CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 105962 661378 13.81 767340 2 124983 846784 12.86 971767 3 109403 812596 11.87 921999 4 110624 845081 11.58 955705 5 122948 924278 11.74 1047226 6 128471 940752 12.02 1069223 7 120665 850397 12.43 971062 8 120032 864661 12.19 984693 9 119320 859967 12.18 979287 10 116931 852772 12.06 969703 11 118550 863272 12.07 981822 12 119867 858755 12.25 978622 13 119399 858123 12.21 977522 14 120466 864069 12.24 984535 15 120716 858635 12.33 979351 16 121829 868355 12.30 990184 17 121172 868821 12.24 989993 18 122143 876278 12.23 998421 19 121863 875343 12.22 997206 20 122847 877775 12.28 1000622 21 122736 874926 12.30 997662 22 122792 876925 12.28 999717 23 122147 878232 12.21 1000379 24 122340 877143 12.24 999483 25 122712 875727 12.29 998439 26 123465 880632 12.30 1004097 27 122675 884378 12.18 1007053 28 122621 883891 12.18 1006512 29 123667 888100 12.22 1011767 30 123362 885680 12.23 1009042 31 122958 881782 12.24 1004740 32 124063 884490 12.30 1008553 33 123015 885372 12.20 1008387 34 122910 883837 12.21 1006747 35 123198 886794 12.20 1009992 36 123517 888163 12.21 1011680 37 123437 886755 12.22 1010192 38 123170 889476 12.16 1012646 39 123490 890761 12.18 1014251 40 123544 889123 12.20 1012667 41 123863 890762 12.21 1014625 42 123908 891678 12.20 1015586 43 123275 888370 12.19 1011645 44 122823 888287 12.15 1011110 45 123921 890378 12.22 1014299 46 123913 889619 12.23 1013532 47 123553 892288 12.16 1015841 48 123812 891945 12.19 1015757 49 123441 890084 12.18 1013525 50 123637 891669 12.18 1015306 51 123384 889305 12.18 1012689 52 123399 889097 12.19 1012496 53 123317 891215 12.16 1014532 54 123597 890428 12.19 1014025 55 123000 889115 12.15 1012115 56 122827 888687 12.14 1011514 57 123829 893371 12.17 1017200 58 123411 889759 12.18 1013170 59 122725 889975 12.12 1012700 60 122630 891078 12.10 1013708 61 122914 889491 12.14 1012405 62 122745 890199 12.12 1012944 63 123707 891926 12.18 1015633 64 122271 889761 12.08 1012032 65 123002 890990 12.13 1013992 66 122757 890731 12.11 1013488 67 122922 888725 12.15 1011647 68 122758 891995 12.10 1014753 69 123027 890449 12.14 1013476 70 122840 889677 12.13 1012517 71 123076 889051 12.16 1012127 72 122179 892704 12.04 1014883 73 122269 887349 12.11 1009618 74 122640 888227 12.13 1010867 75 121964 885923 12.10 1007887 76 121348 887028 12.03 1008376 77 121334 886257 12.04 1007591 78 122348 889706 12.09 1012054 79 122281 888421 12.10 1010702 80 121627 888430 12.04 1010057 81 121606 889106 12.03 1010712 82 121833 888004 12.06 1009837 83 122174 886971 12.11 1009145 84 121337 887706 12.02 1009043 85 121166 884839 12.04 1006005 86 121450 886470 12.05 1007920 87 120549 887636 11.96 1008185 88 120747 884224 12.01 1004971 89 121351 886211 12.04 1007562 90 120808 887093 11.99 1007901 91 121116 887288 12.01 1008404 92 120610 888033 11.96 1008643 93 121200 887245 12.02 1008445 94 120321 886142 11.95 1006463 95 120527 886312 11.97 1006839 96 119832 884723 11.93 1004555 97 120089 883959 11.96 1004048 98 120033 885218 11.94 1005251 99 119724 886578 11.90 1006302 100 119383 884670 11.89 1004053 101 120106 885208 11.95 1005314 102 119966 883949 11.95 1003915 103 119264 880995 11.92 1000259 104 119219 885594 11.86 1004813 105 119222 885248 11.87 1004470 106 118473 881852 11.84 1000325 107 118277 882800 11.81 1001077 108 119045 882245 11.89 1001290 109 118197 879699 