CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 114753 669134 14.64 783887 2 117691 738073 13.75 855764 3 92021 808096 10.22 900117 4 130265 994072 11.59 1124337 5 130683 941235 12.19 1071918 6 128429 1013134 11.25 1141563 7 121519 878248 12.15 999767 8 121846 893075 12.01 1014921 9 121042 896074 11.90 1017116 10 120387 897178 11.83 1017565 11 119263 889268 11.83 1008531 12 121727 892468 12.00 1014195 13 120388 889575 11.92 1009963 14 121533 889759 12.02 1011292 15 121136 888324 12.00 1009460 16 122479 894471 12.04 1016950 17 121815 897759 11.95 1019574 18 122905 902940 11.98 1025845 19 123062 904274 11.98 1027336 20 122919 902787 11.98 1025706 21 123322 902355 12.02 1025677 22 124701 903444 12.13 1028145 23 123328 899528 12.06 1022856 24 122843 895924 12.06 1018767 25 122687 894909 12.06 1017596 26 122921 901867 11.99 1024788 27 123352 903221 12.02 1026573 28 123534 909525 11.96 1033059 29 123027 909357 11.92 1032384 30 123089 908084 11.94 1031173 31 123461 905409 12.00 1028870 32 123153 907207 11.95 1030360 33 122586 905897 11.92 1028483 34 123700 905401 12.02 1029101 35 122391 902126 11.95 1024517 36 122856 903396 11.97 1026252 37 123700 904941 12.03 1028641 38 123297 907726 11.96 1031023 39 122785 908019 11.91 1030804 40 124889 912268 12.04 1037157 41 123663 911884 11.94 1035547 42 123451 911100 11.93 1034551 43 123270 908057 11.95 1031327 44 123245 905993 11.97 1029238 45 123366 902843 12.02 1026209 46 122625 905826 11.92 1028451 47 123018 909797 11.91 1032815 48 122351 910317 11.85 1032668 49 123336 911708 11.92 1035044 50 121963 909950 11.82 1031913 51 122257 908717 11.86 1030974 52 123408 913909 11.90 1037317 53 122667 909096 11.89 1031763 54 123007 908688 11.92 1031695 55 122105 908389 11.85 1030494 56 122139 907158 11.87 1029297 57 121122 907004 11.78 1028126 58 122764 910291 11.88 1033055 59 121824 905877 11.85 1027701 60 122365 909122 11.86 1031487 61 122607 913047 11.84 1035654 62 121704 912812 11.76 1034516 63 121252 911847 11.74 1033099 64 121421 909700 11.78 1031121 65 121389 905538 11.82 1026927 66 121116 908682 11.76 1029798 67 121825 910118 11.81 1031943 68 121313 908589 11.78 1029902 69 120570 910501 11.69 1031071 70 120919 909605 11.73 1030524 71 120824 910733 11.71 1031557 72 121090 913747 11.70 1034837 73 121274 911883 11.74 1033157 74 120820 909287 11.73 1030107 75 120453 908450 11.71 1028903 76 120824 908646 11.74 1029470 77 120273 908001 11.70 1028274 78 120593 911816 11.68 1032409 79 120717 912301 11.69 1033018 80 119840 910047 11.64 1029887 81 120212 912267 11.64 1032479 82 120200 912944 11.63 1033144 83 119777 910013 11.63 1029790 84 119729 911574 11.61 1031303 85 120198 909846 11.67 1030044 86 119873 909571 11.64 1029444 87 119456 908286 11.62 1027742 88 119629 909900 11.62 1029529 89 119316 912212 11.57 1031528 90 118869 910848 11.54 1029717 91 118982 914039 11.52 1033021 92 118721 913303 11.50 1032024 93 118462 909813 11.52 1028275 94 119180 911950 11.56 1031130 95 117701 909808 11.45 1027509 96 117384 907773 11.45 1025157 97 118210 908970 11.51 1027180 98 117123 907840 11.43 1024963 99 117003 910171 11.39 1027174 100 116768 910011 11.37 1026779 101 116861 909437 11.39 1026298 102 116543 909783 11.36 1026326 103 116256 910663 11.32 1026919 104 117033 909789 11.40 1026822 105 116146 906150 11.36 1022296 106 115568 907886 11.29 1023454 107 115710 904491 11.34 1020201 108 115677 