CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 156541 941444 14.26 1097985 2 192165 1216047 13.65 1408212 3 135715 1065360 11.30 1201075 4 152126 1202058 11.23 1354184 5 178977 1362918 11.61 1541895 6 186100 1405389 11.69 1591489 7 170099 1204966 12.37 1375065 8 168399 1217156 12.15 1385555 9 167975 1218271 12.12 1386246 10 166126 1209364 12.08 1375490 11 168177 1221779 12.10 1389956 12 170062 1213247 12.29 1383309 13 169483 1206446 12.32 1375929 14 171016 1222953 12.27 1393969 15 171348 1214117 12.37 1385465 16 171319 1229910 12.23 1401229 17 171547 1237945 12.17 1409492 18 173641 1245810 12.23 1419451 19 172752 1248450 12.16 1421202 20 174291 1246250 12.27 1420541 21 172847 1237935 12.25 1410782 22 174428 1234210 12.38 1408638 23 173087 1225138 12.38 1398225 24 172389 1218797 12.39 1391186 25 171980 1223113 12.33 1395093 26 172997 1240387 12.24 1413384 27 173640 1243150 12.26 1416790 28 172768 1243421 12.20 1416189 29 174519 1256039 12.20 1430558 30 174262 1246639 12.26 1420901 31 173699 1241538 12.27 1415237 32 175112 1240080 12.37 1415192 33 173591 1235303 12.32 1408894 34 172730 1230436 12.31 1403166 35 172704 1230932 12.30 1403636 36 173761 1235654 12.33 1409415 37 173725 1237517 12.31 1411242 38 174736 1247459 12.29 1422195 39 174443 1249844 12.25 1424287 40 174309 1252687 12.22 1426996 41 173793 1254609 12.17 1428402 42 175240 1252809 12.27 1428049 43 174047 1242624 12.29 1416671 44 174042 1239434 12.31 1413476 45 173598 1234962 12.32 1408560 46 173274 1237679 12.28 1410953 47 173524 1250969 12.18 1424493 48 174741 1252039 12.25 1426780 49 173806 1248940 12.22 1422746 50 173570 1251655 12.18 1425225 51 173794 1248705 12.22 1422499 52 173990 1247338 12.24 1421328 53 174730 1251152 12.25 1425882 54 174274 1246231 12.27 1420505 55 173244 1239510 12.26 1412754 56 172730 1242784 12.20 1415514 57 173610 1243217 12.25 1416827 58 173869 1245052 12.25 1418921 59 172065 1246586 12.13 1418651 60 172353 1248675 12.13 1421028 61 172104 1249654 12.11 1421758 62 172083 1250140 12.10 1422223 63 173138 1252800 12.14 1425938 64 172598 1248970 12.14 1421568 65 172111 1244757 12.15 1416868 66 172257 1245833 12.15 1418090 67 172720 1246887 12.17 1419607 68 171567 1246999 12.09 1418566 69 170877 1246658 12.05 1417535 70 172640 1248211 12.15 1420851 71 170887 1250829 12.02 1421716 72 171045 1251619 12.02 1422664 73 171226 1247585 12.07 1418811 74 171197 1244593 12.09 1415790 75 171097 1242242 12.11 1413339 76 170356 1244567 12.04 1414923 77 170853 1248665 12.04 1419518 78 171650 1250407 12.07 1422057 79 170757 1251650 12.00 1422407 80 171102 1249700 12.04 1420802 81 169933 1248131 11.98 1418064 82 169804 1249537 11.96 1419341 83 170124 1249854 11.98 1419978 84 169033 1249037 11.92 1418070 85 169755 1246096 11.99 1415851 86 169362 1244299 11.98 1413661 87 168819 1243530 11.95 1412349 88 169605 1245076 11.99 1414681 89 168459 1249826 11.88 1418285 90 168504 1250335 11.88 1418839 91 168326 1250389 11.86 1418715 92 168820 1254876 11.86 1423696 93 168051 1250829 11.84 1418880 94 168393 1246562 11.90 1414955 95 167154 1245888 11.83 1413042 96 166932 1242585 11.84 1409517 97 167375 1242734 11.87 1410109 98 167366 1246503 11.84 1413869 99 166487 1247546 11.77 1414033 100 166011 1246488 11.75 1412499 101 165214 1245043 11.72 1410257 102 164660 1241764 11.71 1406424 103 164553 1243210 11.69 1407763 104 165101 1246304 11.70 1411405 105 164956 1242918 11.72 1407874 106 164746 1238732 11.74 1403478 107 163043 1236069 