CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 112375 668494 14.39 780869 2 112996 779181 12.67 892177 3 101413 818587 11.02 920000 4 117381 895155 11.59 1012536 5 123989 924068 11.83 1048057 6 125816 961820 11.57 1087636 7 118606 849827 12.25 968433 8 119200 868468 12.07 987668 9 118315 865944 12.02 984259 10 115940 863258 11.84 979198 11 117073 868188 11.88 985261 12 118028 861994 12.04 980022 13 118246 865463 12.02 983709 14 118702 870371 12.00 989073 15 119131 865277 12.10 984408 16 119694 869527 12.10 989221 17 120229 875591 12.07 995820 18 119856 881008 11.98 1000864 19 120701 880255 12.06 1000956 20 121372 882380 12.09 1003752 21 121547 882969 12.10 1004516 22 121732 881568 12.13 1003300 23 121654 880232 12.14 1001886 24 121116 877283 12.13 998399 25 120630 876496 12.10 997126 26 120894 883369 12.04 1004263 27 121126 885393 12.03 1006519 28 121291 886413 12.04 1007704 29 121516 889400 12.02 1010916 30 122268 890508 12.07 1012776 31 121178 887484 12.01 1008662 32 122318 889888 12.08 1012206 33 121766 889357 12.04 1011123 34 121952 886018 12.10 1007970 35 121769 884422 12.10 1006191 36 121912 888897 12.06 1010809 37 121775 888988 12.05 1010763 38 121785 891027 12.02 1012812 39 121698 893415 11.99 1015113 40 122550 892765 12.07 1015315 41 122219 894769 12.02 1016988 42 121947 896209 11.98 1018156 43 122019 891754 12.04 1013773 44 122407 890534 12.08 1012941 45 121667 890919 12.02 1012586 46 122378 890059 12.09 1012437 47 122108 895111 12.00 1017219 48 122906 894835 12.08 1017741 49 122678 894932 12.06 1017610 50 120924 893054 11.93 1013978 51 121910 894427 12.00 1016337 52 122509 893903 12.05 1016412 53 122059 897788 11.97 1019847 54 121889 894352 11.99 1016241 55 122157 893756 12.02 1015913 56 121650 892939 11.99 1014589 57 121828 896372 11.97 1018200 58 121578 895268 11.96 1016846 59 121089 892782 11.94 1013871 60 121545 895011 11.96 1016556 61 121803 898393 11.94 1020196 62 121434 897375 11.92 1018809 63 121679 899242 11.92 1020921 64 121334 895602 11.93 1016936 65 121204 893608 11.94 1014812 66 121578 896830 11.94 1018408 67 120860 894906 11.90 1015766 68 120793 895109 11.89 1015902 69 121227 897360 11.90 1018587 70 120823 896007 11.88 1016830 71 121525 897844 11.92 1019369 72 121117 900934 11.85 1022051 73 121105 896456 11.90 1017561 74 120493 895825 11.86 1016318 75 120252 893208 11.87 1013460 76 120526 894429 11.88 1014955 77 120757 894813 11.89 1015570 78 120863 897040 11.87 1017903 79 120742 897961 11.85 1018703 80 120610 896071 11.86 1016681 81 119537 897178 11.76 1016715 82 120322 898187 11.81 1018509 83 119907 895656 11.81 1015563 84 120054 897944 11.79 1017998 85 119865 895339 11.81 1015204 86 119086 895620 11.74 1014706 87 120048 895699 11.82 1015747 88 119898 893002 11.84 1012900 89 119832 897397 11.78 1017229 90 118431 896538 11.67 1014969 91 119812 898429 11.77 1018241 92 119101 898354 11.71 1017455 93 118170 897235 11.64 1015405 94 119274 897279 11.73 1016553 95 118313 894566 11.68 1012879 96 119031 895234 11.74 1014265 97 118782 893758 11.73 1012540 98 118394 895033 11.68 1013427 99 117488 897548 11.57 1015036 100 118014 893058 11.67 1011072 101 117756 895286 11.62 1013042 102 117612 893821 11.63 1011433 103 117868 894659 11.64 1012527 104 117746 894417 11.63 1012163 105 116874 892946 11.57 1009820 106 117305 892314 11.62 1009619 107 116943 891336 11.60 1008279 108 117035 889980 11.62 