CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 112690 650932 14.76 763622 2 92651 589225 13.59 681876 3 79664 767666 9.40 847330 4 123680 940338 11.62 1064018 5 118324 825479 12.54 943803 6 113093 926750 10.88 1039843 7 110488 825272 11.81 935760 8 112372 853486 11.63 965858 9 111409 855459 11.52 966868 10 109567 844799 11.48 954366 11 106591 828114 11.40 934705 12 108591 825974 11.62 934565 13 108056 819782 11.65 927838 14 108191 816120 11.71 924311 15 107735 815614 11.67 923349 16 109214 823556 11.71 932770 17 109534 826813 11.70 936347 18 109338 834091 11.59 943429 19 109539 838466 11.55 948005 20 110023 836267 11.63 946290 21 109315 836333 11.56 945648 22 110949 835330 11.72 946279 23 109466 825044 11.71 934510 24 109143 818074 11.77 927217 25 109014 818810 11.75 927824 26 109476 822523 11.75 931999 27 109188 832850 11.59 942038 28 110637 838786 11.65 949423 29 109320 839002 11.53 948322 30 109040 838908 11.50 947948 31 109143 838801 11.51 947944 32 109027 834751 11.55 943778 33 108551 833330 11.52 941881 34 109894 830786 11.68 940680 35 109271 826905 11.67 936176 36 108395 827772 11.58 936167 37 109161 829501 11.63 938662 38 108597 831724 11.55 940321 39 109366 836164 11.57 945530 40 110811 844906 11.59 955717 41 109997 842753 11.55 952750 42 109300 840567 11.51 949867 43 109853 837916 11.59 947769 44 108499 829870 11.56 938369 45 107986 824736 11.58 932722 46 108784 831574 11.57 940358 47 108769 832031 11.56 940800 48 108676 837733 11.48 946409 49 109182 838535 11.52 947717 50 107572 833863 11.43 941435 51 108028 834751 11.46 942779 52 108446 838488 11.45 946934 53 107802 832804 11.46 940606 54 108303 831242 11.53 939545 55 108627 832320 11.54 940947 56 107485 828666 11.48 936151 57 106988 829090 11.43 936078 58 107401 834392 11.40 941793 59 106691 829687 11.39 936378 60 106372 833774 11.31 940146 61 107375 838236 11.36 945611 62 106550 835050 11.32 941600 63 107049 834529 11.37 941578 64 106824 833197 11.36 940021 65 105778 826083 11.35 931861 66 105895 827327 11.35 933222 67 105937 830296 11.32 936233 68 106152 827150 11.37 933302 69 105275 831188 11.24 936463 70 105620 829171 11.30 934791 71 104738 830429 11.20 935167 72 105491 832828 11.24 938319 73 105209 832062 11.23 937271 74 104615 825833 11.24 930448 75 104375 824371 11.24 928746 76 105103 825137 11.30 930240 77 104492 824582 11.25 929074 78 104962 827721 11.25 932683 79 104283 828997 11.17 933280 80 103576 828993 11.11 932569 81 103059 828740 11.06 931799 82 103431 827447 11.11 930878 83 103115 825476 11.10 928591 84 103089 828087 11.07 931176 85 103404 824046 11.15 927450 86 102163 819997 11.08 922160 87 102730 818353 11.15 921083 88 102640 821883 11.10 924523 89 101827 821676 11.03 923503 90 101785 824491 10.99 926276 91 101831 827666 10.96 929497 92 100675 825531 10.87 926206 93 100821 823325 10.91 924146 94 101542 823307 10.98 924849 95 100721 820302 10.94 921023 96 99975 815135 10.92 915110 97 100256 816249 10.94 916505 98 99984 817778 10.89 917762 99 99681 819961 10.84 919642 100 99512 822311 10.80 921823 101 99340 819644 10.81 918984 102 99059 818833 10.79 917892 103 99159 820804 10.78 919963 104 98640 817963 10.76 916603 105 98653 816180 10.78 914833 106 98236 815505 10.75 913741 107 96914 809910 10.69 906824 108 96796 807831 10.70 904627 109 97467 811300 10.73 908767 110 97783 813882 10.73 