CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 85873 561938 13.26 647811 2 111097 714197 13.46 825294 3 83049 629680 11.65 712729 4 86116 681597 11.22 767713 5 102087 793643 11.40 895730 6 108676 799932 11.96 908608 7 98215 703799 12.25 802014 8 97080 704360 12.11 801440 9 97001 704592 12.10 801593 10 95945 701704 12.03 797649 11 96887 707315 12.05 804202 12 99259 709704 12.27 808963 13 98271 708208 12.19 806479 14 99850 714424 12.26 814274 15 99317 711820 12.24 811137 16 99657 717581 12.19 817238 17 99698 720300 12.16 819998 18 100667 725685 12.18 826352 19 100497 725047 12.17 825544 20 100928 725323 12.22 826251 21 100975 722997 12.25 823972 22 101302 721768 12.31 823070 23 100814 720485 12.27 821299 24 100568 720621 12.25 821189 25 100701 721881 12.24 822582 26 100977 727814 12.18 828791 27 101459 730246 12.20 831705 28 101073 725603 12.23 826676 29 101683 730741 12.22 832424 30 101740 727999 12.26 829739 31 100954 723883 12.24 824837 32 101998 726497 12.31 828495 33 100859 724921 12.21 825780 34 101018 725942 12.22 826960 35 100937 726437 12.20 827374 36 101671 730100 12.22 831771 37 101276 730041 12.18 831317 38 101886 733226 12.20 835112 39 102280 732197 12.26 834477 40 101806 730825 12.23 832631 41 101969 730992 12.24 832961 42 102067 733272 12.22 835339 43 101492 727354 12.24 828846 44 101274 726943 12.23 828217 45 101264 727744 12.22 829008 46 101242 729109 12.19 830351 47 101974 735996 12.17 837970 48 101755 732548 12.20 834303 49 101349 730613 12.18 831962 50 100920 730900 12.13 831820 51 100657 729623 12.12 830280 52 101843 727653 12.28 829496 53 101398 731992 12.17 833390 54 101558 729397 12.22 830955 55 100923 727736 12.18 828659 56 101107 729700 12.17 830807 57 101165 730739 12.16 831904 58 100491 730546 12.09 831037 59 100574 730021 12.11 830595 60 101075 730356 12.16 831431 61 100490 728810 12.12 829300 62 101009 732346 12.12 833355 63 101152 730490 12.16 831642 64 100720 728918 12.14 829638 65 100747 730534 12.12 831281 66 100548 729508 12.11 830056 67 100658 728661 12.14 829319 68 100760 728967 12.14 829727 69 100693 729117 12.13 829810 70 100535 730518 12.10 831053 71 99729 731989 11.99 831718 72 100206 731201 12.05 831407 73 100632 727974 12.14 828606 74 100320 729739 12.09 830059 75 100171 728663 12.09 828834 76 99713 728768 12.04 828481 77 99261 729234 11.98 828495 78 100156 731157 12.05 831313 79 100405 730037 12.09 830442 80 99869 729522 12.04 829391 81 100049 730202 12.05 830251 82 99656 729900 12.01 829556 83 99691 729224 12.03 828915 84 99206 728808 11.98 828014 85 99211 727925 11.99 827136 86 99453 728679 12.01 828132 87 99385 727677 12.02 827062 88 99350 727644 12.01 826994 89 99008 728978 11.96 827986 90 99089 728411 11.97 827500 91 98299 728264 11.89 826563 92 99040 729578 11.95 828618 93 98327 729512 11.88 827839 94 98860 728628 11.95 827488 95 98015 731092 11.82 829107 96 99155 725225 12.03 824380 97 98362 726159 11.93 824521 98 98888 727504 11.97 826392 99 97958 727890 11.86 825848 100 97519 724271 11.87 821790 101 97724 728019 11.83 825743 102 97573 725581 11.85 823154 103 97463 725964 11.84 823427 104 97180 728201 11.77 825381 105 96798 725305 11.77 822103 106 96845 724177 11.80 821022 107 96711 724396 11.78 821107 108 95848 722808 11.71 818656 109 96118 724533 11.71 820651 110 96232 724599 11.72 820831 111 96820 725172 