CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 103805 645793 13.85 749598 2 131146 844257 13.45 975403 3 104263 811817 11.38 916080 4 109145 862842 11.23 971987 5 127498 979831 11.51 1107329 6 134058 1004152 11.78 1138210 7 122437 875992 12.26 998429 8 121504 887149 12.05 1008653 9 121515 886497 12.05 1008012 10 120508 882898 12.01 1003406 11 121349 892263 11.97 1013612 12 124124 892978 12.20 1017102 13 123729 892049 12.18 1015778 14 124916 898254 12.21 1023170 15 125100 897366 12.24 1022466 16 124939 902805 12.16 1027744 17 125552 906761 12.16 1032313 18 126037 914432 12.11 1040469 19 126203 913459 12.14 1039662 20 126987 913517 12.20 1040504 21 126329 912644 12.16 1038973 22 127513 911483 12.27 1038996 23 127480 907436 12.32 1034916 24 126335 906444 12.23 1032779 25 126427 907184 12.23 1033611 26 126923 916087 12.17 1043010 27 127759 918949 12.21 1046708 28 127076 917628 12.16 1044704 29 127796 922194 12.17 1049990 30 127722 921345 12.17 1049067 31 127192 916390 12.19 1043582 32 127664 920364 12.18 1048028 33 128486 918563 12.27 1047049 34 127811 916308 12.24 1044119 35 127294 917340 12.19 1044634 36 128705 919117 12.28 1047822 37 127519 920657 12.17 1048176 38 128163 923206 12.19 1051369 39 128997 925339 12.23 1054336 40 128085 925473 12.16 1053558 41 127852 926770 12.12 1054622 42 129332 928392 12.23 1057724 43 128058 921409 12.20 1049467 44 127858 922756 12.17 1050614 45 127897 921190 12.19 1049087 46 127980 921247 12.20 1049227 47 127792 927379 12.11 1055171 48 128595 928966 12.16 1057561 49 127925 925413 12.14 1053338 50 127710 926118 12.12 1053828 51 127657 926351 12.11 1054008 52 128874 924530 12.23 1053404 53 128331 924557 12.19 1052888 54 128224 925065 12.17 1053289 55 127744 922911 12.16 1050655 56 127920 923466 12.17 1051386 57 128270 926281 12.16 1054551 58 128527 924841 12.20 1053368 59 127337 923941 12.11 1051278 60 127533 929048 12.07 1056581 61 127678 924855 12.13 1052533 62 127475 928147 12.08 1055622 63 128369 928313 12.15 1056682 64 127668 923965 12.14 1051633 65 127103 924464 12.09 1051567 66 126980 925923 12.06 1052903 67 128215 926845 12.15 1055060 68 126992 925997 12.06 1052989 69 127527 926854 12.09 1054381 70 127851 925215 12.14 1053066 71 126416 926745 12.00 1053161 72 127338 928698 12.06 1056036 73 126875 925862 12.05 1052737 74 127009 925540 12.07 1052549 75 127105 925465 12.08 1052570 76 126872 923399 12.08 1050271 77 126468 926520 12.01 1052988 78 126800 930191 12.00 1056991 79 127283 928572 12.05 1055855 80 126693 927307 12.02 1054000 81 127279 926120 12.08 1053399 82 126831 926256 12.04 1053087 83 126605 926420 12.02 1053025 84 126158 927466 11.97 1053624 85 126734 923345 12.07 1050079 86 125966 925467 11.98 1051433 87 126100 924876 12.00 1050976 88 125467 924309 11.95 1049776 89 125701 926850 11.94 1052551 90 125413 926394 11.92 1051807 91 125231 926968 11.90 1052199 92 125238 927600 11.90 1052838 93 125773 928575 11.93 1054348 94 125821 927072 11.95 1052893 95 125233 926312 11.91 1051545 96 124641 923312 11.89 1047953 97 124883 923939 11.91 1048822 98 124592 923836 11.88 1048428 99 124650 925874 11.87 1050524 100 124202 925038 11.84 1049240 101 123728 925019 11.80 1048747 102 124142 922435 11.86 1046577 103 123981 923622 11.83 1047603 104 123723 923691 11.81 1047414 105 123894 923959 11.82 1047853 106 123423 920292 11.83 1043715 107 123184 921734 11.79 1044918 108 123135 920291 11.80 