11.65 1399112 108 164028 1232231 11.75 1396259 109 163334 1237227 11.66 1400561 110 164122 1240975 11.68 1405097 111 163331 1241784 11.62 1405115 112 163077 1239991 11.62 1403068 113 162245 1241442 11.56 1403687 114 162505 1236473 11.62 1398978 115 160894 1234321 11.53 1395215 116 161475 1230531 11.60 1392006 117 160536 1233051 11.52 1393587 118 160297 1231603 11.52 1391900 119 160518 1234041 11.51 1394559 120 160263 1234017 11.49 1394280 121 159277 1233433 11.44 1392710 122 159468 1234947 11.44 1394415 123 158259 1237122 11.34 1395381 124 158710 1232008 11.41 1390718 125 158107 1234222 11.36 1392329 126 158308 1224523 11.45 1382831 127 157304 1222118 11.40 1379422 128 156922 1223671 11.37 1380593 129 155905 1219550 11.33 1375455 130 155134 1220285 11.28 1375419 131 155484 1219467 11.31 1374951 132 154348 1218536 11.24 1372884 133 154871 1219029 11.27 1373900 134 155279 1223156 11.26 1378435 135 154788 1218550 11.27 1373338 136 153686 1213919 11.24 1367605 137 152051 1214339 11.13 1366390 138 151501 1211286 11.12 1362787 139 152508 1213631 11.16 1366139 140 152032 1209431 11.17 1361463 141 151012 1207585 11.12 1358597 142 150665 1206272 11.10 1356937 143 149975 1208477 11.04 1358452 144 149131 1208512 10.98 1357643 145 149110 1202153 11.03 1351263 146 149307 1207523 11.00 1356830 147 148059 1204626 10.95 1352685 148 146063 1198494 10.86 1344557 149 142699 1194941 10.67 1337640 150 125236 1109760 10.14 1234996 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4906 3743267 0.13 3748173 2 5396 1614471 0.33 1619867 3 3708 1548664 0.24 1552372 4 4587 1893747 0.24 1898334 5 6078 2253279 0.27 2259357 6 5749 2097999 0.27 2103748 7 5345 1904096 0.28 1909441 8 5598 1929320 0.29 1934918 9 5493 1909868 0.29 1915361 10 5331 1905841 0.28 1911172 11 5460 1913744 0.28 1919204 12 5596 1901816 0.29 1907412 13 5780 1919119 0.30 1924899 14 5699 1913969 0.30 1919668 15 5879 1898697 0.31 1904576 16 6098 1926882 0.32 1932980 17 6203 1934125 0.32 1940328 18 6011 1922751 0.31 1928762 19 6145 1942476 0.32 1948621 20 6224 1924445 0.32 1930669 21 6177 1928471 0.32 1934648 22 6040 1933663 0.31 1939703 23 6235 1925172 0.32 1931407 24 6206 1920838 0.32 1927044 25 6229 1928531 0.32 1934760 26 6206 1936714 0.32 1942920 27 6238 1928784 0.32 1935022 28 6342 1957762 0.32 1964104 29 6342 1943614 0.33 1949956 30 6179 1934581 0.32 1940760 31 6202 1946438 0.32 1952640 32 6253 1939646 0.32 1945899 33 6078 1942716 0.31 1948794 34 6373 1940997 0.33 1947370 35 6258 1940598 0.32 1946856 36 6357 1940572 0.33 1946929 37 6591 1950329 0.34 1956920 38 6443 1943673 0.33 1950116 39 6449 1946819 0.33 1953268 40 6399 1954349 0.33 1960748 41 6472 1955643 0.33 1962115 42 6389 1943284 0.33 1949673 43 6319 1959374 0.32 1965693 44 6309 1950840 0.32 1957149 45 6238 1943299 0.32 1949537 46 6357 1960807 0.32 1967164 47 6259 1955124 0.32 1961383 48 6234 1950785 0.32 1957019 49 6281 1951176 0.32 1957457 50 6136 1953625 0.31 1959761 51 6273 1953937 0.32 1960210 52 6509 1961337 0.33 1967846 53 6350 1968727 0.32 1975077 54 6337 1956090 0.32 1962427 55 6156 1964078 0.31 1970234 56 6240 1964185 0.32 1970425 57 6230 1955639 0.32 1961869 58 6067 1950861 0.31 1956928 59 6352 1958411 0.32 1964763 60 6238 1949272 0.32 1955510 61 6124 1960347 0.31 1966471 62 6267 1962697 0.32 1968964 63 6306 1957535 0.32 1963841 64 6181 1969637 0.31 1975818 65 6290 1971464 0.32 1977754 66 6308 1961549 0.32 1967857 67 6228 1972572 0.31 1978800 68 6299 1963932 0.32 1970231 69 6405 