CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 158852 953518 14.28 1112370 2 180349 1129113 13.77 1309462 3 139652 1143819 10.88 1283471 4 176901 1342804 11.64 1519705 5 186745 1346665 12.18 1533410 6 186183 1424350 11.56 1610533 7 179187 1271704 12.35 1450891 8 179882 1309490 12.08 1489372 9 177709 1300476 12.02 1478185 10 175473 1284147 12.02 1459620 11 174437 1270377 12.07 1444814 12 175825 1255356 12.29 1431181 13 173780 1244080 12.26 1417860 14 175141 1254354 12.25 1429495 15 174444 1250793 12.24 1425237 16 177512 1272734 12.24 1450246 17 176867 1277309 12.16 1454176 18 178160 1289387 12.14 1467547 19 178680 1291330 12.16 1470010 20 179780 1291151 12.22 1470931 21 178711 1281515 12.24 1460226 22 179420 1271139 12.37 1450559 23 178002 1260161 12.38 1438163 24 177708 1258907 12.37 1436615 25 177171 1263216 12.30 1440387 26 177259 1278251 12.18 1455510 27 178670 1288275 12.18 1466945 28 179007 1291242 12.18 1470249 29 178842 1296869 12.12 1475711 30 179280 1291620 12.19 1470900 31 179344 1283710 12.26 1463054 32 178935 1280111 12.26 1459046 33 177726 1271581 12.26 1449307 34 178570 1270469 12.32 1449039 35 177514 1271411 12.25 1448925 36 178056 1277095 12.24 1455151 37 177676 1283439 12.16 1461115 38 178765 1285345 12.21 1464110 39 178527 1290306 12.15 1468833 40 180811 1299129 12.22 1479940 41 178980 1296238 12.13 1475218 42 179301 1291225 12.19 1470526 43 178352 1282204 12.21 1460556 44 177822 1273284 12.25 1451106 45 178267 1273670 12.28 1451937 46 177514 1278859 12.19 1456373 47 178146 1289726 12.14 1467872 48 178291 1292897 12.12 1471188 49 177836 1290119 12.11 1467955 50 178383 1289824 12.15 1468207 51 178364 1287856 12.16 1466220 52 178755 1290643 12.17 1469398 53 178071 1286339 12.16 1464410 54 177212 1281337 12.15 1458549 55 178079 1280351 12.21 1458430 56 176959 1281792 12.13 1458751 57 177640 1281400 12.18 1459040 58 176785 1284851 12.10 1461636 59 176266 1282940 12.08 1459206 60 177251 1287109 12.10 1464360 61 177317 1290068 12.08 1467385 62 178099 1293027 12.11 1471126 63 177605 1290490 12.10 1468095 64 177135 1286624 12.10 1463759 65 176238 1282260 12.08 1458498 66 176448 1279706 12.12 1456154 67 177511 1284538 12.14 1462049 68 175199 1282076 12.02 1457275 69 175623 1282367 12.05 1457990 70 175921 1286061 12.03 1461982 71 175879 1288520 12.01 1464399 72 176135 1290662 12.01 1466797 73 175723 1286272 12.02 1461995 74 175816 1279623 12.08 1455439 75 175350 1280621 12.04 1455971 76 176241 1280357 12.10 1456598 77 176009 1282667 12.07 1458676 78 175858 1287162 12.02 1463020 79 175866 1287578 12.02 1463444 80 174942 1283917 11.99 1458859 81 174517 1286081 11.95 1460598 82 174797 1283506 11.99 1458303 83 175092 1285443 11.99 1460535 84 174946 1285971 11.98 1460917 85 175115 1281737 12.02 1456852 86 174072 1280858 11.96 1454930 87 174647 1280882 12.00 1455529 88 174612 1283394 11.98 1458006 89 174003 1286347 11.92 1460350 90 174134 1286939 11.92 1461073 91 173558 1289321 11.86 1462879 92 174278 1290816 11.90 1465094 93 173687 1287509 11.89 1461196 94 174284 1285515 11.94 1459799 95 172979 1280124 11.90 1453103 96 173741 1277863 11.97 1451604 97 173677 1281379 11.94 1455056 98 172211 1280465 11.85 1452676 99 172207 1286828 11.80 1459035 100 172068 1284832 11.81 1456900 101 172086 1284048 11.82 1456134 102 171657 1284242 11.79 1455899 103 171404 1286818 11.75 1458222 104 171176 1284669 11.76 1455845 105 171348 1279518 11.81 1450866 106 171151 1278004 11.81 1449155 107 170561 1275200 11.80 