11.84 997896 110 118514 882569 11.84 1001083 111 118178 884878 11.78 1003056 112 117197 878577 11.77 995774 113 118233 883427 11.80 1001660 114 117808 881961 11.78 999769 115 117537 878618 11.80 996155 116 118068 879759 11.83 997827 117 117690 879179 11.81 996869 118 117569 877272 11.82 994841 119 116993 880342 11.73 997335 120 116796 877977 11.74 994773 121 116003 879152 11.66 995155 122 116288 879662 11.68 995950 123 115748 878379 11.64 994127 124 116488 877437 11.72 993925 125 115428 878115 11.62 993543 126 115594 875605 11.66 991199 127 115429 874787 11.66 990216 128 114739 876496 11.58 991235 129 115012 874136 11.63 989148 130 114078 871975 11.57 986053 131 114700 871554 11.63 986254 132 114578 872152 11.61 986730 133 113791 871777 11.55 985568 134 114301 873084 11.58 987385 135 114692 872852 11.61 987544 136 112906 870870 11.48 983776 137 113019 871356 11.48 984375 138 112741 869120 11.48 981861 139 113090 867873 11.53 980963 140 112007 867454 11.44 979461 141 112504 865643 11.50 978147 142 112431 864720 11.51 977151 143 110989 864342 11.38 975331 144 111298 864837 11.40 976135 145 110693 862108 11.38 972801 146 110796 866271 11.34 977067 147 111011 864305 11.38 975316 148 109195 859892 11.27 969087 149 106081 858923 10.99 965004 150 94236 797701 10.57 891937 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3266 2106181 0.15 2109447 2 3685 1244878 0.30 1248563 3 2919 1214000 0.24 1216919 4 3158 1332127 0.24 1335285 5 3816 1493598 0.25 1497414 6 3908 1445522 0.27 1449430 7 3556 1375336 0.26 1378892 8 3661 1364953 0.27 1368614 9 3728 1364539 0.27 1368267 10 3689 1356287 0.27 1359976 11 3754 1358911 0.28 1362665 12 3715 1360542 0.27 1364257 13 3940 1363079 0.29 1367019 14 3986 1362654 0.29 1366640 15 3946 1361694 0.29 1365640 16 4093 1371123 0.30 1375216 17 4167 1374413 0.30 1378580 18 4088 1373713 0.30 1377801 19 4063 1383312 0.29 1387375 20 4201 1378300 0.30 1382501 21 4219 1382191 0.30 1386410 22 4182 1385125 0.30 1389307 23 4290 1382040 0.31 1386330 24 4174 1383358 0.30 1387532 25 4263 1386724 0.31 1390987 26 4368 1389052 0.31 1393420 27 4251 1390724 0.30 1394975 28 4287 1397559 0.31 1401846 29 4462 1393590 0.32 1398052 30 4279 1392766 0.31 1397045 31 4202 1397439 0.30 1401641 32 4240 1393614 0.30 1397854 33 4246 1398380 0.30 1402626 34 4262 1398071 0.30 1402333 35 4245 1393775 0.30 1398020 36 4309 1396699 0.31 1401008 37 4351 1400291 0.31 1404642 38 4261 1400957 0.30 1405218 39 4273 1400739 0.30 1405012 40 4396 1400059 0.31 1404455 41 4294 1402370 0.31 1406664 42 4411 1397355 0.31 1401766 43 4401 1403530 0.31 1407931 44 4361 1401358 0.31 1405719 45 4307 1399762 0.31 1404069 46 4285 1401538 0.30 1405823 47 4417 1404384 0.31 1408801 48 4388 1402452 0.31 1406840 49 4286 1404996 0.30 1409282 50 4262 1401778 0.30 1406040 51 4332 1404135 0.31 1408467 52 4383 1403525 0.31 1407908 53 4340 1406687 0.31 1411027 54 4351 1399667 0.31 1404018 55 4275 1405293 0.30 1409568 56 4221 1406748 0.30 1410969 57 4357 1403174 0.31 1407531 58 4247 1401503 0.30 1405750 59 4298 1405852 0.30 1410150 60 4335 1402680 0.31 1407015 61 4248 1403255 0.30 1407503 62 4235 1404391 0.30 1408626 63 4395 1402890 0.31 1407285 64 4365 1404020 0.31 1408385 65 4357 1406374 0.31 1410731 66 4297 1399343 0.31 1403640 67 4304 1407075 0.30 1411379 68 4211 1402838 0.30 1407049 69 4441 1403040 0.32 1407481 70 4347 1405799 0.31 1410146 71 4310 1406527 0.31 1410837 72 4409 