CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 89533 534169 14.36 623702 2 109787 694702 13.65 804489 3 91826 697883 11.63 789709 4 91400 708598 11.43 799998 5 109231 829176 11.64 938407 6 113918 843134 11.90 957052 7 104472 746439 12.28 850911 8 103588 754448 12.07 858036 9 103740 755192 12.08 858932 10 103282 751761 12.08 855043 11 104452 759552 12.09 864004 12 106443 760847 12.27 867290 13 105196 759348 12.17 864544 14 106469 762299 12.26 868768 15 106872 763140 12.28 870012 16 106566 768643 12.18 875209 17 106992 771749 12.18 878741 18 107922 779637 12.16 887559 19 108512 780893 12.20 889405 20 108388 777960 12.23 886348 21 108993 777972 12.29 886965 22 109719 778030 12.36 887749 23 108854 774649 12.32 883503 24 107688 772946 12.23 880634 25 108294 774112 12.27 882406 26 109085 780234 12.27 889319 27 109399 785674 12.22 895073 28 109212 782881 12.24 892093 29 109073 789200 12.14 898273 30 109928 783621 12.30 893549 31 108308 783596 12.14 891904 32 109798 785898 12.26 895696 33 110322 786460 12.30 896782 34 108936 782387 12.22 891323 35 109428 783177 12.26 892605 36 109838 784585 12.28 894423 37 109511 783259 12.27 892770 38 109769 789226 12.21 898995 39 110402 790445 12.26 900847 40 110979 791536 12.30 902515 41 109971 791971 12.19 901942 42 109895 791243 12.20 901138 43 110408 786272 12.31 896680 44 109720 786949 12.24 896669 45 109673 787778 12.22 897451 46 109728 787622 12.23 897350 47 110057 794017 12.17 904074 48 110557 793574 12.23 904131 49 110160 791286 12.22 901446 50 109976 792226 12.19 902202 51 109875 792368 12.18 902243 52 110516 791719 12.25 902235 53 110194 792699 12.20 902893 54 109901 790758 12.20 900659 55 110183 789296 12.25 899479 56 109918 789458 12.22 899376 57 109976 791151 12.20 901127 58 109936 790968 12.20 900904 59 109834 790646 12.20 900480 60 109828 792340 12.17 902168 61 109621 792113 12.16 901734 62 109872 793595 12.16 903467 63 110523 792701 12.24 903224 64 109520 789120 12.19 898640 65 109607 792207 12.15 901814 66 109614 792637 12.15 902251 67 109993 793488 12.17 903481 68 109434 792510 12.13 901944 69 109695 792859 12.15 902554 70 109734 793670 12.15 903404 71 108887 793014 12.07 901901 72 109406 793088 12.12 902494 73 109715 793194 12.15 902909 74 108783 793075 12.06 901858 75 109599 790713 12.17 900312 76 108923 790597 12.11 899520 77 109024 792343 12.10 901367 78 110090 795916 12.15 906006 79 110034 793988 12.17 904022 80 108791 791766 12.08 900557 81 109628 792903 12.15 902531 82 108925 794183 12.06 903108 83 108631 792841 12.05 901472 84 109099 794091 12.08 903190 85 108652 789802 12.09 898454 86 108469 792230 12.04 900699 87 108796 792790 12.07 901586 88 108362 791264 12.05 899626 89 108710 794547 12.04 903257 90 108081 793610 11.99 901691 91 108109 792776 12.00 900885 92 108312 793949 12.00 902261 93 108213 793113 12.01 901326 94 108189 790874 12.03 899063 95 107462 791530 11.95 898992 96 107922 791815 11.99 899737 97 108127 792158 12.01 900285 98 107279 790829 11.94 898108 99 107960 792576 11.99 900536 100 106611 790328 11.89 896939 101 107604 789988 11.99 897592 102 106876 789425 11.92 896301 103 106227 790304 11.85 896531 104 106806 791361 11.89 898167 105 106978 791563 11.91 898541 106 106585 789529 11.89 896114 107 106776 788633 11.92 895409 108 106101 787922 11.87 894023 109 105727 787898 11.83 893625 110 106286 788081 11.88 894367 