1007015 109 116437 890192 11.57 1006629 110 116138 892225 11.52 1008363 111 116088 893900 11.49 1009988 112 115426 891910 11.46 1007336 113 115698 892787 11.47 1008485 114 115838 890999 11.51 1006837 115 114918 889473 11.44 1004391 116 115822 888706 11.53 1004528 117 115206 887418 11.49 1002624 118 114942 889113 11.45 1004055 119 114113 888543 11.38 1002656 120 114340 887398 11.41 1001738 121 113864 886351 11.38 1000215 122 114161 886542 11.41 1000703 123 113161 887586 11.31 1000747 124 113699 885848 11.38 999547 125 112695 885576 11.29 998271 126 113066 884383 11.34 997449 127 112523 883175 11.30 995698 128 112058 881441 11.28 993499 129 112632 879346 11.35 991978 130 111763 881651 11.25 993414 131 111898 881786 11.26 993684 132 111253 879985 11.22 991238 133 111270 877702 11.25 988972 134 110795 878031 11.20 988826 135 111760 876775 11.31 988535 136 109828 876388 11.14 986216 137 109593 874261 11.14 983854 138 109876 875296 11.15 985172 139 110403 874562 11.21 984965 140 109389 871365 11.15 980754 141 108817 871940 11.10 980757 142 108642 869871 11.10 978513 143 108211 868758 11.08 976969 144 106941 868088 10.97 975029 145 108030 865834 11.09 973864 146 108065 870118 11.05 978183 147 106815 867387 10.96 974202 148 106292 864005 10.95 970297 149 103077 860615 10.70 963692 150 90153 797864 10.15 888017 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2809 1940031 0.14 1942840 2 2776 1162239 0.24 1165015 3 2430 1263862 0.19 1266292 4 2688 1392688 0.19 1395376 5 3094 1514797 0.20 1517891 6 3203 1449074 0.22 1452277 7 2967 1360797 0.22 1363764 8 2910 1389540 0.21 1392450 9 3054 1375179 0.22 1378233 10 3041 1356879 0.22 1359920 11 3069 1362159 0.22 1365228 12 3071 1363271 0.22 1366342 13 3143 1367906 0.23 1371049 14 3118 1371913 0.23 1375031 15 3398 1361335 0.25 1364733 16 3443 1373522 0.25 1376965 17 3295 1376978 0.24 1380273 18 3388 1376632 0.25 1380020 19 3453 1384189 0.25 1387642 20 3454 1378301 0.25 1381755 21 3476 1380910 0.25 1384386 22 3481 1380503 0.25 1383984 23 3597 1382003 0.26 1385600 24 3572 1381350 0.26 1384922 25 3479 1384647 0.25 1388126 26 3547 1389595 0.25 1393142 27 3375 1391096 0.24 1394471 28 3591 1399056 0.26 1402647 29 3634 1394069 0.26 1397703 30 3579 1391486 0.26 1395065 31 3494 1397716 0.25 1401210 32 3703 1398466 0.26 1402169 33 3572 1401058 0.25 1404630 34 3666 1397630 0.26 1401296 35 3599 1400105 0.26 1403704 36 3685 1403836 0.26 1407521 37 3633 1398871 0.26 1402504 38 3614 1401872 0.26 1405486 39 3606 1403886 0.26 1407492 40 3661 1402269 0.26 1405930 41 3699 1404104 0.26 1407803 42 3791 1399174 0.27 1402965 43 3643 1404708 0.26 1408351 44 3638 1403864 0.26 1407502 45 3644 1401501 0.26 1405145 46 3546 1406862 0.25 1410408 47 3661 1406801 0.26 1410462 48 3641 1406876 0.26 1410517 49 3615 1404594 0.26 1408209 50 3589 1404274 0.25 1407863 51 3721 1403975 0.26 1407696 52 3715 1408398 0.26 1412113 53 3730 1407845 0.26 1411575 54 3711 1408524 0.26 1412235 55 3632 1409581 0.26 1413213 56 3687 1409503 0.26 1413190 57 3628 1409767 0.26 1413395 58 3599 1405887 0.26 1409486 59 3612 1409818 0.26 1413430 60 3692 1408584 0.26 1412276 61 3518 1407742 0.25 1411260 62 3702 1409719 0.26 1413421 63 3640 1409376 0.26 1413016 64 3619 1410138 0.26 1413757 65 3772 1413739 0.27 1417511 66 3673 1411420 0.26 1415093 67 3698 1418393 0.26 1422091 68 3642 1415754 0.26 1419396 69 3728 1410355 0.26 1414083 70 3731 1413805 