902411 11.36 1018088 109 115083 907097 11.26 1022180 110 115364 906460 11.29 1021824 111 115079 905238 11.28 1020317 112 114220 905709 11.20 1019929 113 114404 904243 11.23 1018647 114 114695 903725 11.26 1018420 115 113988 904450 11.19 1018438 116 113735 901707 11.20 1015442 117 113216 902377 11.15 1015593 118 113306 902547 11.15 1015853 119 113186 901558 11.15 1014744 120 112872 901530 11.13 1014402 121 112308 900986 11.08 1013294 122 112928 900381 11.14 1013309 123 110965 900252 10.97 1011217 124 112618 902098 11.10 1014716 125 111945 900435 11.06 1012380 126 111618 896205 11.08 1007823 127 111490 895146 11.08 1006636 128 111004 894111 11.04 1005115 129 110296 892280 11.00 1002576 130 110449 893080 11.01 1003529 131 109910 893998 10.95 1003908 132 109672 891567 10.95 1001239 133 109405 892359 10.92 1001764 134 109371 892669 10.91 1002040 135 109476 889512 10.96 998988 136 108640 887808 10.90 996448 137 108381 888536 10.87 996917 138 108101 886719 10.87 994820 139 108569 886071 10.92 994640 140 107651 883534 10.86 991185 141 107381 882066 10.85 989447 142 106406 883334 10.75 989740 143 106901 881162 10.82 988063 144 106392 878573 10.80 984965 145 105784 879210 10.74 984994 146 105173 879823 10.68 984996 147 105115 879544 10.68 984659 148 103358 876815 10.54 980173 149 101058 870997 10.40 972055 150 88130 808134 9.83 896264 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2710 1859160 0.15 1861870 2 2753 1055281 0.26 1058034 3 2300 1248014 0.18 1250314 4 3028 1477566 0.20 1480594 5 3268 1583079 0.21 1586347 6 3327 1489094 0.22 1492421 7 3107 1368511 0.23 1371618 8 3261 1456379 0.22 1459640 9 3226 1408838 0.23 1412064 10 3081 1397280 0.22 1400361 11 2999 1403077 0.21 1406076 12 3183 1398266 0.23 1401449 13 3345 1394478 0.24 1397823 14 3256 1396278 0.23 1399534 15 3419 1390753 0.25 1394172 16 3512 1400282 0.25 1403794 17 3428 1404239 0.24 1407667 18 3551 1403322 0.25 1406873 19 3495 1411492 0.25 1414987 20 3438 1403846 0.24 1407284 21 3634 1407104 0.26 1410738 22 3541 1403032 0.25 1406573 23 3669 1404397 0.26 1408066 24 3694 1402724 0.26 1406418 25 3534 1401852 0.25 1405386 26 3540 1417304 0.25 1420844 27 3639 1412995 0.26 1416634 28 3574 1419869 0.25 1423443 29 3695 1421781 0.26 1425476 30 3656 1415705 0.26 1419361 31 3623 1418518 0.25 1422141 32 3755 1425219 0.26 1428974 33 3662 1423924 0.26 1427586 34 3785 1414613 0.27 1418398 35 3583 1423703 0.25 1427286 36 3729 1421604 0.26 1425333 37 3730 1415760 0.26 1419490 38 3752 1416563 0.26 1420315 39 3691 1420841 0.26 1424532 40 3902 1419913 0.27 1423815 41 3864 1422680 0.27 1426544 42 3882 1418305 0.27 1422187 43 3803 1424358 0.27 1428161 44 3796 1427070 0.27 1430866 45 3680 1419209 0.26 1422889 46 3693 1422911 0.26 1426604 47 3733 1429405 0.26 1433138 48 3780 1425607 0.26 1429387 49 3638 1424886 0.25 1428524 50 3676 1421654 0.26 1425330 51 3784 1425697 0.26 1429481 52 3793 1421861 0.27 1425654 53 3688 1428800 0.26 1432488 54 3646 1425174 0.26 1428820 55 3646 1424634 0.26 1428280 56 3637 1423548 0.25 1427185 57 3741 1426623 0.26 1430364 58 3701 1420083 0.26 1423784 59 3613 1430199 0.25 1433812 60 3732 1423434 0.26 1427166 61 3637 1422951 0.25 1426588 62 3756 1424523 0.26 1428279 63 3723 1424855 0.26 1428578 64 3656 1426272 0.26 1429928 65 3709 1431684 0.26 1435393 66 3831 1426546 0.27 1430377 67 3747 1434921 0.26 1438668 68 3809 1436951 0.26 1440760 69 3809 1424023 