111 105883 790457 11.81 896340 112 105641 788935 11.81 894576 113 105459 788874 11.79 894333 114 105379 787537 11.80 892916 115 105344 785889 11.82 891233 116 104804 786549 11.76 891353 117 104855 786586 11.76 891441 118 104788 787384 11.75 892172 119 104736 787515 11.74 892251 120 103949 787974 11.65 891923 121 103539 783916 11.67 887455 122 103886 787768 11.65 891654 123 103757 787452 11.64 891209 124 103576 785657 11.65 889233 125 102855 784104 11.60 886959 126 103769 783415 11.70 887184 127 102723 780693 11.63 883416 128 102637 780703 11.62 883340 129 102444 780990 11.60 883434 130 101917 779875 11.56 881792 131 102278 781676 11.57 883954 132 101902 778215 11.58 880117 133 101408 777831 11.53 879239 134 101919 781458 11.54 883377 135 101665 777975 11.56 879640 136 100932 775595 11.51 876527 137 100582 777613 11.45 878195 138 100589 775322 11.48 875911 139 100279 775700 11.45 875979 140 100034 773726 11.45 873760 141 100074 773228 11.46 873302 142 98827 772821 11.34 871648 143 98265 772258 11.29 870523 144 98319 771465 11.30 869784 145 98368 769652 11.33 868020 146 98412 770721 11.32 869133 147 97776 771064 11.25 868840 148 96271 766736 11.16 863007 149 94126 765950 10.94 860076 150 82310 705561 10.45 787871 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2661 2049664 0.13 2052325 2 2759 1016832 0.27 1019591 3 2030 993570 0.20 995600 4 2037 1142061 0.18 1144098 5 2690 1358790 0.20 1361480 6 2748 1292006 0.21 1294754 7 2532 1195244 0.21 1197776 8 2801 1195922 0.23 1198723 9 2760 1195386 0.23 1198146 10 2686 1199850 0.22 1202536 11 2750 1206987 0.23 1209737 12 2724 1205148 0.23 1207872 13 2986 1210285 0.25 1213271 14 2882 1206004 0.24 1208886 15 2990 1201007 0.25 1203997 16 3058 1214379 0.25 1217437 17 3121 1219012 0.26 1222133 18 3197 1215805 0.26 1219002 19 3108 1226529 0.25 1229637 20 3109 1219142 0.25 1222251 21 3222 1223144 0.26 1226366 22 3188 1227407 0.26 1230595 23 3142 1222840 0.26 1225982 24 3253 1219703 0.27 1222956 25 3205 1224588 0.26 1227793 26 3399 1228603 0.28 1232002 27 3220 1228993 0.26 1232213 28 3263 1241009 0.26 1244272 29 3283 1232787 0.27 1236070 30 3269 1231194 0.26 1234463 31 3194 1234939 0.26 1238133 32 3255 1236805 0.26 1240060 33 3191 1237399 0.26 1240590 34 3275 1236825 0.26 1240100 35 3307 1234934 0.27 1238241 36 3407 1235304 0.28 1238711 37 3518 1243232 0.28 1246750 38 3330 1237526 0.27 1240856 39 3299 1239020 0.27 1242319 40 3356 1242638 0.27 1245994 41 3355 1240857 0.27 1244212 42 3443 1238465 0.28 1241908 43 3349 1244829 0.27 1248178 44 3433 1240433 0.28 1243866 45 3311 1237411 0.27 1240722 46 3449 1245595 0.28 1249044 47 3357 1244491 0.27 1247848 48 3395 1242306 0.27 1245701 49 3310 1244938 0.27 1248248 50 3384 1243587 0.27 1246971 51 3452 1245544 0.28 1248996 52 3472 1244280 0.28 1247752 53 3394 1246557 0.27 1249951 54 3309 1241956 0.27 1245265 55 3355 1247059 0.27 1250414 56 3334 1245484 0.27 1248818 57 3383 1243871 0.27 1247254 58 3458 1243335 0.28 1246793 59 3415 1247369 0.27 1250784 60 3478 1242488 0.28 1245966 61 3338 1245572 0.27 1248910 62 3347 1249363 0.27 1252710 63 3384 1245259 0.27 1248643 64 3377 1247649 0.27 1251026 65 3494 1249691 0.28 1253185 66 3299 1245846 0.26 1249145 67 3461 1248525 0.28 1251986 68 3396 1248337 0.27 1251733 69 3616 1243427 0.29 1247043 70 3373 1248346 0.27 1251719 71 3444 1250388 0.27 1253832 72 3537 1248971 