CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 106726 681493 13.54 788219 2 128335 850759 13.11 979094 3 110064 799934 12.09 909998 4 109573 847040 11.45 956613 5 123774 939060 11.65 1062834 6 130332 956713 11.99 1087045 7 121183 863779 12.30 984962 8 119799 867345 12.14 987144 9 119818 865914 12.16 985732 10 118559 860862 12.11 979421 11 118541 865723 12.04 984264 12 122271 871044 12.31 993315 13 120349 869101 12.16 989450 14 121438 874816 12.19 996254 15 121999 873263 12.26 995262 16 122483 881534 12.20 1004017 17 122610 882253 12.20 1004863 18 123202 887123 12.19 1010325 19 122957 887525 12.17 1010482 20 123237 890683 12.15 1013920 21 123710 891217 12.19 1014927 22 123850 888545 12.23 1012395 23 123692 887734 12.23 1011426 24 124411 889226 12.27 1013637 25 123207 891341 12.14 1014548 26 124553 896359 12.20 1020912 27 124745 899947 12.17 1024692 28 123447 895122 12.12 1018569 29 124574 903668 12.12 1028242 30 125434 898825 12.25 1024259 31 124366 896315 12.18 1020681 32 124831 898343 12.20 1023174 33 124508 899241 12.16 1023749 34 125034 898077 12.22 1023111 35 124264 900569 12.13 1024833 36 124852 902651 12.15 1027503 37 124368 901823 12.12 1026191 38 125593 906047 12.17 1031640 39 125159 905200 12.15 1030359 40 124973 903338 12.15 1028311 41 125273 905836 12.15 1031109 42 125874 906309 12.19 1032183 43 125208 902672 12.18 1027880 44 124936 902117 12.16 1027053 45 125127 903854 12.16 1028981 46 124830 902878 12.15 1027708 47 125316 908861 12.12 1034177 48 126068 908017 12.19 1034085 49 125306 906637 12.14 1031943 50 125525 908564 12.14 1034089 51 125267 906878 12.14 1032145 52 125033 903490 12.16 1028523 53 125410 906537 12.15 1031947 54 125980 905473 12.21 1031453 55 125040 904146 12.15 1029186 56 124616 905260 12.10 1029876 57 124805 908130 12.08 1032935 58 125427 905405 12.17 1030832 59 124348 906297 12.07 1030645 60 125542 907221 12.16 1032763 61 124416 904780 12.09 1029196 62 124495 905872 12.08 1030367 63 124828 907180 12.10 1032008 64 124855 906443 12.11 1031298 65 124280 905447 12.07 1029727 66 125526 905534 12.17 1031060 67 124118 904925 12.06 1029043 68 125245 905746 12.15 1030991 69 124614 905798 12.09 1030412 70 125147 905135 12.15 1030282 71 124439 908264 12.05 1032703 72 124506 908280 12.06 1032786 73 124271 904928 12.07 1029199 74 124490 905877 12.08 1030367 75 124019 904241 12.06 1028260 76 124436 902977 12.11 1027413 77 123642 904603 12.02 1028245 78 124111 905447 12.05 1029558 79 123389 904266 12.01 1027655 80 124211 904255 12.08 1028466 81 124938 905006 12.13 1029944 82 124163 905967 12.05 1030130 83 123559 904485 12.02 1028044 84 123661 903025 12.04 1026686 85 123189 901380 12.02 1024569 86 123309 904214 12.00 1027523 87 123277 902692 12.02 1025969 88 122916 899112 12.03 1022028 89 123137 905104 11.98 1028241 90 123171 904706 11.98 1027877 91 122451 902255 11.95 1024706 92 122834 904803 11.95 1027637 93 123020 902926 11.99 1025946 94 123359 901426 12.04 1024785 95 122897 904649 11.96 1027546 96 122392 901272 11.96 1023664 97 123063 901668 12.01 1024731 98 122704 900645 11.99 1023349 99 122124 901918 11.93 1024042 100 121338 898531 11.90 1019869 101 120956 900746 11.84 1021702 102 121452 900347 11.89 1021799 103 121125 896828 11.90 1017953 104 121448 899457 11.90 1020905 105 120928 898970 11.86 1019898 106 120505 897666 11.84 1018171 107 120834 898747 11.85 1019581 108 120584 897730 11.84 1018314 109 120572 898660 