CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 82690 546740 13.14 629430 2 110193 710163 13.43 820356 3 87522 658504 11.73 746026 4 89590 691131 11.48 780721 5 106381 793829 11.82 900210 6 109873 799336 12.08 909209 7 101486 712766 12.46 814252 8 101531 721202 12.34 822733 9 100403 717699 12.27 818102 10 100220 714055 12.31 814275 11 100901 719118 12.30 820019 12 102904 718746 12.52 821650 13 101203 714455 12.41 815658 14 102852 721685 12.47 824537 15 103035 722771 12.48 825806 16 102610 727528 12.36 830138 17 103157 731642 12.36 834799 18 103992 736688 12.37 840680 19 104000 735614 12.39 839614 20 104795 736190 12.46 840985 21 104240 733326 12.45 837566 22 104555 728827 12.55 833382 23 103951 727798 12.50 831749 24 105009 728675 12.60 833684 25 103461 731468 12.39 834929 26 104909 736569 12.47 841478 27 105128 739342 12.45 844470 28 104351 736566 12.41 840917 29 104938 742435 12.38 847373 30 104840 737989 12.44 842829 31 104104 733695 12.43 837799 32 105284 736456 12.51 841740 33 104291 733290 12.45 837581 34 104742 730742 12.54 835484 35 103634 734514 12.36 838148 36 104834 736232 12.46 841066 37 104715 737441 12.43 842156 38 104972 740415 12.42 845387 39 104891 742519 12.38 847410 40 104513 740060 12.37 844573 41 105498 739849 12.48 845347 42 105210 741536 12.43 846746 43 104943 734990 12.49 839933 44 104489 734631 12.45 839120 45 105265 734707 12.53 839972 46 104666 736415 12.44 841081 47 104883 743077 12.37 847960 48 104914 741229 12.40 846143 49 104799 738658 12.42 843457 50 104176 738068 12.37 842244 51 104814 738346 12.43 843160 52 104541 736761 12.43 841302 53 103957 738721 12.34 842678 54 105141 735297 12.51 840438 55 104368 732315 12.47 836683 56 104529 734986 12.45 839515 57 104503 738255 12.40 842758 58 104482 735184 12.44 839666 59 104466 735939 12.43 840405 60 104304 736307 12.41 840611 61 103954 735868 12.38 839822 62 104393 737790 12.40 842183 63 104401 738570 12.38 842971 64 103757 736143 12.35 839900 65 103668 735610 12.35 839278 66 104282 734612 12.43 838894 67 103775 734641 12.38 838416 68 103632 733988 12.37 837620 69 104081 734143 12.42 838224 70 103869 734651 12.39 838520 71 104172 735971 12.40 840143 72 102673 736341 12.24 839014 73 103483 733552 12.36 837035 74 104006 733301 12.42 837307 75 103571 732389 12.39 835960 76 103919 731797 12.43 835716 77 102969 735114 12.29 838083 78 104136 735746 12.40 839882 79 103668 734557 12.37 838225 80 103367 733828 12.35 837195 81 103825 734219 12.39 838044 82 103372 734569 12.34 837941 83 103645 733415 12.38 837060 84 102860 735031 12.28 837891 85 102561 731254 12.30 833815 86 102702 732525 12.30 835227 87 102431 733633 12.25 836064 88 101956 731076 12.24 833032 89 103357 732873 12.36 836230 90 102741 733700 12.28 836441 91 102553 732893 12.28 835446 92 102519 733882 12.26 836401 93 102852 732302 12.32 835154 94 102452 733527 12.26 835979 95 102062 731591 12.24 833653 96 102459 729523 12.32 831982 97 102433 730648 12.30 833081 98 101832 733175 12.20 835007 99 101850 731563 12.22 833413 100 101100 730368 12.16 831468 101 101421 732170 12.17 833591 102 100871 730731 12.13 831602 103 100631 730116 12.11 830747 104 100973 729671 12.16 830644 105 100804 730222 12.13 831026 106 101353 726887 12.24 828240 107 100376 727329 12.13 827705 108 100952 728103 12.18 829055 109 100424 728120 12.12 828544 110 100307 729879 