CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 91050 550984 14.18 642034 2 100773 630382 13.78 731155 3 75669 617940 10.91 693609 4 95726 728111 11.62 823837 5 101946 734971 12.18 836917 6 103998 784127 11.71 888125 7 97321 684786 12.44 782107 8 97227 693138 12.30 790365 9 96444 694017 12.20 790461 10 95629 693003 12.13 788632 11 95596 691042 12.15 786638 12 97098 689459 12.34 786557 13 95428 684180 12.24 779608 14 96830 686366 12.36 783196 15 97054 684078 12.42 781132 16 97406 690230 12.37 787636 17 97603 695510 12.31 793113 18 98015 700494 12.27 798509 19 99058 703477 12.34 802535 20 99002 700795 12.38 799797 21 98157 699382 12.31 797539 22 99332 697554 12.47 796886 23 98132 693851 12.39 791983 24 97358 688224 12.39 785582 25 98088 689039 12.46 787127 26 98704 697553 12.40 796257 27 97819 701503 12.24 799322 28 98138 701574 12.27 799712 29 98922 706121 12.29 805043 30 98828 703402 12.32 802230 31 98180 700205 12.30 798385 32 98344 699950 12.32 798294 33 98039 697988 12.32 796027 34 98345 696060 12.38 794405 35 97653 695341 12.31 792994 36 98216 699113 12.32 797329 37 98063 698568 12.31 796631 38 98796 703280 12.32 802076 39 98963 703483 12.33 802446 40 98794 706395 12.27 805189 41 98378 706991 12.22 805369 42 98847 706614 12.27 805461 43 98501 702489 12.30 800990 44 97431 699408 12.23 796839 45 97536 695689 12.30 793225 46 98251 695540 12.38 793791 47 98162 703415 12.25 801577 48 98227 704705 12.23 802932 49 98180 704991 12.22 803171 50 97729 704927 12.18 802656 51 97928 702876 12.23 800804 52 98527 705429 12.26 803956 53 97893 704600 12.20 802493 54 98074 701098 12.27 799172 55 98258 699900 12.31 798158 56 97900 698283 12.30 796183 57 97378 698557 12.23 795935 58 97560 702383 12.20 799943 59 97057 699371 12.19 796428 60 97121 700910 12.17 798031 61 97540 704833 12.16 802373 62 96815 705098 12.07 801913 63 97154 703961 12.13 801115 64 96617 702127 12.10 798744 65 96734 698448 12.17 795182 66 97010 700198 12.17 797208 67 97167 699260 12.20 796427 68 96611 700867 12.11 797478 69 96845 700485 12.15 797330 70 96694 702821 12.09 799515 71 97024 704941 12.10 801965 72 96425 705245 12.03 801670 73 96849 701912 12.12 798761 74 96567 697947 12.15 794514 75 96502 699660 12.12 796162 76 97124 700839 12.17 797963 77 96688 700826 12.12 797514 78 96468 702546 12.07 799014 79 96589 702940 12.08 799529 80 96258 702484 12.05 798742 81 95735 701489 12.01 797224 82 95789 702603 12.00 798392 83 95957 700642 12.05 796599 84 96457 702110 12.08 798567 85 95521 700255 12.00 795776 86 95288 698857 12.00 794145 87 95431 698566 12.02 793997 88 95785 701161 12.02 796946 89 95217 700239 11.97 795456 90 94978 701369 11.93 796347 91 95199 702930 11.93 798129 92 94738 704814 11.85 799552 93 94906 702000 11.91 796906 94 94860 698597 11.96 793457 95 94496 697556 11.93 792052 96 94415 697004 11.93 791419 97 94637 697907 11.94 792544 98 94222 697710 11.90 791932 99 94715 699241 11.93 793956 100 93821 700337 11.81 794158 101 93557 699461 11.80 793018 102 93319 699657 11.77 792976 103 93670 700633 11.79 794303 104 93586 699464 11.80 793050 105 93507 697708 11.82 791215 106 93081 695617 11.80 788698 107 92877 696060 11.77 788937 108 91821 694811 11.67 786632 109 92919 696241 11.77 789160 110 92577 697181 11.72 789758 111 92973 699099 11.74 792072 112 91982 697846 11.65 789828 113 93022 697517 