CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 97090 583679 14.26 680769 2 114484 759686 13.10 874170 3 93798 766882 10.90 860680 4 105225 823978 11.32 929203 5 117195 899707 11.52 1016902 6 120610 928047 11.50 1048657 7 111501 804164 12.18 915665 8 111862 818886 12.02 930748 9 110693 820301 11.89 930994 10 109182 814841 11.82 924023 11 110938 825848 11.84 936786 12 112237 820379 12.03 932616 13 111808 818776 12.01 930584 14 112878 827452 12.00 940330 15 112773 820587 12.08 933360 16 113126 829106 12.01 942232 17 113376 833004 11.98 946380 18 114480 840466 11.99 954946 19 114310 840747 11.97 955057 20 114817 839282 12.03 954099 21 114444 838852 12.01 953296 22 116137 835609 12.20 951746 23 115019 833699 12.12 948718 24 115197 829117 12.20 944314 25 113879 828284 12.09 942163 26 114140 839063 11.97 953203 27 114887 843841 11.98 958728 28 114882 842497 12.00 957379 29 115729 845338 12.04 961067 30 115455 844051 12.03 959506 31 115507 842266 12.06 957773 32 115303 844106 12.02 959409 33 115806 842270 12.09 958076 34 115446 839648 12.09 955094 35 114873 837065 12.07 951938 36 115515 842238 12.06 957753 37 115161 844189 12.00 959350 38 115662 846555 12.02 962217 39 115486 848843 11.98 964329 40 115612 849206 11.98 964818 41 115541 852295 11.94 967836 42 116356 850528 12.03 966884 43 115830 844157 12.07 959987 44 114848 842896 11.99 957744 45 115428 843653 12.04 959081 46 115318 844496 12.01 959814 47 115728 849751 11.99 965479 48 116043 852658 11.98 968701 49 115753 850513 11.98 966266 50 114755 850791 11.88 965546 51 115318 850728 11.94 966046 52 115721 850665 11.97 966386 53 115830 851557 11.97 967387 54 115791 850298 11.99 966089 55 114726 847998 11.92 962724 56 114960 849904 11.91 964864 57 115635 850059 11.97 965694 58 115729 851064 11.97 966793 59 114471 848292 11.89 962763 60 115380 852233 11.92 967613 61 115228 852519 11.91 967747 62 115076 856386 11.85 971462 63 115313 853320 11.90 968633 64 114949 851044 11.90 965993 65 114576 849282 11.89 963858 66 114575 851384 11.86 965959 67 114588 852686 11.85 967274 68 113960 852628 11.79 966588 69 114402 852323 11.83 966725 70 115484 851742 11.94 967226 71 114500 852695 11.84 967195 72 114553 856380 11.80 970933 73 114742 851896 11.87 966638 74 113471 849398 11.78 962869 75 113836 849506 11.82 963342 76 114007 850578 11.82 964585 77 113650 850558 11.79 964208 78 113811 855138 11.75 968949 79 114050 856642 11.75 970692 80 114138 853858 11.79 967996 81 114000 853811 11.78 967811 82 114389 853999 11.81 968388 83 113417 852373 11.74 965790 84 113888 852652 11.78 966540 85 112808 850836 11.71 963644 86 113438 851293 11.76 964731 87 113382 852765 11.74 966147 88 113272 849916 11.76 963188 89 113497 852935 11.74 966432 90 112591 854172 11.65 966763 91 112699 855298 11.64 967997 92 112734 855894 11.64 968628 93 112407 850581 11.67 962988 94 112688 853036 11.67 965724 95 112311 853919 11.62 966230 96 111646 849887 11.61 961533 97 112428 850460 11.68 962888 98 111373 853105 11.55 964478 99 111928 854349 11.58 966277 100 111238 851031 11.56 962269 101 110805 850269 11.53 961074 102 110452 849385 11.51 959837 103 110500 850060 11.50 960560 104 110535 850811 11.50 961346 105 110686 849239 11.53 959925 106 110444 848557 11.52 959001 107 109916 846140 11.50 956056 108 109724 845072 11.49 954796 109 109587 846511 11.46 956098 110 109589 848944 11.43 958533 111 