CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 118237 719605 14.11 837842 2 131630 851222 13.39 982852 3 101029 772533 11.57 873562 4 113722 877120 11.48 990842 5 129995 952968 12.00 1082963 6 133413 994053 11.83 1127466 7 123802 870264 12.45 994066 8 122737 880445 12.23 1003182 9 122337 877433 12.24 999770 10 120708 872882 12.15 993590 11 121083 878556 12.11 999639 12 123703 879918 12.33 1003621 13 122663 873359 12.32 996022 14 123260 876800 12.33 1000060 15 123865 874852 12.40 998717 16 124808 883330 12.38 1008138 17 123909 884697 12.29 1008606 18 125302 892326 12.31 1017628 19 124904 896564 12.23 1021468 20 125935 895291 12.33 1021226 21 124778 891204 12.28 1015982 22 125855 892756 12.36 1018611 23 124938 884402 12.38 1009340 24 124545 883227 12.36 1007772 25 124043 879111 12.37 1003154 26 124958 891513 12.29 1016471 27 125108 893632 12.28 1018740 28 124784 895143 12.23 1019927 29 125993 900748 12.27 1026741 30 124731 896243 12.22 1020974 31 125189 893815 12.29 1019004 32 124594 895010 12.22 1019604 33 125355 892796 12.31 1018151 34 125367 889449 12.35 1014816 35 125091 889722 12.33 1014813 36 125385 891455 12.33 1016840 37 124703 893861 12.24 1018564 38 125456 897546 12.26 1023002 39 126111 899543 12.30 1025654 40 125815 899161 12.27 1024976 41 125572 898343 12.26 1023915 42 125396 900100 12.23 1025496 43 125295 895776 12.27 1021071 44 125032 892511 12.29 1017543 45 124705 891726 12.27 1016431 46 125208 891601 12.31 1016809 47 124723 899123 12.18 1023846 48 125544 896944 12.28 1022488 49 124642 898285 12.18 1022927 50 123752 897245 12.12 1020997 51 124774 897235 12.21 1022009 52 124227 895964 12.18 1020191 53 125033 897331 12.23 1022364 54 125278 893220 12.30 1018498 55 124506 891719 12.25 1016225 56 123702 893204 12.16 1016906 57 124447 892551 12.24 1016998 58 123916 894102 12.17 1018018 59 123266 891619 12.15 1014885 60 123642 895422 12.13 1019064 61 123887 894905 12.16 1018792 62 123498 896387 12.11 1019885 63 123557 898227 12.09 1021784 64 123725 892110 12.18 1015835 65 123406 890645 12.17 1014051 66 122260 891944 12.05 1014204 67 123100 894521 12.10 1017621 68 122532 890478 12.10 1013010 69 122305 890831 12.07 1013136 70 122395 892354 12.06 1014749 71 122620 894811 12.05 1017431 72 122511 894000 12.05 1016511 73 122747 892901 12.09 1015648 74 121928 889901 12.05 1011829 75 121952 888602 12.07 1010554 76 120835 886430 12.00 1007265 77 121467 888788 12.02 1010255 78 121100 892440 11.95 1013540 79 121517 891847 11.99 1013364 80 121374 889046 12.01 1010420 81 120531 891242 11.91 1011773 82 121165 890609 11.98 1011774 83 120771 888013 11.97 1008784 84 119865 889535 11.87 1009400 85 120952 886072 12.01 1007024 86 119996 885396 11.94 1005392 87 120245 885501 11.96 1005746 88 119671 885705 11.90 1005376 89 119600 887806 11.87 1007406 90 119141 886783 11.84 1005924 91 120050 887705 11.91 1007755 92 119103 889066 11.81 1008169 93 118397 888187 11.76 1006584 94 118648 884076 11.83 1002724 95 117674 883361 11.76 1001035 96 118165 880044 11.84 998209 97 118340 882480 11.82 1000820 98 117613 881731 11.77 999344 99 116934 883021 11.69 999955 100 117006 881186 11.72 998192 101 116801 884286 11.67 1001087 102 116877 881956 11.70 998833 103 116213 882979 11.63 999192 104 116672 881153 11.69 997825 105 116492 880067 11.69 996559 106 116274 879375 11.68 995649 107 116071 877534 11.68 993605 108 114837 876096 11.59 990933 