1951715 0.33 1958120 70 6272 1960954 0.32 1967226 71 6341 1966848 0.32 1973189 72 6351 1962309 0.32 1968660 73 6343 1965051 0.32 1971394 74 6544 1969002 0.33 1975546 75 6371 1967703 0.32 1974074 76 6325 1974591 0.32 1980916 77 6398 1972252 0.32 1978650 78 6320 1969522 0.32 1975842 79 6148 1969171 0.31 1975319 80 6261 1971511 0.32 1977772 81 6365 1957086 0.32 1963451 82 6221 1965272 0.32 1971493 83 6336 1972995 0.32 1979331 84 6360 1962282 0.32 1968642 85 6542 1977806 0.33 1984348 86 6290 1968358 0.32 1974648 87 6471 1965426 0.33 1971897 88 6280 1970325 0.32 1976605 89 6159 1967476 0.31 1973635 90 6300 1958610 0.32 1964910 91 6323 1975072 0.32 1981395 92 6429 1974197 0.32 1980626 93 6317 1961390 0.32 1967707 94 6398 1965343 0.32 1971741 95 6265 1965984 0.32 1972249 96 6188 1957906 0.32 1964094 97 6408 1966109 0.32 1972517 98 6392 1964779 0.32 1971171 99 6191 1959928 0.31 1966119 100 6246 1966347 0.32 1972593 101 6260 1959823 0.32 1966083 102 6178 1950843 0.32 1957021 103 6320 1963767 0.32 1970087 104 6174 1955809 0.31 1961983 105 6274 1954464 0.32 1960738 106 6101 1957385 0.31 1963486 107 6257 1954087 0.32 1960344 108 6186 1947232 0.32 1953418 109 6188 1951091 0.32 1957279 110 6237 1956362 0.32 1962599 111 6079 1946067 0.31 1952146 112 6064 1951123 0.31 1957187 113 6058 1950324 0.31 1956382 114 6186 1939932 0.32 1946118 115 5905 1943946 0.30 1949851 116 6083 1940861 0.31 1946944 117 5954 1940350 0.31 1946304 118 6084 1944746 0.31 1950830 119 6000 1944554 0.31 1950554 120 6050 1932508 0.31 1938558 121 6036 1939328 0.31 1945364 122 6087 1936758 0.31 1942845 123 5978 1930296 0.31 1936274 124 6172 1932881 0.32 1939053 125 5919 1924633 0.31 1930552 126 5858 1918906 0.30 1924764 127 5913 1925310 0.31 1931223 128 5961 1913866 0.31 1919827 129 5899 1912050 0.31 1917949 130 6106 1916256 0.32 1922362 131 5911 1912386 0.31 1918297 132 5934 1905956 0.31 1911890 133 5741 1913391 0.30 1919132 134 6137 1910082 0.32 1916219 135 5824 1905215 0.30 1911039 136 5907 1904039 0.31 1909946 137 6023 1900548 0.32 1906571 138 5830 1893009 0.31 1898839 139 5943 1902654 0.31 1908597 140 5903 1890648 0.31 1896551 141 6042 1885102 0.32 1891144 142 6092 1888844 0.32 1894936 143 6073 1884823 0.32 1890896 144 6242 1879491 0.33 1885733 145 6428 1889385 0.34 1895813 146 6937 1879550 0.37 1886487 147 6925 1872716 0.37 1879641 148 6907 1868439 0.37 1875346 149 6317 1857690 0.34 1864007 150 5757 1693501 0.34 1699258 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 12865 8593882 0.15 8606747 2 16139 6295843 0.26 6311982 3 16991 7005454 0.24 7022445 4 19366 8886805 0.22 8906171 5 22137 9897886 0.22 9920023 6 21722 9753479 0.22 9775201 7 20055 8783784 0.23 8803839 8 20380 8682364 0.23 8702744 9 19861 8463996 0.23 8483857 10 19442 8375238 0.23 8394680 11 20070 8404636 0.24 8424706 12 20333 8360717 0.24 8381050 13 20490 8323346 0.25 8343836 14 20923 8334159 0.25 8355082 15 21149 8307658 0.25 8328807 16 21003 8379438 0.25 8400441 17 21372 8411887 0.25 8433259 18 21447 8451542 0.25 8472989 19 22010 8465710 0.26 8487720 20 22239 8450826 0.26 8473065 21 22236 8425177 0.26 8447413 22 22165 8412531 0.26 8434696 23 22056 8380156 0.26 8402212 24 21922 8368066 0.26 8389988 25 22418 8358074 0.27 8380492 26 22083 8375219 0.26 8397302 27 22596 8415678 0.27 8438274 28 22888 8461230 0.27 8484118 29 22915 8488762 0.27 8511677 30 22801 8497730 0.27 8520531 31 23062 8512854 0.27 8535916 32 23033 8471091 0.27 8494124 33 23156 8446659 0.27 8469815 34 