109682 848251 11.45 957933 112 109029 846421 11.41 955450 113 109219 849130 11.40 958349 114 109412 845191 11.46 954603 115 108235 846334 11.34 954569 116 108734 842609 11.43 951343 117 107695 841849 11.34 949544 118 107923 841697 11.36 949620 119 107581 845270 11.29 952851 120 107018 842103 11.28 949121 121 107465 842259 11.32 949724 122 107022 843741 11.26 950763 123 106802 842925 11.25 949727 124 106991 842592 11.27 949583 125 105957 839842 11.20 945799 126 105955 838897 11.21 944852 127 105540 836617 11.20 942157 128 105459 837347 11.19 942806 129 104554 833940 11.14 938494 130 104954 832849 11.19 937803 131 104455 835059 11.12 939514 132 103943 834741 11.07 938684 133 104032 831297 11.12 935329 134 103897 834675 11.07 938572 135 104496 832380 11.15 936876 136 102087 829992 10.95 932079 137 103089 829211 11.06 932300 138 102406 829019 10.99 931425 139 102665 828498 11.03 931163 140 101984 828078 10.97 930062 141 101631 825708 10.96 927339 142 101870 823814 11.00 925684 143 100963 823093 10.93 924056 144 100269 821216 10.88 921485 145 100284 820321 10.89 920605 146 100516 821912 10.90 922428 147 99400 822188 10.79 921588 148 98857 817393 10.79 916250 149 95843 815409 10.52 911252 150 83921 750257 10.06 834178 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2612 2097135 0.12 2099747 2 3025 1092036 0.28 1095061 3 2436 1145511 0.21 1147947 4 2743 1290379 0.21 1293122 5 3462 1464825 0.24 1468287 6 3341 1382137 0.24 1385478 7 3285 1274674 0.26 1277959 8 3156 1296209 0.24 1299365 9 3324 1284800 0.26 1288124 10 3200 1277247 0.25 1280447 11 3185 1286128 0.25 1289313 12 3263 1287295 0.25 1290558 13 3398 1289121 0.26 1292519 14 3400 1289997 0.26 1293397 15 3441 1281691 0.27 1285132 16 3513 1293923 0.27 1297436 17 3651 1296811 0.28 1300462 18 3667 1292106 0.28 1295773 19 3514 1301378 0.27 1304892 20 3649 1294497 0.28 1298146 21 3669 1296532 0.28 1300201 22 3619 1300771 0.28 1304390 23 3708 1298682 0.28 1302390 24 3767 1297188 0.29 1300955 25 3575 1300809 0.27 1304384 26 3695 1307815 0.28 1311510 27 3642 1305075 0.28 1308717 28 3727 1317413 0.28 1321140 29 3832 1313189 0.29 1317021 30 3746 1307777 0.29 1311523 31 3637 1312623 0.28 1316260 32 3865 1314811 0.29 1318676 33 3696 1316819 0.28 1320515 34 3931 1312778 0.30 1316709 35 3815 1313945 0.29 1317760 36 3871 1318187 0.29 1322058 37 3904 1316681 0.30 1320585 38 3869 1313050 0.29 1316919 39 3740 1317323 0.28 1321063 40 3989 1318668 0.30 1322657 41 3852 1321728 0.29 1325580 42 3904 1313740 0.30 1317644 43 3776 1323152 0.28 1326928 44 3817 1320864 0.29 1324681 45 3761 1315991 0.28 1319752 46 3755 1323345 0.28 1327100 47 3761 1325119 0.28 1328880 48 3813 1320643 0.29 1324456 49 3682 1322304 0.28 1325986 50 3837 1321869 0.29 1325706 51 3913 1324126 0.29 1328039 52 3774 1325054 0.28 1328828 53 3846 1330464 0.29 1334310 54 3531 1324298 0.27 1327829 55 3689 1329047 0.28 1332736 56 3843 1330408 0.29 1334251 57 3732 1326583 0.28 1330315 58 3711 1320074 0.28 1323785 59 3767 1326590 0.28 1330357 60 3750 1323289 0.28 1327039 61 3810 1327931 0.29 1331741 62 3849 1327667 0.29 1331516 63 3792 1327388 0.28 1331180 64 3779 1332421 0.28 1336200 65 3796 1335579 0.28 1339375 66 3804 1329386 0.29 1333190 67 3833 1334120 0.29 1337953 68 3887 1332723 0.29 1336610 69 3914 1326610 0.29 1330524 70 3729 1328249 0.28 1331978 71 3779 1332962 0.28 1336741 72 3878 1332535 0.29 1336413 