CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 92723 566294 14.07 659017 2 112762 715917 13.61 828679 3 86033 684033 11.17 770066 4 100142 768225 11.53 868367 5 109819 822788 11.78 932607 6 113788 851411 11.79 965199 7 104787 742778 12.36 847565 8 104240 753544 12.15 857784 9 104166 752867 12.15 857033 10 102662 750681 12.03 853343 11 104006 755930 12.09 859936 12 105959 754236 12.32 860195 13 104618 751595 12.22 856213 14 105598 756461 12.25 862059 15 105791 753226 12.32 859017 16 106610 761056 12.29 867666 17 106365 762599 12.24 868964 18 106544 766096 12.21 872640 19 106308 767204 12.17 873512 20 107502 768324 12.27 875826 21 107138 766561 12.26 873699 22 108336 763634 12.42 871970 23 107061 760506 12.34 867567 24 107046 761385 12.33 868431 25 106443 760885 12.27 867328 26 107563 768948 12.27 876511 27 107216 770422 12.22 877638 28 106833 769550 12.19 876383 29 107468 772957 12.21 880425 30 107237 771483 12.20 878720 31 107071 766766 12.25 873837 32 107044 770185 12.20 877229 33 107554 767836 12.29 875390 34 107374 766231 12.29 873605 35 107086 765737 12.27 872823 36 107594 770446 12.25 878040 37 107508 771424 12.23 878932 38 107461 772723 12.21 880184 39 107532 773242 12.21 880774 40 107949 773944 12.24 881893 41 107557 774793 12.19 882350 42 107990 773598 12.25 881588 43 107912 768757 12.31 876669 44 107645 769925 12.27 877570 45 107312 768396 12.25 875708 46 107036 770387 12.20 877423 47 107150 774141 12.16 881291 48 107323 774430 12.17 881753 49 107024 773468 12.16 880492 50 106510 774924 12.08 881434 51 106730 771722 12.15 878452 52 107054 771883 12.18 878937 53 107564 772015 12.23 879579 54 107081 771120 12.19 878201 55 106501 768593 12.17 875094 56 106352 770066 12.13 876418 57 107001 772907 12.16 879908 58 106991 773436 12.15 880427 59 106454 771314 12.13 877768 60 106649 774047 12.11 880696 61 106253 772960 12.09 879213 62 106716 772474 12.14 879190 63 107102 773517 12.16 880619 64 105938 771777 12.07 877715 65 105889 769615 12.09 875504 66 106347 770914 12.12 877261 67 105941 770310 12.09 876251 68 106433 772902 12.10 879335 69 106072 772542 12.07 878614 70 106666 770314 12.16 876980 71 105688 773791 12.02 879479 72 106096 773381 12.06 879477 73 106293 770579 12.12 876872 74 105580 770218 12.06 875798 75 105394 770449 12.03 875843 76 105642 768583 12.08 874225 77 105545 768354 12.08 873899 78 104815 772525 11.95 877340 79 105829 771883 12.06 877712 80 105699 772166 12.04 877865 81 105051 770323 12.00 875374 82 105650 771968 12.04 877618 83 104945 770559 11.99 875504 84 105253 771289 12.01 876542 85 104275 768705 11.94 872980 86 104266 769348 11.94 873614 87 105012 769258 12.01 874270 88 104971 767593 12.03 872564 89 104572 769653 11.96 874225 90 104493 770404 11.94 874897 91 104414 770663 11.93 875077 92 104098 771781 11.88 875879 93 103977 769699 11.90 873676 94 103871 767235 11.92 871106 95 103434 769712 11.85 873146 96 103357 766918 11.88 870275 97 103463 767182 11.88 870645 98 103967 767137 11.94 871104 99 103245 768841 11.84 872086 100 103147 767064 11.85 870211 101 102817 767529 11.81 870346 102 102593 767119 11.80 869712 103 102771 769099 11.79 871870 104 102995 767945 11.83 870940 105 102300 766530 11.77 868830 106 102233 764513 11.80 866746 107 102022 764594 11.77 866616 108 101710 764738 11.74 866448 109 101609 766060 11.71 867669 110 102208 764776 11.79 