1445761 108 170305 1273306 11.80 1443611 109 170424 1278320 11.76 1448744 110 169781 1280228 11.71 1450009 111 170542 1284002 11.72 1454544 112 170530 1283036 11.73 1453566 113 169007 1282489 11.64 1451496 114 169657 1277277 11.73 1446934 115 168243 1277262 11.64 1445505 116 167879 1272221 11.66 1440100 117 168043 1271519 11.67 1439562 118 167714 1274814 11.63 1442528 119 167410 1276239 11.60 1443649 120 166796 1275258 11.57 1442054 121 167394 1280013 11.57 1447407 122 166754 1279377 11.53 1446131 123 166548 1278448 11.53 1444996 124 167037 1278421 11.56 1445458 125 166530 1276053 11.54 1442583 126 166459 1271247 11.58 1437706 127 165427 1268444 11.54 1433871 128 164963 1264910 11.54 1429873 129 164477 1265197 11.50 1429674 130 164499 1267615 11.49 1432114 131 163500 1266922 11.43 1430422 132 163591 1267143 11.43 1430734 133 163385 1268332 11.41 1431717 134 164117 1269734 11.45 1433851 135 163762 1264544 11.47 1428306 136 161941 1263592 11.36 1425533 137 161558 1262558 11.34 1424116 138 160915 1262109 11.31 1423024 139 162297 1262613 11.39 1424910 140 160635 1259176 11.31 1419811 141 161182 1257449 11.36 1418631 142 159830 1255942 11.29 1415772 143 159179 1255715 11.25 1414894 144 159324 1254880 11.27 1414204 145 158126 1255165 11.19 1413291 146 158512 1258460 11.19 1416972 147 157402 1252800 11.16 1410202 148 156034 1251615 11.08 1407649 149 151273 1245619 10.83 1396892 150 133526 1154132 10.37 1287658 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4249 2949914 0.14 2954163 2 4169 1645104 0.25 1649273 3 3395 1764837 0.19 1768232 4 4091 2076742 0.20 2080833 5 4946 2249562 0.22 2254508 6 4623 2124237 0.22 2128860 7 4438 2009367 0.22 2013805 8 4605 2091920 0.22 2096525 9 4635 2035967 0.23 2040602 10 4503 2009289 0.22 2013792 11 4528 2007887 0.23 2012415 12 4720 1992143 0.24 1996863 13 4846 1988114 0.24 1992960 14 4680 1986610 0.24 1991290 15 4873 1979720 0.25 1984593 16 5064 2004774 0.25 2009838 17 5000 2010432 0.25 2015432 18 5253 2003357 0.26 2008610 19 5127 2020342 0.25 2025469 20 5078 2006423 0.25 2011501 21 5241 2012090 0.26 2017331 22 5251 2008168 0.26 2013419 23 5196 2003950 0.26 2009146 24 5355 1998942 0.27 2004297 25 5231 2000870 0.26 2006101 26 5217 2016737 0.26 2021954 27 5261 2014785 0.26 2020046 28 5280 2029990 0.26 2035270 29 5338 2027245 0.26 2032583 30 5370 2017456 0.27 2022826 31 5224 2026869 0.26 2032093 32 5259 2022971 0.26 2028230 33 5299 2018336 0.26 2023635 34 5332 2015931 0.26 2021263 35 5335 2017332 0.26 2022667 36 5177 2019299 0.26 2024476 37 5563 2022076 0.27 2027639 38 5426 2021070 0.27 2026496 39 5427 2027897 0.27 2033324 40 5596 2030548 0.27 2036144 41 5552 2030298 0.27 2035850 42 5584 2022800 0.28 2028384 43 5316 2026928 0.26 2032244 44 5429 2024152 0.27 2029581 45 5304 2018384 0.26 2023688 46 5447 2032737 0.27 2038184 47 5382 2034764 0.26 2040146 48 5440 2029722 0.27 2035162 49 5342 2028832 0.26 2034174 50 5336 2027427 0.26 2032763 51 5523 2025804 0.27 2031327 52 5426 2031109 0.27 2036535 53 5397 2038901 0.26 2044298 54 5531 2032463 0.27 2037994 55 5460 2037917 0.27 2043377 56 5380 2033302 0.26 2038682 57 5378 2026129 0.26 2031507 58 5366 2022732 0.26 2028098 59 5447 2033059 0.27 2038506 60 5430 2023757 0.27 2029187 61 5286 2032842 0.26 2038128 62 5427 2038599 0.27 2044026 63 5394 2033664 0.26 2039058 64 5473 2040310 0.27 2045783 65 5441 2042854 0.27 2048295 66 5660 2036775 0.28 2042435 67 5320 2042701 0.26 2048021 68 5533 2033976 0.27 2039509 69 5557 2027499 0.27 2033056 