CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 88118 695586 11.24 783704 2 108369 729254 12.94 837623 3 102137 778069 11.60 880206 4 99358 746945 11.74 846303 5 110942 820787 11.91 931729 6 114960 847780 11.94 962740 7 110644 792074 12.26 902718 8 113892 826936 12.11 940828 9 112589 807912 12.23 920501 10 109736 792667 12.16 902403 11 110652 798218 12.17 908870 12 112355 799400 12.32 911755 13 111271 797916 12.24 909187 14 112773 803107 12.31 915880 15 113186 804999 12.33 918185 16 113228 810086 12.26 923314 17 112878 810633 12.22 923511 18 114256 818207 12.25 932463 19 113957 818010 12.23 931967 20 114347 818752 12.25 933099 21 114752 818905 12.29 933657 22 114572 813673 12.34 928245 23 114692 813957 12.35 928649 24 115454 817213 12.38 932667 25 114426 820106 12.24 934532 26 114897 824794 12.23 939691 27 114997 825684 12.22 940681 28 114241 825094 12.16 939335 29 114700 826777 12.18 941477 30 115173 827466 12.22 942639 31 115165 820830 12.30 935995 32 115042 823346 12.26 938388 33 115548 823715 12.30 939263 34 115515 823129 12.31 938644 35 115748 824675 12.31 940423 36 115995 830645 12.25 946640 37 115659 828299 12.25 943958 38 115094 829836 12.18 944930 39 115875 832110 12.22 947985 40 116570 829123 12.33 945693 41 115782 829494 12.25 945276 42 115740 832930 12.20 948670 43 115447 827067 12.25 942514 44 115800 827194 12.28 942994 45 115772 830704 12.23 946476 46 115441 830384 12.21 945825 47 115762 835155 12.17 950917 48 115810 833356 12.20 949166 49 115090 829510 12.18 944600 50 115183 830143 12.18 945326 51 116128 830815 12.26 946943 52 116247 828833 12.30 945080 53 115550 827527 12.25 943077 54 115438 828482 12.23 943920 55 115293 826077 12.25 941370 56 115336 829364 12.21 944700 57 115287 832099 12.17 947386 58 114994 828233 12.19 943227 59 114723 826380 12.19 941103 60 115270 828269 12.22 943539 61 115153 827018 12.22 942171 62 115053 828365 12.20 943418 63 115835 831156 12.23 946991 64 114349 827146 12.15 941495 65 115004 826610 12.21 941614 66 114720 828656 12.16 943376 67 114545 827488 12.16 942033 68 114581 827721 12.16 942302 69 114639 826092 12.19 940731 70 114886 827779 12.19 942665 71 114827 826857 12.19 941684 72 114988 827493 12.20 942481 73 114362 825436 12.17 939798 74 114374 822966 12.20 937340 75 114831 825922 12.21 940753 76 113985 826428 12.12 940413 77 114849 825458 12.21 940307 78 114786 829667 12.15 944453 79 114709 826286 12.19 940995 80 113975 824954 12.14 938929 81 114060 826290 12.13 940350 82 114884 826984 12.20 941868 83 113194 825113 12.06 938307 84 113934 825365 12.13 939299 85 114077 824843 12.15 938920 86 114448 826389 12.16 940837 87 113937 826783 12.11 940720 88 113679 826232 12.09 939911 89 113739 826712 12.09 940451 90 113586 828363 12.06 941949 91 113241 825487 12.06 938728 92 113208 825336 12.06 938544 93 113792 825527 12.11 939319 94 113358 824245 12.09 937603 95 112674 826018 12.00 938692 96 112815 822946 12.06 935761 97 113081 824668 12.06 937749 98 112577 823604 12.03 936181 99 112945 824958 12.04 937903 100 112786 823824 12.04 936610 101 111850 821663 11.98 933513 102 111602 823564 11.93 935166 103 112423 823731 12.01 936154 104 111532 823041 11.93 934573 105 112137 821915 12.01 934052 106 112133 821327 12.01 933460 107 111456 821693 11.94 933149 108 111716 821737 11.97 933453 109 112025 820432 12.01 932457 110 111895 822276 11.98 934171 111 112015 