CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 121111 638449 15.94 759560 2 116158 776365 13.01 892523 3 116410 925105 11.18 1041515 4 117667 888766 11.69 1006433 5 138835 1015235 12.03 1154070 6 141688 1061031 11.78 1202719 7 133460 951892 12.30 1085352 8 133794 980671 12.01 1114465 9 133423 985288 11.93 1118711 10 131962 976914 11.90 1108876 11 133507 983544 11.95 1117051 12 134835 973314 12.17 1108149 13 133729 966696 12.15 1100425 14 134493 972870 12.15 1107363 15 134924 965436 12.26 1100360 16 135672 979834 12.16 1115506 17 136108 987202 12.12 1123310 18 137140 997584 12.09 1134724 19 138075 1007873 12.05 1145948 20 137959 1003693 12.08 1141652 21 137580 1000892 12.08 1138472 22 138855 996165 12.23 1135020 23 137527 987314 12.23 1124841 24 136619 974730 12.29 1111349 25 137196 978200 12.30 1115396 26 138427 994915 12.21 1133342 27 138506 1003236 12.13 1141742 28 138246 1003375 12.11 1141621 29 138717 1011668 12.06 1150385 30 139093 1009370 12.11 1148463 31 137962 1004994 12.07 1142956 32 140360 1006076 12.24 1146436 33 139663 1001578 12.24 1141241 34 139201 995412 12.27 1134613 35 139375 997414 12.26 1136789 36 138810 998971 12.20 1137781 37 139200 1000222 12.22 1139422 38 139728 1005835 12.20 1145563 39 139984 1011103 12.16 1151087 40 141545 1018576 12.20 1160121 41 140661 1019959 12.12 1160620 42 140936 1019839 12.14 1160775 43 141032 1011573 12.24 1152605 44 139402 1001128 12.22 1140530 45 140419 998281 12.33 1138700 46 140024 1005746 12.22 1145770 47 140439 1015276 12.15 1155715 48 141664 1020384 12.19 1162048 49 140646 1015147 12.17 1155793 50 139795 1013840 12.12 1153635 51 139960 1016327 12.10 1156287 52 141087 1019453 12.16 1160540 53 140316 1017828 12.12 1158144 54 141242 1013856 12.23 1155098 55 140482 1009155 12.22 1149637 56 139914 1012136 12.14 1152050 57 140457 1013598 12.17 1154055 58 140885 1014372 12.20 1155257 59 139677 1012821 12.12 1152498 60 140821 1018530 12.15 1159351 61 140726 1021808 12.11 1162534 62 140377 1020749 12.09 1161126 63 140536 1021279 12.10 1161815 64 140474 1015855 12.15 1156329 65 140420 1011524 12.19 1151944 66 140989 1019751 12.15 1160740 67 140712 1019245 12.13 1159957 68 139926 1015852 12.11 1155778 69 140247 1015969 12.13 1156216 70 140069 1018201 12.09 1158270 71 139612 1021440 12.02 1161052 72 140158 1026138 12.02 1166296 73 140230 1018843 12.10 1159073 74 139774 1014558 12.11 1154332 75 140187 1013836 12.15 1154023 76 139660 1016514 12.08 1156174 77 139333 1019449 12.02 1158782 78 139945 1025745 12.01 1165690 79 139890 1025015 12.01 1164905 80 139112 1023024 11.97 1162136 81 139072 1019411 12.00 1158483 82 138905 1022602 11.96 1161507 83 140145 1023016 12.05 1163161 84 139210 1022541 11.98 1161751 85 138941 1018151 12.01 1157092 86 138992 1016982 12.02 1155974 87 138479 1016546 11.99 1155025 88 138784 1017308 12.00 1156092 89 137864 1021375 11.89 1159239 90 138562 1024207 11.92 1162769 91 138539 1028232 11.87 1166771 92 137949 1025250 11.86 1163199 93 137399 1022570 11.85 1159969 94 137432 1017354 11.90 1154786 95 136766 1012651 11.90 1149417 96 136632 1011571 11.90 1148203 97 137304 1015940 11.91 1153244 98 136697 1017446 11.84 1154143 99 137059 1019714 11.85 1156773 100 135222 1016508 11.74 1151730 101 135694 