70 5584 2031991 0.27 2037575 71 5526 2038824 0.27 2044350 72 5455 2033015 0.27 2038470 73 5570 2034915 0.27 2040485 74 5665 2040693 0.28 2046358 75 5581 2042649 0.27 2048230 76 5620 2047402 0.27 2053022 77 5650 2046697 0.28 2052347 78 5541 2045887 0.27 2051428 79 5503 2040954 0.27 2046457 80 5587 2038239 0.27 2043826 81 5620 2031694 0.28 2037314 82 5636 2038489 0.28 2044125 83 5613 2045494 0.27 2051107 84 5542 2035236 0.27 2040778 85 5436 2044189 0.27 2049625 86 5583 2039615 0.27 2045198 87 5681 2037772 0.28 2043453 88 5583 2041065 0.27 2046648 89 5472 2041600 0.27 2047072 90 5715 2036694 0.28 2042409 91 5662 2040555 0.28 2046217 92 5763 2042038 0.28 2047801 93 5652 2037830 0.28 2043482 94 5608 2038575 0.27 2044183 95 5597 2038044 0.27 2043641 96 5648 2035193 0.28 2040841 97 5436 2039287 0.27 2044723 98 5660 2041843 0.28 2047503 99 5531 2036625 0.27 2042156 100 5617 2036495 0.28 2042112 101 5590 2030592 0.27 2036182 102 5613 2026559 0.28 2032172 103 5555 2035340 0.27 2040895 104 5447 2029778 0.27 2035225 105 5434 2029658 0.27 2035092 106 5413 2031155 0.27 2036568 107 5407 2030951 0.27 2036358 108 5479 2022710 0.27 2028189 109 5690 2028172 0.28 2033862 110 5417 2034381 0.27 2039798 111 5485 2024063 0.27 2029548 112 5545 2026985 0.27 2032530 113 5403 2024625 0.27 2030028 114 5479 2023424 0.27 2028903 115 5527 2021451 0.27 2026978 116 5390 2022016 0.27 2027406 117 5316 2019661 0.26 2024977 118 5510 2020764 0.27 2026274 119 5460 2025437 0.27 2030897 120 5525 2017915 0.27 2023440 121 5264 2020723 0.26 2025987 122 5244 2017554 0.26 2022798 123 5394 2018167 0.27 2023561 124 5469 2017717 0.27 2023186 125 5353 2014286 0.27 2019639 126 5467 2000943 0.27 2006410 127 5412 2005769 0.27 2011181 128 5368 2002223 0.27 2007591 129 5502 1995579 0.27 2001081 130 5452 2002043 0.27 2007495 131 5453 2001200 0.27 2006653 132 5455 1997161 0.27 2002616 133 5587 1997241 0.28 2002828 134 5538 1996549 0.28 2002087 135 5440 1992636 0.27 1998076 136 5382 1989266 0.27 1994648 137 5472 1991949 0.27 1997421 138 5423 1985461 0.27 1990884 139 5468 1987012 0.27 1992480 140 5632 1982989 0.28 1988621 141 5467 1978624 0.28 1984091 142 5536 1976404 0.28 1981940 143 5454 1976202 0.28 1981656 144 5635 1970697 0.29 1976332 145 5737 1979634 0.29 1985371 146 6200 1971120 0.31 1977320 147 6170 1965705 0.31 1971875 148 6270 1961369 0.32 1967639 149 5740 1952458 0.29 1958198 150 5309 1772715 0.30 1778024 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 12425 8063785 0.15 8076210 2 13543 7123338 0.19 7136881 3 12912 8116763 0.16 8129675 4 15198 9701978 0.16 9717176 5 15404 9651652 0.16 9667056 6 15221 9501834 0.16 9517055 7 15152 9125144 0.17 9140296 8 15599 9312934 0.17 9328533 9 15362 9033029 0.17 9048391 10 15473 8910987 0.17 8926460 11 15695 8866727 0.18 8882422 12 15487 8762639 0.18 8778126 13 15541 8683383 0.18 8698924 14 15934 8671332 0.18 8687266 15 16078 8620176 0.19 8636254 16 16483 8722509 0.19 8738992 17 16808 8750767 0.19 8767575 18 17040 8806739 0.19 8823779 19 17592 8834262 0.20 8851854 20 17412 8803735 0.20 8821147 21 17419 8790553 0.20 8807972 22 17735 8749044 0.20 8766779 23 17320 8701478 0.20 8718798 24 17173 8693550 0.20 8710723 25 17445 8690389 0.20 8707834 26 17483 8711884 0.20 8729367 27 18092 8763555 0.21 8781647 28 18100 8823625 0.20 8841725 29 17987 8857883 0.20 8875870 30 18098 8864037 0.20 8882135 31 18295 8854342 0.21 8872637 32 18541 8799620 0.21 8818161 33 18324 8764629 0.21 8782953 34 18182 8754467 0.21 8772649 35 