CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 108205 642825 14.41 751030 2 130816 837459 13.51 968275 3 110895 843703 11.62 954598 4 109448 861174 11.28 970622 5 133202 1012361 11.63 1145563 6 138149 1034105 11.78 1172254 7 126589 911636 12.19 1038225 8 125720 921578 12.00 1047298 9 126065 921746 12.03 1047811 10 125724 917583 12.05 1043307 11 126660 927102 12.02 1053762 12 129270 931057 12.19 1060327 13 128145 925902 12.16 1054047 14 129836 933053 12.22 1062889 15 130170 931424 12.26 1061594 16 130709 939657 12.21 1070366 17 131096 942379 12.21 1073475 18 131514 952212 12.14 1083726 19 131244 950799 12.13 1082043 20 132696 952324 12.23 1085020 21 132616 949880 12.25 1082496 22 133070 948645 12.30 1081715 23 132536 944941 12.30 1077477 24 132498 944399 12.30 1076897 25 131655 944520 12.23 1076175 26 133399 954423 12.26 1087822 27 132813 959353 12.16 1092166 28 132325 957610 12.14 1089935 29 133473 964047 12.16 1097520 30 133403 958475 12.22 1091878 31 132779 957008 12.18 1089787 32 133833 959035 12.25 1092868 33 133731 957577 12.25 1091308 34 134084 955974 12.30 1090058 35 132992 957034 12.20 1090026 36 133993 960227 12.25 1094220 37 132872 960033 12.16 1092905 38 133988 964589 12.20 1098577 39 134495 967468 12.21 1101963 40 134943 966006 12.26 1100949 41 134500 966782 12.21 1101282 42 135314 968511 12.26 1103825 43 134004 962877 12.22 1096881 44 133239 960244 12.18 1093483 45 134066 962099 12.23 1096165 46 134156 962805 12.23 1096961 47 134244 969672 12.16 1103916 48 134699 969812 12.20 1104511 49 133566 967038 12.14 1100604 50 133646 968467 12.13 1102113 51 134693 966862 12.23 1101555 52 134618 967545 12.21 1102163 53 134966 967238 12.25 1102204 54 133721 966758 12.15 1100479 55 134093 963944 12.21 1098037 56 134174 966517 12.19 1100691 57 134163 968359 12.17 1102522 58 134289 968562 12.18 1102851 59 133502 967581 12.12 1101083 60 134407 972095 12.15 1106502 61 132912 967431 12.08 1100343 62 133220 970142 12.07 1103362 63 134339 969963 12.17 1104302 64 133667 965955 12.16 1099622 65 132835 966108 12.09 1098943 66 133830 971919 12.10 1105749 67 133799 968474 12.14 1102273 68 132439 970472 12.01 1102911 69 133365 970948 12.08 1104313 70 134070 971676 12.12 1105746 71 133530 970441 12.10 1103971 72 133489 972086 12.07 1105575 73 133696 969881 12.11 1103577 74 132595 966329 12.07 1098924 75 133010 967152 12.09 1100162 76 132935 966383 12.09 1099318 77 133489 968875 12.11 1102364 78 133508 970660 12.09 1104168 79 133453 968341 12.11 1101794 80 132951 969395 12.06 1102346 81 133060 969496 12.07 1102556 82 133117 971070 12.06 1104187 83 132032 968640 12.00 1100672 84 132945 969720 12.06 1102665 85 132582 966532 12.06 1099114 86 132042 967725 12.01 1099767 87 131953 968170 11.99 1100123 88 131334 966266 11.97 1097600 89 131469 969313 11.94 1100782 90 131091 967804 11.93 1098895 91 131199 969659 11.92 1100858 92 131814 970489 11.96 1102303 93 131259 969861 11.92 1101120 94 131546 966451 11.98 1097997 95 130270 967597 11.87 1097867 96 130814 964384 11.94 1095198 97 130764 964543 11.94 1095307 98 130371 967747 11.87 1098118 99 130677 968412 11.89 1099089 100 130296 964396 11.90 1094692 101 129493 966801 11.81 1096294 102 129766 964136 11.86 1093902 103 128802 962862 11.80 1091664 104 129561 964132 11.85 1093693 105 129665 963533 11.86 1093198 106 128836 961076 11.82 1089912 107 127589 962615 11.70 1090204 108 128715 961368 11.81 1090083 109 