911665 111 97042 816490 10.62 913532 112 96926 816348 10.61 913274 113 95932 813596 10.55 909528 114 95994 811958 10.57 907952 115 96465 809937 10.64 906402 116 95378 806955 10.57 902333 117 94989 805403 10.55 900392 118 95101 808035 10.53 903136 119 94451 803657 10.52 898108 120 94543 806478 10.49 901021 121 93870 808145 10.41 902015 122 93737 807713 10.40 901450 123 94246 809321 10.43 903567 124 93343 807455 10.36 900798 125 92922 804070 10.36 896992 126 93362 799900 10.45 893262 127 92436 799518 10.36 891954 128 92215 795422 10.39 887637 129 91555 793081 10.35 884636 130 91484 793643 10.34 885127 131 90643 792736 10.26 883379 132 91136 793402 10.30 884538 133 91056 795018 10.28 886074 134 90699 792579 10.27 883278 135 90286 789839 10.26 880125 136 89347 789259 10.17 878606 137 88525 785721 10.13 874246 138 88595 784905 10.14 873500 139 88801 787061 10.14 875862 140 88251 781789 10.14 870040 141 88309 782394 10.14 870703 142 87442 781992 10.06 869434 143 87122 779318 10.06 866440 144 86957 779544 10.04 866501 145 85949 777018 9.96 862967 146 86725 774202 10.07 860927 147 85835 776281 9.96 862116 148 84991 772601 9.91 857592 149 82680 767719 9.72 850399 150 72226 715071 9.17 787297 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2060 1210589 0.17 1212649 2 2082 907162 0.23 909244 3 2258 1206746 0.19 1209004 4 2934 1381523 0.21 1384457 5 3053 1423045 0.21 1426098 6 3209 1354840 0.24 1358049 7 3072 1274703 0.24 1277775 8 3111 1399209 0.22 1402320 9 3134 1317894 0.24 1321028 10 3047 1291501 0.24 1294548 11 3117 1291725 0.24 1294842 12 3157 1287237 0.24 1290394 13 3126 1281714 0.24 1284840 14 3230 1282613 0.25 1285843 15 3390 1278598 0.26 1281988 16 3605 1285007 0.28 1288612 17 3463 1286850 0.27 1290313 18 3433 1290733 0.27 1294166 19 3474 1292881 0.27 1296355 20 3512 1290674 0.27 1294186 21 3597 1293258 0.28 1296855 22 3520 1284263 0.27 1287783 23 3539 1285452 0.27 1288991 24 3661 1282424 0.28 1286085 25 3366 1277665 0.26 1281031 26 3528 1298155 0.27 1301683 27 3541 1297464 0.27 1301005 28 3565 1299208 0.27 1302773 29 3565 1304699 0.27 1308264 30 3595 1298090 0.28 1301685 31 3476 1296921 0.27 1300397 32 3516 1301782 0.27 1305298 33 3506 1302321 0.27 1305827 34 3600 1297188 0.28 1300788 35 3590 1304884 0.27 1308474 36 3676 1303581 0.28 1307257 37 3671 1295167 0.28 1298838 38 3553 1294949 0.27 1298502 39 3662 1296816 0.28 1300478 40 3743 1298864 0.29 1302607 41 3719 1301195 0.28 1304914 42 3842 1297169 0.30 1301011 43 3701 1299680 0.28 1303381 44 3673 1304007 0.28 1307680 45 3563 1297376 0.27 1300939 46 3604 1297521 0.28 1301125 47 3619 1303668 0.28 1307287 48 3684 1303310 0.28 1306994 49 3582 1296688 0.28 1300270 50 3596 1295757 0.28 1299353 51 3630 1297107 0.28 1300737 52 3598 1295813 0.28 1299411 53 3580 1303871 0.27 1307451 54 3643 1304325 0.28 1307968 55 3531 1299354 0.27 1302885 56 3605 1302245 0.28 1305850 57 3677 1301943 0.28 1305620 58 3542 1294935 0.27 1298477 59 3544 1299152 0.27 1302696 60 3660 1295540 0.28 1299200 61 3512 1292674 0.27 1296186 62 3561 1298246 0.27 1301807 63 3562 1294754 0.27 1298316 64 3397 1296825 0.26 1300222 65 3627 1305601 0.28 1309228 66 3634 1303776 0.28 1307410 67 3460 1306511 0.26 1309971 68 3748 1306357 0.29 1310105 69 3686 1294648 0.28 1298334 70 3457 1290351 0.27 1293808 71 3620 1296070 0.28 1299690 72 3689 1294092 0.28 1297781 