18000 8718012 0.21 8736012 36 18256 8724637 0.21 8742893 37 18256 8757488 0.21 8775744 38 18578 8784347 0.21 8802925 39 18579 8822030 0.21 8840609 40 18757 8847361 0.21 8866118 41 18244 8825223 0.21 8843467 42 18591 8824246 0.21 8842837 43 18490 8810520 0.21 8829010 44 18239 8771082 0.21 8789321 45 18136 8744978 0.21 8763114 46 17823 8759300 0.20 8777123 47 18194 8761521 0.21 8779715 48 18323 8781205 0.21 8799528 49 18566 8815880 0.21 8834446 50 18667 8826971 0.21 8845638 51 18696 8836001 0.21 8854697 52 18520 8857991 0.21 8876511 53 18668 8833246 0.21 8851914 54 18495 8814780 0.21 8833275 55 18479 8799847 0.21 8818326 56 18535 8787069 0.21 8805604 57 18471 8771562 0.21 8790033 58 18585 8786430 0.21 8805015 59 18600 8786848 0.21 8805448 60 18539 8827288 0.21 8845827 61 19005 8850368 0.21 8869373 62 18920 8850547 0.21 8869467 63 18902 8850068 0.21 8868970 64 18742 8848934 0.21 8867676 65 18664 8840274 0.21 8858938 66 18697 8839247 0.21 8857944 67 18717 8845891 0.21 8864608 68 18859 8825464 0.21 8844323 69 18522 8815984 0.21 8834506 70 18787 8846609 0.21 8865396 71 19117 8860555 0.22 8879672 72 18984 8852580 0.21 8871564 73 18905 8859102 0.21 8878007 74 18752 8841341 0.21 8860093 75 18943 8833562 0.21 8852505 76 19185 8849248 0.22 8868433 77 18779 8839119 0.21 8857898 78 19082 8828793 0.22 8847875 79 19123 8838883 0.22 8858006 80 19160 8843601 0.22 8862761 81 19069 8854095 0.21 8873164 82 19277 8872137 0.22 8891414 83 18945 8870778 0.21 8889723 84 18905 8862707 0.21 8881612 85 19034 8851497 0.21 8870531 86 18772 8831899 0.21 8850671 87 18929 8822067 0.21 8840996 88 18720 8828798 0.21 8847518 89 18894 8843913 0.21 8862807 90 19004 8863402 0.21 8882406 91 18971 8880276 0.21 8899247 92 19117 8873055 0.21 8892172 93 18878 8870082 0.21 8888960 94 18927 8881361 0.21 8900288 95 19019 8867464 0.21 8886483 96 18847 8838909 0.21 8857756 97 18663 8839857 0.21 8858520 98 18588 8838721 0.21 8857309 99 19234 8854854 0.22 8874088 100 19124 8872662 0.22 8891786 101 19005 8876075 0.21 8895080 102 18919 8871947 0.21 8890866 103 18905 8877420 0.21 8896325 104 18786 8865744 0.21 8884530 105 19109 8853894 0.22 8873003 106 19159 8852639 0.22 8871798 107 18900 8825534 0.21 8844434 108 18560 8800836 0.21 8819396 109 18793 8823084 0.21 8841877 110 19000 8836485 0.21 8855485 111 18938 8846319 0.21 8865257 112 19216 8856082 0.22 8875298 113 18857 8861671 0.21 8880528 114 18941 8846790 0.21 8865731 115 18921 8848784 0.21 8867705 116 18770 8832720 0.21 8851490 117 18989 8819109 0.21 8838098 118 18683 8812392 0.21 8831075 119 18787 8794763 0.21 8813550 120 18852 8788833 0.21 8807685 121 18935 8806146 0.21 8825081 122 18807 8809160 0.21 8827967 123 19111 8806124 0.22 8825235 124 18938 8813349 0.21 8832287 125 18830 8789981 0.21 8808811 126 18870 8780745 0.21 8799615 127 18703 8779538 0.21 8798241 128 18805 8759051 0.21 8777856 129 18977 8745021 0.22 8763998 130 18760 8741012 0.21 8759772 131 18997 8740903 0.22 8759900 132 19031 8731064 0.22 8750095 133 19139 8744228 0.22 8763367 134 19046 8738572 0.22 8757618 135 19248 8737924 0.22 8757172 136 18948 8726000 0.22 8744948 137 18881 8712864 0.22 8731745 138 19127 8708389 0.22 8727516 139 18991 8701188 0.22 8720179 140 19233 8676689 0.22 8695922 141 19295 8658813 0.22 8678108 142 19351 8658068 0.22 8677419 143 19511 8651306 0.23 8670817 144 19793 8649216 0.23 8669009 145 20139 8657389 0.23 8677528 146 20988 8662788 0.24 8683776 147 21349 8644855 0.25 8666204 148 20810 8624099 0.24 8644909 149 