CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 115715 700770 14.17 816485 2 114741 764038 13.06 878779 3 91498 815873 10.08 907371 4 121284 939845 11.43 1061129 5 126446 933210 11.93 1059656 6 126426 1003572 11.19 1129998 7 120049 887893 11.91 1007942 8 120871 909348 11.73 1030219 9 120165 907289 11.70 1027454 10 118206 901998 11.59 1020204 11 117359 895113 11.59 1012472 12 119502 891939 11.82 1011441 13 118047 882414 11.80 1000461 14 119168 884431 11.87 1003599 15 118964 879620 11.91 998584 16 119540 891697 11.82 1011237 17 120511 900567 11.80 1021078 18 121144 907578 11.78 1028722 19 121784 909587 11.81 1031371 20 121218 907475 11.78 1028693 21 121374 905293 11.82 1026667 22 121903 902916 11.90 1024819 23 120904 893169 11.92 1014073 24 120613 887133 11.97 1007746 25 120194 887570 11.93 1007764 26 120646 896866 11.86 1017512 27 121227 904202 11.82 1025429 28 121666 912344 11.77 1034010 29 121486 914123 11.73 1035609 30 120833 911749 11.70 1032582 31 120521 906663 11.73 1027184 32 121115 904759 11.81 1025874 33 120630 903930 11.77 1024560 34 120503 897201 11.84 1017704 35 120415 894744 11.86 1015159 36 120995 899320 11.86 1020315 37 120748 902082 11.81 1022830 38 120543 906089 11.74 1026632 39 121172 910763 11.74 1031935 40 122388 915238 11.80 1037626 41 121462 916295 11.70 1037757 42 121381 915522 11.71 1036903 43 121448 908562 11.79 1030010 44 121032 901383 11.84 1022415 45 120522 898967 11.82 1019489 46 121219 901471 11.85 1022690 47 120330 909171 11.69 1029501 48 121790 912593 11.77 1034383 49 120384 912719 11.65 1033103 50 120102 910507 11.65 1030609 51 120789 908816 11.73 1029605 52 119844 911613 11.62 1031457 53 119968 909138 11.66 1029106 54 120366 907118 11.71 1027484 55 120537 904231 11.76 1024768 56 119581 903206 11.69 1022787 57 119762 906699 11.67 1026461 58 120540 908044 11.72 1028584 59 119589 904622 11.68 1024211 60 119349 909288 11.60 1028637 61 119857 911688 11.62 1031545 62 119708 913009 11.59 1032717 63 120504 912486 11.67 1032990 64 118617 908385 11.55 1027002 65 118288 902947 11.58 1021235 66 118830 906833 11.59 1025663 67 119637 907343 11.65 1026980 68 118289 906542 11.54 1024831 69 117981 907256 11.51 1025237 70 118880 909293 11.56 1028173 71 118585 907555 11.56 1026140 72 117960 914190 11.43 1032150 73 118481 908669 11.53 1027150 74 117739 903494 11.53 1021233 75 117511 903662 11.51 1021173 76 117876 904799 11.53 1022675 77 117983 904535 11.54 1022518 78 117673 908945 11.46 1026618 79 117380 911239 11.41 1028619 80 116818 908085 11.40 1024903 81 116631 907870 11.38 1024501 82 117109 907886 11.43 1024995 83 116195 905628 11.37 1021823 84 116587 909132 11.37 1025719 85 116249 904088 11.39 1020337 86 116201 905174 11.38 1021375 87 115846 902031 11.38 1017877 88 115794 904065 11.35 1019859 89 115260 905309 11.29 1020569 90 115094 907316 11.26 1022410 91 116395 908803 11.35 1025198 92 114707 909909 11.20 1024616 93 115048 907383 11.25 1022431 94 114664 905410 11.24 1020074 95 114828 902337 11.29 1017165 96 113968 900054 11.24 1014022 97 114349 901827 11.25 1016176 98 113589 902985 11.17 1016574 99 113597 904604 11.16 1018201 100 113641 903943 11.17 1017584 101 113051 902820 11.13 1015871 102 112550 902133 11.09 1014683 103 112772 905517 11.07 1018289 104 112417 901293 11.09 1013710 105 112040 901735 11.05 1013775 106 111569 899074 11.04 1010643 107 111176 894907 11.05 1006083 