820477 12.01 932492 112 111449 820480 11.96 931929 113 111158 820322 11.93 931480 114 111410 821227 11.95 932637 115 111051 821554 11.91 932605 116 110880 819643 11.92 930523 117 110839 821011 11.89 931850 118 110467 820284 11.87 930751 119 110208 819670 11.85 929878 120 110553 819587 11.89 930140 121 109856 819113 11.83 928969 122 110421 816572 11.91 926993 123 110591 817992 11.91 928583 124 109984 816524 11.87 926508 125 109225 816449 11.80 925674 126 109911 817270 11.85 927181 127 108928 817290 11.76 926218 128 109072 816674 11.78 925746 129 108269 816826 11.70 925095 130 107649 814422 11.67 922071 131 108026 813946 11.72 921972 132 108560 814123 11.77 922683 133 108183 812477 11.75 920660 134 107594 813184 11.69 920778 135 108149 815089 11.71 923238 136 107378 811947 11.68 919325 137 107139 811515 11.66 918654 138 106727 812375 11.61 919102 139 107867 810455 11.75 918322 140 106414 807723 11.64 914137 141 106386 807655 11.64 914041 142 105598 806630 11.58 912228 143 105610 805043 11.60 910653 144 104929 805253 11.53 910182 145 104686 804354 11.52 909040 146 105568 806938 11.57 912506 147 104572 806046 11.48 910618 148 103778 802605 11.45 906383 149 100388 800478 11.14 900866 150 88948 748777 10.62 837725 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2551 1859411 0.14 1861962 2 2641 1185870 0.22 1188511 3 2344 1118711 0.21 1121055 4 2239 1188768 0.19 1191007 5 2692 1328408 0.20 1331100 6 2778 1308557 0.21 1311335 7 2770 1289618 0.21 1292388 8 2925 1310275 0.22 1313200 9 2904 1282451 0.23 1285355 10 2894 1265774 0.23 1268668 11 2843 1273810 0.22 1276653 12 2980 1272573 0.23 1275553 13 2956 1276195 0.23 1279151 14 3051 1279388 0.24 1282439 15 3157 1274001 0.25 1277158 16 3185 1283551 0.25 1286736 17 3121 1288198 0.24 1291319 18 3378 1287847 0.26 1291225 19 3331 1298040 0.26 1301371 20 3314 1289295 0.26 1292609 21 3289 1291436 0.25 1294725 22 3201 1293883 0.25 1297084 23 3375 1295761 0.26 1299136 24 3321 1295247 0.26 1298568 25 3353 1297371 0.26 1300724 26 3423 1299687 0.26 1303110 27 3334 1299987 0.26 1303321 28 3400 1308130 0.26 1311530 29 3338 1306070 0.25 1309408 30 3406 1304772 0.26 1308178 31 3490 1309341 0.27 1312831 32 3397 1305558 0.26 1308955 33 3359 1306319 0.26 1309678 34 3455 1306384 0.26 1309839 35 3485 1305677 0.27 1309162 36 3528 1309298 0.27 1312826 37 3508 1313297 0.27 1316805 38 3529 1311450 0.27 1314979 39 3540 1312796 0.27 1316336 40 3528 1315034 0.27 1318562 41 3485 1313424 0.26 1316909 42 3540 1311333 0.27 1314873 43 3504 1313643 0.27 1317147 44 3449 1312037 0.26 1315486 45 3462 1310312 0.26 1313774 46 3449 1316776 0.26 1320225 47 3419 1314188 0.26 1317607 48 3482 1312530 0.26 1316012 49 3429 1312076 0.26 1315505 50 3465 1313774 0.26 1317239 51 3486 1313431 0.26 1316917 52 3519 1312323 0.27 1315842 53 3561 1315298 0.27 1318859 54 3487 1310222 0.27 1313709 55 3510 1315015 0.27 1318525 56 3531 1312906 0.27 1316437 57 3595 1310253 0.27 1313848 58 3541 1310870 0.27 1314411 59 3574 1311408 0.27 1314982 60 3531 1308264 0.27 1311795 61 3598 1313699 0.27 1317297 62 3575 1313668 0.27 1317243 63 3655 1312133 0.28 1315788 64 3643 1313644 0.28 1317287 65 3513 1314347 0.27 1317860 66 3539 1310851 0.27 1314390 67 3524 1311124 0.27 1314648 68 3672 1306967 0.28 1310639 69 3714 1309635 0.28 1313349 70 3630 1313633 0.28 1317263 71 3514 1314918 0.27 1318432 72 3713 1313917 0.28 1317630 73 