1403906 0.31 1408315 73 4408 1404685 0.31 1409093 74 4541 1406041 0.32 1410582 75 4480 1403711 0.32 1408191 76 4351 1403108 0.31 1407459 77 4338 1403202 0.31 1407540 78 4375 1403073 0.31 1407448 79 4378 1405738 0.31 1410116 80 4405 1405380 0.31 1409785 81 4401 1400081 0.31 1404482 82 4365 1405610 0.31 1409975 83 4421 1404970 0.31 1409391 84 4304 1402263 0.31 1406567 85 4252 1402584 0.30 1406836 86 4267 1402791 0.30 1407058 87 4305 1400930 0.31 1405235 88 4242 1402572 0.30 1406814 89 4328 1403751 0.31 1408079 90 4303 1400117 0.31 1404420 91 4437 1402869 0.32 1407306 92 4402 1400821 0.31 1405223 93 4355 1399825 0.31 1404180 94 4371 1400610 0.31 1404981 95 4373 1399565 0.31 1403938 96 4397 1396976 0.31 1401373 97 4528 1399057 0.32 1403585 98 4441 1398998 0.32 1403439 99 4194 1397489 0.30 1401683 100 4408 1399814 0.31 1404222 101 4361 1399874 0.31 1404235 102 4268 1393867 0.31 1398135 103 4371 1398549 0.31 1402920 104 4283 1394507 0.31 1398790 105 4413 1395995 0.32 1400408 106 4255 1396374 0.30 1400629 107 4280 1397185 0.31 1401465 108 4407 1393432 0.32 1397839 109 4310 1393771 0.31 1398081 110 4305 1396551 0.31 1400856 111 4312 1392688 0.31 1397000 112 4319 1391899 0.31 1396218 113 4230 1392510 0.30 1396740 114 4250 1389849 0.30 1394099 115 4334 1391968 0.31 1396302 116 4354 1391130 0.31 1395484 117 4215 1388228 0.30 1392443 118 4249 1390761 0.30 1395010 119 4226 1390762 0.30 1394988 120 4226 1385757 0.30 1389983 121 4261 1387801 0.31 1392062 122 4281 1386589 0.31 1390870 123 4334 1388366 0.31 1392700 124 4280 1385369 0.31 1389649 125 4285 1384902 0.31 1389187 126 4189 1379792 0.30 1383981 127 4196 1381567 0.30 1385763 128 4294 1380217 0.31 1384511 129 4255 1379105 0.31 1383360 130 4228 1376591 0.31 1380819 131 4243 1377677 0.31 1381920 132 4323 1373007 0.31 1377330 133 4214 1375458 0.31 1379672 134 4334 1376306 0.31 1380640 135 4173 1373553 0.30 1377726 136 4130 1369431 0.30 1373561 137 4187 1368195 0.31 1372382 138 4313 1364402 0.32 1368715 139 4377 1368549 0.32 1372926 140 4207 1366064 0.31 1370271 141 4196 1362744 0.31 1366940 142 4255 1362452 0.31 1366707 143 4261 1359320 0.31 1363581 144 4278 1357491 0.31 1361769 145 4462 1361652 0.33 1366114 146 4859 1359365 0.36 1364224 147 4804 1356909 0.35 1361713 148 4638 1352049 0.34 1356687 149 4437 1346324 0.33 1350761 150 3963 1228775 0.32 1232738 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9305 5464929 0.17 5474234 2 11436 4803329 0.24 4814765 3 11628 5137075 0.23 5148703 4 12039 5893323 0.20 5905362 5 13731 6486222 0.21 6499953 6 13662 6517609 0.21 6531271 7 13090 6099695 0.21 6112785 8 13124 6059004 0.22 6072128 9 13041 5995758 0.22 6008799 10 13343 5919118 0.22 5932461 11 13161 5958729 0.22 5971890 12 13384 5942873 0.22 5956257 13 13620 5916794 0.23 5930414 14 14015 5948262 0.24 5962277 15 14052 5947470 0.24 5961522 16 14060 5981495 0.23 5995555 17 14415 5983408 0.24 5997823 18 14160 6007821 0.24 6021981 19 14575 6004852 0.24 6019427 20 14794 5995491 0.25 6010285 21 14724 5994875 0.25 6009599 22 14791 5990418 0.25 6005209 23 14611 5993914 0.24 6008525 24 15005 6006216 0.25 6021221 25 14994 5996696 0.25 6011690 26 14833 6011961 0.25 6026794 27 15025 6027369 0.25 6042394 28 15132 6036175 0.25 6051307 29 15304 6030172 0.25 6045476 30 15201 6036772 0.25 6051973 31 15312 6041446 0.25 6056758 32 15456 6031926 0.26 6047382 33 15398 6037599 0.25 6052997 34 15123 6029391 0.25 6044514 