108 111112 891820 11.08 1002932 109 110997 897226 11.01 1008223 110 111565 898338 11.05 1009903 111 110728 900178 10.95 1010906 112 110703 901191 10.94 1011894 113 110446 900348 10.93 1010794 114 109904 896987 10.92 1006891 115 110073 896458 10.94 1006531 116 109615 892001 10.94 1001616 117 109383 891891 10.92 1001274 118 108959 893896 10.86 1002855 119 108831 894771 10.84 1003602 120 108738 893136 10.85 1001874 121 107640 893627 10.75 1001267 122 106776 895669 10.65 1002445 123 107691 897223 10.72 1004914 124 107465 895283 10.72 1002748 125 107165 891791 10.73 998956 126 106711 888011 10.73 994722 127 106249 885343 10.71 991592 128 106150 881449 10.75 987599 129 105830 881972 10.71 987802 130 104613 881825 10.61 986438 131 104327 882924 10.57 987251 132 103768 882653 10.52 986421 133 103955 881348 10.55 985303 134 103689 883059 10.51 986748 135 103205 879438 10.50 982643 136 103050 877791 10.51 980841 137 102239 875821 10.45 978060 138 101955 875970 10.43 977925 139 102179 874182 10.47 976361 140 101278 874376 10.38 975654 141 101634 871322 10.45 972956 142 100978 870668 10.39 971646 143 100223 868941 10.34 969164 144 99781 869241 10.30 969022 145 99630 867824 10.30 967454 146 100103 868297 10.34 968400 147 99575 867289 10.30 966864 148 98413 862384 10.24 960797 149 94888 855886 9.98 950774 150 82835 796431 9.42 879266 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2706 1952200 0.14 1954906 2 2593 1076114 0.24 1078707 3 2226 1223775 0.18 1226001 4 2677 1418670 0.19 1421347 5 3177 1563625 0.20 1566802 6 3210 1482229 0.22 1485439 7 2951 1381227 0.21 1384178 8 3153 1455052 0.22 1458205 9 3213 1407758 0.23 1410971 10 3019 1390754 0.22 1393773 11 3065 1392756 0.22 1395821 12 3072 1387823 0.22 1390895 13 3343 1383727 0.24 1387070 14 3225 1388246 0.23 1391471 15 3287 1377030 0.24 1380317 16 3493 1393419 0.25 1396912 17 3375 1398180 0.24 1401555 18 3403 1394676 0.24 1398079 19 3450 1401689 0.25 1405139 20 3377 1396442 0.24 1399819 21 3584 1403484 0.25 1407068 22 3580 1391334 0.26 1394914 23 3636 1393826 0.26 1397462 24 3678 1391162 0.26 1394840 25 3545 1391194 0.25 1394739 26 3535 1403553 0.25 1407088 27 3615 1402096 0.26 1405711 28 3603 1412739 0.25 1416342 29 3752 1410304 0.27 1414056 30 3611 1404020 0.26 1407631 31 3557 1408415 0.25 1411972 32 3526 1409969 0.25 1413495 33 3650 1411962 0.26 1415612 34 3682 1405384 0.26 1409066 35 3688 1410424 0.26 1414112 36 3598 1410180 0.25 1413778 37 3705 1408379 0.26 1412084 38 3599 1404602 0.26 1408201 39 3755 1407111 0.27 1410866 40 3818 1411836 0.27 1415654 41 3810 1415967 0.27 1419777 42 3891 1410420 0.28 1414311 43 3665 1413070 0.26 1416735 44 3732 1414461 0.26 1418193 45 3616 1407156 0.26 1410772 46 3626 1414594 0.26 1418220 47 3684 1416561 0.26 1420245 48 3797 1414131 0.27 1417928 49 3766 1412901 0.27 1416667 50 3671 1408870 0.26 1412541 51 3709 1410715 0.26 1414424 52 3633 1413664 0.26 1417297 53 3635 1421031 0.26 1424666 54 3645 1416388 0.26 1420033 55 3562 1419357 0.25 1422919 56 3635 1417766 0.26 1421401 57 3638 1417323 0.26 1420961 58 3513 1411773 0.25 1415286 59 3625 1418836 0.25 1422461 60 3656 1410712 0.26 1414368 61 3614 1413555 0.26 1417169 62 3706 1417560 0.26 1421266 63 3755 1414006 0.26 1417761 64 3596 1419800 0.25 1423396 65 3739 1425298 0.26 1429037 66 3665 1421587 0.26 1425252 67 3890 1427806 0.27 1431696 68 3711 1428093 0.26 1431804 69 3812 