11.83 1019232 110 120389 898146 11.82 1018535 111 120389 899352 11.81 1019741 112 120158 895317 11.83 1015475 113 119988 899906 11.76 1019894 114 120043 897133 11.80 1017176 115 119919 896137 11.80 1016056 116 120512 895131 11.87 1015643 117 118838 895688 11.71 1014526 118 118834 896661 11.70 1015495 119 118916 895022 11.73 1013938 120 119193 895816 11.74 1015009 121 118602 891969 11.74 1010571 122 117735 893953 11.64 1011688 123 117802 894672 11.64 1012474 124 117741 890800 11.67 1008541 125 117128 893219 11.59 1010347 126 117990 889503 11.71 1007493 127 117266 890568 11.64 1007834 128 117297 888303 11.66 1005600 129 116561 888124 11.60 1004685 130 116381 888170 11.59 1004551 131 116542 888148 11.60 1004690 132 115889 886017 11.57 1001906 133 115450 885228 11.54 1000678 134 115829 887288 11.55 1003117 135 115906 886963 11.56 1002869 136 114689 881795 11.51 996484 137 114558 882441 11.49 996999 138 114415 884227 11.46 998642 139 114867 882237 11.52 997104 140 113671 881118 11.43 994789 141 114187 881316 11.47 995503 142 113617 876596 11.47 990213 143 113166 878729 11.41 991895 144 112499 879184 11.34 991683 145 112036 877183 11.33 989219 146 113146 878293 11.41 991439 147 111364 877745 11.26 989109 148 110501 872347 11.24 982848 149 107753 872934 10.99 980687 150 95404 805467 10.59 900871 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3198 2220712 0.14 2223910 2 3280 1237059 0.26 1240339 3 2474 1183580 0.21 1186054 4 2418 1330727 0.18 1333145 5 3232 1527882 0.21 1531114 6 3106 1471063 0.21 1474169 7 2950 1377510 0.21 1380460 8 3145 1380781 0.23 1383926 9 3138 1373763 0.23 1376901 10 3047 1372215 0.22 1375262 11 3193 1378083 0.23 1381276 12 3100 1376301 0.22 1379401 13 3271 1383961 0.24 1387232 14 3255 1380520 0.24 1383775 15 3335 1381497 0.24 1384832 16 3387 1391373 0.24 1394760 17 3507 1397602 0.25 1401109 18 3473 1395972 0.25 1399445 19 3584 1407821 0.25 1411405 20 3511 1400416 0.25 1403927 21 3519 1403268 0.25 1406787 22 3514 1405143 0.25 1408657 23 3544 1404329 0.25 1407873 24 3620 1408056 0.26 1411676 25 3495 1408419 0.25 1411914 26 3530 1408849 0.25 1412379 27 3599 1411405 0.25 1415004 28 3640 1421947 0.26 1425587 29 3807 1414360 0.27 1418167 30 3678 1415135 0.26 1418813 31 3520 1419780 0.25 1423300 32 3650 1418409 0.26 1422059 33 3627 1421706 0.25 1425333 34 3714 1420372 0.26 1424086 35 3735 1419348 0.26 1423083 36 3778 1419855 0.27 1423633 37 3865 1427592 0.27 1431457 38 3838 1422864 0.27 1426702 39 3701 1422918 0.26 1426619 40 3823 1424844 0.27 1428667 41 3793 1425085 0.27 1428878 42 3724 1422278 0.26 1426002 43 3697 1425766 0.26 1429463 44 3779 1421480 0.27 1425259 45 3801 1422006 0.27 1425807 46 3627 1427761 0.25 1431388 47 3721 1425649 0.26 1429370 48 3719 1427465 0.26 1431184 49 3711 1429481 0.26 1433192 50 3852 1426135 0.27 1429987 51 3812 1423732 0.27 1427544 52 3806 1426336 0.27 1430142 53 3847 1428662 0.27 1432509 54 3753 1425472 0.26 1429225 55 3783 1426976 0.26 1430759 56 3814 1425590 0.27 1429404 57 3825 1428002 0.27 1431827 58 3859 1426082 0.27 1429941 59 3786 1429689 0.26 1433475 60 3685 1425478 0.26 1429163 61 3893 1428599 0.27 1432492 62 3912 1425806 0.27 1429718 63 3813 1426952 0.27 1430765 64 3778 1427418 0.26 1431196 65 3867 1430581 0.27 1434448 66 3741 1424572 0.26 1428313 67 3806 1428692 0.27 1432498 68 3809 1427193 0.27 1431002 69 3912 1424530 0.27 1428442 70 3874 1430298 0.27 1434172 71 3642 1428781 0.25 