11.78 821992 112 96541 723336 11.78 819877 113 96974 725655 11.79 822629 114 96092 724526 11.71 820618 115 96075 724779 11.70 820854 116 95393 720403 11.69 815796 117 95272 722811 11.65 818083 118 94708 721867 11.60 816575 119 94996 722063 11.63 817059 120 95165 723348 11.63 818513 121 94948 721980 11.62 816928 122 94907 721868 11.62 816775 123 94850 721522 11.62 816372 124 94573 721561 11.59 816134 125 95046 722131 11.63 817177 126 94430 719247 11.61 813677 127 94358 717477 11.62 811835 128 93465 719301 11.50 812766 129 93298 717117 11.51 810415 130 93520 717538 11.53 811058 131 93048 717437 11.48 810485 132 93483 717384 11.53 810867 133 92741 712481 11.52 805222 134 92746 718489 11.43 811235 135 92380 715623 11.43 808003 136 92046 715353 11.40 807399 137 92168 714596 11.42 806764 138 91725 712312 11.41 804037 139 91210 711121 11.37 802331 140 90791 712025 11.31 802816 141 90361 711820 11.26 802181 142 91037 709977 11.37 801014 143 91028 709661 11.37 800689 144 90102 710491 11.25 800593 145 89645 708442 11.23 798087 146 90518 710459 11.30 800977 147 89216 708438 11.18 797654 148 88594 706108 11.15 794702 149 87495 707629 11.00 795124 150 79475 664732 10.68 744207 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2787 2273196 0.12 2275983 2 2812 996914 0.28 999726 3 1955 916878 0.21 918833 4 1909 1098052 0.17 1099961 5 2781 1298285 0.21 1301066 6 2626 1224164 0.21 1226790 7 2457 1120648 0.22 1123105 8 2399 1117284 0.21 1119683 9 2576 1113875 0.23 1116451 10 2595 1115374 0.23 1117969 11 2664 1124325 0.24 1126989 12 2697 1120034 0.24 1122731 13 2775 1129588 0.25 1132363 14 2802 1124600 0.25 1127402 15 2800 1121216 0.25 1124016 16 2859 1134503 0.25 1137362 17 2934 1136656 0.26 1139590 18 2985 1129743 0.26 1132728 19 2921 1140749 0.26 1143670 20 2934 1131136 0.26 1134070 21 2947 1135033 0.26 1137980 22 3018 1139009 0.26 1142027 23 2905 1137963 0.25 1140868 24 3072 1133788 0.27 1136860 25 3060 1139397 0.27 1142457 26 2956 1141021 0.26 1143977 27 3040 1138327 0.27 1141367 28 3043 1152543 0.26 1155586 29 3243 1144744 0.28 1147987 30 3046 1139249 0.27 1142295 31 3059 1143305 0.27 1146364 32 3123 1143937 0.27 1147060 33 3001 1146446 0.26 1149447 34 3185 1145956 0.28 1149141 35 3110 1143354 0.27 1146464 36 3055 1144978 0.27 1148033 37 3324 1150654 0.29 1153978 38 3117 1147413 0.27 1150530 39 3129 1149657 0.27 1152786 40 3211 1147646 0.28 1150857 41 3218 1147953 0.28 1151171 42 3251 1146606 0.28 1149857 43 3158 1151735 0.27 1154893 44 3181 1145325 0.28 1148506 45 3170 1144638 0.28 1147808 46 3188 1152270 0.28 1155458 47 3141 1148066 0.27 1151207 48 3240 1147719 0.28 1150959 49 3185 1151627 0.28 1154812 50 3142 1148561 0.27 1151703 51 3152 1148997 0.27 1152149 52 3201 1151618 0.28 1154819 53 3239 1153129 0.28 1156368 54 3212 1145247 0.28 1148459 55 3113 1151822 0.27 1154935 56 3098 1149141 0.27 1152239 57 3257 1147996 0.28 1151253 58 3230 1146736 0.28 1149966 59 3204 1152874 0.28 1156078 60 3166 1145454 0.28 1148620 61 3119 1150169 0.27 1153288 62 3241 1150780 0.28 1154021 63 3186 1148426 0.28 1151612 64 3175 1152703 0.27 1155878 65 3281 1152373 0.28 1155654 66 3178 1145990 0.28 1149168 67 3197 1150542 0.28 1153739 68 3295 1149503 0.29 1152798 69 3339 1146141 0.29 1149480 70 3199 1150800 0.28 1153999 71 3142 1150977 0.27 1154119 72 3268 1149144 0.28 1152412 73 3291 1150217 0.29 