1414332 0.27 1418144 70 3610 1415070 0.25 1418680 71 3896 1419933 0.27 1423829 72 3738 1417967 0.26 1421705 73 3803 1419660 0.27 1423463 74 3799 1425542 0.27 1429341 75 3807 1423810 0.27 1427617 76 3779 1423534 0.26 1427313 77 3759 1427283 0.26 1431042 78 3747 1422771 0.26 1426518 79 3653 1421781 0.26 1425434 80 3786 1422328 0.27 1426114 81 3812 1416899 0.27 1420711 82 3790 1416337 0.27 1420127 83 3887 1422626 0.27 1426513 84 3765 1417846 0.26 1421611 85 3732 1421797 0.26 1425529 86 3742 1419231 0.26 1422973 87 3860 1417479 0.27 1421339 88 3635 1417574 0.26 1421209 89 3764 1418044 0.26 1421808 90 3748 1415301 0.26 1419049 91 3714 1416546 0.26 1420260 92 3752 1420251 0.26 1424003 93 3835 1414633 0.27 1418468 94 3757 1412423 0.27 1416180 95 3759 1413616 0.27 1417375 96 3756 1408118 0.27 1411874 97 3628 1408622 0.26 1412250 98 3773 1415708 0.27 1419481 99 3616 1411063 0.26 1414679 100 3640 1413236 0.26 1416876 101 3821 1412348 0.27 1416169 102 3811 1404859 0.27 1408670 103 3776 1403419 0.27 1407195 104 3612 1405793 0.26 1409405 105 3773 1401657 0.27 1405430 106 3737 1403875 0.27 1407612 107 3622 1401938 0.26 1405560 108 3645 1397459 0.26 1401104 109 3690 1399732 0.26 1403422 110 3582 1403578 0.25 1407160 111 3698 1398460 0.26 1402158 112 3532 1400888 0.25 1404420 113 3530 1400436 0.25 1403966 114 3677 1395119 0.26 1398796 115 3590 1395647 0.26 1399237 116 3616 1394501 0.26 1398117 117 3621 1391932 0.26 1395553 118 3670 1392535 0.26 1396205 119 3595 1392143 0.26 1395738 120 3623 1385335 0.26 1388958 121 3581 1388520 0.26 1392101 122 3606 1389247 0.26 1392853 123 3592 1387945 0.26 1391537 124 3580 1384196 0.26 1387776 125 3682 1381504 0.27 1385186 126 3616 1371891 0.26 1375507 127 3429 1371710 0.25 1375139 128 3550 1370800 0.26 1374350 129 3563 1367447 0.26 1371010 130 3543 1367417 0.26 1370960 131 3477 1366570 0.25 1370047 132 3609 1364752 0.26 1368361 133 3553 1364593 0.26 1368146 134 3539 1362373 0.26 1365912 135 3681 1360174 0.27 1363855 136 3520 1357034 0.26 1360554 137 3530 1358103 0.26 1361633 138 3673 1349698 0.27 1353371 139 3638 1352084 0.27 1355722 140 3724 1350452 0.28 1354176 141 3608 1343542 0.27 1347150 142 3671 1344169 0.27 1347840 143 3575 1340614 0.27 1344189 144 3737 1335780 0.28 1339517 145 3908 1339258 0.29 1343166 146 4399 1336713 0.33 1341112 147 4495 1331906 0.34 1336401 148 4283 1325435 0.32 1329718 149 4047 1318824 0.31 1322871 150 3551 1201348 0.29 1204899 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 8929 5753120 0.15 5762049 2 9035 4876993 0.18 4886028 3 9043 5857638 0.15 5866681 4 10757 6938965 0.15 6949722 5 10651 6891401 0.15 6902052 6 10785 6734740 0.16 6745525 7 10190 6392138 0.16 6402328 8 10614 6516513 0.16 6527127 9 10540 6288399 0.17 6298939 10 10512 6225540 0.17 6236052 11 10600 6190955 0.17 6201555 12 10814 6145513 0.18 6156327 13 11077 6119983 0.18 6131060 14 11152 6097781 0.18 6108933 15 11172 6057586 0.18 6068758 16 11261 6109477 0.18 6120738 17 11528 6121823 0.19 6133351 18 11895 6145367 0.19 6157262 19 12115 6167143 0.20 6179258 20 12136 6164328 0.20 6176464 21 12393 6149201 0.20 6161594 22 12371 6139308 0.20 6151679 23 12212 6132587 0.20 6144799 24 11969 6119723 0.20 6131692 25 12227 6095211 0.20 6107438 26 12259 6104651 0.20 6116910 27 12591 6125461 0.21 6138052 28 12604 6166034 0.20 6178638 29 12611 6193867 0.20 6206478 30 12692 6205320 0.20 6218012 31 