73 3649 1294234 0.28 1297883 74 3666 1300101 0.28 1303767 75 3645 1297852 0.28 1301497 76 3629 1298669 0.28 1302298 77 3737 1303655 0.29 1307392 78 3711 1297106 0.29 1300817 79 3515 1296604 0.27 1300119 80 3541 1298046 0.27 1301587 81 3584 1292105 0.28 1295689 82 3623 1291773 0.28 1295396 83 3620 1296124 0.28 1299744 84 3481 1292375 0.27 1295856 85 3602 1290903 0.28 1294505 86 3470 1289480 0.27 1292950 87 3560 1291390 0.27 1294950 88 3512 1287267 0.27 1290779 89 3549 1288015 0.27 1291564 90 3621 1287350 0.28 1290971 91 3592 1286821 0.28 1290413 92 3627 1288144 0.28 1291771 93 3619 1284881 0.28 1288500 94 3769 1282420 0.29 1286189 95 3665 1282843 0.28 1286508 96 3603 1276806 0.28 1280409 97 3517 1276078 0.27 1279595 98 3553 1279660 0.28 1283213 99 3585 1281335 0.28 1284920 100 3403 1276346 0.27 1279749 101 3594 1276356 0.28 1279950 102 3524 1275743 0.28 1279267 103 3466 1270506 0.27 1273972 104 3497 1271684 0.27 1275181 105 3419 1267188 0.27 1270607 106 3338 1265377 0.26 1268715 107 3411 1263948 0.27 1267359 108 3367 1263494 0.27 1266861 109 3453 1262265 0.27 1265718 110 3463 1265402 0.27 1268865 111 3418 1265041 0.27 1268459 112 3377 1263208 0.27 1266585 113 3447 1260426 0.27 1263873 114 3353 1261069 0.27 1264422 115 3373 1257732 0.27 1261105 116 3376 1255316 0.27 1258692 117 3391 1255517 0.27 1258908 118 3376 1254424 0.27 1257800 119 3459 1254979 0.27 1258438 120 3418 1248179 0.27 1251597 121 3334 1250215 0.27 1253549 122 3369 1253903 0.27 1257272 123 3351 1250014 0.27 1253365 124 3428 1245319 0.27 1248747 125 3315 1242050 0.27 1245365 126 3309 1234628 0.27 1237937 127 3284 1230378 0.27 1233662 128 3346 1228449 0.27 1231795 129 3273 1226670 0.27 1229943 130 3291 1227265 0.27 1230556 131 3381 1225437 0.28 1228818 132 3321 1222293 0.27 1225614 133 3405 1222959 0.28 1226364 134 3380 1221055 0.28 1224435 135 3384 1219989 0.28 1223373 136 3334 1214932 0.27 1218266 137 3436 1214273 0.28 1217709 138 3404 1211974 0.28 1215378 139 3345 1210818 0.28 1214163 140 3499 1206507 0.29 1210006 141 3651 1203211 0.30 1206862 142 3431 1199262 0.29 1202693 143 3514 1198872 0.29 1202386 144 3624 1193571 0.30 1197195 145 3871 1194917 0.32 1198788 146 4434 1191676 0.37 1196110 147 4490 1184976 0.38 1189466 148 4369 1181764 0.37 1186133 149 3974 1179862 0.34 1183836 150 3490 1075024 0.32 1078514 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 8560 4757950 0.18 4766510 2 9152 4823852 0.19 4833004 3 10569 6183894 0.17 6194463 4 12368 7045611 0.18 7057979 5 10930 6234413 0.18 6245343 6 10554 6025537 0.17 6036091 7 10759 5955362 0.18 5966121 8 11291 6227536 0.18 6238827 9 10757 5911154 0.18 5921911 10 10883 5875271 0.18 5886154 11 10901 5814900 0.19 5825801 12 11253 5766272 0.19 5777525 13 11315 5749856 0.20 5761171 14 11334 5714816 0.20 5726150 15 11499 5658196 0.20 5669695 16 11391 5682306 0.20 5693697 17 11687 5677453 0.21 5689140 18 11869 5699046 0.21 5710915 19 12399 5727628 0.22 5740027 20 12269 5721968 0.21 5734237 21 12544 5715696 0.22 5728240 22 12436 5708524 0.22 5720960 23 12367 5706298 0.22 5718665 24 12435 5704684 0.22 5717119 25 12450 5676939 0.22 5689389 26 12163 5680111 0.21 5692274 27 12376 5690642 0.22 5703018 28 12714 5730113 0.22 5742827 29 12706 5751668 0.22 5764374 30 12826 5761902 0.22 5774728 31 12997 5767378 0.22 5780375 32 13254 5746340 0.23 5759594 33 13065 5719724 