866984 111 101079 765195 11.67 866274 112 101900 764378 11.76 866278 113 101242 766048 11.67 867290 114 101230 763945 11.70 865175 115 101380 762190 11.74 863570 116 100947 763278 11.68 864225 117 100722 762424 11.67 863146 118 100297 761180 11.64 861477 119 100272 761829 11.63 862101 120 100063 762224 11.60 862287 121 100187 761176 11.63 861363 122 99923 762872 11.58 862795 123 99953 762963 11.58 862916 124 99872 761374 11.60 861246 125 99767 761386 11.59 861153 126 99339 758794 11.58 858133 127 99037 756366 11.58 855403 128 99028 758409 11.55 857437 129 98080 756428 11.48 854508 130 98622 755162 11.55 853784 131 97668 756748 11.43 854416 132 97957 755108 11.48 853065 133 98292 754308 11.53 852600 134 97866 755532 11.47 853398 135 96814 754856 11.37 851670 136 96772 753034 11.39 849806 137 96408 752740 11.35 849148 138 96259 752669 11.34 848928 139 96737 748857 11.44 845594 140 96086 749292 11.37 845378 141 95230 750091 11.27 845321 142 95177 748969 11.27 844146 143 95633 750256 11.31 845889 144 94216 748461 11.18 842677 145 93745 746614 11.16 840359 146 95549 748355 11.32 843904 147 93394 747890 11.10 841284 148 93142 743837 11.13 836979 149 91895 743957 10.99 835852 150 83735 703874 10.63 787609 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2704 1971211 0.14 1973915 2 2937 1019263 0.29 1022200 3 2064 1022472 0.20 1024536 4 2462 1198339 0.21 1200801 5 2982 1354667 0.22 1357649 6 2895 1285042 0.22 1287937 7 2753 1180255 0.23 1183008 8 2885 1205067 0.24 1207952 9 2890 1189485 0.24 1192375 10 2774 1187749 0.23 1190523 11 2789 1194073 0.23 1196862 12 2926 1190966 0.25 1193892 13 3011 1192537 0.25 1195548 14 3003 1192275 0.25 1195278 15 3200 1187702 0.27 1190902 16 3255 1198248 0.27 1201503 17 3202 1201885 0.27 1205087 18 3223 1196809 0.27 1200032 19 3247 1205431 0.27 1208678 20 3203 1200801 0.27 1204004 21 3333 1201857 0.28 1205190 22 3212 1201270 0.27 1204482 23 3393 1202723 0.28 1206116 24 3324 1201138 0.28 1204462 25 3272 1204522 0.27 1207794 26 3355 1208616 0.28 1211971 27 3240 1207427 0.27 1210667 28 3430 1215947 0.28 1219377 29 3433 1211886 0.28 1215319 30 3409 1206058 0.28 1209467 31 3367 1210821 0.28 1214188 32 3252 1212776 0.27 1216028 33 3294 1212227 0.27 1215521 34 3467 1212638 0.29 1216105 35 3443 1211343 0.28 1214786 36 3449 1214380 0.28 1217829 37 3463 1216130 0.28 1219593 38 3437 1211219 0.28 1214656 39 3391 1215317 0.28 1218708 40 3535 1214817 0.29 1218352 41 3444 1216053 0.28 1219497 42 3428 1214331 0.28 1217759 43 3435 1218646 0.28 1222081 44 3355 1215812 0.28 1219167 45 3463 1214602 0.28 1218065 46 3284 1219376 0.27 1222660 47 3380 1217327 0.28 1220707 48 3374 1215343 0.28 1218717 49 3380 1217437 0.28 1220817 50 3457 1215605 0.28 1219062 51 3320 1215901 0.27 1219221 52 3410 1217825 0.28 1221235 53 3381 1221397 0.28 1224778 54 3386 1214726 0.28 1218112 55 3393 1217129 0.28 1220522 56 3347 1218268 0.27 1221615 57 3522 1217464 0.29 1220986 58 3384 1213849 0.28 1217233 59 3407 1221888 0.28 1225295 60 3423 1214321 0.28 1217744 61 3404 1218587 0.28 1221991 62 3360 1218660 0.27 1222020 63 3488 1216496 0.29 1219984 64 3430 1218888 0.28 1222318 65 3429 1220269 0.28 1223698 66 3484 1217781 0.29 1221265 67 3377 1224404 0.28 1227781 68 3475 1220681 0.28 1224156 69 3577 1216536 0.29 1220113 70 3477 1219317 0.28 1222794 71 3430 1221944 0.28 1225374 72 3535 1218093 0.29 