128058 962967 11.74 1091025 110 128994 965045 11.79 1094039 111 129084 964414 11.80 1093498 112 127805 960233 11.75 1088038 113 127319 963667 11.67 1090986 114 127286 961412 11.69 1088698 115 127380 960288 11.71 1087668 116 127489 958108 11.74 1085597 117 126303 960155 11.63 1086458 118 126312 956995 11.66 1083307 119 126069 957794 11.63 1083863 120 126524 958216 11.66 1084740 121 125591 954323 11.63 1079914 122 125520 958548 11.58 1084068 123 125389 956864 11.59 1082253 124 124609 955502 11.54 1080111 125 123733 954969 11.47 1078702 126 124450 953013 11.55 1077463 127 123644 951987 11.50 1075631 128 123889 952048 11.51 1075937 129 123289 947990 11.51 1071279 130 122787 947562 11.47 1070349 131 122833 947118 11.48 1069951 132 122612 946464 11.47 1069076 133 122177 945277 11.45 1067454 134 121850 949030 11.38 1070880 135 122721 945387 11.49 1068108 136 119931 943948 11.27 1063879 137 121328 944567 11.38 1065895 138 120348 944782 11.30 1065130 139 121204 941748 11.40 1062952 140 120040 940419 11.32 1060459 141 120251 938037 11.36 1058288 142 119004 935705 11.28 1054709 143 119372 938918 11.28 1058290 144 118773 936735 11.25 1055508 145 117815 935396 11.19 1053211 146 117965 935616 11.20 1053581 147 117836 933208 11.21 1051044 148 116038 929333 11.10 1045371 149 112094 928720 10.77 1040814 150 99221 862298 10.32 961519 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3112 2454030 0.13 2457142 2 3415 1234026 0.28 1237441 3 2514 1214867 0.21 1217381 4 2544 1383444 0.18 1385988 5 3403 1654498 0.21 1657901 6 3428 1573321 0.22 1576749 7 3054 1453776 0.21 1456830 8 3297 1456861 0.23 1460158 9 3376 1456566 0.23 1459942 10 3305 1460476 0.23 1463781 11 3273 1471193 0.22 1474466 12 3324 1467643 0.23 1470967 13 3496 1477924 0.24 1481420 14 3636 1470642 0.25 1474278 15 3760 1464424 0.26 1468184 16 3816 1481850 0.26 1485666 17 3881 1486470 0.26 1490351 18 3852 1478775 0.26 1482627 19 3706 1490692 0.25 1494398 20 3790 1484494 0.25 1488284 21 3967 1487793 0.27 1491760 22 3703 1492273 0.25 1495976 23 3845 1487089 0.26 1490934 24 3772 1485645 0.25 1489417 25 3806 1493511 0.25 1497317 26 3999 1497441 0.27 1501440 27 3968 1494859 0.26 1498827 28 4025 1509820 0.27 1513845 29 4159 1500971 0.28 1505130 30 3968 1496513 0.26 1500481 31 3813 1504130 0.25 1507943 32 4023 1504527 0.27 1508550 33 3912 1507687 0.26 1511599 34 4074 1506814 0.27 1510888 35 4043 1504834 0.27 1508877 36 4138 1504063 0.27 1508201 37 4300 1511267 0.28 1515567 38 4087 1506164 0.27 1510251 39 4185 1510234 0.28 1514419 40 4087 1511710 0.27 1515797 41 4159 1515234 0.27 1519393 42 4281 1510234 0.28 1514515 43 4127 1519730 0.27 1523857 44 4120 1512495 0.27 1516615 45 3996 1506422 0.26 1510418 46 4023 1519359 0.26 1523382 47 4015 1515955 0.26 1519970 48 4137 1514278 0.27 1518415 49 4085 1514800 0.27 1518885 50 4085 1516397 0.27 1520482 51 4113 1516235 0.27 1520348 52 4071 1518895 0.27 1522966 53 4104 1520151 0.27 1524255 54 4091 1512939 0.27 1517030 55 4055 1517198 0.27 1521253 56 4096 1518313 0.27 1522409 57 4054 1516136 0.27 1520190 58 4077 1514938 0.27 1519015 59 4181 1519018 0.27 1523199 60 4135 1513490 0.27 1517625 61 4042 1517234 0.27 1521276 62 4072 1516775 0.27 1520847 63 3970 1516387 0.26 1520357 64 4174 1521907 0.27 1526081 65 4175 1522013 0.27 1526188 66 4036 1518109 0.27 1522145 67 4055 1520944 0.27 1524999 68 4352 1518520 0.29 1522872 69 4323 1516672 0.28 1520995 70 4377 1522573 0.29 