0.23 5732789 34 12819 5722872 0.22 5735691 35 12708 5692688 0.22 5705396 36 12734 5673568 0.22 5686302 37 12962 5679747 0.23 5692709 38 12651 5694914 0.22 5707565 39 13161 5708008 0.23 5721169 40 13056 5735174 0.23 5748230 41 12900 5727149 0.22 5740049 42 12947 5726478 0.23 5739425 43 12976 5730035 0.23 5743011 44 12572 5711687 0.22 5724259 45 12700 5695017 0.22 5707717 46 12475 5697760 0.22 5710235 47 12676 5687872 0.22 5700548 48 12907 5699905 0.23 5712812 49 12923 5729482 0.23 5742405 50 12875 5729172 0.22 5742047 51 13028 5736060 0.23 5749088 52 12965 5750717 0.22 5763682 53 13025 5729607 0.23 5742632 54 12618 5714432 0.22 5727050 55 12680 5710159 0.22 5722839 56 12782 5695290 0.22 5708072 57 12621 5687825 0.22 5700446 58 12910 5691566 0.23 5704476 59 12802 5684791 0.22 5697593 60 12861 5703914 0.22 5716775 61 13294 5731891 0.23 5745185 62 13039 5737516 0.23 5750555 63 13037 5724643 0.23 5737680 64 13267 5735154 0.23 5748421 65 12718 5722406 0.22 5735124 66 12817 5717988 0.22 5730805 67 12906 5726504 0.22 5739410 68 13029 5716072 0.23 5729101 69 12932 5697681 0.23 5710613 70 12978 5716492 0.23 5729470 71 12916 5719590 0.23 5732506 72 13076 5724561 0.23 5737637 73 13077 5738526 0.23 5751603 74 12846 5719831 0.22 5732677 75 12664 5707174 0.22 5719838 76 12816 5706778 0.22 5719594 77 12815 5696378 0.22 5709193 78 13096 5685984 0.23 5699080 79 12979 5705672 0.23 5718651 80 12727 5706433 0.22 5719160 81 13110 5708284 0.23 5721394 82 12909 5727551 0.22 5740460 83 12782 5717854 0.22 5730636 84 12800 5706602 0.22 5719402 85 12651 5698999 0.22 5711650 86 12438 5673801 0.22 5686239 87 12608 5665194 0.22 5677802 88 12517 5679053 0.22 5691570 89 12693 5670773 0.22 5683466 90 12522 5676402 0.22 5688924 91 12544 5696173 0.22 5708717 92 12649 5701255 0.22 5713904 93 12540 5686997 0.22 5699537 94 12611 5694628 0.22 5707239 95 12742 5678002 0.22 5690744 96 12315 5659860 0.22 5672175 97 12439 5654604 0.22 5667043 98 12494 5655720 0.22 5668214 99 12513 5657018 0.22 5669531 100 12579 5669671 0.22 5682250 101 12569 5665008 0.22 5677577 102 12465 5661135 0.22 5673600 103 12748 5655892 0.22 5668640 104 12488 5646665 0.22 5659153 105 12359 5642228 0.22 5654587 106 12415 5630172 0.22 5642587 107 12193 5611435 0.22 5623628 108 12322 5596276 0.22 5608598 109 12372 5607233 0.22 5619605 110 12292 5611213 0.22 5623505 111 12313 5615539 0.22 5627852 112 12277 5617299 0.22 5629576 113 12424 5617690 0.22 5630114 114 12282 5605148 0.22 5617430 115 12412 5605537 0.22 5617949 116 12166 5591630 0.22 5603796 117 12184 5572477 0.22 5584661 118 12152 5559777 0.22 5571929 119 12071 5549034 0.22 5561105 120 12206 5545853 0.22 5558059 121 12215 5552685 0.22 5564900 122 12262 5548569 0.22 5560831 123 12061 5537157 0.22 5549218 124 12316 5534216 0.22 5546532 125 12263 5517095 0.22 5529358 126 12509 5507717 0.23 5520226 127 12214 5498167 0.22 5510381 128 12214 5489434 0.22 5501648 129 12163 5471798 0.22 5483961 130 12445 5471866 0.23 5484311 131 12044 5460187 0.22 5472231 132 12241 5448564 0.22 5460805 133 12273 5448490 0.22 5460763 134 12086 5442360 0.22 5454446 135 12530 5440414 0.23 5452944 136 12298 5436099 0.23 5448397 137 12373 5422751 0.23 5435124 138 12083 5411514 0.22 5423597 139 12651 5399548 0.23 5412199 140 12624 5373008 0.23 5385632 141 12555 5355182 0.23 5367737 142 12416 5352703 0.23 5365119 143 