22733 8427454 0.27 8450187 35 22269 8410895 0.26 8433164 36 22698 8401229 0.27 8423927 37 22897 8416134 0.27 8439031 38 22912 8445292 0.27 8468204 39 22914 8479690 0.27 8502604 40 23231 8498871 0.27 8522102 41 22828 8485766 0.27 8508594 42 23032 8488563 0.27 8511595 43 22875 8474970 0.27 8497845 44 22663 8455524 0.27 8478187 45 22589 8436160 0.27 8458749 46 22286 8430190 0.26 8452476 47 22782 8442323 0.27 8465105 48 22614 8442698 0.27 8465312 49 22904 8479127 0.27 8502031 50 22929 8507789 0.27 8530718 51 22474 8504751 0.26 8527225 52 22826 8522765 0.27 8545591 53 22931 8521544 0.27 8544475 54 22967 8501856 0.27 8524823 55 22470 8488618 0.26 8511088 56 23075 8482926 0.27 8506001 57 23053 8457160 0.27 8480213 58 22850 8464031 0.27 8486881 59 22370 8457796 0.26 8480166 60 22493 8493828 0.26 8516321 61 22833 8519197 0.27 8542030 62 22902 8531332 0.27 8554234 63 22816 8528839 0.27 8551655 64 22708 8530966 0.27 8553674 65 22816 8519251 0.27 8542067 66 22442 8520220 0.26 8542662 67 22838 8521981 0.27 8544819 68 22646 8524855 0.26 8547501 69 22501 8499264 0.26 8521765 70 22722 8542041 0.27 8564763 71 22544 8549479 0.26 8572023 72 22864 8538774 0.27 8561638 73 22621 8538230 0.26 8560851 74 22745 8533497 0.27 8556242 75 22417 8514273 0.26 8536690 76 22517 8530883 0.26 8553400 77 22469 8521281 0.26 8543750 78 22795 8516466 0.27 8539261 79 22806 8524474 0.27 8547280 80 22700 8528238 0.27 8550938 81 22877 8537176 0.27 8560053 82 22891 8557610 0.27 8580501 83 22584 8560334 0.26 8582918 84 22696 8543643 0.26 8566339 85 22535 8539837 0.26 8562372 86 22176 8516085 0.26 8538261 87 22170 8498201 0.26 8520371 88 22415 8509165 0.26 8531580 89 22289 8520350 0.26 8542639 90 22463 8542713 0.26 8565176 91 22303 8558125 0.26 8580428 92 22247 8544037 0.26 8566284 93 22276 8550697 0.26 8572973 94 22438 8558061 0.26 8580499 95 22558 8545613 0.26 8568171 96 22355 8520232 0.26 8542587 97 22188 8519028 0.26 8541216 98 22275 8523229 0.26 8545504 99 22647 8520874 0.27 8543521 100 22326 8546457 0.26 8568783 101 22401 8546513 0.26 8568914 102 22129 8538422 0.26 8560551 103 22082 8532491 0.26 8554573 104 22236 8537147 0.26 8559383 105 22060 8517320 0.26 8539380 106 22125 8522185 0.26 8544310 107 21872 8492202 0.26 8514074 108 21832 8457861 0.26 8479693 109 21682 8483361 0.25 8505043 110 21930 8494486 0.26 8516416 111 21587 8498533 0.25 8520120 112 21776 8503929 0.26 8525705 113 22097 8510654 0.26 8532751 114 22068 8489879 0.26 8511947 115 21897 8491925 0.26 8513822 116 21937 8485383 0.26 8507320 117 22049 8461488 0.26 8483537 118 21862 8461423 0.26 8483285 119 21734 8437138 0.26 8458872 120 21984 8432696 0.26 8454680 121 21956 8436693 0.26 8458649 122 21760 8449320 0.26 8471080 123 21755 8441986 0.26 8463741 124 22000 8446077 0.26 8468077 125 21800 8434420 0.26 8456220 126 21718 8412058 0.26 8433776 127 21850 8407374 0.26 8429224 128 21698 8386133 0.26 8407831 129 21754 8371914 0.26 8393668 130 21674 8370093 0.26 8391767 131 21458 8361056 0.26 8382514 132 21647 8352595 0.26 8374242 133 22056 8357136 0.26 8379192 134 21908 8364259 0.26 8386167 135 22419 8351652 0.27 8374071 136 21917 8331070 0.26 8352987 137 21968 8319676 0.26 8341644 138 21754 8315553 0.26 8337307 139 21805 8302829 0.26 8324634 140 21707 8287861 0.26 8309568 141 22079 8259675 0.27 8281754 142 22185 8256340 0.27 8278525 143 22441 8248945 0.27 8271386 144 22571 8237609 0.27 8260180 145 23213 8243754 0.28 8266967 146 23832 8254621 0.29 8278453 147 24195 8230031 0.29 