20355 8535660 0.24 8556015 150 17945 7997185 0.22 8015130 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3556 1573816 0.23 1577372 2 44798 1410578 3.08 1455376 3 91321 1124167 7.51 1215488 4 85942 1132482 7.05 1218424 5 105934 1351016 7.27 1456950 6 112724 1369458 7.61 1482182 7 116741 1437174 7.51 1553915 8 112933 1282190 8.09 1395123 9 117176 1315242 8.18 1432418 10 118834 1302017 8.36 1420851 11 120330 1282956 8.57 1403286 12 121205 1265604 8.74 1386809 13 123113 1246155 8.99 1369268 14 123940 1240528 9.08 1364468 15 123908 1244057 9.06 1367965 16 125934 1239907 9.22 1365841 17 127268 1259101 9.18 1386369 18 128745 1262775 9.25 1391520 19 129548 1267620 9.27 1397168 20 131572 1271660 9.38 1403232 21 132282 1264630 9.47 1396912 22 131461 1252970 9.50 1384431 23 133179 1246385 9.65 1379564 24 131995 1228879 9.70 1360874 25 132565 1228790 9.74 1361355 26 133735 1236049 9.76 1369784 27 134184 1241865 9.75 1376049 28 133989 1247293 9.70 1381282 29 135477 1250897 9.77 1386374 30 135703 1252139 9.78 1387842 31 136662 1242351 9.91 1379013 32 136791 1235430 9.97 1372221 33 135889 1224822 9.99 1360711 34 135760 1217825 10.03 1353585 35 137017 1215824 10.13 1352841 36 136285 1210838 10.12 1347123 37 136759 1216594 10.11 1353353 38 137004 1220784 10.09 1357788 39 138261 1218307 10.19 1356568 40 138017 1217456 10.18 1355473 41 138901 1225908 10.18 1364809 42 138429 1217994 10.21 1356423 43 138822 1212579 10.27 1351401 44 138746 1204368 10.33 1343114 45 138518 1189555 10.43 1328073 46 137965 1186995 10.41 1324960 47 138464 1191542 10.41 1330006 48 137933 1198132 10.32 1336065 49 139439 1196155 10.44 1335594 50 139177 1195958 10.42 1335135 51 138224 1188852 10.42 1327076 52 138616 1182717 10.49 1321333 53 139238 1182514 10.53 1321752 54 139165 1177236 10.57 1316401 55 139398 1171310 10.64 1310708 56 139545 1170940 10.65 1310485 57 139502 1167252 10.68 1306754 58 138888 1165474 10.65 1304362 59 139228 1164927 10.68 1304155 60 137763 1158860 10.62 1296623 61 137745 1159224 10.62 1296969 62 139329 1160446 10.72 1299775 63 138334 1154739 10.70 1293073 64 139325 1151087 10.80 1290412 65 139264 1149083 10.81 1288347 66 137521 1140648 10.76 1278169 67 138313 1137652 10.84 1275965 68 138724 1137753 10.87 1276477 69 136219 1130446 10.75 1266665 70 137211 1127776 10.85 1264987 71 137844 1131192 10.86 1269036 72 137266 1129175 10.84 1266441 73 137047 1127414 10.84 1264461 74 137898 1121546 10.95 1259444 75 137412 1111346 11.00 1248758 76 136469 1108047 10.97 1244516 77 137106 1106807 11.02 1243913 78 135964 1105128 10.96 1241092 79 135871 1105645 10.94 1241516 80 136329 1103463 11.00 1239792 81 135597 1095886 11.01 1231483 82 135692 1092726 11.05 1228418 83 135606 1093763 11.03 1229369 84 135102 1085626 11.07 1220728 85 135621 1085149 11.11 1220770 86 135287 1079983 11.13 1215270 87 134288 1073357 11.12 1207645 88 133586 1070727 11.09 1204313 89 134111 1071633 11.12 1205744 90 133168 1069244 11.08 1202412 91 133389 1064428 11.14 1197817 92 132987 1065844 11.09 1198831 93 133377 1064437 11.14 1197814 94 133087 1056708 11.19 1189795 95 132064 1051642 11.16 1183706 96 132112 1044777 11.23 1176889 97 131634 1037745 11.26 1169379 98 132235 1038156 11.30 1170391 99 130662 1036176 11.20 1166838 100 130817 1036885 11.20 1167702 101 130360 1031431 11.22 1161791 102 129068 1026121 11.17 1155189 103 129657 1024854 11.23 1154511 104 129410 1020609 11.25 1150019 105 127852 1016231 11.18 1144083 106 127931 1008557 11.26 1136488 107 