3714 1311321 0.28 1315035 74 3654 1312394 0.28 1316048 75 3650 1313085 0.28 1316735 76 3604 1314532 0.27 1318136 77 3685 1313154 0.28 1316839 78 3597 1313448 0.27 1317045 79 3639 1315081 0.28 1318720 80 3579 1315790 0.27 1319369 81 3515 1312108 0.27 1315623 82 3645 1313228 0.28 1316873 83 3749 1313964 0.28 1317713 84 3608 1310495 0.27 1314103 85 3651 1314700 0.28 1318351 86 3672 1314462 0.28 1318134 87 3625 1310489 0.28 1314114 88 3755 1310456 0.29 1314211 89 3646 1311981 0.28 1315627 90 3676 1309944 0.28 1313620 91 3630 1313124 0.28 1316754 92 3670 1313655 0.28 1317325 93 3511 1310333 0.27 1313844 94 3730 1311721 0.28 1315451 95 3668 1311664 0.28 1315332 96 3650 1307615 0.28 1311265 97 3694 1311242 0.28 1314936 98 3774 1310202 0.29 1313976 99 3644 1305452 0.28 1309096 100 3531 1307979 0.27 1311510 101 3572 1308057 0.27 1311629 102 3692 1305764 0.28 1309456 103 3711 1309431 0.28 1313142 104 3613 1304993 0.28 1308606 105 3610 1305517 0.28 1309127 106 3659 1307083 0.28 1310742 107 3625 1306585 0.28 1310210 108 3629 1303721 0.28 1307350 109 3700 1306218 0.28 1309918 110 3659 1304745 0.28 1308404 111 3562 1304076 0.27 1307638 112 3499 1302722 0.27 1306221 113 3629 1303593 0.28 1307222 114 3513 1301385 0.27 1304898 115 3551 1301206 0.27 1304757 116 3630 1299364 0.28 1302994 117 3607 1302682 0.28 1306289 118 3559 1301863 0.27 1305422 119 3566 1301353 0.27 1304919 120 3678 1300024 0.28 1303702 121 3575 1299270 0.27 1302845 122 3524 1295818 0.27 1299342 123 3706 1295103 0.29 1298809 124 3575 1295377 0.28 1298952 125 3525 1293742 0.27 1297267 126 3538 1291097 0.27 1294635 127 3502 1294699 0.27 1298201 128 3543 1289884 0.27 1293427 129 3621 1290041 0.28 1293662 130 3538 1289485 0.27 1293023 131 3489 1287475 0.27 1290964 132 3617 1285687 0.28 1289304 133 3538 1288414 0.27 1291952 134 3670 1288594 0.28 1292264 135 3643 1285536 0.28 1289179 136 3486 1285227 0.27 1288713 137 3634 1283932 0.28 1287566 138 3507 1280098 0.27 1283605 139 3529 1283325 0.27 1286854 140 3504 1277355 0.27 1280859 141 3669 1274712 0.29 1278381 142 3580 1275769 0.28 1279349 143 3651 1271064 0.29 1274715 144 3602 1268442 0.28 1272044 145 3730 1274715 0.29 1278445 146 4043 1272464 0.32 1276507 147 4036 1267463 0.32 1271499 148 4071 1265607 0.32 1269678 149 3916 1260070 0.31 1263986 150 3403 1156154 0.29 1159557 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 7898 5578009 0.14 5585907 2 8135 4522390 0.18 4530525 3 8392 4865877 0.17 4874269 4 8164 5366939 0.15 5375103 5 8824 5822522 0.15 5831346 6 9302 5956527 0.16 5965829 7 9089 5749267 0.16 5758356 8 9635 5796524 0.17 5806159 9 9627 5630090 0.17 5639717 10 9252 5537444 0.17 5546696 11 9590 5550903 0.17 5560493 12 9850 5549605 0.18 5559455 13 10023 5534502 0.18 5544525 14 10076 5547182 0.18 5557258 15 10436 5550563 0.19 5560999 16 10129 5593028 0.18 5603157 17 10438 5606164 0.19 5616602 18 10640 5636045 0.19 5646685 19 10745 5638350 0.19 5649095 20 10924 5621772 0.19 5632696 21 10791 5621417 0.19 5632208 22 10868 5607064 0.19 5617932 23 10953 5601500 0.20 5612453 24 11252 5616763 0.20 5628015 25 11207 5620947 0.20 5632154 26 11285 5641425 0.20 5652710 27 11372 5661647 0.20 5673019 28 11435 5673626 0.20 5685061 29 11468 5675780 0.20 5687248 30 11412 5679673 0.20 5691085 31 11378 5668844 0.20 5680222 32 11561 5653184 0.20 5664745 33 11588 5649266 0.20 5660854 34 11418 5648717 0.20 5660135 35 