109 115096 877394 11.60 992490 110 115985 876840 11.68 992825 111 114380 880665 11.49 995045 112 114407 878928 11.52 993335 113 114516 878485 11.53 993001 114 114014 877667 11.50 991681 115 114077 876533 11.52 990610 116 113027 873427 11.46 986454 117 112704 871332 11.45 984036 118 112449 873249 11.41 985698 119 113045 872536 11.47 985581 120 112552 872833 11.42 985385 121 111592 871969 11.35 983561 122 111463 873751 11.31 985214 123 111306 872902 11.31 984208 124 111021 871626 11.30 982647 125 111501 870898 11.35 982399 126 111326 867708 11.37 979034 127 110296 865505 11.30 975801 128 109928 865470 11.27 975398 129 109403 862302 11.26 971705 130 109519 861809 11.28 971328 131 108202 863332 11.14 971534 132 108471 863039 11.17 971510 133 108185 862822 11.14 971007 134 108366 863030 11.16 971396 135 108668 860365 11.21 969033 136 107349 860039 11.10 967388 137 107307 857273 11.12 964580 138 105946 856566 11.01 962512 139 106860 856496 11.09 963356 140 105623 854099 11.01 959722 141 105411 852907 11.00 958318 142 105452 853974 10.99 959426 143 104608 851191 10.94 955799 144 103862 850438 10.88 954300 145 104051 849903 10.91 953954 146 104364 851728 10.92 956092 147 103344 847965 10.86 951309 148 102390 845309 10.80 947699 149 100051 842151 10.62 942202 150 86965 780332 10.03 867297 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3542 2434858 0.15 2438400 2 3570 1131300 0.31 1134870 3 2727 1130649 0.24 1133376 4 3186 1360411 0.23 1363597 5 4148 1586390 0.26 1590538 6 4018 1496770 0.27 1500788 7 3696 1372756 0.27 1376452 8 3758 1400765 0.27 1404523 9 3882 1377296 0.28 1381178 10 3690 1374505 0.27 1378195 11 3893 1384693 0.28 1388586 12 3812 1375776 0.28 1379588 13 4013 1377823 0.29 1381836 14 3859 1376197 0.28 1380056 15 4054 1370867 0.29 1374921 16 4090 1387642 0.29 1391732 17 4290 1391377 0.31 1395667 18 4168 1386688 0.30 1390856 19 4136 1398362 0.29 1402498 20 4029 1388602 0.29 1392631 21 4384 1392648 0.31 1397032 22 4102 1388025 0.29 1392127 23 4272 1387184 0.31 1391456 24 4255 1386547 0.31 1390802 25 4298 1390789 0.31 1395087 26 4183 1395229 0.30 1399412 27 4247 1395873 0.30 1400120 28 4313 1406557 0.31 1410870 29 4324 1402418 0.31 1406742 30 4363 1395562 0.31 1399925 31 4295 1400616 0.31 1404911 32 4326 1400242 0.31 1404568 33 4297 1403226 0.31 1407523 34 4334 1400782 0.31 1405116 35 4421 1400262 0.31 1404683 36 4340 1400083 0.31 1404423 37 4492 1407151 0.32 1411643 38 4452 1401360 0.32 1405812 39 4373 1403174 0.31 1407547 40 4454 1404563 0.32 1409017 41 4431 1405922 0.31 1410353 42 4543 1401756 0.32 1406299 43 4447 1408214 0.31 1412661 44 4317 1403226 0.31 1407543 45 4345 1396398 0.31 1400743 46 4285 1409957 0.30 1414242 47 4357 1406847 0.31 1411204 48 4396 1402237 0.31 1406633 49 4191 1406399 0.30 1410590 50 4344 1403356 0.31 1407700 51 4372 1402600 0.31 1406972 52 4378 1405299 0.31 1409677 53 4345 1408803 0.31 1413148 54 4364 1400982 0.31 1405346 55 4157 1406995 0.29 1411152 56 4341 1403941 0.31 1408282 57 4344 1403282 0.31 1407626 58 4332 1400276 0.31 1404608 59 4357 1407246 0.31 1411603 60 4249 1399362 0.30 1403611 61 4244 1402318 0.30 1406562 62 4141 1402916 0.29 1407057 63 4209 1399999 0.30 1404208 64 4340 1403621 0.31 1407961 65 4233 1405170 0.30 1409403 66 4311 1402956 0.31 1407267 67 4200 1410398 0.30 1414598 68 4401 1402915 0.31 1407316 69 4403 1400013 0.31 1404416 70 4265 1403912 0.30 1408177 71 4397 