11.77 790539 114 92132 695679 11.69 787811 115 91731 694747 11.66 786478 116 91094 691741 11.64 782835 117 90785 692617 11.59 783402 118 91239 692679 11.64 783918 119 90936 692598 11.61 783534 120 90844 693816 11.58 784660 121 91032 693923 11.60 784955 122 90315 694530 11.51 784845 123 90955 693927 11.59 784882 124 91245 695550 11.60 786795 125 90412 693531 11.53 783943 126 90729 690029 11.62 780758 127 89964 688112 11.56 778076 128 89490 689185 11.49 778675 129 89086 686850 11.48 775936 130 89791 686617 11.56 776408 131 89708 685840 11.57 775548 132 89077 687121 11.48 776198 133 89059 686953 11.48 776012 134 88460 687337 11.40 775797 135 88129 685180 11.40 773309 136 87757 686509 11.33 774266 137 87598 684072 11.35 771670 138 87367 683804 11.33 771171 139 87390 681234 11.37 768624 140 87244 682350 11.34 769594 141 86400 679190 11.29 765590 142 86871 681514 11.31 768385 143 86658 679265 11.31 765923 144 85708 677376 11.23 763084 145 85219 677970 11.17 763189 146 86264 680303 11.25 766567 147 85305 679126 11.16 764431 148 84056 675798 11.06 759854 149 82232 674422 10.87 756654 150 75316 635846 10.59 711162 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2499 1675343 0.15 1677842 2 2964 889557 0.33 892521 3 2364 935005 0.25 937369 4 3114 1111731 0.28 1114845 5 3664 1234884 0.30 1238548 6 3570 1168832 0.30 1172402 7 3286 1077887 0.30 1081173 8 3463 1121651 0.31 1125114 9 3371 1094310 0.31 1097681 10 3230 1089202 0.30 1092432 11 3377 1090924 0.31 1094301 12 3336 1085522 0.31 1088858 13 3576 1085353 0.33 1088929 14 3439 1086587 0.32 1090026 15 3496 1082340 0.32 1085836 16 3709 1091137 0.34 1094846 17 3796 1096267 0.35 1100063 18 3752 1094725 0.34 1098477 19 3766 1100956 0.34 1104722 20 3712 1095131 0.34 1098843 21 3788 1096730 0.34 1100518 22 3631 1094412 0.33 1098043 23 3698 1095117 0.34 1098815 24 3869 1091852 0.35 1095721 25 3651 1094202 0.33 1097853 26 3754 1102116 0.34 1105870 27 3745 1099043 0.34 1102788 28 3850 1105627 0.35 1109477 29 3970 1105219 0.36 1109189 30 3724 1100492 0.34 1104216 31 3718 1103230 0.34 1106948 32 3787 1104329 0.34 1108116 33 3701 1104872 0.33 1108573 34 3857 1101879 0.35 1105736 35 3762 1106343 0.34 1110105 36 3757 1106534 0.34 1110291 37 4030 1104757 0.36 1108787 38 3877 1102955 0.35 1106832 39 3811 1107182 0.34 1110993 40 3949 1105450 0.36 1109399 41 3894 1109420 0.35 1113314 42 4053 1102179 0.37 1106232 43 3859 1108376 0.35 1112235 44 3819 1107817 0.34 1111636 45 3847 1102867 0.35 1106714 46 3680 1108068 0.33 1111748 47 3711 1110248 0.33 1113959 48 3865 1108268 0.35 1112133 49 3736 1108401 0.34 1112137 50 3768 1106076 0.34 1109844 51 3875 1107961 0.35 1111836 52 3895 1110758 0.35 1114653 53 3759 1114680 0.34 1118439 54 3788 1110195 0.34 1113983 55 3867 1113354 0.35 1117221 56 3674 1111170 0.33 1114844 57 3737 1109581 0.34 1113318 58 3819 1107083 0.34 1110902 59 3732 1111750 0.33 1115482 60 3878 1104500 0.35 1108378 61 3817 1108552 0.34 1112369 62 3736 1109555 0.34 1113291 63 3832 1107931 0.34 1111763 64 3756 1109977 0.34 1113733 65 3704 1114067 0.33 1117771 66 3892 1110038 0.35 1113930 67 3774 1119198 0.34 1122972 68 3812 1114100 0.34 1117912 69 3817 1107755 0.34 1111572 70 3708 1108793 0.33 1112501 71 3930 1115394 0.35 1119324 72 3791 1111899 0.34 1115690 73 3898 1110723 0.35 1114621 74 4022 1113858 0.36 1117880 75 3801 1115792 0.34 