CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 124859 764760 14.04 889619 2 160686 1027410 13.52 1188096 3 118110 888300 11.74 1006410 4 123363 959758 11.39 1083121 5 147694 1130919 11.55 1278613 6 154566 1142537 11.92 1297103 7 141691 988160 12.54 1129851 8 139834 1003127 12.23 1142961 9 139436 999492 12.24 1138928 10 137047 990809 12.15 1127856 11 139670 1001258 12.24 1140928 12 141635 996684 12.44 1138319 13 140982 997047 12.39 1138029 14 143007 1008969 12.41 1151976 15 141846 1001486 12.41 1143332 16 142323 1011285 12.34 1153608 17 144190 1020905 12.38 1165095 18 144075 1024358 12.33 1168433 19 143984 1025127 12.32 1169111 20 145314 1024992 12.42 1170306 21 143788 1018231 12.37 1162019 22 145115 1016674 12.49 1161789 23 144122 1012440 12.46 1156562 24 144465 1010392 12.51 1154857 25 144110 1012962 12.45 1157072 26 143701 1023964 12.31 1167665 27 144597 1025823 12.35 1170420 28 143624 1021180 12.33 1164804 29 145592 1033529 12.35 1179121 30 145116 1028829 12.36 1173945 31 144990 1020174 12.44 1165164 32 144647 1025499 12.36 1170146 33 144093 1019184 12.39 1163277 34 144808 1016671 12.47 1161479 35 144600 1019515 12.42 1164115 36 145355 1022583 12.45 1167938 37 144971 1023959 12.40 1168930 38 145775 1031078 12.39 1176853 39 145185 1030617 12.35 1175802 40 146444 1027976 12.47 1174420 41 145660 1030702 12.38 1176362 42 145401 1032079 12.35 1177480 43 144198 1023936 12.34 1168134 44 144606 1024419 12.37 1169025 45 145089 1022926 12.42 1168015 46 143754 1024958 12.30 1168712 47 145171 1033679 12.31 1178850 48 146080 1032263 12.40 1178343 49 144569 1025814 12.35 1170383 50 144434 1030521 12.29 1174955 51 145184 1027156 12.38 1172340 52 144740 1026205 12.36 1170945 53 144775 1028835 12.34 1173610 54 144844 1026190 12.37 1171034 55 144221 1023061 12.36 1167282 56 144383 1025210 12.34 1169593 57 145009 1026657 12.38 1171666 58 144618 1025329 12.36 1169947 59 143484 1025276 12.28 1168760 60 143864 1027776 12.28 1171640 61 143486 1025304 12.28 1168790 62 144047 1027530 12.30 1171577 63 143630 1027770 12.26 1171400 64 143549 1025336 12.28 1168885 65 143084 1025134 12.25 1168218 66 144129 1024780 12.33 1168909 67 143273 1026561 12.25 1169834 68 143929 1024933 12.31 1168862 69 143314 1023121 12.29 1166435 70 142909 1024444 12.24 1167353 71 142647 1026646 12.20 1169293 72 142956 1026762 12.22 1169718 73 143129 1022205 12.28 1165334 74 142926 1021485 12.27 1164411 75 142465 1021643 12.24 1164108 76 142205 1018699 12.25 1160904 77 142175 1023965 12.19 1166140 78 142931 1025124 12.24 1168055 79 143697 1026393 12.28 1170090 80 142180 1024576 12.19 1166756 81 141844 1022446 12.18 1164290 82 141771 1024013 12.16 1165784 83 141864 1021086 12.20 1162950 84 142065 1021107 12.21 1163172 85 141190 1018757 12.17 1159947 86 140668 1020183 12.12 1160851 87 140949 1019339 12.15 1160288 88 140404 1016671 12.13 1157075 89 140459 1021265 12.09 1161724 90 140602 1020894 12.11 1161496 91 139308 1021591 12.00 1160899 92 140303 1024121 12.05 1164424 93 139846 1021389 12.04 1161235 94 140497 1020718 12.10 1161215 95 139692 1021797 12.03 1161489 96 139858 1016982 12.09 1156840 97 139528 1016900 12.07 1156428 98 139002 1018275 12.01 1157277 99 139437 1021807 12.01 1161244 100 138119 1016363 11.96 1154482 101 138147 1018051 11.95 1156198 102 137749 1015664 11.94 1153413 103 137549 1015848 11.93 1153397 104 137800 1017033 11.93 1154833 105 138243 1017337 11.96 1155580 106 137545 1013112 11.95 1150657 