1526950 71 4219 1520074 0.28 1524293 72 4204 1520525 0.28 1524729 73 4359 1520134 0.29 1524493 74 4237 1525164 0.28 1529401 75 4365 1523115 0.29 1527480 76 4211 1523530 0.28 1527741 77 4254 1521949 0.28 1526203 78 4320 1520879 0.28 1525199 79 4150 1525072 0.27 1529222 80 4097 1524521 0.27 1528618 81 4235 1517615 0.28 1521850 82 4190 1523787 0.27 1527977 83 4180 1524808 0.27 1528988 84 4272 1520591 0.28 1524863 85 4296 1526158 0.28 1530454 86 4195 1521736 0.27 1525931 87 4294 1518115 0.28 1522409 88 4290 1519164 0.28 1523454 89 4204 1517830 0.28 1522034 90 4179 1516056 0.27 1520235 91 4158 1526282 0.27 1530440 92 4286 1520054 0.28 1524340 93 4143 1519131 0.27 1523274 94 4224 1517947 0.28 1522171 95 4278 1518379 0.28 1522657 96 4147 1515508 0.27 1519655 97 4264 1518482 0.28 1522746 98 4335 1517867 0.28 1522202 99 4103 1513955 0.27 1518058 100 4165 1517656 0.27 1521821 101 4276 1513725 0.28 1518001 102 4194 1509944 0.28 1514138 103 4155 1515462 0.27 1519617 104 4138 1512127 0.27 1516265 105 4162 1512543 0.27 1516705 106 4220 1514434 0.28 1518654 107 4166 1516166 0.27 1520332 108 4202 1509112 0.28 1513314 109 4315 1511547 0.28 1515862 110 4100 1512468 0.27 1516568 111 4234 1507852 0.28 1512086 112 4162 1508419 0.28 1512581 113 4075 1507316 0.27 1511391 114 4153 1505307 0.28 1509460 115 3997 1504465 0.26 1508462 116 4091 1504367 0.27 1508458 117 4189 1501334 0.28 1505523 118 4034 1506021 0.27 1510055 119 4192 1505277 0.28 1509469 120 4088 1497161 0.27 1501249 121 4065 1500280 0.27 1504345 122 4101 1498506 0.27 1502607 123 4157 1496270 0.28 1500427 124 4096 1498271 0.27 1502367 125 4024 1494400 0.27 1498424 126 4078 1488348 0.27 1492426 127 3987 1494251 0.27 1498238 128 3998 1485655 0.27 1489653 129 4181 1485669 0.28 1489850 130 4125 1488338 0.28 1492463 131 4005 1483437 0.27 1487442 132 4079 1481336 0.27 1485415 133 3927 1482589 0.26 1486516 134 4160 1483679 0.28 1487839 135 4041 1481476 0.27 1485517 136 4086 1478413 0.28 1482499 137 4184 1476397 0.28 1480581 138 3875 1471775 0.26 1475650 139 4195 1477057 0.28 1481252 140 4030 1469813 0.27 1473843 141 4178 1464109 0.28 1468287 142 4130 1467551 0.28 1471681 143 4164 1462185 0.28 1466349 144 4096 1459032 0.28 1463128 145 4458 1467087 0.30 1471545 146 4778 1460905 0.33 1465683 147 4769 1452695 0.33 1457464 148 4846 1452946 0.33 1457792 149 4542 1446842 0.31 1451384 150 3984 1321721 0.30 1325705 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9077 6222186 0.15 6231263 2 9336 4798078 0.19 4807414 3 9487 5417307 0.17 5426794 4 9627 6385431 0.15 6395058 5 11415 7321954 0.16 7333369 6 11645 7321188 0.16 7332833 7 10907 6682570 0.16 6693477 8 11062 6574246 0.17 6585308 9 11097 6476853 0.17 6487950 10 11074 6440673 0.17 6451747 11 11160 6457753 0.17 6468913 12 11504 6453620 0.18 6465124 13 11714 6426320 0.18 6438034 14 12203 6421974 0.19 6434177 15 12257 6430466 0.19 6442723 16 12359 6469418 0.19 6481777 17 12600 6490122 0.19 6502722 18 12341 6522173 0.19 6534514 19 12929 6518601 0.20 6531530 20 12909 6504842 0.20 6517751 21 13019 6487949 0.20 6500968 22 12913 6483550 0.20 6496463 23 12915 6482966 0.20 6495881 24 13250 6483311 0.20 6496561 25 13078 6480711 0.20 6493789 26 13374 6494732 0.21 6508106 27 13448 6515172 0.21 6528620 28 13519 6538832 0.21 6552351 29 13511 6541391 0.21 6554902 30 13589 6546491 0.21 6560080 31 13556 6554061 0.21 6567617 32 13957 6527935 0.21 6541892 33 13982 6524861 0.21 