8254226 148 24376 8207278 0.30 8231654 149 23601 8124482 0.29 8148083 150 20820 7630472 0.27 7651292 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3673 1347099 0.27 1350772 2 42979 1375320 3.03 1418299 3 87976 1222681 6.71 1310657 4 75113 1054861 6.65 1129974 5 83166 1197756 6.49 1280922 6 96422 1367973 6.58 1464395 7 103771 1405297 6.88 1509068 8 96465 1207683 7.40 1304148 9 99065 1214762 7.54 1313827 10 101542 1208961 7.75 1310503 11 102578 1197665 7.89 1300243 12 104144 1205092 7.95 1309236 13 107026 1192896 8.23 1299922 14 107362 1190377 8.27 1297739 15 108841 1200285 8.31 1309126 16 109411 1190810 8.41 1300221 17 110611 1203453 8.42 1314064 18 111581 1206781 8.46 1318362 19 113565 1212369 8.56 1325934 20 113663 1212458 8.57 1326121 21 114722 1203891 8.70 1318613 22 114215 1197130 8.71 1311345 23 116075 1190575 8.88 1306650 24 115408 1179130 8.91 1294538 25 115354 1170111 8.97 1285465 26 116302 1174873 9.01 1291175 27 117310 1185228 9.01 1302538 28 117134 1183233 9.01 1300367 29 117353 1180372 9.04 1297725 30 118316 1188557 9.05 1306873 31 118811 1173648 9.19 1292459 32 119020 1172030 9.22 1291050 33 119581 1169384 9.28 1288965 34 119383 1158369 9.34 1277752 35 119257 1152546 9.38 1271803 36 119804 1150191 9.43 1269995 37 120433 1152446 9.46 1272879 38 120531 1152830 9.47 1273361 39 120613 1155267 9.45 1275880 40 121289 1153118 9.52 1274407 41 122233 1150625 9.60 1272858 42 121843 1149408 9.58 1271251 43 122721 1147001 9.67 1269722 44 122200 1137259 9.70 1259459 45 121782 1127669 9.75 1249451 46 121765 1121159 9.80 1242924 47 122288 1123013 9.82 1245301 48 122250 1127379 9.78 1249629 49 123128 1127066 9.85 1250194 50 123011 1124218 9.86 1247229 51 122484 1118506 9.87 1240990 52 122718 1111318 9.94 1234036 53 122852 1112189 9.95 1235041 54 123607 1109370 10.03 1232977 55 124036 1100597 10.13 1224633 56 123006 1097843 10.08 1220849 57 123147 1095475 10.11 1218622 58 122881 1092671 10.11 1215552 59 123972 1093085 10.19 1217057 60 122141 1085181 10.12 1207322 61 123371 1086588 10.20 1209959 62 122663 1084048 10.17 1206711 63 122942 1083134 10.19 1206076 64 123130 1078911 10.24 1202041 65 123637 1072376 10.34 1196013 66 122298 1069036 10.27 1191334 67 123198 1063464 10.38 1186662 68 122628 1062461 10.35 1185089 69 122272 1059675 10.34 1181947 70 122131 1054283 10.38 1176414 71 122530 1054615 10.41 1177145 72 122141 1052661 10.40 1174802 73 121895 1050556 10.40 1172451 74 122734 1044443 10.52 1167177 75 122516 1038226 10.55 1160742 76 121843 1031941 10.56 1153784 77 121563 1030224 10.55 1151787 78 121566 1029049 10.57 1150615 79 121044 1027860 10.54 1148904 80 121336 1027357 10.56 1148693 81 120693 1021159 10.57 1141852 82 121124 1018582 10.63 1139706 83 120843 1016380 10.63 1137223 84 120216 1009361 10.64 1129577 85 119913 1006710 10.64 1126623 86 120069 1001287 10.71 1121356 87 119520 997118 10.70 1116638 88 119425 996386 10.70 1115811 89 119485 992187 10.75 1111672 90 118977 990754 10.72 1109731 91 117944 987024 10.67 1104968 92 119385 987294 10.79 1106679 93 118795 984552 10.77 1103347 94 117550 975797 10.75 1093347 95 118086 973235 10.82 1091321 96 116836 969746 10.75 1086582 97 116976 959396 10.87 1076372 98 117594 960148 10.91 1077742 99 116655 959089 10.84 1075744 100 115964 956433 10.81 1072397 101 115461 952238 10.81 1067699 102 114657 949027 10.78 1063684 103 115268 944490 10.88 1059758 104 114574 940813 10.86 1055387 105 114079 936986 10.85 1051065 106 113995 931884 10.90 1045879 107 