1221628 73 3591 1219558 0.29 1223149 74 3547 1222547 0.29 1226094 75 3642 1219565 0.30 1223207 76 3607 1220234 0.29 1223841 77 3607 1219949 0.29 1223556 78 3502 1218775 0.29 1222277 79 3458 1220787 0.28 1224245 80 3416 1219024 0.28 1222440 81 3423 1219911 0.28 1223334 82 3468 1217553 0.28 1221021 83 3521 1223039 0.29 1226560 84 3488 1214758 0.29 1218246 85 3445 1221925 0.28 1225370 86 3507 1217433 0.29 1220940 87 3395 1216402 0.28 1219797 88 3479 1217117 0.29 1220596 89 3430 1217848 0.28 1221278 90 3504 1215476 0.29 1218980 91 3614 1217816 0.30 1221430 92 3531 1220337 0.29 1223868 93 3542 1215296 0.29 1218838 94 3465 1215261 0.28 1218726 95 3534 1215973 0.29 1219507 96 3485 1211534 0.29 1215019 97 3570 1215453 0.29 1219023 98 3601 1216346 0.30 1219947 99 3486 1213876 0.29 1217362 100 3415 1213686 0.28 1217101 101 3593 1215490 0.29 1219083 102 3449 1210182 0.28 1213631 103 3484 1214784 0.29 1218268 104 3444 1210260 0.28 1213704 105 3441 1209314 0.28 1212755 106 3339 1211379 0.27 1214718 107 3456 1211524 0.28 1214980 108 3484 1207350 0.29 1210834 109 3503 1208616 0.29 1212119 110 3445 1208202 0.28 1211647 111 3384 1205872 0.28 1209256 112 3329 1208456 0.27 1211785 113 3471 1208918 0.29 1212389 114 3428 1205223 0.28 1208651 115 3408 1205080 0.28 1208488 116 3406 1203659 0.28 1207065 117 3406 1205679 0.28 1209085 118 3436 1205983 0.28 1209419 119 3426 1206882 0.28 1210308 120 3416 1200275 0.28 1203691 121 3444 1202017 0.29 1205461 122 3337 1202038 0.28 1205375 123 3486 1200360 0.29 1203846 124 3360 1200271 0.28 1203631 125 3482 1197924 0.29 1201406 126 3399 1193293 0.28 1196692 127 3270 1197026 0.27 1200296 128 3359 1192552 0.28 1195911 129 3448 1191456 0.29 1194904 130 3202 1191356 0.27 1194558 131 3377 1188585 0.28 1191962 132 3318 1187007 0.28 1190325 133 3299 1187306 0.28 1190605 134 3281 1186455 0.28 1189736 135 3366 1183037 0.28 1186403 136 3288 1183681 0.28 1186969 137 3336 1184289 0.28 1187625 138 3307 1179469 0.28 1182776 139 3349 1184056 0.28 1187405 140 3435 1178846 0.29 1182281 141 3350 1176597 0.28 1179947 142 3383 1178175 0.29 1181558 143 3324 1174384 0.28 1177708 144 3341 1172045 0.28 1175386 145 3556 1175002 0.30 1178558 146 3764 1174410 0.32 1178174 147 3743 1168797 0.32 1172540 148 3673 1166545 0.31 1170218 149 3429 1164505 0.29 1167934 150 3306 1088069 0.30 1091375 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 7559 4947039 0.15 4954598 2 8341 4075411 0.20 4083752 3 8148 4548978 0.18 4557126 4 9179 5519983 0.17 5529162 5 9953 5912690 0.17 5922643 6 10032 5889996 0.17 5900028 7 9460 5411761 0.17 5421221 8 9685 5381480 0.18 5391165 9 9614 5245549 0.18 5255163 10 9415 5199669 0.18 5209084 11 9610 5207026 0.18 5216636 12 9722 5201489 0.19 5211211 13 9870 5173261 0.19 5183131 14 10165 5189802 0.20 5199967 15 10519 5187372 0.20 5197891 16 10536 5215147 0.20 5225683 17 10456 5210797 0.20 5221253 18 10717 5232199 0.20 5242916 19 10827 5226573 0.21 5237400 20 10887 5220861 0.21 5231748 21 10814 5210076 0.21 5220890 22 11014 5206469 0.21 5217483 23 10824 5206525 0.21 5217349 24 10907 5211434 0.21 5222341 25 11245 5208544 0.22 5219789 26 11137 5211531 0.21 5222668 27 11403 5230282 0.22 5241685 28 11462 5245165 0.22 5256627 29 11297 5252504 0.21 5263801 30 11715 5254571 0.22 5266286 31 11596 5256281 0.22 5267877 32 11542 5240813 0.22 5252355 33 11606 5235221 0.22 5246827 34 