12825 5334704 0.24 5347529 144 13226 5329855 0.25 5343081 145 14100 5330845 0.26 5344945 146 15104 5323607 0.28 5338711 147 15523 5315617 0.29 5331140 148 14977 5301470 0.28 5316447 149 14524 5246119 0.28 5260643 150 12933 4916776 0.26 4929709 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2148 936514 0.23 938662 2 26771 943930 2.76 970701 3 46969 570724 7.60 617693 4 45803 727137 5.93 772940 5 65060 911319 6.66 976379 6 63413 815253 7.22 878666 7 62583 894767 6.54 957350 8 60922 796071 7.11 856993 9 64187 818209 7.27 882396 10 65100 815815 7.39 880915 11 64415 804767 7.41 869182 12 64428 784828 7.59 849256 13 66053 781466 7.79 847519 14 66672 778832 7.89 845504 15 66494 771917 7.93 838411 16 67187 768036 8.04 835223 17 68807 776087 8.14 844894 18 68835 775644 8.15 844479 19 69082 776977 8.17 846059 20 69731 779475 8.21 849206 21 69734 775119 8.25 844853 22 70029 769444 8.34 839473 23 71669 769601 8.52 841270 24 70875 758034 8.55 828909 25 70685 751639 8.60 822324 26 72164 751926 8.76 824090 27 71251 752707 8.65 823958 28 71654 753218 8.69 824872 29 72075 758054 8.68 830129 30 71925 756628 8.68 828553 31 71938 749922 8.75 821860 32 72797 749247 8.86 822044 33 72156 743964 8.84 816120 34 72491 741607 8.90 814098 35 73192 738119 9.02 811311 36 72824 730143 9.07 802967 37 72626 729605 9.05 802231 38 73589 732506 9.13 806095 39 72455 727690 9.06 800145 40 73621 726734 9.20 800355 41 74518 732045 9.24 806563 42 73518 727854 9.17 801372 43 73836 724426 9.25 798262 44 74166 722250 9.31 796416 45 72880 712261 9.28 785141 46 73553 707169 9.42 780722 47 73811 709456 9.42 783267 48 73174 706433 9.39 779607 49 72955 707827 9.34 780782 50 73849 708030 9.45 781879 51 72874 702441 9.40 775315 52 73404 696441 9.53 769845 53 73420 700452 9.49 773872 54 73665 692763 9.61 766428 55 73037 689135 9.58 762172 56 73780 689859 9.66 763639 57 73045 682653 9.67 755698 58 73026 683798 9.65 756824 59 73285 684186 9.67 757471 60 72962 676830 9.73 749792 61 72698 677640 9.69 750338 62 72726 680062 9.66 752788 63 72499 673011 9.72 745510 64 72740 669941 9.79 742681 65 72207 669394 9.74 741601 66 71762 659213 9.82 730975 67 72080 660491 9.84 732571 68 72754 659728 9.93 732482 69 71727 655100 9.87 726827 70 71669 654587 9.87 726256 71 71679 653843 9.88 725522 72 71335 649877 9.89 721212 73 71001 649175 9.86 720176 74 71332 647479 9.92 718811 75 71127 639524 10.01 710651 76 70926 637270 10.02 708196 77 70891 636507 10.02 707398 78 70882 634331 10.05 705213 79 71004 633797 10.07 704801 80 70817 632986 10.06 703803 81 70210 628108 10.05 698318 82 69572 625307 10.01 694879 83 69250 624018 9.99 693268 84 69441 621394 10.05 690835 85 69314 619637 10.06 688951 86 69423 617052 10.11 686475 87 68932 610852 10.14 679784 88 68860 609187 10.16 678047 89 68672 610252 10.11 678924 90 68766 606010 10.19 674776 91 68115 602966 10.15 671081 92 68001 604781 10.11 672782 93 67947 600056 10.17 668003 94 67305 598163 10.11 665468 95 67860 595487 10.23 663347 96 67547 590790 10.26 658337 97 66607 587727 10.18 654334 98 67291 586531 10.29 653822 99 66407 581996 10.24 648403 100 66757 582115 10.29 648872 101 66168 580008 10.24 646176 102 65394 577754 10.17 643148 103 65710 576268 10.24 641978 104 65230 575219 10.19 640449 105 64992 569962 10.24 634954 106 64980 568328 10.26 633308 107 64838 565523 10.29 630361 108 64378 