73 3844 1330139 0.29 1333983 74 3905 1332899 0.29 1336804 75 3836 1333280 0.29 1337116 76 3925 1333709 0.29 1337634 77 3790 1333591 0.28 1337381 78 3936 1333945 0.29 1337881 79 3666 1333627 0.27 1337293 80 3857 1335737 0.29 1339594 81 3829 1331482 0.29 1335311 82 3819 1332837 0.29 1336656 83 3880 1335915 0.29 1339795 84 3794 1332315 0.28 1336109 85 3792 1336244 0.28 1340036 86 3853 1335683 0.29 1339536 87 3808 1330362 0.29 1334170 88 3877 1329805 0.29 1333682 89 3779 1335035 0.28 1338814 90 3998 1328818 0.30 1332816 91 3738 1337077 0.28 1340815 92 3907 1334491 0.29 1338398 93 3826 1329990 0.29 1333816 94 3893 1330582 0.29 1334475 95 3848 1331057 0.29 1334905 96 3782 1326012 0.28 1329794 97 3913 1329766 0.29 1333679 98 3887 1331360 0.29 1335247 99 3758 1327905 0.28 1331663 100 3867 1330150 0.29 1334017 101 3821 1329518 0.29 1333339 102 3796 1323712 0.29 1327508 103 3718 1330081 0.28 1333799 104 3783 1323885 0.28 1327668 105 3903 1322530 0.29 1326433 106 3846 1324288 0.29 1328134 107 3736 1323376 0.28 1327112 108 3755 1318571 0.28 1322326 109 3731 1322520 0.28 1326251 110 3779 1322201 0.28 1325980 111 3667 1318273 0.28 1321940 112 3800 1319785 0.29 1323585 113 3790 1319802 0.29 1323592 114 3741 1317637 0.28 1321378 115 3735 1316687 0.28 1320422 116 3613 1313850 0.27 1317463 117 3648 1316266 0.28 1319914 118 3649 1318751 0.28 1322400 119 3815 1317808 0.29 1321623 120 3723 1311507 0.28 1315230 121 3715 1314259 0.28 1317974 122 3659 1311060 0.28 1314719 123 3647 1309670 0.28 1313317 124 3697 1310094 0.28 1313791 125 3807 1305787 0.29 1309594 126 3721 1301720 0.29 1305441 127 3636 1303182 0.28 1306818 128 3627 1298280 0.28 1301907 129 3645 1295771 0.28 1299416 130 3812 1297829 0.29 1301641 131 3665 1297589 0.28 1301254 132 3802 1294501 0.29 1298303 133 3544 1294605 0.27 1298149 134 3615 1294049 0.28 1297664 135 3749 1291654 0.29 1295403 136 3639 1288723 0.28 1292362 137 3597 1288783 0.28 1292380 138 3665 1285355 0.28 1289020 139 3610 1287120 0.28 1290730 140 3703 1284735 0.29 1288438 141 3640 1280192 0.28 1283832 142 3738 1280179 0.29 1283917 143 3649 1275620 0.29 1279269 144 3670 1272770 0.29 1276440 145 3973 1278008 0.31 1281981 146 4270 1275027 0.33 1279297 147 4247 1267932 0.33 1272179 148 4256 1269019 0.33 1273275 149 4037 1258682 0.32 1262719 150 3639 1137734 0.32 1141373 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 8050 5410268 0.15 5418318 2 9403 4399142 0.21 4408545 3 10038 5079594 0.20 5089632 4 10780 5951028 0.18 5961808 5 11729 6444025 0.18 6455754 6 11944 6415148 0.19 6427092 7 11135 5860734 0.19 5871869 8 11212 5835313 0.19 5846525 9 10961 5708664 0.19 5719625 10 11012 5634028 0.20 5645040 11 11450 5671324 0.20 5682774 12 11412 5654152 0.20 5665564 13 11796 5609227 0.21 5621023 14 11849 5620648 0.21 5632497 15 12053 5600597 0.21 5612650 16 12106 5639302 0.21 5651408 17 12142 5649200 0.21 5661342 18 12282 5675078 0.22 5687360 19 12640 5673352 0.22 5685992 20 12601 5667165 0.22 5679766 21 12844 5650164 0.23 5663008 22 12679 5648016 0.22 5660695 23 12637 5648771 0.22 5661408 24 12631 5646054 0.22 5658685 25 12705 5629153 0.23 5641858 26 12753 5641451 0.23 5654204 27 13010 5659809 0.23 5672819 28 13092 5678920 0.23 5692012 29 13072 5693959 0.23 5707031 30 13266 5701306 0.23 5714572 31 13281 5709937 0.23 5723218 32 13426 5687952 0.24 5701378 33 13236 5682068 0.23 5695304 34 13202 5672792 