12920 6211062 0.21 6223982 32 13131 6185086 0.21 6198217 33 13014 6157258 0.21 6170272 34 12675 6147126 0.21 6159801 35 12532 6127739 0.20 6140271 36 12848 6114613 0.21 6127461 37 12926 6125766 0.21 6138692 38 12659 6140115 0.21 6152774 39 13040 6163274 0.21 6176314 40 13246 6191653 0.21 6204899 41 13056 6182920 0.21 6195976 42 12757 6174890 0.21 6187647 43 13037 6173497 0.21 6186534 44 12630 6157243 0.20 6169873 45 12776 6135520 0.21 6148296 46 12633 6137639 0.21 6150272 47 12746 6137285 0.21 6150031 48 12813 6146922 0.21 6159735 49 13125 6170373 0.21 6183498 50 13111 6188072 0.21 6201183 51 12996 6195672 0.21 6208668 52 12878 6206212 0.21 6219090 53 13010 6192474 0.21 6205484 54 13012 6183401 0.21 6196413 55 12791 6173494 0.21 6186285 56 13015 6161418 0.21 6174433 57 13013 6147875 0.21 6160888 58 13062 6157548 0.21 6170610 59 12985 6143930 0.21 6156915 60 13062 6168077 0.21 6181139 61 13198 6196009 0.21 6209207 62 12947 6198989 0.21 6211936 63 13444 6198153 0.22 6211597 64 13256 6206754 0.21 6220010 65 12977 6190371 0.21 6203348 66 12983 6190419 0.21 6203402 67 13092 6200273 0.21 6213365 68 13010 6190154 0.21 6203164 69 13072 6178263 0.21 6191335 70 13246 6195799 0.21 6209045 71 13110 6201672 0.21 6214782 72 13103 6205283 0.21 6218386 73 13051 6212446 0.21 6225497 74 13292 6196500 0.21 6209792 75 13014 6180505 0.21 6193519 76 13262 6187430 0.21 6200692 77 13111 6177891 0.21 6191002 78 13168 6175653 0.21 6188821 79 13085 6186038 0.21 6199123 80 13156 6192651 0.21 6205807 81 13404 6203183 0.22 6216587 82 13254 6219220 0.21 6232474 83 12929 6208601 0.21 6221530 84 12892 6201192 0.21 6214084 85 12913 6190368 0.21 6203281 86 13120 6170065 0.21 6183185 87 12845 6157157 0.21 6170002 88 12704 6163315 0.21 6176019 89 12703 6169884 0.21 6182587 90 12838 6185936 0.21 6198774 91 13012 6204268 0.21 6217280 92 13064 6201541 0.21 6214605 93 12788 6196682 0.21 6209470 94 12934 6204000 0.21 6216934 95 13122 6188561 0.21 6201683 96 12841 6162682 0.21 6175523 97 12842 6162015 0.21 6174857 98 13031 6170617 0.21 6183648 99 12926 6170743 0.21 6183669 100 12896 6184606 0.21 6197502 101 12986 6186541 0.21 6199527 102 12858 6177649 0.21 6190507 103 13043 6183398 0.21 6196441 104 13026 6174545 0.21 6187571 105 12651 6162177 0.20 6174828 106 12969 6159239 0.21 6172208 107 12621 6141575 0.21 6154196 108 12705 6115785 0.21 6128490 109 12782 6135728 0.21 6148510 110 12737 6133647 0.21 6146384 111 12767 6146089 0.21 6158856 112 12929 6152979 0.21 6165908 113 12759 6149479 0.21 6162238 114 12833 6141127 0.21 6153960 115 12803 6135040 0.21 6147843 116 12641 6126892 0.21 6139533 117 12946 6105760 0.21 6118706 118 12498 6097649 0.20 6110147 119 12496 6086533 0.20 6099029 120 12727 6085238 0.21 6097965 121 12877 6089953 0.21 6102830 122 12754 6095036 0.21 6107790 123 12574 6088647 0.21 6101221 124 12632 6085914 0.21 6098546 125 12912 6069437 0.21 6082349 126 12809 6057264 0.21 6070073 127 12686 6053161 0.21 6065847 128 12651 6039508 0.21 6052159 129 12690 6021165 0.21 6033855 130 12810 6020220 0.21 6033030 131 12826 6011721 0.21 6024547 132 12814 6007923 0.21 6020737 133 12632 6009101 0.21 6021733 134 12884 6005089 0.21 6017973 135 12853 6002468 0.21 6015321 136 12856 5986181 0.21 5999037 137 12771 5983630 0.21 5996401 138 12805 5972933 0.21 5985738 139 12796 5962154 0.21 5974950 140 12903 5943209 0.22 5956112 141 12803 5924011 0.22 5936814 