0.27 1427832 70 3734 1426529 0.26 1430263 71 3723 1431692 0.26 1435415 72 3718 1429034 0.26 1432752 73 3805 1428498 0.27 1432303 74 3797 1433168 0.26 1436965 75 3730 1430753 0.26 1434483 76 3736 1430508 0.26 1434244 77 3871 1435199 0.27 1439070 78 3787 1429942 0.26 1433729 79 3750 1428577 0.26 1432327 80 3811 1435064 0.26 1438875 81 3686 1432305 0.26 1435991 82 3807 1431741 0.27 1435548 83 3746 1434771 0.26 1438517 84 3866 1427601 0.27 1431467 85 3826 1434029 0.27 1437855 86 3724 1431948 0.26 1435672 87 3830 1430562 0.27 1434392 88 3704 1430366 0.26 1434070 89 3797 1432245 0.26 1436042 90 3696 1428896 0.26 1432592 91 3848 1430585 0.27 1434433 92 3697 1432113 0.26 1435810 93 3798 1429200 0.27 1432998 94 3761 1426799 0.26 1430560 95 3806 1428252 0.27 1432058 96 3698 1425168 0.26 1428866 97 3637 1426726 0.25 1430363 98 3790 1428558 0.26 1432348 99 3893 1426405 0.27 1430298 100 3879 1426525 0.27 1430404 101 3757 1427334 0.26 1431091 102 3773 1422516 0.26 1426289 103 3764 1421858 0.26 1425622 104 3653 1422204 0.26 1425857 105 3685 1418695 0.26 1422380 106 3655 1421166 0.26 1424821 107 3633 1419834 0.26 1423467 108 3778 1419556 0.27 1423334 109 3769 1417617 0.27 1421386 110 3705 1421763 0.26 1425468 111 3719 1417475 0.26 1421194 112 3618 1417681 0.25 1421299 113 3649 1418408 0.26 1422057 114 3718 1414133 0.26 1417851 115 3671 1412361 0.26 1416032 116 3668 1414773 0.26 1418441 117 3617 1411949 0.26 1415566 118 3712 1414189 0.26 1417901 119 3558 1415780 0.25 1419338 120 3642 1408494 0.26 1412136 121 3630 1409961 0.26 1413591 122 3710 1409836 0.26 1413546 123 3739 1407199 0.27 1410938 124 3634 1407261 0.26 1410895 125 3592 1403148 0.26 1406740 126 3531 1395402 0.25 1398933 127 3538 1398566 0.25 1402104 128 3593 1396188 0.26 1399781 129 3428 1396208 0.24 1399636 130 3504 1392956 0.25 1396460 131 3657 1391736 0.26 1395393 132 3594 1387911 0.26 1391505 133 3522 1387898 0.25 1391420 134 3566 1386025 0.26 1389591 135 3638 1386667 0.26 1390305 136 3595 1382663 0.26 1386258 137 3707 1383981 0.27 1387688 138 3573 1378432 0.26 1382005 139 3670 1382217 0.26 1385887 140 3675 1376875 0.27 1380550 141 3678 1373839 0.27 1377517 142 3658 1372323 0.27 1375981 143 3681 1369583 0.27 1373264 144 3665 1366888 0.27 1370553 145 3935 1368329 0.29 1372264 146 4401 1364694 0.32 1369095 147 4311 1361003 0.32 1365314 148 4313 1358194 0.32 1362507 149 4037 1354588 0.30 1358625 150 3612 1228081 0.29 1231693 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9064 5478586 0.17 5487650 2 9248 4883407 0.19 4892655 3 9376 5948211 0.16 5957587 4 11274 7236989 0.16 7248263 5 10915 6955811 0.16 6966726 6 11127 6824727 0.16 6835854 7 10578 6430560 0.16 6441138 8 10643 6519433 0.16 6530076 9 10465 6237263 0.17 6247728 10 10637 6192184 0.17 6202821 11 10823 6150239 0.18 6161062 12 11050 6126295 0.18 6137345 13 11060 6128429 0.18 6139489 14 11384 6118114 0.19 6129498 15 11420 6095984 0.19 6107404 16 11569 6124113 0.19 6135682 17 11784 6125941 0.19 6137725 18 11567 6135386 0.19 6146953 19 11993 6132339 0.20 6144332 20 12208 6116361 0.20 6128569 21 12116 6107380 0.20 6119496 22 12272 6106339 0.20 6118611 23 12188 6119035 0.20 6131223 24 12171 6131169 0.20 6143340 25 12203 6120795 0.20 6132998 26 12302 6124298 0.20 6136600 27 12269 6128144 0.20 6140413 28 12619 6151580 0.20 6164199 29 12449 6164557 0.20 6177006 30 12677 6158604 0.21 6171281 31 12769 6170041 0.21 6182810 