1153508 74 3197 1150767 0.28 1153964 75 3195 1152460 0.28 1155655 76 3177 1151174 0.28 1154351 77 3482 1149631 0.30 1153113 78 3226 1151942 0.28 1155168 79 3184 1153400 0.28 1156584 80 3251 1151115 0.28 1154366 81 3225 1148161 0.28 1151386 82 3198 1150985 0.28 1154183 83 3235 1152034 0.28 1155269 84 3235 1146691 0.28 1149926 85 3195 1155813 0.28 1159008 86 3269 1149077 0.28 1152346 87 3188 1147884 0.28 1151072 88 3235 1149785 0.28 1153020 89 3254 1146936 0.28 1150190 90 3278 1145029 0.29 1148307 91 3235 1150723 0.28 1153958 92 3269 1151174 0.28 1154443 93 3302 1146132 0.29 1149434 94 3406 1151103 0.30 1154509 95 3354 1146370 0.29 1149724 96 3142 1143837 0.27 1146979 97 3182 1148416 0.28 1151598 98 3407 1148862 0.30 1152269 99 3175 1144879 0.28 1148054 100 3134 1149052 0.27 1152186 101 3285 1147391 0.29 1150676 102 3205 1141585 0.28 1144790 103 3360 1147673 0.29 1151033 104 3279 1142157 0.29 1145436 105 3296 1142099 0.29 1145395 106 3257 1147196 0.28 1150453 107 3214 1145020 0.28 1148234 108 3160 1139757 0.28 1142917 109 3152 1142070 0.28 1145222 110 3215 1144926 0.28 1148141 111 3285 1138832 0.29 1142117 112 3275 1141948 0.29 1145223 113 3130 1141816 0.27 1144946 114 3222 1138314 0.28 1141536 115 3171 1141019 0.28 1144190 116 3161 1136136 0.28 1139297 117 3133 1135711 0.28 1138844 118 3162 1141784 0.28 1144946 119 3181 1140198 0.28 1143379 120 3201 1135198 0.28 1138399 121 3229 1137988 0.28 1141217 122 3194 1136420 0.28 1139614 123 3204 1132960 0.28 1136164 124 3144 1134906 0.28 1138050 125 3142 1133569 0.28 1136711 126 3139 1129825 0.28 1132964 127 3063 1135325 0.27 1138388 128 3098 1128125 0.27 1131223 129 3291 1128543 0.29 1131834 130 3264 1130448 0.29 1133712 131 3174 1127851 0.28 1131025 132 3180 1121803 0.28 1124983 133 3087 1125958 0.27 1129045 134 3061 1125321 0.27 1128382 135 3116 1124255 0.28 1127371 136 3178 1124233 0.28 1127411 137 3178 1120420 0.28 1123598 138 3072 1114575 0.27 1117647 139 3164 1121186 0.28 1124350 140 3185 1117577 0.28 1120762 141 3159 1113220 0.28 1116379 142 3084 1116558 0.28 1119642 143 3153 1112630 0.28 1115783 144 3063 1108653 0.28 1111716 145 3213 1117770 0.29 1120983 146 3474 1113510 0.31 1116984 147 3596 1109744 0.32 1113340 148 3392 1109678 0.30 1113070 149 3399 1105400 0.31 1108799 150 3056 1025887 0.30 1028943 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 7028 5050257 0.14 5057285 2 7760 3706505 0.21 3714265 3 7105 3988338 0.18 3995443 4 7867 4975056 0.16 4982923 5 9180 5691694 0.16 5700874 6 9655 5636578 0.17 5646233 7 8681 5099296 0.17 5107977 8 8887 4995647 0.18 5004534 9 8849 4902590 0.18 4911439 10 8823 4870796 0.18 4879619 11 8785 4884124 0.18 4892909 12 9305 4885210 0.19 4894515 13 9244 4871268 0.19 4880512 14 9447 4882712 0.19 4892159 15 9625 4889514 0.20 4899139 16 9665 4925898 0.20 4935563 17 9928 4932926 0.20 4942854 18 9851 4956009 0.20 4965860 19 10086 4953941 0.20 4964027 20 10237 4937590 0.21 4947827 21 9989 4929725 0.20 4939714 22 10179 4925447 0.21 4935626 23 10053 4919079 0.20 4929132 24 10240 4923043 0.21 4933283 25 10344 4932631 0.21 4942975 26 10354 4936713 0.21 4947067 27 10393 4955752 0.21 4966145 28 10510 4966935 0.21 4977445 29 10359 4967350 0.21 4977709 30 10430 4970479 0.21 4980909 31 10502 4972516 0.21 4983018 32 10857 4959368 0.22 4970225 33 10722 4949869 0.22 4960591 34 10827 4947162 0.22 