1043426 109 123091 920387 11.80 1043478 110 122904 924010 11.74 1046914 111 122478 923165 11.71 1045643 112 122269 920185 11.73 1042454 113 122199 922089 11.70 1044288 114 122097 921717 11.70 1043814 115 121847 918182 11.72 1040029 116 121533 918081 11.69 1039614 117 120686 920118 11.60 1040804 118 121222 917865 11.67 1039087 119 120533 918808 11.60 1039341 120 120700 917960 11.62 1038660 121 119921 917958 11.55 1037879 122 120628 917914 11.62 1038542 123 120371 920820 11.56 1041191 124 119872 917174 11.56 1037046 125 119384 916934 11.52 1036318 126 119696 915666 11.56 1035362 127 118703 912645 11.51 1031348 128 118592 912594 11.50 1031186 129 118361 911449 11.49 1029810 130 117908 910252 11.47 1028160 131 118484 910847 11.51 1029331 132 118032 909246 11.49 1027278 133 117643 906614 11.49 1024257 134 117528 911530 11.42 1029058 135 116944 909414 11.39 1026358 136 116041 907559 11.34 1023600 137 116120 907596 11.34 1023716 138 115785 906253 11.33 1022038 139 115945 904497 11.36 1020442 140 115888 903661 11.37 1019549 141 115515 901340 11.36 1016855 142 114715 903272 11.27 1017987 143 115022 903062 11.30 1018084 144 113266 899731 11.18 1012997 145 113665 899291 11.22 1012956 146 114508 901278 11.27 1015786 147 112761 900388 11.13 1013149 148 112162 895055 11.14 1007217 149 108235 893871 10.80 1002106 150 96303 829097 10.41 925400 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2978 2450616 0.12 2453594 2 3312 1204402 0.27 1207714 3 2349 1174900 0.20 1177249 4 2498 1368198 0.18 1370696 5 3295 1607516 0.20 1610811 6 3235 1523679 0.21 1526914 7 3029 1398794 0.22 1401823 8 3091 1407961 0.22 1411052 9 3194 1403140 0.23 1406334 10 3124 1403239 0.22 1406363 11 3281 1413272 0.23 1416553 12 3209 1413462 0.23 1416671 13 3367 1418677 0.24 1422044 14 3312 1414072 0.23 1417384 15 3483 1404974 0.25 1408457 16 3717 1423266 0.26 1426983 17 3605 1428604 0.25 1432209 18 3679 1422428 0.26 1426107 19 3531 1436836 0.25 1440367 20 3592 1428706 0.25 1432298 21 3739 1429633 0.26 1433372 22 3588 1433907 0.25 1437495 23 3694 1433454 0.26 1437148 24 3733 1426452 0.26 1430185 25 3737 1434879 0.26 1438616 26 3706 1438242 0.26 1441948 27 3646 1436413 0.25 1440059 28 3779 1452086 0.26 1455865 29 3876 1444649 0.27 1448525 30 3724 1439069 0.26 1442793 31 3743 1445563 0.26 1449306 32 3785 1447776 0.26 1451561 33 3856 1447736 0.27 1451592 34 3881 1447207 0.27 1451088 35 3819 1444021 0.26 1447840 36 3950 1447892 0.27 1451842 37 4051 1453244 0.28 1457295 38 3918 1448397 0.27 1452315 39 3801 1449293 0.26 1453094 40 3982 1451638 0.27 1455620 41 3895 1454070 0.27 1457965 42 4014 1446061 0.28 1450075 43 3781 1454424 0.26 1458205 44 4059 1450363 0.28 1454422 45 3886 1446935 0.27 1450821 46 3779 1456584 0.26 1460363 47 3986 1453807 0.27 1457793 48 3804 1453714 0.26 1457518 49 3940 1455149 0.27 1459089 50 3897 1454957 0.27 1458854 51 3907 1453144 0.27 1457051 52 3847 1455270 0.26 1459117 53 3863 1457155 0.26 1461018 54 3769 1452483 0.26 1456252 55 3909 1456259 0.27 1460168 56 3881 1458403 0.27 1462284 57 3869 1452935 0.27 1456804 58 3940 1451592 0.27 1455532 59 3830 1458168 0.26 1461998 60 3866 1452080 0.27 1455946 61 3803 1458086 0.26 1461889 62 4018 1456638 0.28 1460656 63 3935 1452471 0.27 1456406 64 3939 1457439 0.27 1461378 65 3980 1462451 0.27 1466431 66 3978 1455832 0.27 1459810 67 3950 1461143 0.27 1465093 68 3994 1456006 0.27 1460000 69 4037 1451665 0.28 1455702 