32 12986 6153401 0.21 6166387 33 12678 6138489 0.21 6151167 34 12654 6144910 0.21 6157564 35 12614 6135353 0.21 6147967 36 12796 6122845 0.21 6135641 37 12811 6128346 0.21 6141157 38 12684 6137592 0.21 6150276 39 12791 6143554 0.21 6156345 40 12809 6156952 0.21 6169761 41 12697 6145397 0.21 6158094 42 12766 6146263 0.21 6159029 43 12863 6148162 0.21 6161025 44 12704 6143058 0.21 6155762 45 12531 6137916 0.20 6150447 46 12337 6139478 0.20 6151815 47 12734 6141843 0.21 6154577 48 12662 6143671 0.21 6156333 49 12806 6169593 0.21 6182399 50 12883 6171691 0.21 6184574 51 12883 6163250 0.21 6176133 52 12810 6175722 0.21 6188532 53 12852 6165092 0.21 6177944 54 12767 6157043 0.21 6169810 55 12872 6151945 0.21 6164817 56 12791 6148161 0.21 6160952 57 12734 6134676 0.21 6147410 58 12889 6151769 0.21 6164658 59 12862 6139518 0.21 6152380 60 12428 6159932 0.20 6172360 61 12709 6173372 0.21 6186081 62 13103 6174635 0.21 6187738 63 12965 6168097 0.21 6181062 64 12799 6181504 0.21 6194303 65 12884 6174788 0.21 6187672 66 12904 6174945 0.21 6187849 67 12868 6183888 0.21 6196756 68 12646 6175533 0.20 6188179 69 12997 6164224 0.21 6177221 70 12869 6185982 0.21 6198851 71 13022 6179218 0.21 6192240 72 13128 6177266 0.21 6190394 73 13138 6182116 0.21 6195254 74 12867 6179870 0.21 6192737 75 12759 6168551 0.21 6181310 76 12920 6184393 0.21 6197313 77 13014 6174681 0.21 6187695 78 13012 6162667 0.21 6175679 79 13061 6176457 0.21 6189518 80 12808 6179193 0.21 6192001 81 12977 6184624 0.21 6197601 82 12789 6194351 0.21 6207140 83 13135 6191238 0.21 6204373 84 12739 6185086 0.21 6197825 85 12811 6180603 0.21 6193414 86 12598 6171701 0.20 6184299 87 12710 6163236 0.21 6175946 88 12793 6166461 0.21 6179254 89 12708 6169053 0.21 6181761 90 12850 6165553 0.21 6178403 91 12714 6176808 0.21 6189522 92 12674 6174674 0.20 6187348 93 12719 6170867 0.21 6183586 94 12761 6180541 0.21 6193302 95 12896 6178416 0.21 6191312 96 12720 6171661 0.21 6184381 97 12795 6171954 0.21 6184749 98 12707 6172171 0.21 6184878 99 12879 6167663 0.21 6180542 100 12791 6184319 0.21 6197110 101 12608 6178671 0.20 6191279 102 12446 6173332 0.20 6185778 103 12770 6167528 0.21 6180298 104 12743 6163482 0.21 6176225 105 12621 6153693 0.20 6166314 106 12705 6160527 0.21 6173232 107 12425 6150710 0.20 6163135 108 12574 6139582 0.20 6152156 109 12569 6152569 0.20 6165138 110 12643 6152070 0.21 6164713 111 12506 6149014 0.20 6161520 112 12621 6145860 0.20 6158481 113 12626 6148986 0.20 6161612 114 12654 6137887 0.21 6150541 115 12634 6145905 0.21 6158539 116 12603 6148126 0.20 6160729 117 12614 6135387 0.21 6148001 118 12453 6126613 0.20 6139066 119 12690 6121123 0.21 6133813 120 12656 6109254 0.21 6121910 121 12649 6113199 0.21 6125848 122 12617 6105899 0.21 6118516 123 12582 6102216 0.21 6114798 124 12827 6095346 0.21 6108173 125 12807 6090921 0.21 6103728 126 12910 6081047 0.21 6093957 127 12493 6084218 0.20 6096711 128 12577 6080871 0.21 6093448 129 12402 6069250 0.20 6081652 130 12902 6061784 0.21 6074686 131 12474 6053229 0.21 6065703 132 12666 6036366 0.21 6049032 133 12599 6041786 0.21 6054385 134 12692 6038329 0.21 6051021 135 12809 6040429 0.21 6053238 136 12703 6032498 0.21 6045201 137 12738 6028609 0.21 6041347 138 12477 6024903 0.21 6037380 139 12681 6016995 0.21 6029676 140 12721 5996732 0.21 6009453 141 12936 5983441 0.22 5996377 142 12915 5973974 0.22 5986889 