4957989 35 10619 4944125 0.21 4954744 36 10819 4954886 0.22 4965705 37 10731 4953011 0.22 4963742 38 10859 4960124 0.22 4970983 39 10847 4977959 0.22 4988806 40 10829 4969142 0.22 4979971 41 10680 4964806 0.21 4975486 42 10839 4971120 0.22 4981959 43 10875 4956712 0.22 4967587 44 10914 4953500 0.22 4964414 45 10767 4953343 0.22 4964110 46 10618 4952354 0.21 4962972 47 11096 4964366 0.22 4975462 48 10885 4968175 0.22 4979060 49 11041 4975650 0.22 4986691 50 11186 4977685 0.22 4988871 51 10810 4974951 0.22 4985761 52 10844 4977863 0.22 4988707 53 10962 4978918 0.22 4989880 54 11018 4973979 0.22 4984997 55 10891 4965977 0.22 4976868 56 11153 4969735 0.22 4980888 57 11233 4960905 0.23 4972138 58 11169 4975381 0.22 4986550 59 10881 4968068 0.22 4978949 60 10821 4970792 0.22 4981613 61 10977 4972203 0.22 4983180 62 11024 4975900 0.22 4986924 63 11170 4981286 0.22 4992456 64 11063 4981522 0.22 4992585 65 11047 4983308 0.22 4994355 66 10932 4982862 0.22 4993794 67 11265 4979736 0.23 4991001 68 11007 4986071 0.22 4997078 69 11060 4981775 0.22 4992835 70 11100 4990434 0.22 5001534 71 11245 4989907 0.22 5001152 72 11317 4985763 0.23 4997080 73 11145 4983046 0.22 4994191 74 11336 4985372 0.23 4996708 75 11168 4980738 0.22 4991906 76 11130 4985837 0.22 4996967 77 11391 4987516 0.23 4998907 78 11392 4988012 0.23 4999404 79 11064 4986288 0.22 4997352 80 11016 4980811 0.22 4991827 81 11336 4986021 0.23 4997357 82 11089 4992044 0.22 5003133 83 10943 4988557 0.22 4999500 84 11077 4989216 0.22 5000293 85 11076 4986241 0.22 4997317 86 11145 4982725 0.22 4993870 87 10914 4980620 0.22 4991534 88 10889 4981582 0.22 4992471 89 11136 4986327 0.22 4997463 90 11084 4984333 0.22 4995417 91 11017 4986070 0.22 4997087 92 10973 4981238 0.22 4992211 93 11079 4986235 0.22 4997314 94 10994 4992301 0.22 5003295 95 11214 4992017 0.22 5003231 96 11276 4988326 0.23 4999602 97 11052 4987247 0.22 4998299 98 11259 4978263 0.23 4989522 99 11187 4978168 0.22 4989355 100 11306 4988358 0.23 4999664 101 11214 4986804 0.22 4998018 102 11147 4985585 0.22 4996732 103 11125 4985876 0.22 4997001 104 11138 4983269 0.22 4994407 105 11010 4979768 0.22 4990778 106 11238 4983352 0.23 4994590 107 11024 4974774 0.22 4985798 108 10904 4968893 0.22 4979797 109 11163 4972616 0.22 4983779 110 11124 4968983 0.22 4980107 111 10957 4975811 0.22 4986768 112 10745 4972548 0.22 4983293 113 11154 4978249 0.22 4989403 114 11163 4972307 0.22 4983470 115 11069 4967657 0.22 4978726 116 10991 4972079 0.22 4983070 117 11243 4966874 0.23 4978117 118 10873 4964553 0.22 4975426 119 11002 4955386 0.22 4966388 120 11346 4952313 0.23 4963659 121 11202 4949775 0.23 4960977 122 11241 4954805 0.23 4966046 123 11043 4950079 0.22 4961122 124 11260 4954353 0.23 4965613 125 11347 4946077 0.23 4957424 126 11144 4937469 0.23 4948613 127 11127 4939403 0.22 4950530 128 11030 4925615 0.22 4936645 129 10929 4923879 0.22 4934808 130 11037 4919286 0.22 4930323 131 10991 4917857 0.22 4928848 132 10966 4912046 0.22 4923012 133 10832 4916015 0.22 4926847 134 11259 4910659 0.23 4921918 135 10989 4905471 0.22 4916460 136 10950 4900433 0.22 4911383 137 11174 4894160 0.23 4905334 138 11187 4893966 0.23 4905153 139 11042 4890574 0.23 4901616 140 11081 4882625 0.23 4893706 141 11138 4873840 0.23 4884978 142 11062 4873017 0.23 4884079 143 11064 4867041 0.23 4878105 144 