1432423 72 3855 1428529 0.27 1432384 73 3911 1429830 0.27 1433741 74 3894 1425020 0.27 1428914 75 3935 1427904 0.27 1431839 76 3840 1429585 0.27 1433425 77 3929 1425713 0.27 1429642 78 3974 1428096 0.28 1432070 79 3761 1429559 0.26 1433320 80 4007 1427758 0.28 1431765 81 3864 1424769 0.27 1428633 82 3898 1426330 0.27 1430228 83 3901 1429439 0.27 1433340 84 3792 1422987 0.27 1426779 85 3876 1429699 0.27 1433575 86 3836 1426454 0.27 1430290 87 3929 1422900 0.28 1426829 88 3766 1422126 0.26 1425892 89 3819 1425201 0.27 1429020 90 3733 1423329 0.26 1427062 91 3948 1426897 0.28 1430845 92 3842 1425738 0.27 1429580 93 3843 1420640 0.27 1424483 94 3860 1424856 0.27 1428716 95 3770 1421226 0.26 1424996 96 3939 1420027 0.28 1423966 97 3888 1420287 0.27 1424175 98 3919 1421399 0.27 1425318 99 3826 1418666 0.27 1422492 100 3979 1420590 0.28 1424569 101 3904 1420663 0.27 1424567 102 3909 1418295 0.27 1422204 103 3986 1420302 0.28 1424288 104 3968 1416318 0.28 1420286 105 3891 1417697 0.27 1421588 106 3953 1422289 0.28 1426242 107 3808 1418835 0.27 1422643 108 3853 1414983 0.27 1418836 109 3916 1416596 0.28 1420512 110 3863 1417035 0.27 1420898 111 3806 1412042 0.27 1415848 112 3830 1415378 0.27 1419208 113 3787 1413372 0.27 1417159 114 3701 1412002 0.26 1415703 115 3702 1411215 0.26 1414917 116 3746 1411131 0.26 1414877 117 3816 1410438 0.27 1414254 118 3779 1413491 0.27 1417270 119 3821 1410494 0.27 1414315 120 3814 1407210 0.27 1411024 121 3700 1409250 0.26 1412950 122 3825 1409126 0.27 1412951 123 3935 1404619 0.28 1408554 124 3709 1405905 0.26 1409614 125 3856 1402453 0.27 1406309 126 3708 1400372 0.26 1404080 127 3849 1403603 0.27 1407452 128 3715 1398642 0.26 1402357 129 3670 1399449 0.26 1403119 130 3745 1399161 0.27 1402906 131 3706 1396591 0.26 1400297 132 3757 1392762 0.27 1396519 133 3808 1392456 0.27 1396264 134 3756 1394455 0.27 1398211 135 3672 1394030 0.26 1397702 136 3847 1388769 0.28 1392616 137 3879 1387808 0.28 1391687 138 3770 1386714 0.27 1390484 139 3880 1390906 0.28 1394786 140 3850 1384646 0.28 1388496 141 3852 1382754 0.28 1386606 142 3805 1380716 0.27 1384521 143 3964 1378961 0.29 1382925 144 3839 1377907 0.28 1381746 145 4069 1385254 0.29 1389323 146 4324 1377998 0.31 1382322 147 4256 1374440 0.31 1378696 148 4290 1372536 0.31 1376826 149 3871 1364072 0.28 1367943 150 3683 1240439 0.30 1244122 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 8618 5618719 0.15 5627337 2 9461 4787707 0.20 4797168 3 9232 5101434 0.18 5110666 4 9438 6002497 0.16 6011935 5 10472 6685294 0.16 6695766 6 10729 6680279 0.16 6691008 7 10203 6216076 0.16 6226279 8 10288 6159848 0.17 6170136 9 10263 6067564 0.17 6077827 10 10416 6017950 0.17 6028366 11 10531 6032501 0.17 6043032 12 10786 6037326 0.18 6048112 13 10766 6019594 0.18 6030360 14 11255 6039514 0.19 6050769 15 11405 6056757 0.19 6068162 16 11439 6083330 0.19 6094769 17 11639 6100746 0.19 6112385 18 11642 6119657 0.19 6131299 19 11774 6114648 0.19 6126422 20 11830 6103970 0.19 6115800 21 11734 6102148 0.19 6113882 22 12119 6092037 0.20 6104156 23 11997 6090287 0.20 6102284 24 12197 6114979 0.20 6127176 25 12096 6111973 0.20 6124069 26 12288 6123944 0.20 6136232 27 12553 6136163 0.20 6148716 28 12590 6142051 0.20 6154641 29 12530 6147511 0.20 6160041 30 12419 6154269 0.20 6166688 31 12617 6148747 0.20 6161364 32 12739 6133748 0.21 6146487 33 12673 6130076 0.21 6142749 34 12531 6135640 0.20 