559665 10.32 624043 109 63762 558675 10.24 622437 110 64321 557542 10.34 621863 111 64033 554614 10.35 618647 112 63752 554865 10.31 618617 113 63469 552505 10.30 615974 114 63359 550766 10.32 614125 115 63233 546763 10.37 609996 116 62896 544315 10.36 607211 117 62279 539699 10.35 601978 118 62162 537899 10.36 600061 119 62385 538381 10.38 600766 120 61741 532800 10.38 594541 121 61512 532432 10.36 593944 122 61679 530648 10.41 592327 123 60883 526244 10.37 587127 124 60139 526272 10.26 586411 125 60855 523692 10.41 584547 126 60689 520509 10.44 581198 127 59700 515690 10.38 575390 128 59449 513638 10.37 573087 129 59439 508073 10.47 567512 130 59156 506094 10.47 565250 131 59270 505266 10.50 564536 132 58571 501821 10.45 560392 133 58293 498646 10.47 556939 134 57847 496703 10.43 554550 135 57382 493684 10.41 551066 136 57179 489400 10.46 546579 137 56728 490283 10.37 547011 138 56312 485226 10.40 541538 139 56565 482274 10.50 538839 140 55902 481675 10.40 537577 141 55925 475032 10.53 530957 142 55387 474773 10.45 530160 143 55286 471268 10.50 526554 144 54700 468592 10.45 523292 145 54409 465212 10.47 519621 146 53870 461588 10.45 515458 147 53843 456771 10.54 510614 148 53369 451872 10.56 505241 149 51781 407121 11.28 458902 150 45575 0 100.00 45575 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2363 1742047 0.14 1744410 2 2011 1068149 0.19 1070160 3 4510 1367484 0.33 1371994 4 4457 820004 0.54 824461 5 2558 1083237 0.24 1085795 6 2903 1278437 0.23 1281340 7 2796 1298789 0.21 1301585 8 3063 1248902 0.24 1251965 9 2785 1142952 0.24 1145737 10 2703 1249936 0.22 1252639 11 2680 1184951 0.23 1187631 12 2658 1161424 0.23 1164082 13 2495 1156124 0.22 1158619 14 2579 1151022 0.22 1153601 15 2649 1149203 0.23 1151852 16 2525 1150100 0.22 1152625 17 2561 1145284 0.22 1147845 18 2693 1147437 0.23 1150130 19 2614 1147266 0.23 1149880 20 2697 1145712 0.23 1148409 21 2617 1146237 0.23 1148854 22 2583 1138432 0.23 1141015 23 2686 1137770 0.24 1140456 24 2659 1128290 0.24 1130949 25 2568 1128967 0.23 1131535 26 2653 1125702 0.24 1128355 27 2657 1124597 0.24 1127254 28 2593 1130320 0.23 1132913 29 2675 1124766 0.24 1127441 30 2612 1124866 0.23 1127478 31 2689 1125443 0.24 1128132 32 2604 1116991 0.23 1119595 33 2646 1113313 0.24 1115959 34 2567 1113625 0.23 1116192 35 2588 1109335 0.23 1111923 36 2582 1104907 0.23 1107489 37 2645 1106107 0.24 1108752 38 2680 1104810 0.24 1107490 39 2659 1097417 0.24 1100076 40 2616 1092708 0.24 1095324 41 2692 1090463 0.25 1093155 42 2709 1087931 0.25 1090640 43 2642 1086847 0.24 1089489 44 2619 1081383 0.24 1084002 45 2691 1081682 0.25 1084373 46 2630 1077929 0.24 1080559 47 2644 1070316 0.25 1072960 48 2709 1072109 0.25 1074818 49 2656 1071361 0.25 1074017 50 2659 1069283 0.25 1071942 51 2606 1064979 0.24 1067585 52 2576 1054952 0.24 1057528 53 2619 1052380 0.25 1054999 54 2576 1051190 0.24 1053766 55 2582 1053727 0.24 1056309 56 2662 1047487 0.25 1050149 57 2545 1044039 0.24 1046584 58 2670 1040715 0.26 1043385 59 2733 1037715 0.26 1040448 60 2558 1030732 0.25 1033290 61 2515 1032455 0.24 1034970 62 2566 1028003 0.25 1030569 63 2565 1020560 0.25 1023125 64 2540 1020170 0.25 1022710 65 2502 1016007 0.25 1018509 66 2640 1015623 0.26 1018263 67 2644 1014153 0.26 1016797 68 2610 1009541 0.26 1012151 69 2553 1012167 0.25 1014720 70 2520 1007835 