0.23 5685994 35 13284 5668537 0.23 5681821 36 13252 5666951 0.23 5680203 37 13334 5666691 0.23 5680025 38 13239 5682798 0.23 5696037 39 13290 5700772 0.23 5714062 40 13462 5706151 0.24 5719613 41 13230 5700392 0.23 5713622 42 13381 5700193 0.23 5713574 43 13247 5692114 0.23 5705361 44 13154 5684291 0.23 5697445 45 12972 5682480 0.23 5695452 46 12813 5680247 0.23 5693060 47 13145 5685433 0.23 5698578 48 13181 5685364 0.23 5698545 49 13659 5706893 0.24 5720552 50 13590 5718056 0.24 5731646 51 13391 5714235 0.23 5727626 52 13282 5719864 0.23 5733146 53 13137 5725625 0.23 5738762 54 13488 5720319 0.24 5733807 55 13138 5703380 0.23 5716518 56 13337 5699512 0.23 5712849 57 13084 5688055 0.23 5701139 58 13310 5702463 0.23 5715773 59 13216 5698766 0.23 5711982 60 13140 5720517 0.23 5733657 61 13274 5727079 0.23 5740353 62 13528 5728873 0.24 5742401 63 13456 5733926 0.23 5747382 64 13353 5732779 0.23 5746132 65 13082 5726544 0.23 5739626 66 13199 5725865 0.23 5739064 67 13079 5732114 0.23 5745193 68 13321 5730486 0.23 5743807 69 13142 5718498 0.23 5731640 70 13300 5738654 0.23 5751954 71 13501 5750232 0.23 5763733 72 13360 5744075 0.23 5757435 73 13150 5737851 0.23 5751001 74 13576 5730309 0.24 5743885 75 13120 5727430 0.23 5740550 76 13130 5733542 0.23 5746672 77 13386 5731392 0.23 5744778 78 13425 5730608 0.23 5744033 79 13525 5732311 0.24 5745836 80 13273 5729184 0.23 5742457 81 13700 5741313 0.24 5755013 82 13487 5753026 0.23 5766513 83 13268 5749561 0.23 5762829 84 13410 5740909 0.23 5754319 85 13165 5737337 0.23 5750502 86 13257 5727976 0.23 5741233 87 13013 5717339 0.23 5730352 88 13056 5722776 0.23 5735832 89 13218 5727103 0.23 5740321 90 13192 5738857 0.23 5752049 91 13311 5742103 0.23 5755414 92 13252 5739819 0.23 5753071 93 13161 5741488 0.23 5754649 94 13174 5751185 0.23 5764359 95 13416 5741358 0.23 5754774 96 13233 5731222 0.23 5744455 97 13082 5725444 0.23 5738526 98 13126 5727841 0.23 5740967 99 13148 5729645 0.23 5742793 100 13365 5739615 0.23 5752980 101 13120 5740082 0.23 5753202 102 12938 5734993 0.23 5747931 103 12914 5735782 0.22 5748696 104 13017 5730880 0.23 5743897 105 13004 5722973 0.23 5735977 106 13014 5720437 0.23 5733451 107 12970 5715312 0.23 5728282 108 13210 5698530 0.23 5711740 109 12957 5706875 0.23 5719832 110 13031 5712788 0.23 5725819 111 12855 5713407 0.22 5726262 112 13030 5713293 0.23 5726323 113 12809 5718460 0.22 5731269 114 13120 5704286 0.23 5717406 115 13046 5704874 0.23 5717920 116 12978 5705543 0.23 5718521 117 13101 5694301 0.23 5707402 118 13166 5692281 0.23 5705447 119 12887 5679312 0.23 5692199 120 13031 5674185 0.23 5687216 121 13193 5676692 0.23 5689885 122 13108 5675570 0.23 5688678 123 12969 5671738 0.23 5684707 124 12951 5671835 0.23 5684786 125 13167 5660252 0.23 5673419 126 12772 5654647 0.23 5667419 127 13121 5653244 0.23 5666365 128 13008 5641574 0.23 5654582 129 12712 5641006 0.22 5653718 130 12938 5632030 0.23 5644968 131 13022 5624537 0.23 5637559 132 12981 5616384 0.23 5629365 133 12734 5614972 0.23 5627706 134 12987 5612173 0.23 5625160 135 13117 5608825 0.23 5621942 136 12966 5599071 0.23 5612037 137 12813 5599210 0.23 5612023 138 13028 5597307 0.23 5610335 139 12939 5589700 0.23 5602639 140 13282 5579349 0.24 5592631 141 13243 5568400 0.24 5581643 142 13052 5555057 0.23 5568109 143 13193 5553429 0.24 5566622 144 13455 5548054 0.24 5561509 145 