107 136893 1012784 11.91 1149677 108 136711 1010798 11.91 1147509 109 136728 1011923 11.90 1148651 110 136980 1015161 11.89 1152141 111 136427 1014890 11.85 1151317 112 135813 1010959 11.84 1146772 113 135813 1014131 11.81 1149944 114 136339 1011417 11.88 1147756 115 135417 1012363 11.80 1147780 116 134769 1007762 11.80 1142531 117 134645 1010003 11.76 1144648 118 134579 1006042 11.80 1140621 119 134291 1010027 11.74 1144318 120 133934 1007844 11.73 1141778 121 133164 1009169 11.66 1142333 122 133097 1010817 11.64 1143914 123 132274 1011594 11.56 1143868 124 133279 1005811 11.70 1139090 125 132747 1008080 11.64 1140827 126 132073 1002261 11.64 1134334 127 131215 1001613 11.58 1132828 128 131232 1002057 11.58 1133289 129 131323 1001134 11.60 1132457 130 130096 998660 11.53 1128756 131 131234 1003829 11.56 1135063 132 130155 1000063 11.52 1130218 133 129756 997679 11.51 1127435 134 129726 999211 11.49 1128937 135 130029 998162 11.53 1128191 136 128431 993686 11.45 1122117 137 128208 998122 11.38 1126330 138 128015 994077 11.41 1122092 139 128077 994033 11.41 1122110 140 127489 992569 11.38 1120058 141 127363 990408 11.39 1117771 142 126453 988657 11.34 1115110 143 125868 989327 11.29 1115195 144 125487 988334 11.27 1113821 145 124784 985895 11.23 1110679 146 125455 990010 11.25 1115465 147 124409 987770 11.19 1112179 148 123489 982586 11.16 1106075 149 119164 983372 10.81 1102536 150 105327 910408 10.37 1015735 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3899 3219299 0.12 3223198 2 3986 1408960 0.28 1412946 3 2596 1292094 0.20 1294690 4 2831 1555006 0.18 1557837 5 3872 1853044 0.21 1856916 6 3668 1732325 0.21 1735993 7 3384 1592897 0.21 1596281 8 3586 1580351 0.23 1583937 9 3658 1582611 0.23 1586269 10 3420 1571676 0.22 1575096 11 3621 1580024 0.23 1583645 12 3655 1573585 0.23 1577240 13 3810 1588559 0.24 1592369 14 3869 1586583 0.24 1590452 15 3935 1572425 0.25 1576360 16 4017 1599650 0.25 1603667 17 4065 1599557 0.25 1603622 18 4225 1589344 0.27 1593569 19 4141 1610146 0.26 1614287 20 4028 1594182 0.25 1598210 21 4078 1600555 0.25 1604633 22 4157 1604404 0.26 1608561 23 4165 1596255 0.26 1600420 24 4277 1593455 0.27 1597732 25 4219 1604799 0.26 1609018 26 4254 1602818 0.26 1607072 27 4104 1602066 0.26 1606170 28 4232 1621708 0.26 1625940 29 4303 1609183 0.27 1613486 30 4257 1602922 0.26 1607179 31 4261 1615005 0.26 1619266 32 4308 1609653 0.27 1613961 33 4274 1609209 0.26 1613483 34 4386 1611012 0.27 1615398 35 4250 1604845 0.26 1609095 36 4426 1608478 0.27 1612904 37 4538 1620237 0.28 1624775 38 4474 1614100 0.28 1618574 39 4304 1613636 0.27 1617940 40 4291 1617414 0.26 1621705 41 4400 1617882 0.27 1622282 42 4429 1610235 0.27 1614664 43 4346 1621303 0.27 1625649 44 4458 1610247 0.28 1614705 45 4269 1607859 0.26 1612128 46 4366 1622731 0.27 1627097 47 4417 1617139 0.27 1621556 48 4247 1611756 0.26 1616003 49 4372 1618085 0.27 1622457 50 4276 1612622 0.26 1616898 51 4405 1613075 0.27 1617480 52 4387 1619627 0.27 1624014 53 4366 1620874 0.27 1625240 54 4409 1609197 0.27 1613606 55 4410 1618867 0.27 1623277 56 4290 1618466 0.26 1622756 57 4413 1614664 0.27 1619077 58 4386 1611427 0.27 1615813 59 4413 1618399 0.27 1622812 60 4309 1611591 0.27 1615900 61 4271 1618685 0.26 1622956 62 4383 1614807 0.27 1619190 63 4332 1613520 0.27 1617852 64 4468 1620893 0.27 1625361 65 4392 1620400 0.27 1624792 66 4370 1612976 0.27 1617346 67 4510 1619687 0.28 1624197 68 4533 1612394 