12.08 830186 111 100714 729238 12.13 829952 112 100516 727399 12.14 827915 113 100753 729647 12.13 830400 114 100523 727543 12.14 828066 115 100292 725966 12.14 826258 116 99392 725444 12.05 824836 117 99235 726617 12.02 825852 118 99392 726088 12.04 825480 119 99215 727216 12.01 826431 120 98979 727494 11.98 826473 121 99530 726354 12.05 825884 122 99321 726690 12.02 826011 123 98803 726798 11.97 825601 124 98293 724153 11.95 822446 125 98748 725500 11.98 824248 126 98708 723938 12.00 822646 127 98371 721709 12.00 820080 128 97763 722705 11.92 820468 129 97566 721555 11.91 819121 130 97512 721288 11.91 818800 131 97201 721658 11.87 818859 132 97503 720486 11.92 817989 133 97207 719309 11.91 816516 134 97266 721901 11.87 819167 135 96005 719820 11.77 815825 136 96446 720421 11.81 816867 137 95962 719919 11.76 815881 138 96321 719635 11.80 815956 139 96438 715656 11.88 812094 140 95303 715144 11.76 810447 141 95300 717232 11.73 812532 142 95085 714970 11.74 810055 143 95268 715508 11.75 810776 144 94002 716073 11.60 810075 145 93977 713463 11.64 807440 146 95460 715464 11.77 810924 147 93365 714205 11.56 807570 148 92979 711971 11.55 804950 149 90805 713155 11.29 803960 150 83161 667395 11.08 750556 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2479 2019944 0.12 2022423 2 2864 1035469 0.28 1038333 3 1963 958121 0.20 960084 4 2046 1115104 0.18 1117150 5 2537 1290886 0.20 1293423 6 2606 1218183 0.21 1220789 7 2394 1140955 0.21 1143349 8 2510 1144182 0.22 1146692 9 2555 1139216 0.22 1141771 10 2548 1137320 0.22 1139868 11 2557 1146163 0.22 1148720 12 2644 1139430 0.23 1142074 13 2617 1144776 0.23 1147393 14 2793 1145206 0.24 1147999 15 2782 1138473 0.24 1141255 16 2948 1151814 0.26 1154762 17 2845 1158146 0.25 1160991 18 2830 1149191 0.25 1152021 19 2795 1161275 0.24 1164070 20 2893 1152334 0.25 1155227 21 2917 1155486 0.25 1158403 22 2908 1160150 0.25 1163058 23 2912 1155317 0.25 1158229 24 2978 1155065 0.26 1158043 25 2973 1159633 0.26 1162606 26 3027 1161660 0.26 1164687 27 2969 1161431 0.25 1164400 28 2967 1171389 0.25 1174356 29 3074 1164429 0.26 1167503 30 2984 1161456 0.26 1164440 31 2939 1165469 0.25 1168408 32 3090 1161628 0.27 1164718 33 2995 1163190 0.26 1166185 34 3044 1163225 0.26 1166269 35 3058 1160622 0.26 1163680 36 3076 1165206 0.26 1168282 37 3132 1168721 0.27 1171853 38 3064 1164644 0.26 1167708 39 3065 1167396 0.26 1170461 40 3099 1168596 0.26 1171695 41 3081 1169672 0.26 1172753 42 3119 1165568 0.27 1168687 43 3088 1169459 0.26 1172547 44 3159 1163303 0.27 1166462 45 3058 1163636 0.26 1166694 46 3173 1171138 0.27 1174311 47 3231 1166026 0.28 1169257 48 3136 1166984 0.27 1170120 49 2892 1166941 0.25 1169833 50 3096 1165803 0.26 1168899 51 3045 1164363 0.26 1167408 52 3108 1168048 0.27 1171156 53 3100 1168167 0.26 1171267 54 3015 1160709 0.26 1163724 55 3042 1166513 0.26 1169555 56 3098 1169343 0.26 1172441 57 3050 1163663 0.26 1166713 58 3227 1162970 0.28 1166197 59 3214 1166186 0.27 1169400 60 3098 1161873 0.27 1164971 61 2985 1169807 0.25 1172792 62 3194 1169483 0.27 1172677 63 3121 1164577 0.27 1167698 64 3075 1169865 0.26 1172940 65 3164 1166249 0.27 1169413 66 3167 1163185 0.27 1166352 67 3266 1168491 0.28 1171757 68 3191 1163566 0.27 1166757 69 3340 1161701 0.29 1165041 70 3064 1167240 0.26 1170304 71 3150 1167455 0.27 1170605 72 3144 1163791 0.27 