0.26 1417536 71 3766 1416613 0.27 1420379 72 3768 1413846 0.27 1417614 73 3763 1412115 0.27 1415878 74 3797 1415324 0.27 1419121 75 3731 1415238 0.26 1418969 76 3633 1414921 0.26 1418554 77 3868 1417171 0.27 1421039 78 3770 1418942 0.26 1422712 79 3753 1417057 0.26 1420810 80 3685 1416047 0.26 1419732 81 3701 1414117 0.26 1417818 82 3696 1415370 0.26 1419066 83 3791 1418792 0.27 1422583 84 3777 1410817 0.27 1414594 85 3721 1417152 0.26 1420873 86 3631 1418386 0.26 1422017 87 3710 1413081 0.26 1416791 88 3784 1417130 0.27 1420914 89 3709 1414655 0.26 1418364 90 3601 1415880 0.25 1419481 91 3689 1416108 0.26 1419797 92 3814 1418256 0.27 1422070 93 3869 1415667 0.27 1419536 94 3742 1411829 0.26 1415571 95 3730 1412883 0.26 1416613 96 3755 1409228 0.27 1412983 97 3732 1412418 0.26 1416150 98 3657 1410550 0.26 1414207 99 3799 1410347 0.27 1414146 100 3685 1410729 0.26 1414414 101 3759 1411479 0.27 1415238 102 3685 1407278 0.26 1410963 103 3556 1408629 0.25 1412185 104 3661 1407887 0.26 1411548 105 3777 1404221 0.27 1407998 106 3626 1407005 0.26 1410631 107 3668 1405429 0.26 1409097 108 3695 1404385 0.26 1408080 109 3874 1404159 0.28 1408033 110 3653 1405339 0.26 1408992 111 3646 1403704 0.26 1407350 112 3534 1402786 0.25 1406320 113 3758 1403322 0.27 1407080 114 3742 1400592 0.27 1404334 115 3616 1399395 0.26 1403011 116 3632 1397946 0.26 1401578 117 3533 1397895 0.25 1401428 118 3515 1399927 0.25 1403442 119 3603 1400129 0.26 1403732 120 3648 1395937 0.26 1399585 121 3610 1396197 0.26 1399807 122 3670 1394552 0.26 1398222 123 3579 1394331 0.26 1397910 124 3647 1393553 0.26 1397200 125 3660 1390306 0.26 1393966 126 3527 1386350 0.25 1389877 127 3616 1385264 0.26 1388880 128 3636 1383611 0.26 1387247 129 3646 1382357 0.26 1386003 130 3510 1384108 0.25 1387618 131 3548 1382436 0.26 1385984 132 3671 1377449 0.27 1381120 133 3618 1378864 0.26 1382482 134 3608 1377743 0.26 1381351 135 3533 1376584 0.26 1380117 136 3634 1372665 0.26 1376299 137 3621 1370420 0.26 1374041 138 3502 1369347 0.26 1372849 139 3637 1370284 0.26 1373921 140 3742 1368567 0.27 1372309 141 3683 1366497 0.27 1370180 142 3745 1364647 0.27 1368392 143 3748 1360357 0.27 1364105 144 3773 1359719 0.28 1363492 145 3937 1361687 0.29 1365624 146 4364 1356506 0.32 1360870 147 4298 1355148 0.32 1359446 148 4317 1352367 0.32 1356684 149 3919 1345362 0.29 1349281 150 3622 1226408 0.29 1230030 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9361 5644505 0.17 5653866 2 8897 4948649 0.18 4957546 3 9234 5659844 0.16 5669078 4 10119 6434666 0.16 6444785 5 10385 6658158 0.16 6668543 6 10453 6629182 0.16 6639635 7 10010 6198805 0.16 6208815 8 10199 6232924 0.16 6243123 9 10211 6088353 0.17 6098564 10 10088 6011620 0.17 6021708 11 10324 6041174 0.17 6051498 12 10615 6012148 0.18 6022763 13 10652 5996102 0.18 6006754 14 11026 6016210 0.18 6027236 15 11144 5986245 0.19 5997389 16 11226 6010038 0.19 6021264 17 11557 6014423 0.19 6025980 18 11455 6028702 0.19 6040157 19 11417 6029500 0.19 6040917 20 11589 6020697 0.19 6032286 21 11739 6017755 0.19 6029494 22 12057 6012508 0.20 6024565 23 11603 6020233 0.19 6031836 24 11922 6032735 0.20 6044657 25 11935 6017726 0.20 6029661 26 12093 6030236 0.20 6042329 27 12009 6033307 0.20 6045316 28 12265 6048261 0.20 6060526 29 12095 6056144 0.20 6068239 30 12269 6060367 0.20 6072636 31 12439 6070520 0.20 6082959 32 12497 6055797 0.21 6068294 