35 15367 6035100 0.25 6050467 36 15404 6045822 0.25 6061226 37 15409 6041826 0.25 6057235 38 15361 6048676 0.25 6064037 39 15448 6055715 0.25 6071163 40 15515 6049407 0.26 6064922 41 15260 6045671 0.25 6060931 42 15509 6050111 0.26 6065620 43 15439 6038165 0.26 6053604 44 15397 6046846 0.25 6062243 45 15403 6052463 0.25 6067866 46 15243 6044182 0.25 6059425 47 15434 6056444 0.25 6071878 48 15468 6060142 0.25 6075610 49 15439 6058614 0.25 6074053 50 15532 6061048 0.26 6076580 51 15515 6067722 0.26 6083237 52 15383 6060755 0.25 6076138 53 15534 6065190 0.26 6080724 54 15307 6070007 0.25 6085314 55 15336 6056933 0.25 6072269 56 15609 6062139 0.26 6077748 57 15579 6060129 0.26 6075708 58 15684 6054292 0.26 6069976 59 15550 6048227 0.26 6063777 60 15656 6066092 0.26 6081748 61 15478 6065828 0.25 6081306 62 15646 6065739 0.26 6081385 63 15577 6064801 0.26 6080378 64 15350 6071128 0.25 6086478 65 15669 6069616 0.26 6085285 66 15593 6073896 0.26 6089489 67 15648 6069717 0.26 6085365 68 15469 6082491 0.25 6097960 69 15551 6073564 0.26 6089115 70 15657 6082724 0.26 6098381 71 15624 6078390 0.26 6094014 72 15626 6078984 0.26 6094610 73 15490 6071367 0.25 6086857 74 15493 6078934 0.25 6094427 75 15580 6073235 0.26 6088815 76 15718 6076296 0.26 6092014 77 15714 6075956 0.26 6091670 78 15811 6081941 0.26 6097752 79 15515 6071067 0.25 6086582 80 15693 6077818 0.26 6093511 81 15529 6085736 0.25 6101265 82 15723 6084023 0.26 6099746 83 15560 6083279 0.26 6098839 84 15670 6078309 0.26 6093979 85 15311 6076409 0.25 6091720 86 15420 6076599 0.25 6092019 87 15843 6076700 0.26 6092543 88 15589 6071110 0.26 6086699 89 15380 6075209 0.25 6090589 90 15597 6076151 0.26 6091748 91 15618 6073130 0.26 6088748 92 15324 6074012 0.25 6089336 93 15642 6082143 0.26 6097785 94 15480 6083181 0.25 6098661 95 15533 6081032 0.25 6096565 96 15648 6080055 0.26 6095703 97 15500 6073200 0.25 6088700 98 15610 6075053 0.26 6090663 99 15358 6080426 0.25 6095784 100 15545 6076250 0.26 6091795 101 15294 6080345 0.25 6095639 102 15360 6075559 0.25 6090919 103 15469 6077112 0.25 6092581 104 15291 6075560 0.25 6090851 105 15286 6073479 0.25 6088765 106 15550 6069816 0.26 6085366 107 15358 6071469 0.25 6086827 108 15340 6062398 0.25 6077738 109 15128 6062621 0.25 6077749 110 15220 6069342 0.25 6084562 111 15394 6067551 0.25 6082945 112 15362 6063301 0.25 6078663 113 15493 6064650 0.25 6080143 114 15201 6059182 0.25 6074383 115 15569 6057820 0.26 6073389 116 15231 6056872 0.25 6072103 117 15559 6056899 0.26 6072458 118 15353 6054968 0.25 6070321 119 15177 6046551 0.25 6061728 120 15383 6039317 0.25 6054700 121 15228 6036104 0.25 6051332 122 15173 6040604 0.25 6055777 123 15181 6038405 0.25 6053586 124 14893 6033558 0.25 6048451 125 15379 6030914 0.25 6046293 126 15386 6020836 0.25 6036222 127 15297 6019819 0.25 6035116 128 15384 6018312 0.25 6033696 129 15380 6013340 0.26 6028720 130 15317 6002997 0.25 6018314 131 15471 6003677 0.26 6019148 132 15256 5997191 0.25 6012447 133 15276 5995312 0.25 6010588 134 15572 5991585 0.26 6007157 135 15425 5983521 0.26 5998946 136 15278 5968554 0.26 5983832 137 15286 5974999 0.26 5990285 138 15602 5977692 0.26 5993294 139 15388 5970216 0.26 5985604 140 15534 5961828 0.26 5977362 141 15537 5955709 0.26 5971246 142 15676 5946768 0.26 5962444 143 15537 5938291 0.26 5953828 144 15605 5940248 0.26 5955853 145 16030 5940012 0.27 5956042 146 16801 5945128 0.28 