11500 5645344 0.20 5656844 36 11686 5665996 0.21 5677682 37 11734 5669803 0.21 5681537 38 11722 5674290 0.21 5686012 39 12000 5693628 0.21 5705628 40 11595 5686412 0.20 5698007 41 12029 5665172 0.21 5677201 42 11712 5673490 0.21 5685202 43 11759 5664442 0.21 5676201 44 11781 5652015 0.21 5663796 45 11699 5662028 0.21 5673727 46 11564 5662199 0.20 5673763 47 11880 5668502 0.21 5680382 48 11687 5682107 0.21 5693794 49 11982 5679032 0.21 5691014 50 12068 5680167 0.21 5692235 51 11848 5677885 0.21 5689733 52 11977 5687764 0.21 5699741 53 12124 5677608 0.21 5689732 54 12148 5679036 0.21 5691184 55 12034 5669113 0.21 5681147 56 12194 5670771 0.21 5682965 57 12107 5667316 0.21 5679423 58 12208 5674120 0.21 5686328 59 11937 5669365 0.21 5681302 60 12027 5682880 0.21 5694907 61 12039 5681692 0.21 5693731 62 12170 5679861 0.21 5692031 63 12171 5684699 0.21 5696870 64 11900 5684120 0.21 5696020 65 12245 5676229 0.22 5688474 66 12317 5694853 0.22 5707170 67 12268 5691539 0.22 5703807 68 12241 5691656 0.21 5703897 69 12236 5691666 0.21 5703902 70 12237 5696100 0.21 5708337 71 12170 5692372 0.21 5704542 72 12303 5689771 0.22 5702074 73 12162 5691781 0.21 5703943 74 12230 5680328 0.21 5692558 75 12123 5679177 0.21 5691300 76 12383 5687539 0.22 5699922 77 12174 5685967 0.21 5698141 78 12545 5690158 0.22 5702703 79 12583 5692527 0.22 5705110 80 12163 5684322 0.21 5696485 81 12412 5689035 0.22 5701447 82 12364 5692581 0.22 5704945 83 12455 5688787 0.22 5701242 84 12220 5694702 0.21 5706922 85 12331 5683930 0.22 5696261 86 12221 5686537 0.21 5698758 87 12294 5679161 0.22 5691455 88 12085 5685788 0.21 5697873 89 12357 5695926 0.22 5708283 90 12389 5704075 0.22 5716464 91 12353 5704517 0.22 5716870 92 12419 5692665 0.22 5705084 93 12261 5699243 0.21 5711504 94 12102 5699437 0.21 5711539 95 12335 5697594 0.22 5709929 96 12559 5699883 0.22 5712442 97 12238 5691865 0.21 5704103 98 12387 5692662 0.22 5705049 99 12417 5695214 0.22 5707631 100 12335 5701868 0.22 5714203 101 12272 5698578 0.21 5710850 102 12430 5694888 0.22 5707318 103 12252 5692403 0.21 5704655 104 12294 5690398 0.22 5702692 105 12225 5687194 0.21 5699419 106 12432 5694914 0.22 5707346 107 12156 5684822 0.21 5696978 108 12115 5679900 0.21 5692015 109 12191 5683694 0.21 5695885 110 12207 5685090 0.21 5697297 111 12248 5686255 0.21 5698503 112 12221 5677194 0.21 5689415 113 12394 5672388 0.22 5684782 114 12406 5669280 0.22 5681686 115 12424 5672271 0.22 5684695 116 12347 5666426 0.22 5678773 117 12191 5673628 0.21 5685819 118 12390 5671330 0.22 5683720 119 12234 5662884 0.22 5675118 120 12348 5661920 0.22 5674268 121 12317 5656713 0.22 5669030 122 12600 5652340 0.22 5664940 123 12350 5651442 0.22 5663792 124 12429 5651048 0.22 5663477 125 12631 5642597 0.22 5655228 126 12351 5643947 0.22 5656298 127 12361 5641191 0.22 5653552 128 12332 5633537 0.22 5645869 129 12358 5632840 0.22 5645198 130 12196 5622570 0.22 5634766 131 12123 5618947 0.22 5631070 132 12489 5614143 0.22 5626632 133 12559 5612533 0.22 5625092 134 12646 5602185 0.23 5614831 135 12585 5604297 0.22 5616882 136 12521 5588629 0.22 5601150 137 12364 5583995 0.22 5596359 138 12513 5587764 0.22 5600277 139 12385 5584169 0.22 5596554 140 12365 5577732 0.22 5590097 141 12645 5573118 0.23 5585763 142 12526 5563725 0.22 5576251 143 12729 5556110 0.23 5568839 144 12594 5553601 0.23 5566195 145 13168 5554304 0.24 