11712 5231558 0.22 5243270 35 11565 5229678 0.22 5241243 36 11707 5231362 0.22 5243069 37 11455 5229923 0.22 5241378 38 11531 5238964 0.22 5250495 39 11590 5251739 0.22 5263329 40 11595 5255302 0.22 5266897 41 11545 5246683 0.22 5258228 42 11514 5249704 0.22 5261218 43 11769 5241752 0.22 5253521 44 11577 5236597 0.22 5248174 45 11662 5228208 0.22 5239870 46 11422 5234783 0.22 5246205 47 11498 5237612 0.22 5249110 48 11566 5248638 0.22 5260204 49 11751 5256042 0.22 5267793 50 11623 5257151 0.22 5268774 51 11717 5259058 0.22 5270775 52 11750 5262383 0.22 5274133 53 11750 5258820 0.22 5270570 54 11848 5255857 0.22 5267705 55 11512 5249287 0.22 5260799 56 11933 5248050 0.23 5259983 57 11666 5239802 0.22 5251468 58 11925 5253682 0.23 5265607 59 11722 5243402 0.22 5255124 60 11723 5257450 0.22 5269173 61 11844 5260819 0.22 5272663 62 11917 5265850 0.23 5277767 63 11741 5264602 0.22 5276343 64 11739 5261962 0.22 5273701 65 11725 5263190 0.22 5274915 66 11615 5262883 0.22 5274498 67 11667 5264965 0.22 5276632 68 11787 5267886 0.22 5279673 69 11902 5258668 0.23 5270570 70 11887 5272589 0.22 5284476 71 11940 5274122 0.23 5286062 72 11830 5273191 0.22 5285021 73 11843 5271029 0.22 5282872 74 11900 5268740 0.23 5280640 75 11788 5263876 0.22 5275664 76 11785 5268787 0.22 5280572 77 11782 5267148 0.22 5278930 78 12174 5266160 0.23 5278334 79 11692 5267789 0.22 5279481 80 12026 5261879 0.23 5273905 81 12108 5271602 0.23 5283710 82 12207 5279203 0.23 5291410 83 11748 5273177 0.22 5284925 84 11707 5275043 0.22 5286750 85 11891 5270147 0.23 5282038 86 11717 5265166 0.22 5276883 87 11663 5256102 0.22 5267765 88 11875 5260040 0.23 5271915 89 11817 5266697 0.22 5278514 90 11825 5266075 0.22 5277900 91 11804 5265864 0.22 5277668 92 11929 5266579 0.23 5278508 93 11660 5269305 0.22 5280965 94 11761 5274612 0.22 5286373 95 11931 5269845 0.23 5281776 96 11850 5266001 0.22 5277851 97 11715 5260798 0.22 5272513 98 11737 5263103 0.22 5274840 99 11671 5266566 0.22 5278237 100 11983 5266338 0.23 5278321 101 11691 5273996 0.22 5285687 102 11804 5266309 0.22 5278113 103 11717 5268440 0.22 5280157 104 11921 5266578 0.23 5278499 105 11651 5256151 0.22 5267802 106 11884 5263344 0.23 5275228 107 11650 5255039 0.22 5266689 108 11468 5242400 0.22 5253868 109 11849 5247776 0.23 5259625 110 11889 5247807 0.23 5259696 111 11774 5248974 0.22 5260748 112 11922 5251467 0.23 5263389 113 11767 5255425 0.22 5267192 114 11800 5241594 0.22 5253394 115 11914 5245375 0.23 5257289 116 11848 5242928 0.23 5254776 117 11744 5236829 0.22 5248573 118 11930 5237359 0.23 5249289 119 11796 5226070 0.23 5237866 120 11911 5218297 0.23 5230208 121 11690 5222147 0.22 5233837 122 11808 5219104 0.23 5230912 123 11863 5224334 0.23 5236197 124 12037 5215958 0.23 5227995 125 11806 5210304 0.23 5222110 126 11839 5206504 0.23 5218343 127 11820 5201688 0.23 5213508 128 11870 5196036 0.23 5207906 129 11902 5190123 0.23 5202025 130 11663 5188313 0.22 5199976 131 11892 5183839 0.23 5195731 132 11715 5175999 0.23 5187714 133 11848 5178397 0.23 5190245 134 11726 5173310 0.23 5185036 135 11751 5167337 0.23 5179088 136 11526 5164967 0.22 5176493 137 11759 5160293 0.23 5172052 138 12017 5157678 0.23 5169695 139 11826 5148316 0.23 5160142 140 11838 5142702 0.23 5154540 141 11582 5130853 0.23 5142435 142 11697 5124500 0.23 5136197 143 12067 5127218 0.23 5139285 144 