33 12418 6052932 0.20 6065350 34 12425 6055368 0.20 6067793 35 12143 6043963 0.20 6056106 36 12451 6047520 0.21 6059971 37 12530 6046544 0.21 6059074 38 12452 6050732 0.21 6063184 39 12426 6063476 0.20 6075902 40 12578 6068015 0.21 6080593 41 12508 6061618 0.21 6074126 42 12533 6062275 0.21 6074808 43 12655 6059805 0.21 6072460 44 12580 6063538 0.21 6076118 45 12326 6057801 0.20 6070127 46 12256 6061046 0.20 6073302 47 12441 6061685 0.20 6074126 48 12646 6067051 0.21 6079697 49 12767 6080572 0.21 6093339 50 12644 6077707 0.21 6090351 51 12611 6081385 0.21 6093996 52 12502 6089059 0.20 6101561 53 12785 6084561 0.21 6097346 54 12713 6085361 0.21 6098074 55 12547 6069297 0.21 6081844 56 12705 6071846 0.21 6084551 57 12586 6064799 0.21 6077385 58 12695 6073966 0.21 6086661 59 12791 6063230 0.21 6076021 60 12689 6078849 0.21 6091538 61 12812 6091805 0.21 6104617 62 12734 6091441 0.21 6104175 63 12734 6092365 0.21 6105099 64 12750 6098490 0.21 6111240 65 12834 6090721 0.21 6103555 66 12691 6095180 0.21 6107871 67 12675 6098742 0.21 6111417 68 12577 6100527 0.21 6113104 69 12868 6092437 0.21 6105305 70 12547 6102073 0.21 6114620 71 12676 6104831 0.21 6117507 72 12824 6100634 0.21 6113458 73 12870 6102470 0.21 6115340 74 12787 6102092 0.21 6114879 75 12799 6098705 0.21 6111504 76 12542 6106963 0.20 6119505 77 12539 6103272 0.21 6115811 78 12919 6099762 0.21 6112681 79 12812 6092248 0.21 6105060 80 12686 6099256 0.21 6111942 81 12650 6109001 0.21 6121651 82 12928 6116115 0.21 6129043 83 12962 6109450 0.21 6122412 84 12908 6110587 0.21 6123495 85 12586 6101897 0.21 6114483 86 12703 6099476 0.21 6112179 87 12632 6087073 0.21 6099705 88 12771 6092037 0.21 6104808 89 12912 6098157 0.21 6111069 90 12670 6100621 0.21 6113291 91 12608 6105751 0.21 6118359 92 12566 6098813 0.21 6111379 93 12707 6096765 0.21 6109472 94 12702 6104048 0.21 6116750 95 12977 6099503 0.21 6112480 96 12800 6102665 0.21 6115465 97 12516 6099331 0.20 6111847 98 12656 6097753 0.21 6110409 99 12635 6101532 0.21 6114167 100 12859 6106209 0.21 6119068 101 12554 6102039 0.21 6114593 102 12544 6098313 0.21 6110857 103 12964 6095713 0.21 6108677 104 12759 6094181 0.21 6106940 105 12813 6092865 0.21 6105678 106 12667 6089588 0.21 6102255 107 12548 6082921 0.21 6095469 108 12636 6076450 0.21 6089086 109 12742 6083047 0.21 6095789 110 12824 6088813 0.21 6101637 111 12726 6080316 0.21 6093042 112 12581 6077364 0.21 6089945 113 12638 6081471 0.21 6094109 114 12615 6070715 0.21 6083330 115 12638 6075759 0.21 6088397 116 12589 6074601 0.21 6087190 117 12652 6071658 0.21 6084310 118 12698 6064733 0.21 6077431 119 12477 6055644 0.21 6068121 120 12652 6046999 0.21 6059651 121 12695 6048158 0.21 6060853 122 12534 6048308 0.21 6060842 123 12586 6041575 0.21 6054161 124 12708 6038596 0.21 6051304 125 12623 6032370 0.21 6044993 126 12575 6026312 0.21 6038887 127 12779 6026300 0.21 6039079 128 12609 6017991 0.21 6030600 129 12511 6009812 0.21 6022323 130 12651 6006562 0.21 6019213 131 12600 6001354 0.21 6013954 132 12803 5989561 0.21 6002364 133 12813 5988527 0.21 6001340 134 12752 5991955 0.21 6004707 135 12850 5987624 0.21 6000474 136 12551 5975058 0.21 5987609 137 12657 5969752 0.21 5982409 138 12836 5970638 0.21 5983474 139 13020 5966639 0.22 5979659 140 13130 5951585 0.22 5964715 141 12993 5944234 0.22 5957227 142 13055 5930455 0.22 5943510 143 13177 5933635 0.22 5946812 144 