1166935 73 3312 1167163 0.28 1170475 74 3306 1168920 0.28 1172226 75 3249 1168045 0.28 1171294 76 3156 1168111 0.27 1171267 77 3309 1166410 0.28 1169719 78 3141 1164572 0.27 1167713 79 3127 1167652 0.27 1170779 80 3134 1164929 0.27 1168063 81 3189 1162389 0.27 1165578 82 3161 1165028 0.27 1168189 83 3256 1168689 0.28 1171945 84 3254 1165166 0.28 1168420 85 3145 1168471 0.27 1171616 86 3199 1165035 0.27 1168234 87 3181 1160440 0.27 1163621 88 3185 1164797 0.27 1167982 89 3277 1163428 0.28 1166705 90 3345 1159677 0.29 1163022 91 3163 1166872 0.27 1170035 92 3238 1164872 0.28 1168110 93 3203 1162154 0.27 1165357 94 3169 1165134 0.27 1168303 95 3327 1163715 0.29 1167042 96 3200 1159627 0.28 1162827 97 3202 1162492 0.27 1165694 98 3289 1162218 0.28 1165507 99 3277 1160164 0.28 1163441 100 3263 1161788 0.28 1165051 101 3243 1159848 0.28 1163091 102 3191 1156433 0.28 1159624 103 3156 1163049 0.27 1166205 104 3126 1158961 0.27 1162087 105 3341 1156935 0.29 1160276 106 3128 1161851 0.27 1164979 107 3096 1159338 0.27 1162434 108 3186 1155670 0.27 1158856 109 3176 1157321 0.27 1160497 110 3168 1156936 0.27 1160104 111 3231 1154618 0.28 1157849 112 3170 1157394 0.27 1160564 113 3174 1158050 0.27 1161224 114 3147 1154083 0.27 1157230 115 3102 1157095 0.27 1160197 116 3050 1152788 0.26 1155838 117 3200 1152228 0.28 1155428 118 3149 1156207 0.27 1159356 119 3130 1156839 0.27 1159969 120 3086 1150867 0.27 1153953 121 3135 1152206 0.27 1155341 122 3078 1150388 0.27 1153466 123 3181 1147904 0.28 1151085 124 3126 1151878 0.27 1155004 125 3088 1149073 0.27 1152161 126 3152 1143726 0.27 1146878 127 3121 1148616 0.27 1151737 128 3194 1145434 0.28 1148628 129 3093 1142772 0.27 1145865 130 3122 1144629 0.27 1147751 131 3174 1143802 0.28 1146976 132 3121 1139911 0.27 1143032 133 3088 1142717 0.27 1145805 134 2948 1141999 0.26 1144947 135 3085 1138884 0.27 1141969 136 3101 1141492 0.27 1144593 137 3127 1138870 0.27 1141997 138 3194 1135785 0.28 1138979 139 3152 1135494 0.28 1138646 140 3109 1135551 0.27 1138660 141 3075 1131940 0.27 1135015 142 3158 1134031 0.28 1137189 143 3146 1129696 0.28 1132842 144 3220 1128258 0.28 1131478 145 3233 1134475 0.28 1137708 146 3363 1129989 0.30 1133352 147 3402 1126540 0.30 1129942 148 3404 1125062 0.30 1128466 149 3187 1119751 0.28 1122938 150 3089 1040760 0.30 1043849 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 6800 4908307 0.14 4915107 2 7606 3865656 0.20 3873262 3 7127 4142591 0.17 4149718 4 7472 4967384 0.15 4974856 5 8780 5584286 0.16 5593066 6 8915 5564063 0.16 5572978 7 8422 5134592 0.16 5143014 8 8414 5070548 0.17 5078962 9 8471 4975992 0.17 4984463 10 8392 4934570 0.17 4942962 11 8446 4940837 0.17 4949283 12 8707 4935209 0.18 4943916 13 8691 4916235 0.18 4924926 14 9201 4925979 0.19 4935180 15 9411 4925384 0.19 4934795 16 9289 4971974 0.19 4981263 17 9384 4987133 0.19 4996517 18 9656 5009853 0.19 5019509 19 9512 5006506 0.19 5016018 20 9762 4996750 0.19 5006512 21 9667 4993772 0.19 5003439 22 9730 4982684 0.19 4992414 23 9641 4971230 0.19 4980871 24 9889 4974483 0.20 4984372 25 9923 4983174 0.20 4993097 26 9856 4989787 0.20 4999643 27 10151 5013055 0.20 5023206 28 10356 5028904 0.21 5039260 29 10107 5031278 0.20 5041385 30 10324 5034121 0.20 5044445 31 10233 5030686 0.20 5040919 32 10528 5010957 0.21 5021485 33 10284 5011011 0.20 5021295 34 10276 