 1054579 127 121105 924103 11.59 1045208 128 120466 921422 11.56 1041888 129 120563 917166 11.62 1037729 130 120199 910595 11.66 1030794 131 120376 908404 11.70 1028780 132 118788 906684 11.58 1025472 133 118636 900070 11.65 1018706 134 117766 896697 11.61 1014463 135 117594 893255 11.63 1010849 136 116931 888316 11.63 1005247 137 116405 884742 11.63 1001147 138 115582 879311 11.62 994893 139 115274 875313 11.64 990587 140 113907 870298 11.57 984205 141 114319 866732 11.65 981051 142 113361 861680 11.63 975041 143 112957 856452 11.65 969409 144 112293 851818 11.65 964111 145 111697 846648 11.66 958345 146 110337 842097 11.58 952434 147 110114 835294 11.65 945408 148 108810 822532 11.68 931342 149 107047 743866 12.58 850913 150 94413 0 100.00 94413 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3127 2011259 0.16 2014386 2 4496 1756074 0.26 1760570 3 13445 3862151 0.35 3875596 4 13213 1749221 0.75 1762434 5 5096 1637080 0.31 1642176 6 5590 1869685 0.30 1875275 7 6648 2142379 0.31 2149027 8 6402 2044092 0.31 2050494 9 6037 1890419 0.32 1896456 10 5930 1893390 0.31 1899320 11 5663 1881184 0.30 1886847 12 5622 1875678 0.30 1881300 13 5867 1877809 0.31 1883676 14 5555 1873729 0.30 1879284 15 5643 1885506 0.30 1891149 16 5707 1881696 0.30 1887403 17 5723 1872464 0.30 1878187 18 5779 1897117 0.30 1902896 19 5697 1886763 0.30 1892460 20 5777 1877787 0.31 1883564 21 5706 1892548 0.30 1898254 22 5675 1877453 0.30 1883128 23 5767 1881310 0.31 1887077 24 5748 1887381 0.30 1893129 25 5936 1877975 0.32 1883911 26 5732 1875580 0.30 1881312 27 5869 1883325 0.31 1889194 28 5826 1876448 0.31 1882274 29 5678 1871495 0.30 1877173 30 5827 1884804 0.31 1890631 31 5808 1874159 0.31 1879967 32 5783 1859941 0.31 1865724 33 5629 1870368 0.30 1875997 34 5810 1862550 0.31 1868360 35 5727 1863605 0.31 1869332 36 5747 1865704 0.31 1871451 37 5624 1854660 0.30 1860284 38 5897 1852191 0.32 1858088 39 5740 1858317 0.31 1864057 40 5864 1847151 0.32 1853015 41 5908 1847314 0.32 1853222 42 5792 1843210 0.31 1849002 43 5747 1840941 0.31 1846688 44 5802 1830666 0.32 1836468 45 6054 1842718 0.33 1848772 46 5768 1831391 0.31 1837159 47 5755 1822402 0.31 1828157 48 5886 1830048 0.32 1835934 49 5784 1820551 0.32 1826335 50 5724 1815965 0.31 1821689 51 5754 1817100 0.32 1822854 52 5541 1806955 0.31 1812496 53 5782 1801838 0.32 1807620 54 5678 1804651 0.31 1810329 55 5531 1803859 0.31 1809390 56 5635 1794151 0.31 1799786 57 5641 1793260 0.31 1798901 58 5559 1789962 0.31 1795521 59 5772 1783055 0.32 1788827 60 5571 1777595 0.31 1783166 61 5584 1778572 0.31 1784156 62 5467 1767217 0.31 1772684 63 5545 1770738 0.31 1776283 64 5583 1764945 0.32 1770528 65 5388 1756015 0.31 1761403 66 5591 1760637 0.32 1766228 67 5682 1759073 0.32 1764755 68 5552 1746543 0.32 1752095 69 5542 1748827 0.32 1754369 70 5408 1741564 0.31 1746972 71 5434 1733125 0.31 1738559 72 5565 1734315 0.32 1739880 73 5311 1728675 0.31 1733986 74 5500 1724405 0.32 1729905 75 5428 1721267 0.31 1726695 76 5546 1720760 0.32 1726306 77 5427 1713781 0.32 1719208 78 5352 1709242 0.31 1714594 79 5376 1706074 0.31 1711450 80 5412 1702066 0.32 1707478 81 5286 1698225 0.31 1703511 82 5497 1690861 0.32 1696358 83 5395 1681212 0.32 1686607 84 5383 1682526 0.32 1687909 85 5343 1677254 0.32 