6148171 35 12462 6144435 0.20 6156897 36 12704 6150666 0.21 6163370 37 12828 6147913 0.21 6160741 38 12857 6152900 0.21 6165757 39 12877 6166886 0.21 6179763 40 12894 6160051 0.21 6172945 41 12801 6153677 0.21 6166478 42 12731 6151514 0.21 6164245 43 12787 6139833 0.21 6152620 44 12890 6142950 0.21 6155840 45 12764 6149121 0.21 6161885 46 12517 6151226 0.20 6163743 47 12978 6156177 0.21 6169155 48 12792 6162583 0.21 6175375 49 12964 6167726 0.21 6180690 50 13051 6167719 0.21 6180770 51 12834 6170325 0.21 6183159 52 12853 6167949 0.21 6180802 53 13083 6167415 0.21 6180498 54 12944 6170825 0.21 6183769 55 12823 6159003 0.21 6171826 56 13100 6169225 0.21 6182325 57 13043 6160806 0.21 6173849 58 13314 6158855 0.22 6172169 59 12842 6158966 0.21 6171808 60 12972 6168867 0.21 6181839 61 13051 6163486 0.21 6176537 62 13201 6167865 0.21 6181066 63 13108 6170998 0.21 6184106 64 12933 6177694 0.21 6190627 65 13130 6173816 0.21 6186946 66 13203 6175828 0.21 6189031 67 13203 6174565 0.21 6187768 68 13347 6177846 0.22 6191193 69 12981 6182158 0.21 6195139 70 13273 6187784 0.21 6201057 71 13127 6185512 0.21 6198639 72 13378 6182635 0.22 6196013 73 13082 6176327 0.21 6189409 74 13100 6181420 0.21 6194520 75 13129 6177654 0.21 6190783 76 13329 6184495 0.22 6197824 77 13318 6180816 0.22 6194134 78 13485 6182378 0.22 6195863 79 13357 6177420 0.22 6190777 80 13299 6176276 0.21 6189575 81 13463 6183357 0.22 6196820 82 13451 6186140 0.22 6199591 83 13371 6184097 0.22 6197468 84 13105 6185376 0.21 6198481 85 13015 6178994 0.21 6192009 86 13071 6179870 0.21 6192941 87 13264 6171473 0.21 6184737 88 12942 6174942 0.21 6187884 89 13430 6180983 0.22 6194413 90 13300 6183218 0.21 6196518 91 13277 6174437 0.21 6187714 92 13188 6174590 0.21 6187778 93 13180 6179211 0.21 6192391 94 13229 6183634 0.21 6196863 95 13336 6179362 0.22 6192698 96 13487 6182240 0.22 6195727 97 13324 6176820 0.22 6190144 98 13391 6175098 0.22 6188489 99 13407 6175843 0.22 6189250 100 13432 6180801 0.22 6194233 101 13241 6180815 0.21 6194056 102 13193 6180003 0.21 6193196 103 13263 6173769 0.21 6187032 104 13115 6177803 0.21 6190918 105 13224 6171746 0.21 6184970 106 13222 6173089 0.21 6186311 107 13193 6173375 0.21 6186568 108 13276 6159446 0.22 6172722 109 13093 6160450 0.21 6173543 110 13179 6163301 0.21 6176480 111 13215 6167481 0.21 6180696 112 13103 6159573 0.21 6172676 113 13196 6164570 0.21 6177766 114 13194 6155762 0.21 6168956 115 13386 6154834 0.22 6168220 116 13304 6158446 0.22 6171750 117 13426 6156147 0.22 6169573 118 13149 6150088 0.21 6163237 119 13189 6149120 0.21 6162309 120 13206 6139253 0.21 6152459 121 13345 6142134 0.22 6155479 122 13321 6138791 0.22 6152112 123 13272 6139002 0.22 6152274 124 13426 6130945 0.22 6144371 125 13128 6124836 0.21 6137964 126 13131 6122292 0.21 6135423 127 13229 6120143 0.22 6133372 128 13540 6111098 0.22 6124638 129 13145 6109362 0.21 6122507 130 13112 6102126 0.21 6115238 131 13299 6102953 0.22 6116252 132 13282 6093438 0.22 6106720 133 13280 6091800 0.22 6105080 134 13214 6087991 0.22 6101205 135 13466 6084936 0.22 6098402 136 13108 6069525 0.22 6082633 137 13414 6072660 0.22 6086074 138 13354 6075775 0.22 6089129 139 13509 6067077 0.22 6080586 140 13412 6059802 0.22 6073214 141 13554 6049576 0.22 6063130 142 13526 6047719 0.22 6061245 143 13706 6044472 0.23 6058178 144 13962 6042170 0.23 6056132 145 14070 6043605 0.23 6057675 146 14745 6045864 0.24 