14032 5547629 0.25 5561661 146 14549 5552399 0.26 5566948 147 14856 5539654 0.27 5554510 148 14627 5526358 0.26 5540985 149 13904 5468986 0.25 5482890 150 12640 5115223 0.25 5127863 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2448 1008861 0.24 1011309 2 28512 864265 3.19 892777 3 54401 745698 6.80 800099 4 53617 750284 6.67 803901 5 59755 819071 6.80 878826 6 65919 895440 6.86 961359 7 69779 921222 7.04 991001 8 65626 799501 7.59 865127 9 68621 809055 7.82 877676 10 70441 805680 8.04 876121 11 70344 799130 8.09 869474 12 72604 806289 8.26 878893 13 73958 799927 8.46 873885 14 74483 801421 8.50 875904 15 75488 808421 8.54 883909 16 75792 801783 8.64 877575 17 76704 806507 8.68 883211 18 77584 807891 8.76 885475 19 78207 810971 8.80 889178 20 78928 812436 8.85 891364 21 79786 807187 9.00 886973 22 79611 804495 9.00 884106 23 80514 803473 9.11 883987 24 80809 797282 9.20 878091 25 80561 794029 9.21 874590 26 80752 793757 9.23 874509 27 81201 799602 9.22 880803 28 81118 799395 9.21 880513 29 81663 797811 9.29 879474 30 81956 801031 9.28 882987 31 82718 794079 9.43 876797 32 82279 793934 9.39 876213 33 83136 792031 9.50 875167 34 82933 787907 9.52 870840 35 83449 784807 9.61 868256 36 83339 782689 9.62 866028 37 83548 783224 9.64 866772 38 83912 784983 9.66 868895 39 84139 784598 9.69 868737 40 83888 782485 9.68 866373 41 84341 782639 9.73 866980 42 84125 780183 9.73 864308 43 85058 780685 9.82 865743 44 84269 775293 9.80 859562 45 84291 770250 9.86 854541 46 84485 766631 9.93 851116 47 84837 768058 9.95 852895 48 84707 769488 9.92 854195 49 85215 769649 9.97 854864 50 85034 768503 9.96 853537 51 84884 763078 10.01 847962 52 85298 760349 10.09 845647 53 85637 760883 10.12 846520 54 85800 759341 10.15 845141 55 85547 755684 10.17 841231 56 84964 753044 10.14 838008 57 85910 751992 10.25 837902 58 85352 751413 10.20 836765 59 85198 751383 10.18 836581 60 84936 746284 10.22 831220 61 84790 746578 10.20 831368 62 84723 746011 10.20 830734 63 85160 743752 10.27 828912 64 85469 741973 10.33 827442 65 85231 738649 10.35 823880 66 84461 734338 10.32 818799 67 84797 733096 10.37 817893 68 85248 734471 10.40 819719 69 84476 731745 10.35 816221 70 84549 728624 10.40 813173 71 85016 728023 10.46 813039 72 84231 725095 10.41 809326 73 84879 724263 10.49 809142 74 84958 721383 10.54 806341 75 84201 717165 10.51 801366 76 84349 713104 10.58 797453 77 84171 712536 10.56 796707 78 83945 711739 10.55 795684 79 84284 711009 10.60 795293 80 84143 710020 10.60 794163 81 84286 706183 10.66 790469 82 84388 707023 10.66 791411 83 83302 704496 10.57 787798 84 83548 702202 10.63 785750 85 84103 698641 10.74 782744 86 83311 694700 10.71 778011 87 83200 692701 10.72 775901 88 82621 690970 10.68 773591 89 82802 688566 10.73 771368 90 82027 688182 10.65 770209 91 81919 685592 10.67 767511 92 81954 685580 10.68 767534 93 82074 683070 10.73 765144 94 81739 679830 10.73 761569 95 81812 677347 10.78 759159 96 81209 674415 10.75 755624 97 81306 671089 10.81 752395 98 81348 670305 10.82 751653 99 80966 667223 10.82 748189 100 80381 667105 10.75 747486 101 80407 662650 10.82 743057 102 79991 660057 10.81 740048 103 80130 657765 10.86 737895 104 80023 653839 10.90 733862 105 79738 652313 10.89 732051 106 79264 649601 10.87 728865 107 78637 646654 10.84 725291 108 78389 643061 10.87 721450 109 77857 639035 10.86 716892 110 78391 637685 