6538843 34 13638 6519274 0.21 6532912 35 13600 6514700 0.21 6528300 36 13899 6518491 0.21 6532390 37 13868 6526484 0.21 6540352 38 13862 6538141 0.21 6552003 39 13737 6556251 0.21 6569988 40 14187 6556885 0.22 6571072 41 13940 6540205 0.21 6554145 42 13774 6551718 0.21 6565492 43 13924 6541810 0.21 6555734 44 13919 6529264 0.21 6543183 45 13574 6529893 0.21 6543467 46 13683 6529808 0.21 6543491 47 14084 6544649 0.21 6558733 48 13883 6546099 0.21 6559982 49 14152 6562914 0.22 6577066 50 14505 6565098 0.22 6579603 51 14057 6559453 0.21 6573510 52 14216 6565192 0.22 6579408 53 14171 6569598 0.22 6583769 54 13904 6569538 0.21 6583442 55 13962 6551448 0.21 6565410 56 14096 6552216 0.21 6566312 57 14230 6544931 0.22 6559161 58 14465 6551685 0.22 6566150 59 14036 6547381 0.21 6561417 60 14130 6565846 0.21 6579976 61 14205 6567831 0.22 6582036 62 14086 6566931 0.21 6581017 63 14317 6571089 0.22 6585406 64 14203 6573705 0.22 6587908 65 13905 6570962 0.21 6584867 66 14226 6570733 0.22 6584959 67 14245 6571161 0.22 6585406 68 14345 6577786 0.22 6592131 69 14152 6569316 0.21 6583468 70 14341 6590453 0.22 6604794 71 14411 6585814 0.22 6600225 72 14424 6582403 0.22 6596827 73 14404 6582315 0.22 6596719 74 14517 6579834 0.22 6594351 75 14364 6573322 0.22 6587686 76 14146 6578915 0.21 6593061 77 14473 6573267 0.22 6587740 78 14339 6577461 0.22 6591800 79 14303 6577570 0.22 6591873 80 14196 6578814 0.22 6593010 81 14312 6588845 0.22 6603157 82 14391 6600227 0.22 6614618 83 14253 6586931 0.22 6601184 84 14281 6585485 0.22 6599766 85 14165 6582702 0.21 6596867 86 14211 6570913 0.22 6585124 87 14172 6566936 0.22 6581108 88 14260 6569535 0.22 6583795 89 14434 6575498 0.22 6589932 90 14195 6589568 0.21 6603763 91 14318 6582440 0.22 6596758 92 14338 6579487 0.22 6593825 93 14362 6581071 0.22 6595433 94 14474 6588394 0.22 6602868 95 14265 6584060 0.22 6598325 96 14204 6577808 0.22 6592012 97 14080 6577498 0.21 6591578 98 14249 6573191 0.22 6587440 99 14456 6575062 0.22 6589518 100 14294 6580394 0.22 6594688 101 14300 6583461 0.22 6597761 102 14157 6581273 0.21 6595430 103 14249 6578477 0.22 6592726 104 14290 6572516 0.22 6586806 105 14197 6564260 0.22 6578457 106 14213 6563514 0.22 6577727 107 13950 6556839 0.21 6570789 108 14143 6542518 0.22 6556661 109 14000 6550644 0.21 6564644 110 14338 6552882 0.22 6567220 111 13812 6551026 0.21 6564838 112 13943 6549431 0.21 6563374 113 14121 6554934 0.21 6569055 114 14198 6542644 0.22 6556842 115 14179 6546158 0.22 6560337 116 14000 6541145 0.21 6555145 117 14268 6533810 0.22 6548078 118 13952 6531367 0.21 6545319 119 14215 6520437 0.22 6534652 120 14204 6513763 0.22 6527967 121 14114 6515742 0.22 6529856 122 14055 6513922 0.22 6527977 123 14007 6512873 0.21 6526880 124 14335 6507346 0.22 6521681 125 14297 6495528 0.22 6509825 126 14124 6489982 0.22 6504106 127 14192 6487510 0.22 6501702 128 14137 6474810 0.22 6488947 129 14090 6471273 0.22 6485363 130 13948 6469356 0.22 6483304 131 14104 6462538 0.22 6476642 132 13792 6452374 0.21 6466166 133 14037 6453962 0.22 6467999 134 14019 6443851 0.22 6457870 135 14348 6440515 0.22 6454863 136 13976 6422918 0.22 6436894 137 14098 6415080 0.22 6429178 138 14192 6426283 0.22 6440475 139 14346 6414223 0.22 6428569 140 14335 6409156 0.22 6423491 141 14261 6397742 0.22 6412003 142 14349 6389497 0.22 6403846 143 14494 6377312 0.23 6391806 144 14947 6366598 0.23 6381545 145 15416 6372967 0.24 