6060609 147 15048 6041446 0.25 6056494 148 14669 6017447 0.24 6032116 149 14528 5956450 0.24 5970978 150 13011 5583831 0.23 5596842 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3089 1241486 0.25 1244575 2 36968 976203 3.65 1013171 3 74119 825371 8.24 899490 4 77023 785686 8.93 862709 5 80706 837921 8.79 918627 6 88698 935075 8.66 1023773 7 94698 951561 9.05 1046259 8 89463 855344 9.47 944807 9 90166 860487 9.48 950653 10 91734 854518 9.69 946252 11 91029 845920 9.72 936949 12 92259 848875 9.80 941134 13 94456 852107 9.98 946563 14 94202 850204 9.97 944406 15 94834 855448 9.98 950282 16 96195 854519 10.12 950714 17 97292 860262 10.16 957554 18 97286 861222 10.15 958508 19 98912 865063 10.26 963975 20 98614 863253 10.25 961867 21 99248 862359 10.32 961607 22 99614 860171 10.38 959785 23 100028 860932 10.41 960960 24 99620 857974 10.40 957594 25 101495 860421 10.55 961916 26 100844 861872 10.47 962716 27 100755 861502 10.47 962257 28 101111 860909 10.51 962020 29 100701 859357 10.49 960058 30 101740 862979 10.55 964719 31 102064 855584 10.66 957648 32 101832 854320 10.65 956152 33 102009 856640 10.64 958649 34 102293 856070 10.67 958363 35 102455 851895 10.74 954350 36 102145 851596 10.71 953741 37 102682 852286 10.75 954968 38 103083 852704 10.79 955787 39 102820 852371 10.76 955191 40 103401 850217 10.84 953618 41 103314 849811 10.84 953125 42 103024 845896 10.86 948920 43 103113 847075 10.85 950188 44 102893 843377 10.87 946270 45 102828 839823 10.91 942651 46 103213 839846 10.94 943059 47 103282 839551 10.95 942833 48 103659 839808 10.99 943467 49 103842 840062 11.00 943904 50 103515 837016 11.01 940531 51 103393 834973 11.02 938366 52 102918 832540 11.00 935458 53 103505 830844 11.08 934349 54 102896 830139 11.03 933035 55 103284 828037 11.09 931321 56 103452 825593 11.14 929045 57 102997 825498 11.09 928495 58 103690 825011 11.17 928701 59 103225 823703 11.14 926928 60 102801 820701 11.13 923502 61 103047 821774 11.14 924821 62 102619 817013 11.16 919632 63 102701 816124 11.18 918825 64 102887 816132 11.20 919019 65 102975 811178 11.26 914153 66 102731 812704 11.22 915435 67 103421 808634 11.34 912055 68 101794 807411 11.20 909205 69 102669 805706 11.30 908375 70 102801 803478 11.34 906279 71 102097 800869 11.31 902966 72 102069 800432 11.31 902501 73 101714 798610 11.30 900324 74 102078 797412 11.35 899490 75 102399 792668 11.44 895067 76 102368 791567 11.45 893935 77 101137 790482 11.34 891619 78 101477 789306 11.39 890783 79 101501 788451 11.41 889952 80 101328 786292 11.42 887620 81 101275 782925 11.45 884200 82 101124 783798 11.43 884922 83 101465 779986 11.51 881451 84 100840 777655 11.48 878495 85 101186 774325 11.56 875511 86 100585 773636 11.51 874221 87 99907 773412 11.44 873319 88 100206 770945 11.50 871151 89 100039 768487 11.52 868526 90 99583 765207 11.52 864790 91 100180 764956 11.58 865136 92 100115 762144 11.61 862259 93 98802 761955 11.48 860757 94 98995 759341 11.53 858336 95 98901 755221 11.58 854122 96 98740 755317 11.56 854057 97 98649 750561 11.62 849210 98 98123 750210 11.57 848333 99 97627 747255 11.56 844882 100 98120 746786 11.61 844906 101 97418 742778 11.59 840196 102 97369 741286 11.61 838655 103 96962 739787 11.59 836749 104 96763 734921 11.63 831684 105 96814 733062 11.67 829876 106 96889 731920 11.69 828809 107 96138 729379 11.65 825517 108 95548 727627 11.61 823175 109 95425 725040 11.63 820465 110 