1016307 11.78 1152001 102 135593 1016953 11.76 1152546 103 134907 1016092 11.72 1150999 104 135860 1014184 11.81 1150044 105 135210 1011440 11.79 1146650 106 134603 1006406 11.80 1141009 107 133777 1002551 11.77 1136328 108 133699 1005967 11.73 1139666 109 133467 1007344 11.70 1140811 110 134402 1010817 11.74 1145219 111 133663 1013774 11.65 1147437 112 133248 1010312 11.65 1143560 113 133149 1007859 11.67 1141008 114 132838 1005640 11.67 1138478 115 132151 1002453 11.65 1134604 116 131443 999512 11.62 1130955 117 131581 999274 11.64 1130855 118 130773 1003356 11.53 1134129 119 130693 1002100 11.54 1132793 120 129821 1000693 11.48 1130514 121 130145 999637 11.52 1129782 122 129050 1002729 11.40 1131779 123 130232 1001938 11.50 1132170 124 130038 998861 11.52 1128899 125 128694 995002 11.45 1123696 126 128540 991345 11.48 1119885 127 127960 987779 11.47 1115739 128 127906 984511 11.50 1112417 129 126555 984937 11.39 1111492 130 126415 986022 11.36 1112437 131 125877 986802 11.31 1112679 132 126310 984189 11.37 1110499 133 124850 982543 11.27 1107393 134 125682 982997 11.34 1108679 135 125285 982859 11.31 1108144 136 123574 978801 11.21 1102375 137 123988 976772 11.26 1100760 138 123315 974829 11.23 1098144 139 123737 974771 11.26 1098508 140 122829 972306 11.22 1095135 141 122080 969284 11.19 1091364 142 121894 969000 11.17 1090894 143 120840 966704 11.11 1087544 144 120445 965825 11.09 1086270 145 120366 961468 11.13 1081834 146 119748 963518 11.05 1083266 147 119136 962286 11.02 1081422 148 117327 955663 10.93 1072990 149 114276 953107 10.71 1067383 150 100936 884480 10.24 985416 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2850 2030839 0.14 2033689 2 2949 1195594 0.25 1198543 3 2718 1315664 0.21 1318382 4 2829 1435207 0.20 1438036 5 3775 1670546 0.23 1674321 6 3754 1609224 0.23 1612978 7 3666 1524211 0.24 1527877 8 3641 1545935 0.23 1549576 9 3772 1543421 0.24 1547193 10 3608 1533469 0.23 1537077 11 3697 1539851 0.24 1543548 12 3702 1535824 0.24 1539526 13 4026 1539260 0.26 1543286 14 3997 1533118 0.26 1537115 15 4063 1523058 0.27 1527121 16 4193 1543529 0.27 1547722 17 4257 1547947 0.27 1552204 18 4267 1546462 0.28 1550729 19 4284 1557745 0.27 1562029 20 4119 1551713 0.26 1555832 21 4225 1557570 0.27 1561795 22 4273 1559159 0.27 1563432 23 4406 1550775 0.28 1555181 24 4362 1547286 0.28 1551648 25 4379 1553988 0.28 1558367 26 4316 1567649 0.27 1571965 27 4393 1562338 0.28 1566731 28 4465 1574332 0.28 1578797 29 4533 1568670 0.29 1573203 30 4444 1563559 0.28 1568003 31 4449 1574833 0.28 1579282 32 4492 1575178 0.28 1579670 33 4634 1579617 0.29 1584251 34 4558 1576917 0.29 1581475 35 4601 1575981 0.29 1580582 36 4634 1572916 0.29 1577550 37 4673 1577469 0.30 1582142 38 4546 1573047 0.29 1577593 39 4485 1579332 0.28 1583817 40 4672 1585576 0.29 1590248 41 4442 1591104 0.28 1595546 42 4663 1583539 0.29 1588202 43 4464 1593908 0.28 1598372 44 4563 1589463 0.29 1594026 45 4559 1583463 0.29 1588022 46 4586 1594282 0.29 1598868 47 4489 1592599 0.28 1597088 48 4521 1589010 0.28 1593531 49 4458 1587008 0.28 1591466 50 4591 1588574 0.29 1593165 51 4712 1591102 0.30 1595814 52 4707 1596727 0.29 1601434 53 4543 1603832 0.28 1608375 54 4585 1596429 0.29 1601014 55 4536 1600811 