10.95 716076 111 77763 636668 10.88 714431 112 77616 635917 10.88 713533 113 77573 632592 10.92 710165 114 77216 630738 10.91 707954 115 77265 625798 10.99 703063 116 76904 623400 10.98 700304 117 76250 620261 10.95 696511 118 76104 617588 10.97 693692 119 75135 614843 10.89 689978 120 74926 613480 10.88 688406 121 75447 610893 10.99 686340 122 75181 606497 11.03 681678 123 74969 605379 11.02 680348 124 74327 601813 10.99 676140 125 74038 599696 10.99 673734 126 73659 595276 11.01 668935 127 73541 592414 11.04 665955 128 72371 588779 10.95 661150 129 72720 586273 11.04 658993 130 72249 582632 11.03 654881 131 71912 580682 11.02 652594 132 71418 577918 11.00 649336 133 71043 575521 10.99 646564 134 70723 571587 11.01 642310 135 70654 570589 11.02 641243 136 69715 565753 10.97 635468 137 69922 563187 11.04 633109 138 69260 559249 11.02 628509 139 68943 556500 11.02 625443 140 68578 553981 11.02 622559 141 68573 549775 11.09 618348 142 68317 546045 11.12 614362 143 67894 543883 11.10 611777 144 67562 539340 11.13 606902 145 66906 538667 11.05 605573 146 66012 532685 11.03 598697 147 65443 527430 11.04 592873 148 65541 520183 11.19 585724 149 63488 474411 11.80 537899 150 56985 0 100.00 56985 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1627 1351168 0.12 1352795 2 1973 1068495 0.18 1070468 3 6212 2331726 0.27 2337938 4 6309 1075158 0.58 1081467 5 2599 1097016 0.24 1099615 6 2790 1215752 0.23 1218542 7 3207 1369661 0.23 1372868 8 3184 1301048 0.24 1304232 9 2890 1195292 0.24 1198182 10 2873 1207179 0.24 1210052 11 2814 1199955 0.23 1202769 12 2671 1190812 0.22 1193483 13 2825 1194052 0.24 1196877 14 2821 1198426 0.23 1201247 15 2812 1202152 0.23 1204964 16 2795 1205466 0.23 1208261 17 2834 1195724 0.24 1198558 18 2909 1208295 0.24 1211204 19 2919 1206530 0.24 1209449 20 2878 1200046 0.24 1202924 21 2912 1207555 0.24 1210467 22 2938 1198237 0.24 1201175 23 2951 1197828 0.25 1200779 24 2797 1201712 0.23 1204509 25 3041 1198747 0.25 1201788 26 3139 1196347 0.26 1199486 27 2963 1198719 0.25 1201682 28 2834 1200441 0.24 1203275 29 2835 1195132 0.24 1197967 30 2942 1203821 0.24 1206763 31 2955 1196259 0.25 1199214 32 2886 1186705 0.24 1189591 33 2885 1193266 0.24 1196151 34 2899 1188925 0.24 1191824 35 2921 1192939 0.24 1195860 36 2845 1189809 0.24 1192654 37 2968 1186397 0.25 1189365 38 3061 1185870 0.26 1188931 39 2991 1186949 0.25 1189940 40 3070 1178677 0.26 1181747 41 3050 1180795 0.26 1183845 42 3055 1176816 0.26 1179871 43 2902 1176735 0.25 1179637 44 2975 1172684 0.25 1175659 45 2992 1177314 0.25 1180306 46 2991 1172246 0.25 1175237 47 3007 1163717 0.26 1166724 48 2910 1168774 0.25 1171684 49 2948 1166735 0.25 1169683 50 2927 1163278 0.25 1166205 51 2910 1161877 0.25 1164787 52 2910 1154939 0.25 1157849 53 2946 1154481 0.25 1157427 54 3031 1154294 0.26 1157325 55 2893 1156172 0.25 1159065 56 3037 1149451 0.26 1152488 57 2952 1151233 0.26 1154185 58 2989 1148876 0.26 1151865 59 2897 1144643 0.25 1147540 60 2845 1138872 0.25 1141717 61 2954 1138879 0.26 1141833 62 3022 1129463 0.27 1132485 63 2811 1131168 0.25 1133979 64 2981 1129984 0.26 1132965 65 2931 1125409 0.26 1128340 66 2928 1130264 0.26 1133192 67 2920 1129148 0.26 1132068 68 2945 1120968 0.26 1123913 69 3009 1124244 0.27 1127253 70 2980 1115060 0.27 1118040 71 2914 1111376 0.26 1114290 72 2949 1111170 0.26 1114119 73 3017 1108405 0.27 