1405464 0.31 1409861 72 4310 1404791 0.31 1409101 73 4475 1401986 0.32 1406461 74 4420 1407402 0.31 1411822 75 4290 1404269 0.30 1408559 76 4454 1404445 0.32 1408899 77 4414 1405370 0.31 1409784 78 4342 1405133 0.31 1409475 79 4228 1404612 0.30 1408840 80 4312 1404622 0.31 1408934 81 4214 1395561 0.30 1399775 82 4312 1398267 0.31 1402579 83 4504 1404911 0.32 1409415 84 4262 1397488 0.30 1401750 85 4476 1404231 0.32 1408707 86 4211 1398985 0.30 1403196 87 4270 1395560 0.31 1399830 88 4232 1394399 0.30 1398631 89 4250 1397279 0.30 1401529 90 4316 1391507 0.31 1395823 91 4428 1398043 0.32 1402471 92 4229 1396896 0.30 1401125 93 4278 1390873 0.31 1395151 94 4347 1392278 0.31 1396625 95 4245 1393653 0.30 1397898 96 4283 1387551 0.31 1391834 97 4241 1390731 0.30 1394972 98 4295 1392211 0.31 1396506 99 4292 1384634 0.31 1388926 100 4260 1390962 0.31 1395222 101 4328 1387401 0.31 1391729 102 4186 1382582 0.30 1386768 103 4423 1386404 0.32 1390827 104 4133 1384067 0.30 1388200 105 4344 1383777 0.31 1388121 106 4189 1385956 0.30 1390145 107 4267 1384083 0.31 1388350 108 4266 1377148 0.31 1381414 109 4219 1378760 0.31 1382979 110 4167 1381944 0.30 1386111 111 4148 1376153 0.30 1380301 112 4088 1377505 0.30 1381593 113 4307 1379101 0.31 1383408 114 4264 1374725 0.31 1378989 115 4165 1375129 0.30 1379294 116 4196 1369560 0.31 1373756 117 4048 1370650 0.29 1374698 118 4259 1373094 0.31 1377353 119 4239 1372065 0.31 1376304 120 4123 1366299 0.30 1370422 121 4171 1367107 0.30 1371278 122 4026 1366334 0.29 1370360 123 4042 1364205 0.30 1368247 124 4148 1364236 0.30 1368384 125 4122 1361078 0.30 1365200 126 4073 1357020 0.30 1361093 127 4055 1358479 0.30 1362534 128 4237 1351241 0.31 1355478 129 4118 1350192 0.30 1354310 130 4106 1350963 0.30 1355069 131 4046 1349879 0.30 1353925 132 4058 1346249 0.30 1350307 133 4017 1348262 0.30 1352279 134 4100 1345988 0.30 1350088 135 4116 1345221 0.31 1349337 136 4074 1340086 0.30 1344160 137 4073 1339296 0.30 1343369 138 4028 1334562 0.30 1338590 139 4096 1338930 0.30 1343026 140 4077 1333718 0.30 1337795 141 4086 1329035 0.31 1333121 142 4215 1329413 0.32 1333628 143 4142 1327562 0.31 1331704 144 4175 1321267 0.31 1325442 145 4459 1330041 0.33 1334500 146 4845 1323231 0.36 1328076 147 5005 1317735 0.38 1322740 148 4878 1314670 0.37 1319548 149 4469 1308654 0.34 1313123 150 3908 1189704 0.33 1193612 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9614 5918441 0.16 5928055 2 11353 4610780 0.25 4622133 3 11755 5179051 0.23 5190806 4 12965 6456133 0.20 6469098 5 14305 6992124 0.20 7006429 6 14193 6841270 0.21 6855463 7 13365 6289804 0.21 6303169 8 13534 6268219 0.22 6281753 9 13248 6089641 0.22 6102889 10 13193 6050111 0.22 6063304 11 13209 6048638 0.22 6061847 12 13502 6027514 0.22 6041016 13 13700 6007718 0.23 6021418 14 14024 6016197 0.23 6030221 15 14242 6009664 0.24 6023906 16 14325 6059664 0.24 6073989 17 14650 6058054 0.24 6072704 18 14751 6077271 0.24 6092022 19 15050 6089331 0.25 6104381 20 14928 6076462 0.25 6091390 21 15119 6067682 0.25 6082801 22 15190 6060449 0.25 6075639 23 14826 6054477 0.24 6069303 24 15041 6060615 0.25 6075656 25 15352 6052051 0.25 6067403 26 15098 6059090 0.25 6074188 27 15525 6078108 0.25 6093633 28 15350 6097611 0.25 6112961 29 15651 6110213 0.26 6125864 30 15466 6111622 0.25 6127088 31 15641 6119705 0.25 6135346 32 15901 6096579 0.26 6112480 33 15458 6085962 