6388383 146 16113 6378503 0.25 6394616 147 16331 6370843 0.26 6387174 148 16246 6343829 0.26 6360075 149 15381 6284470 0.24 6299851 150 13729 5895336 0.23 5909065 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2562 1165467 0.22 1168029 2 30810 941890 3.17 972700 3 67877 810401 7.73 878278 4 70057 826824 7.81 896881 5 72105 855497 7.77 927602 6 83449 1009041 7.64 1092490 7 89084 1025940 7.99 1115024 8 83564 904190 8.46 987754 9 85613 911078 8.59 996691 10 87415 907521 8.79 994936 11 88699 901473 8.96 990172 12 90104 907365 9.03 997469 13 92490 905939 9.26 998429 14 92507 906122 9.26 998629 15 94111 909847 9.37 1003958 16 93975 909927 9.36 1003902 17 95256 914056 9.44 1009312 18 95758 916623 9.46 1012381 19 97182 919489 9.56 1016671 20 97017 919689 9.54 1016706 21 97513 914932 9.63 1012445 22 98191 912427 9.72 1010618 23 99157 912793 9.80 1011950 24 98849 906308 9.83 1005157 25 98984 903829 9.87 1002813 26 99304 905118 9.89 1004422 27 100101 910811 9.90 1010912 28 100135 909785 9.92 1009920 29 100350 906667 9.97 1007017 30 100423 910062 9.94 1010485 31 101056 902938 10.07 1003994 32 100693 899958 10.06 1000651 33 101396 900092 10.12 1001488 34 101463 899542 10.14 1001005 35 101344 896194 10.16 997538 36 101261 891893 10.20 993154 37 102289 893979 10.27 996268 38 101500 894718 10.19 996218 39 102541 894520 10.28 997061 40 102391 894058 10.28 996449 41 103110 890619 10.38 993729 42 103132 889253 10.39 992385 43 103236 888818 10.41 992054 44 103131 884433 10.44 987564 45 103230 877042 10.53 980272 46 103112 876946 10.52 980058 47 102448 876693 10.46 979141 48 103455 879913 10.52 983368 49 103596 876014 10.58 979610 50 102787 873653 10.53 976440 51 103130 870807 10.59 973937 52 103327 867396 10.64 970723 53 104003 867994 10.70 971997 54 103093 866840 10.63 969933 55 104007 862146 10.77 966153 56 102918 859515 10.69 962433 57 103138 856105 10.75 959243 58 104475 858067 10.85 962542 59 103594 856869 10.79 960463 60 102856 852259 10.77 955115 61 103341 851279 10.83 954620 62 102993 849331 10.81 952324 63 103251 847349 10.86 950600 64 103189 844830 10.88 948019 65 102579 841675 10.86 944254 66 102577 838368 10.90 940945 67 103757 836557 11.03 940314 68 102373 834851 10.92 937224 69 102035 832956 10.91 934991 70 102713 829894 11.01 932607 71 103078 829314 11.06 932392 72 102386 827299 11.01 929685 73 102129 825290 11.01 927419 74 102315 821101 11.08 923416 75 101525 817275 11.05 918800 76 102589 813453 11.20 916042 77 101564 812669 11.11 914233 78 101489 808204 11.16 909693 79 101657 812256 11.12 913913 80 101003 808099 11.11 909102 81 101061 804725 11.16 905786 82 100814 802196 11.16 903010 83 100699 800512 11.17 901211 84 100012 797910 11.14 897922 85 100200 793618 11.21 893818 86 100131 790669 11.24 890800 87 99690 787983 11.23 887673 88 99431 785904 11.23 885335 89 99564 782005 11.29 881569 90 99022 781511 11.25 880533 91 98362 777811 11.23 876173 92 98605 778171 11.25 876776 93 98615 774343 11.30 872958 94 97949 772684 11.25 870633 95 97731 768312 11.28 866043 96 97550 764539 11.32 862089 97 97917 761221 11.40 859138 98 97668 761097 11.37 858765 99 96947 757905 11.34 854852 100 96493 756023 11.32 852516 101 96483 751656 11.38 848139 102 96006 748173 11.37 844179 103 95927 746001 11.39 841928 104 95029 741315 11.36 836344 105 94615 739514 11.34 834129 106 94740 735431 11.41 830171 107 94205 733290 11.38 827495 108 93371 728756 11.36 822127 