127970 1004832 11.30 1132802 108 126621 998323 11.26 1124944 109 126611 991651 11.32 1118262 110 125577 991847 11.24 1117424 111 126250 991375 11.30 1117625 112 125837 990338 11.27 1116175 113 125225 985686 11.27 1110911 114 124940 981895 11.29 1106835 115 124015 973063 11.30 1097078 116 123645 972776 11.28 1096421 117 123039 962497 11.33 1085536 118 122727 959149 11.34 1081876 119 123377 955964 11.43 1079341 120 122142 954365 11.35 1076507 121 121660 950919 11.34 1072579 122 121225 949544 11.32 1070769 123 120033 944078 11.28 1064111 124 120049 939581 11.33 1059630 125 119657 935736 11.34 1055393 126 118868 930260 11.33 1049128 127 118755 921992 11.41 1040747 128 117765 916800 11.38 1034565 129 116425 911425 11.33 1027850 130 116336 907557 11.36 1023893 131 116875 906291 11.42 1023166 132 115155 900315 11.34 1015470 133 114983 895697 11.38 1010680 134 114258 893195 11.34 1007453 135 113501 887537 11.34 1001038 136 113201 884591 11.35 997792 137 112947 878659 11.39 991606 138 112178 872439 11.39 984617 139 110623 865833 11.33 976456 140 110208 862423 11.33 972631 141 110857 856576 11.46 967433 142 110089 852672 11.43 962761 143 108681 849020 11.35 957701 144 107878 843003 11.35 950881 145 108079 839976 11.40 948055 146 106726 831885 11.37 938611 147 105998 825187 11.38 931185 148 105144 811003 11.48 916147 149 103182 730773 12.37 833955 150 90396 0 100.00 90396 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2140 2335807 0.09 2337947 2 2715 1719405 0.16 1722120 3 8534 3331621 0.26 3340155 4 8648 1617480 0.53 1626128 5 3648 1689087 0.22 1692735 6 4271 1997559 0.21 2001830 7 4580 2143553 0.21 2148133 8 4477 2041119 0.22 2045596 9 4325 1911638 0.23 1915963 10 4252 1979840 0.21 1984092 11 4199 1936396 0.22 1940595 12 4059 1905802 0.21 1909861 13 3905 1899943 0.21 1903848 14 4020 1890005 0.21 1894025 15 4061 1889827 0.21 1893888 16 3883 1892010 0.20 1895893 17 4204 1883175 0.22 1887379 18 4317 1904729 0.23 1909046 19 4213 1903280 0.22 1907493 20 4252 1897183 0.22 1901435 21 4152 1912898 0.22 1917050 22 4144 1891083 0.22 1895227 23 4370 1896768 0.23 1901138 24 4377 1892363 0.23 1896740 25 4377 1885669 0.23 1890046 26 4384 1882831 0.23 1887215 27 4406 1889417 0.23 1893823 28 4299 1893931 0.23 1898230 29 4358 1883263 0.23 1887621 30 4382 1895739 0.23 1900121 31 4367 1892715 0.23 1897082 32 4498 1877065 0.24 1881563 33 4388 1879711 0.23 1884099 34 4278 1873552 0.23 1877830 35 4580 1869036 0.24 1873616 36 4253 1870617 0.23 1874870 37 4476 1865476 0.24 1869952 38 4496 1866208 0.24 1870704 39 4455 1866970 0.24 1871425 40 4531 1858946 0.24 1863477 41 4552 1858185 0.24 1862737 42 4532 1858964 0.24 1863496 43 4477 1853974 0.24 1858451 44 4540 1846590 0.25 1851130 45 4569 1852424 0.25 1856993 46 4503 1840069 0.24 1844572 47 4458 1835083 0.24 1839541 48 4556 1843687 0.25 1848243 49 4477 1842155 0.24 1846632 50 4659 1830474 0.25 1835133 51 4481 1829226 0.24 1833707 52 4458 1820866 0.24 1825324 53 4667 1815438 0.26 1820105 54 4439 1819771 0.24 1824210 55 4310 1820753 0.24 1825063 56 4519 1809212 0.25 1813731 57 4518 1815518 0.25 1820036 58 4553 1805275 0.25 1809828 59 4550 1794663 0.25 1799213 60 4460 1790565 0.25 1795025 61 4275 1792051 0.24 1796326 62 4387 1782376 0.25 1786763 63 4485 1786875 0.25 1791360 64 4376 1784058 0.24 1788434 65 4386 1777916 0.25 1782302 66 4358 1783273 0.24 1787631 67 4544 1775213 0.26 1779757 68 4461 1768113 0.25 1772574 69 4345 1766664 0.25 1771009 70 4522 1757647 0.26 1762169 71 4364 1745980 