1119593 76 3788 1114910 0.34 1118698 77 3863 1116970 0.34 1120833 78 3782 1115433 0.34 1119215 79 3850 1113689 0.34 1117539 80 3962 1112678 0.35 1116640 81 3758 1111202 0.34 1114960 82 3851 1110916 0.35 1114767 83 3933 1116021 0.35 1119954 84 3810 1110387 0.34 1114197 85 3831 1116523 0.34 1120354 86 3683 1112506 0.33 1116189 87 3924 1112754 0.35 1116678 88 3831 1112824 0.34 1116655 89 3905 1112082 0.35 1115987 90 3698 1109883 0.33 1113581 91 3968 1112897 0.36 1116865 92 3711 1115182 0.33 1118893 93 3715 1111439 0.33 1115154 94 3798 1108752 0.34 1112550 95 3747 1110605 0.34 1114352 96 3729 1108254 0.34 1111983 97 3772 1109498 0.34 1113270 98 3817 1112012 0.34 1115829 99 3782 1110411 0.34 1114193 100 3689 1107711 0.33 1111400 101 3730 1110536 0.33 1114266 102 3741 1103184 0.34 1106925 103 3879 1108263 0.35 1112142 104 3804 1106206 0.34 1110010 105 3727 1103077 0.34 1106804 106 3746 1105511 0.34 1109257 107 3713 1104843 0.33 1108556 108 3770 1100450 0.34 1104220 109 3810 1103897 0.34 1107707 110 3745 1104761 0.34 1108506 111 3684 1099915 0.33 1103599 112 3734 1105081 0.34 1108815 113 3640 1100869 0.33 1104509 114 3701 1100048 0.34 1103749 115 3716 1099495 0.34 1103211 116 3647 1097060 0.33 1100707 117 3676 1096877 0.33 1100553 118 3716 1099765 0.34 1103481 119 3688 1099953 0.33 1103641 120 3588 1093739 0.33 1097327 121 3611 1096736 0.33 1100347 122 3614 1097004 0.33 1100618 123 3722 1095551 0.34 1099273 124 3701 1094965 0.34 1098666 125 3676 1092882 0.34 1096558 126 3654 1086082 0.34 1089736 127 3611 1088464 0.33 1092075 128 3513 1083828 0.32 1087341 129 3591 1082734 0.33 1086325 130 3671 1082897 0.34 1086568 131 3572 1084153 0.33 1087725 132 3654 1079461 0.34 1083115 133 3655 1082429 0.34 1086084 134 3616 1079269 0.33 1082885 135 3699 1079592 0.34 1083291 136 3454 1076438 0.32 1079892 137 3618 1076743 0.33 1080361 138 3566 1073937 0.33 1077503 139 3589 1078337 0.33 1081926 140 3681 1072632 0.34 1076313 141 3637 1070428 0.34 1074065 142 3563 1070413 0.33 1073976 143 3624 1068614 0.34 1072238 144 3574 1061769 0.34 1065343 145 3694 1067793 0.34 1071487 146 3969 1065327 0.37 1069296 147 3937 1062199 0.37 1066136 148 3951 1058018 0.37 1061969 149 3694 1056827 0.35 1060521 150 3352 982157 0.34 985509 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 7482 4520618 0.17 4528100 2 10357 3812380 0.27 3822737 3 11114 4336271 0.26 4347385 4 12803 5315236 0.24 5328039 5 12952 5396590 0.24 5409542 6 13184 5336650 0.25 5349834 7 12581 4995135 0.25 5007716 8 12812 5022934 0.25 5035746 9 12246 4856921 0.25 4869167 10 12241 4816518 0.25 4828759 11 12271 4791566 0.26 4803837 12 12476 4770872 0.26 4783348 13 12639 4751578 0.27 4764217 14 12756 4748512 0.27 4761268 15 13226 4729158 0.28 4742384 16 13034 4760038 0.27 4773072 17 13266 4768748 0.28 4782014 18 13388 4783725 0.28 4797113 19 13495 4793691 0.28 4807186 20 13597 4791884 0.28 4805481 21 13831 4777124 0.29 4790955 22 13637 4768912 0.29 4782549 23 13603 4760324 0.28 4773927 24 13509 4755504 0.28 4769013 25 13627 4751524 0.29 4765151 26 13516 4753418 0.28 4766934 27 13595 4766106 0.28 4779701 28 13763 4790853 0.29 4804616 29 13805 4810193 0.29 4823998 30 13928 4816400 0.29 4830328 31 13979 4821208 0.29 4835187 32 14320 4795782 0.30 4810102 33 14014 4784505 0.29 4798519 34 13920 4776114 0.29 4790034 35 13748 4765167 0.29 4778915 