142 13057 5917807 0.22 5930864 143 13288 5907972 0.22 5921260 144 13557 5896030 0.23 5909587 145 14112 5898297 0.24 5912409 146 14721 5898654 0.25 5913375 147 15343 5885263 0.26 5900606 148 15077 5871378 0.26 5886455 149 14581 5814800 0.25 5829381 150 12903 5452235 0.24 5465138 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2410 1032185 0.23 1034595 2 38182 987656 3.72 1025838 3 55704 754305 6.88 810009 4 51236 791471 6.08 842707 5 64925 929171 6.53 994096 6 68126 929926 6.83 998052 7 70439 988952 6.65 1059391 8 67832 873456 7.21 941288 9 70243 889801 7.32 960044 10 70955 886296 7.41 957251 11 71184 877862 7.50 949046 12 71431 867947 7.60 939378 13 73307 859719 7.86 933026 14 73806 852888 7.96 926694 15 74105 854759 7.98 928864 16 74705 849139 8.09 923844 17 75781 855988 8.13 931769 18 76166 861944 8.12 938110 19 77353 864381 8.21 941734 20 77991 863709 8.28 941700 21 78200 858778 8.35 936978 22 78275 852959 8.41 931234 23 79419 851562 8.53 930981 24 78730 840119 8.57 918849 25 78694 830670 8.65 909364 26 79692 833971 8.72 913663 27 79254 836513 8.65 915767 28 80149 839648 8.71 919797 29 81083 842104 8.78 923187 30 80865 842391 8.76 923256 31 80785 834788 8.82 915573 32 81486 831783 8.92 913269 33 80615 825930 8.89 906545 34 81351 821102 9.01 902453 35 81313 816472 9.06 897785 36 80857 812117 9.05 892974 37 81215 811370 9.10 892585 38 82278 811748 9.20 894026 39 81379 811945 9.11 893324 40 82111 809634 9.21 891745 41 82628 814667 9.21 897295 42 82303 807864 9.25 890167 43 83292 807381 9.35 890673 44 82824 801556 9.37 884380 45 82216 790096 9.43 872312 46 81981 786727 9.44 868708 47 82747 787159 9.51 869906 48 82191 789879 9.42 872070 49 82586 787790 9.49 870376 50 82858 787605 9.52 870463 51 82705 778957 9.60 861662 52 83120 777768 9.66 860888 53 82234 776204 9.58 858438 54 82665 773361 9.66 856026 55 83055 768439 9.75 851494 56 82330 765833 9.71 848163 57 83134 761264 9.85 844398 58 82513 761232 9.78 843745 59 83033 762363 9.82 845396 60 81435 756974 9.71 838409 61 82122 754673 9.81 836795 62 82056 756272 9.79 838328 63 81962 750552 9.85 832514 64 82203 747201 9.91 829404 65 82263 744317 9.95 826580 66 80723 735288 9.89 816011 67 81563 735392 9.98 816955 68 82150 736751 10.03 818901 69 81195 729259 10.02 810454 70 81020 727636 10.02 808656 71 81343 727872 10.05 809215 72 80975 724011 10.06 804986 73 80683 723057 10.04 803740 74 81314 720485 10.14 801799 75 80479 713006 10.14 793485 76 80344 710730 10.16 791074 77 80272 707882 10.18 788154 78 80328 705763 10.22 786091 79 79812 703692 10.19 783504 80 79742 704552 10.17 784294 81 79172 700021 10.16 779193 82 79520 697051 10.24 776571 83 79114 694995 10.22 774109 84 78785 690473 10.24 769258 85 79027 686426 10.32 765453 86 79128 683626 10.37 762754 87 78152 677947 10.34 756099 88 78134 675300 10.37 753434 89 78051 675170 10.36 753221 90 77263 671990 10.31 749253 91 77391 669941 10.36 747332 92 77058 668649 10.33 745707 93 76607 667019 10.30 743626 94 76972 661639 10.42 738611 95 76706 658273 10.44 734979 96 75962 654170 10.40 730132 97 75611 648310 10.44 723921 98 76396 647399 10.55 723795 99 75675 644728 10.50 720403 100 75015 644103 10.43 719118 101 74813 641516 10.44 716329 102 74458 637121 10.46 711579 103 73842 635076 10.42 708918 104 73983 632151 10.48 706134 105 73816 628149 10.52 701965 106 73512 625429 10.52 698941 107 72493 621090 10.45 