0.28 1616927 69 4544 1609928 0.28 1614472 70 4435 1621009 0.27 1625444 71 4371 1618026 0.27 1622397 72 4357 1614947 0.27 1619304 73 4608 1617140 0.28 1621748 74 4649 1618910 0.29 1623559 75 4530 1617756 0.28 1622286 76 4514 1619625 0.28 1624139 77 4543 1616562 0.28 1621105 78 4598 1619533 0.28 1624131 79 4372 1617560 0.27 1621932 80 4457 1616569 0.27 1621026 81 4422 1609658 0.27 1614080 82 4434 1615316 0.27 1619750 83 4560 1619800 0.28 1624360 84 4461 1610774 0.28 1615235 85 4423 1619480 0.27 1623903 86 4595 1614028 0.28 1618623 87 4536 1610986 0.28 1615522 88 4440 1610065 0.28 1614505 89 4442 1609869 0.28 1614311 90 4474 1606572 0.28 1611046 91 4499 1614399 0.28 1618898 92 4421 1613984 0.27 1618405 93 4393 1608380 0.27 1612773 94 4456 1612983 0.28 1617439 95 4479 1610082 0.28 1614561 96 4435 1602196 0.28 1606631 97 4509 1611894 0.28 1616403 98 4654 1609965 0.29 1614619 99 4383 1602876 0.27 1607259 100 4434 1607870 0.28 1612304 101 4530 1601120 0.28 1605650 102 4566 1597096 0.29 1601662 103 4513 1604461 0.28 1608974 104 4438 1600109 0.28 1604547 105 4446 1599472 0.28 1603918 106 4497 1605767 0.28 1610264 107 4436 1602573 0.28 1607009 108 4483 1594021 0.28 1598504 109 4471 1599539 0.28 1604010 110 4505 1599124 0.28 1603629 111 4489 1592863 0.28 1597352 112 4367 1599448 0.27 1603815 113 4372 1593904 0.27 1598276 114 4361 1592094 0.27 1596455 115 4354 1594951 0.27 1599305 116 4242 1591082 0.27 1595324 117 4272 1587781 0.27 1592053 118 4353 1595959 0.27 1600312 119 4338 1592501 0.27 1596839 120 4410 1586009 0.28 1590419 121 4366 1588866 0.27 1593232 122 4152 1584539 0.26 1588691 123 4453 1581965 0.28 1586418 124 4299 1586114 0.27 1590413 125 4351 1580608 0.27 1584959 126 4334 1575137 0.27 1579471 127 4233 1580783 0.27 1585016 128 4323 1573633 0.27 1577956 129 4413 1569709 0.28 1574122 130 4441 1574101 0.28 1578542 131 4200 1569053 0.27 1573253 132 4366 1565722 0.28 1570088 133 4250 1570227 0.27 1574477 134 4280 1569533 0.27 1573813 135 4060 1566136 0.26 1570196 136 4287 1563863 0.27 1568150 137 4525 1559150 0.29 1563675 138 4314 1555356 0.28 1559670 139 4294 1561280 0.27 1565574 140 4426 1556619 0.28 1561045 141 4336 1553648 0.28 1557984 142 4528 1552779 0.29 1557307 143 4312 1547552 0.28 1551864 144 4380 1544905 0.28 1549285 145 4594 1554830 0.29 1559424 146 5058 1546792 0.33 1551850 147 5127 1543566 0.33 1548693 148 5036 1541716 0.33 1546752 149 4742 1532531 0.31 1537273 150 4332 1395790 0.31 1400122 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 10144 7102841 0.14 7112985 2 10862 5242613 0.21 5253475 3 10062 5621275 0.18 5631337 4 10686 7044372 0.15 7055058 5 12722 8088358 0.16 8101080 6 12773 8007164 0.16 8019937 7 11782 7205072 0.16 7216854 8 12024 7092948 0.17 7104972 9 12009 6980443 0.17 6992452 10 12217 6885699 0.18 6897916 11 12367 6916285 0.18 6928652 12 12497 6887999 0.18 6900496 13 12720 6870753 0.18 6883473 14 13045 6891345 0.19 6904390 15 13247 6871398 0.19 6884645 16 13389 6940875 0.19 6954264 17 13835 6956011 0.20 6969846 18 13505 6982576 0.19 6996081 19 13845 6989053 0.20 7002898 20 13782 6973580 0.20 6987362 21 13876 6957555 0.20 6971431 22 14046 6946212 0.20 6960258 23 13796 6924400 0.20 6938196 24 14158 6928104 0.20 6942262 25 14357 6936243 0.21 6950600 26 14163 6948751 0.20 6962914 27 14386 6973430 0.21 6987816 28 14395 7001641 0.21 7016036 29 14518 7008060 0.21 7022578 30 14576 7013873 0.21 7028449 31 14686 7012940 0.21 7027626 32 14979 6984916 0.21 