95043 722277 11.63 817320 111 95059 720424 11.66 815483 112 94946 719169 11.66 814115 113 94370 715642 11.65 810012 114 94302 713175 11.68 807477 115 93843 710941 11.66 804784 116 93624 707209 11.69 800833 117 93339 704482 11.70 797821 118 92607 702839 11.64 795446 119 92547 701467 11.66 794014 120 92098 699141 11.64 791239 121 92186 695443 11.70 787629 122 91543 693433 11.66 784976 123 91202 692327 11.64 783529 124 91196 688247 11.70 779443 125 90973 683850 11.74 774823 126 90476 682172 11.71 772648 127 90327 680992 11.71 771319 128 89105 677327 11.63 766432 129 89115 673241 11.69 762356 130 89126 670649 11.73 759775 131 88130 669044 11.64 757174 132 88198 666130 11.69 754328 133 88078 664210 11.71 752288 134 86781 659501 11.63 746282 135 86686 658957 11.63 745643 136 86663 653697 11.71 740360 137 86096 652386 11.66 738482 138 86294 648332 11.75 734626 139 85031 646420 11.62 731451 140 84656 642880 11.64 727536 141 84910 638757 11.73 723667 142 84976 636273 11.78 721249 143 83370 633073 11.64 716443 144 83038 628749 11.67 711787 145 82967 628037 11.67 711004 146 82194 623662 11.64 705856 147 81738 617818 11.68 699556 148 81541 609550 11.80 691091 149 79435 551103 12.60 630538 150 70531 0 100.00 70531 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1091 1314521 0.08 1315612 2 1908 1337669 0.14 1339577 3 6265 2487012 0.25 2493277 4 5807 1221952 0.47 1227759 5 2646 1158793 0.23 1161439 6 2649 1279262 0.21 1281911 7 3138 1449955 0.22 1453093 8 2986 1402603 0.21 1405589 9 2947 1315719 0.22 1318666 10 2911 1311659 0.22 1314570 11 2872 1310339 0.22 1313211 12 2804 1302906 0.21 1305710 13 2923 1304624 0.22 1307547 14 2874 1306426 0.22 1309300 15 2903 1315848 0.22 1318751 16 2914 1313607 0.22 1316521 17 2950 1311529 0.22 1314479 18 2991 1324008 0.23 1326999 19 2990 1322089 0.23 1325079 20 2979 1321215 0.22 1324194 21 2952 1329414 0.22 1332366 22 3053 1320714 0.23 1323767 23 3074 1324317 0.23 1327391 24 3113 1328280 0.23 1331393 25 3128 1322349 0.24 1325477 26 3139 1325590 0.24 1328729 27 3111 1328493 0.23 1331604 28 3068 1326792 0.23 1329860 29 3105 1322665 0.23 1325770 30 3194 1329909 0.24 1333103 31 3105 1323927 0.23 1327032 32 3097 1315721 0.23 1318818 33 3061 1321878 0.23 1324939 34 3217 1321598 0.24 1324815 35 3199 1321208 0.24 1324407 36 3061 1321970 0.23 1325031 37 3119 1317073 0.24 1320192 38 3310 1315416 0.25 1318726 39 3032 1316349 0.23 1319381 40 3173 1312474 0.24 1315647 41 3203 1310081 0.24 1313284 42 3188 1310510 0.24 1313698 43 3245 1307928 0.25 1311173 44 3194 1302295 0.24 1305489 45 3335 1305209 0.25 1308544 46 3157 1303420 0.24 1306577 47 3199 1299047 0.25 1302246 48 3134 1303703 0.24 1306837 49 3203 1297310 0.25 1300513 50 3068 1296012 0.24 1299080 51 3258 1297668 0.25 1300926 52 3072 1292096 0.24 1295168 53 3209 1287456 0.25 1290665 54 3157 1286923 0.24 1290080 55 3181 1287553 0.25 1290734 56 3126 1281251 0.24 1284377 57 3240 1282158 0.25 1285398 58 3128 1279619 0.24 1282747 59 3150 1275827 0.25 1278977 60 3176 1273565 0.25 1276741 61 3269 1274729 0.26 1277998 62 3047 1268505 0.24 1271552 63 3173 1268981 0.25 1272154 64 3146 1263255 0.25 1266401 65 3111 1261817 0.25 1264928 66 3185 1263245 0.25 1266430 67 3201 1258209 0.25 1261410 68 3203 1254945 0.25 1258148 69 3291 1255389 0.26 1258680 70 3150 1250991 0.25 1254141 71 3225 1246440 0.26 1249665 72 3269 1246897 0.26 1250166 73 3273 1244643 0.26 1247916 74 3227 1241888 0.26 