11431 4867737 0.23 4879168 145 11340 4867936 0.23 4879276 146 11883 4873983 0.24 4885866 147 11980 4870492 0.25 4882472 148 11829 4856239 0.24 4868068 149 11421 4817457 0.24 4828878 150 10664 4585266 0.23 4595930 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2073 895050 0.23 897123 2 25650 770465 3.22 796115 3 59124 709769 7.69 768893 4 53878 622595 7.96 676473 5 57103 680430 7.74 737533 6 66581 796559 7.71 863140 7 71116 801752 8.15 872868 8 66633 700027 8.69 766660 9 67894 702615 8.81 770509 10 68562 697605 8.95 766167 11 69153 692931 9.07 762084 12 70037 697144 9.13 767181 13 71873 698592 9.33 770465 14 71749 697768 9.32 769517 15 72347 702549 9.34 774896 16 73466 700515 9.49 773981 17 73856 704642 9.49 778498 18 74181 704846 9.52 779027 19 75086 708311 9.58 783397 20 75465 706385 9.65 781850 21 75559 704609 9.68 780168 22 76106 699887 9.81 775993 23 76348 697720 9.86 774068 24 76637 696338 9.91 772975 25 76554 695391 9.92 771945 26 76845 697308 9.93 774153 27 76930 701294 9.89 778224 28 77500 698498 9.99 775998 29 77231 695731 9.99 772962 30 77897 697560 10.05 775457 31 78045 691767 10.14 769812 32 77914 690923 10.13 768837 33 78274 690334 10.18 768608 34 78044 686858 10.20 764902 35 77992 687046 10.19 765038 36 78189 686787 10.22 764976 37 78431 684843 10.28 763274 38 78537 688032 10.25 766569 39 78838 686418 10.30 765256 40 79475 686143 10.38 765618 41 78709 681409 10.35 760118 42 78698 680407 10.37 759105 43 79190 679762 10.43 758952 44 78542 675054 10.42 753596 45 78927 672437 10.50 751364 46 79243 670948 10.56 750191 47 79550 671260 10.60 750810 48 78950 673715 10.49 752665 49 79465 670918 10.59 750383 50 78882 670003 10.53 748885 51 78771 667397 10.56 746168 52 78881 662972 10.63 741853 53 79206 663366 10.67 742572 54 79445 661668 10.72 741113 55 78959 657524 10.72 736483 56 78757 656321 10.71 735078 57 78881 654498 10.76 733379 58 78760 655259 10.73 734019 59 79055 653840 10.79 732895 60 78378 653083 10.72 731461 61 77930 649190 10.72 727120 62 78250 646594 10.80 724844 63 78480 646388 10.83 724868 64 78471 645149 10.84 723620 65 78481 643038 10.88 721519 66 77905 639621 10.86 717526 67 78257 639067 10.91 717324 68 77882 635790 10.91 713672 69 77838 636281 10.90 714119 70 78146 632809 10.99 710955 71 78237 632644 11.01 710881 72 77637 631687 10.95 709324 73 77870 629040 11.02 706910 74 77422 626521 11.00 703943 75 77295 623573 11.03 700868 76 77460 620912 11.09 698372 77 77005 618758 11.07 695763 78 76882 617120 11.08 694002 79 77108 616899 11.11 694007 80 76583 613128 11.10 689711 81 76612 611591 11.13 688203 82 75753 610088 11.05 685841 83 76142 609238 11.11 685380 84 76043 606025 11.15 682068 85 76204 603160 11.22 679364 86 75428 601081 11.15 676509 87 75182 598848 11.15 674030 88 76080 598799 11.27 674879 89 75319 595104 11.23 670423 90 74919 594213 11.20 669132 91 74667 590165 11.23 664832 92 74404 590207 11.20 664611 93 74258 588412 11.21 662670 94 74536 586161 11.28 660697 95 73810 583679 11.23 657489 96 74192 583311 11.28 657503 97 73582 578252 11.29 651834 98 73954 577072 11.36 651026 99 73416 575660 11.31 649076 100 73077 572718 11.32 645795 101 72209 570521 11.23 642730 102 71931 568858 11.23 640789 103 71985 565172 11.30 637157 104 71686 562584 11.30 634270 105 71164 560295 11.27 631459 106 71882 558619 11.40 630501 107 71009 555404 11.34 