109 93499 725074 11.42 818573 110 93064 723212 11.40 816276 111 93370 720916 11.47 814286 112 92698 719599 11.41 812297 113 92731 715261 11.48 807992 114 91971 713195 11.42 805166 115 92038 709877 11.48 801915 116 91245 704733 11.46 795978 117 91094 701746 11.49 792840 118 90684 698830 11.49 789514 119 89517 696363 11.39 785880 120 89311 693707 11.41 783018 121 89994 689757 11.54 779751 122 88455 687676 11.40 776131 123 87868 684311 11.38 772179 124 87860 681252 11.42 769112 125 88236 677330 11.53 765566 126 87400 672864 11.50 760264 127 86351 668174 11.44 754525 128 86056 665790 11.45 751846 129 85504 663096 11.42 748600 130 85535 659121 11.49 744656 131 85044 654313 11.50 739357 132 84668 653859 11.46 738527 133 84514 649536 11.51 734050 134 83940 644464 11.52 728404 135 83175 641506 11.48 724681 136 82484 639263 11.43 721747 137 82752 635622 11.52 718374 138 82593 630392 11.58 712985 139 80844 625600 11.44 706444 140 80595 623998 11.44 704593 141 80613 620369 11.50 700982 142 80197 615211 11.53 695408 143 79692 612600 11.51 692292 144 78489 607497 11.44 685986 145 78494 606293 11.46 684787 146 77543 600556 11.44 678099 147 76709 595211 11.42 671920 148 76918 583650 11.64 660568 149 74983 527986 12.44 602969 150 65526 0 100.00 65526 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1188 1399124 0.08 1400312 2 1734 1207550 0.14 1209284 3 6447 2688479 0.24 2694926 4 6030 1210166 0.50 1216196 5 2488 1179196 0.21 1181684 6 2562 1308340 0.20 1310902 7 3190 1552167 0.21 1555357 8 3201 1481170 0.22 1484371 9 3059 1370447 0.22 1373506 10 2956 1367939 0.22 1370895 11 2882 1370449 0.21 1373331 12 2865 1368218 0.21 1371083 13 2920 1372597 0.21 1375517 14 2961 1373073 0.22 1376034 15 3023 1386025 0.22 1389048 16 2908 1377813 0.21 1380721 17 3010 1373348 0.22 1376358 18 3152 1389804 0.23 1392956 19 3089 1385412 0.22 1388501 20 3110 1379247 0.22 1382357 21 3196 1388649 0.23 1391845 22 3184 1379170 0.23 1382354 23 3327 1380064 0.24 1383391 24 3245 1387395 0.23 1390640 25 3278 1380168 0.24 1383446 26 3287 1374819 0.24 1378106 27 3209 1385120 0.23 1388329 28 3079 1380097 0.22 1383176 29 3262 1375886 0.24 1379148 30 3229 1388097 0.23 1391326 31 3294 1374649 0.24 1377943 32 3230 1366536 0.24 1369766 33 3183 1371925 0.23 1375108 34 3284 1370690 0.24 1373974 35 3316 1371270 0.24 1374586 36 3288 1374104 0.24 1377392 37 3230 1366069 0.24 1369299 38 3283 1363826 0.24 1367109 39 3242 1366355 0.24 1369597 40 3460 1358829 0.25 1362289 41 3365 1358400 0.25 1361765 42 3218 1355357 0.24 1358575 43 3283 1352752 0.24 1356035 44 3219 1349638 0.24 1352857 45 3330 1353784 0.25 1357114 46 3234 1344596 0.24 1347830 47 3299 1340758 0.25 1344057 48 3316 1348608 0.25 1351924 49 3316 1339365 0.25 1342681 50 3317 1336885 0.25 1340202 51 3351 1336253 0.25 1339604 52 3277 1329840 0.25 1333117 53 3307 1329575 0.25 1332882 54 3045 1328157 0.23 1331202 55 3381 1329969 0.25 1333350 56 3148 1318667 0.24 1321815 57 3177 1319484 0.24 1322661 58 3265 1316898 0.25 1320163 59 3234 1312153 0.25 1315387 60 3163 1309752 0.24 1312915 61 3281 1311268 0.25 1314549 62 3210 1300621 0.25 1303831 63 3199 1301998 0.25 1305197 64 3267 1299873 0.25 1303140 65 3129 1292148 0.24 1295277 66 3277 1294884 0.25 1298161 67 3300 1293798 0.25 1297098 68 3212 1283537 0.25 1286749 69 3351 1287993 0.26 1291344 70 3319 1279918 0.26 1283237 71 3290 1273970 0.26 1277260 72 3304 1277181 0.26 1280485 73 3318 1268336 0.26 