6999895 33 14837 6982367 0.21 6997204 34 14779 6966700 0.21 6981479 35 14576 6957063 0.21 6971639 36 14789 6965346 0.21 6980135 37 14914 6977214 0.21 6992128 38 14946 6997868 0.21 7012814 39 14903 7010322 0.21 7025225 40 14924 7015585 0.21 7030509 41 14886 7004069 0.21 7018955 42 14951 7012515 0.21 7027466 43 14912 6988941 0.21 7003853 44 14955 6981301 0.21 6996256 45 14849 6976700 0.21 6991549 46 14590 6980295 0.21 6994885 47 15140 6994068 0.22 7009208 48 15134 6991545 0.22 7006679 49 15318 7007378 0.22 7022696 50 15310 7026128 0.22 7041438 51 15085 7020245 0.21 7035330 52 15144 7030078 0.21 7045222 53 15217 7031094 0.22 7046311 54 15271 7016031 0.22 7031302 55 15054 7006898 0.21 7021952 56 15382 7008861 0.22 7024243 57 15372 6993110 0.22 7008482 58 15411 7000716 0.22 7016127 59 15206 6989867 0.22 7005073 60 15152 7014122 0.22 7029274 61 15264 7022880 0.22 7038144 62 15329 7027972 0.22 7043301 63 15474 7033260 0.22 7048734 64 15303 7029177 0.22 7044480 65 15004 7030237 0.21 7045241 66 15237 7030345 0.22 7045582 67 15590 7025486 0.22 7041076 68 15242 7032543 0.22 7047785 69 15130 7015225 0.22 7030355 70 15509 7045790 0.22 7061299 71 15535 7043629 0.22 7059164 72 15632 7031968 0.22 7047600 73 15540 7036743 0.22 7052283 74 15241 7032807 0.22 7048048 75 15419 7022036 0.22 7037455 76 15287 7031259 0.22 7046546 77 15118 7032193 0.21 7047311 78 15575 7021919 0.22 7037494 79 15575 7021845 0.22 7037420 80 15455 7021209 0.22 7036664 81 15550 7027741 0.22 7043291 82 15450 7037145 0.22 7052595 83 15478 7038918 0.22 7054396 84 15362 7031329 0.22 7046691 85 15328 7033674 0.22 7049002 86 15273 7016742 0.22 7032015 87 15263 7006062 0.22 7021325 88 15022 7014638 0.21 7029660 89 15195 7019709 0.22 7034904 90 15388 7031914 0.22 7047302 91 15373 7033386 0.22 7048759 92 15142 7025638 0.22 7040780 93 15296 7033118 0.22 7048414 94 15337 7041520 0.22 7056857 95 15325 7030626 0.22 7045951 96 15537 7021035 0.22 7036572 97 15211 7015919 0.22 7031130 98 15542 7015185 0.22 7030727 99 15705 7015996 0.22 7031701 100 15665 7021735 0.22 7037400 101 15452 7035352 0.22 7050804 102 15097 7022106 0.21 7037203 103 15500 7024142 0.22 7039642 104 15386 7025767 0.22 7041153 105 15350 7009614 0.22 7024964 106 15296 7014737 0.22 7030033 107 15240 6999475 0.22 7014715 108 15310 6977799 0.22 6993109 109 15069 6992537 0.22 7007606 110 15283 6995814 0.22 7011097 111 15159 6998712 0.22 7013871 112 15018 6999422 0.21 7014440 113 15228 7001232 0.22 7016460 114 14960 6986777 0.21 7001737 115 15381 6991280 0.22 7006661 116 15148 6984856 0.22 7000004 117 15279 6977338 0.22 6992617 118 15330 6978125 0.22 6993455 119 15333 6961448 0.22 6976781 120 15438 6947777 0.22 6963215 121 15521 6956585 0.22 6972106 122 15362 6958343 0.22 6973705 123 15082 6954868 0.22 6969950 124 15430 6959242 0.22 6974672 125 15347 6945383 0.22 6960730 126 15467 6931760 0.22 6947227 127 15263 6930608 0.22 6945871 128 15470 6913553 0.22 6929023 129 15228 6909352 0.22 6924580 130 15168 6905958 0.22 6921126 131 15338 6900902 0.22 6916240 132 15151 6894730 0.22 6909881 133 15016 6891320 0.22 6906336 134 15330 6893355 0.22 6908685 135 15489 6886992 0.22 6902481 136 15102 6869710 0.22 6884812 137 15455 6865803 0.22 6881258 138 15157 6860647 0.22 6875804 139 15348 6857722 0.22 6873070 140 15470 6844982 0.23 6860452 141 15278 6829359 0.22 6844637 142 15424 6819657 0.23 6835081 143 15597 6815941 0.23 6831538 144 16112 6810621 0.24 6826733 145 16529 6823464 0.24 