70 4063 1460461 0.28 1464524 71 3972 1459941 0.27 1463913 72 4030 1460241 0.28 1464271 73 4135 1460823 0.28 1464958 74 4035 1459426 0.28 1463461 75 3971 1463927 0.27 1467898 76 4031 1461527 0.28 1465558 77 4075 1463010 0.28 1467085 78 4063 1464229 0.28 1468292 79 3984 1465788 0.27 1469772 80 4031 1463211 0.27 1467242 81 3995 1455938 0.27 1459933 82 3999 1462645 0.27 1466644 83 4026 1463907 0.27 1467933 84 3964 1459357 0.27 1463321 85 4076 1466809 0.28 1470885 86 3990 1459865 0.27 1463855 87 4047 1460913 0.28 1464960 88 4052 1460946 0.28 1464998 89 3786 1458899 0.26 1462685 90 4090 1457413 0.28 1461503 91 3994 1461445 0.27 1465439 92 4033 1460178 0.28 1464211 93 4007 1456501 0.27 1460508 94 4001 1459110 0.27 1463111 95 4006 1459964 0.27 1463970 96 4025 1453715 0.28 1457740 97 4119 1460909 0.28 1465028 98 4037 1459443 0.28 1463480 99 3972 1456613 0.27 1460585 100 3989 1457619 0.27 1461608 101 4104 1456067 0.28 1460171 102 3932 1449831 0.27 1453763 103 4031 1458225 0.28 1462256 104 3967 1454343 0.27 1458310 105 4006 1449802 0.28 1453808 106 3845 1456154 0.26 1459999 107 3995 1456187 0.27 1460182 108 3987 1450530 0.27 1454517 109 3972 1453338 0.27 1457310 110 4042 1452732 0.28 1456774 111 3850 1449134 0.26 1452984 112 3890 1450230 0.27 1454120 113 3883 1448263 0.27 1452146 114 3987 1446054 0.27 1450041 115 4004 1447901 0.28 1451905 116 3907 1444467 0.27 1448374 117 3923 1445262 0.27 1449185 118 3926 1449790 0.27 1453716 119 3985 1447117 0.27 1451102 120 3981 1443176 0.28 1447157 121 3993 1444423 0.28 1448416 122 3961 1442502 0.27 1446463 123 3952 1439773 0.27 1443725 124 3967 1440600 0.27 1444567 125 3900 1437807 0.27 1441707 126 3821 1433646 0.27 1437467 127 3896 1436785 0.27 1440681 128 3783 1432922 0.26 1436705 129 3924 1431388 0.27 1435312 130 3872 1432728 0.27 1436600 131 3958 1429077 0.28 1433035 132 3828 1427264 0.27 1431092 133 3854 1428676 0.27 1432530 134 3979 1428433 0.28 1432412 135 3854 1425316 0.27 1429170 136 3781 1425204 0.26 1428985 137 3922 1424900 0.27 1428822 138 3874 1417893 0.27 1421767 139 3891 1424079 0.27 1427970 140 3758 1418658 0.26 1422416 141 3881 1412746 0.27 1416627 142 3930 1414569 0.28 1418499 143 4006 1410255 0.28 1414261 144 4006 1407567 0.28 1411573 145 4236 1414384 0.30 1418620 146 4503 1407803 0.32 1412306 147 4588 1404465 0.33 1409053 148 4495 1401665 0.32 1406160 149 4195 1394838 0.30 1399033 150 3829 1270824 0.30 1274653 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 8549 5953556 0.14 5962105 2 9370 4716959 0.20 4726329 3 8924 5257812 0.17 5266736 4 9579 6348245 0.15 6357824 5 11001 7111111 0.15 7122112 6 11189 7109844 0.16 7121033 7 10459 6447466 0.16 6457925 8 10829 6348771 0.17 6359600 9 10624 6227016 0.17 6237640 10 10639 6178492 0.17 6189131 11 10858 6201918 0.17 6212776 12 11030 6195380 0.18 6206410 13 11156 6169022 0.18 6180178 14 11636 6185793 0.19 6197429 15 11618 6187888 0.19 6199506 16 11820 6221875 0.19 6233695 17 11901 6233082 0.19 6244983 18 12005 6263727 0.19 6275732 19 12015 6259382 0.19 6271397 20 12398 6249383 0.20 6261781 21 12073 6236962 0.19 6249035 22 12325 6230594 0.20 6242919 23 12269 6227134 0.20 6239403 24 12479 6235812 0.20 6248291 25 12395 6236056 0.20 6248451 26 12549 6244294 0.20 6256843 27 12813 6261564 0.20 6274377 28 12964 6278715 0.21 6291679 29 12889 6285267 0.20 6298156 30 12669 6287147 0.20 6299816 31 12971 6293546 0.21 6306517 32 13133 6276801 