0.28 1252508 73 3568 1252173 0.28 1255741 74 3608 1251127 0.29 1254735 75 3489 1251026 0.28 1254515 76 3402 1252231 0.27 1255633 77 3592 1249003 0.29 1252595 78 3482 1250610 0.28 1254092 79 3551 1251898 0.28 1255449 80 3371 1250672 0.27 1254043 81 3410 1247974 0.27 1251384 82 3406 1250233 0.27 1253639 83 3436 1250922 0.27 1254358 84 3461 1247471 0.28 1250932 85 3559 1253844 0.28 1257403 86 3505 1249451 0.28 1252956 87 3437 1245152 0.28 1248589 88 3500 1248789 0.28 1252289 89 3502 1248071 0.28 1251573 90 3489 1246467 0.28 1249956 91 3592 1251707 0.29 1255299 92 3534 1251978 0.28 1255512 93 3433 1247263 0.27 1250696 94 3486 1249466 0.28 1252952 95 3451 1249071 0.28 1252522 96 3410 1245526 0.27 1248936 97 3512 1250000 0.28 1253512 98 3589 1247724 0.29 1251313 99 3488 1243104 0.28 1246592 100 3448 1247295 0.28 1250743 101 3454 1246334 0.28 1249788 102 3561 1241721 0.29 1245282 103 3388 1246790 0.27 1250178 104 3473 1241695 0.28 1245168 105 3556 1244159 0.29 1247715 106 3460 1246177 0.28 1249637 107 3458 1244959 0.28 1248417 108 3518 1241489 0.28 1245007 109 3536 1242020 0.28 1245556 110 3463 1245308 0.28 1248771 111 3446 1240804 0.28 1244250 112 3351 1241372 0.27 1244723 113 3575 1239970 0.29 1243545 114 3400 1238292 0.27 1241692 115 3439 1240993 0.28 1244432 116 3358 1237058 0.27 1240416 117 3515 1238925 0.28 1242440 118 3442 1242321 0.28 1245763 119 3294 1239709 0.27 1243003 120 3471 1235634 0.28 1239105 121 3340 1237255 0.27 1240595 122 3429 1235766 0.28 1239195 123 3465 1235656 0.28 1239121 124 3379 1236511 0.27 1239890 125 3341 1230780 0.27 1234121 126 3430 1227418 0.28 1230848 127 3335 1231324 0.27 1234659 128 3425 1225803 0.28 1229228 129 3381 1225313 0.28 1228694 130 3482 1229298 0.28 1232780 131 3442 1225153 0.28 1228595 132 3255 1221837 0.27 1225092 133 3335 1222963 0.27 1226298 134 3331 1224299 0.27 1227630 135 3381 1220833 0.28 1224214 136 3454 1221341 0.28 1224795 137 3357 1218753 0.27 1222110 138 3340 1215260 0.27 1218600 139 3492 1218389 0.29 1221881 140 3462 1215015 0.28 1218477 141 3409 1211388 0.28 1214797 142 3381 1213991 0.28 1217372 143 3422 1210233 0.28 1213655 144 3357 1208163 0.28 1211520 145 3665 1211803 0.30 1215468 146 3961 1208667 0.33 1212628 147 3887 1204767 0.32 1208654 148 3924 1200483 0.33 1204407 149 3578 1196462 0.30 1200040 150 3268 1082029 0.30 1085297 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 7578 4990376 0.15 4997954 2 7594 3928754 0.19 3936348 3 7869 4412743 0.18 4420612 4 7941 5231887 0.15 5239828 5 9376 5987333 0.16 5996709 6 9855 5979408 0.16 5989263 7 9179 5458320 0.17 5467499 8 9032 5376370 0.17 5385402 9 8929 5297954 0.17 5306883 10 9137 5270721 0.17 5279858 11 9194 5282273 0.17 5291467 12 9650 5281318 0.18 5290968 13 9639 5258396 0.18 5268035 14 10108 5257847 0.19 5267955 15 10178 5259442 0.19 5269620 16 10127 5295939 0.19 5306066 17 10324 5314577 0.19 5324901 18 10319 5341255 0.19 5351574 19 10542 5340489 0.20 5351031 20 10421 5329418 0.20 5339839 21 10785 5319823 0.20 5330608 22 10764 5319807 0.20 5330571 23 10549 5311716 0.20 5322265 24 10763 5312321 0.20 5323084 25 10955 5308876 0.21 5319831 26 10897 5323329 0.20 5334226 27 11150 5338202 0.21 5349352 28 11163 5352632 0.21 5363795 29 10947 5356511 0.20 5367458 30 11229 5364253 0.21 5375482 31 11169 5373286 0.21 5384455 32 11457 5350257 0.21 5361714 33 11384 5344692 0.21 5356076 34 