6839993 146 17295 6819248 0.25 6836543 147 17558 6811786 0.26 6829344 148 17192 6786534 0.25 6803726 149 16712 6715292 0.25 6732004 150 15056 6302296 0.24 6317352 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2739 1213912 0.23 1216651 2 39307 1091050 3.48 1130357 3 78209 1009363 7.19 1087572 4 69258 875584 7.33 944842 5 73825 955548 7.17 1029373 6 87356 1129145 7.18 1216501 7 94300 1137764 7.65 1232064 8 87995 986623 8.19 1074618 9 89610 996930 8.25 1086540 10 92102 988826 8.52 1080928 11 91905 975616 8.61 1067521 12 94327 985740 8.73 1080067 13 96601 975581 9.01 1072182 14 96822 980593 8.99 1077415 15 97872 988486 9.01 1086358 16 99421 980603 9.21 1080024 17 99510 990854 9.13 1090364 18 100907 992837 9.23 1093744 19 101921 994983 9.29 1096904 20 102215 992150 9.34 1094365 21 103133 988313 9.45 1091446 22 103318 981936 9.52 1085254 23 104212 982028 9.59 1086240 24 104037 974975 9.64 1079012 25 104540 971473 9.72 1076013 26 104755 975408 9.70 1080163 27 104892 981020 9.66 1085912 28 104718 979954 9.65 1084672 29 105458 976402 9.75 1081860 30 106492 979806 9.80 1086298 31 106262 971826 9.86 1078088 32 106242 964617 9.92 1070859 33 106496 967199 9.92 1073695 34 106277 959942 9.97 1066219 35 106817 956251 10.05 1063068 36 106751 956122 10.04 1062873 37 107574 956515 10.11 1064089 38 107458 958261 10.08 1065719 39 107712 959967 10.09 1067679 40 107972 956916 10.14 1064888 41 108254 954250 10.19 1062504 42 108204 950526 10.22 1058730 43 108652 951210 10.25 1059862 44 108274 944437 10.29 1052711 45 107693 938003 10.30 1045696 46 108352 937086 10.36 1045438 47 108458 936238 10.38 1044696 48 108899 938996 10.39 1047895 49 108669 936137 10.40 1044806 50 108459 931881 10.43 1040340 51 108239 930439 10.42 1038678 52 108668 925574 10.51 1034242 53 108994 925678 10.53 1034672 54 109004 921094 10.58 1030098 55 109047 919605 10.60 1028652 56 108409 914374 10.60 1022783 57 108485 913247 10.62 1021732 58 108638 913727 10.63 1022365 59 108894 910526 10.68 1019420 60 108312 906679 10.67 1014991 61 108097 905006 10.67 1013103 62 108206 902734 10.70 1010940 63 107873 901362 10.69 1009235 64 108469 899878 10.76 1008347 65 107412 894650 10.72 1002062 66 108534 891078 10.86 999612 67 108706 889364 10.89 998070 68 108140 887377 10.86 995517 69 107148 885313 10.80 992461 70 108136 882280 10.92 990416 71 108143 880322 10.94 988465 72 107237 879718 10.87 986955 73 107801 878088 10.93 985889 74 107664 871554 10.99 979218 75 106997 868259 10.97 975256 76 107086 865928 11.01 973014 77 106826 863287 11.01 970113 78 106506 862744 10.99 969250 79 107523 862661 11.08 970184 80 106501 857333 11.05 963834 81 106606 855938 11.08 962544 82 106163 853125 11.07 959288 83 105981 851145 11.07 957126 84 105618 847450 11.08 953068 85 106344 843589 11.19 949933 86 105118 838810 11.14 943928 87 104938 837082 11.14 942020 88 104639 835192 11.13 939831 89 104668 832079 11.17 936747 90 104438 832550 11.15 936988 91 104508 828718 11.20 933226 92 104281 827750 11.19 932031 93 103978 824303 11.20 928281 94 103832 820641 11.23 924473 95 103718 817641 11.26 921359 96 102589 816246 11.17 918835 97 103308 810421 11.31 913729 98 103036 809796 11.29 912832 99 102382 805239 11.28 907621 100 102281 805749 11.26 908030 101 101540 799740 11.27 901280 102 101313 798536 11.26 899849 103 101739 794146 11.36 895885 104 100478 791983 11.26 892461 105 100515 789278 11.30 889793 106 100303 785887 11.32 886190 107 99835 782142 11.32 