143 13077 5972398 0.22 5985475 144 13189 5956225 0.22 5969414 145 13562 5963975 0.23 5977537 146 14489 5966445 0.24 5980934 147 14764 5959273 0.25 5974037 148 14733 5944705 0.25 5959438 149 13964 5883158 0.24 5897122 150 12443 5514107 0.23 5526550 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2304 1020158 0.23 1022462 2 33443 980956 3.30 1014399 3 60192 721051 7.70 781243 4 55680 785776 6.62 841456 5 74928 982896 7.08 1057824 6 77143 938646 7.59 1015789 7 78723 1002931 7.28 1081654 8 74250 867375 7.89 941625 9 76544 880508 8.00 957052 10 77525 880747 8.09 958272 11 78788 876752 8.25 955540 12 79225 869790 8.35 949015 13 80814 872339 8.48 953153 14 80592 863825 8.53 944417 15 81614 864771 8.62 946385 16 82430 860171 8.74 942601 17 83594 867109 8.79 950703 18 84225 868537 8.84 952762 19 84313 868129 8.85 952442 20 85431 870074 8.94 955505 21 85997 865851 9.03 951848 22 86073 862266 9.08 948339 23 86887 864754 9.13 951641 24 86730 856894 9.19 943624 25 86662 852328 9.23 938990 26 87972 852585 9.35 940557 27 87892 853972 9.33 941864 28 87376 854569 9.28 941945 29 88188 856120 9.34 944308 30 87722 856116 9.29 943838 31 88452 851899 9.41 940351 32 88400 849190 9.43 937590 33 88576 847056 9.47 935632 34 88506 842949 9.50 931455 35 89867 841635 9.65 931502 36 89326 837138 9.64 926464 37 88952 835555 9.62 924507 38 89602 837575 9.66 927177 39 89532 836229 9.67 925761 40 90383 833223 9.79 923606 41 90347 837135 9.74 927482 42 90005 832210 9.76 922215 43 90795 830502 9.86 921297 44 90443 826265 9.87 916708 45 90402 820230 9.93 910632 46 89451 817167 9.87 906618 47 90882 818796 9.99 909678 48 90381 816072 9.97 906453 49 89931 815765 9.93 905696 50 90478 816729 9.97 907207 51 90408 812539 10.01 902947 52 90428 808895 10.06 899323 53 91035 809133 10.11 900168 54 90599 805230 10.11 895829 55 90915 800795 10.20 891710 56 90806 801336 10.18 892142 57 90573 793134 10.25 883707 58 90246 793565 10.21 883811 59 90610 796791 10.21 887401 60 90334 789565 10.27 879899 61 90481 788731 10.29 879212 62 90455 791688 10.25 882143 63 89427 785317 10.22 874744 64 90080 783625 10.31 873705 65 90044 780590 10.34 870634 66 90014 776310 10.39 866324 67 89575 774817 10.36 864392 68 89447 774935 10.35 864382 69 89868 770681 10.44 860549 70 89423 768740 10.42 858163 71 89310 768392 10.41 857702 72 89266 765426 10.44 854692 73 89131 763224 10.46 852355 74 89223 761904 10.48 851127 75 89079 755298 10.55 844377 76 88724 751841 10.56 840565 77 89215 752288 10.60 841503 78 88432 748893 10.56 837325 79 88776 746498 10.63 835274 80 88284 747697 10.56 835981 81 87913 743668 10.57 831581 82 88060 741956 10.61 830016 83 88168 740538 10.64 828706 84 87256 735597 10.60 822853 85 86802 734388 10.57 821190 86 87924 731592 10.73 819516 87 86782 727601 10.66 814383 88 86682 724787 10.68 811469 89 86772 724228 10.70 811000 90 86437 721360 10.70 807797 91 86246 717003 10.74 803249 92 85996 718517 10.69 804513 93 85556 716914 10.66 802470 94 85562 709995 10.75 795557 95 85499 708373 10.77 793872 96 84666 704491 10.73 789157 97 84711 702268 10.76 786979 98 84771 702422 10.77 787193 99 83626 695582 10.73 779208 100 83938 695200 10.77 779138 101 84034 693622 10.81 777656 102 83215 690257 10.76 773472 103 82685 686589 10.75 769274 104 83123 686552 10.80 769675 105 82907 682411 10.83 765318 106 82280 677486 10.83 759766 107 82794 674657 10.93 757451 108 81173 670970 10.79 