0.25 6101420 34 15763 6083030 0.26 6098793 35 15444 6076226 0.25 6091670 36 15477 6075515 0.25 6090992 37 15640 6082252 0.26 6097892 38 15451 6089737 0.25 6105188 39 15682 6104784 0.26 6120466 40 15840 6113128 0.26 6128968 41 15487 6106949 0.25 6122436 42 15482 6107969 0.25 6123451 43 15733 6098482 0.26 6114215 44 15265 6092436 0.25 6107701 45 15292 6081083 0.25 6096375 46 14985 6081469 0.25 6096454 47 15554 6088770 0.25 6104324 48 15428 6094382 0.25 6109810 49 15620 6110338 0.25 6125958 50 15763 6119016 0.26 6134779 51 15550 6118607 0.25 6134157 52 15705 6130511 0.26 6146216 53 15617 6122142 0.25 6137759 54 15556 6112134 0.25 6127690 55 15356 6102106 0.25 6117462 56 15588 6103486 0.25 6119074 57 15384 6089536 0.25 6104920 58 15814 6097963 0.26 6113777 59 15508 6085077 0.25 6100585 60 15349 6098422 0.25 6113771 61 15708 6113809 0.26 6129517 62 15635 6121417 0.25 6137052 63 15400 6122093 0.25 6137493 64 15555 6128703 0.25 6144258 65 15422 6118443 0.25 6133865 66 15523 6119438 0.25 6134961 67 15440 6121553 0.25 6136993 68 15545 6120625 0.25 6136170 69 15432 6112977 0.25 6128409 70 15485 6124958 0.25 6140443 71 15444 6129883 0.25 6145327 72 15572 6125548 0.25 6141120 73 15519 6128796 0.25 6144315 74 15582 6123038 0.25 6138620 75 15615 6113949 0.25 6129564 76 15151 6121488 0.25 6136639 77 15490 6111787 0.25 6127277 78 15690 6114389 0.26 6130079 79 15422 6113171 0.25 6128593 80 15750 6110251 0.26 6126001 81 15479 6118526 0.25 6134005 82 15314 6129116 0.25 6144430 83 15485 6131562 0.25 6147047 84 15473 6126267 0.25 6141740 85 15028 6122987 0.24 6138015 86 15257 6107226 0.25 6122483 87 15146 6085528 0.25 6100674 88 15237 6099278 0.25 6114515 89 15219 6106596 0.25 6121815 90 14984 6115085 0.24 6130069 91 15135 6120153 0.25 6135288 92 15138 6114639 0.25 6129777 93 15184 6117491 0.25 6132675 94 15239 6125328 0.25 6140567 95 15272 6108694 0.25 6123966 96 14991 6097255 0.25 6112246 97 15231 6094364 0.25 6109595 98 15303 6095346 0.25 6110649 99 15235 6095788 0.25 6111023 100 15305 6101768 0.25 6117073 101 15107 6106522 0.25 6121629 102 15260 6097837 0.25 6113097 103 15232 6096759 0.25 6111991 104 15008 6097135 0.25 6112143 105 15238 6088098 0.25 6103336 106 14950 6082300 0.25 6097250 107 14858 6067188 0.24 6082046 108 14799 6045394 0.24 6060193 109 14934 6058483 0.25 6073417 110 14902 6056058 0.25 6070960 111 14872 6062768 0.24 6077640 112 14933 6061869 0.25 6076802 113 15021 6072741 0.25 6087762 114 15068 6053438 0.25 6068506 115 14861 6056144 0.24 6071005 116 14899 6046243 0.25 6061142 117 15018 6043125 0.25 6058143 118 14949 6027723 0.25 6042672 119 14664 6017494 0.24 6032158 120 14888 6009323 0.25 6024211 121 14849 6014886 0.25 6029735 122 14672 6019210 0.24 6033882 123 14632 6019118 0.24 6033750 124 14889 6013245 0.25 6028134 125 14826 6005935 0.25 6020761 126 14671 5985513 0.24 6000184 127 14972 5982693 0.25 5997665 128 14596 5970484 0.24 5985080 129 14672 5956822 0.25 5971494 130 14616 5955831 0.24 5970447 131 14649 5949593 0.25 5964242 132 14749 5944643 0.25 5959392 133 14891 5947648 0.25 5962539 134 14986 5942165 0.25 5957151 135 15013 5937475 0.25 5952488 136 14920 5920124 0.25 5935044 137 14852 5912304 0.25 5927156 138 14877 5908820 0.25 5923697 139 14913 5896291 0.25 5911204 140 14806 5885686 0.25 5900492 141 14862 5870098 0.25 5884960 142 15072 5861842 0.26 5876914 143 15191 5860301 0.26 5875492 144 15478 5849005 0.26 