1245115 75 3124 1240256 0.25 1243380 76 3130 1234684 0.25 1237814 77 3175 1232133 0.26 1235308 78 3110 1231646 0.25 1234756 79 3231 1228534 0.26 1231765 80 3052 1225767 0.25 1228819 81 3089 1223897 0.25 1226986 82 3108 1219257 0.25 1222365 83 3184 1216399 0.26 1219583 84 3083 1214646 0.25 1217729 85 3167 1210566 0.26 1213733 86 3066 1205874 0.25 1208940 87 3102 1208548 0.26 1211650 88 3099 1203979 0.26 1207078 89 3085 1198408 0.26 1201493 90 3144 1196979 0.26 1200123 91 3145 1193178 0.26 1196323 92 3167 1186211 0.27 1189378 93 3074 1188328 0.26 1191402 94 3127 1184393 0.26 1187520 95 3135 1179591 0.27 1182726 96 3165 1183618 0.27 1186783 97 3069 1174569 0.26 1177638 98 2969 1168261 0.25 1171230 99 3019 1171624 0.26 1174643 100 3027 1164190 0.26 1167217 101 3088 1162226 0.26 1165314 102 2903 1156708 0.25 1159611 103 2885 1152557 0.25 1155442 104 2962 1148523 0.26 1151485 105 2989 1148128 0.26 1151117 106 2937 1143857 0.26 1146794 107 2913 1140427 0.25 1143340 108 2953 1139317 0.26 1142270 109 3069 1134540 0.27 1137609 110 3081 1126377 0.27 1129458 111 2987 1127228 0.26 1130215 112 3040 1122771 0.27 1125811 113 2920 1119452 0.26 1122372 114 2861 1115752 0.26 1118613 115 2969 1110236 0.27 1113205 116 2924 1108081 0.26 1111005 117 2863 1102468 0.26 1105331 118 2823 1098047 0.26 1100870 119 2880 1094063 0.26 1096943 120 2961 1092816 0.27 1095777 121 2959 1087931 0.27 1090890 122 2863 1083530 0.26 1086393 123 2808 1079961 0.26 1082769 124 2946 1075345 0.27 1078291 125 2940 1069480 0.27 1072420 126 2935 1068831 0.27 1071766 127 3017 1061108 0.28 1064125 128 2842 1055219 0.27 1058061 129 2894 1055568 0.27 1058462 130 2879 1049218 0.27 1052097 131 2803 1046226 0.27 1049029 132 2907 1041554 0.28 1044461 133 2880 1035180 0.28 1038060 134 2806 1028491 0.27 1031297 135 2837 1024515 0.28 1027352 136 2857 1021526 0.28 1024383 137 2868 1016835 0.28 1019703 138 2818 1012859 0.28 1015677 139 2884 1007866 0.29 1010750 140 2883 1001642 0.29 1004525 141 2770 998973 0.28 1001743 142 2771 995915 0.28 998686 143 2803 986714 0.28 989517 144 2856 983120 0.29 985976 145 2771 975067 0.28 977838 146 2751 968805 0.28 971556 147 2933 965436 0.30 968369 148 2808 950110 0.29 952918 149 2585 876831 0.29 879416 150 1931 0 100.00 1931 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4834 5904465 0.08 5909299 2 6921 5197361 0.13 5204282 3 10762 6819455 0.16 6830217 4 11663 6952706 0.17 6964369 5 9872 6164504 0.16 6174376 6 9339 5762036 0.16 5771375 7 9831 5830302 0.17 5840133 8 9504 5735538 0.17 5745042 9 9865 5779120 0.17 5788985 10 9816 5776932 0.17 5786748 11 9995 5778039 0.17 5788034 12 10058 5799915 0.17 5809973 13 10563 5796335 0.18 5806898 14 10357 5788325 0.18 5798682 15 10561 5800938 0.18 5811499 16 10419 5806705 0.18 5817124 17 10651 5810109 0.18 5820760 18 10717 5799651 0.18 5810368 19 10975 5795415 0.19 5806390 20 10798 5775481 0.19 5786279 21 10917 5785913 0.19 5796830 22 10940 5773874 0.19 5784814 23 10967 5771972 0.19 5782939 24 11247 5773814 0.19 5785061 25 11118 5780127 0.19 5791245 26 11103 5773886 0.19 5784989 27 11044 5780009 0.19 5791053 28 11448 5776817 0.20 5788265 29 11182 5753845 0.19 5765027 30 11381 5754835 0.20 5766216 31 11354 5755567 0.20 5766921 32 11287 5735058 0.20 5746345 33 11283 5731518 0.20 5742801 34 11412 5720314 0.20 5731726 35 11530 5718380 0.20 5729910 36 11362 5724424 0.20 5735786 37 11539 5721562 0.20 5733101 38 11589 5714246 0.20 