752143 109 80793 667563 10.80 748356 110 80783 667307 10.80 748090 111 80738 663470 10.85 744208 112 80004 660014 10.81 740018 113 80619 658054 10.91 738673 114 79956 654912 10.88 734868 115 79704 652978 10.88 732682 116 80002 650959 10.94 730961 117 78098 645427 10.79 723525 118 78756 641307 10.94 720063 119 78789 641554 10.94 720343 120 78005 637225 10.91 715230 121 77499 634047 10.89 711546 122 77588 631023 10.95 708611 123 76889 628801 10.90 705690 124 76278 625789 10.86 702067 125 76246 622936 10.91 699182 126 76023 619214 10.93 695237 127 75076 615286 10.87 690362 128 74748 612423 10.88 687171 129 74604 607986 10.93 682590 130 74530 603688 10.99 678218 131 74158 602619 10.96 676777 132 73007 597951 10.88 670958 133 73245 594056 10.98 667301 134 72356 590842 10.91 663198 135 72438 587141 10.98 659579 136 71785 584405 10.94 656190 137 71176 580718 10.92 651894 138 70869 576895 10.94 647764 139 70285 572658 10.93 642943 140 69935 572327 10.89 642262 141 69862 567878 10.95 637740 142 69464 564170 10.96 633634 143 68829 561255 10.92 630084 144 68529 555610 10.98 624139 145 68217 551973 11.00 620190 146 67474 549118 10.94 616592 147 66968 541668 11.00 608636 148 66518 532916 11.10 599434 149 64780 477225 11.95 542005 150 57263 0 100.00 57263 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1928 1779385 0.11 1781313 2 1746 1091801 0.16 1093547 3 5138 2066246 0.25 2071384 4 5462 1018257 0.53 1023719 5 2449 1169504 0.21 1171953 6 2825 1393140 0.20 1395965 7 2922 1481338 0.20 1484260 8 3018 1405960 0.21 1408978 9 2720 1268127 0.21 1270847 10 2753 1348273 0.20 1351026 11 2694 1308499 0.21 1311193 12 2574 1300892 0.20 1303466 13 2614 1299987 0.20 1302601 14 2625 1297167 0.20 1299792 15 2729 1294650 0.21 1297379 16 2699 1297272 0.21 1299971 17 2755 1291941 0.21 1294696 18 2867 1297890 0.22 1300757 19 2796 1299381 0.21 1302177 20 2776 1296784 0.21 1299560 21 2834 1299236 0.22 1302070 22 2722 1290340 0.21 1293062 23 2775 1293899 0.21 1296674 24 2897 1287729 0.22 1290626 25 2766 1290686 0.21 1293452 26 2865 1286084 0.22 1288949 27 2838 1287309 0.22 1290147 28 2870 1291928 0.22 1294798 29 2865 1287552 0.22 1290417 30 2898 1289155 0.22 1292053 31 2849 1292102 0.22 1294951 32 2855 1279424 0.22 1282279 33 2784 1277544 0.22 1280328 34 2881 1277381 0.23 1280262 35 2952 1278883 0.23 1281835 36 2812 1274867 0.22 1277679 37 2910 1272935 0.23 1275845 38 2804 1269676 0.22 1272480 39 2832 1268732 0.22 1271564 40 2925 1263697 0.23 1266622 41 2963 1260200 0.23 1263163 42 2996 1260033 0.24 1263029 43 2926 1259065 0.23 1261991 44 2908 1253100 0.23 1256008 45 3003 1254933 0.24 1257936 46 2937 1254176 0.23 1257113 47 2878 1242964 0.23 1245842 48 2872 1246416 0.23 1249288 49 2852 1246375 0.23 1249227 50 2951 1243780 0.24 1246731 51 2957 1243441 0.24 1246398 52 2875 1230913 0.23 1233788 53 2880 1230145 0.23 1233025 54 2905 1229595 0.24 1232500 55 2830 1230742 0.23 1233572 56 3003 1225615 0.24 1228618 57 2863 1225023 0.23 1227886 58 2850 1217865 0.23 1220715 59 2894 1214809 0.24 1217703 60 2875 1209399 0.24 1212274 61 2853 1212732 0.23 1215585 62 2835 1203203 0.24 1206038 63 2881 1200551 0.24 1203432 64 2764 1201084 0.23 1203848 65 2921 1195109 0.24 1198030 66 2767 1194342 0.23 1197109 67 2978 1198506 0.25 1201484 68 2865 1188556 0.24 1191421 69 2799 1190798 0.23 1193597 70 2815 1186339 0.24 1189154 71 2851 1179957 0.24 1182808 72 2840 1176292 