36 14108 4756883 0.30 4770991 37 14142 4764321 0.30 4778463 38 13911 4775640 0.29 4789551 39 13958 4792489 0.29 4806447 40 14281 4803102 0.30 4817383 41 14209 4801620 0.30 4815829 42 14049 4801470 0.29 4815519 43 14062 4800275 0.29 4814337 44 14050 4788157 0.29 4802207 45 13709 4776485 0.29 4790194 46 13626 4772298 0.28 4785924 47 13725 4774628 0.29 4788353 48 13762 4776659 0.29 4790421 49 13829 4798098 0.29 4811927 50 13930 4805828 0.29 4819758 51 14077 4806168 0.29 4820245 52 13878 4818687 0.29 4832565 53 13885 4811349 0.29 4825234 54 13988 4804311 0.29 4818299 55 13612 4797578 0.28 4811190 56 13857 4790952 0.29 4804809 57 13711 4777783 0.29 4791494 58 14029 4788330 0.29 4802359 59 13919 4784490 0.29 4798409 60 13815 4795376 0.29 4809191 61 14100 4812731 0.29 4826831 62 14114 4821230 0.29 4835344 63 14170 4815909 0.29 4830079 64 13860 4819271 0.29 4833131 65 13829 4809741 0.29 4823570 66 13707 4811628 0.28 4825335 67 14191 4814327 0.29 4828518 68 14089 4811861 0.29 4825950 69 13851 4795285 0.29 4809136 70 13887 4814038 0.29 4827925 71 13927 4816439 0.29 4830366 72 14346 4818339 0.30 4832685 73 13852 4822432 0.29 4836284 74 13885 4818813 0.29 4832698 75 13706 4807689 0.28 4821395 76 13885 4820551 0.29 4834436 77 13808 4812031 0.29 4825839 78 13852 4804335 0.29 4818187 79 13919 4811367 0.29 4825286 80 13792 4812915 0.29 4826707 81 13986 4818811 0.29 4832797 82 13855 4829993 0.29 4843848 83 13835 4826385 0.29 4840220 84 13736 4825143 0.28 4838879 85 13679 4816113 0.28 4829792 86 13642 4804945 0.28 4818587 87 13797 4792798 0.29 4806595 88 13497 4798389 0.28 4811886 89 13688 4810089 0.28 4823777 90 13814 4814817 0.29 4828631 91 13611 4817418 0.28 4831029 92 13632 4821584 0.28 4835216 93 13841 4820427 0.29 4834268 94 13741 4827602 0.28 4841343 95 13622 4817026 0.28 4830648 96 13224 4804788 0.27 4818012 97 13493 4808483 0.28 4821976 98 13760 4812323 0.29 4826083 99 13661 4812516 0.28 4826177 100 13935 4819308 0.29 4833243 101 13616 4823604 0.28 4837220 102 13511 4818390 0.28 4831901 103 13636 4820900 0.28 4834536 104 13744 4816947 0.28 4830691 105 13619 4805559 0.28 4819178 106 13587 4803858 0.28 4817445 107 13541 4791914 0.28 4805455 108 13363 4780961 0.28 4794324 109 13434 4789512 0.28 4802946 110 13564 4793523 0.28 4807087 111 13441 4800132 0.28 4813573 112 13542 4802894 0.28 4816436 113 13540 4805026 0.28 4818566 114 13658 4794487 0.28 4808145 115 13435 4793258 0.28 4806693 116 13573 4789562 0.28 4803135 117 13450 4779313 0.28 4792763 118 13405 4776467 0.28 4789872 119 13323 4762911 0.28 4776234 120 13552 4759830 0.28 4773382 121 13457 4766557 0.28 4780014 122 13535 4768794 0.28 4782329 123 13322 4770514 0.28 4783836 124 13615 4769551 0.28 4783166 125 13375 4761594 0.28 4774969 126 13251 4748345 0.28 4761596 127 13594 4748368 0.29 4761962 128 13225 4735317 0.28 4748542 129 13132 4735210 0.28 4748342 130 13244 4729757 0.28 4743001 131 13143 4726421 0.28 4739564 132 13316 4720121 0.28 4733437 133 13413 4721271 0.28 4734684 134 13471 4717004 0.28 4730475 135 13269 4711497 0.28 4724766 136 13131 4713083 0.28 4726214 137 13143 4706931 0.28 4720074 138 13382 4700545 0.28 4713927 139 13299 4690672 0.28 4703971 140 13501 4678447 0.29 4691948 141 13322 4667508 0.28 4680830 142 13204 4661376 0.28 4674580 143 13289 4667020 0.28 4680309 144 13302 4659314 0.28 4672616 145 13560 