881977 108 99379 779102 11.31 878481 109 98480 774719 11.28 873199 110 99252 772873 11.38 872125 111 98754 771888 11.34 870642 112 98926 768937 11.40 867863 113 98227 764068 11.39 862295 114 97802 763433 11.36 861235 115 97498 759985 11.37 857483 116 97660 755995 11.44 853655 117 96643 752568 11.38 849211 118 96261 748578 11.39 844839 119 96059 746731 11.40 842790 120 95733 744342 11.40 840075 121 95803 741454 11.44 837257 122 95241 739200 11.41 834441 123 95024 737346 11.42 832370 124 93656 732091 11.34 825747 125 94260 728924 11.45 823184 126 94065 726468 11.46 820533 127 92613 719027 11.41 811640 128 91981 717242 11.37 809223 129 92215 713259 11.45 805474 130 92154 709038 11.50 801192 131 92225 707436 11.53 799661 132 90942 705170 11.42 796112 133 90641 700513 11.46 791154 134 90939 697218 11.54 788157 135 89947 694930 11.46 784877 136 89279 691354 11.44 780633 137 89028 687652 11.46 776680 138 88405 685052 11.43 773457 139 87873 680724 11.43 768597 140 87501 677479 11.44 764980 141 86890 671775 11.45 758665 142 86749 668741 11.48 755490 143 86165 668232 11.42 754397 144 85160 663198 11.38 748358 145 85470 659110 11.48 744580 146 84415 652717 11.45 737132 147 84654 650859 11.51 735513 148 83737 639311 11.58 723048 149 81446 578241 12.35 659687 150 71994 0 100.00 71994 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1482 1562190 0.09 1563672 2 1946 1281266 0.15 1283212 3 7883 3518989 0.22 3526872 4 7366 1414139 0.52 1421505 5 2474 1254337 0.20 1256811 6 2838 1457670 0.19 1460508 7 3499 1731327 0.20 1734826 8 3357 1633483 0.21 1636840 9 3232 1505471 0.21 1508703 10 3060 1487005 0.21 1490065 11 2936 1489123 0.20 1492059 12 3011 1475573 0.20 1478584 13 3155 1477497 0.21 1480652 14 3043 1474935 0.21 1477978 15 3112 1493990 0.21 1497102 16 2980 1490963 0.20 1493943 17 3201 1475855 0.22 1479056 18 3307 1499310 0.22 1502617 19 3283 1496120 0.22 1499403 20 3396 1484250 0.23 1487646 21 3362 1500511 0.22 1503873 22 3298 1481336 0.22 1484634 23 3305 1485490 0.22 1488795 24 3202 1492822 0.21 1496024 25 3469 1481586 0.23 1485055 26 3390 1473543 0.23 1476933 27 3345 1488960 0.22 1492305 28 3355 1482884 0.23 1486239 29 3391 1474798 0.23 1478189 30 3438 1487934 0.23 1491372 31 3428 1476545 0.23 1479973 32 3313 1463238 0.23 1466551 33 3275 1474314 0.22 1477589 34 3450 1463847 0.24 1467297 35 3543 1462027 0.24 1465570 36 3303 1465316 0.22 1468619 37 3370 1456913 0.23 1460283 38 3476 1455605 0.24 1459081 39 3312 1464732 0.23 1468044 40 3533 1454648 0.24 1458181 41 3449 1455036 0.24 1458485 42 3470 1453833 0.24 1457303 43 3495 1445628 0.24 1449123 44 3423 1443235 0.24 1446658 45 3524 1448624 0.24 1452148 46 3510 1438583 0.24 1442093 47 3401 1430035 0.24 1433436 48 3321 1439556 0.23 1442877 49 3354 1431658 0.23 1435012 50 3402 1425944 0.24 1429346 51 3416 1429265 0.24 1432681 52 3402 1418903 0.24 1422305 53 3639 1414981 0.26 1418620 54 3392 1418503 0.24 1421895 55 3466 1416764 0.24 1420230 56 3412 1407668 0.24 1411080 57 3326 1411809 0.24 1415135 58 3354 1402736 0.24 1406090 59 3402 1397400 0.24 1400802 60 3351 1393952 0.24 1397303 61 3465 1396042 0.25 1399507 62 3363 1387364 0.24 1390727 63 3407 1385686 0.25 1389093 64 3430 1382784 0.25 1386214 65 3372 1375633 0.24 1379005 66 3475 1384374 0.25 1387849 67 3394 1376980 0.25 1380374 68 3272 1367754 0.24 1371026 69 3380 1369514 0.25 1372894 70 3401 1362959 0.25 1366360 71 3434 1357474 0.25 1360908 72 3409 1362077 0.25 1365486 73 3363 1355262 