113911 926266 10.95 1040177 108 112910 919396 10.94 1032306 109 111881 914900 10.90 1026781 110 112211 913354 10.94 1025565 111 112045 913644 10.92 1025689 112 111328 909956 10.90 1021284 113 111576 905839 10.97 1017415 114 110951 903458 10.94 1014409 115 110794 896738 11.00 1007532 116 110659 891876 11.04 1002535 117 108844 886236 10.94 995080 118 108837 882275 10.98 991112 119 108510 881378 10.96 989888 120 108010 876613 10.97 984623 121 107671 872056 10.99 979727 122 107487 871853 10.98 979340 123 106818 869083 10.95 975901 124 106187 862826 10.96 969013 125 105744 859078 10.96 964822 126 105872 853004 11.04 958876 127 105220 846726 11.05 951946 128 104352 841364 11.03 945716 129 103992 836456 11.06 940448 130 103194 831342 11.04 934536 131 102853 828927 11.04 931780 132 102779 826237 11.06 929016 133 101921 821735 11.03 923656 134 101161 816474 11.02 917635 135 100831 814275 11.02 915106 136 100407 808391 11.05 908798 137 99964 803548 11.06 903512 138 99067 799553 11.02 898620 139 98561 794090 11.04 892651 140 97921 786402 11.07 884323 141 98256 783308 11.15 881564 142 96983 778933 11.07 875916 143 96748 777400 11.07 874148 144 96444 771663 11.11 868107 145 95587 767080 11.08 862667 146 94380 759271 11.06 853651 147 94193 751639 11.14 845832 148 93267 736473 11.24 829740 149 90534 652735 12.18 743269 150 78989 0 100.00 78989 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3196 2051722 0.16 2054918 2 3397 1394253 0.24 1397650 3 13637 4177166 0.33 4190803 4 13201 1632108 0.80 1645309 5 4403 1485447 0.30 1489850 6 4852 1759942 0.27 1764794 7 5832 2090717 0.28 2096549 8 5611 1967728 0.28 1973339 9 5256 1782637 0.29 1787893 10 4893 1796539 0.27 1801432 11 4812 1785088 0.27 1789900 12 4870 1776107 0.27 1780977 13 4929 1780604 0.28 1785533 14 4864 1772831 0.27 1777695 15 4940 1793369 0.27 1798309 16 4847 1785166 0.27 1790013 17 4919 1771962 0.28 1776881 18 5058 1800623 0.28 1805681 19 4960 1795747 0.28 1800707 20 5031 1780045 0.28 1785076 21 4874 1796081 0.27 1800955 22 4835 1774577 0.27 1779412 23 4917 1780095 0.28 1785012 24 4828 1780705 0.27 1785533 25 4984 1771501 0.28 1776485 26 4866 1763733 0.28 1768599 27 4904 1777081 0.28 1781985 28 4901 1774119 0.28 1779020 29 5071 1762904 0.29 1767975 30 4979 1778830 0.28 1783809 31 5002 1765997 0.28 1770999 32 4858 1751958 0.28 1756816 33 4976 1759271 0.28 1764247 34 4889 1751122 0.28 1756011 35 5005 1749366 0.29 1754371 36 4879 1753196 0.28 1758075 37 4929 1741520 0.28 1746449 38 5135 1738709 0.29 1743844 39 4990 1748388 0.28 1753378 40 4958 1734738 0.28 1739696 41 4942 1732027 0.28 1736969 42 5031 1730109 0.29 1735140 43 4994 1727203 0.29 1732197 44 4966 1717918 0.29 1722884 45 5241 1729042 0.30 1734283 46 5097 1716404 0.30 1721501 47 4924 1703459 0.29 1708383 48 4934 1713655 0.29 1718589 49 4826 1706817 0.28 1711643 50 4857 1701029 0.28 1705886 51 5010 1703092 0.29 1708102 52 4835 1687512 0.29 1692347 53 4969 1685922 0.29 1690891 54 4790 1689362 0.28 1694152 55 4776 1689292 0.28 1694068 56 4972 1680460 0.29 1685432 57 4601 1680901 0.27 1685502 58 4856 1675550 0.29 1680406 59 4840 1665688 0.29 1670528 60 4652 1662193 0.28 1666845 61 4840 1661246 0.29 1666086 62 4654 1647961 0.28 1652615 63 4651 1649196 0.28 1653847 64 4623 1647935 0.28 1652558 65 4826 1637782 0.29 1642608 66 4650 1646388 0.28 1651038 67 4726 1641835 0.29 1646561 68 4807 1631339 0.29 1636146 69 4873 1634146 0.30 1639019 70 4812 1622373 0.30 1627185 71 4736 1610645 0.29 1615381 72 