4663674 0.29 4677234 146 13989 4662568 0.30 4676557 147 14190 4653508 0.30 4667698 148 13954 4646446 0.30 4660400 149 13654 4607047 0.30 4620701 150 12940 4390730 0.29 4403670 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2538 817384 0.31 819922 2 28665 764805 3.61 793470 3 51166 618785 7.64 669951 4 46872 602054 7.22 648926 5 57586 717389 7.43 774975 6 61541 731332 7.76 792873 7 64375 775975 7.66 840350 8 61074 676238 8.28 737312 9 62772 683357 8.41 746129 10 64238 682247 8.61 746485 11 63785 677465 8.61 741250 12 63894 671229 8.69 735123 13 65803 672251 8.92 738054 14 66031 665842 9.02 731873 15 66301 666942 9.04 733243 16 66845 664766 9.14 731611 17 68111 668698 9.24 736809 18 68378 672983 9.22 741361 19 69114 675082 9.29 744196 20 69641 675169 9.35 744810 21 70088 672688 9.44 742776 22 70080 668939 9.48 739019 23 70923 667852 9.60 738775 24 70838 660933 9.68 731771 25 70387 654447 9.71 724834 26 70440 656567 9.69 727007 27 71373 658981 9.77 730354 28 70866 661548 9.68 732414 29 71654 660909 9.78 732563 30 71893 662009 9.80 733902 31 71525 658822 9.79 730347 32 71621 656183 9.84 727804 33 71712 652458 9.90 724170 34 72062 648818 10.00 720880 35 72452 646496 10.08 718948 36 72265 644540 10.08 716805 37 72222 644664 10.07 716886 38 72702 645523 10.12 718225 39 72152 645966 10.05 718118 40 73181 643854 10.21 717035 41 73961 647100 10.26 721061 42 73277 643735 10.22 717012 43 72890 642219 10.19 715109 44 73190 638131 10.29 711321 45 72916 631656 10.35 704572 46 73047 629312 10.40 702359 47 73090 628710 10.41 701800 48 73313 629393 10.43 702706 49 73929 631063 10.49 704992 50 73626 630740 10.45 704366 51 73108 627024 10.44 700132 52 73152 623817 10.50 696969 53 73171 622429 10.52 695600 54 73567 621267 10.59 694834 55 73616 618120 10.64 691736 56 73393 616327 10.64 689720 57 72604 611988 10.61 684592 58 73158 611790 10.68 684948 59 73107 611795 10.67 684902 60 72325 609885 10.60 682210 61 73340 607653 10.77 680993 62 73018 609213 10.70 682231 63 72719 605216 10.73 677935 64 72513 603285 10.73 675798 65 72640 602024 10.77 674664 66 72194 595682 10.81 667876 67 72565 596100 10.85 668665 68 72968 594941 10.92 667909 69 72217 592760 10.86 664977 70 71979 592245 10.84 664224 71 72307 589448 10.93 661755 72 71897 587812 10.90 659709 73 71662 587833 10.87 659495 74 71061 586295 10.81 657356 75 71767 581473 10.99 653240 76 71755 578680 11.03 650435 77 71156 576643 10.98 647799 78 70867 575811 10.96 646678 79 70831 575528 10.96 646359 80 71104 573936 11.02 645040 81 70448 572290 10.96 642738 82 70206 569699 10.97 639905 83 70658 569702 11.03 640360 84 70426 566444 11.06 636870 85 70802 563498 11.16 634300 86 70345 560659 11.15 631004 87 69635 557712 11.10 627347 88 69890 556920 11.15 626810 89 69489 555944 11.11 625433 90 69609 553975 11.16 623584 91 69301 552535 11.14 621836 92 69593 551494 11.21 621087 93 68959 550273 11.14 619232 94 68774 545668 11.19 614442 95 68809 543417 11.24 612226 96 68068 540796 11.18 608864 97 67680 536312 11.21 603992 98 68289 537221 11.28 605510 99 67815 534106 11.27 601921 100 67784 533767 11.27 601551 101 67428 533501 11.22 600929 102 67077 531041 11.21 598118 103 66287 525692 11.20 591979 104 66515 527575 11.20 594090 105 66480 522731 11.28 589211 106 66093 518270 11.31 584363 107 65724 516509 11.29 582233 108 65346 514153 11.28 579499 109 