12040 5116805 0.23 5128845 145 12207 5122833 0.24 5135040 146 12566 5128447 0.24 5141013 147 12975 5119877 0.25 5132852 148 12635 5106146 0.25 5118781 149 12385 5067411 0.24 5079796 150 11437 4833961 0.24 4845398 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2466 956491 0.26 958957 2 34836 811786 4.11 846622 3 60029 709043 7.81 769072 4 56496 670085 7.78 726581 5 64545 760207 7.83 824752 6 70692 819085 7.94 889777 7 75039 844304 8.16 919343 8 70505 735778 8.74 806283 9 71913 744290 8.81 816203 10 73328 739831 9.02 813159 11 72930 734284 9.03 807214 12 74209 737182 9.15 811391 13 76005 736286 9.36 812291 14 76000 732957 9.39 808957 15 76448 736842 9.40 813290 16 77084 734384 9.50 811468 17 77910 739497 9.53 817407 18 78096 738480 9.56 816576 19 79003 741721 9.63 820724 20 79820 740752 9.73 820572 21 79183 735527 9.72 814710 22 79272 735470 9.73 814742 23 80809 734648 9.91 815457 24 80311 730469 9.91 810780 25 80846 727337 10.00 808183 26 81271 731065 10.00 812336 27 81149 730836 9.99 811985 28 80825 729571 9.97 810396 29 81710 728552 10.08 810262 30 81773 732823 10.04 814596 31 82319 727494 10.17 809813 32 82322 724233 10.21 806555 33 82802 723210 10.27 806012 34 82252 720229 10.25 802481 35 82743 719355 10.32 802098 36 82349 715494 10.32 797843 37 82702 715034 10.37 797736 38 82876 715816 10.38 798692 39 82476 715965 10.33 798441 40 83262 713532 10.45 796794 41 83131 712988 10.44 796119 42 83327 712453 10.47 795780 43 83263 709647 10.50 792910 44 83252 706221 10.55 789473 45 82976 702851 10.56 785827 46 83226 701229 10.61 784455 47 83345 700697 10.63 784042 48 83039 702869 10.57 785908 49 83311 701139 10.62 784450 50 83314 698705 10.65 782019 51 82944 697098 10.63 780042 52 83027 693195 10.70 776222 53 82946 693124 10.69 776070 54 82505 690951 10.67 773456 55 83035 687569 10.78 770604 56 83202 687777 10.79 770979 57 82629 683984 10.78 766613 58 83016 683260 10.83 766276 59 83021 683659 10.83 766680 60 82110 678882 10.79 760992 61 82734 679276 10.86 762010 62 83404 676625 10.97 760029 63 82928 672739 10.97 755667 64 82297 672135 10.91 754432 65 82236 669804 10.94 752040 66 82294 667463 10.98 749757 67 82239 665078 11.00 747317 68 82012 664173 10.99 746185 69 81473 661659 10.96 743132 70 81323 660927 10.96 742250 71 81832 659090 11.04 740922 72 81351 659815 10.98 741166 73 81075 655566 11.01 736641 74 81588 652976 11.11 734564 75 81399 649691 11.13 731090 76 81373 646446 11.18 727819 77 80699 644352 11.13 725051 78 81214 644286 11.19 725500 79 80405 643110 11.11 723515 80 80237 641436 11.12 721673 81 80455 638825 11.19 719280 82 80223 639207 11.15 719430 83 79789 634856 11.16 714645 84 79842 632070 11.22 711912 85 79682 630356 11.22 710038 86 79087 627316 11.20 706403 87 79029 625525 11.22 704554 88 78973 623532 11.24 702505 89 79362 622303 11.31 701665 90 77810 621574 11.13 699384 91 78875 617519 11.33 696394 92 78355 616450 11.28 694805 93 78121 615590 11.26 693711 94 77835 611406 11.29 689241 95 77805 609613 11.32 687418 96 77442 606843 11.32 684285 97 77410 603493 11.37 680903 98 77439 603956 11.36 681395 99 76690 600382 11.33 677072 100 77026 599644 11.38 676670 101 76014 597530 11.29 673544 102 75652 592533 11.32 668185 103 75841 589734 11.39 665575 104 75549 590310 11.35 665859 105 74995 586029 11.35 661024 106 74970 583785 11.38 658755 107 74767 581770 11.39 656537 108 