0.21 6289934 33 13069 6267948 0.21 6281017 34 13063 6262156 0.21 6275219 35 13129 6262786 0.21 6275915 36 13203 6266369 0.21 6279572 37 13125 6262521 0.21 6275646 38 13210 6280992 0.21 6294202 39 13372 6293306 0.21 6306678 40 13457 6291301 0.21 6304758 41 13236 6286792 0.21 6300028 42 13263 6296011 0.21 6309274 43 13228 6281682 0.21 6294910 44 13235 6274813 0.21 6288048 45 13140 6273187 0.21 6286327 46 12851 6272558 0.20 6285409 47 13235 6287081 0.21 6300316 48 13190 6288498 0.21 6301688 49 13511 6296809 0.21 6310320 50 13420 6306516 0.21 6319936 51 13368 6303906 0.21 6317274 52 13323 6309706 0.21 6323029 53 13546 6308030 0.21 6321576 54 13444 6303114 0.21 6316558 55 13316 6294151 0.21 6307467 56 13455 6299166 0.21 6312621 57 13439 6289087 0.21 6302526 58 13482 6291029 0.21 6304511 59 13091 6283777 0.21 6296868 60 13357 6304138 0.21 6317495 61 13418 6306968 0.21 6320386 62 13701 6308178 0.22 6321879 63 13582 6319248 0.21 6332830 64 13548 6320668 0.21 6334216 65 13490 6319755 0.21 6333245 66 13346 6316200 0.21 6329546 67 13744 6315680 0.22 6329424 68 13387 6321133 0.21 6334520 69 13495 6309915 0.21 6323410 70 13503 6330160 0.21 6343663 71 13579 6326792 0.21 6340371 72 13630 6325080 0.22 6338710 73 13835 6324767 0.22 6338602 74 13913 6324571 0.22 6338484 75 13555 6321283 0.21 6334838 76 13639 6321076 0.22 6334715 77 13646 6315917 0.22 6329563 78 13982 6319671 0.22 6333653 79 13694 6317699 0.22 6331393 80 13479 6321376 0.21 6334855 81 13845 6328713 0.22 6342558 82 13701 6337828 0.22 6351529 83 13598 6330053 0.21 6343651 84 13779 6330574 0.22 6344353 85 13418 6325823 0.21 6339241 86 13630 6319224 0.22 6332854 87 13450 6313023 0.21 6326473 88 13602 6320824 0.21 6334426 89 13486 6322254 0.21 6335740 90 13433 6331284 0.21 6344717 91 13529 6329727 0.21 6343256 92 13494 6325480 0.21 6338974 93 13441 6334320 0.21 6347761 94 13517 6338113 0.21 6351630 95 13533 6334181 0.21 6347714 96 13711 6327329 0.22 6341040 97 13497 6323360 0.21 6336857 98 13623 6324221 0.21 6337844 99 13990 6328529 0.22 6342519 100 13775 6334179 0.22 6347954 101 13752 6328842 0.22 6342594 102 13501 6329193 0.21 6342694 103 13683 6330860 0.22 6344543 104 13611 6321822 0.21 6335433 105 13241 6318684 0.21 6331925 106 13437 6321830 0.21 6335267 107 13525 6303772 0.21 6317297 108 13318 6296923 0.21 6310241 109 13311 6303499 0.21 6316810 110 13375 6309410 0.21 6322785 111 13265 6309986 0.21 6323251 112 13465 6308950 0.21 6322415 113 13438 6309833 0.21 6323271 114 13517 6301290 0.21 6314807 115 13439 6300250 0.21 6313689 116 13353 6302308 0.21 6315661 117 13709 6296811 0.22 6310520 118 13776 6292764 0.22 6306540 119 13370 6283012 0.21 6296382 120 13635 6275307 0.22 6288942 121 13690 6278591 0.22 6292281 122 13682 6278554 0.22 6292236 123 13521 6277174 0.21 6290695 124 13444 6276170 0.21 6289614 125 13587 6271384 0.22 6284971 126 13533 6261965 0.22 6275498 127 13456 6252956 0.21 6266412 128 13605 6246634 0.22 6260239 129 13719 6242189 0.22 6255908 130 13424 6238898 0.21 6252322 131 13659 6232570 0.22 6246229 132 13421 6227038 0.22 6240459 133 13799 6224648 0.22 6238447 134 13663 6222636 0.22 6236299 135 13657 6219622 0.22 6233279 136 13444 6204670 0.22 6218114 137 13535 6196475 0.22 6210010 138 13277 6199595 0.21 6212872 139 13731 6196336 0.22 6210067 140 13512 6182133 0.22 6195645 141 13462 6172730 0.22 6186192 142 13613 6160224 0.22 6173837 143 13628 6157167 0.22 6170795 144 