0.25 1010355 71 2531 1000220 0.25 1002751 72 2530 991957 0.25 994487 73 2525 991332 0.25 993857 74 2532 989402 0.26 991934 75 2477 984631 0.25 987108 76 2518 983807 0.26 986325 77 2463 979572 0.25 982035 78 2447 977919 0.25 980366 79 2544 977221 0.26 979765 80 2447 972095 0.25 974542 81 2481 966823 0.26 969304 82 2519 961492 0.26 964011 83 2446 957802 0.25 960248 84 2383 953272 0.25 955655 85 2394 950907 0.25 953301 86 2427 946823 0.26 949250 87 2304 947328 0.24 949632 88 2414 939940 0.26 942354 89 2403 936229 0.26 938632 90 2413 933745 0.26 936158 91 2394 929132 0.26 931526 92 2416 926999 0.26 929415 93 2493 921248 0.27 923741 94 2347 922165 0.25 924512 95 2320 916982 0.25 919302 96 2297 913338 0.25 915635 97 2305 909728 0.25 912033 98 2321 901961 0.26 904282 99 2279 898127 0.25 900406 100 2217 897704 0.25 899921 101 2280 894441 0.25 896721 102 2326 888768 0.26 891094 103 2197 888288 0.25 890485 104 2210 881743 0.25 883953 105 2327 876891 0.26 879218 106 2226 874154 0.25 876380 107 2310 869053 0.27 871363 108 2225 866538 0.26 868763 109 2153 859839 0.25 861992 110 2219 857347 0.26 859566 111 2245 854722 0.26 856967 112 2202 851672 0.26 853874 113 2140 846910 0.25 849050 114 2159 842927 0.26 845086 115 2233 840708 0.26 842941 116 2185 835927 0.26 838112 117 2084 831819 0.25 833903 118 2213 828534 0.27 830747 119 2128 823267 0.26 825395 120 2147 822562 0.26 824709 121 2218 816182 0.27 818400 122 2091 813575 0.26 815666 123 2050 810690 0.25 812740 124 2155 806596 0.27 808751 125 2121 802272 0.26 804393 126 2167 799175 0.27 801342 127 2049 792317 0.26 794366 128 2147 785394 0.27 787541 129 2092 781127 0.27 783219 130 2045 777625 0.26 779670 131 2131 772931 0.27 775062 132 2088 768829 0.27 770917 133 2038 762818 0.27 764856 134 2060 760722 0.27 762782 135 2041 756506 0.27 758547 136 2037 748758 0.27 750795 137 2052 748526 0.27 750578 138 2101 743645 0.28 745746 139 2036 740442 0.27 742478 140 2023 734692 0.27 736715 141 2111 733461 0.29 735572 142 2079 728511 0.28 730590 143 2026 721830 0.28 723856 144 2104 717953 0.29 720057 145 2040 711775 0.29 713815 146 2036 703289 0.29 705325 147 1982 699117 0.28 701099 148 1989 689200 0.29 691189 149 1870 632803 0.29 634673 150 1365 0 100.00 1365 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9493 7434387 0.13 7443880 2 12878 6966913 0.18 6979791 3 10177 5182735 0.20 5192912 4 9187 4825155 0.19 4834342 5 8777 4768225 0.18 4777002 6 8626 4761841 0.18 4770467 7 9463 5449783 0.17 5459246 8 9749 5335517 0.18 5345266 9 9152 5045267 0.18 5054419 10 9383 5123475 0.18 5132858 11 9504 5080737 0.19 5090241 12 9257 4986997 0.19 4996254 13 9256 4964028 0.19 4973284 14 9210 4959152 0.19 4968362 15 9374 4928830 0.19 4938204 16 9377 4958781 0.19 4968158 17 9591 4988500 0.19 4998091 18 9477 4973267 0.19 4982744 19 9680 4993505 0.19 5003185 20 9863 4991867 0.20 5001730 21 9612 4955767 0.19 4965379 22 9590 4931683 0.19 4941273 23 9799 4912304 0.20 4922103 24 9747 4857964 0.20 4867711 25 9839 4839771 0.20 4849610 26 9823 4850358 0.20 4860181 27 9740 4846656 0.20 4856396 28 9921 4867593 0.20 4877514 29 9953 4875750 0.20 4885703 30 10011 4842491 0.21 4852502 31 9916 4832823 0.20 4842739 32 9996 4822084 0.21 4832080 33 9906 4765099 0.21 4775005 34 9712 4755973 0.20 4765685 35 10022 4753219 0.21 4763241 36 9726 4729813 0.21 4739539 37 9901 4739160 0.21 