1271654 74 3184 1265864 0.25 1269048 75 3272 1265665 0.26 1268937 76 3223 1261704 0.25 1264927 77 3249 1257160 0.26 1260409 78 3254 1256606 0.26 1259860 79 3171 1250204 0.25 1253375 80 3170 1248818 0.25 1251988 81 3211 1245949 0.26 1249160 82 3206 1240009 0.26 1243215 83 3067 1231459 0.25 1234526 84 3220 1233301 0.26 1236521 85 3193 1230339 0.26 1233532 86 3142 1223023 0.26 1226165 87 3124 1225222 0.25 1228346 88 3097 1218355 0.25 1221452 89 3121 1211611 0.26 1214732 90 3040 1209162 0.25 1212202 91 3198 1203735 0.26 1206933 92 3076 1200099 0.26 1203175 93 3119 1201383 0.26 1204502 94 3067 1194777 0.26 1197844 95 2990 1189238 0.25 1192228 96 3031 1187058 0.25 1190089 97 3014 1183997 0.25 1187011 98 2953 1173367 0.25 1176320 99 2975 1176833 0.25 1179808 100 3091 1169813 0.26 1172904 101 2950 1163340 0.25 1166290 102 3085 1162567 0.26 1165652 103 3046 1155022 0.26 1158068 104 2954 1149150 0.26 1152104 105 2896 1151014 0.25 1153910 106 3053 1139683 0.27 1142736 107 3024 1135941 0.27 1138965 108 3006 1137608 0.26 1140614 109 2977 1128126 0.26 1131103 110 2899 1123591 0.26 1126490 111 2979 1119900 0.27 1122879 112 2864 1116602 0.26 1119466 113 2922 1109627 0.26 1112549 114 2963 1107740 0.27 1110703 115 2919 1100982 0.26 1103901 116 2881 1095754 0.26 1098635 117 2864 1092743 0.26 1095607 118 2843 1083384 0.26 1086227 119 2916 1081142 0.27 1084058 120 2912 1081380 0.27 1084292 121 2758 1072119 0.26 1074877 122 2888 1066058 0.27 1068946 123 2733 1062872 0.26 1065605 124 2882 1053757 0.27 1056639 125 2908 1049712 0.28 1052620 126 2891 1046402 0.28 1049293 127 2858 1041066 0.27 1043924 128 2781 1030821 0.27 1033602 129 2834 1028161 0.27 1030995 130 2786 1023150 0.27 1025936 131 2760 1019047 0.27 1021807 132 2756 1011446 0.27 1014202 133 2727 1005837 0.27 1008564 134 2780 998332 0.28 1001112 135 2763 994809 0.28 997572 136 2802 988702 0.28 991504 137 2702 984123 0.27 986825 138 2724 980882 0.28 983606 139 2800 972456 0.29 975256 140 2794 964083 0.29 966877 141 2796 964647 0.29 967443 142 2746 955274 0.29 958020 143 2754 948582 0.29 951336 144 2667 944465 0.28 947132 145 2737 934915 0.29 937652 146 2647 927903 0.28 930550 147 2696 921258 0.29 923954 148 2690 907102 0.30 909792 149 2575 833982 0.31 836557 150 1832 0 100.00 1832 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 6140 7270609 0.08 7276749 2 7287 5438107 0.13 5445394 3 10569 7069749 0.15 7080318 4 12117 7423525 0.16 7435642 5 9991 6423692 0.16 6433683 6 9542 5960305 0.16 5969847 7 9831 6041944 0.16 6051775 8 9664 5921162 0.16 5930826 9 9957 6003654 0.17 6013611 10 10094 6021891 0.17 6031985 11 10336 6039048 0.17 6049384 12 10358 6073963 0.17 6084321 13 10834 6055990 0.18 6066824 14 10680 6042307 0.18 6052987 15 10827 6060463 0.18 6071290 16 10917 6072093 0.18 6083010 17 11060 6075557 0.18 6086617 18 10790 6063797 0.18 6074587 19 11486 6062610 0.19 6074096 20 11307 6039669 0.19 6050976 21 11062 6034926 0.18 6045988 22 11304 6007534 0.19 6018838 23 11136 6000962 0.19 6012098 24 11278 5992967 0.19 6004245 25 11512 5999658 0.19 6011170 26 11539 5982843 0.19 5994382 27 11417 5999705 0.19 6011122 28 11860 6001091 0.20 6012951 29 11743 5981912 0.20 5993655 30 11640 5975624 0.19 5987264 31 11721 5970610 0.20 5982331 32 11609 5939703 0.20 5951312 33 11555 5924264 0.19 5935819 34 11668 5910892 0.20 5922560 35 11754 5912486 0.20 5924240 36 11760 5922087 0.20 5933847 37 11977 5913370 0.20 5925347 