74289 577361 11.40 651650 109 74249 574149 11.45 648398 110 73572 572995 11.38 646567 111 73258 571752 11.36 645010 112 73351 568654 11.43 642005 113 72908 568198 11.37 641106 114 72987 564607 11.45 637594 115 72147 561402 11.39 633549 116 72663 560387 11.48 633050 117 72306 556120 11.51 628426 118 71321 553916 11.41 625237 119 71186 551155 11.44 622341 120 71184 549042 11.48 620226 121 70626 546597 11.44 617223 122 70712 544992 11.48 615704 123 69899 543258 11.40 613157 124 69883 537439 11.51 607322 125 69398 536219 11.46 605617 126 69036 534156 11.45 603192 127 68545 528462 11.48 597007 128 68313 527323 11.47 595636 129 67976 524619 11.47 592595 130 67758 521415 11.50 589173 131 67141 517851 11.48 584992 132 67056 516727 11.49 583783 133 66648 513414 11.49 580062 134 66609 509531 11.56 576140 135 66241 507653 11.54 573894 136 65317 504249 11.47 569566 137 64886 501949 11.45 566835 138 65428 497915 11.61 563343 139 64660 496043 11.53 560703 140 64038 494206 11.47 558244 141 63591 488654 11.51 552245 142 63277 486066 11.52 549343 143 62545 482873 11.47 545418 144 62329 480005 11.49 542334 145 62616 478039 11.58 540655 146 61801 475061 11.51 536862 147 61019 470212 11.49 531231 148 60382 462549 11.55 522931 149 58918 421299 12.27 480217 150 52617 0 100.00 52617 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1302 1277724 0.10 1279026 2 1740 1008002 0.17 1009742 3 5768 2177797 0.26 2183565 4 5999 1010805 0.59 1016804 5 2233 981244 0.23 983477 6 2509 1128424 0.22 1130933 7 2866 1269131 0.23 1271997 8 2801 1211299 0.23 1214100 9 2649 1110107 0.24 1112756 10 2565 1128870 0.23 1131435 11 2492 1117960 0.22 1120452 12 2448 1114408 0.22 1116856 13 2564 1114015 0.23 1116579 14 2568 1113535 0.23 1116103 15 2492 1119654 0.22 1122146 16 2519 1114537 0.23 1117056 17 2686 1110979 0.24 1113665 18 2712 1124028 0.24 1126740 19 2608 1120272 0.23 1122880 20 2660 1114920 0.24 1117580 21 2589 1123389 0.23 1125978 22 2699 1115436 0.24 1118135 23 2690 1115056 0.24 1117746 24 2666 1117172 0.24 1119838 25 2788 1115325 0.25 1118113 26 2687 1111842 0.24 1114529 27 2737 1115507 0.24 1118244 28 2655 1113827 0.24 1116482 29 2713 1109910 0.24 1112623 30 2691 1116449 0.24 1119140 31 2786 1114385 0.25 1117171 32 2737 1103934 0.25 1106671 33 2642 1105988 0.24 1108630 34 2798 1103747 0.25 1106545 35 2886 1106033 0.26 1108919 36 2778 1105763 0.25 1108541 37 2758 1098812 0.25 1101570 38 2797 1096178 0.25 1098975 39 2727 1099158 0.25 1101885 40 2775 1094723 0.25 1097498 41 2798 1091087 0.26 1093885 42 2749 1091277 0.25 1094026 43 2702 1090415 0.25 1093117 44 2742 1084212 0.25 1086954 45 2826 1088543 0.26 1091369 46 2936 1083915 0.27 1086851 47 2681 1077728 0.25 1080409 48 2793 1081425 0.26 1084218 49 2757 1078187 0.26 1080944 50 2838 1075055 0.26 1077893 51 2697 1072719 0.25 1075416 52 2821 1069628 0.26 1072449 53 2857 1066160 0.27 1069017 54 2668 1066538 0.25 1069206 55 2794 1067183 0.26 1069977 56 2902 1059812 0.27 1062714 57 2820 1059422 0.27 1062242 58 2704 1055735 0.26 1058439 59 2725 1055684 0.26 1058409 60 2658 1049508 0.25 1052166 61 2688 1050874 0.26 1053562 62 2683 1044347 0.26 1047030 63 2674 1044264 0.26 1046938 64 2684 1042565 0.26 1045249 65 2658 1037457 0.26 1040115 66 2706 1038654 0.26 1041360 67 2632 1036116 0.25 1038748 68 2710 1027773 0.26 1030483 69 2750 1033753 0.27 1036503 70 2820 1025359 0.27 