11337 5337365 0.21 5348702 35 11456 5339579 0.21 5351035 36 11491 5339078 0.21 5350569 37 11167 5348785 0.21 5359952 38 11468 5359138 0.21 5370606 39 11469 5376010 0.21 5387479 40 11477 5368618 0.21 5380095 41 11597 5363879 0.22 5375476 42 11424 5366409 0.21 5377833 43 11374 5359219 0.21 5370593 44 11319 5348085 0.21 5359404 45 11249 5353294 0.21 5364543 46 11308 5352348 0.21 5363656 47 11579 5364022 0.22 5375601 48 11433 5363050 0.21 5374483 49 11564 5373226 0.21 5384790 50 11812 5380798 0.22 5392610 51 11713 5374207 0.22 5385920 52 11496 5384041 0.21 5395537 53 11636 5381573 0.22 5393209 54 11607 5378820 0.22 5390427 55 11546 5367882 0.21 5379428 56 11519 5372576 0.21 5384095 57 11714 5363098 0.22 5374812 58 11608 5369271 0.22 5380879 59 11608 5363789 0.22 5375397 60 11555 5381765 0.21 5393320 61 11786 5386287 0.22 5398073 62 11717 5376923 0.22 5388640 63 11888 5385444 0.22 5397332 64 11818 5391120 0.22 5402938 65 11700 5384533 0.22 5396233 66 11805 5392425 0.22 5404230 67 11780 5390915 0.22 5402695 68 11876 5388091 0.22 5399967 69 11707 5389167 0.22 5400874 70 11839 5398821 0.22 5410660 71 11879 5398742 0.22 5410621 72 11938 5391762 0.22 5403700 73 11535 5394333 0.21 5405868 74 11943 5391914 0.22 5403857 75 11973 5386226 0.22 5398199 76 11649 5387692 0.22 5399341 77 11679 5393124 0.22 5404803 78 11956 5393766 0.22 5405722 79 11910 5393643 0.22 5405553 80 12018 5394348 0.22 5406366 81 11885 5402537 0.22 5414422 82 12084 5408301 0.22 5420385 83 11867 5405293 0.22 5417160 84 11865 5406524 0.22 5418389 85 11610 5404166 0.21 5415776 86 11920 5392421 0.22 5404341 87 11865 5389370 0.22 5401235 88 11768 5391222 0.22 5402990 89 11869 5392563 0.22 5404432 90 11987 5401372 0.22 5413359 91 11652 5405366 0.22 5417018 92 11872 5399575 0.22 5411447 93 11688 5407063 0.22 5418751 94 11688 5406789 0.22 5418477 95 11893 5403345 0.22 5415238 96 11780 5401151 0.22 5412931 97 11914 5400018 0.22 5411932 98 12027 5398189 0.22 5410216 99 11792 5401241 0.22 5413033 100 11966 5406276 0.22 5418242 101 11937 5405872 0.22 5417809 102 11882 5405181 0.22 5417063 103 11951 5405937 0.22 5417888 104 11877 5398633 0.22 5410510 105 11811 5397934 0.22 5409745 106 11806 5401188 0.22 5412994 107 11741 5387370 0.22 5399111 108 11781 5377339 0.22 5389120 109 11776 5384247 0.22 5396023 110 11686 5393498 0.22 5405184 111 11732 5391635 0.22 5403367 112 11737 5385881 0.22 5397618 113 11635 5392680 0.22 5404315 114 11738 5385016 0.22 5396754 115 11776 5390210 0.22 5401986 116 11767 5388696 0.22 5400463 117 11823 5380147 0.22 5391970 118 11783 5376720 0.22 5388503 119 11803 5369241 0.22 5381044 120 11868 5362351 0.22 5374219 121 11775 5365322 0.22 5377097 122 11858 5367300 0.22 5379158 123 11930 5363920 0.22 5375850 124 12087 5360839 0.22 5372926 125 11834 5359829 0.22 5371663 126 11670 5356312 0.22 5367982 127 11851 5347213 0.22 5359064 128 11695 5336115 0.22 5347810 129 11613 5338201 0.22 5349814 130 11800 5338137 0.22 5349937 131 11825 5328724 0.22 5340549 132 11788 5325530 0.22 5337318 133 11677 5323691 0.22 5335368 134 11942 5319356 0.22 5331298 135 12092 5316465 0.23 5328557 136 11721 5303278 0.22 5314999 137 11842 5303137 0.22 5314979 138 11938 5303752 0.22 5315690 139 11820 5295953 0.22 5307773 140 11908 5290454 0.22 5302362 141 11981 5279706 0.23 5291687 142 12087 5273349 0.23 5285436 143 12040 5268154 0.23 5280194 144 12065 