13868 6156561 0.22 6170429 145 14356 6163627 0.23 6177983 146 14700 6163556 0.24 6178256 147 15255 6147787 0.25 6163042 148 14868 6128638 0.24 6143506 149 14888 6073640 0.24 6088528 150 13167 5697236 0.23 5710403 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2433 1139322 0.21 1141755 2 30299 948486 3.10 978785 3 68832 840337 7.57 909169 4 67115 802812 7.72 869927 5 72183 869457 7.67 941640 6 81247 993261 7.56 1074508 7 87164 1013830 7.92 1100994 8 82110 881103 8.52 963213 9 83891 885538 8.65 969429 10 85112 882905 8.79 968017 11 85458 876182 8.89 961640 12 87318 882201 9.01 969519 13 89974 880952 9.27 970926 14 89923 879351 9.28 969274 15 91484 885428 9.36 976912 16 91818 880979 9.44 972797 17 92990 888293 9.48 981283 18 93440 887825 9.52 981265 19 93829 890418 9.53 984247 20 94855 891705 9.61 986560 21 95998 887735 9.76 983733 22 95890 885189 9.77 981079 23 96499 885163 9.83 981662 24 96044 878837 9.85 974881 25 96260 875346 9.91 971606 26 95844 879154 9.83 974998 27 96741 881049 9.89 977790 28 97337 882522 9.93 979859 29 97389 877151 9.99 974540 30 97913 882509 9.99 980422 31 97672 874802 10.04 972474 32 97920 872526 10.09 970446 33 98711 872683 10.16 971394 34 99086 868278 10.24 967364 35 98170 867602 10.16 965772 36 98450 864631 10.22 963081 37 98395 866178 10.20 964573 38 99084 866533 10.26 965617 39 99023 865246 10.27 964269 40 99187 864404 10.29 963591 41 99919 863156 10.37 963075 42 99875 861170 10.39 961045 43 100494 860552 10.46 961046 44 99279 853903 10.42 953182 45 99260 849501 10.46 948761 46 99570 848729 10.50 948299 47 99679 846531 10.53 946210 48 99924 851633 10.50 951557 49 99941 846807 10.56 946748 50 99512 844504 10.54 944016 51 100287 841449 10.65 941736 52 100422 838348 10.70 938770 53 100365 838558 10.69 938923 54 100589 835523 10.75 936112 55 99774 831720 10.71 931494 56 99722 830235 10.72 929957 57 99990 828023 10.77 928013 58 99957 825579 10.80 925536 59 100040 828187 10.78 928227 60 99389 822465 10.78 921854 61 99757 822158 10.82 921915 62 99670 818319 10.86 917989 63 99452 818311 10.84 917763 64 99565 816069 10.87 915634 65 99673 812371 10.93 912044 66 98978 808904 10.90 907882 67 99236 806513 10.96 905749 68 99040 805417 10.95 904457 69 98859 803353 10.96 902212 70 98393 801195 10.94 899588 71 98874 800690 10.99 899564 72 98209 796972 10.97 895181 73 98799 795158 11.05 893957 74 97931 790300 11.03 888231 75 98154 786898 11.09 885052 76 97717 783875 11.08 881592 77 97630 782973 11.09 880603 78 98408 780859 11.19 879267 79 97447 779604 11.11 877051 80 98119 778962 11.19 877081 81 96883 774082 11.12 870965 82 97629 771918 11.23 869547 83 96813 769857 11.17 866670 84 96302 767767 11.15 864069 85 96807 763827 11.25 860634 86 95909 761072 11.19 856981 87 95294 759451 11.15 854745 88 95774 757485 11.22 853259 89 95742 754282 11.26 850024 90 95576 752004 11.28 847580 91 94543 751352 11.18 845895 92 94691 747301 11.25 841992 93 94360 745286 11.24 839646 94 94609 740314 11.33 834923 95 94355 738237 11.33 832592 96 94024 737095 11.31 831119 97 93439 733186 11.30 826625 98 93151 729810 11.32 822961 99 93054 727961 11.33 821015 100 92517 726192 11.30 818709 101 92501 721371 11.37 813872 102 91910 718527 11.34 810437 103 91659 716564 11.34 808223 104 91329 712766 11.36 804095 105 90390 710559 11.29 800949 106 90336 706058 11.34 796394 107 90578 702510 11.42 793088 108 89930 699293 11.39 789223 109 89548 