5001888 0.21 5012164 35 10361 4997384 0.21 5007745 36 10434 5007526 0.21 5017960 37 10305 5009741 0.21 5020046 38 10600 5022423 0.21 5033023 39 10324 5036041 0.20 5046365 40 10475 5031950 0.21 5042425 41 10487 5026920 0.21 5037407 42 10508 5032758 0.21 5043266 43 10458 5020723 0.21 5031181 44 10448 5006929 0.21 5017377 45 10329 5006956 0.21 5017285 46 10358 5010133 0.21 5020491 47 10503 5017243 0.21 5027746 48 10562 5020614 0.21 5031176 49 10497 5028527 0.21 5039024 50 10774 5036036 0.21 5046810 51 10710 5035579 0.21 5046289 52 10789 5036462 0.21 5047251 53 10827 5036717 0.21 5047544 54 10720 5035350 0.21 5046070 55 10601 5026039 0.21 5036640 56 10882 5023842 0.22 5034724 57 10739 5018068 0.21 5028807 58 10762 5021348 0.21 5032110 59 10681 5018538 0.21 5029219 60 10739 5032496 0.21 5043235 61 10767 5031017 0.21 5041784 62 10825 5038476 0.21 5049301 63 10835 5040254 0.21 5051089 64 10714 5042053 0.21 5052767 65 10932 5040767 0.22 5051699 66 10663 5043886 0.21 5054549 67 10726 5040232 0.21 5050958 68 10842 5037801 0.21 5048643 69 10666 5030555 0.21 5041221 70 10854 5048550 0.21 5059404 71 10985 5047797 0.22 5058782 72 11056 5047525 0.22 5058581 73 10951 5040845 0.22 5051796 74 11015 5037415 0.22 5048430 75 10779 5038170 0.21 5048949 76 10862 5040090 0.22 5050952 77 10870 5041987 0.22 5052857 78 11128 5040918 0.22 5052046 79 10893 5034421 0.22 5045314 80 10924 5038780 0.22 5049704 81 10772 5045316 0.21 5056088 82 10984 5044503 0.22 5055487 83 10886 5046514 0.22 5057400 84 10929 5048373 0.22 5059302 85 10667 5043376 0.21 5054043 86 10752 5034550 0.21 5045302 87 10780 5032400 0.21 5043180 88 10949 5030094 0.22 5041043 89 10847 5042693 0.21 5053540 90 10866 5044594 0.21 5055460 91 10734 5045316 0.21 5056050 92 10918 5043220 0.22 5054138 93 11015 5046346 0.22 5057361 94 11150 5053747 0.22 5064897 95 10868 5047692 0.21 5058560 96 11017 5037726 0.22 5048743 97 10727 5038335 0.21 5049062 98 10979 5039807 0.22 5050786 99 11121 5041786 0.22 5052907 100 11160 5047465 0.22 5058625 101 10897 5049514 0.22 5060411 102 10822 5046986 0.21 5057808 103 10943 5048224 0.22 5059167 104 10866 5045038 0.21 5055904 105 11094 5043777 0.22 5054871 106 10899 5041072 0.22 5051971 107 10744 5030548 0.21 5041292 108 10729 5027082 0.21 5037811 109 10900 5029969 0.22 5040869 110 10814 5031749 0.21 5042563 111 10846 5040880 0.21 5051726 112 11084 5034609 0.22 5045693 113 10853 5038999 0.21 5049852 114 10884 5029239 0.22 5040123 115 10738 5023914 0.21 5034652 116 10864 5027188 0.22 5038052 117 10982 5022809 0.22 5033791 118 10875 5021472 0.22 5032347 119 10959 5014365 0.22 5025324 120 11128 5006836 0.22 5017964 121 11040 5010816 0.22 5021856 122 10909 5020275 0.22 5031184 123 10699 5015998 0.21 5026697 124 10963 5020018 0.22 5030981 125 10870 5009475 0.22 5020345 126 10943 5007349 0.22 5018292 127 10898 5003112 0.22 5014010 128 11141 4989986 0.22 5001127 129 10845 4993611 0.22 5004456 130 10868 4988476 0.22 4999344 131 10670 4983064 0.21 4993734 132 10756 4976305 0.22 4987061 133 10767 4978454 0.22 4989221 134 10997 4979819 0.22 4990816 135 10937 4970632 0.22 4981569 136 10899 4967556 0.22 4978455 137 10993 4963607 0.22 4974600 138 10949 4962308 0.22 4973257 139 10957 4958119 0.22 4969076 140 10963 4950906 0.22 4961869 141 11001 4942853 0.22 4953854 142 11050 4941003 0.22 4952053 143 10949 4933356 0.22 4944305 