626413 108 70681 554225 11.31 624906 109 70610 550849 11.36 621459 110 70234 549025 11.34 619259 111 70077 546779 11.36 616856 112 69735 544198 11.36 613933 113 69798 540531 11.44 610329 114 69450 539941 11.40 609391 115 69237 537234 11.42 606471 116 68807 534219 11.41 603026 117 68387 531718 11.40 600105 118 68165 528312 11.43 596477 119 67998 526082 11.45 594080 120 67533 525433 11.39 592966 121 67540 523314 11.43 590854 122 67381 520044 11.47 587425 123 66410 516870 11.39 583280 124 66183 514019 11.41 580202 125 65379 511406 11.34 576785 126 66186 508114 11.52 574300 127 64973 503742 11.42 568715 128 64835 503354 11.41 568189 129 64869 500965 11.46 565834 130 64338 497666 11.45 562004 131 63795 493796 11.44 557591 132 63849 492050 11.49 555899 133 63413 489546 11.47 552959 134 62959 485186 11.49 548145 135 62749 484266 11.47 547015 136 62449 481514 11.48 543963 137 61951 476671 11.50 538622 138 61750 475841 11.49 537591 139 61623 472330 11.54 533953 140 60622 470053 11.42 530675 141 60636 466489 11.50 527125 142 60293 462614 11.53 522907 143 59708 460927 11.47 520635 144 59285 456440 11.50 515725 145 59010 454495 11.49 513505 146 58359 451062 11.46 509421 147 57865 448157 11.44 506022 148 58030 438814 11.68 496844 149 56481 399352 12.39 455833 150 50092 0 100.00 50092 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1056 1104503 0.10 1105559 2 1459 943453 0.15 944912 3 5722 2405293 0.24 2411015 4 6236 1008666 0.61 1014902 5 1950 895531 0.22 897481 6 2211 1033656 0.21 1035867 7 2642 1227557 0.21 1230199 8 2585 1161725 0.22 1164310 9 2553 1066020 0.24 1068573 10 2357 1059609 0.22 1061966 11 2366 1058981 0.22 1061347 12 2357 1057168 0.22 1059525 13 2373 1059944 0.22 1062317 14 2340 1056861 0.22 1059201 15 2396 1070719 0.22 1073115 16 2339 1066282 0.22 1068621 17 2397 1058964 0.23 1061361 18 2538 1073167 0.24 1075705 19 2571 1071031 0.24 1073602 20 2478 1064068 0.23 1066546 21 2524 1072534 0.23 1075058 22 2422 1064692 0.23 1067114 23 2624 1066562 0.25 1069186 24 2559 1068855 0.24 1071414 25 2473 1061224 0.23 1063697 26 2407 1059418 0.23 1061825 27 2548 1066365 0.24 1068913 28 2522 1064282 0.24 1066804 29 2512 1057613 0.24 1060125 30 2666 1068073 0.25 1070739 31 2533 1062471 0.24 1065004 32 2437 1051537 0.23 1053974 33 2599 1056042 0.25 1058641 34 2575 1053882 0.24 1056457 35 2637 1053249 0.25 1055886 36 2490 1055301 0.24 1057791 37 2542 1045869 0.24 1048411 38 2597 1048170 0.25 1050767 39 2532 1052300 0.24 1054832 40 2608 1046970 0.25 1049578 41 2692 1045668 0.26 1048360 42 2668 1042135 0.26 1044803 43 2548 1039845 0.24 1042393 44 2601 1034705 0.25 1037306 45 2659 1041226 0.25 1043885 46 2609 1034770 0.25 1037379 47 2600 1029135 0.25 1031735 48 2562 1034533 0.25 1037095 49 2581 1029418 0.25 1031999 50 2558 1023247 0.25 1025805 51 2638 1027777 0.26 1030415 52 2587 1020669 0.25 1023256 53 2636 1015511 0.26 1018147 54 2537 1019512 0.25 1022049 55 2708 1019747 0.26 1022455 56 2487 1010541 0.25 1013028 57 2537 1013153 0.25 1015690 58 2562 1010962 0.25 1013524 59 2570 1005633 0.25 1008203 60 2481 1005141 0.25 1007622 61 2567 1002922 0.26 1005489 62 2635 994640 0.26 997275 63 2496 998363 0.25 1000859 64 2526 994927 0.25 997453 65 2493 989907 0.25 992400 66 2579 993668 0.26 996247 67 2526 988384 0.25 990910 68 2481 980984 0.25 983465 69 2568 985545 0.26 988113 70 2568 978114 