1028179 71 2583 1021949 0.25 1024532 72 2729 1022046 0.27 1024775 73 2734 1018245 0.27 1020979 74 2669 1013268 0.26 1015937 75 2917 1013283 0.29 1016200 76 2698 1009698 0.27 1012396 77 2684 1008143 0.27 1010827 78 2690 1004425 0.27 1007115 79 2727 1001599 0.27 1004326 80 2622 999376 0.26 1001998 81 2608 997668 0.26 1000276 82 2694 991599 0.27 994293 83 2623 986739 0.27 989362 84 2654 986239 0.27 988893 85 2653 983571 0.27 986224 86 2638 977629 0.27 980267 87 2617 980174 0.27 982791 88 2582 974165 0.26 976747 89 2576 968225 0.27 970801 90 2673 967777 0.28 970450 91 2583 963375 0.27 965958 92 2577 959462 0.27 962039 93 2508 959657 0.26 962165 94 2563 955490 0.27 958053 95 2525 950140 0.27 952665 96 2446 947438 0.26 949884 97 2566 944699 0.27 947265 98 2514 938262 0.27 940776 99 2524 941978 0.27 944502 100 2513 935593 0.27 938106 101 2444 929058 0.26 931502 102 2438 928130 0.26 930568 103 2467 921849 0.27 924316 104 2439 916344 0.27 918783 105 2539 915322 0.28 917861 106 2413 909560 0.26 911973 107 2454 907184 0.27 909638 108 2461 906159 0.27 908620 109 2386 900606 0.26 902992 110 2385 894540 0.27 896925 111 2398 893510 0.27 895908 112 2296 887000 0.26 889296 113 2493 881568 0.28 884061 114 2330 881797 0.26 884127 115 2386 876383 0.27 878769 116 2373 871693 0.27 874066 117 2247 868376 0.26 870623 118 2220 861939 0.26 864159 119 2403 859954 0.28 862357 120 2368 858835 0.27 861203 121 2381 854597 0.28 856978 122 2273 847456 0.27 849729 123 2295 844361 0.27 846656 124 2201 840366 0.26 842567 125 2284 834274 0.27 836558 126 2377 831140 0.29 833517 127 2350 826017 0.28 828367 128 2343 819616 0.29 821959 129 2271 819227 0.28 821498 130 2232 813676 0.27 815908 131 2280 805922 0.28 808202 132 2251 803184 0.28 805435 133 2230 799146 0.28 801376 134 2234 791583 0.28 793817 135 2180 788316 0.28 790496 136 2190 784657 0.28 786847 137 2237 778949 0.29 781186 138 2195 776572 0.28 778767 139 2158 773871 0.28 776029 140 2205 767443 0.29 769648 141 2185 764175 0.29 766360 142 2260 757118 0.30 759378 143 2081 753510 0.28 755591 144 2189 746494 0.29 748683 145 2171 740773 0.29 742944 146 2149 736522 0.29 738671 147 2049 731184 0.28 733233 148 2087 719236 0.29 721323 149 2014 667439 0.30 669453 150 1435 0 100.00 1435 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 5402 5771717 0.09 5777119 2 7340 4681759 0.16 4689099 3 9811 5786854 0.17 5796665 4 10291 5747843 0.18 5758134 5 8804 5120897 0.17 5129701 6 8291 4760362 0.17 4768653 7 8749 4960276 0.18 4969025 8 8531 4850444 0.18 4858975 9 8835 4843197 0.18 4852032 10 8634 4860472 0.18 4869106 11 9079 4877884 0.19 4886963 12 9075 4892988 0.19 4902063 13 9096 4874678 0.19 4883774 14 9081 4870548 0.19 4879629 15 9250 4871094 0.19 4880344 16 9423 4872344 0.19 4881767 17 9347 4884895 0.19 4894242 18 9284 4873367 0.19 4882651 19 9697 4871306 0.20 4881003 20 9546 4862683 0.20 4872229 21 9489 4855712 0.20 4865201 22 9563 4838716 0.20 4848279 23 9853 4827986 0.20 4837839 24 9746 4816003 0.20 4825749 25 9817 4817982 0.20 4827799 26 9795 4809652 0.20 4819447 27 9897 4825722 0.20 4835619 28 9867 4815564 0.20 4825431 29 9884 4809267 0.21 4819151 30 9834 4801135 0.20 4810969 31 9995 4796824 0.21 4806819 32 9996 4776611 0.21 4786607 33 9853 4762317 0.21 4772170 34 9822 4750046 0.21 4759868 35 9867 4748893 0.21 4758760 36 9664 4748864 0.20 4758528 37 10001 4749838 0.21 