4748 1615899 0.29 1620647 73 4677 1611658 0.29 1616335 74 4812 1605865 0.30 1610677 75 4703 1603229 0.29 1607932 76 4829 1599622 0.30 1604451 77 4743 1593685 0.30 1598428 78 4714 1593004 0.30 1597718 79 4695 1587776 0.29 1592471 80 4627 1585556 0.29 1590183 81 4774 1580552 0.30 1585326 82 4568 1569400 0.29 1573968 83 4587 1558789 0.29 1563376 84 4675 1557511 0.30 1562186 85 4486 1557596 0.29 1562082 86 4644 1546355 0.30 1550999 87 4509 1553380 0.29 1557889 88 4517 1538806 0.29 1543323 89 4496 1533499 0.29 1537995 90 4438 1532288 0.29 1536726 91 4461 1526728 0.29 1531189 92 4385 1517946 0.29 1522331 93 4448 1520141 0.29 1524589 94 4430 1511855 0.29 1516285 95 4441 1501282 0.29 1505723 96 4340 1501210 0.29 1505550 97 4341 1495673 0.29 1500014 98 4345 1481664 0.29 1486009 99 4357 1490094 0.29 1494451 100 4309 1481935 0.29 1486244 101 4285 1472602 0.29 1476887 102 4279 1472161 0.29 1476440 103 4221 1462623 0.29 1466844 104 4258 1448992 0.29 1453250 105 4387 1450721 0.30 1455108 106 4219 1439693 0.29 1443912 107 4355 1435717 0.30 1440072 108 4231 1434773 0.29 1439004 109 4282 1426758 0.30 1431040 110 4264 1411124 0.30 1415388 111 4287 1416885 0.30 1421172 112 4178 1409893 0.30 1414071 113 4242 1399782 0.30 1404024 114 4216 1396531 0.30 1400747 115 4123 1392119 0.30 1396242 116 4138 1380503 0.30 1384641 117 4061 1378317 0.29 1382378 118 4117 1364119 0.30 1368236 119 4168 1362053 0.31 1366221 120 4145 1364125 0.30 1368270 121 3972 1353067 0.29 1357039 122 4050 1343638 0.30 1347688 123 4081 1343153 0.30 1347234 124 4096 1332889 0.31 1336985 125 4025 1323192 0.30 1327217 126 4002 1323089 0.30 1327091 127 3993 1311035 0.30 1315028 128 4056 1296450 0.31 1300506 129 3968 1297356 0.30 1301324 130 4046 1288739 0.31 1292785 131 3945 1279998 0.31 1283943 132 3910 1276180 0.31 1280090 133 4035 1268635 0.32 1272670 134 3987 1256263 0.32 1260250 135 3975 1254382 0.32 1258357 136 4040 1245818 0.32 1249858 137 3931 1239804 0.32 1243735 138 3969 1234562 0.32 1238531 139 3930 1225435 0.32 1229365 140 3912 1213800 0.32 1217712 141 3933 1216240 0.32 1220173 142 4055 1204723 0.34 1208778 143 3788 1195207 0.32 1198995 144 3955 1193134 0.33 1197089 145 3900 1178990 0.33 1182890 146 3918 1165298 0.34 1169216 147 3927 1159124 0.34 1163051 148 3788 1136788 0.33 1140576 149 3492 1024790 0.34 1028282 150 2310 0 100.00 2310 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 13717 9543350 0.14 9557067 2 16227 7149265 0.23 7165492 3 22961 9751570 0.23 9774531 4 24401 9480496 0.26 9504897 5 19099 8131707 0.23 8150806 6 17513 7443661 0.23 7461174 7 18639 7823173 0.24 7841812 8 18495 7729435 0.24 7747930 9 18485 7786395 0.24 7804880 10 18394 7799305 0.24 7817699 11 18508 7827875 0.24 7846383 12 18805 7856378 0.24 7875183 13 18942 7806243 0.24 7825185 14 18315 7784663 0.23 7802978 15 18619 7818773 0.24 7837392 16 18556 7850615 0.24 7869171 17 18770 7882908 0.24 7901678 18 18989 7861739 0.24 7880728 19 19250 7853344 0.24 7872594 20 18916 7816242 0.24 7835158 21 18795 7811972 0.24 7830767 22 18863 7735865 0.24 7754728 23 18900 7706909 0.24 7725809 24 18776 7682194 0.24 7700970 25 18828 7689716 0.24 7708544 26 19274 7686293 0.25 7705567 27 19043 7728431 0.25 7747474 28 19233 7742510 0.25 7761743 29 19231 7710143 0.25 7729374 30 19298 7695245 0.25 7714543 31 19251 7674082 0.25 7693333 32 19272 7615359 0.25 7634631 33 19020 7595743 0.25 7614763 34 18859 7542805 0.25 7561664 35 19031 7542208 0.25 7561239 36 19002 7556591 0.25 7575593 37 