5961929 147 16812 5939908 0.28 5956720 148 16370 5914338 0.28 5930708 149 16318 5862838 0.28 5879156 150 14454 5503753 0.26 5518207 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3674 1251010 0.29 1254684 2 43929 950621 4.42 994550 3 73540 839199 8.06 912739 4 77026 799059 8.79 876085 5 80077 837960 8.72 918037 6 87105 920762 8.64 1007867 7 92794 937233 9.01 1030027 8 87731 845659 9.40 933390 9 89294 858386 9.42 947680 10 91643 847508 9.76 939151 11 90909 840409 9.76 931318 12 92113 843419 9.85 935532 13 94464 837171 10.14 931635 14 94601 842243 10.10 936844 15 95285 846347 10.12 941632 16 95982 840527 10.25 936509 17 96983 847665 10.27 944648 18 96711 846208 10.26 942919 19 98110 851457 10.33 949567 20 98707 851179 10.39 949886 21 99451 848407 10.49 947858 22 99741 846810 10.54 946551 23 99820 850420 10.50 950240 24 99994 845381 10.58 945375 25 100668 845674 10.64 946342 26 100652 847041 10.62 947693 27 100235 846755 10.58 946990 28 101069 845172 10.68 946241 29 100788 842968 10.68 943756 30 100961 847295 10.65 948256 31 101476 842151 10.75 943627 32 100711 839015 10.72 939726 33 101845 841391 10.80 943236 34 102095 838208 10.86 940303 35 101608 837293 10.82 938901 36 101887 835475 10.87 937362 37 102421 835342 10.92 937763 38 102104 835920 10.89 938024 39 102024 833751 10.90 935775 40 101945 833731 10.90 935676 41 101855 829499 10.94 931354 42 102062 828257 10.97 930319 43 102497 829328 11.00 931825 44 102717 825490 11.07 928207 45 102437 822239 11.08 924676 46 102406 822148 11.08 924554 47 102501 821043 11.10 923544 48 102464 821912 11.08 924376 49 102814 820646 11.13 923460 50 102318 817231 11.13 919549 51 101981 814451 11.13 916432 52 102137 812363 11.17 914500 53 101722 810910 11.15 912632 54 102683 809616 11.26 912299 55 102476 807693 11.26 910169 56 101799 805598 11.22 907397 57 102254 804567 11.28 906821 58 102007 802679 11.28 904686 59 102228 800541 11.32 902769 60 101438 798567 11.27 900005 61 101198 797161 11.26 898359 62 101368 793827 11.32 895195 63 101081 793239 11.30 894320 64 101333 791941 11.34 893274 65 101349 789965 11.37 891314 66 100083 785842 11.30 885925 67 100730 784187 11.38 884917 68 100513 781624 11.39 882137 69 100296 780465 11.39 880761 70 100400 779008 11.42 879408 71 100676 776839 11.47 877515 72 100054 777155 11.41 877209 73 100064 773145 11.46 873209 74 100019 770614 11.49 870633 75 99514 765545 11.50 865059 76 98745 764716 11.44 863461 77 99094 760723 11.53 859817 78 99328 760051 11.56 859379 79 98957 761229 11.50 860186 80 98902 757050 11.55 855952 81 97962 755258 11.48 853220 82 98344 754611 11.53 852955 83 98378 751395 11.58 849773 84 97749 748613 11.55 846362 85 97950 747982 11.58 845932 86 97290 743246 11.57 840536 87 96918 742714 11.54 839632 88 96670 738694 11.57 835364 89 97166 736259 11.66 833425 90 96525 734892 11.61 831417 91 95814 733204 11.56 829018 92 96062 729910 11.63 825972 93 96025 728105 11.65 824130 94 96065 726126 11.68 822191 95 95882 723508 11.70 819390 96 94640 721624 11.59 816264 97 94334 719445 11.59 813779 98 94584 716168 11.67 810752 99 93662 713480 11.60 807142 100 93859 710409 11.67 804268 101 93487 707164 11.68 800651 102 93117 705921 11.65 799038 103 92875 703157 11.67 796032 104 91972 700030 11.61 792002 105 92103 698194 11.65 790297 106 91402 694516 11.63 785918 107 91858 692341 11.71 784199 108 90906 688941 11.66 779847 109 90175 686908 11.60 777083 110 90851 