5268003 0.23 5280068 145 12559 5273797 0.24 5286356 146 12915 5276525 0.24 5289440 147 13212 5269668 0.25 5282880 148 13048 5247871 0.25 5260919 149 12693 5191483 0.24 5204176 150 11329 4861509 0.23 4872838 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2080 970198 0.21 972278 2 25676 785514 3.17 811190 3 58313 677958 7.92 736271 4 59837 687659 8.00 747496 5 61582 707378 8.01 768960 6 71236 830529 7.90 901765 7 76084 847285 8.24 923369 8 71433 746391 8.73 817824 9 72207 751058 8.77 823265 10 74217 750977 8.99 825194 11 74668 744891 9.11 819559 12 75066 748256 9.12 823322 13 77755 750206 9.39 827961 14 77653 747646 9.41 825299 15 79157 750731 9.54 829888 16 78948 749278 9.53 828226 17 79822 753553 9.58 833375 18 80397 756006 9.61 836403 19 81013 760876 9.62 841889 20 81854 760455 9.72 842309 21 82333 757929 9.80 840262 22 82360 756064 9.82 838424 23 83117 754796 9.92 837913 24 83017 752312 9.94 835329 25 83788 748307 10.07 832095 26 83587 751292 10.01 834879 27 84019 754353 10.02 838372 28 84008 755356 10.01 839364 29 84540 752252 10.10 836792 30 84324 752293 10.08 836617 31 85288 749785 10.21 835073 32 85034 746985 10.22 832019 33 84744 747621 10.18 832365 34 85167 745030 10.26 830197 35 85754 741910 10.36 827664 36 84868 741120 10.27 825988 37 85629 742149 10.34 827778 38 85966 742687 10.37 828653 39 85483 741732 10.33 827215 40 85714 741208 10.37 826922 41 86273 740106 10.44 826379 42 86439 737305 10.49 823744 43 86578 738721 10.49 825299 44 86814 732881 10.59 819695 45 86465 730005 10.59 816470 46 86035 726589 10.59 812624 47 86692 729022 10.63 815714 48 85934 730159 10.53 816093 49 86627 727407 10.64 814034 50 86556 724991 10.67 811547 51 86196 723568 10.64 809764 52 86885 722347 10.74 809232 53 87157 719804 10.80 806961 54 86429 716806 10.76 803235 55 87432 714897 10.90 802329 56 86334 714522 10.78 800856 57 86405 713003 10.81 799408 58 86786 713249 10.85 800035 59 86853 710685 10.89 797538 60 86903 708384 10.93 795287 61 86339 707064 10.88 793403 62 86356 705531 10.91 791887 63 86747 703405 10.98 790152 64 86446 700468 10.99 786914 65 85929 699264 10.94 785193 66 85721 697568 10.94 783289 67 86656 696303 11.07 782959 68 85406 693819 10.96 779225 69 86284 693109 11.07 779393 70 85670 690609 11.04 776279 71 85815 689819 11.06 775634 72 85744 686405 11.10 772149 73 85381 686831 11.06 772212 74 85829 684061 11.15 769890 75 85382 680881 11.14 766263 76 85277 676938 11.19 762215 77 85358 677612 11.19 762970 78 84759 675104 11.15 759863 79 85247 675269 11.21 760516 80 85212 672207 11.25 757419 81 84762 670819 11.22 755581 82 84862 669980 11.24 754842 83 84719 668285 11.25 753004 84 83782 664212 11.20 747994 85 84151 661610 11.28 745761 86 83685 658592 11.27 742277 87 83390 657857 11.25 741247 88 84163 655937 11.37 740100 89 83308 651917 11.33 735225 90 83088 652572 11.29 735660 91 83247 648277 11.38 731524 92 82945 649059 11.33 732004 93 82328 646080 11.30 728408 94 82421 644760 11.33 727181 95 81754 638852 11.35 720606 96 81833 638222 11.36 720055 97 81729 636166 11.38 717895 98 81484 634559 11.38 716043 99 81420 630619 11.43 712039 100 81122 629634 11.41 710756 101 80187 625985 11.36 706172 102 79440 624778 11.28 704218 103 80608 621550 11.48 702158 104 79806 619275 11.42 699081 105 79338 615137 11.42 694475 106 79321 613955 11.44 693276 107 78841 610898 11.43 689739 108 78495 