1682597 86 5339 1668565 0.32 1673904 87 5414 1672926 0.32 1678340 88 5277 1660710 0.32 1665987 89 5239 1653792 0.32 1659031 90 5182 1650853 0.31 1656035 91 5335 1648063 0.32 1653398 92 5175 1640051 0.31 1645226 93 5051 1640208 0.31 1645259 94 5323 1634997 0.32 1640320 95 5202 1626065 0.32 1631267 96 5185 1623203 0.32 1628388 97 5138 1619818 0.32 1624956 98 5133 1610492 0.32 1615625 99 5173 1613902 0.32 1619075 100 5128 1604480 0.32 1609608 101 5087 1594506 0.32 1599593 102 4972 1595454 0.31 1600426 103 4951 1585472 0.31 1590423 104 5046 1577141 0.32 1582187 105 4930 1578771 0.31 1583701 106 4985 1565350 0.32 1570335 107 4983 1561443 0.32 1566426 108 5088 1559850 0.33 1564938 109 5005 1551855 0.32 1556860 110 5000 1543923 0.32 1548923 111 4943 1542968 0.32 1547911 112 4884 1536776 0.32 1541660 113 4949 1525507 0.32 1530456 114 4960 1524899 0.32 1529859 115 4825 1521000 0.32 1525825 116 4821 1511466 0.32 1516287 117 4840 1506823 0.32 1511663 118 4747 1496702 0.32 1501449 119 4802 1492753 0.32 1497555 120 4563 1490620 0.31 1495183 121 4686 1484768 0.31 1489454 122 4678 1476861 0.32 1481539 123 4804 1472995 0.33 1477799 124 4790 1465181 0.33 1469971 125 4820 1455346 0.33 1460166 126 4710 1453024 0.32 1457734 127 4629 1444103 0.32 1448732 128 4634 1434452 0.32 1439086 129 4513 1434148 0.31 1438661 130 4687 1421945 0.33 1426632 131 4510 1417145 0.32 1421655 132 4751 1412947 0.34 1417698 133 4699 1400931 0.33 1405630 134 4685 1393820 0.34 1398505 135 4589 1388077 0.33 1392666 136 4614 1384167 0.33 1388781 137 4538 1376874 0.33 1381412 138 4565 1369465 0.33 1374030 139 4536 1360124 0.33 1364660 140 4550 1353242 0.34 1357792 141 4541 1351809 0.33 1356350 142 4446 1340828 0.33 1345274 143 4514 1332481 0.34 1336995 144 4499 1326901 0.34 1331400 145 4518 1317809 0.34 1322327 146 4471 1305602 0.34 1310073 147 4628 1299506 0.35 1304134 148 4399 1281514 0.34 1285913 149 4229 1179726 0.36 1183955 150 2965 0 100.00 2965 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 13831 9245543 0.15 9259374 2 17303 7401611 0.23 7418914 3 25216 10041109 0.25 10066325 4 27304 9967458 0.27 9994762 5 22664 8788339 0.26 8811003 6 20612 8151645 0.25 8172257 7 21588 8334249 0.26 8355837 8 21433 8189253 0.26 8210686 9 21397 8268505 0.26 8289902 10 21525 8255068 0.26 8276593 11 21622 8278329 0.26 8299951 12 21801 8299104 0.26 8320905 13 21740 8247672 0.26 8269412 14 21241 8252000 0.26 8273241 15 21569 8263831 0.26 8285400 16 21393 8268278 0.26 8289671 17 21929 8282795 0.26 8304724 18 22033 8268619 0.27 8290652 19 22109 8267301 0.27 8289410 20 21994 8229211 0.27 8251205 21 21723 8236824 0.26 8258547 22 22113 8186962 0.27 8209075 23 21978 8176313 0.27 8198291 24 22100 8176895 0.27 8198995 25 22001 8180367 0.27 8202368 26 22288 8160007 0.27 8182295 27 22151 8190868 0.27 8213019 28 22291 8188817 0.27 8211108 29 21936 8151045 0.27 8172981 30 21930 8152235 0.27 8174165 31 22288 8138758 0.27 8161046 32 22199 8091483 0.27 8113682 33 21979 8084696 0.27 8106675 34 22158 8054535 0.27 8076693 35 22016 8055967 0.27 8077983 36 21998 8060179 0.27 8082177 37 21819 8053169 0.27 8074988 38 22244 8054994 0.28 8077238 39 22077 8046132 0.27 8068209 40 22387 8029845 0.28 8052232 41 21987 8012010 0.27 8033997 42 21935 7991818 0.27 8013753 43 22071 7971893 0.28 