683185 11.74 774036 111 90638 682279 11.73 772917 112 89699 679851 11.66 769550 113 90140 675996 11.77 766136 114 89495 673701 11.73 763196 115 89211 670187 11.75 759398 116 88988 667413 11.76 756401 117 88361 665923 11.71 754284 118 87344 660682 11.68 748026 119 87817 657199 11.79 745016 120 87421 656159 11.76 743580 121 87449 654163 11.79 741612 122 86495 651445 11.72 737940 123 85963 647163 11.73 733126 124 85441 644080 11.71 729521 125 85560 642366 11.75 727926 126 85000 637544 11.76 722544 127 84633 635643 11.75 720276 128 83359 632122 11.65 715481 129 83463 628777 11.72 712240 130 83525 625591 11.78 709116 131 82836 624100 11.72 706936 132 82329 619351 11.73 701680 133 81815 615435 11.73 697250 134 81363 611853 11.74 693216 135 80539 610638 11.65 691177 136 80340 607297 11.68 687637 137 79883 603322 11.69 683205 138 79747 601719 11.70 681466 139 79028 597515 11.68 676543 140 78867 593533 11.73 672400 141 78627 589164 11.77 667791 142 77907 586962 11.72 664869 143 76934 581748 11.68 658682 144 76514 578326 11.68 654840 145 76644 574586 11.77 651230 146 75467 572024 11.66 647491 147 74762 567165 11.65 641927 148 74767 558719 11.80 633486 149 72847 506571 12.57 579418 150 64129 0 100.00 64129 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1792 1302645 0.14 1304437 2 2917 1361828 0.21 1364745 3 7389 2385266 0.31 2392655 4 8710 1241754 0.70 1250464 5 3352 1188512 0.28 1191864 6 3356 1287070 0.26 1290426 7 3896 1421912 0.27 1425808 8 3798 1382850 0.27 1386648 9 3799 1315264 0.29 1319063 10 3601 1299286 0.28 1302887 11 3609 1298296 0.28 1301905 12 3471 1286663 0.27 1290134 13 3585 1285037 0.28 1288622 14 3590 1287813 0.28 1291403 15 3475 1293611 0.27 1297086 16 3596 1294528 0.28 1298124 17 3642 1290361 0.28 1294003 18 3521 1303806 0.27 1307327 19 3657 1300524 0.28 1304181 20 3697 1297547 0.28 1301244 21 3732 1306057 0.28 1309789 22 3649 1302561 0.28 1306210 23 3608 1299803 0.28 1303411 24 3641 1308268 0.28 1311909 25 3614 1302724 0.28 1306338 26 3738 1302234 0.29 1305972 27 3737 1305041 0.29 1308778 28 3671 1302088 0.28 1305759 29 3701 1300178 0.28 1303879 30 3730 1306104 0.28 1309834 31 3748 1299652 0.29 1303400 32 3734 1292444 0.29 1296178 33 3678 1299007 0.28 1302685 34 3733 1294241 0.29 1297974 35 3736 1295673 0.29 1299409 36 3700 1297543 0.28 1301243 37 3686 1290268 0.28 1293954 38 3840 1291877 0.30 1295717 39 3729 1295286 0.29 1299015 40 3751 1286302 0.29 1290053 41 3724 1285664 0.29 1289388 42 3776 1282975 0.29 1286751 43 3718 1278500 0.29 1282218 44 3729 1276707 0.29 1280436 45 3791 1282034 0.29 1285825 46 3786 1274976 0.30 1278762 47 3740 1272728 0.29 1276468 48 3738 1274688 0.29 1278426 49 3761 1268852 0.30 1272613 50 3683 1265811 0.29 1269494 51 3702 1267189 0.29 1270891 52 3755 1260722 0.30 1264477 53 3697 1257483 0.29 1261180 54 3799 1259893 0.30 1263692 55 3635 1256694 0.29 1260329 56 3582 1251794 0.29 1255376 57 3710 1251602 0.30 1255312 58 3780 1247982 0.30 1251762 59 3639 1243795 0.29 1247434 60 3602 1243429 0.29 1247031 61 3663 1241282 0.29 1244945 62 3696 1234264 0.30 1237960 63 3740 1232607 0.30 1236347 64 3707 1231120 0.30 1234827 65 3611 1227573 0.29 1231184 66 3641 1228964 0.30 1232605 67 3703 1223792 0.30 1227495 68 3782 1218933 0.31 1222715 69 3612 1220375 0.30 1223987 70 3634 1214694 0.30 1218328 71 3617 1210420 0.30 1214037 72 3670 1211688 0.30 1215358 73 3608 1209501 0.30 1213109 74 3628 1201304 0.30 