18831 7561539 0.25 7580370 38 19212 7582199 0.25 7601411 39 19388 7572507 0.26 7591895 40 19237 7560018 0.25 7579255 41 19256 7540002 0.25 7559258 42 19006 7515623 0.25 7534629 43 19121 7480311 0.25 7499432 44 18872 7439911 0.25 7458783 45 18743 7427099 0.25 7445842 46 18791 7413035 0.25 7431826 47 19166 7415325 0.26 7434491 48 19060 7435329 0.26 7454389 49 19044 7433287 0.26 7452331 50 19144 7423919 0.26 7443063 51 18546 7388990 0.25 7407536 52 18936 7359898 0.26 7378834 53 18645 7335141 0.25 7353786 54 18886 7311449 0.26 7330335 55 18433 7290483 0.25 7308916 56 18754 7274324 0.26 7293078 57 18329 7268246 0.25 7286575 58 18473 7264278 0.25 7282751 59 18762 7255551 0.26 7274313 60 18724 7239642 0.26 7258366 61 18395 7237257 0.25 7255652 62 18584 7203566 0.26 7222150 63 18229 7177455 0.25 7195684 64 18064 7157013 0.25 7175077 65 18163 7114149 0.25 7132312 66 18036 7106986 0.25 7125022 67 18220 7111024 0.26 7129244 68 18224 7076758 0.26 7094982 69 17923 7058615 0.25 7076538 70 18023 7042313 0.26 7060336 71 18030 7028409 0.26 7046439 72 18087 7015723 0.26 7033810 73 17886 7003293 0.25 7021179 74 17610 6956594 0.25 6974204 75 17700 6936144 0.25 6953844 76 17812 6928296 0.26 6946108 77 17432 6909723 0.25 6927155 78 17888 6902707 0.26 6920595 79 17811 6899962 0.26 6917773 80 17255 6873165 0.25 6890420 81 17198 6867138 0.25 6884336 82 17115 6836529 0.25 6853644 83 17018 6802736 0.25 6819754 84 16930 6767980 0.25 6784910 85 16736 6748043 0.25 6764779 86 16534 6733892 0.24 6750426 87 16887 6723942 0.25 6740829 88 16892 6710555 0.25 6727447 89 16877 6700504 0.25 6717381 90 16606 6688367 0.25 6704973 91 17074 6656875 0.26 6673949 92 16592 6634837 0.25 6651429 93 16761 6612422 0.25 6629183 94 16415 6588894 0.25 6605309 95 16204 6525769 0.25 6541973 96 16324 6508415 0.25 6524739 97 16196 6496441 0.25 6512637 98 16166 6474943 0.25 6491109 99 16201 6472388 0.25 6488589 100 15850 6455493 0.24 6471343 101 16042 6421652 0.25 6437694 102 16041 6414019 0.25 6430060 103 15891 6380468 0.25 6396359 104 15910 6351080 0.25 6366990 105 15809 6324800 0.25 6340609 106 15597 6281300 0.25 6296897 107 15561 6254437 0.25 6269998 108 15746 6232407 0.25 6248153 109 15675 6218622 0.25 6234297 110 15511 6205921 0.25 6221432 111 15315 6198884 0.25 6214199 112 15265 6168498 0.25 6183763 113 15379 6137508 0.25 6152887 114 15018 6109851 0.25 6124869 115 15369 6068790 0.25 6084159 116 14986 6033584 0.25 6048570 117 15149 6004515 0.25 6019664 118 14926 5983562 0.25 5998488 119 15052 5951226 0.25 5966278 120 14925 5944241 0.25 5959166 121 14809 5923759 0.25 5938568 122 14895 5893228 0.25 5908123 123 14963 5870739 0.25 5885702 124 14772 5838251 0.25 5853023 125 15039 5799741 0.26 5814780 126 14763 5763185 0.26 5777948 127 14661 5733914 0.26 5748575 128 14711 5690914 0.26 5705625 129 14723 5679029 0.26 5693752 130 14354 5649447 0.25 5663801 131 14446 5628939 0.26 5643385 132 14527 5609697 0.26 5624224 133 14612 5575304 0.26 5589916 134 14689 5542682 0.26 5557371 135 15036 5510564 0.27 5525600 136 14578 5478171 0.27 5492749 137 14565 5439976 0.27 5454541 138 14736 5417038 0.27 5431774 139 14500 5373344 0.27 5387844 140 14577 5345121 0.27 5359698 141 14514 5323970 0.27 5338484 142 14283 5293160 0.27 5307443 143 14574 5260439 0.28 5275013 144 14745 5222569 0.28 5237314 145 14571 5185788 0.28 5200359 146 14647 5138945 0.28 5153592 147 15075 5088661 0.30 5103736 148 14679 5012288 0.29 5026967 149 13515 4522067 0.30 4535582 150 8883 0 100.00 8883