610045 11.40 688540 109 78496 604509 11.49 683005 110 78072 601752 11.48 679824 111 78141 602236 11.48 680377 112 77824 600217 11.48 678041 113 77566 596849 11.50 674415 114 77198 594524 11.49 671722 115 76746 590896 11.50 667642 116 76572 588550 11.51 665122 117 76258 583949 11.55 660207 118 75833 581961 11.53 657794 119 75979 579359 11.59 655338 120 74483 578454 11.41 652937 121 75802 576621 11.62 652423 122 74780 571936 11.56 646716 123 73777 571671 11.43 645448 124 73973 568499 11.51 642472 125 74103 564003 11.61 638106 126 73234 561147 11.54 634381 127 73491 557253 11.65 630744 128 72206 555334 11.51 627540 129 72314 550305 11.61 622619 130 72289 548636 11.64 620925 131 71281 546787 11.53 618068 132 70863 542830 11.55 613693 133 71351 540120 11.67 611471 134 70213 537463 11.55 607676 135 69532 534748 11.51 604280 136 69574 530324 11.60 599898 137 69333 528523 11.60 597856 138 68868 525846 11.58 594714 139 67803 523010 11.48 590813 140 67569 519111 11.52 586680 141 67684 516179 11.59 583863 142 67137 512379 11.59 579516 143 66325 510900 11.49 577225 144 65809 505767 11.51 571576 145 65807 504511 11.54 570318 146 64769 499253 11.48 564022 147 64680 494854 11.56 559534 148 63949 487560 11.60 551509 149 62706 439885 12.48 502591 150 55430 0 100.00 55430 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 999 1159829 0.09 1160828 2 1521 1007099 0.15 1008620 3 5309 2280311 0.23 2285620 4 4900 1010909 0.48 1015809 5 2101 975163 0.21 977264 6 2177 1084473 0.20 1086650 7 2691 1282886 0.21 1285577 8 2621 1227382 0.21 1230003 9 2436 1137282 0.21 1139718 10 2324 1135571 0.20 1137895 11 2404 1135720 0.21 1138124 12 2385 1136257 0.21 1138642 13 2493 1140302 0.22 1142795 14 2414 1138264 0.21 1140678 15 2468 1150965 0.21 1153433 16 2435 1144540 0.21 1146975 17 2369 1138942 0.21 1141311 18 2560 1153834 0.22 1156394 19 2610 1152894 0.23 1155504 20 2616 1146494 0.23 1149110 21 2580 1154288 0.22 1156868 22 2579 1145924 0.22 1148503 23 2738 1147940 0.24 1150678 24 2636 1153752 0.23 1156388 25 2678 1147522 0.23 1150200 26 2687 1143238 0.23 1145925 27 2723 1150540 0.24 1153263 28 2616 1150998 0.23 1153614 29 2672 1143012 0.23 1145684 30 2791 1155292 0.24 1158083 31 2674 1145594 0.23 1148268 32 2713 1136605 0.24 1139318 33 2643 1144921 0.23 1147564 34 2707 1141237 0.24 1143944 35 2691 1142223 0.24 1144914 36 2691 1143128 0.23 1145819 37 2719 1134186 0.24 1136905 38 2644 1135007 0.23 1137651 39 2715 1139868 0.24 1142583 40 2759 1131236 0.24 1133995 41 2777 1130816 0.24 1133593 42 2803 1131062 0.25 1133865 43 2794 1126836 0.25 1129630 44 2610 1125651 0.23 1128261 45 2823 1131584 0.25 1134407 46 2804 1121887 0.25 1124691 47 2629 1116670 0.23 1119299 48 2732 1122755 0.24 1125487 49 2709 1115605 0.24 1118314 50 2742 1114682 0.25 1117424 51 2671 1116273 0.24 1118944 52 2760 1110696 0.25 1113456 53 2788 1106069 0.25 1108857 54 2640 1107912 0.24 1110552 55 2640 1107662 0.24 1110302 56 2736 1100871 0.25 1103607 57 2720 1102871 0.25 1105591 58 2723 1096843 0.25 1099566 59 2753 1094621 0.25 1097374 60 2644 1095467 0.24 1098111 61 2760 1092843 0.25 1095603 62 2832 1087509 0.26 1090341 63 2595 1087899 0.24 1090494 64 2710 1085389 0.25 1088099 65 2668 1078683 0.25 1081351 66 2692 1083014 0.25 1085706 67 2707 1078893 0.25 1081600 68 2694 1072086 0.25 1074780 69 2769 1075487 0.26 1078256 70 2680 1067527 0.25 1070207 71 2722 