5567472 146 13600 5560232 0.24 5573832 147 13937 5551800 0.25 5565737 148 13745 5531356 0.25 5545101 149 13406 5486280 0.24 5499686 150 12032 5153320 0.23 5165352 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2799 1226629 0.23 1229428 2 30075 988626 2.95 1018701 3 63601 704982 8.28 768583 4 74137 764914 8.84 839051 5 72945 741248 8.96 814193 6 79577 819207 8.85 898784 7 85005 847519 9.12 932524 8 82016 790378 9.40 872394 9 87884 822023 9.66 909907 10 86830 797239 9.82 884069 11 86099 780930 9.93 867029 12 87588 780283 10.09 867871 13 89176 782700 10.23 871876 14 89313 780057 10.27 869370 15 90388 786979 10.30 877367 16 91127 784983 10.40 876110 17 91487 791948 10.36 883435 18 91889 789145 10.43 881034 19 92636 795241 10.43 887877 20 93321 795525 10.50 888846 21 94151 790923 10.64 885074 22 94517 788093 10.71 882610 23 94574 787092 10.73 881666 24 94336 781998 10.76 876334 25 94494 786557 10.73 881051 26 94865 788772 10.74 883637 27 94896 788793 10.74 883689 28 95585 788676 10.81 884261 29 95038 785026 10.80 880064 30 94858 785235 10.78 880093 31 95282 784027 10.84 879309 32 94641 777494 10.85 872135 33 94924 777103 10.89 872027 34 95353 776214 10.94 871567 35 95418 774313 10.97 869731 36 95386 774413 10.97 869799 37 95712 777817 10.96 873529 38 95885 777286 10.98 873171 39 95456 772349 11.00 867805 40 95750 772274 11.03 868024 41 95714 770963 11.04 866677 42 95476 766770 11.07 862246 43 96392 769432 11.13 865824 44 96601 763593 11.23 860194 45 96041 760792 11.21 856833 46 96410 762563 11.22 858973 47 96074 760994 11.21 857068 48 95618 761994 11.15 857612 49 96446 758461 11.28 854907 50 95193 756228 11.18 851421 51 95013 752597 11.21 847610 52 95729 750554 11.31 846283 53 96343 750132 11.38 846475 54 95542 746534 11.35 842076 55 95127 745059 11.32 840186 56 96055 744726 11.42 840781 57 95541 742776 11.40 838317 58 95590 743786 11.39 839376 59 94825 741635 11.34 836460 60 94828 736135 11.41 830963 61 94504 734613 11.40 829117 62 94876 732588 11.47 827464 63 95032 732093 11.49 827125 64 94834 732025 11.47 826859 65 94809 728158 11.52 822967 66 94436 724562 11.53 818998 67 94048 726578 11.46 820626 68 94191 723357 11.52 817548 69 93505 719666 11.50 813171 70 93844 719607 11.54 813451 71 94329 717874 11.61 812203 72 93949 714554 11.62 808503 73 93189 715099 11.53 808288 74 93149 708887 11.61 802036 75 92794 707730 11.59 800524 76 92929 706735 11.62 799664 77 92817 705233 11.63 798050 78 92856 704221 11.65 797077 79 92667 703960 11.63 796627 80 92268 701365 11.63 793633 81 92115 698624 11.65 790739 82 92344 697619 11.69 789963 83 91269 695702 11.60 786971 84 91382 691248 11.68 782630 85 91022 689050 11.67 780072 86 91142 687782 11.70 778924 87 90782 685272 11.70 776054 88 91048 684977 11.73 776025 89 90761 683346 11.72 774107 90 90215 682353 11.68 772568 91 90382 680225 11.73 770607 92 90179 677802 11.74 767981 93 89665 674936 11.73 764601 94 90251 673420 11.82 763671 95 89306 669845 11.76 759151 96 88909 667746 11.75 756655 97 88619 666262 11.74 754881 98 88795 665865 11.77 754660 99 88478 661048 11.80 749526 100 88225 660584 11.78 748809 101 87831 657264 11.79 745095 102 88100 654806 11.86 742906 103 87579 653446 11.82 741025 104 86994 651338 11.78 738332 105 86609 646459 11.81 733068 106 86775 646010 11.84 732785 107 86036 644380 11.78 730416 108 85816 638281 11.85 724097 109 85546 638755 11.81 