4759839 38 9889 4752242 0.21 4762131 39 9931 4742373 0.21 4752304 40 10186 4738502 0.21 4748688 41 9990 4722822 0.21 4732812 42 10120 4708730 0.21 4718850 43 9960 4700246 0.21 4710206 44 10031 4686662 0.21 4696693 45 9884 4676393 0.21 4686277 46 10063 4672151 0.21 4682214 47 10307 4667653 0.22 4677960 48 10029 4666692 0.21 4676721 49 10179 4658916 0.22 4669095 50 10069 4647158 0.22 4657227 51 9924 4638251 0.21 4648175 52 10023 4625842 0.22 4635865 53 10007 4614301 0.22 4624308 54 10053 4600585 0.22 4610638 55 9992 4594112 0.22 4604104 56 10005 4584830 0.22 4594835 57 9998 4569679 0.22 4579677 58 10171 4570661 0.22 4580832 59 10056 4563604 0.22 4573660 60 10158 4549000 0.22 4559158 61 9856 4549655 0.22 4559511 62 10056 4525933 0.22 4535989 63 9919 4510356 0.22 4520275 64 9890 4501244 0.22 4511134 65 9990 4483283 0.22 4493273 66 10047 4475662 0.22 4485709 67 9971 4473223 0.22 4483194 68 9869 4465790 0.22 4475659 69 9796 4447763 0.22 4457559 70 9743 4436060 0.22 4445803 71 9720 4428487 0.22 4438207 72 9879 4419077 0.22 4428956 73 9917 4410427 0.22 4420344 74 9677 4391784 0.22 4401461 75 9612 4378840 0.22 4388452 76 9740 4367522 0.22 4377262 77 9774 4356995 0.22 4366769 78 9665 4347091 0.22 4356756 79 9784 4339065 0.22 4348849 80 9509 4325843 0.22 4335352 81 9549 4314198 0.22 4323747 82 9352 4300974 0.22 4310326 83 9506 4284712 0.22 4294218 84 9252 4266676 0.22 4275928 85 9371 4256516 0.22 4265887 86 9236 4247207 0.22 4256443 87 9373 4239167 0.22 4248540 88 9275 4230274 0.22 4239549 89 9100 4217101 0.22 4226201 90 9267 4208003 0.22 4217270 91 9227 4193290 0.22 4202517 92 9287 4178191 0.22 4187478 93 9090 4160861 0.22 4169951 94 9060 4148599 0.22 4157659 95 9068 4121133 0.22 4130201 96 9007 4109328 0.22 4118335 97 8739 4094243 0.21 4102982 98 9088 4081704 0.22 4090792 99 8906 4073716 0.22 4082622 100 8950 4064204 0.22 4073154 101 8848 4040709 0.22 4049557 102 8984 4032017 0.22 4041001 103 8749 4014399 0.22 4023148 104 8858 3999824 0.22 4008682 105 8617 3985968 0.22 3994585 106 8754 3961345 0.22 3970099 107 8616 3947147 0.22 3955763 108 8715 3928561 0.22 3937276 109 8530 3924539 0.22 3933069 110 8634 3907138 0.22 3915772 111 8464 3895642 0.22 3904106 112 8535 3873898 0.22 3882433 113 8367 3859820 0.22 3868187 114 8428 3842174 0.22 3850602 115 8393 3823338 0.22 3831731 116 8328 3804507 0.22 3812835 117 8229 3788235 0.22 3796464 118 8337 3769860 0.22 3778197 119 8268 3752153 0.22 3760421 120 8265 3740883 0.22 3749148 121 8215 3722807 0.22 3731022 122 8327 3703737 0.22 3712064 123 8284 3688889 0.22 3697173 124 8138 3666416 0.22 3674554 125 8156 3645275 0.22 3653431 126 7998 3623743 0.22 3631741 127 8017 3608127 0.22 3616144 128 8180 3586016 0.23 3594196 129 8124 3574356 0.23 3582480 130 7955 3556101 0.22 3564056 131 7908 3533787 0.22 3541695 132 8042 3517383 0.23 3525425 133 7819 3502824 0.22 3510643 134 8117 3484497 0.23 3492614 135 7778 3462475 0.22 3470253 136 8023 3440662 0.23 3448685 137 8010 3413826 0.23 3421836 138 7839 3397925 0.23 3405764 139 7726 3384040 0.23 3391766 140 7847 3359477 0.23 3367324 141 7757 3340479 0.23 3348236 142 7943 3320484 0.24 3328427 143 7844 3301940 0.24 3309784 144 7971 3278624 0.24 3286595 145 7935 3255281 0.24 3263216 146 7863 3235883 0.24 3243746 147 8084 3203162 0.25 3211246 148 7967 3162982 0.25 3170949 149 7570 2930065 0.26 2937635 150 5444 0 100.00 5444