1204932 75 3703 1200204 0.31 1203907 76 3648 1195839 0.30 1199487 77 3597 1194944 0.30 1198541 78 3465 1190842 0.29 1194307 79 3590 1186485 0.30 1190075 80 3464 1185048 0.29 1188512 81 3538 1183543 0.30 1187081 82 3506 1177760 0.30 1181266 83 3577 1172693 0.30 1176270 84 3461 1172371 0.29 1175832 85 3547 1168566 0.30 1172113 86 3484 1164136 0.30 1167620 87 3476 1164542 0.30 1168018 88 3554 1156680 0.31 1160234 89 3441 1151113 0.30 1154554 90 3526 1150239 0.31 1153765 91 3479 1145221 0.30 1148700 92 3336 1142262 0.29 1145598 93 3297 1142384 0.29 1145681 94 3299 1135875 0.29 1139174 95 3347 1131457 0.29 1134804 96 3325 1131231 0.29 1134556 97 3429 1126426 0.30 1129855 98 3297 1117646 0.29 1120943 99 3298 1120833 0.29 1124131 100 3379 1112608 0.30 1115987 101 3291 1109064 0.30 1112355 102 3274 1107676 0.29 1110950 103 3246 1100604 0.29 1103850 104 3238 1095113 0.29 1098351 105 3349 1094128 0.31 1097477 106 3342 1086487 0.31 1089829 107 3211 1083222 0.30 1086433 108 3273 1081851 0.30 1085124 109 3347 1075761 0.31 1079108 110 3300 1070219 0.31 1073519 111 3205 1069207 0.30 1072412 112 3218 1065025 0.30 1068243 113 3319 1056985 0.31 1060304 114 3193 1057138 0.30 1060331 115 3126 1050124 0.30 1053250 116 3151 1045801 0.30 1048952 117 3120 1044432 0.30 1047552 118 3165 1034776 0.30 1037941 119 3101 1032454 0.30 1035555 120 3073 1028860 0.30 1031933 121 3070 1023131 0.30 1026201 122 3064 1019770 0.30 1022834 123 3090 1014812 0.30 1017902 124 3026 1009605 0.30 1012631 125 3080 1004869 0.31 1007949 126 3043 1002257 0.30 1005300 127 3055 994515 0.31 997570 128 3009 987529 0.30 990538 129 2998 986855 0.30 989853 130 3035 978531 0.31 981566 131 2921 974518 0.30 977439 132 3063 969806 0.31 972869 133 3012 964687 0.31 967699 134 3015 956947 0.31 959962 135 3033 954063 0.32 957096 136 2958 949233 0.31 952191 137 2998 941641 0.32 944639 138 2898 939448 0.31 942346 139 3030 932856 0.32 935886 140 2925 924797 0.32 927722 141 2929 923622 0.32 926551 142 2898 914769 0.32 917667 143 2788 911324 0.30 914112 144 2877 905511 0.32 908388 145 2863 900335 0.32 903198 146 2922 890673 0.33 893595 147 2988 884681 0.34 887669 148 2851 872267 0.33 875118 149 2726 805446 0.34 808172 150 1908 0 100.00 1908 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 7556 5887280 0.13 5894836 2 10274 5133691 0.20 5143965 3 14344 6561820 0.22 6576164 4 15793 6815562 0.23 6831355 5 13553 6103170 0.22 6116723 6 12867 5735541 0.22 5748408 7 13058 5779846 0.23 5792904 8 12850 5678061 0.23 5690911 9 13076 5743912 0.23 5756988 10 13177 5695258 0.23 5708435 11 13250 5703976 0.23 5717226 12 13222 5719093 0.23 5732315 13 13239 5673333 0.23 5686572 14 13177 5683987 0.23 5697164 15 13340 5685410 0.23 5698750 16 13398 5681140 0.24 5694538 17 13680 5692024 0.24 5705704 18 13470 5684993 0.24 5698463 19 13814 5691252 0.24 5705066 20 13617 5672188 0.24 5685805 21 13678 5680124 0.24 5693802 22 13797 5667746 0.24 5681543 23 13813 5659165 0.24 5672978 24 13854 5661579 0.24 5675433 25 13892 5662105 0.24 5675997 26 13855 5650109 0.24 5663964 27 13937 5660554 0.25 5674491 28 14226 5656057 0.25 5670283 29 13945 5640494 0.25 5654439 30 13941 5646069 0.25 5660010 31 14185 5636702 0.25 5650887 32 13904 5616463 0.25 5630367 33 14185 5614449 0.25 5628634 34 14083 5600984 0.25 5615067 35 14236 5595948 0.25 5610184 36 13715 5594795 0.24 5608510 37 14076 5589135 0.25 5603211 38 13997 5584553 0.25 5598550 39 