0.25 1358625 74 3497 1351209 0.26 1354706 75 3514 1349063 0.26 1352577 76 3352 1342365 0.25 1345717 77 3565 1343822 0.26 1347387 78 3398 1336038 0.25 1339436 79 3395 1335239 0.25 1338634 80 3325 1333111 0.25 1336436 81 3366 1329938 0.25 1333304 82 3416 1324553 0.26 1327969 83 3330 1313897 0.25 1317227 84 3292 1315105 0.25 1318397 85 3296 1311320 0.25 1314616 86 3344 1304142 0.26 1307486 87 3257 1307734 0.25 1310991 88 3292 1301207 0.25 1304499 89 3266 1290879 0.25 1294145 90 3176 1292902 0.25 1296078 91 3185 1287186 0.25 1290371 92 3232 1279169 0.25 1282401 93 3172 1284712 0.25 1287884 94 3213 1278240 0.25 1281453 95 3166 1267666 0.25 1270832 96 3259 1269107 0.26 1272366 97 3281 1263172 0.26 1266453 98 3253 1254413 0.26 1257666 99 3168 1261111 0.25 1264279 100 3206 1250129 0.26 1253335 101 3245 1246501 0.26 1249746 102 3171 1243906 0.25 1247077 103 3102 1237566 0.25 1240668 104 3197 1228289 0.26 1231486 105 3221 1232154 0.26 1235375 106 3218 1221010 0.26 1224228 107 3136 1217343 0.26 1220479 108 3130 1216222 0.26 1219352 109 3123 1211587 0.26 1214710 110 3089 1202050 0.26 1205139 111 3116 1202822 0.26 1205938 112 3148 1197734 0.26 1200882 113 3137 1189660 0.26 1192797 114 3048 1188024 0.26 1191072 115 2977 1185286 0.25 1188263 116 2997 1177224 0.25 1180221 117 3092 1172994 0.26 1176086 118 2936 1164521 0.25 1167457 119 3158 1160147 0.27 1163305 120 3044 1161764 0.26 1164808 121 2932 1156288 0.25 1159220 122 3013 1149941 0.26 1152954 123 3055 1146463 0.27 1149518 124 3104 1139018 0.27 1142122 125 3082 1130544 0.27 1133626 126 2939 1129757 0.26 1132696 127 3128 1122995 0.28 1126123 128 3094 1112941 0.28 1116035 129 2898 1113661 0.26 1116559 130 2963 1108511 0.27 1111474 131 2970 1099465 0.27 1102435 132 3052 1097103 0.28 1100155 133 3128 1091605 0.29 1094733 134 2935 1084448 0.27 1087383 135 2978 1078547 0.28 1081525 136 3007 1075178 0.28 1078185 137 2876 1067205 0.27 1070081 138 3012 1064730 0.28 1067742 139 2817 1055344 0.27 1058161 140 2840 1048066 0.27 1050906 141 2948 1047831 0.28 1050779 142 2895 1041346 0.28 1044241 143 2842 1031999 0.27 1034841 144 2896 1028060 0.28 1030956 145 2880 1020605 0.28 1023485 146 2942 1010801 0.29 1013743 147 2968 1008182 0.29 1011150 148 2904 992110 0.29 995014 149 2710 909800 0.30 912510 150 2010 0 100.00 2010 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 6615 7275978 0.09 7282593 2 7762 5549192 0.14 5556954 3 12234 8210996 0.15 8223230 4 13088 8065296 0.16 8078384 5 10709 6928496 0.15 6939205 6 10004 6359476 0.16 6369480 7 10192 6503037 0.16 6513229 8 10402 6419847 0.16 6430249 9 10568 6547149 0.16 6557717 10 11039 6513062 0.17 6524101 11 10885 6543778 0.17 6554663 12 10957 6568839 0.17 6579796 13 11351 6512612 0.17 6523963 14 11202 6507260 0.17 6518462 15 11603 6545233 0.18 6556836 16 11526 6553871 0.18 6565397 17 11620 6573320 0.18 6584940 18 11793 6555789 0.18 6567582 19 12000 6543075 0.18 6555075 20 11977 6515590 0.18 6527567 21 11669 6512814 0.18 6524483 22 12185 6467403 0.19 6479588 23 11989 6449860 0.19 6461849 24 12112 6450301 0.19 6462413 25 12363 6460767 0.19 6473130 26 12561 6447003 0.19 6459564 27 12107 6474787 0.19 6486894 28 12320 6470036 0.19 6482356 29 12283 6430933 0.19 6443216 30 12535 6433478 0.19 6446013 31 12535 6422602 0.19 6435137 32 12699 6377013 0.20 6389712 33 12385 6374355 0.19 6386740 34 12495 6345874 0.20 6358369 35 12413 6344386 0.20 6356799 36 12530 6359111 0.20 6371641 37 12547 6355684 0.20 6368231 