5864483 145 16089 5856455 0.27 5872544 146 16786 5857616 0.29 5874402 147 17125 5843099 0.29 5860224 148 16827 5824360 0.29 5841187 149 16452 5760399 0.28 5776851 150 14559 5402868 0.27 5417427 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2765 1058969 0.26 1061734 2 31556 1023897 2.99 1055453 3 62037 820596 7.03 882633 4 59111 751996 7.29 811107 5 65789 858804 7.12 924593 6 73159 942330 7.20 1015489 7 78203 977665 7.41 1055868 8 73222 855604 7.88 928826 9 74866 861246 8.00 936112 10 76646 856920 8.21 933566 11 77414 850385 8.34 927799 12 78070 850805 8.40 928875 13 79864 846835 8.62 926699 14 79800 845333 8.63 925133 15 80737 847612 8.70 928349 16 81668 843877 8.82 925545 17 82211 849092 8.83 931303 18 83273 848913 8.93 932186 19 83636 853634 8.92 937270 20 83525 851969 8.93 935494 21 84013 850852 8.99 934865 22 85034 844089 9.15 929123 23 85749 845317 9.21 931066 24 85604 834604 9.30 920208 25 85743 831530 9.35 917273 26 86405 833672 9.39 920077 27 85974 833199 9.35 919173 28 86605 835273 9.39 921878 29 87054 835103 9.44 922157 30 86821 837239 9.40 924060 31 87572 828215 9.56 915787 32 87118 825626 9.54 912744 33 87784 824282 9.62 912066 34 88048 819565 9.70 907613 35 87580 817695 9.67 905275 36 87249 812990 9.69 900239 37 88520 813271 9.82 901791 38 88196 815208 9.76 903404 39 89031 812718 9.87 901749 40 89024 810265 9.90 899289 41 88829 812089 9.86 900918 42 88651 808767 9.88 897418 43 89377 807163 9.97 896540 44 88846 802842 9.96 891688 45 88961 797235 10.04 886196 46 88963 792775 10.09 881738 47 88871 793216 10.08 882087 48 89604 792918 10.15 882522 49 89793 792591 10.18 882384 50 89555 791094 10.17 880649 51 88933 787493 10.15 876426 52 89403 783412 10.24 872815 53 89469 783744 10.25 873213 54 89161 778422 10.28 867583 55 89784 775343 10.38 865127 56 89400 772412 10.37 861812 57 89292 769560 10.40 858852 58 89363 768411 10.42 857774 59 88866 770597 10.34 859463 60 88977 763625 10.44 852602 61 88896 764172 10.42 853068 62 88945 763095 10.44 852040 63 89152 758798 10.51 847950 64 89042 757122 10.52 846164 65 88348 756077 10.46 844425 66 88783 749990 10.58 838773 67 88316 748986 10.55 837302 68 88524 749191 10.57 837715 69 88028 744371 10.58 832399 70 88409 742351 10.64 830760 71 88294 739604 10.66 827898 72 88020 739017 10.64 827037 73 87631 737154 10.62 824785 74 88252 736149 10.70 824401 75 87799 730075 10.74 817874 76 87124 725538 10.72 812662 77 87111 724513 10.73 811624 78 86783 721807 10.73 808590 79 87368 722368 10.79 809736 80 86705 720279 10.74 806984 81 86489 715740 10.78 802229 82 86406 715237 10.78 801643 83 86452 714242 10.80 800694 84 85826 708663 10.80 794489 85 86358 707204 10.88 793562 86 85994 705432 10.87 791426 87 85966 700203 10.93 786169 88 84873 698200 10.84 783073 89 85301 694713 10.94 780014 90 85299 695192 10.93 780491 91 84966 692856 10.92 777822 92 85142 693329 10.94 778471 93 84716 689517 10.94 774233 94 84512 687478 10.95 771990 95 84572 683752 11.01 768324 96 83967 679433 11.00 763400 97 83411 675574 10.99 758985 98 84014 675895 11.06 759909 99 83086 673492 10.98 756578 100 83056 671460 11.01 754516 101 82643 668950 11.00 751593 102 82720 666093 11.05 748813 103 82251 664233 11.02 746484 104 82080 661160 11.04 743240 105 82316 659199 11.10 741515 106 81586 655804 11.06 737390 107 81502 655131 11.06 736633 108 81106 648678 11.11 729784 109 80773 645875 11.12 726648 110 80396 