14193 5583903 0.25 5598096 40 14089 5570270 0.25 5584359 41 14241 5557265 0.26 5571506 42 13880 5547393 0.25 5561273 43 13869 5539200 0.25 5553069 44 14097 5525769 0.25 5539866 45 13995 5528655 0.25 5542650 46 13881 5521075 0.25 5534956 47 14142 5508690 0.26 5522832 48 14190 5507948 0.26 5522138 49 13970 5494895 0.25 5508865 50 13978 5484246 0.25 5498224 51 14046 5468233 0.26 5482279 52 13989 5458375 0.26 5472364 53 13986 5447738 0.26 5461724 54 13813 5440586 0.25 5454399 55 13922 5431601 0.26 5445523 56 14112 5421414 0.26 5435526 57 13713 5410495 0.25 5424208 58 13844 5404114 0.26 5417958 59 13714 5389304 0.25 5403018 60 13766 5375683 0.26 5389449 61 13653 5372232 0.25 5385885 62 13818 5355869 0.26 5369687 63 13678 5349057 0.26 5362735 64 13702 5331568 0.26 5345270 65 13481 5319132 0.25 5332613 66 13631 5311431 0.26 5325062 67 13581 5306565 0.26 5320146 68 13538 5285521 0.26 5299059 69 13591 5277171 0.26 5290762 70 13426 5262924 0.25 5276350 71 13428 5249905 0.26 5263333 72 13458 5239709 0.26 5253167 73 13391 5229785 0.26 5243176 74 13432 5207929 0.26 5221361 75 13280 5195931 0.25 5209211 76 13435 5188460 0.26 5201895 77 13133 5166587 0.25 5179720 78 13156 5161044 0.25 5174200 79 13250 5152880 0.26 5166130 80 13012 5139477 0.25 5152489 81 13148 5125893 0.26 5139041 82 13031 5111202 0.25 5124233 83 13082 5089020 0.26 5102102 84 12784 5074424 0.25 5087208 85 13070 5061505 0.26 5074575 86 12819 5052271 0.25 5065090 87 12677 5042728 0.25 5055405 88 12905 5025527 0.26 5038432 89 12516 5011886 0.25 5024402 90 12645 5000315 0.25 5012960 91 12485 4989091 0.25 5001576 92 12546 4966054 0.25 4978600 93 12401 4957161 0.25 4969562 94 12590 4943411 0.25 4956001 95 12374 4913671 0.25 4926045 96 12168 4901944 0.25 4914112 97 12230 4889948 0.25 4902178 98 12136 4871377 0.25 4883513 99 12340 4857057 0.25 4869397 100 12177 4843043 0.25 4855220 101 12230 4825196 0.25 4837426 102 12382 4813208 0.26 4825590 103 12100 4795537 0.25 4807637 104 11898 4770279 0.25 4782177 105 11964 4758970 0.25 4770934 106 12101 4738370 0.25 4750471 107 11853 4717356 0.25 4729209 108 11726 4703309 0.25 4715035 109 11764 4685619 0.25 4697383 110 11793 4663692 0.25 4675485 111 11594 4656018 0.25 4667612 112 11601 4635070 0.25 4646671 113 11438 4617554 0.25 4628992 114 11484 4603593 0.25 4615077 115 11590 4581946 0.25 4593536 116 11237 4563576 0.25 4574813 117 11339 4541511 0.25 4552850 118 11371 4520240 0.25 4531611 119 11181 4497835 0.25 4509016 120 11245 4480860 0.25 4492105 121 10988 4462051 0.25 4473039 122 11407 4443907 0.26 4455314 123 11099 4422247 0.25 4433346 124 11213 4403165 0.25 4414378 125 10874 4380187 0.25 4391061 126 10962 4357095 0.25 4368057 127 11026 4336096 0.25 4347122 128 11148 4311155 0.26 4322303 129 10974 4295124 0.25 4306098 130 10942 4274672 0.26 4285614 131 11045 4251873 0.26 4262918 132 10963 4234816 0.26 4245779 133 11154 4211966 0.26 4223120 134 10957 4185585 0.26 4196542 135 11070 4167631 0.26 4178701 136 10860 4146113 0.26 4156973 137 10948 4122830 0.26 4133778 138 11001 4101401 0.27 4112402 139 10781 4074943 0.26 4085724 140 10887 4046914 0.27 4057801 141 10782 4032118 0.27 4042900 142 10534 4003297 0.26 4013831 143 10745 3981554 0.27 3992299 144 10875 3952539 0.27 3963414 145 10830 3930310 0.27 3941140 146 10900 3894584 0.28 3905484 147 11022 3864955 0.28 3875977 148 10843 3819027 0.28 3829870 149 10479 3519634 0.30 3530113 150 7207 0 100.00 7207