0.25 1750344 72 4425 1749390 0.25 1753815 73 4464 1750679 0.25 1755143 74 4421 1739284 0.25 1743705 75 4475 1736445 0.26 1740920 76 4526 1737612 0.26 1742138 77 4431 1732187 0.26 1736618 78 4352 1731560 0.25 1735912 79 4501 1728490 0.26 1732991 80 4266 1720979 0.25 1725245 81 4355 1718759 0.25 1723114 82 4361 1707119 0.25 1711480 83 4289 1693464 0.25 1697753 84 4266 1695611 0.25 1699877 85 4366 1693052 0.26 1697418 86 4281 1685167 0.25 1689448 87 4270 1687677 0.25 1691947 88 4429 1679530 0.26 1683959 89 4290 1675516 0.26 1679806 90 4209 1669710 0.25 1673919 91 4220 1663770 0.25 1667990 92 4343 1657256 0.26 1661599 93 4251 1658202 0.26 1662453 94 4318 1653091 0.26 1657409 95 4299 1643876 0.26 1648175 96 4325 1637361 0.26 1641686 97 4254 1636257 0.26 1640511 98 4217 1622007 0.26 1626224 99 4244 1625422 0.26 1629666 100 4131 1618973 0.25 1623104 101 4154 1610200 0.26 1614354 102 4054 1607649 0.25 1611703 103 4195 1599639 0.26 1603834 104 4105 1590162 0.26 1594267 105 4387 1587713 0.28 1592100 106 4132 1576898 0.26 1581030 107 4110 1571819 0.26 1575929 108 4209 1568878 0.27 1573087 109 4203 1560472 0.27 1564675 110 4077 1550521 0.26 1554598 111 4239 1550425 0.27 1554664 112 3965 1547748 0.26 1551713 113 4139 1536183 0.27 1540322 114 3965 1534409 0.26 1538374 115 4100 1524486 0.27 1528586 116 4009 1514957 0.26 1518966 117 4061 1513256 0.27 1517317 118 3989 1500191 0.27 1504180 119 4018 1495049 0.27 1499067 120 3909 1496050 0.26 1499959 121 3915 1486257 0.26 1490172 122 3897 1477960 0.26 1481857 123 3968 1475177 0.27 1479145 124 4019 1464812 0.27 1468831 125 4031 1458015 0.28 1462046 126 3979 1453192 0.27 1457171 127 3944 1442312 0.27 1446256 128 3959 1426990 0.28 1430949 129 3963 1425898 0.28 1429861 130 3894 1418208 0.27 1422102 131 3795 1410302 0.27 1414097 132 3934 1406336 0.28 1410270 133 3827 1396007 0.27 1399834 134 3794 1387983 0.27 1391777 135 3869 1382087 0.28 1385956 136 3836 1374341 0.28 1378177 137 3924 1367833 0.29 1371757 138 3858 1360078 0.28 1363936 139 3916 1351995 0.29 1355911 140 3794 1340598 0.28 1344392 141 3863 1338887 0.29 1342750 142 3914 1328412 0.29 1332326 143 3707 1320290 0.28 1323997 144 3887 1313157 0.30 1317044 145 3761 1303823 0.29 1307584 146 3741 1291562 0.29 1295303 147 3857 1281138 0.30 1284995 148 3805 1262080 0.30 1265885 149 3513 1156606 0.30 1160119 150 2679 0 100.00 2679 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 8891 10430102 0.09 10438993 2 12296 8696254 0.14 8708550 3 14641 9363187 0.16 9377828 4 14965 9126812 0.16 9141777 5 13853 8371094 0.17 8384947 6 12927 8059382 0.16 8072309 7 14000 8677005 0.16 8691005 8 13937 8490310 0.16 8504247 9 13847 8348488 0.17 8362335 10 13914 8331177 0.17 8345091 11 14300 8293661 0.17 8307961 12 14169 8224680 0.17 8238849 13 14283 8174663 0.17 8188946 14 14382 8181380 0.18 8195762 15 14498 8200168 0.18 8214666 16 14356 8270007 0.17 8284363 17 14935 8339877 0.18 8354812 18 15154 8316529 0.18 8331683 19 15213 8313749 0.18 8328962 20 15194 8282649 0.18 8297843 21 15225 8248024 0.18 8263249 22 15061 8171390 0.18 8186451 23 15132 8138783 0.19 8153915 24 15259 8108117 0.19 8123376 25 15732 8144190 0.19 8159922 26 15767 8174364 0.19 8190131 27 15750 8212929 0.19 8228679 28 15927 8229867 0.19 8245794 29 15961 8205424 0.19 8221385 30 16078 8176780 0.20 8192858 31 15889 8135539 0.19 8151428 32 16053 8089957 0.20 8106010 33 15796 8049419 0.20 8065215 34 15744 8026573 0.20 8042317 35 15890 8034641 0.20 8050531 36 15909 8054190 0.20 