5725835 39 11444 5710782 0.20 5722226 40 11684 5701090 0.20 5712774 41 11565 5686324 0.20 5697889 42 11525 5672828 0.20 5684353 43 11563 5668323 0.20 5679886 44 11533 5656230 0.20 5667763 45 11543 5657595 0.20 5669138 46 11877 5650153 0.21 5662030 47 11694 5641866 0.21 5653560 48 11787 5644571 0.21 5656358 49 11655 5634421 0.21 5646076 50 11500 5620891 0.20 5632391 51 11731 5610637 0.21 5622368 52 11551 5602470 0.21 5614021 53 11609 5586717 0.21 5598326 54 11622 5579268 0.21 5590890 55 11624 5570036 0.21 5581660 56 11529 5565072 0.21 5576601 57 11518 5557262 0.21 5568780 58 11388 5554780 0.20 5566168 59 11578 5542384 0.21 5553962 60 11411 5534989 0.21 5546400 61 11299 5526369 0.20 5537668 62 11487 5509102 0.21 5520589 63 11469 5502568 0.21 5514037 64 11501 5491468 0.21 5502969 65 11483 5472336 0.21 5483819 66 11446 5469961 0.21 5481407 67 11555 5470407 0.21 5481962 68 11506 5447880 0.21 5459386 69 11390 5444321 0.21 5455711 70 11289 5428947 0.21 5440236 71 11535 5413150 0.21 5424685 72 11428 5415371 0.21 5426799 73 11332 5403639 0.21 5414971 74 11319 5384599 0.21 5395918 75 11288 5378177 0.21 5389465 76 11330 5366154 0.21 5377484 77 11375 5355446 0.21 5366821 78 11242 5343316 0.21 5354558 79 11318 5336875 0.21 5348193 80 11189 5322273 0.21 5333462 81 11295 5316672 0.21 5327967 82 11151 5300865 0.21 5312016 83 11189 5282540 0.21 5293729 84 10998 5273170 0.21 5284168 85 11057 5260085 0.21 5271142 86 11106 5246284 0.21 5257390 87 11176 5241523 0.21 5252699 88 10625 5228414 0.20 5239039 89 10889 5215456 0.21 5226345 90 10963 5213436 0.21 5224399 91 10859 5198193 0.21 5209052 92 10991 5181440 0.21 5192431 93 10800 5175542 0.21 5186342 94 10627 5159895 0.21 5170522 95 10926 5134222 0.21 5145148 96 10615 5128800 0.21 5139415 97 10868 5113563 0.21 5124431 98 10689 5093968 0.21 5104657 99 10690 5092985 0.21 5103675 100 10607 5075604 0.21 5086211 101 10686 5056437 0.21 5067123 102 10618 5049758 0.21 5060376 103 10594 5030978 0.21 5041572 104 10490 5018302 0.21 5028792 105 10445 5004902 0.21 5015347 106 10628 4981902 0.21 4992530 107 10479 4964675 0.21 4975154 108 10556 4951735 0.21 4962291 109 10643 4945845 0.21 4956488 110 10346 4927827 0.21 4938173 111 10298 4919100 0.21 4929398 112 10342 4897858 0.21 4908200 113 10335 4881185 0.21 4891520 114 10295 4870423 0.21 4880718 115 10084 4852964 0.21 4863048 116 10274 4834945 0.21 4845219 117 10263 4819402 0.21 4829665 118 10392 4797995 0.22 4808387 119 10066 4775000 0.21 4785066 120 10131 4762896 0.21 4773027 121 10068 4755289 0.21 4765357 122 10093 4733686 0.21 4743779 123 10115 4717162 0.21 4727277 124 10169 4701858 0.22 4712027 125 10188 4683342 0.22 4693530 126 10025 4663690 0.21 4673715 127 10202 4645290 0.22 4655492 128 10091 4617271 0.22 4627362 129 9923 4604868 0.22 4614791 130 10083 4590063 0.22 4600146 131 10041 4567593 0.22 4577634 132 9971 4550766 0.22 4560737 133 10142 4533912 0.22 4544054 134 10268 4512846 0.23 4523114 135 10192 4491127 0.23 4501319 136 10144 4474255 0.23 4484399 137 10088 4450511 0.23 4460599 138 10112 4433457 0.23 4443569 139 10075 4412302 0.23 4422377 140 9957 4384958 0.23 4394915 141 9969 4368750 0.23 4378719 142 10000 4347146 0.23 4357146 143 10269 4326030 0.24 4336299 144 10303 4304085 0.24 4314388 145 10077 4282247 0.23 4292324 146 10506 4250397 0.25 4260903 147 10634 4216896 0.25 4227530 148 10421 4169559 0.25 4179980 149 10172 3843463 0.26 3853635 150 7304 0 100.00 7304