693583 108 72113 615896 10.48 688009 109 72080 613581 10.51 685661 110 71740 611845 10.49 683585 111 72049 608670 10.58 680719 112 71725 606620 10.57 678345 113 71233 605540 10.53 676773 114 71105 602037 10.56 673142 115 70678 597312 10.58 667990 116 70122 593463 10.57 663585 117 70003 588469 10.63 658472 118 69616 585056 10.63 654672 119 69210 585705 10.57 654915 120 68677 582419 10.55 651096 121 69020 577663 10.67 646683 122 68153 576829 10.57 644982 123 67545 573984 10.53 641529 124 67798 571594 10.60 639392 125 67904 566520 10.70 634424 126 67318 562932 10.68 630250 127 66603 557512 10.67 624115 128 65671 553890 10.60 619561 129 65123 549328 10.60 614451 130 65394 545092 10.71 610486 131 65177 543675 10.70 608852 132 64602 540889 10.67 605491 133 64578 538231 10.71 602809 134 63865 533963 10.68 597828 135 63480 531364 10.67 594844 136 63317 527400 10.72 590717 137 62156 525198 10.58 587354 138 62457 521432 10.70 583889 139 61389 515902 10.63 577291 140 61251 514183 10.64 575434 141 61164 510246 10.70 571410 142 61285 506447 10.79 567732 143 60154 504633 10.65 564787 144 59879 499457 10.71 559336 145 59126 495976 10.65 555102 146 58943 491296 10.71 550239 147 58435 487939 10.70 546374 148 57553 480361 10.70 537914 149 56785 435200 11.54 491985 150 49773 0 100.00 49773 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2103 1721818 0.12 1723921 2 1844 1082752 0.17 1084596 3 5196 2138903 0.24 2144099 4 6311 1039625 0.60 1045936 5 2225 1144640 0.19 1146865 6 2561 1326058 0.19 1328619 7 2757 1446218 0.19 1448975 8 2770 1385169 0.20 1387939 9 2595 1268453 0.20 1271048 10 2657 1332864 0.20 1335521 11 2449 1293834 0.19 1296283 12 2547 1275814 0.20 1278361 13 2427 1273681 0.19 1276108 14 2588 1265078 0.20 1267666 15 2577 1267586 0.20 1270163 16 2512 1270326 0.20 1272838 17 2605 1260771 0.21 1263376 18 2698 1274112 0.21 1276810 19 2636 1270479 0.21 1273115 20 2650 1265277 0.21 1267927 21 2606 1269209 0.20 1271815 22 2578 1260542 0.20 1263120 23 2646 1260403 0.21 1263049 24 2698 1255277 0.21 1257975 25 2700 1253869 0.21 1256569 26 2734 1249678 0.22 1252412 27 2729 1249295 0.22 1252024 28 2619 1254633 0.21 1257252 29 2724 1248162 0.22 1250886 30 2823 1251463 0.23 1254286 31 2738 1250483 0.22 1253221 32 2771 1237020 0.22 1239791 33 2678 1240656 0.22 1243334 34 2727 1234110 0.22 1236837 35 2707 1233866 0.22 1236573 36 2744 1228016 0.22 1230760 37 2757 1224359 0.22 1227116 38 2820 1222575 0.23 1225395 39 2787 1220230 0.23 1223017 40 2893 1213111 0.24 1216004 41 2876 1210798 0.24 1213674 42 2706 1208895 0.22 1211601 43 2699 1208214 0.22 1210913 44 2785 1203593 0.23 1206378 45 2742 1203614 0.23 1206356 46 2748 1198173 0.23 1200921 47 2818 1191101 0.24 1193919 48 2756 1193198 0.23 1195954 49 2787 1189499 0.23 1192286 50 2662 1186762 0.22 1189424 51 2791 1183723 0.24 1186514 52 2704 1173457 0.23 1176161 53 2849 1172650 0.24 1175499 54 2732 1170938 0.23 1173670 55 2620 1172536 0.22 1175156 56 2824 1167120 0.24 1169944 57 2803 1165068 0.24 1167871 58 2684 1161417 0.23 1164101 59 2814 1154632 0.24 1157446 60 2694 1148761 0.23 1151455 61 2632 1149574 0.23 1152206 62 2640 1140159 0.23 1142799 63 2614 1138129 0.23 1140743 64 2645 1137608 0.23 1140253 65 2690 1130656 0.24 1133346 66 2686 1131442 0.24 1134128 67 2771 1130032 0.24 1132803 68 2756 1122770 0.24 1125526 69 2706 1127254 0.24 1129960 70 2727 1119248 0.24 1121975 71 