724301 110 85083 636365 11.79 721448 111 85418 633819 11.88 719237 112 85119 631300 11.88 716419 113 84657 628462 11.87 713119 114 84678 626703 11.90 711381 115 84593 623773 11.94 708366 116 84081 621829 11.91 705910 117 83508 618546 11.89 702054 118 83574 617568 11.92 701142 119 82419 616070 11.80 698489 120 82435 611375 11.88 693810 121 82678 610269 11.93 692947 122 81768 608316 11.85 690084 123 81322 604719 11.85 686041 124 80980 602714 11.84 683694 125 80633 599403 11.86 680036 126 80672 595704 11.93 676376 127 80191 593363 11.91 673554 128 79424 591576 11.84 671000 129 79286 587227 11.90 666513 130 79143 585049 11.92 664192 131 78392 583003 11.85 661395 132 77869 579181 11.85 657050 133 78034 577419 11.91 655453 134 77323 574499 11.86 651822 135 76783 570949 11.85 647732 136 76447 567802 11.87 644249 137 76332 565803 11.89 642135 138 76026 562217 11.91 638243 139 75455 559884 11.88 635339 140 75101 556868 11.88 631969 141 75369 553121 11.99 628490 142 74250 550194 11.89 624444 143 73733 546416 11.89 620149 144 73689 542868 11.95 616557 145 73154 540294 11.93 613448 146 72151 536722 11.85 608873 147 71954 531205 11.93 603159 148 71095 523588 11.96 594683 149 69792 472925 12.86 542717 150 61465 0 100.00 61465 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 973 1232990 0.08 1233963 2 1799 1261413 0.14 1263212 3 5133 2124227 0.24 2129360 4 5481 1154341 0.47 1159822 5 2434 1114859 0.22 1117293 6 2463 1147654 0.21 1150117 7 2611 1266570 0.21 1269181 8 2684 1248483 0.21 1251167 9 2727 1231718 0.22 1234445 10 2679 1249467 0.21 1252146 11 2602 1222031 0.21 1224633 12 2598 1203052 0.22 1205650 13 2611 1205959 0.22 1208570 14 2683 1206269 0.22 1208952 15 2742 1212966 0.23 1215708 16 2573 1213156 0.21 1215729 17 2702 1209463 0.22 1212165 18 2737 1219104 0.22 1221841 19 2873 1217955 0.24 1220828 20 2703 1213832 0.22 1216535 21 2773 1220978 0.23 1223751 22 2871 1210492 0.24 1213363 23 2813 1215518 0.23 1218331 24 2828 1220208 0.23 1223036 25 2869 1216511 0.24 1219380 26 2824 1216199 0.23 1219023 27 2867 1219166 0.23 1222033 28 2920 1213932 0.24 1216852 29 2916 1211048 0.24 1213964 30 2936 1218252 0.24 1221188 31 2832 1209551 0.23 1212383 32 2956 1207118 0.24 1210074 33 2848 1207870 0.24 1210718 34 2899 1205217 0.24 1208116 35 2928 1205133 0.24 1208061 36 2887 1206269 0.24 1209156 37 2864 1202546 0.24 1205410 38 3082 1202083 0.26 1205165 39 2913 1203628 0.24 1206541 40 2951 1197900 0.25 1200851 41 2976 1196376 0.25 1199352 42 2972 1194272 0.25 1197244 43 2881 1191324 0.24 1194205 44 2983 1187129 0.25 1190112 45 2972 1188812 0.25 1191784 46 2915 1185138 0.25 1188053 47 2942 1181239 0.25 1184181 48 3009 1184464 0.25 1187473 49 2999 1180654 0.25 1183653 50 2936 1175639 0.25 1178575 51 2924 1175568 0.25 1178492 52 2961 1169824 0.25 1172785 53 2976 1169076 0.25 1172052 54 2950 1166268 0.25 1169218 55 2900 1166019 0.25 1168919 56 2964 1160947 0.25 1163911 57 2893 1162423 0.25 1165316 58 2871 1158822 0.25 1161693 59 3031 1151945 0.26 1154976 60 2973 1150992 0.26 1153965 61 2871 1149537 0.25 1152408 62 2932 1143984 0.26 1146916 63 2852 1145843 0.25 1148695 64 2875 1142325 0.25 1145200 65 2867 1136866 0.25 1139733 66 2865 1141763 0.25 1144628 67 2929 1136135 0.26 1139064 68 2970 1130533 0.26 1133503 69 2968 1131326 0.26 1134294 70 2881 1123636 0.26 1126517 71 2889 1123539 0.26 1126428 72 2822 1126107 0.25 1128929 73 