13256 5918118 0.22 5931374 145 13848 5928508 0.23 5942356 146 14412 5929053 0.24 5943465 147 14605 5920578 0.25 5935183 148 14604 5905116 0.25 5919720 149 14032 5848057 0.24 5862089 150 12685 5486388 0.23 5499073 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2783 1152879 0.24 1155662 2 33976 964801 3.40 998777 3 61747 761005 7.50 822752 4 63761 805748 7.33 869509 5 73089 894422 7.55 967511 6 77747 923718 7.76 1001465 7 81475 957647 7.84 1039122 8 77278 844798 8.38 922076 9 80200 859147 8.54 939347 10 82332 856390 8.77 938722 11 82057 844944 8.85 927001 12 83599 848606 8.97 932205 13 84933 840763 9.18 925696 14 85368 845309 9.17 930677 15 86563 848429 9.26 934992 16 87123 844195 9.35 931318 17 88410 848906 9.43 937316 18 88188 849226 9.41 937414 19 89511 850613 9.52 940124 20 89898 850923 9.56 940821 21 90652 849528 9.64 940180 22 90765 847356 9.68 938121 23 91352 849164 9.71 940516 24 91825 843081 9.82 934906 25 91767 841574 9.83 933341 26 92461 842713 9.89 935174 27 92622 841219 9.92 933841 28 92459 841771 9.90 934230 29 92752 842802 9.91 935554 30 92457 843054 9.88 935511 31 92821 840779 9.94 933600 32 93569 837060 10.05 930629 33 93189 835175 10.04 928364 34 93868 835871 10.10 929739 35 94272 833536 10.16 927808 36 94088 828725 10.20 922813 37 94261 831082 10.19 925343 38 94264 828262 10.22 922526 39 94376 826683 10.25 921059 40 94488 827427 10.25 921915 41 94761 827147 10.28 921908 42 95166 824980 10.34 920146 43 95573 825470 10.38 921043 44 95235 822094 10.38 917329 45 94688 816018 10.40 910706 46 95023 814245 10.45 909268 47 95111 815488 10.44 910599 48 94787 814068 10.43 908855 49 95021 813653 10.46 908674 50 95510 813221 10.51 908731 51 94864 808373 10.50 903237 52 95490 805941 10.59 901431 53 95721 806844 10.61 902565 54 95584 804044 10.62 899628 55 95310 802587 10.61 897897 56 95710 799201 10.69 894911 57 94727 797788 10.61 892515 58 94915 798010 10.63 892925 59 95620 796181 10.72 891801 60 95023 793932 10.69 888955 61 94798 792406 10.69 887204 62 94776 791001 10.70 885777 63 94674 787626 10.73 882300 64 94930 786014 10.78 880944 65 95002 784460 10.80 879462 66 93869 780509 10.74 874378 67 93970 779958 10.75 873928 68 94628 778468 10.84 873096 69 94570 775818 10.87 870388 70 93964 774498 10.82 868462 71 94333 773702 10.87 868035 72 93782 771264 10.84 865046 73 94341 769183 10.93 863524 74 93734 767298 10.89 861032 75 93692 762301 10.95 855993 76 93307 760216 10.93 853523 77 93289 759703 10.94 852992 78 92799 758647 10.90 851446 79 93573 758880 10.98 852453 80 93419 754223 11.02 847642 81 92874 752073 10.99 844947 82 92885 751494 11.00 844379 83 92536 749882 10.98 842418 84 92099 744863 11.00 836962 85 92658 743230 11.08 835888 86 92294 741319 11.07 833613 87 92051 737867 11.09 829918 88 91734 737860 11.06 829594 89 91947 734695 11.12 826642 90 91322 733175 11.08 824497 91 90968 729253 11.09 820221 92 91171 729740 11.11 820911 93 90207 727682 11.03 817889 94 90580 725449 11.10 816029 95 90206 722471 11.10 812677 96 89283 721993 11.01 811276 97 89838 716512 11.14 806350 98 89985 714250 11.19 804235 99 89575 711043 11.19 800618 100 89941 710065 11.24 800006 101 89023 708498 11.16 797521 102 88571 703632 11.18 792203 103 88274 701724 11.17 789998 104 87534 700959 11.10 788493 105 87919 697881 11.19 785800 106 87631 693669 11.22 781300 107 87463 692976 11.21 780439 108 87217 690100 11.22 777317 109 86858 