1111422 74 2962 1105162 0.27 1108124 75 2942 1103205 0.27 1106147 76 2945 1101457 0.27 1104402 77 2931 1100656 0.27 1103587 78 2874 1096331 0.26 1099205 79 2874 1094369 0.26 1097243 80 2859 1093215 0.26 1096074 81 2952 1089282 0.27 1092234 82 2840 1083581 0.26 1086421 83 2826 1079810 0.26 1082636 84 2836 1078763 0.26 1081599 85 2880 1076100 0.27 1078980 86 2888 1068995 0.27 1071883 87 2788 1072030 0.26 1074818 88 2866 1065571 0.27 1068437 89 2790 1061799 0.26 1064589 90 2808 1058148 0.26 1060956 91 2870 1056711 0.27 1059581 92 2769 1050138 0.26 1052907 93 2717 1054763 0.26 1057480 94 2783 1048572 0.26 1051355 95 2780 1041169 0.27 1043949 96 2808 1038894 0.27 1041702 97 2755 1035877 0.27 1038632 98 2738 1028803 0.27 1031541 99 2729 1029627 0.26 1032356 100 2655 1023200 0.26 1025855 101 2676 1021623 0.26 1024299 102 2720 1018683 0.27 1021403 103 2618 1013976 0.26 1016594 104 2669 1007153 0.26 1009822 105 2654 1007066 0.26 1009720 106 2667 999086 0.27 1001753 107 2602 994330 0.26 996932 108 2706 994105 0.27 996811 109 2698 989625 0.27 992323 110 2574 983554 0.26 986128 111 2656 983886 0.27 986542 112 2609 979699 0.27 982308 113 2655 971520 0.27 974175 114 2585 971414 0.27 973999 115 2594 965337 0.27 967931 116 2514 961207 0.26 963721 117 2644 956987 0.28 959631 118 2551 952361 0.27 954912 119 2524 948432 0.27 950956 120 2482 945668 0.26 948150 121 2573 941104 0.27 943677 122 2509 937106 0.27 939615 123 2463 932916 0.26 935379 124 2564 928397 0.28 930961 125 2452 922177 0.27 924629 126 2523 919436 0.27 921959 127 2435 912694 0.27 915129 128 2423 907197 0.27 909620 129 2478 904744 0.27 907222 130 2512 899413 0.28 901925 131 2425 894850 0.27 897275 132 2376 891140 0.27 893516 133 2407 885199 0.27 887606 134 2459 881250 0.28 883709 135 2375 874958 0.27 877333 136 2523 870525 0.29 873048 137 2386 866703 0.27 869089 138 2404 862851 0.28 865255 139 2474 856216 0.29 858690 140 2489 847466 0.29 849955 141 2467 850508 0.29 852975 142 2360 841009 0.28 843369 143 2362 836572 0.28 838934 144 2291 833047 0.27 835338 145 2428 824513 0.29 826941 146 2327 819235 0.28 821562 147 2415 812802 0.30 815217 148 2334 804415 0.29 806749 149 2171 741594 0.29 743765 150 1626 0 100.00 1626 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 7881 6778468 0.12 6786349 2 8996 5100269 0.18 5109265 3 11816 6164967 0.19 6176783 4 12540 6265797 0.20 6278337 5 10349 5543111 0.19 5553460 6 9637 5170373 0.19 5180010 7 10319 5384782 0.19 5395101 8 10104 5268353 0.19 5278457 9 10328 5285725 0.20 5296053 10 10238 5275899 0.19 5286137 11 10415 5288108 0.20 5298523 12 10225 5302757 0.19 5312982 13 10646 5239356 0.20 5250002 14 10485 5246326 0.20 5256811 15 10503 5264915 0.20 5275418 16 10348 5268060 0.20 5278408 17 10603 5287678 0.20 5298281 18 10677 5276761 0.20 5287438 19 10861 5281553 0.21 5292414 20 10838 5262994 0.21 5273832 21 10627 5258969 0.20 5269596 22 10933 5227041 0.21 5237974 23 11034 5217541 0.21 5228575 24 10874 5196421 0.21 5207295 25 10904 5201002 0.21 5211906 26 10926 5191644 0.21 5202570 27 10742 5209964 0.21 5220706 28 11160 5219389 0.21 5230549 29 11144 5208309 0.21 5219453 30 11017 5198782 0.21 5209799 31 11099 5187876 0.21 5198975 32 11107 5163298 0.21 5174405 33 10982 5138207 0.21 5149189 34 11027 5122871 0.21 5133898 35 10992 5124755 0.21 5135747 36 10731 5126625 0.21 5137356 37 10834 5126700 0.21 5137534 38 11011 5138523 