8070099 37 16161 8088446 0.20 8104607 38 16049 8112886 0.20 8128935 39 15939 8084967 0.20 8100906 40 16470 8086775 0.20 8103245 41 16489 8066913 0.20 8083402 42 16379 8024609 0.20 8040988 43 16277 7993244 0.20 8009521 44 16098 7950124 0.20 7966222 45 16081 7928521 0.20 7944602 46 16107 7937290 0.20 7953397 47 16468 7950171 0.21 7966639 48 16290 7982578 0.20 7998868 49 16382 7979547 0.20 7995929 50 16782 7968540 0.21 7985322 51 16537 7924476 0.21 7941013 52 16310 7907209 0.21 7923519 53 16324 7881763 0.21 7898087 54 16436 7846818 0.21 7863254 55 16259 7826888 0.21 7843147 56 16547 7827840 0.21 7844387 57 16247 7814936 0.21 7831183 58 16360 7831180 0.21 7847540 59 16660 7820480 0.21 7837140 60 16411 7794309 0.21 7810720 61 16427 7793576 0.21 7810003 62 16567 7764616 0.21 7781183 63 16206 7733254 0.21 7749460 64 16174 7720659 0.21 7736833 65 16376 7685325 0.21 7701701 66 16073 7674028 0.21 7690101 67 16567 7669476 0.22 7686043 68 16197 7643851 0.21 7660048 69 16151 7622707 0.21 7638858 70 15772 7612208 0.21 7627980 71 16157 7603496 0.21 7619653 72 16211 7588296 0.21 7604507 73 16099 7578981 0.21 7595080 74 16016 7536327 0.21 7552343 75 15881 7512691 0.21 7528572 76 16370 7509938 0.22 7526308 77 16234 7499205 0.22 7515439 78 16005 7488015 0.21 7504020 79 16196 7482475 0.22 7498671 80 15944 7470296 0.21 7486240 81 15731 7449710 0.21 7465441 82 15643 7427852 0.21 7443495 83 15742 7398262 0.21 7414004 84 15590 7362587 0.21 7378177 85 15621 7335239 0.21 7350860 86 15370 7326912 0.21 7342282 87 15469 7305512 0.21 7320981 88 15396 7304464 0.21 7319860 89 15458 7304770 0.21 7320228 90 15487 7278641 0.21 7294128 91 15325 7253619 0.21 7268944 92 15330 7229890 0.21 7245220 93 15084 7196457 0.21 7211541 94 15137 7176536 0.21 7191673 95 14940 7127964 0.21 7142904 96 14911 7096788 0.21 7111699 97 15022 7084629 0.21 7099651 98 14968 7075403 0.21 7090371 99 15103 7059377 0.21 7074480 100 14756 7051368 0.21 7066124 101 14707 7022538 0.21 7037245 102 14854 6997163 0.21 7012017 103 14656 6976239 0.21 6990895 104 14579 6946798 0.21 6961377 105 14599 6906229 0.21 6920828 106 14437 6870977 0.21 6885414 107 14607 6848172 0.21 6862779 108 14386 6817511 0.21 6831897 109 14622 6811434 0.21 6826056 110 14704 6800167 0.22 6814871 111 14319 6782564 0.21 6796883 112 14267 6761466 0.21 6775733 113 14296 6725618 0.21 6739914 114 14118 6693832 0.21 6707950 115 14111 6650093 0.21 6664204 116 14113 6612493 0.21 6626606 117 14017 6578608 0.21 6592625 118 13824 6558000 0.21 6571824 119 13788 6535059 0.21 6548847 120 14118 6517968 0.22 6532086 121 13607 6495215 0.21 6508822 122 13976 6477564 0.22 6491540 123 13930 6442016 0.22 6455946 124 14044 6406838 0.22 6420882 125 13796 6372433 0.22 6386229 126 13820 6323922 0.22 6337742 127 13648 6290790 0.22 6304438 128 13711 6260555 0.22 6274266 129 13803 6226533 0.22 6240336 130 13778 6207962 0.22 6221740 131 13766 6188471 0.22 6202237 132 13711 6161323 0.22 6175034 133 13735 6134400 0.22 6148135 134 14176 6099845 0.23 6114021 135 13891 6060973 0.23 6074864 136 13794 6027202 0.23 6040996 137 13718 5989469 0.23 6003187 138 13818 5948851 0.23 5962669 139 13897 5913150 0.23 5927047 140 13977 5887937 0.24 5901914 141 13691 5862782 0.23 5876473 142 13687 5827124 0.23 5840811 143 13591 5800122 0.23 5813713 144 13817 5757125 0.24 5770942 145 13941 5721058 0.24 5734999 146 13964 5675287 0.25 5689251 147 14393 5618534 0.26 5632927 148 14252 5546229 0.26 5560481 149 13262 5092399 0.26 5105661 150 9683 0 100.00 9683