643181 11.11 723577 111 80008 642889 11.07 722897 112 80190 642169 11.10 722359 113 80213 638753 11.16 718966 114 79978 636730 11.16 716708 115 79865 633078 11.20 712943 116 79664 630779 11.21 710443 117 78665 626214 11.16 704879 118 78793 623860 11.21 702653 119 77971 623290 11.12 701261 120 78138 621392 11.17 699530 121 78046 616656 11.23 694702 122 77528 616290 11.17 693818 123 77317 613763 11.19 691080 124 76875 611035 11.18 687910 125 76804 608064 11.21 684868 126 76649 606068 11.23 682717 127 76256 598824 11.30 675080 128 76078 596167 11.32 672245 129 75336 593993 11.26 669329 130 75055 590415 11.28 665470 131 74726 588313 11.27 663039 132 74144 587325 11.21 661469 133 74048 585492 11.23 659540 134 74044 581550 11.29 655594 135 73289 580626 11.21 653915 136 73202 574826 11.30 648028 137 72462 574304 11.20 646766 138 72422 569034 11.29 641456 139 71718 565645 11.25 637363 140 71384 564221 11.23 635605 141 71543 560713 11.32 632256 142 71196 556877 11.34 628073 143 69749 555960 11.15 625709 144 69951 550563 11.27 620514 145 69798 548733 11.28 618531 146 68791 545357 11.20 614148 147 68602 541113 11.25 609715 148 67623 532678 11.26 600301 149 67042 479960 12.26 547002 150 59138 0 100.00 59138 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2105 1513303 0.14 1515408 2 2459 1118637 0.22 1121096 3 8607 2647388 0.32 2655995 4 7324 1105017 0.66 1112341 5 2970 1069429 0.28 1072399 6 3342 1258797 0.26 1262139 7 3859 1456395 0.26 1460254 8 3761 1390174 0.27 1393935 9 3526 1267471 0.28 1270997 10 3380 1290084 0.26 1293464 11 3350 1273938 0.26 1277288 12 3091 1268989 0.24 1272080 13 3235 1268421 0.25 1271656 14 3301 1263556 0.26 1266857 15 3292 1270214 0.26 1273506 16 3252 1265336 0.26 1268588 17 3222 1261863 0.25 1265085 18 3396 1274202 0.27 1277598 19 3349 1271972 0.26 1275321 20 3355 1267470 0.26 1270825 21 3334 1275083 0.26 1278417 22 3358 1265731 0.26 1269089 23 3382 1264001 0.27 1267383 24 3378 1264376 0.27 1267754 25 3293 1256552 0.26 1259845 26 3388 1256208 0.27 1259596 27 3395 1259933 0.27 1263328 28 3279 1259187 0.26 1262466 29 3419 1253955 0.27 1257374 30 3434 1262132 0.27 1265566 31 3488 1255767 0.28 1259255 32 3349 1244525 0.27 1247874 33 3376 1247734 0.27 1251110 34 3358 1246526 0.27 1249884 35 3395 1242611 0.27 1246006 36 3358 1241134 0.27 1244492 37 3214 1236088 0.26 1239302 38 3383 1234424 0.27 1237807 39 3275 1236831 0.26 1240106 40 3426 1229933 0.28 1233359 41 3370 1227627 0.27 1230997 42 3345 1225530 0.27 1228875 43 3277 1224125 0.27 1227402 44 3360 1217628 0.28 1220988 45 3401 1223143 0.28 1226544 46 3367 1216344 0.28 1219711 47 3324 1207187 0.27 1210511 48 3389 1212869 0.28 1216258 49 3352 1208579 0.28 1211931 50 3263 1204492 0.27 1207755 51 3288 1201962 0.27 1205250 52 3253 1196976 0.27 1200229 53 3418 1194585 0.29 1198003 54 3255 1190665 0.27 1193920 55 3206 1195653 0.27 1198859 56 3247 1184733 0.27 1187980 57 3227 1186574 0.27 1189801 58 3198 1181822 0.27 1185020 59 3245 1177370 0.27 1180615 60 3280 1173580 0.28 1176860 61 3261 1173067 0.28 1176328 62 3260 1165890 0.28 1169150 63 3291 1165741 0.28 1169032 64 3204 1161306 0.28 1164510 65 3284 1155250 0.28 1158534 66 3208 1159606 0.28 1162814 67 3161 1157216 0.27 1160377 68 3157 1146821 0.27 1149978 69 3324 1151361 0.29 1154685 70 3334 1144700 0.29 1148034 71 3188 1141677 0.28 1144865 72 3228 1138366 0.28 1141594 73 3170 1136733 0.28 1139903 74 3131 