0.24 1179132 73 2713 1175701 0.23 1178414 74 2870 1170263 0.24 1173133 75 2831 1166123 0.24 1168954 76 2895 1164235 0.25 1167130 77 2958 1162937 0.25 1165895 78 2877 1157830 0.25 1160707 79 2763 1156333 0.24 1159096 80 2735 1153555 0.24 1156290 81 2871 1148690 0.25 1151561 82 2852 1144763 0.25 1147615 83 2854 1140044 0.25 1142898 84 2831 1134906 0.25 1137737 85 2790 1133488 0.25 1136278 86 2843 1128002 0.25 1130845 87 2769 1127868 0.24 1130637 88 2714 1123118 0.24 1125832 89 2808 1119282 0.25 1122090 90 2833 1115461 0.25 1118294 91 2679 1112128 0.24 1114807 92 2857 1105926 0.26 1108783 93 2787 1107068 0.25 1109855 94 2723 1102115 0.25 1104838 95 2715 1093072 0.25 1095787 96 2667 1089032 0.24 1091699 97 2708 1087161 0.25 1089869 98 2752 1078196 0.25 1080948 99 2722 1080232 0.25 1082954 100 2593 1076023 0.24 1078616 101 2547 1074224 0.24 1076771 102 2531 1069958 0.24 1072489 103 2569 1063373 0.24 1065942 104 2618 1056931 0.25 1059549 105 2585 1053573 0.24 1056158 106 2542 1049050 0.24 1051592 107 2504 1043449 0.24 1045953 108 2558 1038498 0.25 1041056 109 2551 1033747 0.25 1036298 110 2578 1030270 0.25 1032848 111 2573 1026448 0.25 1029021 112 2490 1023332 0.24 1025822 113 2511 1016262 0.25 1018773 114 2530 1013248 0.25 1015778 115 2597 1008231 0.26 1010828 116 2507 1001339 0.25 1003846 117 2402 999799 0.24 1002201 118 2391 992306 0.24 994697 119 2446 989069 0.25 991515 120 2493 988786 0.25 991279 121 2488 982541 0.25 985029 122 2461 976950 0.25 979411 123 2408 971726 0.25 974134 124 2534 966101 0.26 968635 125 2452 960681 0.25 963133 126 2466 957733 0.26 960199 127 2470 950599 0.26 953069 128 2431 941565 0.26 943996 129 2526 938835 0.27 941361 130 2408 933568 0.26 935976 131 2384 928663 0.26 931047 132 2389 924768 0.26 927157 133 2472 917023 0.27 919495 134 2464 909838 0.27 912302 135 2389 902993 0.26 905382 136 2393 900847 0.26 903240 137 2425 894671 0.27 897096 138 2355 890063 0.26 892418 139 2419 883279 0.27 885698 140 2372 878543 0.27 880915 141 2388 876755 0.27 879143 142 2340 871416 0.27 873756 143 2423 862410 0.28 864833 144 2233 857195 0.26 859428 145 2321 850016 0.27 852337 146 2388 841366 0.28 843754 147 2386 835925 0.28 838311 148 2316 821666 0.28 823982 149 2187 748594 0.29 750781 150 1586 0 100.00 1586 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 7788 7711773 0.10 7719561 2 9633 6570911 0.15 6580544 3 9983 6375003 0.16 6384986 4 9663 6125078 0.16 6134741 5 9326 5710364 0.16 5719690 6 8664 5404996 0.16 5413660 7 9283 5967172 0.16 5976455 8 9153 5793380 0.16 5802533 9 9096 5584278 0.16 5593374 10 9251 5664438 0.16 5673689 11 9546 5666366 0.17 5675912 12 9351 5656137 0.17 5665488 13 9520 5660381 0.17 5669901 14 9555 5645469 0.17 5655024 15 9724 5627003 0.17 5636727 16 9610 5642535 0.17 5652145 17 9796 5660704 0.17 5670500 18 9725 5638008 0.17 5647733 19 10169 5650229 0.18 5660398 20 9894 5648074 0.17 5657968 21 10062 5627458 0.18 5637520 22 10029 5605018 0.18 5615047 23 10176 5595955 0.18 5606131 24 10218 5561862 0.18 5572080 25 10201 5559187 0.18 5569388 26 10296 5553498 0.19 5563794 27 10357 5553760 0.19 5564117 28 10348 5558545 0.19 5568893 29 10297 5556333 0.18 5566630 30 10300 5530706 0.19 5541006 31 10413 5526496 0.19 5536909 32 10505 5521420 0.19 5531925 33 10400 5482762 0.19 5493162 34 10288 5474197 0.19 5484485 35 10632 5476203 0.19 5486835 36 10377 5456428 0.19 5466805 37 10484 5459805 