65176 512064 11.29 577240 110 64900 511657 11.26 576557 111 64915 509482 11.30 574397 112 64466 506587 11.29 571053 113 64570 505174 11.33 569744 114 64198 504556 11.29 568754 115 64276 500189 11.39 564465 116 64055 498357 11.39 562412 117 63376 492875 11.39 556251 118 62937 490744 11.37 553681 119 62932 491053 11.36 553985 120 62699 487909 11.39 550608 121 62497 487096 11.37 549593 122 62391 484497 11.41 546888 123 61805 482147 11.36 543952 124 61652 480591 11.37 542243 125 61548 478467 11.40 540015 126 60711 473793 11.36 534504 127 60295 471029 11.35 531324 128 60032 467326 11.38 527358 129 59767 464652 11.40 524419 130 59843 461619 11.48 521462 131 59492 459478 11.46 518970 132 58700 458698 11.35 517398 133 58766 455879 11.42 514645 134 58590 453628 11.44 512218 135 58290 451416 11.44 509706 136 57987 448025 11.46 506012 137 57125 445115 11.37 502240 138 57485 443564 11.47 501049 139 56487 441309 11.35 497796 140 56289 438052 11.39 494341 141 56657 434428 11.54 491085 142 55539 432683 11.38 488222 143 55477 430091 11.43 485568 144 55099 426084 11.45 481183 145 54973 423706 11.48 478679 146 54805 421819 11.50 476624 147 54179 418084 11.47 472263 148 53150 411212 11.45 464362 149 52647 375524 12.30 428171 150 46316 0 100.00 46316 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2171 1311965 0.17 1314136 2 2320 870308 0.27 872628 3 6831 1794597 0.38 1801428 4 6610 869965 0.75 876575 5 2852 881938 0.32 884790 6 3297 1043507 0.31 1046804 7 3608 1150104 0.31 1153712 8 3546 1100053 0.32 1103599 9 3143 1000715 0.31 1003858 10 3381 1037741 0.32 1041122 11 3112 1020075 0.30 1023187 12 3055 1011410 0.30 1014465 13 3028 1011915 0.30 1014943 14 3131 1007705 0.31 1010836 15 3154 1009465 0.31 1012619 16 3158 1010395 0.31 1013553 17 3121 1004857 0.31 1007978 18 3176 1014825 0.31 1018001 19 3089 1015136 0.30 1018225 20 3105 1009817 0.31 1012922 21 3111 1014603 0.31 1017714 22 3007 1006679 0.30 1009686 23 3167 1008792 0.31 1011959 24 3095 1007250 0.31 1010345 25 3109 1002810 0.31 1005919 26 3072 1000890 0.31 1003962 27 3227 1002221 0.32 1005448 28 3121 1005180 0.31 1008301 29 3232 1000252 0.32 1003484 30 3213 1005415 0.32 1008628 31 3158 1002862 0.31 1006020 32 3124 993975 0.31 997099 33 3143 994986 0.31 998129 34 3093 995725 0.31 998818 35 3113 993347 0.31 996460 36 3100 991192 0.31 994292 37 3100 990597 0.31 993697 38 3066 988308 0.31 991374 39 3068 987168 0.31 990236 40 3301 982923 0.33 986224 41 2976 980488 0.30 983464 42 3153 980239 0.32 983392 43 3129 978896 0.32 982025 44 3039 973941 0.31 976980 45 3200 977012 0.33 980212 46 3131 973534 0.32 976665 47 3135 968004 0.32 971139 48 3066 969353 0.32 972419 49 3025 965834 0.31 968859 50 3155 965724 0.33 968879 51 3147 965210 0.32 968357 52 3085 957869 0.32 960954 53 3098 955069 0.32 958167 54 2984 956599 0.31 959583 55 3072 958944 0.32 962016 56 3068 954030 0.32 957098 57 2975 953207 0.31 956182 58 2884 948646 0.30 951530 59 3045 945425 0.32 948470 60 3125 940480 0.33 943605 61 2952 940418 0.31 943370 62 2929 933912 0.31 936841 63 2971 935263 0.32 938234 64 2921 931677 0.31 934598 65 2960 928392 0.32 931352 66 2939 932116 0.31 935055 67 2901 931410 0.31 934311 68 2900 923405 0.31 926305 69 2988 926148 0.32 929136 70 2880 921043 0.31 923923 71 2837 914316 0.31 917153 72 2949 913306 0.32 916255 73 2828 914034 0.31 916862 74 