1130137 0.28 1133268 75 3269 1129574 0.29 1132843 76 3250 1126968 0.29 1130218 77 3211 1124819 0.28 1128030 78 3127 1122092 0.28 1125219 79 3175 1116252 0.28 1119427 80 3167 1114844 0.28 1118011 81 3141 1109765 0.28 1112906 82 3026 1106508 0.27 1109534 83 3070 1098717 0.28 1101787 84 3089 1098109 0.28 1101198 85 3126 1096100 0.28 1099226 86 2990 1089193 0.27 1092183 87 3056 1091764 0.28 1094820 88 3062 1084925 0.28 1087987 89 3065 1079743 0.28 1082808 90 3061 1075346 0.28 1078407 91 3057 1073946 0.28 1077003 92 2989 1068795 0.28 1071784 93 2978 1070023 0.28 1073001 94 2985 1064842 0.28 1067827 95 3002 1056981 0.28 1059983 96 2960 1055723 0.28 1058683 97 3035 1053336 0.29 1056371 98 3030 1045955 0.29 1048985 99 2881 1049352 0.27 1052233 100 2970 1042617 0.28 1045587 101 2938 1036434 0.28 1039372 102 2855 1037616 0.27 1040471 103 2924 1030871 0.28 1033795 104 2879 1023383 0.28 1026262 105 2992 1024667 0.29 1027659 106 2901 1015989 0.28 1018890 107 2855 1012481 0.28 1015336 108 2837 1012763 0.28 1015600 109 2913 1007912 0.29 1010825 110 2861 1000386 0.29 1003247 111 2891 999536 0.29 1002427 112 2850 996912 0.29 999762 113 2984 990690 0.30 993674 114 2908 987831 0.29 990739 115 2902 985683 0.29 988585 116 2872 979544 0.29 982416 117 2756 974841 0.28 977597 118 2776 965963 0.29 968739 119 2815 966144 0.29 968959 120 2688 966309 0.28 968997 121 2737 959084 0.28 961821 122 2714 954550 0.28 957264 123 2712 951908 0.28 954620 124 2718 947799 0.29 950517 125 2715 941024 0.29 943739 126 2654 942276 0.28 944930 127 2651 932709 0.28 935360 128 2837 924136 0.31 926973 129 2779 925540 0.30 928319 130 2765 918709 0.30 921474 131 2722 915172 0.30 917894 132 2671 909301 0.29 911972 133 2737 903062 0.30 905799 134 2712 899251 0.30 901963 135 2784 896480 0.31 899264 136 2573 892766 0.29 895339 137 2741 886356 0.31 889097 138 2708 884701 0.31 887409 139 2777 879047 0.31 881824 140 2670 870287 0.31 872957 141 2669 870307 0.31 872976 142 2637 866003 0.30 868640 143 2632 857587 0.31 860219 144 2661 855226 0.31 857887 145 2645 847851 0.31 850496 146 2632 841201 0.31 843833 147 2691 834673 0.32 837364 148 2671 823668 0.32 826339 149 2375 754286 0.31 756661 150 1751 0 100.00 1751 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9068 6657000 0.14 6666068 2 11485 5534566 0.21 5546051 3 15003 6842909 0.22 6857912 4 15080 6614610 0.23 6629690 5 12277 5732687 0.21 5744964 6 11470 5318447 0.22 5329917 7 12250 5629749 0.22 5641999 8 12328 5565599 0.22 5577927 9 12261 5549665 0.22 5561926 10 12351 5574252 0.22 5586603 11 12241 5577572 0.22 5589813 12 12531 5588726 0.22 5601257 13 12400 5568574 0.22 5580974 14 12299 5556522 0.22 5568821 15 12327 5555739 0.22 5568066 16 12516 5563385 0.22 5575901 17 12269 5578905 0.22 5591174 18 12560 5562884 0.23 5575444 19 12726 5567509 0.23 5580235 20 12495 5551163 0.22 5563658 21 12467 5543372 0.22 5555839 22 12639 5508833 0.23 5521472 23 12665 5499844 0.23 5512509 24 12623 5477862 0.23 5490485 25 12795 5472955 0.23 5485750 26 12937 5462766 0.24 5475703 27 12739 5482577 0.23 5495316 28 13110 5483020 0.24 5496130 29 12840 5467297 0.23 5480137 30 12589 5455679 0.23 5468268 31 12765 5450912 0.23 5463677 32 12799 5419897 0.24 5432696 33 12686 5398557 0.23 5411243 34 12768 5377796 0.24 5390564 35 13052 5373069 0.24 5386121 36 12684 5372061 0.24 5384745 37 12845 5369707 0.24 5382552 38 12694 5375925 0.24 5388619 39 