1063180 0.26 1065902 72 2653 1066192 0.25 1068845 73 2687 1062700 0.25 1065387 74 2714 1058520 0.26 1061234 75 2754 1058334 0.26 1061088 76 2756 1055830 0.26 1058586 77 2732 1051114 0.26 1053846 78 2741 1052735 0.26 1055476 79 2767 1044254 0.26 1047021 80 2720 1045059 0.26 1047779 81 2691 1041031 0.26 1043722 82 2709 1038110 0.26 1040819 83 2619 1031743 0.25 1034362 84 2683 1032456 0.26 1035139 85 2720 1028531 0.26 1031251 86 2690 1024433 0.26 1027123 87 2557 1025090 0.25 1027647 88 2611 1019463 0.26 1022074 89 2603 1016258 0.26 1018861 90 2558 1012022 0.25 1014580 91 2577 1007561 0.26 1010138 92 2575 1004308 0.26 1006883 93 2509 1006094 0.25 1008603 94 2568 1000010 0.26 1002578 95 2572 995750 0.26 998322 96 2582 994417 0.26 996999 97 2529 989322 0.25 991851 98 2539 985210 0.26 987749 99 2513 986015 0.25 988528 100 2533 980245 0.26 982778 101 2537 974162 0.26 976699 102 2593 973395 0.27 975988 103 2555 966765 0.26 969320 104 2576 962297 0.27 964873 105 2560 962333 0.27 964893 106 2491 953434 0.26 955925 107 2557 951225 0.27 953782 108 2479 950802 0.26 953281 109 2474 946691 0.26 949165 110 2409 939526 0.26 941935 111 2527 937974 0.27 940501 112 2461 932655 0.26 935116 113 2493 928245 0.27 930738 114 2423 926875 0.26 929298 115 2431 921347 0.26 923778 116 2518 916833 0.27 919351 117 2436 913565 0.27 916001 118 2394 905598 0.26 907992 119 2380 905010 0.26 907390 120 2421 904188 0.27 906609 121 2305 898020 0.26 900325 122 2462 892309 0.28 894771 123 2373 887803 0.27 890176 124 2391 881256 0.27 883647 125 2452 877172 0.28 879624 126 2456 876336 0.28 878792 127 2465 869874 0.28 872339 128 2330 864321 0.27 866651 129 2295 862352 0.27 864647 130 2310 855064 0.27 857374 131 2301 850474 0.27 852775 132 2374 847434 0.28 849808 133 2390 839524 0.28 841914 134 2374 835567 0.28 837941 135 2257 830769 0.27 833026 136 2343 828102 0.28 830445 137 2289 821733 0.28 824022 138 2309 818906 0.28 821215 139 2325 811532 0.29 813857 140 2300 804526 0.29 806826 141 2276 803548 0.28 805824 142 2258 799076 0.28 801334 143 2340 793161 0.29 795501 144 2232 788210 0.28 790442 145 2315 781214 0.30 783529 146 2232 773379 0.29 775611 147 2333 768877 0.30 771210 148 2244 758519 0.29 760763 149 2128 698026 0.30 700154 150 1545 0 100.00 1545 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4668 5877469 0.08 5882137 2 6170 4505568 0.14 4511738 3 8780 5877627 0.15 5886407 4 10060 6154614 0.16 6164674 5 8292 5298383 0.16 5306675 6 7935 4925538 0.16 4933473 7 8228 4999308 0.16 5007536 8 8255 4895567 0.17 4903822 9 8397 4969035 0.17 4977432 10 8597 4988015 0.17 4996612 11 8669 5004185 0.17 5012854 12 8895 5030740 0.18 5039635 13 9072 5025072 0.18 5034144 14 8986 5006068 0.18 5015054 15 9013 5029371 0.18 5038384 16 9011 5038923 0.18 5047934 17 9302 5042169 0.18 5051471 18 9108 5041575 0.18 5050683 19 9449 5033276 0.19 5042725 20 9297 5014348 0.19 5023645 21 9438 5015568 0.19 5025006 22 9600 4994832 0.19 5004432 23 9610 4985596 0.19 4995206 24 9508 4985243 0.19 4994751 25 9684 4988333 0.19 4998017 26 10037 4980265 0.20 4990302 27 9717 4994170 0.19 5003887 28 9857 4993702 0.20 5003559 29 9810 4973695 0.20 4983505 30 9630 4969049 0.19 4978679 31 10008 4966100 0.20 4976108 32 9764 4944492 0.20 4954256 33 9880 4936073 0.20 4945953 34 9835 4920887 0.20 4930722 35 9783 4926091 0.20 4935874 36 9822 4931027 0.20 4940849 37 9824 