38 12432 6354570 0.20 6367002 39 12481 6355079 0.20 6367560 40 12813 6331370 0.20 6344183 41 12800 6311896 0.20 6324696 42 13040 6296725 0.21 6309765 43 12563 6275968 0.20 6288531 44 12444 6247727 0.20 6260171 45 12497 6259525 0.20 6272022 46 12522 6251060 0.20 6263582 47 12863 6242535 0.21 6255398 48 12652 6256313 0.20 6268965 49 12633 6237436 0.20 6250069 50 12666 6224214 0.20 6236880 51 12697 6203886 0.20 6216583 52 13025 6184214 0.21 6197239 53 12714 6165786 0.21 6178500 54 12689 6154080 0.21 6166769 55 12275 6140238 0.20 6152513 56 12545 6125419 0.20 6137964 57 12480 6124010 0.20 6136490 58 12563 6123544 0.20 6136107 59 12656 6103943 0.21 6116599 60 12489 6088861 0.20 6101350 61 12541 6080454 0.21 6092995 62 12810 6052950 0.21 6065760 63 12554 6046721 0.21 6059275 64 12635 6034587 0.21 6047222 65 12444 6002348 0.21 6014792 66 12732 6001267 0.21 6013999 67 12553 5997328 0.21 6009881 68 12457 5972386 0.21 5984843 69 12450 5956508 0.21 5968958 70 12291 5939429 0.21 5951720 71 12431 5923770 0.21 5936201 72 12592 5926719 0.21 5939311 73 12582 5910358 0.21 5922940 74 12038 5873618 0.20 5885656 75 12344 5864355 0.21 5876699 76 12499 5853949 0.21 5866448 77 12311 5836623 0.21 5848934 78 12430 5832443 0.21 5844873 79 12280 5824072 0.21 5836352 80 12171 5800403 0.21 5812574 81 12022 5799145 0.21 5811167 82 11998 5778255 0.21 5790253 83 11887 5747929 0.21 5759816 84 11996 5731448 0.21 5743444 85 11855 5721190 0.21 5733045 86 11853 5701399 0.21 5713252 87 11717 5693733 0.21 5705450 88 11686 5684940 0.21 5696626 89 12003 5666464 0.21 5678467 90 11704 5658186 0.21 5669890 91 11732 5641278 0.21 5653010 92 11778 5616951 0.21 5628729 93 11771 5607807 0.21 5619578 94 11807 5588751 0.21 5600558 95 11567 5548501 0.21 5560068 96 11440 5537892 0.21 5549332 97 11358 5525607 0.21 5536965 98 11294 5498570 0.20 5509864 99 11348 5500129 0.21 5511477 100 11122 5483425 0.20 5494547 101 11247 5451488 0.21 5462735 102 11337 5451597 0.21 5462934 103 10869 5424644 0.20 5435513 104 11195 5404970 0.21 5416165 105 11349 5387731 0.21 5399080 106 11309 5355996 0.21 5367305 107 11299 5334624 0.21 5345923 108 11173 5322294 0.21 5333467 109 11429 5306996 0.21 5318425 110 11163 5288132 0.21 5299295 111 10815 5280196 0.20 5291011 112 11140 5262995 0.21 5274135 113 11066 5236200 0.21 5247266 114 11115 5217498 0.21 5228613 115 11152 5188070 0.21 5199222 116 11045 5163586 0.21 5174631 117 11122 5150411 0.22 5161533 118 10955 5126652 0.21 5137607 119 10864 5098862 0.21 5109726 120 10994 5086976 0.22 5097970 121 10694 5070821 0.21 5081515 122 10838 5049414 0.21 5060252 123 10796 5030533 0.21 5041329 124 10702 5006600 0.21 5017302 125 10624 4973834 0.21 4984458 126 10651 4955927 0.21 4966578 127 10750 4926351 0.22 4937101 128 10601 4900128 0.22 4910729 129 10603 4884520 0.22 4895123 130 10642 4862624 0.22 4873266 131 10501 4844454 0.22 4854955 132 10728 4829126 0.22 4839854 133 10584 4801188 0.22 4811772 134 10820 4777362 0.23 4788182 135 10739 4751320 0.23 4762059 136 10695 4732254 0.23 4742949 137 10840 4697853 0.23 4708693 138 10759 4683041 0.23 4693800 139 10584 4649379 0.23 4659963 140 10674 4622622 0.23 4633296 141 10725 4606171 0.23 4616896 142 10779 4580709 0.23 4591488 143 10802 4553909 0.24 4564711 144 10817 4526624 0.24 4537441 145 10780 4497370 0.24 4508150 146 10835 4458071 0.24 4468906 147 11038 4422290 0.25 4433328 148 10994 4368633 0.25 4379627 149 10344 4012737 0.26 4023081 150 7440 0 100.00 7440