38 11777 5914590 0.20 5926367 39 11986 5907202 0.20 5919188 40 11918 5891234 0.20 5903152 41 11983 5874802 0.20 5886785 42 11883 5857435 0.20 5869318 43 11815 5847439 0.20 5859254 44 11823 5823292 0.20 5835115 45 11871 5823855 0.20 5835726 46 11977 5821989 0.21 5833966 47 12025 5811779 0.21 5823804 48 12029 5819380 0.21 5831409 49 11874 5812251 0.20 5824125 50 12133 5793377 0.21 5805510 51 11979 5774378 0.21 5786357 52 12156 5756974 0.21 5769130 53 12020 5739953 0.21 5751973 54 12174 5726225 0.21 5738399 55 12048 5722419 0.21 5734467 56 11760 5709768 0.21 5721528 57 11868 5700473 0.21 5712341 58 11823 5701207 0.21 5713030 59 11767 5685388 0.21 5697155 60 12130 5673325 0.21 5685455 61 11938 5662049 0.21 5673987 62 11874 5634482 0.21 5646356 63 11722 5620972 0.21 5632694 64 11784 5606995 0.21 5618779 65 11600 5589983 0.21 5601583 66 11710 5585471 0.21 5597181 67 11656 5585446 0.21 5597102 68 11650 5564913 0.21 5576563 69 11700 5548214 0.21 5559914 70 11503 5538991 0.21 5550494 71 11568 5524248 0.21 5535816 72 11802 5506849 0.21 5518651 73 11541 5504190 0.21 5515731 74 11583 5470791 0.21 5482374 75 11548 5459780 0.21 5471328 76 11531 5449162 0.21 5460693 77 11481 5435017 0.21 5446498 78 11653 5427363 0.21 5439016 79 11432 5421001 0.21 5432433 80 11447 5399306 0.21 5410753 81 11411 5389734 0.21 5401145 82 11074 5369496 0.21 5380570 83 11171 5347137 0.21 5358308 84 11274 5325000 0.21 5336274 85 11045 5312094 0.21 5323139 86 11243 5301307 0.21 5312550 87 11073 5287094 0.21 5298167 88 11016 5276566 0.21 5287582 89 11050 5266734 0.21 5277784 90 10907 5251526 0.21 5262433 91 10810 5235876 0.21 5246686 92 11009 5216149 0.21 5227158 93 10792 5198913 0.21 5209705 94 10983 5185236 0.21 5196219 95 10825 5146375 0.21 5157200 96 10853 5133195 0.21 5144048 97 10724 5121759 0.21 5132483 98 10610 5099578 0.21 5110188 99 10780 5089985 0.21 5100765 100 10693 5069915 0.21 5080608 101 10682 5046497 0.21 5057179 102 10607 5035099 0.21 5045706 103 10523 5017586 0.21 5028109 104 10141 4995026 0.20 5005167 105 10405 4974734 0.21 4985139 106 10459 4952765 0.21 4963224 107 10464 4926120 0.21 4936584 108 10409 4916269 0.21 4926678 109 10529 4906913 0.21 4917442 110 10347 4884650 0.21 4894997 111 10464 4872785 0.21 4883249 112 10238 4847771 0.21 4858009 113 10095 4827734 0.21 4837829 114 10074 4808213 0.21 4818287 115 10158 4781620 0.21 4791778 116 10124 4757624 0.21 4767748 117 10145 4739343 0.21 4749488 118 10001 4712352 0.21 4722353 119 9899 4691757 0.21 4701656 120 9937 4680532 0.21 4690469 121 10008 4662424 0.21 4672432 122 9718 4637066 0.21 4646784 123 9732 4618145 0.21 4627877 124 9606 4596552 0.21 4606158 125 9815 4565414 0.21 4575229 126 9793 4545977 0.21 4555770 127 9743 4523956 0.21 4533699 128 9931 4495865 0.22 4505796 129 9756 4478392 0.22 4488148 130 9710 4454405 0.22 4464115 131 9777 4434701 0.22 4444478 132 9723 4413173 0.22 4422896 133 9789 4388645 0.22 4398434 134 9880 4362195 0.23 4372075 135 9975 4338465 0.23 4348440 136 9889 4314201 0.23 4324090 137 9773 4284556 0.23 4294329 138 9819 4261843 0.23 4271662 139 9639 4234791 0.23 4244430 140 9750 4208494 0.23 4218244 141 9673 4189261 0.23 4198934 142 9535 4164438 0.23 4173973 143 9731 4139564 0.23 4149295 144 9593 4111590 0.23 4121183 145 9684 4083536 0.24 4093220 146 9924 4050805 0.24 4060729 147 10033 4013080 0.25 4023113 148 9986 3960147 0.25 3970133 149 9351 3635364 0.26 3644715 150 6738 0 100.00 6738