144 11036 4933098 0.22 4944134 145 11214 4936520 0.23 4947734 146 11904 4946765 0.24 4958669 147 11672 4935426 0.24 4947098 148 11721 4927606 0.24 4939327 149 11414 4881016 0.23 4892430 150 10961 4649661 0.24 4660622 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2194 936345 0.23 938539 2 32834 769167 4.09 802001 3 62033 703063 8.11 765096 4 58036 651343 8.18 709379 5 61469 692240 8.16 753709 6 71090 794640 8.21 865730 7 75400 798657 8.63 874057 8 71036 709543 9.10 780579 9 72558 715829 9.20 788387 10 73397 712108 9.34 785505 11 73432 704878 9.43 778310 12 74893 709258 9.55 784151 13 76650 707149 9.78 783799 14 76094 702197 9.78 778291 15 77399 710532 9.82 787931 16 77879 708366 9.91 786245 17 79292 713429 10.00 792721 18 79350 715599 9.98 794949 19 80254 719134 10.04 799388 20 80382 717426 10.08 797808 21 80888 715410 10.16 796298 22 81517 709679 10.30 791196 23 81752 709661 10.33 791413 24 81932 705430 10.41 787362 25 81823 703061 10.42 784884 26 82282 707092 10.42 789374 27 82108 711563 10.35 793671 28 82583 711023 10.41 793606 29 82192 707900 10.40 790092 30 83124 711622 10.46 794746 31 83129 704893 10.55 788022 32 82836 700317 10.58 783153 33 82929 700049 10.59 782978 34 82963 697724 10.63 780687 35 83227 694612 10.70 777839 36 82505 696051 10.60 778556 37 83720 696245 10.73 779965 38 83902 697089 10.74 780991 39 83340 697548 10.67 780888 40 84161 695210 10.80 779371 41 83957 695067 10.78 779024 42 84768 693411 10.89 778179 43 84490 691737 10.88 776227 44 84186 687346 10.91 771532 45 83512 682614 10.90 766126 46 84555 682883 11.02 767438 47 84131 683379 10.96 767510 48 84131 686303 10.92 770434 49 84728 683087 11.03 767815 50 83653 680743 10.94 764396 51 83920 678669 11.00 762589 52 83864 676657 11.03 760521 53 84598 673898 11.15 758496 54 84372 675511 11.10 759883 55 84372 670193 11.18 754565 56 83518 668596 11.10 752114 57 83797 668808 11.13 752605 58 83654 666222 11.16 749876 59 83518 666619 11.13 750137 60 83975 662310 11.25 746285 61 83772 663799 11.21 747571 62 83870 660081 11.27 743951 63 83919 661759 11.25 745678 64 84166 659053 11.32 743219 65 83422 655830 11.28 739252 66 83249 653722 11.30 736971 67 83723 652414 11.37 736137 68 82848 650213 11.30 733061 69 83700 648160 11.44 731860 70 83127 647497 11.38 730624 71 83638 646177 11.46 729815 72 83241 644874 11.43 728115 73 82927 643181 11.42 726108 74 82991 640810 11.47 723801 75 83176 638679 11.52 721855 76 82795 635032 11.53 717827 77 82242 634204 11.48 716446 78 82183 633808 11.48 715991 79 82881 633123 11.58 716004 80 81621 629531 11.48 711152 81 81572 626511 11.52 708083 82 81724 626524 11.54 708248 83 81936 625150 11.59 707086 84 81488 622029 11.58 703517 85 81776 618924 11.67 700700 86 80750 616090 11.59 696840 87 81459 615779 11.68 697238 88 81262 612929 11.71 694191 89 80961 612178 11.68 693139 90 80208 611710 11.59 691918 91 79801 608578 11.59 688379 92 80219 609905 11.62 690124 93 79885 606413 11.64 686298 94 80397 603353 11.76 683750 95 80138 602000 11.75 682138 96 79739 599178 11.75 678917 97 79758 596746 11.79 676504 98 79063 596030 11.71 675093 99 79282 594745 11.76 674027 100 78467 592749 11.69 671216 101 78217 589527 11.71 667744 102 78096 586556 11.75 664652 103 78060 585019 11.77 663079 104 77544 582796 11.74 660340 105 77351 582007 11.73 659358 106 77245 579121 11.77 656366 107 77166 575634 