0.26 980682 71 2576 974833 0.26 977409 72 2621 977342 0.27 979963 73 2560 973154 0.26 975714 74 2556 968708 0.26 971264 75 2640 968045 0.27 970685 76 2612 966199 0.27 968811 77 2504 962259 0.26 964763 78 2519 958246 0.26 960765 79 2570 955636 0.27 958206 80 2464 953580 0.26 956044 81 2540 952579 0.27 955119 82 2523 948843 0.27 951366 83 2385 940486 0.25 942871 84 2536 941129 0.27 943665 85 2445 940390 0.26 942835 86 2486 932400 0.27 934886 87 2434 935204 0.26 937638 88 2519 927487 0.27 930006 89 2474 925887 0.27 928361 90 2430 923802 0.26 926232 91 2423 919912 0.26 922335 92 2448 914760 0.27 917208 93 2425 915818 0.26 918243 94 2310 912857 0.25 915167 95 2460 905065 0.27 907525 96 2380 906503 0.26 908883 97 2378 903213 0.26 905591 98 2399 894644 0.27 897043 99 2325 897270 0.26 899595 100 2399 890366 0.27 892765 101 2387 886015 0.27 888402 102 2226 884243 0.25 886469 103 2382 879207 0.27 881589 104 2315 873089 0.26 875404 105 2433 873902 0.28 876335 106 2242 865960 0.26 868202 107 2297 865230 0.26 867527 108 2315 864256 0.27 866571 109 2240 859112 0.26 861352 110 2227 853392 0.26 855619 111 2382 852857 0.28 855239 112 2271 846352 0.27 848623 113 2301 842049 0.27 844350 114 2207 838178 0.26 840385 115 2324 837516 0.28 839840 116 2217 832475 0.27 834692 117 2156 828614 0.26 830770 118 2186 821829 0.27 824015 119 2248 817382 0.27 819630 120 2270 817576 0.28 819846 121 2145 815216 0.26 817361 122 2135 807466 0.26 809601 123 2136 805557 0.26 807693 124 2097 797995 0.26 800092 125 2240 793673 0.28 795913 126 2164 789915 0.27 792079 127 2154 783845 0.27 785999 128 2185 778624 0.28 780809 129 2146 780544 0.27 782690 130 2090 773248 0.27 775338 131 2056 768229 0.27 770285 132 2145 765643 0.28 767788 133 2087 761351 0.27 763438 134 2133 755801 0.28 757934 135 2077 751276 0.28 753353 136 2100 747035 0.28 749135 137 2169 740675 0.29 742844 138 2150 739262 0.29 741412 139 2056 734351 0.28 736407 140 2039 728781 0.28 730820 141 2103 725678 0.29 727781 142 2002 720695 0.28 722697 143 2077 714985 0.29 717062 144 2040 709143 0.29 711183 145 2047 705001 0.29 707048 146 2054 699719 0.29 701773 147 2040 694762 0.29 696802 148 2093 682706 0.31 684799 149 1931 632667 0.30 634598 150 1399 0 100.00 1399 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4459 5096187 0.09 5100646 2 5470 3990146 0.14 3995616 3 8909 5827264 0.15 5836173 4 9985 5773085 0.17 5783070 5 8154 4954273 0.16 4962427 6 7692 4532447 0.17 4540139 7 8046 4609211 0.17 4617257 8 7866 4538627 0.17 4546493 9 7839 4609664 0.17 4617503 10 8148 4627818 0.18 4635966 11 8306 4643530 0.18 4651836 12 8424 4677525 0.18 4685949 13 8625 4670708 0.18 4679333 14 8495 4659543 0.18 4668038 15 8686 4678134 0.19 4686820 16 8515 4681565 0.18 4690080 17 8677 4689338 0.18 4698015 18 8994 4670822 0.19 4679816 19 9160 4664116 0.20 4673276 20 8860 4641036 0.19 4649896 21 8811 4645846 0.19 4654657 22 9055 4623741 0.20 4632796 23 8927 4618858 0.19 4627785 24 9080 4624974 0.20 4634054 25 9171 4623517 0.20 4632688 26 9248 4613823 0.20 4623071 27 9031 4628761 0.19 4637792 28 9326 4618600 0.20 4627926 29 9204 4598950 0.20 4608154 30 9399 4598856 0.20 4608255 31 9298 4589786 0.20 4599084 32 9365 4564585 0.20 4573950 33 9366 4566870 0.20 4576236 34 9588 4551112 0.21 4560700 35 9418 4550871 0.21 4560289 36 9473 4557491 0.21 4566964 37 9505 4547645 0.21 