696814 11.39 786362 110 89068 693850 11.38 782918 111 88876 692838 11.37 781714 112 88511 689559 11.38 778070 113 88460 684796 11.44 773256 114 88357 683573 11.45 771930 115 88304 680997 11.48 769301 116 87249 675454 11.44 762703 117 86507 671794 11.41 758301 118 86979 669462 11.50 756441 119 85986 665836 11.44 751822 120 85885 664690 11.44 750575 121 85025 660627 11.40 745652 122 85485 657290 11.51 742775 123 84532 654025 11.45 738557 124 83942 650911 11.42 734853 125 83749 646855 11.46 730604 126 83552 643722 11.49 727274 127 83099 639158 11.51 722257 128 81578 636177 11.37 717755 129 81922 633813 11.45 715735 130 81379 629397 11.45 710776 131 81696 625828 11.55 707524 132 80366 622896 11.43 703262 133 80298 617351 11.51 697649 134 79653 614865 11.47 694518 135 78816 613032 11.39 691848 136 78783 608264 11.47 687047 137 78385 605735 11.46 684120 138 77963 600491 11.49 678454 139 76793 597288 11.39 674081 140 76708 593889 11.44 670597 141 76857 589959 11.53 666816 142 76540 586592 11.54 663132 143 74944 582544 11.40 657488 144 75101 579113 11.48 654214 145 74593 575421 11.48 650014 146 73929 570137 11.48 644066 147 72941 567079 11.40 640020 148 73025 556352 11.60 629377 149 70770 505709 12.28 576479 150 63224 0 100.00 63224 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1205 1435724 0.08 1436929 2 1710 1196058 0.14 1197768 3 6583 2714305 0.24 2720888 4 6815 1207251 0.56 1214066 5 2436 1145922 0.21 1148358 6 2582 1305102 0.20 1307684 7 3090 1523250 0.20 1526340 8 3049 1455651 0.21 1458700 9 3024 1333475 0.23 1336499 10 2904 1334959 0.22 1337863 11 2782 1331013 0.21 1333795 12 2745 1328294 0.21 1331039 13 2904 1332557 0.22 1335461 14 2883 1332140 0.22 1335023 15 2921 1344231 0.22 1347152 16 2853 1340824 0.21 1343677 17 3026 1331448 0.23 1334474 18 3081 1350700 0.23 1353781 19 2958 1346285 0.22 1349243 20 2867 1341531 0.21 1344398 21 3084 1350993 0.23 1354077 22 3005 1337286 0.22 1340291 23 3049 1339194 0.23 1342243 24 3019 1344899 0.22 1347918 25 3121 1338633 0.23 1341754 26 3158 1336062 0.24 1339220 27 3063 1341979 0.23 1345042 28 3075 1338446 0.23 1341521 29 3044 1334541 0.23 1337585 30 3106 1342217 0.23 1345323 31 3128 1338490 0.23 1341618 32 3060 1324466 0.23 1327526 33 3094 1331169 0.23 1334263 34 3179 1328147 0.24 1331326 35 3210 1328208 0.24 1331418 36 3079 1329852 0.23 1332931 37 3253 1321306 0.25 1324559 38 3130 1321080 0.24 1324210 39 3136 1324527 0.24 1327663 40 3226 1317428 0.24 1320654 41 3135 1317293 0.24 1320428 42 3203 1314675 0.24 1317878 43 3277 1312075 0.25 1315352 44 3144 1307723 0.24 1310867 45 3362 1312041 0.26 1315403 46 3150 1306862 0.24 1310012 47 3119 1300673 0.24 1303792 48 3186 1304391 0.24 1307577 49 3210 1299821 0.25 1303031 50 3121 1294602 0.24 1297723 51 3095 1295422 0.24 1298517 52 3238 1289464 0.25 1292702 53 3283 1284382 0.25 1287665 54 3239 1286341 0.25 1289580 55 3183 1285254 0.25 1288437 56 3281 1276467 0.26 1279748 57 3140 1279419 0.24 1282559 58 3146 1273549 0.25 1276695 59 3078 1269602 0.24 1272680 60 3090 1268126 0.24 1271216 61 3206 1266614 0.25 1269820 62 3205 1260858 0.25 1264063 63 3193 1259536 0.25 1262729 64 3067 1258043 0.24 1261110 65 3173 1248126 0.25 1251299 66 3174 1255972 0.25 1259146 67 3248 1250916 0.26 1254164 68 3205 1243801 0.26 1247006 69 3185 1246076 0.25 1249261 70 3244 1239508 0.26 1242752 71 3085 1234536 0.25 1237621 72 3055 1237179 0.25 1240234 73 3130 1228997 