0.28 1605347 56 4615 1601639 0.29 1606254 57 4513 1592802 0.28 1597315 58 4595 1591387 0.29 1595982 59 4522 1594800 0.28 1599322 60 4539 1592142 0.28 1596681 61 4619 1598628 0.29 1603247 62 4549 1600418 0.28 1604967 63 4684 1597955 0.29 1602639 64 4571 1607529 0.28 1612100 65 4740 1611893 0.29 1616633 66 4733 1604619 0.29 1609352 67 4676 1612972 0.29 1617648 68 4579 1601631 0.29 1606210 69 4689 1587946 0.29 1592635 70 4656 1598310 0.29 1602966 71 4454 1602092 0.28 1606546 72 4629 1605203 0.29 1609832 73 4806 1608265 0.30 1613071 74 4682 1613899 0.29 1618581 75 4727 1613826 0.29 1618553 76 4620 1617515 0.28 1622135 77 4723 1614574 0.29 1619297 78 4779 1614708 0.30 1619487 79 4579 1612934 0.28 1617513 80 4476 1611072 0.28 1615548 81 4517 1603082 0.28 1607599 82 4700 1612851 0.29 1617551 83 4807 1616039 0.30 1620846 84 4670 1611920 0.29 1616590 85 4703 1617640 0.29 1622343 86 4731 1614707 0.29 1619438 87 4691 1611829 0.29 1616520 88 4703 1610221 0.29 1614924 89 4605 1608702 0.29 1613307 90 4682 1605151 0.29 1609833 91 4602 1615213 0.28 1619815 92 4695 1611725 0.29 1616420 93 4661 1605490 0.29 1610151 94 4651 1603564 0.29 1608215 95 4628 1608111 0.29 1612739 96 4622 1602246 0.29 1606868 97 4642 1608253 0.29 1612895 98 4706 1604530 0.29 1609236 99 4487 1598655 0.28 1603142 100 4564 1601765 0.28 1606329 101 4558 1602996 0.28 1607554 102 4717 1595979 0.29 1600696 103 4616 1603080 0.29 1607696 104 4520 1595485 0.28 1600005 105 4505 1592053 0.28 1596558 106 4507 1596980 0.28 1601487 107 4575 1592975 0.29 1597550 108 4604 1587496 0.29 1592100 109 4593 1589262 0.29 1593855 110 4579 1593190 0.29 1597769 111 4447 1591466 0.28 1595913 112 4602 1587769 0.29 1592371 113 4634 1585411 0.29 1590045 114 4504 1579753 0.28 1584257 115 4560 1585774 0.29 1590334 116 4546 1579940 0.29 1584486 117 4498 1582645 0.28 1587143 118 4679 1580687 0.30 1585366 119 4485 1578333 0.28 1582818 120 4563 1569669 0.29 1574232 121 4492 1574129 0.28 1578621 122 4518 1570400 0.29 1574918 123 4562 1568729 0.29 1573291 124 4477 1568620 0.28 1573097 125 4402 1560695 0.28 1565097 126 4438 1551921 0.29 1556359 127 4323 1559138 0.28 1563461 128 4398 1550306 0.28 1554704 129 4392 1546683 0.28 1551075 130 4335 1549023 0.28 1553358 131 4466 1546059 0.29 1550525 132 4391 1542992 0.28 1547383 133 4429 1545344 0.29 1549773 134 4471 1541008 0.29 1545479 135 4391 1539237 0.28 1543628 136 4379 1533416 0.28 1537795 137 4515 1531648 0.29 1536163 138 4439 1528029 0.29 1532468 139 4489 1531587 0.29 1536076 140 4499 1520781 0.29 1525280 141 4374 1517412 0.29 1521786 142 4532 1516062 0.30 1520594 143 4368 1508825 0.29 1513193 144 4597 1505184 0.30 1509781 145 5000 1513564 0.33 1518564 146 5602 1502970 0.37 1508572 147 5859 1496530 0.39 1502389 148 5404 1493525 0.36 1498929 149 5015 1483933 0.34 1488948 150 4542 1353532 0.33 1358074 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9836 6264263 0.16 6274099 2 9446 5041434 0.19 5050880 3 11307 6040122 0.19 6051429 4 10792 6617188 0.16 6627980 5 12212 7320103 0.17 7332315 6 12977 7350859 0.18 7363836 7 12201 6863949 0.18 6876150 8 12636 6895666 0.18 6908302 9 12715 6840967 0.19 6853682 10 12665 6774056 0.19 6786721 11 12721 6788821 0.19 6801542 12 13140 6744185 0.19 6757325 13 13325 