4557150 38 9464 4543889 0.21 4553353 39 9608 4542206 0.21 4551814 40 9518 4530171 0.21 4539689 41 9677 4511766 0.21 4521443 42 9551 4511531 0.21 4521082 43 9379 4495329 0.21 4504708 44 9574 4480274 0.21 4489848 45 9366 4485595 0.21 4494961 46 9727 4477499 0.22 4487226 47 9678 4472838 0.22 4482516 48 9531 4478765 0.21 4488296 49 9441 4464179 0.21 4473620 50 9471 4449594 0.21 4459065 51 9527 4439435 0.21 4448962 52 9737 4426720 0.22 4436457 53 9553 4411293 0.22 4420846 54 9527 4407462 0.22 4416989 55 9521 4396650 0.22 4406171 56 9520 4388206 0.22 4397726 57 9242 4382587 0.21 4391829 58 9362 4378441 0.21 4387803 59 9541 4369786 0.22 4379327 60 9316 4357874 0.21 4367190 61 9363 4351940 0.21 4361303 62 9516 4330253 0.22 4339769 63 9620 4327174 0.22 4336794 64 9444 4318409 0.22 4327853 65 9166 4293255 0.21 4302421 66 9379 4296677 0.22 4306056 67 9366 4288183 0.22 4297549 68 9515 4271311 0.22 4280826 69 9316 4264599 0.22 4273915 70 9123 4251744 0.21 4260867 71 9232 4236535 0.22 4245767 72 9506 4237164 0.22 4246670 73 9370 4224343 0.22 4233713 74 9293 4199272 0.22 4208565 75 9087 4193733 0.22 4202820 76 9252 4184371 0.22 4193623 77 9342 4171982 0.22 4181324 78 9568 4165234 0.23 4174802 79 9301 4156628 0.22 4165929 80 9040 4141500 0.22 4150540 81 9111 4138766 0.22 4147877 82 9019 4119690 0.22 4128709 83 9054 4102508 0.22 4111562 84 8828 4088682 0.22 4097510 85 9025 4084880 0.22 4093905 86 8868 4068391 0.22 4077259 87 8971 4059101 0.22 4068072 88 8884 4047753 0.22 4056637 89 8898 4033954 0.22 4042852 90 8769 4025793 0.22 4034562 91 8821 4014499 0.22 4023320 92 9031 3989716 0.23 3998747 93 8844 3984735 0.22 3993579 94 8856 3971379 0.22 3980235 95 8659 3942782 0.22 3951441 96 8630 3933952 0.22 3942582 97 8659 3920512 0.22 3929171 98 8468 3906242 0.22 3914710 99 8400 3900307 0.21 3908707 100 8477 3882551 0.22 3891028 101 8596 3862545 0.22 3871141 102 8555 3855875 0.22 3864430 103 8375 3839280 0.22 3847655 104 8190 3819813 0.21 3828003 105 8203 3810040 0.21 3818243 106 8347 3792455 0.22 3800802 107 8340 3776566 0.22 3784906 108 8112 3759513 0.22 3767625 109 8243 3745406 0.22 3753649 110 8280 3734173 0.22 3742453 111 8068 3722217 0.22 3730285 112 8138 3704022 0.22 3712160 113 8203 3687712 0.22 3695915 114 7958 3677019 0.22 3684977 115 8046 3653197 0.22 3661243 116 7803 3637858 0.21 3645661 117 7961 3624234 0.22 3632195 118 7873 3599966 0.22 3607839 119 7718 3577780 0.22 3585498 120 7821 3572974 0.22 3580795 121 7685 3555064 0.22 3562749 122 7970 3535242 0.22 3543212 123 7635 3524666 0.22 3532301 124 7713 3503611 0.22 3511324 125 7866 3482359 0.23 3490225 126 7789 3465168 0.22 3472957 127 7657 3445178 0.22 3452835 128 7658 3424597 0.22 3432255 129 7544 3412258 0.22 3419802 130 7595 3389585 0.22 3397180 131 7578 3370678 0.22 3378256 132 7767 3358784 0.23 3366551 133 7451 3337394 0.22 3344845 134 7503 3321089 0.23 3328592 135 7462 3303045 0.23 3310507 136 7544 3283877 0.23 3291421 137 7813 3256808 0.24 3264621 138 7515 3245183 0.23 3252698 139 7461 3223530 0.23 3230991 140 7408 3200036 0.23 3207444 141 7405 3182246 0.23 3189651 142 7453 3163273 0.24 3170726 143 7507 3143433 0.24 3150940 144 7306 3119456 0.23 3126762 145 7505 3094828 0.24 3102333 146 7454 3075291 0.24 3082745 147 7491 3047925 0.25 3055416 148 7364 3006109 0.24 3013473 149 7183 2785902 0.26 2793085 150 5391 0 100.00 5391