0.25 1232127 74 3084 1226512 0.25 1229596 75 3149 1221740 0.26 1224889 76 3067 1221605 0.25 1224672 77 3118 1217861 0.26 1220979 78 3128 1215323 0.26 1218451 79 3102 1209824 0.26 1212926 80 3028 1207020 0.25 1210048 81 3070 1203937 0.25 1207007 82 3045 1197206 0.25 1200251 83 3111 1191750 0.26 1194861 84 3094 1193280 0.26 1196374 85 3101 1188387 0.26 1191488 86 3059 1181140 0.26 1184199 87 2996 1183396 0.25 1186392 88 3095 1177085 0.26 1180180 89 3019 1171403 0.26 1174422 90 2934 1167624 0.25 1170558 91 2901 1162635 0.25 1165536 92 3003 1155953 0.26 1158956 93 2877 1159324 0.25 1162201 94 3023 1152767 0.26 1155790 95 2974 1145729 0.26 1148703 96 2831 1145704 0.25 1148535 97 2918 1141838 0.25 1144756 98 2896 1132434 0.26 1135330 99 2857 1133941 0.25 1136798 100 2918 1127022 0.26 1129940 101 3042 1120995 0.27 1124037 102 2862 1117597 0.26 1120459 103 2903 1114821 0.26 1117724 104 2848 1105934 0.26 1108782 105 2993 1106708 0.27 1109701 106 2808 1098471 0.25 1101279 107 2824 1094075 0.26 1096899 108 2821 1095175 0.26 1097996 109 2790 1086189 0.26 1088979 110 2930 1079170 0.27 1082100 111 2836 1076911 0.26 1079747 112 2861 1073827 0.27 1076688 113 2795 1064987 0.26 1067782 114 2730 1062888 0.26 1065618 115 2901 1059433 0.27 1062334 116 2706 1052115 0.26 1054821 117 2739 1047874 0.26 1050613 118 2847 1040709 0.27 1043556 119 2707 1037423 0.26 1040130 120 2769 1035042 0.27 1037811 121 2780 1028943 0.27 1031723 122 2763 1021033 0.27 1023796 123 2673 1019277 0.26 1021950 124 2672 1012839 0.26 1015511 125 2684 1006466 0.27 1009150 126 2635 1003404 0.26 1006039 127 2676 995911 0.27 998587 128 2639 985785 0.27 988424 129 2696 985999 0.27 988695 130 2654 980327 0.27 982981 131 2659 973412 0.27 976071 132 2704 969463 0.28 972167 133 2632 962284 0.27 964916 134 2622 955460 0.27 958082 135 2672 952253 0.28 954925 136 2698 945093 0.28 947791 137 2558 940751 0.27 943309 138 2713 936494 0.29 939207 139 2658 927760 0.29 930418 140 2680 920077 0.29 922757 141 2564 918478 0.28 921042 142 2490 911967 0.27 914457 143 2492 905631 0.27 908123 144 2567 900008 0.28 902575 145 2512 892208 0.28 894720 146 2576 882522 0.29 885098 147 2563 877886 0.29 880449 148 2520 865914 0.29 868434 149 2471 797997 0.31 800468 150 1763 0 100.00 1763 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 5519 6817103 0.08 6822622 2 7211 5354247 0.13 5361458 3 10448 7098967 0.15 7109415 4 11541 7158099 0.16 7169640 5 9667 6201987 0.16 6211654 6 9023 5715655 0.16 5724678 7 9497 5866106 0.16 5875603 8 9204 5749422 0.16 5758626 9 9406 5812364 0.16 5821770 10 9807 5833860 0.17 5843667 11 10187 5862753 0.17 5872940 12 10028 5893752 0.17 5903780 13 10473 5875775 0.18 5886248 14 10340 5862687 0.18 5873027 15 10295 5879376 0.17 5889671 16 10475 5881062 0.18 5891537 17 10608 5893712 0.18 5904320 18 10548 5875132 0.18 5885680 19 10871 5876298 0.18 5887169 20 10674 5856488 0.18 5867162 21 10530 5855621 0.18 5866151 22 10908 5830137 0.19 5841045 23 11103 5822868 0.19 5833971 24 11064 5816055 0.19 5827119 25 11234 5814757 0.19 5825991 26 11183 5802534 0.19 5813717 27 11202 5820378 0.19 5831580 28 11245 5821712 0.19 5832957 29 11308 5795823 0.19 5807131 30 11299 5795048 0.19 5806347 31 11494 5792289 0.20 5803783 32 11423 5753368 0.20 5764791 33 11339 5749574 0.20 5760913 34 11467 5731169 0.20 5742636 35 11385 5728812 0.20 5740197 36 11378 5736746 0.20 5748124 37 11436 5728312 0.20 5739748 