7993964 44 22110 7941881 0.28 7963991 45 21811 7941791 0.27 7963602 46 22317 7933186 0.28 7955503 47 22099 7922379 0.28 7944478 48 21851 7932444 0.27 7954295 49 21987 7920885 0.28 7942872 50 21933 7904251 0.28 7926184 51 21928 7879413 0.28 7901341 52 21704 7857498 0.28 7879202 53 21845 7834516 0.28 7856361 54 21401 7821207 0.27 7842608 55 21237 7805984 0.27 7827221 56 21786 7787352 0.28 7809138 57 21479 7774214 0.28 7795693 58 21459 7774532 0.28 7795991 59 21420 7754372 0.28 7775792 60 21594 7740548 0.28 7762142 61 21280 7732030 0.27 7753310 62 21562 7699793 0.28 7721355 63 21288 7686070 0.28 7707358 64 21312 7669932 0.28 7691244 65 21013 7640109 0.27 7661122 66 20945 7635406 0.27 7656351 67 21027 7628284 0.27 7649311 68 21181 7602133 0.28 7623314 69 21022 7581357 0.28 7602379 70 20745 7564694 0.27 7585439 71 20905 7546587 0.28 7567492 72 20919 7535744 0.28 7556663 73 20940 7522894 0.28 7543834 74 20771 7483729 0.28 7504500 75 20581 7474553 0.27 7495134 76 20864 7459804 0.28 7480668 77 20640 7439850 0.28 7460490 78 20559 7431736 0.28 7452295 79 20674 7420081 0.28 7440755 80 20407 7397912 0.28 7418319 81 20222 7386850 0.27 7407072 82 20360 7364397 0.28 7384757 83 20130 7334526 0.27 7354656 84 20153 7313585 0.27 7333738 85 19998 7293787 0.27 7313785 86 19600 7276159 0.27 7295759 87 19814 7268641 0.27 7288455 88 19543 7256585 0.27 7276128 89 19602 7236200 0.27 7255802 90 19542 7222833 0.27 7242375 91 19585 7200838 0.27 7220423 92 19354 7171733 0.27 7191087 93 19308 7154755 0.27 7174063 94 19392 7137024 0.27 7156416 95 19128 7086014 0.27 7105142 96 18933 7067649 0.27 7086582 97 18911 7055826 0.27 7074737 98 19097 7030971 0.27 7050068 99 18800 7025411 0.27 7044211 100 18553 7007457 0.26 7026010 101 18570 6971567 0.27 6990137 102 18862 6961141 0.27 6980003 103 18508 6935793 0.27 6954301 104 18420 6913798 0.27 6932218 105 18668 6885012 0.27 6903680 106 18582 6853070 0.27 6871652 107 18373 6827366 0.27 6845739 108 18171 6809665 0.27 6827836 109 18171 6791706 0.27 6809877 110 18285 6772437 0.27 6790722 111 17831 6761659 0.26 6779490 112 18125 6734154 0.27 6752279 113 18023 6704309 0.27 6722332 114 17673 6684735 0.26 6702408 115 17797 6649015 0.27 6666812 116 17581 6622353 0.26 6639934 117 17893 6593144 0.27 6611037 118 17467 6566839 0.27 6584306 119 17673 6534477 0.27 6552150 120 17427 6524726 0.27 6542153 121 17405 6500336 0.27 6517741 122 17338 6476402 0.27 6493740 123 17380 6452859 0.27 6470239 124 17373 6418901 0.27 6436274 125 17376 6383234 0.27 6400610 126 17017 6356288 0.27 6373305 127 17190 6332235 0.27 6349425 128 17062 6291968 0.27 6309030 129 17106 6275760 0.27 6292866 130 16785 6249321 0.27 6266106 131 17069 6223839 0.27 6240908 132 16927 6196712 0.27 6213639 133 17046 6171943 0.28 6188989 134 17145 6139740 0.28 6156885 135 16819 6111202 0.27 6128021 136 17173 6081545 0.28 6098718 137 17090 6044419 0.28 6061509 138 16649 6017141 0.28 6033790 139 16730 5983294 0.28 6000024 140 16715 5947399 0.28 5964114 141 16510 5923493 0.28 5940003 142 16673 5893973 0.28 5910646 143 16983 5865272 0.29 5882255 144 16744 5830877 0.29 5847621 145 16815 5798125 0.29 5814940 146 16980 5749950 0.29 5766930 147 17089 5703332 0.30 5720421 148 17275 5632192 0.31 5649467 149 16177 5193563 0.31 5209740 150 10952 0 100.00 10952