686512 11.23 773370 110 87007 684631 11.28 771638 111 86424 681745 11.25 768169 112 85708 679887 11.19 765595 113 85742 678786 11.22 764528 114 85185 674961 11.21 760146 115 85360 672717 11.26 758077 116 84745 670789 11.22 755534 117 84298 665755 11.24 750053 118 84255 663836 11.26 748091 119 84044 661484 11.27 745528 120 83298 658450 11.23 741748 121 83236 655927 11.26 739163 122 83121 654596 11.27 737717 123 81944 651113 11.18 733057 124 81759 647007 11.22 728766 125 81913 645889 11.25 727802 126 81628 641928 11.28 723556 127 81307 638816 11.29 720123 128 80506 634782 11.26 715288 129 79941 631156 11.24 711097 130 80165 629061 11.30 709226 131 79562 627214 11.26 706776 132 79551 624491 11.30 704042 133 78702 619903 11.27 698605 134 78332 616194 11.28 694526 135 77691 615560 11.21 693251 136 77353 610518 11.25 687871 137 77152 609697 11.23 686849 138 77029 604789 11.30 681818 139 76650 601528 11.30 678178 140 76287 598354 11.31 674641 141 75490 596370 11.24 671860 142 75588 593180 11.30 668768 143 74852 588599 11.28 663451 144 75016 585513 11.36 660529 145 74119 582463 11.29 656582 146 73550 578132 11.29 651682 147 72816 573805 11.26 646621 148 72085 564807 11.32 636892 149 70748 510134 12.18 580882 150 62610 0 100.00 62610 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1306 1466130 0.09 1467436 2 1897 1297814 0.15 1299711 3 4932 2152540 0.23 2157472 4 5786 1128759 0.51 1134545 5 2432 1209738 0.20 1212170 6 2655 1333169 0.20 1335824 7 2875 1428339 0.20 1431214 8 2878 1378728 0.21 1381606 9 2620 1286752 0.20 1289372 10 2705 1307527 0.21 1310232 11 2727 1295841 0.21 1298568 12 2642 1277145 0.21 1279787 13 2629 1275725 0.21 1278354 14 2679 1278505 0.21 1281184 15 2658 1284934 0.21 1287592 16 2657 1286331 0.21 1288988 17 2754 1280304 0.21 1283058 18 2768 1289870 0.21 1292638 19 2831 1287879 0.22 1290710 20 2772 1287206 0.21 1289978 21 2819 1291234 0.22 1294053 22 2757 1282896 0.21 1285653 23 2873 1285295 0.22 1288168 24 2850 1288545 0.22 1291395 25 2906 1282676 0.23 1285582 26 2821 1283284 0.22 1286105 27 2833 1285825 0.22 1288658 28 2804 1286813 0.22 1289617 29 2835 1283042 0.22 1285877 30 2779 1285362 0.22 1288141 31 2914 1283224 0.23 1286138 32 3028 1276861 0.24 1279889 33 2915 1278046 0.23 1280961 34 2936 1275072 0.23 1278008 35 2976 1276499 0.23 1279475 36 2991 1277037 0.23 1280028 37 2959 1272082 0.23 1275041 38 3008 1273357 0.24 1276365 39 2898 1271141 0.23 1274039 40 3007 1266111 0.24 1269118 41 2911 1267376 0.23 1270287 42 2941 1263310 0.23 1266251 43 2929 1262011 0.23 1264940 44 2815 1259865 0.22 1262680 45 3027 1261532 0.24 1264559 46 2924 1256777 0.23 1259701 47 3008 1253658 0.24 1256666 48 3012 1254805 0.24 1257817 49 3065 1251269 0.24 1254334 50 3080 1248756 0.25 1251836 51 2954 1246903 0.24 1249857 52 2962 1243141 0.24 1246103 53 3013 1240274 0.24 1243287 54 2884 1240475 0.23 1243359 55 2973 1240718 0.24 1243691 56 2991 1236667 0.24 1239658 57 2909 1233252 0.24 1236161 58 3066 1229485 0.25 1232551 59 2949 1226207 0.24 1229156 60 2963 1223615 0.24 1226578 61 2861 1223938 0.23 1226799 62 2929 1219347 0.24 1222276 63 2926 1217472 0.24 1220398 64 2927 1214691 0.24 1217618 65 2994 1213441 0.25 1216435 66 2974 1212233 0.24 1215207 67 2943 1210207 0.24 1213150 68 2970 1205698 0.25 1208668 69 2883 1205114 0.24 1207997 70 2901 1204093 0.24 1206994 71 2921 1199628 0.24 1202549 72 2927 1195339 0.24 1198266 73 3021 