11.82 652800 108 76510 572506 11.79 649016 109 76154 572418 11.74 648572 110 76107 569999 11.78 646106 111 76205 569292 11.81 645497 112 75936 565496 11.84 641432 113 75774 564656 11.83 640430 114 75091 562298 11.78 637389 115 75456 559130 11.89 634586 116 74790 557086 11.84 631876 117 74213 554026 11.81 628239 118 73928 552821 11.80 626749 119 73775 551002 11.81 624777 120 73239 547883 11.79 621122 121 73561 547354 11.85 620915 122 72636 544019 11.78 616655 123 72572 542117 11.81 614689 124 72282 539596 11.81 611878 125 72339 536952 11.87 609291 126 71877 533513 11.87 605390 127 71253 529135 11.87 600388 128 71372 526747 11.93 598119 129 70713 527624 11.82 598337 130 70013 522593 11.81 592606 131 70086 520010 11.88 590096 132 69780 518491 11.86 588271 133 69507 515568 11.88 585075 134 69739 513685 11.95 583424 135 69024 512529 11.87 581553 136 68648 507836 11.91 576484 137 68244 504758 11.91 573002 138 68191 502525 11.95 570716 139 67763 500728 11.92 568491 140 68078 498334 12.02 566412 141 66954 494878 11.92 561832 142 65874 490793 11.83 556667 143 66335 490401 11.91 556736 144 65648 486113 11.90 551761 145 64929 482818 11.85 547747 146 64708 479733 11.89 544441 147 64090 476383 11.86 540473 148 63833 467247 12.02 531080 149 62497 426424 12.78 488921 150 55835 0 100.00 55835 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 942 1108324 0.08 1109266 2 1485 990411 0.15 991896 3 4739 2213966 0.21 2218705 4 4765 1038311 0.46 1043076 5 1916 938627 0.20 940543 6 2156 1059788 0.20 1061944 7 2555 1222919 0.21 1225474 8 2384 1161996 0.20 1164380 9 2325 1086723 0.21 1089048 10 2285 1087559 0.21 1089844 11 2318 1081171 0.21 1083489 12 2277 1081348 0.21 1083625 13 2257 1083121 0.21 1085378 14 2416 1079391 0.22 1081807 15 2346 1087659 0.22 1090005 16 2288 1088396 0.21 1090684 17 2429 1078950 0.22 1081379 18 2407 1094655 0.22 1097062 19 2398 1093665 0.22 1096063 20 2375 1086097 0.22 1088472 21 2421 1095372 0.22 1097793 22 2477 1087796 0.23 1090273 23 2398 1088050 0.22 1090448 24 2373 1093475 0.22 1095848 25 2547 1087331 0.23 1089878 26 2508 1083447 0.23 1085955 27 2498 1092823 0.23 1095321 28 2492 1087265 0.23 1089757 29 2504 1082009 0.23 1084513 30 2507 1092196 0.23 1094703 31 2513 1084877 0.23 1087390 32 2529 1076607 0.23 1079136 33 2570 1081751 0.24 1084321 34 2619 1078127 0.24 1080746 35 2613 1075359 0.24 1077972 36 2521 1077185 0.23 1079706 37 2512 1071975 0.23 1074487 38 2533 1070844 0.24 1073377 39 2551 1077848 0.24 1080399 40 2556 1070787 0.24 1073343 41 2618 1069627 0.24 1072245 42 2632 1070424 0.25 1073056 43 2505 1067300 0.23 1069805 44 2538 1061622 0.24 1064160 45 2648 1066783 0.25 1069431 46 2642 1059185 0.25 1061827 47 2477 1056422 0.23 1058899 48 2623 1061724 0.25 1064347 49 2627 1056583 0.25 1059210 50 2549 1051095 0.24 1053644 51 2607 1052553 0.25 1055160 52 2628 1047086 0.25 1049714 53 2712 1045467 0.26 1048179 54 2446 1044439 0.23 1046885 55 2572 1046449 0.25 1049021 56 2432 1038798 0.23 1041230 57 2480 1041863 0.24 1044343 58 2554 1038689 0.25 1041243 59 2499 1033533 0.24 1036032 60 2614 1031621 0.25 1034235 61 2614 1030399 0.25 1033013 62 2634 1025969 0.26 1028603 63 2556 1028924 0.25 1031480 64 2599 1025173 0.25 1027772 65 2464 1018839 0.24 1021303 66 2642 1024822 0.26 1027464 67 2573 1022520 0.25 1025093 68 2563 1014135 0.25 1016698 69 2549 1015842 0.25 1018391 