2721 1107888 0.25 1110609 72 2707 1105255 0.24 1107962 73 2638 1105297 0.24 1107935 74 2588 1101533 0.23 1104121 75 2612 1095285 0.24 1097897 76 2646 1093885 0.24 1096531 77 2623 1091697 0.24 1094320 78 2735 1088259 0.25 1090994 79 2571 1085730 0.24 1088301 80 2711 1080261 0.25 1082972 81 2535 1073899 0.24 1076434 82 2689 1070079 0.25 1072768 83 2534 1060977 0.24 1063511 84 2583 1059467 0.24 1062050 85 2607 1056460 0.25 1059067 86 2552 1049861 0.24 1052413 87 2504 1049688 0.24 1052192 88 2534 1043393 0.24 1045927 89 2554 1037904 0.25 1040458 90 2520 1034823 0.24 1037343 91 2519 1029530 0.24 1032049 92 2478 1024457 0.24 1026935 93 2497 1023818 0.24 1026315 94 2567 1018352 0.25 1020919 95 2527 1011427 0.25 1013954 96 2540 1009528 0.25 1012068 97 2478 1005007 0.25 1007485 98 2529 996214 0.25 998743 99 2517 994784 0.25 997301 100 2336 991248 0.24 993584 101 2430 987291 0.25 989721 102 2372 983619 0.24 985991 103 2472 976061 0.25 978533 104 2444 969484 0.25 971928 105 2504 966833 0.26 969337 106 2343 961913 0.24 964256 107 2367 955017 0.25 957384 108 2323 951685 0.24 954008 109 2400 946654 0.25 949054 110 2292 941501 0.24 943793 111 2429 938634 0.26 941063 112 2316 935628 0.25 937944 113 2449 929983 0.26 932432 114 2260 923602 0.24 925862 115 2260 923353 0.24 925613 116 2382 914406 0.26 916788 117 2306 909359 0.25 911665 118 2280 903250 0.25 905530 119 2193 898955 0.24 901148 120 2222 897697 0.25 899919 121 2239 890843 0.25 893082 122 2235 884441 0.25 886676 123 2169 881378 0.25 883547 124 2228 876748 0.25 878976 125 2211 869645 0.25 871856 126 2215 866168 0.26 868383 127 2193 860663 0.25 862856 128 2228 850537 0.26 852765 129 2195 847559 0.26 849754 130 2199 839144 0.26 841343 131 2197 836306 0.26 838503 132 2165 831071 0.26 833236 133 2169 826692 0.26 828861 134 2170 819007 0.26 821177 135 2190 816551 0.27 818741 136 2144 810606 0.26 812750 137 2104 804055 0.26 806159 138 2161 800456 0.27 802617 139 2152 794033 0.27 796185 140 2108 786735 0.27 788843 141 2134 785875 0.27 788009 142 2117 779183 0.27 781300 143 2121 770874 0.27 772995 144 2090 766105 0.27 768195 145 2043 760709 0.27 762752 146 2086 753220 0.28 755306 147 2073 747089 0.28 749162 148 2053 736429 0.28 738482 149 1917 676701 0.28 678618 150 1436 0 100.00 1436 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 8715 7818953 0.11 7827668 2 9414 6332586 0.15 6342000 3 9555 6281552 0.15 6291107 4 9414 6145136 0.15 6154550 5 8547 5595979 0.15 5604526 6 8089 5334099 0.15 5342188 7 8586 5833655 0.15 5842241 8 8735 5752865 0.15 5761600 9 8871 5588901 0.16 5597772 10 8885 5630447 0.16 5639332 11 9044 5608999 0.16 5618043 12 8986 5563062 0.16 5572048 13 8911 5524419 0.16 5533330 14 8959 5511220 0.16 5520179 15 9142 5500376 0.17 5509518 16 9304 5536219 0.17 5545523 17 9486 5561510 0.17 5570996 18 9602 5557014 0.17 5566616 19 9822 5561588 0.18 5571410 20 9772 5550644 0.18 5560416 21 9713 5522709 0.18 5532422 22 9800 5473885 0.18 5483685 23 10054 5448857 0.18 5458911 24 9769 5397724 0.18 5407493 25 9845 5395811 0.18 5405656 26 10001 5404957 0.18 5414958 27 10145 5422120 0.19 5432265 28 10061 5443484 0.18 5453545 29 10249 5435462 0.19 5445711 30 10145 5410203 0.19 5420348 31 10240 5388239 0.19 5398479 32 10116 5350231 0.19 5360347 33 9864 5303507 0.19 5313371 34 10050 5291995 0.19 5302045 35 10207 5286230 0.19 5296437 36 9860 5277027 0.19 5286887 37 10111 