1193790 0.25 1196811 74 2990 1188701 0.25 1191691 75 2939 1187710 0.25 1190649 76 2939 1186175 0.25 1189114 77 3024 1182975 0.25 1185999 78 2871 1181254 0.24 1184125 79 2872 1179040 0.24 1181912 80 2835 1175665 0.24 1178500 81 2827 1171839 0.24 1174666 82 2842 1167412 0.24 1170254 83 2827 1161366 0.24 1164193 84 2838 1161681 0.24 1164519 85 2918 1156696 0.25 1159614 86 2877 1153920 0.25 1156797 87 2879 1152868 0.25 1155747 88 2785 1148348 0.24 1151133 89 2873 1146462 0.25 1149335 90 2759 1140624 0.24 1143383 91 2743 1140171 0.24 1142914 92 2756 1131972 0.24 1134728 93 2790 1132073 0.25 1134863 94 2697 1128240 0.24 1130937 95 2780 1124419 0.25 1127199 96 2710 1120640 0.24 1123350 97 2793 1118598 0.25 1121391 98 2790 1112083 0.25 1114873 99 2839 1113052 0.25 1115891 100 2851 1106768 0.26 1109619 101 2733 1105387 0.25 1108120 102 2723 1099643 0.25 1102366 103 2707 1095544 0.25 1098251 104 2665 1090224 0.24 1092889 105 2712 1087775 0.25 1090487 106 2703 1082999 0.25 1085702 107 2674 1078438 0.25 1081112 108 2713 1075001 0.25 1077714 109 2605 1069716 0.24 1072321 110 2737 1066721 0.26 1069458 111 2699 1063963 0.25 1066662 112 2640 1060421 0.25 1063061 113 2621 1055190 0.25 1057811 114 2740 1053012 0.26 1055752 115 2666 1049399 0.25 1052065 116 2587 1042029 0.25 1044616 117 2662 1039737 0.26 1042399 118 2646 1031434 0.26 1034080 119 2618 1031904 0.25 1034522 120 2583 1028540 0.25 1031123 121 2561 1023026 0.25 1025587 122 2533 1018673 0.25 1021206 123 2574 1015960 0.25 1018534 124 2526 1009364 0.25 1011890 125 2589 1005623 0.26 1008212 126 2565 1001517 0.26 1004082 127 2606 995500 0.26 998106 128 2588 988085 0.26 990673 129 2577 987225 0.26 989802 130 2513 980784 0.26 983297 131 2479 974813 0.25 977292 132 2567 970735 0.26 973302 133 2451 966056 0.25 968507 134 2491 961648 0.26 964139 135 2580 955361 0.27 957941 136 2451 950704 0.26 953155 137 2489 945751 0.26 948240 138 2623 942255 0.28 944878 139 2425 934056 0.26 936481 140 2475 930574 0.27 933049 141 2588 927585 0.28 930173 142 2531 921585 0.27 924116 143 2446 913403 0.27 915849 144 2475 912275 0.27 914750 145 2579 904821 0.28 907400 146 2514 896942 0.28 899456 147 2432 889502 0.27 891934 148 2499 877336 0.28 879835 149 2378 807125 0.29 809503 150 1630 0 100.00 1630 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 6118 6769045 0.09 6775163 2 7857 5896492 0.13 5904349 3 9508 6416764 0.15 6426272 4 10215 6444579 0.16 6454794 5 9128 5893995 0.15 5903123 6 8503 5605575 0.15 5614078 7 8958 5845122 0.15 5854080 8 9014 5711355 0.16 5720369 9 9118 5686998 0.16 5696116 10 9212 5664001 0.16 5673213 11 9352 5688705 0.16 5698057 12 9166 5674478 0.16 5683644 13 9625 5616582 0.17 5626207 14 9578 5625526 0.17 5635104 15 9597 5620459 0.17 5630056 16 9571 5627754 0.17 5637325 17 9803 5640949 0.17 5650752 18 9923 5627077 0.18 5637000 19 10108 5634779 0.18 5644887 20 10021 5621353 0.18 5631374 21 10213 5618038 0.18 5628251 22 10130 5598732 0.18 5608862 23 10248 5592557 0.18 5602805 24 10201 5575510 0.18 5585711 25 10247 5576480 0.18 5586727 26 10509 5562892 0.19 5573401 27 10311 5570164 0.18 5580475 28 10631 5572678 0.19 5583309 29 10591 5569377 0.19 5579968 30 10626 5555679 0.19 5566305 31 10689 5556701 0.19 5567390 32 10624 5538503 0.19 5549127 33 10539 5519372 0.19 5529911 34 10753 5505800 0.19 5516553 35 10871 5501751 0.20 5512622 36 10533 5494922 0.19 5505455 37 10584 5495877 0.19 