70 2644 1008850 0.26 1011494 71 2536 1005613 0.25 1008149 72 2600 1007969 0.26 1010569 73 2554 1003369 0.25 1005923 74 2644 999163 0.26 1001807 75 2563 997216 0.26 999779 76 2557 996133 0.26 998690 77 2596 993959 0.26 996555 78 2610 990768 0.26 993378 79 2535 989802 0.26 992337 80 2533 987000 0.26 989533 81 2630 986155 0.27 988785 82 2530 979370 0.26 981900 83 2594 975927 0.27 978521 84 2492 976683 0.25 979175 85 2590 973818 0.27 976408 86 2592 966679 0.27 969271 87 2544 968532 0.26 971076 88 2602 964858 0.27 967460 89 2513 959594 0.26 962107 90 2498 958271 0.26 960769 91 2513 955012 0.26 957525 92 2502 949086 0.26 951588 93 2462 951954 0.26 954416 94 2468 945209 0.26 947677 95 2543 941846 0.27 944389 96 2404 940947 0.25 943351 97 2377 936105 0.25 938482 98 2474 931427 0.26 933901 99 2425 934766 0.26 937191 100 2387 928992 0.26 931379 101 2326 923472 0.25 925798 102 2416 923960 0.26 926376 103 2406 918564 0.26 920970 104 2417 910455 0.26 912872 105 2368 914584 0.26 916952 106 2386 906958 0.26 909344 107 2387 904281 0.26 906668 108 2301 904712 0.25 907013 109 2285 900672 0.25 902957 110 2330 893528 0.26 895858 111 2338 893980 0.26 896318 112 2438 889030 0.27 891468 113 2397 884421 0.27 886818 114 2328 882110 0.26 884438 115 2388 878331 0.27 880719 116 2264 873920 0.26 876184 117 2278 871071 0.26 873349 118 2303 865216 0.27 867519 119 2349 862165 0.27 864514 120 2323 862446 0.27 864769 121 2262 856914 0.26 859176 122 2204 850304 0.26 852508 123 2269 849975 0.27 852244 124 2227 844143 0.26 846370 125 2298 838793 0.27 841091 126 2184 837095 0.26 839279 127 2293 832105 0.27 834398 128 2298 824770 0.28 827068 129 2208 826006 0.27 828214 130 2089 819846 0.25 821935 131 2173 814718 0.27 816891 132 2210 811384 0.27 813594 133 2252 808052 0.28 810304 134 2208 800936 0.27 803144 135 2176 801908 0.27 804084 136 2230 795224 0.28 797454 137 2206 788715 0.28 790921 138 2200 787518 0.28 789718 139 2189 782533 0.28 784722 140 2171 777647 0.28 779818 141 2178 776396 0.28 778574 142 2140 768318 0.28 770458 143 2061 763019 0.27 765080 144 2182 759379 0.29 761561 145 2197 753771 0.29 755968 146 2165 748786 0.29 750951 147 2139 744985 0.29 747124 148 2126 733214 0.29 735340 149 1992 681837 0.29 683829 150 1546 0 100.00 1546 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4336 5240761 0.08 5245097 2 5534 4099276 0.13 4104810 3 8238 5675023 0.14 5683261 4 9028 5733960 0.16 5742988 5 7708 5012827 0.15 5020535 6 7493 4659642 0.16 4667135 7 7773 4723207 0.16 4730980 8 7582 4636975 0.16 4644557 9 7805 4698580 0.17 4706385 10 7700 4705896 0.16 4713596 11 7995 4721425 0.17 4729420 12 8127 4752893 0.17 4761020 13 8313 4738562 0.18 4746875 14 8268 4728588 0.17 4736856 15 8341 4749013 0.18 4757354 16 8214 4764128 0.17 4772342 17 8322 4778582 0.17 4786904 18 8675 4766345 0.18 4775020 19 8834 4758180 0.19 4767014 20 8755 4734392 0.18 4743147 21 8856 4732803 0.19 4741659 22 8860 4704240 0.19 4713100 23 8872 4695498 0.19 4704370 24 8961 4700320 0.19 4709281 25 9126 4709380 0.19 4718506 26 9131 4710392 0.19 4719523 27 9059 4724652 0.19 4733711 28 9386 4717706 0.20 4727092 29 9077 4696238 0.19 4705315 30 9206 4692938 0.20 4702144 31 8961 4678665 0.19 4687626 32 9163 4653829 0.20 4662992 33 9120 4653110 0.20 4662230 34 9124 4638248 0.20 4647372 35 9110 4638474 0.20 4647584 36 9425 4650655 0.20 4660080 37 9120 