2937 907618 0.32 910555 75 3014 903624 0.33 906638 76 2973 905636 0.33 908609 77 2848 904369 0.31 907217 78 2974 901629 0.33 904603 79 2824 899128 0.31 901952 80 2895 893197 0.32 896092 81 2908 891399 0.33 894307 82 2906 889174 0.33 892080 83 2845 881460 0.32 884305 84 2737 879352 0.31 882089 85 2812 879983 0.32 882795 86 2826 873147 0.32 875973 87 2813 875695 0.32 878508 88 2795 871074 0.32 873869 89 2734 867071 0.31 869805 90 2770 867947 0.32 870717 91 2698 861305 0.31 864003 92 2811 857327 0.33 860138 93 2756 856614 0.32 859370 94 2643 855348 0.31 857991 95 2731 847272 0.32 850003 96 2676 844345 0.32 847021 97 2720 843748 0.32 846468 98 2726 837587 0.32 840313 99 2660 840541 0.32 843201 100 2720 836643 0.32 839363 101 2664 832770 0.32 835434 102 2652 829911 0.32 832563 103 2751 823090 0.33 825841 104 2645 815736 0.32 818381 105 2624 816612 0.32 819236 106 2554 811772 0.31 814326 107 2539 810025 0.31 812564 108 2574 805741 0.32 808315 109 2605 802631 0.32 805236 110 2474 798288 0.31 800762 111 2564 795348 0.32 797912 112 2518 793545 0.32 796063 113 2444 787053 0.31 789497 114 2586 785995 0.33 788581 115 2475 782160 0.32 784635 116 2408 778495 0.31 780903 117 2442 774117 0.31 776559 118 2371 768771 0.31 771142 119 2477 764850 0.32 767327 120 2379 764193 0.31 766572 121 2442 763001 0.32 765443 122 2389 756980 0.31 759369 123 2402 752132 0.32 754534 124 2462 747944 0.33 750406 125 2482 743595 0.33 746077 126 2394 741355 0.32 743749 127 2416 734785 0.33 737201 128 2300 729840 0.31 732140 129 2361 726752 0.32 729113 130 2365 721846 0.33 724211 131 2351 718154 0.33 720505 132 2243 712711 0.31 714954 133 2317 711725 0.32 714042 134 2309 705735 0.33 708044 135 2324 701470 0.33 703794 136 2253 697850 0.32 700103 137 2392 692425 0.34 694817 138 2248 690237 0.32 692485 139 2220 687559 0.32 689779 140 2270 680740 0.33 683010 141 2335 677753 0.34 680088 142 2264 672660 0.34 674924 143 2247 668323 0.34 670570 144 2244 664939 0.34 667183 145 2218 659546 0.34 661764 146 2145 654545 0.33 656690 147 2259 648664 0.35 650923 148 2181 639511 0.34 641692 149 2085 596215 0.35 598300 150 1425 0 100.00 1425 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9372 5785342 0.16 5794714 2 12345 4804692 0.26 4817037 3 13830 5232327 0.26 5246157 4 13905 5068265 0.27 5082170 5 12362 4551587 0.27 4563949 6 11400 4258523 0.27 4269923 7 12103 4591800 0.26 4603903 8 11791 4495603 0.26 4507394 9 11670 4396114 0.26 4407784 10 11734 4430407 0.26 4442141 11 11774 4422725 0.27 4434499 12 11920 4415630 0.27 4427550 13 11850 4411134 0.27 4422984 14 11750 4395820 0.27 4407570 15 11771 4395265 0.27 4407036 16 11634 4413618 0.26 4425252 17 11884 4433626 0.27 4445510 18 11916 4425127 0.27 4437043 19 12114 4426046 0.27 4438160 20 11836 4414184 0.27 4426020 21 11878 4403849 0.27 4415727 22 11911 4372614 0.27 4384525 23 12077 4356767 0.28 4368844 24 11860 4330208 0.27 4342068 25 12130 4331157 0.28 4343287 26 12130 4334369 0.28 4346499 27 12010 4345297 0.28 4357307 28 12193 4357661 0.28 4369854 29 12330 4349962 0.28 4362292 30 12205 4336942 0.28 4349147 31 12322 4319714 0.28 4332036 32 12237 4302985 0.28 4315222 33 11885 4272785 0.28 4284670 34 12012 4254320 0.28 4266332 35 12268 4255529 0.29 4267797 36 11928 4253508 0.28 4265436 37 11965 4263633 0.28 4275598 38 11962 4275507 0.28 4287469 39 11958 4266697 0.28 