5506461 38 10794 5497514 0.20 5508308 39 10711 5486817 0.19 5497528 40 10615 5487418 0.19 5498033 41 10724 5474037 0.20 5484761 42 10891 5461296 0.20 5472187 43 11031 5452648 0.20 5463679 44 10532 5432341 0.19 5442873 45 10788 5422468 0.20 5433256 46 10787 5416121 0.20 5426908 47 10897 5412189 0.20 5423086 48 10938 5412311 0.20 5423249 49 10696 5402592 0.20 5413288 50 10776 5400919 0.20 5411695 51 10733 5382341 0.20 5393074 52 10673 5372536 0.20 5383209 53 10783 5363102 0.20 5373885 54 10723 5345493 0.20 5356216 55 10554 5338993 0.20 5349547 56 10798 5327517 0.20 5338315 57 10852 5311344 0.20 5322196 58 10612 5317007 0.20 5327619 59 10748 5310902 0.20 5321650 60 10850 5294600 0.20 5305450 61 10735 5295204 0.20 5305939 62 10921 5271576 0.21 5282497 63 10885 5255131 0.21 5266016 64 10787 5251791 0.20 5262578 65 10687 5230034 0.20 5240721 66 10682 5217782 0.20 5228464 67 10696 5217732 0.20 5228428 68 10590 5200809 0.20 5211399 69 10635 5188397 0.20 5199032 70 10528 5177428 0.20 5187956 71 10525 5172515 0.20 5183040 72 10696 5156781 0.21 5167477 73 10662 5147293 0.21 5157955 74 10589 5131063 0.21 5141652 75 10441 5117540 0.20 5127981 76 10518 5107248 0.21 5117766 77 10519 5095209 0.21 5105728 78 10561 5086848 0.21 5097409 79 10522 5080158 0.21 5090680 80 10438 5067554 0.21 5077992 81 10398 5050349 0.21 5060747 82 10402 5042058 0.21 5052460 83 10110 5019828 0.20 5029938 84 10076 5009892 0.20 5019968 85 9970 4995953 0.20 5005923 86 10228 4986441 0.20 4996669 87 10238 4972343 0.21 4982581 88 10076 4960854 0.20 4970930 89 10053 4956342 0.20 4966395 90 9894 4944477 0.20 4954371 91 10047 4929614 0.20 4939661 92 10082 4914956 0.20 4925038 93 9841 4898679 0.20 4908520 94 9886 4887522 0.20 4897408 95 9777 4858157 0.20 4867934 96 9747 4845731 0.20 4855478 97 9732 4833874 0.20 4843606 98 9700 4815648 0.20 4825348 99 9772 4804115 0.20 4813887 100 9731 4791770 0.20 4801501 101 9703 4772985 0.20 4782688 102 9625 4766480 0.20 4776105 103 9562 4747850 0.20 4757412 104 9689 4731029 0.20 4740718 105 9555 4712433 0.20 4721988 106 9550 4696763 0.20 4706313 107 9474 4681566 0.20 4691040 108 9438 4656092 0.20 4665530 109 9592 4649437 0.21 4659029 110 9528 4629510 0.21 4639038 111 9350 4617559 0.20 4626909 112 9319 4604670 0.20 4613989 113 9342 4581202 0.20 4590544 114 9185 4565234 0.20 4574419 115 9218 4543353 0.20 4552571 116 9085 4528039 0.20 4537124 117 9176 4503379 0.20 4512555 118 9119 4486229 0.20 4495348 119 9179 4466659 0.21 4475838 120 9416 4456543 0.21 4465959 121 9194 4437390 0.21 4446584 122 8997 4425632 0.20 4434629 123 9243 4403137 0.21 4412380 124 9015 4384119 0.21 4393134 125 9236 4367383 0.21 4376619 126 9003 4341845 0.21 4350848 127 8854 4323257 0.20 4332111 128 9190 4301327 0.21 4310517 129 9079 4282560 0.21 4291639 130 8761 4265730 0.20 4274491 131 8824 4248323 0.21 4257147 132 8911 4224444 0.21 4233355 133 9009 4203840 0.21 4212849 134 9130 4188859 0.22 4197989 135 9124 4161117 0.22 4170241 136 9115 4141211 0.22 4150326 137 9084 4120149 0.22 4129233 138 9041 4098660 0.22 4107701 139 8849 4079946 0.22 4088795 140 9063 4058186 0.22 4067249 141 8926 4037334 0.22 4046260 142 8842 4013543 0.22 4022385 143 9244 3991934 0.23 4001178 144 8988 3964016 0.23 3973004 145 9067 3942053 0.23 3951120 146 9225 3913158 0.24 3922383 147 9397 3880533 0.24 3889930 148 9327 3828237 0.24 3837564 149 8794 3519826 0.25 3528620 150 6201 0 100.00 6201