4647683 0.20 4656803 38 9288 4650744 0.20 4660032 39 9222 4644633 0.20 4653855 40 9633 4632094 0.21 4641727 41 9253 4617994 0.20 4627247 42 9453 4606283 0.20 4615736 43 9378 4595585 0.20 4604963 44 9396 4572370 0.21 4581766 45 9324 4579920 0.20 4589244 46 9475 4574698 0.21 4584173 47 9434 4574383 0.21 4583817 48 9432 4586307 0.21 4595739 49 9431 4575232 0.21 4584663 50 9381 4560809 0.21 4570190 51 9570 4548972 0.21 4558542 52 9413 4534974 0.21 4544387 53 9458 4520660 0.21 4530118 54 9401 4513119 0.21 4522520 55 9318 4508677 0.21 4517995 56 9582 4501250 0.21 4510832 57 9300 4498937 0.21 4508237 58 9404 4500344 0.21 4509748 59 9542 4481698 0.21 4491240 60 9363 4476990 0.21 4486353 61 9241 4467839 0.21 4477080 62 9514 4448228 0.21 4457742 63 9337 4443631 0.21 4452968 64 9259 4433991 0.21 4443250 65 9303 4417354 0.21 4426657 66 9445 4414809 0.21 4424254 67 9425 4416863 0.21 4426288 68 9431 4392464 0.21 4401895 69 9450 4388573 0.21 4398023 70 9261 4377101 0.21 4386362 71 9185 4362805 0.21 4371990 72 9356 4360234 0.21 4369590 73 9309 4351904 0.21 4361213 74 9093 4326350 0.21 4335443 75 9261 4321916 0.21 4331177 76 9226 4313804 0.21 4323030 77 9327 4303961 0.22 4313288 78 9191 4298794 0.21 4307985 79 9271 4294660 0.22 4303931 80 9142 4282527 0.21 4291669 81 9233 4276811 0.22 4286044 82 9151 4262034 0.21 4271185 83 9169 4240601 0.22 4249770 84 8900 4231531 0.21 4240431 85 8877 4222234 0.21 4231111 86 8999 4210588 0.21 4219587 87 9112 4203183 0.22 4212295 88 8931 4195951 0.21 4204882 89 8928 4187399 0.21 4196327 90 8837 4178012 0.21 4186849 91 8765 4162879 0.21 4171644 92 8907 4147767 0.21 4156674 93 8643 4139460 0.21 4148103 94 8758 4124663 0.21 4133421 95 8854 4097172 0.22 4106026 96 8626 4091027 0.21 4099653 97 8735 4082415 0.21 4091150 98 8585 4066583 0.21 4075168 99 8705 4063831 0.21 4072536 100 8423 4048561 0.21 4056984 101 8557 4028328 0.21 4036885 102 8661 4026273 0.21 4034934 103 8615 4004630 0.21 4013245 104 8484 3990764 0.21 3999248 105 8416 3983883 0.21 3992299 106 8268 3965759 0.21 3974027 107 8364 3944340 0.21 3952704 108 8384 3931780 0.21 3940164 109 8341 3932135 0.21 3940476 110 8345 3913644 0.21 3921989 111 8383 3903597 0.21 3911980 112 8312 3885349 0.21 3893661 113 8125 3868231 0.21 3876356 114 8245 3854543 0.21 3862788 115 8167 3839701 0.21 3847868 116 8027 3817759 0.21 3825786 117 7951 3811156 0.21 3819107 118 7960 3788048 0.21 3796008 119 7979 3770651 0.21 3778630 120 7959 3759333 0.21 3767292 121 8046 3748496 0.21 3756542 122 8004 3729011 0.21 3737015 123 7992 3718317 0.21 3726309 124 8058 3698124 0.22 3706182 125 8086 3674008 0.22 3682094 126 7978 3655377 0.22 3663355 127 7862 3639511 0.22 3647373 128 8076 3618756 0.22 3626832 129 7935 3608957 0.22 3616892 130 7701 3589413 0.21 3597114 131 7809 3573664 0.22 3581473 132 7909 3564550 0.22 3572459 133 7777 3543769 0.22 3551546 134 7866 3526724 0.22 3534590 135 7735 3510873 0.22 3518608 136 7917 3491073 0.23 3498990 137 8047 3467753 0.23 3475800 138 7806 3456699 0.23 3464505 139 7838 3435524 0.23 3443362 140 7648 3413832 0.22 3421480 141 7733 3395933 0.23 3403666 142 7749 3375180 0.23 3382929 143 7670 3355501 0.23 3363171 144 7864 3335817 0.24 3343681 145 7869 3316540 0.24 3324409 146 7887 3294194 0.24 3302081 147 8108 3265010 0.25 3273118 148 7839 3222361 0.24 3230200 149 7438 2995193 0.25 3002631 150 5498 0 100.00 5498