5291759 0.19 5301870 38 10256 5299313 0.19 5309569 39 10197 5286717 0.19 5296914 40 10258 5290244 0.19 5300502 41 10360 5273185 0.20 5283545 42 10366 5243766 0.20 5254132 43 10181 5218406 0.19 5228587 44 10236 5187404 0.20 5197640 45 9986 5166402 0.19 5176388 46 10192 5162838 0.20 5173030 47 10351 5163752 0.20 5174103 48 10270 5162344 0.20 5172614 49 10355 5163187 0.20 5173542 50 10366 5156965 0.20 5167331 51 10228 5130019 0.20 5140247 52 10427 5103735 0.20 5114162 53 10181 5092144 0.20 5102325 54 10154 5062699 0.20 5072853 55 9936 5042620 0.20 5052556 56 10086 5040580 0.20 5050666 57 10136 5018445 0.20 5028581 58 10270 5016958 0.20 5027228 59 10405 5018646 0.21 5029051 60 10170 4994356 0.20 5004526 61 10070 5003990 0.20 5014060 62 10261 4971998 0.21 4982259 63 9975 4942700 0.20 4952675 64 10041 4930348 0.20 4940389 65 9945 4904535 0.20 4914480 66 9968 4886229 0.20 4896197 67 10180 4885740 0.21 4895920 68 10328 4873152 0.21 4883480 69 9988 4844986 0.21 4854974 70 9964 4839506 0.21 4849470 71 10023 4832582 0.21 4842605 72 10033 4811150 0.21 4821183 73 9919 4797432 0.21 4807351 74 9858 4770296 0.21 4780154 75 9714 4743114 0.20 4752828 76 9850 4737072 0.21 4746922 77 9761 4728686 0.21 4738447 78 9873 4713396 0.21 4723269 79 9993 4714560 0.21 4724553 80 9788 4697717 0.21 4707505 81 9633 4676277 0.21 4685910 82 9561 4660285 0.20 4669846 83 9520 4635081 0.20 4644601 84 9360 4603249 0.20 4612609 85 9513 4592322 0.21 4601835 86 9286 4579228 0.20 4588514 87 9349 4559496 0.20 4568845 88 9278 4552970 0.20 4562248 89 9338 4544857 0.21 4554195 90 9205 4531223 0.20 4540428 91 9399 4512181 0.21 4521580 92 9128 4492549 0.20 4501677 93 9275 4466352 0.21 4475627 94 9361 4449103 0.21 4458464 95 9150 4409875 0.21 4419025 96 8888 4387620 0.20 4396508 97 8977 4376187 0.20 4385164 98 8889 4359706 0.20 4368595 99 8842 4347667 0.20 4356509 100 8874 4337587 0.20 4346461 101 8874 4318077 0.21 4326951 102 8852 4296225 0.21 4305077 103 8704 4281712 0.20 4290416 104 8618 4260857 0.20 4269475 105 8632 4234177 0.20 4242809 106 8670 4204238 0.21 4212908 107 8626 4187637 0.21 4196263 108 8577 4158964 0.21 4167541 109 8547 4148291 0.21 4156838 110 8391 4140621 0.20 4149012 111 8710 4127733 0.21 4136443 112 8454 4108123 0.21 4116577 113 8453 4084597 0.21 4093050 114 8361 4062161 0.21 4070522 115 8484 4030894 0.21 4039378 116 8223 4004347 0.20 4012570 117 8224 3974233 0.21 3982457 118 8196 3961017 0.21 3969213 119 8371 3938694 0.21 3947065 120 8410 3928210 0.21 3936620 121 8082 3913245 0.21 3921327 122 8176 3895431 0.21 3903607 123 8005 3868806 0.21 3876811 124 8021 3848340 0.21 3856361 125 8150 3823281 0.21 3831431 126 7868 3794700 0.21 3802568 127 7964 3767884 0.21 3775848 128 7958 3742030 0.21 3749988 129 7845 3721920 0.21 3729765 130 7920 3700622 0.21 3708542 131 7938 3688845 0.21 3696783 132 7969 3668531 0.22 3676500 133 7808 3652664 0.21 3660472 134 7918 3626337 0.22 3634255 135 7837 3595898 0.22 3603735 136 7750 3572300 0.22 3580050 137 7648 3543464 0.22 3551112 138 7793 3521677 0.22 3529470 139 7684 3498983 0.22 3506667 140 7806 3476483 0.22 3484289 141 7832 3456018 0.23 3463850 142 7698 3433474 0.22 3441172 143 7881 3409992 0.23 3417873 144 7793 3384988 0.23 3392781 145 7796 3362850 0.23 3370646 146 7916 3336638 0.24 3344554 147 7937 3297589 0.24 3305526 148 7977 3255564 0.24 3263541 149 7461 3000285 0.25 3007746 150 5447 0 100.00 5447