0.21 5149534 39 10906 5125914 0.21 5136820 40 11235 5124104 0.22 5135339 41 11174 5107426 0.22 5118600 42 11139 5092885 0.22 5104024 43 11074 5084280 0.22 5095354 44 11168 5058672 0.22 5069840 45 11138 5049422 0.22 5060560 46 11002 5050883 0.22 5061885 47 11247 5047702 0.22 5058949 48 11105 5048463 0.22 5059568 49 11129 5043845 0.22 5054974 50 11087 5036982 0.22 5048069 51 11062 5024613 0.22 5035675 52 11180 5003673 0.22 5014853 53 11112 4993662 0.22 5004774 54 10780 4980358 0.22 4991138 55 10821 4968155 0.22 4978976 56 11115 4960864 0.22 4971979 57 10837 4946761 0.22 4957598 58 10918 4950811 0.22 4961729 59 10831 4945559 0.22 4956390 60 10923 4933164 0.22 4944087 61 10973 4931509 0.22 4942482 62 10909 4909785 0.22 4920694 63 10902 4890958 0.22 4901860 64 10715 4885320 0.22 4896035 65 10790 4859431 0.22 4870221 66 10965 4854890 0.23 4865855 67 10821 4855306 0.22 4866127 68 11097 4841037 0.23 4852134 69 10885 4823522 0.23 4834407 70 10714 4820023 0.22 4830737 71 10644 4808067 0.22 4818711 72 10831 4796741 0.23 4807572 73 10762 4789301 0.22 4800063 74 10530 4766109 0.22 4776639 75 10436 4752769 0.22 4763205 76 10510 4745358 0.22 4755868 77 10466 4730210 0.22 4740676 78 10440 4726053 0.22 4736493 79 10626 4723650 0.22 4734276 80 10313 4705116 0.22 4715429 81 10508 4696612 0.22 4707120 82 10176 4686584 0.22 4696760 83 10250 4658842 0.22 4669092 84 10139 4642980 0.22 4653119 85 10175 4631587 0.22 4641762 86 10152 4624109 0.22 4634261 87 10191 4616116 0.22 4626307 88 10125 4605897 0.22 4616022 89 10330 4598074 0.22 4608404 90 9939 4590703 0.22 4600642 91 10092 4572933 0.22 4583025 92 10049 4557668 0.22 4567717 93 9839 4540775 0.22 4550614 94 10057 4526073 0.22 4536130 95 9781 4493631 0.22 4503412 96 9728 4478015 0.22 4487743 97 9764 4470251 0.22 4480015 98 9821 4454365 0.22 4464186 99 9632 4448837 0.22 4458469 100 9838 4441015 0.22 4450853 101 9724 4413826 0.22 4423550 102 9682 4406674 0.22 4416356 103 9633 4390585 0.22 4400218 104 9552 4375853 0.22 4385405 105 9524 4355568 0.22 4365092 106 9493 4335476 0.22 4344969 107 9375 4315536 0.22 4324911 108 9276 4296640 0.22 4305916 109 9604 4292152 0.22 4301756 110 9397 4281580 0.22 4290977 111 9388 4268005 0.22 4277393 112 9289 4253300 0.22 4262589 113 9329 4230572 0.22 4239901 114 9143 4214199 0.22 4223342 115 9186 4193639 0.22 4202825 116 9166 4172254 0.22 4181420 117 9053 4149124 0.22 4158177 118 9076 4133938 0.22 4143014 119 9058 4117533 0.22 4126591 120 9004 4102387 0.22 4111391 121 8942 4089685 0.22 4098627 122 8954 4067905 0.22 4076859 123 8840 4049139 0.22 4057979 124 8921 4035232 0.22 4044153 125 8949 4012325 0.22 4021274 126 8735 3989944 0.22 3998679 127 8908 3972387 0.22 3981295 128 8940 3944044 0.23 3952984 129 8903 3931042 0.23 3939945 130 8658 3914886 0.22 3923544 131 8869 3894381 0.23 3903250 132 8634 3875416 0.22 3884050 133 9023 3857910 0.23 3866933 134 8914 3837979 0.23 3846893 135 8769 3818539 0.23 3827308 136 8727 3797173 0.23 3805900 137 8858 3772690 0.23 3781548 138 8843 3753580 0.24 3762423 139 8708 3731067 0.23 3739775 140 8684 3706393 0.23 3715077 141 8829 3692029 0.24 3700858 142 8717 3668985 0.24 3677702 143 8776 3649443 0.24 3658219 144 8728 3626276 0.24 3635004 145 8650 3603446 0.24 3612096 146 8734 3576669 0.24 3585403 147 8910 3544433 0.25 3553343 148 8946 3506901 0.25 3515847 149 8603 3245806 0.26 3254409 150 6093 0 100.00 6093