6674078 0.20 6687403 14 13603 6647032 0.20 6660635 15 13748 6622749 0.21 6636497 16 13564 6673926 0.20 6687490 17 13929 6698220 0.21 6712149 18 13895 6754049 0.21 6767944 19 14600 6794270 0.21 6808870 20 14500 6776326 0.21 6790826 21 14799 6766951 0.22 6781750 22 14677 6771286 0.22 6785963 23 14759 6753715 0.22 6768474 24 14694 6727795 0.22 6742489 25 14592 6698819 0.22 6713411 26 14868 6711239 0.22 6726107 27 15224 6738735 0.23 6753959 28 15159 6791469 0.22 6806628 29 14975 6819595 0.22 6834570 30 15133 6829948 0.22 6845081 31 15389 6851611 0.22 6867000 32 15575 6811490 0.23 6827065 33 15620 6800882 0.23 6816502 34 14968 6781578 0.22 6796546 35 15095 6755468 0.22 6770563 36 15356 6743856 0.23 6759212 37 15372 6760810 0.23 6776182 38 15454 6781855 0.23 6797309 39 15628 6822583 0.23 6838211 40 15889 6847510 0.23 6863399 41 15402 6839694 0.22 6855096 42 15671 6847435 0.23 6863106 43 15759 6834224 0.23 6849983 44 15446 6800545 0.23 6815991 45 15392 6775405 0.23 6790797 46 15262 6773498 0.22 6788760 47 15564 6771865 0.23 6787429 48 15461 6782325 0.23 6797786 49 15855 6822932 0.23 6838787 50 16120 6843815 0.23 6859935 51 15666 6843287 0.23 6858953 52 15759 6859296 0.23 6875055 53 15576 6863714 0.23 6879290 54 15722 6855723 0.23 6871445 55 15386 6828917 0.22 6844303 56 15757 6826418 0.23 6842175 57 15505 6790156 0.23 6805661 58 15877 6800765 0.23 6816642 59 15478 6806623 0.23 6822101 60 15754 6850091 0.23 6865845 61 15779 6873242 0.23 6889021 62 15730 6863322 0.23 6879052 63 15936 6865825 0.23 6881761 64 15889 6862856 0.23 6878745 65 15558 6848756 0.23 6864314 66 15572 6854677 0.23 6870249 67 15769 6862276 0.23 6878045 68 15731 6843615 0.23 6859346 69 15643 6835727 0.23 6851370 70 16137 6884979 0.23 6901116 71 15850 6884299 0.23 6900149 72 15790 6886188 0.23 6901978 73 15794 6883483 0.23 6899277 74 16155 6858057 0.24 6874212 75 15558 6843801 0.23 6859359 76 15620 6852072 0.23 6867692 77 15843 6847146 0.23 6862989 78 15885 6856214 0.23 6872099 79 15802 6871491 0.23 6887293 80 16104 6881495 0.23 6897599 81 16067 6891097 0.23 6907164 82 15950 6907235 0.23 6923185 83 15838 6889565 0.23 6905403 84 15795 6881689 0.23 6897484 85 15581 6870112 0.23 6885693 86 15501 6847640 0.23 6863141 87 15548 6838841 0.23 6854389 88 15619 6838155 0.23 6853774 89 15858 6855622 0.23 6871480 90 15650 6880677 0.23 6896327 91 15898 6901754 0.23 6917652 92 15918 6896239 0.23 6912157 93 15716 6892727 0.23 6908443 94 15673 6885094 0.23 6900767 95 15645 6857718 0.23 6873363 96 15663 6844707 0.23 6860370 97 15471 6850263 0.23 6865734 98 15556 6843625 0.23 6859181 99 15752 6851651 0.23 6867403 100 15635 6872328 0.23 6887963 101 15416 6874143 0.22 6889559 102 15434 6864531 0.22 6879965 103 15623 6866595 0.23 6882218 104 15507 6858993 0.23 6874500 105 15365 6836434 0.22 6851799 106 15580 6831256 0.23 6846836 107 15175 6795412 0.22 6810587 108 15378 6774311 0.23 6789689 109 15310 6791526 0.22 6806836 110 15184 6803585 0.22 6818769 111 15456 6804402 0.23 6819858 112 15516 6813194 0.23 6828710 113 15269 6818750 0.22 6834019 114 15452 6799112 0.23 6814564 115 15487 6795297 0.23 6810784 116 15421 6778546 0.23 6793967 117 15315 6756468 0.23 6771783 118 15154 6749191 0.22 6764345 119 15255 6739316 0.23 6754571 120 15262 