0.19 5470289 38 10396 5470627 0.19 5481023 39 10323 5444285 0.19 5454608 40 10608 5450371 0.19 5460979 41 10670 5439916 0.20 5450586 42 10633 5417873 0.20 5428506 43 10616 5413421 0.20 5424037 44 10488 5393626 0.19 5404114 45 10472 5370983 0.19 5381455 46 10232 5361291 0.19 5371523 47 10640 5366524 0.20 5377164 48 10513 5357218 0.20 5367731 49 10581 5350703 0.20 5361284 50 10528 5349521 0.20 5360049 51 10589 5326607 0.20 5337196 52 10591 5317454 0.20 5328045 53 10612 5311051 0.20 5321663 54 10441 5281024 0.20 5291465 55 10415 5271267 0.20 5281682 56 10589 5268839 0.20 5279428 57 10272 5244540 0.20 5254812 58 10355 5246135 0.20 5256490 59 10684 5246501 0.20 5257185 60 10504 5223183 0.20 5233687 61 10641 5230033 0.20 5240674 62 10616 5208091 0.20 5218707 63 10335 5186786 0.20 5197121 64 10202 5171675 0.20 5181877 65 10547 5152358 0.20 5162905 66 10208 5136388 0.20 5146596 67 10317 5130056 0.20 5140373 68 10483 5118924 0.20 5129407 69 10375 5098022 0.20 5108397 70 10196 5097877 0.20 5108073 71 10192 5088400 0.20 5098592 72 10399 5071419 0.20 5081818 73 10363 5059045 0.20 5069408 74 10439 5040996 0.21 5051435 75 10044 5020928 0.20 5030972 76 10313 5011554 0.21 5021867 77 10426 5003788 0.21 5014214 78 10183 4989412 0.20 4999595 79 10108 4980070 0.20 4990178 80 10081 4963311 0.20 4973392 81 10022 4943331 0.20 4953353 82 9907 4933978 0.20 4943885 83 9881 4923269 0.20 4933150 84 9739 4896719 0.20 4906458 85 9867 4885562 0.20 4895429 86 9843 4875042 0.20 4884885 87 9885 4857833 0.20 4867718 88 9785 4847111 0.20 4856896 89 9715 4840247 0.20 4849962 90 9758 4820729 0.20 4830487 91 9838 4803270 0.20 4813108 92 9684 4790173 0.20 4799857 93 9459 4769797 0.20 4779256 94 9428 4758671 0.20 4768099 95 9416 4731404 0.20 4740820 96 9177 4706830 0.19 4716007 97 9409 4693874 0.20 4703283 98 9280 4680989 0.20 4690269 99 9317 4661304 0.20 4670621 100 9241 4650245 0.20 4659486 101 9436 4629786 0.20 4639222 102 9230 4616417 0.20 4625647 103 9056 4603766 0.20 4612822 104 9143 4588964 0.20 4598107 105 9089 4558880 0.20 4567969 106 9123 4534958 0.20 4544081 107 8928 4525483 0.20 4534411 108 9079 4497665 0.20 4506744 109 9132 4486752 0.20 4495884 110 9075 4474909 0.20 4483984 111 8889 4453818 0.20 4462707 112 8977 4438517 0.20 4447494 113 8951 4418817 0.20 4427768 114 8856 4399267 0.20 4408123 115 8815 4370444 0.20 4379259 116 8790 4353162 0.20 4361952 117 8787 4324246 0.20 4333033 118 8646 4309725 0.20 4318371 119 8848 4290781 0.21 4299629 120 8693 4273780 0.20 4282473 121 8515 4253187 0.20 4261702 122 8726 4241425 0.21 4250151 123 8610 4216381 0.20 4224991 124 8644 4197109 0.21 4205753 125 8585 4176419 0.21 4185004 126 8611 4143758 0.21 4152369 127 8527 4122427 0.21 4130954 128 8612 4098111 0.21 4106723 129 8704 4075729 0.21 4084433 130 8554 4056571 0.21 4065125 131 8458 4039280 0.21 4047738 132 8593 4022275 0.21 4030868 133 8610 3998720 0.21 4007330 134 8854 3977513 0.22 3986367 135 8753 3947413 0.22 3956166 136 8506 3927134 0.22 3935640 137 8587 3900619 0.22 3909206 138 8497 3874463 0.22 3882960 139 8269 3854974 0.21 3863243 140 8599 3833866 0.22 3842465 141 8530 3811941 0.22 3820471 142 8450 3789122 0.22 3797572 143 8505 3771020 0.23 3779525 144 8578 3740835 0.23 3749413 145 8649 3712794 0.23 3721443 146 8628 3686683 0.23 3695311 147 8845 3647018 0.24 3655863 148 8677 3595375 0.24 3604052 149 8332 3286350 0.25 3294682 150 5942 0 100.00 5942