4930252 0.20 4940076 38 9808 4925141 0.20 4934949 39 9853 4919821 0.20 4929674 40 10030 4910383 0.20 4920413 41 9953 4893810 0.20 4903763 42 10025 4879080 0.21 4889105 43 9949 4873939 0.20 4883888 44 9919 4860687 0.20 4870606 45 10022 4858594 0.21 4868616 46 10054 4854081 0.21 4864135 47 10082 4847506 0.21 4857588 48 10036 4857638 0.21 4867674 49 9939 4845529 0.20 4855468 50 10165 4832278 0.21 4842443 51 10062 4817923 0.21 4827985 52 9935 4804483 0.21 4814418 53 10076 4792757 0.21 4802833 54 9934 4780718 0.21 4790652 55 9892 4774169 0.21 4784061 56 10131 4762190 0.21 4772321 57 9881 4761746 0.21 4771627 58 9963 4757700 0.21 4767663 59 9962 4754132 0.21 4764094 60 10099 4736358 0.21 4746457 61 9812 4730666 0.21 4740478 62 9987 4707677 0.21 4717664 63 10218 4702753 0.22 4712971 64 9798 4691556 0.21 4701354 65 9879 4670749 0.21 4680628 66 9953 4667376 0.21 4677329 67 9945 4670133 0.21 4680078 68 9998 4648259 0.21 4658257 69 9859 4637234 0.21 4647093 70 9759 4625137 0.21 4634896 71 9660 4613926 0.21 4623586 72 9714 4607504 0.21 4617218 73 9695 4597515 0.21 4607210 74 9685 4571152 0.21 4580837 75 9492 4565461 0.21 4574953 76 9790 4559412 0.21 4569202 77 9804 4544455 0.22 4554259 78 9808 4540301 0.22 4550109 79 9723 4536430 0.21 4546153 80 9628 4515848 0.21 4525476 81 9553 4506027 0.21 4515580 82 9313 4491799 0.21 4501112 83 9441 4469488 0.21 4478929 84 9367 4460278 0.21 4469645 85 9304 4444939 0.21 4454243 86 9368 4437681 0.21 4447049 87 9424 4425370 0.21 4434794 88 9362 4414691 0.21 4424053 89 9305 4405147 0.21 4414452 90 9522 4394438 0.22 4403960 91 9415 4378896 0.21 4388311 92 9154 4361516 0.21 4370670 93 9080 4350814 0.21 4359894 94 9231 4334592 0.21 4343823 95 9162 4303368 0.21 4312530 96 9175 4294723 0.21 4303898 97 9184 4285647 0.21 4294831 98 8896 4267289 0.21 4276185 99 8953 4260122 0.21 4269075 100 8960 4246383 0.21 4255343 101 9121 4225899 0.22 4235020 102 9177 4221427 0.22 4230604 103 8736 4199196 0.21 4207932 104 9030 4184767 0.22 4193797 105 8753 4169285 0.21 4178038 106 9076 4146743 0.22 4155819 107 8659 4128341 0.21 4137000 108 8803 4116511 0.21 4125314 109 8860 4106046 0.22 4114906 110 8724 4090989 0.21 4099713 111 8589 4076369 0.21 4084958 112 8829 4059837 0.22 4068666 113 8684 4038170 0.21 4046854 114 8563 4020871 0.21 4029434 115 8771 4000636 0.22 4009407 116 8398 3981676 0.21 3990074 117 8361 3968162 0.21 3976523 118 8413 3946459 0.21 3954872 119 8354 3924567 0.21 3932921 120 8436 3914365 0.22 3922801 121 8317 3898781 0.21 3907098 122 8380 3878790 0.22 3887170 123 8651 3864909 0.22 3873560 124 8393 3841760 0.22 3850153 125 8424 3818535 0.22 3826959 126 8331 3799699 0.22 3808030 127 8272 3781920 0.22 3790192 128 8421 3755021 0.22 3763442 129 8134 3740914 0.22 3749048 130 8341 3729535 0.22 3737876 131 8088 3704987 0.22 3713075 132 8179 3691213 0.22 3699392 133 8161 3666295 0.22 3674456 134 8445 3645063 0.23 3653508 135 8176 3625277 0.23 3633453 136 8340 3606259 0.23 3614599 137 8352 3584305 0.23 3592657 138 8239 3559995 0.23 3568234 139 8160 3540622 0.23 3548782 140 8122 3516221 0.23 3524343 141 8111 3502733 0.23 3510844 142 8132 3479436 0.23 3487568 143 8296 3455157 0.24 3463453 144 8286 3435133 0.24 3443419 145 8093 3411546 0.24 3419639 146 8276 3379968 0.24 3388244 147 8564 3350297 0.25 3358861 148 8506 3306347 0.26 3314853 149 8038 3045723 0.26 3053761 150 5913 0 100.00 5913