6731375 0.23 6746637 121 15574 6738083 0.23 6753657 122 15267 6741696 0.23 6756963 123 15028 6740442 0.22 6755470 124 15005 6731542 0.22 6746547 125 15117 6710584 0.22 6725701 126 15155 6695909 0.23 6711064 127 15225 6681629 0.23 6696854 128 14988 6663912 0.22 6678900 129 15043 6656766 0.23 6671809 130 15213 6653415 0.23 6668628 131 15454 6639806 0.23 6655260 132 15112 6633153 0.23 6648265 133 15348 6631150 0.23 6646498 134 15390 6620842 0.23 6636232 135 15642 6617775 0.24 6633417 136 15165 6600181 0.23 6615346 137 15399 6587050 0.23 6602449 138 15559 6580816 0.24 6596375 139 15142 6564429 0.23 6579571 140 15344 6546903 0.23 6562247 141 15694 6528458 0.24 6544152 142 15609 6516005 0.24 6531614 143 15785 6501516 0.24 6517301 144 16428 6490655 0.25 6507083 145 16953 6492264 0.26 6509217 146 18378 6487107 0.28 6505485 147 18694 6480401 0.29 6499095 148 18371 6453988 0.28 6472359 149 17728 6382669 0.28 6400397 150 15670 5974943 0.26 5990613 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2472 1136661 0.22 1139133 2 29993 927905 3.13 957898 3 56782 748215 7.05 804997 4 64772 883416 6.83 948188 5 67531 871971 7.19 939502 6 78073 993342 7.29 1071415 7 81982 1034373 7.34 1116355 8 77453 922368 7.75 999821 9 81059 945201 7.90 1026260 10 83680 944518 8.14 1028198 11 83056 934335 8.16 1017391 12 85414 934371 8.38 1019785 13 86624 919370 8.61 1005994 14 87092 914965 8.69 1002057 15 88877 914301 8.86 1003178 16 90233 908400 9.04 998633 17 90425 920721 8.94 1011146 18 90864 921733 8.97 1012597 19 91830 928362 9.00 1020192 20 93308 933448 9.09 1026756 21 93584 924855 9.19 1018439 22 93178 919395 9.20 1012573 23 94856 918079 9.36 1012935 24 93827 905177 9.39 999004 25 93331 894742 9.45 988073 26 94016 896368 9.49 990384 27 94502 903659 9.47 998161 28 95905 906880 9.56 1002785 29 95113 905861 9.50 1000974 30 95946 907784 9.56 1003730 31 95356 901244 9.57 996600 32 97026 894868 9.78 991894 33 96304 894131 9.72 990435 34 96621 887921 9.81 984542 35 97027 882134 9.91 979161 36 96850 876848 9.95 973698 37 96444 878716 9.89 975160 38 97140 878247 9.96 975387 39 96731 878028 9.92 974759 40 97698 878123 10.01 975821 41 98331 880445 10.05 978776 42 97316 876756 9.99 974072 43 97708 873186 10.06 970894 44 97904 865479 10.16 963383 45 97475 856095 10.22 953570 46 97615 852429 10.27 950044 47 98033 852328 10.32 950361 48 97245 856547 10.20 953792 49 98172 857222 10.28 955394 50 97802 853835 10.28 951637 51 97127 848721 10.27 945848 52 97589 846572 10.34 944161 53 98705 845161 10.46 943866 54 98285 840718 10.47 939003 55 97994 836170 10.49 934164 56 97706 831260 10.52 928966 57 97696 827551 10.56 925247 58 97593 829455 10.53 927048 59 97742 827124 10.57 924866 60 96485 822115 10.50 918600 61 97688 823646 10.60 921334 62 98053 824264 10.63 922317 63 96880 818137 10.59 915017 64 97260 813522 10.68 910782 65 97343 810254 10.73 907597 66 96832 806652 10.72 903484 67 97365 804759 10.79 902124 68 96893 803859 10.76 900752 69 96214 798860 10.75 895074 70 96028 795328 10.77 891356 71 96442 797548 10.79 893990 72 96472 793821 10.84 890293 73 95990 794731 10.78 890721 74 96358 790251 10.87 886609 75 95748 780612 10.93 876360 76 95737 777078 10.97 872815 77 95483 776976 10.94 872459 78 95286 776712 10.93 