2944 1118044 0.26 1120988 74 2914 1114748 0.26 1117662 75 2772 1115313 0.25 1118085 76 2895 1112658 0.26 1115553 77 2926 1108554 0.26 1111480 78 2911 1109129 0.26 1112040 79 2902 1105103 0.26 1108005 80 2790 1099009 0.25 1101799 81 2847 1099069 0.26 1101916 82 2819 1096367 0.26 1099186 83 2879 1090574 0.26 1093453 84 2824 1091789 0.26 1094613 85 2822 1085799 0.26 1088621 86 2845 1077367 0.26 1080212 87 2852 1082335 0.26 1085187 88 2881 1075389 0.27 1078270 89 2822 1070859 0.26 1073681 90 2793 1072744 0.26 1075537 91 2718 1068281 0.25 1070999 92 2809 1062207 0.26 1065016 93 2797 1063358 0.26 1066155 94 2790 1060003 0.26 1062793 95 2835 1053812 0.27 1056647 96 2817 1053530 0.27 1056347 97 2751 1047612 0.26 1050363 98 2768 1043041 0.26 1045809 99 2786 1044646 0.27 1047432 100 2686 1038751 0.26 1041437 101 2815 1032222 0.27 1035037 102 2727 1032227 0.26 1034954 103 2753 1028698 0.27 1031451 104 2772 1021640 0.27 1024412 105 2838 1022244 0.28 1025082 106 2747 1013416 0.27 1016163 107 2734 1012601 0.27 1015335 108 2726 1010547 0.27 1013273 109 2602 1004842 0.26 1007444 110 2745 1000847 0.27 1003592 111 2751 999476 0.27 1002227 112 2735 996680 0.27 999415 113 2658 991336 0.27 993994 114 2668 989177 0.27 991845 115 2685 983534 0.27 986219 116 2631 977960 0.27 980591 117 2640 975430 0.27 978070 118 2599 967979 0.27 970578 119 2656 965377 0.27 968033 120 2644 965549 0.27 968193 121 2545 958719 0.26 961264 122 2644 955953 0.28 958597 123 2528 953278 0.26 955806 124 2584 942477 0.27 945061 125 2574 942830 0.27 945404 126 2492 938469 0.26 940961 127 2563 932765 0.27 935328 128 2712 926156 0.29 928868 129 2619 924962 0.28 927581 130 2627 920488 0.28 923115 131 2601 914870 0.28 917471 132 2631 910339 0.29 912970 133 2600 905864 0.29 908464 134 2561 898153 0.28 900714 135 2598 896246 0.29 898844 136 2513 892373 0.28 894886 137 2581 887581 0.29 890162 138 2533 884028 0.29 886561 139 2461 878507 0.28 880968 140 2586 872388 0.30 874974 141 2576 868614 0.30 871190 142 2493 865107 0.29 867600 143 2575 856699 0.30 859274 144 2588 853592 0.30 856180 145 2470 846487 0.29 848957 146 2508 840454 0.30 842962 147 2533 833399 0.30 835932 148 2615 822575 0.32 825190 149 2274 753836 0.30 756110 150 1805 0 100.00 1805 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4715 6234749 0.08 6239464 2 6215 5078187 0.12 5084402 3 8833 5957177 0.15 5966010 4 10213 6388357 0.16 6398570 5 8861 5635594 0.16 5644455 6 8314 5246216 0.16 5254530 7 8536 5274424 0.16 5282960 8 8563 5171536 0.17 5180099 9 8779 5259719 0.17 5268498 10 9249 5240357 0.18 5249606 11 9078 5263175 0.17 5272253 12 9259 5288624 0.17 5297883 13 9419 5287240 0.18 5296659 14 9408 5279522 0.18 5288930 15 9624 5301976 0.18 5311600 16 9663 5315178 0.18 5324841 17 9617 5324069 0.18 5333686 18 9866 5304922 0.19 5314788 19 9930 5308795 0.19 5318725 20 9816 5286803 0.19 5296619 21 9844 5278943 0.19 5288787 22 9735 5264191 0.18 5273926 23 9981 5253629 0.19 5263610 24 9957 5253298 0.19 5263255 25 10415 5277674 0.20 5288089 26 10359 5270278 0.20 5280637 27 10300 5276046 0.19 5286346 28 10502 5273730 0.20 5284232 29 10561 5245620 0.20 5256181 30 10357 5239040 0.20 5249397 31 10266 5226282 0.20 5236548 32 10601 5204530 0.20 5215131 33 10377 5205145 0.20 5215522 34 10465 5195075 0.20 5205540 35 10674 5194903 0.21 5205577 36 10552 5201992 0.20 5212544 37 10477 5205264 0.20 5215741 38 10464 