4278655 40 12209 4265872 0.29 4278081 41 12095 4257583 0.28 4269678 42 12043 4237362 0.28 4249405 43 12108 4225361 0.29 4237469 44 11806 4202864 0.28 4214670 45 11859 4187830 0.28 4199689 46 11947 4183405 0.28 4195352 47 11934 4184667 0.28 4196601 48 11989 4186177 0.29 4198166 49 11746 4189888 0.28 4201634 50 11861 4185322 0.28 4197183 51 11922 4165057 0.29 4176979 52 11659 4151833 0.28 4163492 53 11855 4140427 0.29 4152282 54 11769 4124465 0.28 4136234 55 11538 4111110 0.28 4122648 56 11735 4107228 0.28 4118963 57 11640 4089826 0.28 4101466 58 11440 4094920 0.28 4106360 59 11747 4095205 0.29 4106952 60 11641 4083048 0.28 4094689 61 11615 4086202 0.28 4097817 62 11845 4069279 0.29 4081124 63 11397 4045998 0.28 4057395 64 11566 4035451 0.29 4047017 65 11243 4022426 0.28 4033669 66 11395 4002656 0.28 4014051 67 11448 4007014 0.28 4018462 68 11688 3995842 0.29 4007530 69 11349 3976964 0.28 3988313 70 11202 3979765 0.28 3990967 71 11279 3977408 0.28 3988687 72 11255 3959042 0.28 3970297 73 11213 3948076 0.28 3959289 74 11428 3932851 0.29 3944279 75 11024 3915326 0.28 3926350 76 11111 3903526 0.28 3914637 77 11173 3896230 0.29 3907403 78 11316 3889227 0.29 3900543 79 11126 3887808 0.29 3898934 80 10878 3879744 0.28 3890622 81 10779 3869418 0.28 3880197 82 10659 3856306 0.28 3866965 83 10729 3836126 0.28 3846855 84 10752 3812730 0.28 3823482 85 10499 3802536 0.28 3813035 86 10498 3800068 0.28 3810566 87 10479 3787017 0.28 3797496 88 10400 3782632 0.27 3793032 89 10602 3777054 0.28 3787656 90 10348 3764913 0.27 3775261 91 10537 3751203 0.28 3761740 92 10446 3740001 0.28 3750447 93 10228 3722316 0.27 3732544 94 10115 3711426 0.27 3721541 95 10148 3682936 0.27 3693084 96 10008 3664177 0.27 3674185 97 9996 3655520 0.27 3665516 98 10020 3648323 0.27 3658343 99 9914 3634553 0.27 3644467 100 9898 3633045 0.27 3642943 101 10106 3614372 0.28 3624478 102 9935 3605629 0.27 3615564 103 9769 3586567 0.27 3596336 104 9874 3572814 0.28 3582688 105 9761 3552527 0.27 3562288 106 9538 3533454 0.27 3542992 107 9625 3520283 0.27 3529908 108 9547 3502851 0.27 3512398 109 9417 3496786 0.27 3506203 110 9553 3491420 0.27 3500973 111 9387 3478356 0.27 3487743 112 9501 3465033 0.27 3474534 113 9443 3448448 0.27 3457891 114 9176 3427784 0.27 3436960 115 9298 3406539 0.27 3415837 116 9268 3388291 0.27 3397559 117 9000 3369708 0.27 3378708 118 9132 3354620 0.27 3363752 119 9088 3338505 0.27 3347593 120 8915 3331493 0.27 3340408 121 8953 3322245 0.27 3331198 122 8892 3309420 0.27 3318312 123 8990 3294440 0.27 3303430 124 8830 3271414 0.27 3280244 125 8841 3252739 0.27 3261580 126 8848 3227458 0.27 3236306 127 8759 3209408 0.27 3218167 128 8820 3193325 0.28 3202145 129 8554 3176240 0.27 3184794 130 8613 3159529 0.27 3168142 131 8770 3151115 0.28 3159885 132 8504 3136371 0.27 3144875 133 8749 3121253 0.28 3130002 134 8778 3107654 0.28 3116432 135 8385 3082193 0.27 3090578 136 8507 3060946 0.28 3069453 137 8504 3040184 0.28 3048688 138 8549 3022590 0.28 3031139 139 8358 3004559 0.28 3012917 140 8395 2990155 0.28 2998550 141 8414 2973343 0.28 2981757 142 8330 2956544 0.28 2964874 143 8300 2941041 0.28 2949341 144 8406 2920018 0.29 2928424 145 8383 2899589 0.29 2907972 146 8403 2883112 0.29 2891515 147 8366 2849725 0.29 2858091 148 8282 2818044 0.29 2826326 149 7889 2618295 0.30 2626184 150 5232 0 100.00 5232