38 11400 5726167 0.20 5737567 39 11566 5726019 0.20 5737585 40 11640 5713534 0.20 5725174 41 11662 5693696 0.20 5705358 42 11307 5683135 0.20 5694442 43 11713 5671713 0.21 5683426 44 11363 5648736 0.20 5660099 45 11523 5650056 0.20 5661579 46 11481 5640127 0.20 5651608 47 11819 5634462 0.21 5646281 48 11595 5639694 0.21 5651289 49 11631 5625844 0.21 5637475 50 11656 5613009 0.21 5624665 51 11407 5592973 0.20 5604380 52 11492 5582086 0.21 5593578 53 11620 5564942 0.21 5576562 54 11542 5554351 0.21 5565893 55 11489 5546323 0.21 5557812 56 11593 5533482 0.21 5545075 57 11495 5521088 0.21 5532583 58 11574 5520167 0.21 5531741 59 11489 5507726 0.21 5519215 60 11529 5488480 0.21 5500009 61 11459 5484827 0.21 5496286 62 11469 5464842 0.21 5476311 63 11422 5449355 0.21 5460777 64 11318 5438268 0.21 5449586 65 11227 5412034 0.21 5423261 66 11288 5405267 0.21 5416555 67 11479 5408560 0.21 5420039 68 11326 5383471 0.21 5394797 69 11418 5372435 0.21 5383853 70 11179 5354666 0.21 5365845 71 11526 5339487 0.22 5351013 72 11293 5333838 0.21 5345131 73 11148 5323744 0.21 5334892 74 11227 5295490 0.21 5306717 75 11053 5285670 0.21 5296723 76 11236 5270049 0.21 5281285 77 10879 5259835 0.21 5270714 78 11089 5247627 0.21 5258716 79 11284 5243412 0.21 5254696 80 11133 5223481 0.21 5234614 81 10931 5210204 0.21 5221135 82 10893 5195239 0.21 5206132 83 10706 5168974 0.21 5179680 84 10749 5150658 0.21 5161407 85 10687 5141085 0.21 5151772 86 10560 5125138 0.21 5135698 87 10672 5109882 0.21 5120554 88 10763 5100738 0.21 5111501 89 10699 5090502 0.21 5101201 90 10634 5075845 0.21 5086479 91 10581 5060131 0.21 5070712 92 10584 5035093 0.21 5045677 93 10581 5020518 0.21 5031099 94 10567 5005818 0.21 5016385 95 10393 4970000 0.21 4980393 96 10221 4954819 0.21 4965040 97 10409 4941426 0.21 4951835 98 10252 4918773 0.21 4929025 99 10211 4913667 0.21 4923878 100 10423 4897807 0.21 4908230 101 10132 4869167 0.21 4879299 102 10240 4859946 0.21 4870186 103 10088 4837657 0.21 4847745 104 10246 4820027 0.21 4830273 105 10147 4799757 0.21 4809904 106 9888 4769967 0.21 4779855 107 9854 4750208 0.21 4760062 108 9894 4733241 0.21 4743135 109 9926 4724721 0.21 4734647 110 10039 4704789 0.21 4714828 111 10042 4688868 0.21 4698910 112 9595 4670166 0.21 4679761 113 9909 4652037 0.21 4661946 114 9759 4623546 0.21 4633305 115 9839 4600669 0.21 4610508 116 9688 4576100 0.21 4585788 117 9618 4557248 0.21 4566866 118 9675 4527958 0.21 4537633 119 9527 4509950 0.21 4519477 120 9464 4494527 0.21 4503991 121 9451 4478022 0.21 4487473 122 9430 4453955 0.21 4463385 123 9588 4440254 0.22 4449842 124 9453 4407142 0.21 4416595 125 9460 4382994 0.22 4392454 126 9400 4359308 0.22 4368708 127 9251 4335519 0.21 4344770 128 9428 4306871 0.22 4316299 129 9256 4290489 0.22 4299745 130 9379 4271346 0.22 4280725 131 9258 4248543 0.22 4257801 132 9355 4227322 0.22 4236677 133 9326 4199225 0.22 4208551 134 9440 4178620 0.23 4188060 135 9197 4153956 0.22 4163153 136 9404 4128829 0.23 4138233 137 9354 4099167 0.23 4108521 138 9241 4078739 0.23 4087980 139 9194 4050365 0.23 4059559 140 9413 4024106 0.23 4033519 141 9246 4003549 0.23 4012795 142 9134 3982400 0.23 3991534 143 9335 3954924 0.24 3964259 144 9358 3928185 0.24 3937543 145 9211 3901216 0.24 3910427 146 9335 3868675 0.24 3878010 147 9653 3832381 0.25 3842034 148 9412 3783933 0.25 3793345 149 9038 3490672 0.26 3499710 150 6499 0 100.00 6499