5197109 0.20 5207573 39 10406 5187023 0.20 5197429 40 10518 5177676 0.20 5188194 41 10557 5160329 0.20 5170886 42 10518 5143132 0.20 5153650 43 10494 5140866 0.20 5151360 44 10642 5125736 0.21 5136378 45 10589 5124036 0.21 5134625 46 10570 5122019 0.21 5132589 47 10779 5124372 0.21 5135151 48 10521 5120221 0.21 5130742 49 10574 5105277 0.21 5115851 50 10768 5091551 0.21 5102319 51 10508 5074126 0.21 5084634 52 10511 5067694 0.21 5078205 53 10664 5051549 0.21 5062213 54 10561 5044239 0.21 5054800 55 10575 5042144 0.21 5052719 56 10620 5029618 0.21 5040238 57 10408 5023096 0.21 5033504 58 10520 5024997 0.21 5035517 59 10544 5005564 0.21 5016108 60 10379 4994268 0.21 5004647 61 10549 4982523 0.21 4993072 62 10605 4960816 0.21 4971421 63 10578 4959789 0.21 4970367 64 10736 4954534 0.22 4965270 65 10583 4930052 0.21 4940635 66 10421 4928900 0.21 4939321 67 10326 4924464 0.21 4934790 68 10596 4904087 0.22 4914683 69 10516 4889544 0.21 4900060 70 10374 4876814 0.21 4887188 71 10516 4870256 0.22 4880772 72 10586 4858295 0.22 4868881 73 10361 4852292 0.21 4862653 74 10211 4831948 0.21 4842159 75 10263 4824298 0.21 4834561 76 10595 4822536 0.22 4833131 77 10310 4808058 0.21 4818368 78 10300 4800530 0.21 4810830 79 10262 4799077 0.21 4809339 80 10215 4780460 0.21 4790675 81 10306 4765606 0.22 4775912 82 10150 4757858 0.21 4768008 83 10089 4737663 0.21 4747752 84 10059 4724080 0.21 4734139 85 10060 4718367 0.21 4728427 86 10040 4710070 0.21 4720110 87 10021 4696039 0.21 4706060 88 9869 4689173 0.21 4699042 89 10105 4677359 0.22 4687464 90 9900 4660647 0.21 4670547 91 9961 4649323 0.21 4659284 92 9848 4632412 0.21 4642260 93 9606 4616004 0.21 4625610 94 9896 4609625 0.21 4619521 95 9584 4586306 0.21 4595890 96 9700 4574427 0.21 4584127 97 9738 4563659 0.21 4573397 98 9515 4538878 0.21 4548393 99 9663 4524756 0.21 4534419 100 9666 4521970 0.21 4531636 101 9397 4500904 0.21 4510301 102 9494 4488559 0.21 4498053 103 9429 4476347 0.21 4485776 104 9626 4462048 0.22 4471674 105 9523 4440065 0.21 4449588 106 9738 4428490 0.22 4438228 107 9431 4410175 0.21 4419606 108 9373 4391007 0.21 4400380 109 9454 4379916 0.22 4389370 110 9432 4360961 0.22 4370393 111 9457 4350237 0.22 4359694 112 9422 4335700 0.22 4345122 113 9158 4317467 0.21 4326625 114 9207 4306411 0.21 4315618 115 9228 4291087 0.21 4300315 116 9279 4267238 0.22 4276517 117 9239 4249759 0.22 4258998 118 9086 4237890 0.21 4246976 119 9209 4212050 0.22 4221259 120 9240 4196638 0.22 4205878 121 9115 4183508 0.22 4192623 122 9074 4159897 0.22 4168971 123 9109 4143847 0.22 4152956 124 9129 4126768 0.22 4135897 125 9128 4110514 0.22 4119642 126 8908 4090934 0.22 4099842 127 9143 4074285 0.22 4083428 128 8996 4047073 0.22 4056069 129 8926 4034766 0.22 4043692 130 9050 4018612 0.22 4027662 131 9039 3997301 0.23 4006340 132 8915 3978365 0.22 3987280 133 9039 3961571 0.23 3970610 134 9195 3937264 0.23 3946459 135 9205 3919893 0.23 3929098 136 8940 3907707 0.23 3916647 137 9045 3882553 0.23 3891598 138 9085 3858664 0.23 3867749 139 9018 3837275 0.23 3846293 140 8965 3813136 0.23 3822101 141 8994 3794349 0.24 3803343 142 9009 3775731 0.24 3784740 143 8917 3751072 0.24 3759989 144 8942 3724173 0.24 3733115 145 8990 3707567 0.24 3716557 146 9389 3678353 0.25 3687742 147 9229 3645906 0.25 3655135 148 9272 3602111 0.26 3611383 149 8841 3302971 0.27 3311812 150 6251 0 100.00 6251