12741 5362878 0.24 5375619 40 13021 5359968 0.24 5372989 41 12680 5339435 0.24 5352115 42 12384 5326771 0.23 5339155 43 12858 5309874 0.24 5322732 44 12566 5287352 0.24 5299918 45 12619 5276648 0.24 5289267 46 12753 5269203 0.24 5281956 47 12809 5265585 0.24 5278394 48 12512 5265976 0.24 5278488 49 12665 5260861 0.24 5273526 50 12708 5247399 0.24 5260107 51 12535 5230909 0.24 5243444 52 12652 5215157 0.24 5227809 53 12652 5198684 0.24 5211336 54 12685 5178711 0.24 5191396 55 12493 5166813 0.24 5179306 56 12386 5157320 0.24 5169706 57 12306 5141393 0.24 5153699 58 12402 5143292 0.24 5155694 59 12469 5131934 0.24 5144403 60 12372 5115109 0.24 5127481 61 12363 5119017 0.24 5131380 62 12461 5098599 0.24 5111060 63 12240 5084256 0.24 5096496 64 12228 5070182 0.24 5082410 65 12159 5040313 0.24 5052472 66 11964 5030396 0.24 5042360 67 12235 5029651 0.24 5041886 68 12135 5013632 0.24 5025767 69 12227 4997668 0.24 5009895 70 12025 4990062 0.24 5002087 71 12158 4977858 0.24 4990016 72 12342 4971178 0.25 4983520 73 12160 4956456 0.24 4968616 74 11782 4929703 0.24 4941485 75 11804 4914322 0.24 4926126 76 11950 4905070 0.24 4917020 77 11893 4895825 0.24 4907718 78 11920 4888533 0.24 4900453 79 11864 4884978 0.24 4896842 80 11683 4865861 0.24 4877544 81 11871 4856522 0.24 4868393 82 11825 4838027 0.24 4849852 83 11641 4816761 0.24 4828402 84 11284 4800012 0.23 4811296 85 11638 4782389 0.24 4794027 86 11334 4773733 0.24 4785067 87 11491 4764368 0.24 4775859 88 11182 4749440 0.23 4760622 89 11195 4742249 0.24 4753444 90 11237 4730817 0.24 4742054 91 11161 4715974 0.24 4727135 92 11126 4698468 0.24 4709594 93 11048 4686681 0.24 4697729 94 11138 4668740 0.24 4679878 95 10972 4634222 0.24 4645194 96 11022 4618209 0.24 4629231 97 10801 4609601 0.23 4620402 98 10911 4591235 0.24 4602146 99 10945 4585214 0.24 4596159 100 10784 4576413 0.24 4587197 101 10980 4556132 0.24 4567112 102 10705 4546927 0.23 4557632 103 10713 4534142 0.24 4544855 104 10709 4511777 0.24 4522486 105 10661 4497818 0.24 4508479 106 10436 4468720 0.23 4479156 107 10538 4448632 0.24 4459170 108 10762 4435251 0.24 4446013 109 10625 4426631 0.24 4437256 110 10673 4414541 0.24 4425214 111 10576 4401678 0.24 4412254 112 10460 4386858 0.24 4397318 113 10260 4371069 0.23 4381329 114 10371 4354793 0.24 4365164 115 10398 4325163 0.24 4335561 116 10422 4310009 0.24 4320431 117 10278 4289604 0.24 4299882 118 10208 4264378 0.24 4274586 119 10103 4251069 0.24 4261172 120 10127 4243456 0.24 4253583 121 10118 4231474 0.24 4241592 122 9996 4212157 0.24 4222153 123 10149 4195968 0.24 4206117 124 10060 4177249 0.24 4187309 125 9938 4154765 0.24 4164703 126 9951 4129410 0.24 4139361 127 9979 4109468 0.24 4119447 128 10042 4087297 0.25 4097339 129 10052 4071848 0.25 4081900 130 9809 4051884 0.24 4061693 131 9900 4039110 0.24 4049010 132 9963 4027422 0.25 4037385 133 9936 4004750 0.25 4014686 134 10050 3985342 0.25 3995392 135 9999 3962559 0.25 3972558 136 9963 3944979 0.25 3954942 137 10183 3918785 0.26 3928968 138 10050 3900785 0.26 3910835 139 9993 3876011 0.26 3886004 140 10016 3853481 0.26 3863497 141 9893 3841372 0.26 3851265 142 9833 3817275 0.26 3827108 143 9829 3798304 0.26 3808133 144 9980 3776095 0.26 3786075 145 9817 3757194 0.26 3767011 146 10035 3725153 0.27 3735188 147 10147 3693192 0.27 3703339 148 10189 3645533 0.28 3655722 149 9688 3344054 0.29 3353742 150 6683 0 100.00 6683