4749061 38 10012 4757093 0.21 4767105 39 9924 4730213 0.21 4740137 40 9876 4739341 0.21 4749217 41 10172 4731914 0.21 4742086 42 10060 4703031 0.21 4713091 43 10068 4683711 0.21 4693779 44 9987 4673600 0.21 4683587 45 9766 4629830 0.21 4639596 46 9755 4626569 0.21 4636324 47 9861 4634884 0.21 4644745 48 9969 4625078 0.22 4635047 49 9921 4624524 0.21 4634445 50 9951 4626351 0.21 4636302 51 10080 4598953 0.22 4609033 52 9819 4590615 0.21 4600434 53 9957 4581179 0.22 4591136 54 9622 4545975 0.21 4555597 55 9654 4536790 0.21 4546444 56 9566 4531257 0.21 4540823 57 9635 4500835 0.21 4510470 58 9621 4506452 0.21 4516073 59 9846 4511494 0.22 4521340 60 9679 4488248 0.22 4497927 61 9793 4493388 0.22 4503181 62 9848 4484994 0.22 4494842 63 9677 4446048 0.22 4455725 64 9472 4433590 0.21 4443062 65 9616 4417101 0.22 4426717 66 9546 4391596 0.22 4401142 67 9778 4387735 0.22 4397513 68 9750 4386103 0.22 4395853 69 9599 4361631 0.22 4371230 70 9290 4367621 0.21 4376911 71 9295 4358284 0.21 4367579 72 9371 4335303 0.22 4344674 73 9286 4322166 0.21 4331452 74 9411 4311274 0.22 4320685 75 8978 4282720 0.21 4291698 76 9394 4276776 0.22 4286170 77 9451 4267603 0.22 4277054 78 9210 4257161 0.22 4266371 79 9351 4256443 0.22 4265794 80 9164 4243890 0.22 4253054 81 9079 4220690 0.21 4229769 82 9092 4208561 0.22 4217653 83 9039 4197263 0.21 4206302 84 8831 4168045 0.21 4176876 85 8704 4157435 0.21 4166139 86 8769 4152340 0.21 4161109 87 8909 4137641 0.21 4146550 88 8931 4129899 0.22 4138830 89 8541 4125100 0.21 4133641 90 8804 4106639 0.21 4115443 91 8748 4095512 0.21 4104260 92 8830 4086636 0.22 4095466 93 8670 4057467 0.21 4066137 94 8681 4044196 0.21 4052877 95 8600 4023305 0.21 4031905 96 8493 3992950 0.21 4001443 97 8381 3989065 0.21 3997446 98 8537 3980096 0.21 3988633 99 8436 3964635 0.21 3973071 100 8597 3955501 0.22 3964098 101 8519 3946491 0.22 3955010 102 8298 3924188 0.21 3932486 103 8296 3914158 0.21 3922454 104 8356 3899040 0.21 3907396 105 8171 3872073 0.21 3880244 106 8391 3852173 0.22 3860564 107 8186 3842807 0.21 3850993 108 8161 3815136 0.21 3823297 109 8058 3806681 0.21 3814739 110 8286 3803368 0.22 3811654 111 8088 3788454 0.21 3796542 112 8051 3780006 0.21 3788057 113 8085 3761551 0.21 3769636 114 7858 3737424 0.21 3745282 115 7977 3716285 0.21 3724262 116 7950 3695678 0.21 3703628 117 8014 3666155 0.22 3674169 118 7808 3657178 0.21 3664986 119 7842 3647464 0.21 3655306 120 7871 3633580 0.22 3641451 121 7733 3620096 0.21 3627829 122 7655 3609804 0.21 3617459 123 7828 3589962 0.22 3597790 124 7661 3576171 0.21 3583832 125 7579 3558868 0.21 3566447 126 7700 3530301 0.22 3538001 127 7718 3505815 0.22 3513533 128 7646 3486189 0.22 3493835 129 7775 3466468 0.22 3474243 130 7477 3454355 0.22 3461832 131 7588 3446165 0.22 3453753 132 7589 3425925 0.22 3433514 133 7639 3414334 0.22 3421973 134 7571 3400760 0.22 3408331 135 7589 3364171 0.23 3371760 136 7652 3348662 0.23 3356314 137 7563 3324410 0.23 3331973 138 7578 3303747 0.23 3311325 139 7501 3288417 0.23 3295918 140 7599 3272819 0.23 3280418 141 7635 3259713 0.23 3267348 142 7460 3245115 0.23 3252575 143 7672 3224655 0.24 3232327 144 7626 3203993 0.24 3211619 145 7641 3182157 0.24 3189798 146 7692 3159590 0.24 3167282 147 7705 3125532 0.25 3133237 148 7745 3084024 0.25 3091769 149 7305 2838201 0.26 2845506 150 5021 0 100.00 5021