871998 79 95168 777716 10.90 872884 80 94595 774487 10.88 869082 81 94527 770379 10.93 864906 82 94338 768981 10.93 863319 83 95087 766309 11.04 861396 84 93549 763599 10.91 857148 85 94251 759904 11.03 854155 86 94097 754047 11.09 848144 87 93639 749128 11.11 842767 88 93549 747277 11.13 840826 89 93542 747222 11.13 840764 90 93082 745256 11.10 838338 91 92544 743592 11.07 836136 92 92375 744436 11.04 836811 93 92267 739025 11.10 831292 94 91922 733669 11.13 825591 95 92098 730584 11.19 822682 96 90803 726219 11.11 817022 97 91111 722103 11.20 813214 98 91358 721082 11.24 812440 99 90514 718118 11.19 808632 100 90808 716884 11.24 807692 101 90331 714704 11.22 805035 102 89556 711909 11.17 801465 103 88930 707022 11.17 795952 104 88977 706248 11.19 795225 105 88751 701250 11.23 790001 106 88296 696114 11.26 784410 107 87744 692421 11.25 780165 108 87143 687405 11.25 774548 109 87118 684422 11.29 771540 110 87354 683681 11.33 771035 111 86735 683347 11.26 770082 112 86394 679472 11.28 765866 113 85754 677910 11.23 763664 114 85998 674470 11.31 760468 115 85609 668804 11.35 754413 116 85267 667010 11.33 752277 117 84538 660465 11.35 745003 118 84151 658794 11.33 742945 119 84331 656309 11.39 740640 120 84122 654288 11.39 738410 121 82881 650133 11.31 733014 122 82529 648327 11.29 730856 123 82052 643856 11.30 725908 124 82232 642351 11.35 724583 125 81868 638300 11.37 720168 126 81032 634152 11.33 715184 127 80739 628043 11.39 708782 128 79846 623887 11.35 703733 129 79501 621795 11.34 701296 130 79784 618513 11.43 698297 131 79258 615672 11.41 694930 132 78647 612352 11.38 690999 133 78437 608516 11.42 686953 134 77528 606925 11.33 684453 135 77491 603538 11.38 681029 136 77111 598481 11.41 675592 137 76143 596457 11.32 672600 138 75876 592273 11.36 668149 139 75559 588495 11.38 664054 140 75681 584554 11.46 660235 141 74730 580019 11.41 654749 142 74647 576300 11.47 650947 143 73956 573838 11.42 647794 144 73697 570207 11.45 643904 145 72761 566986 11.37 639747 146 71910 562889 11.33 634799 147 71699 556654 11.41 628353 148 70915 548634 11.45 619549 149 69459 496676 12.27 566135 150 61748 0 100.00 61748 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1618 1475616 0.11 1477234 2 2008 1189922 0.17 1191930 3 5564 2193831 0.25 2199395 4 6775 1131840 0.60 1138615 5 2735 1243461 0.22 1246196 6 2849 1332495 0.21 1335344 7 3148 1532812 0.20 1535960 8 3357 1480806 0.23 1484163 9 3091 1393475 0.22 1396566 10 3043 1403478 0.22 1406521 11 3086 1400168 0.22 1403254 12 3007 1390788 0.22 1393795 13 3059 1386612 0.22 1389671 14 3202 1383514 0.23 1386716 15 3139 1389745 0.23 1392884 16 3072 1381344 0.22 1384416 17 3258 1373645 0.24 1376903 18 3304 1387309 0.24 1390613 19 3197 1384891 0.23 1388088 20 3248 1377706 0.24 1380954 21 3158 1390366 0.23 1393524 22 3189 1377337 0.23 1380526 23 3300 1379680 0.24 1382980 24 3213 1379103 0.23 1382316 25 3276 1370037 0.24 1373313 26 3383 1365819 0.25 1369202 27 3249 1368831 0.24 1372080 28 3252 1371766 0.24 1375018 29 3332 1366607 0.24 1369939 30 3318 1372199 0.24 1375517 31 3319 1362963 0.24 1366282 32 3291 1350181 0.24 1353472 33 3348 1355909 0.25 1359257 34 3193 1350281 0.24 1353474 35 3305 1349317 0.24 1352622 36 3261 1349781 0.24 1353042 37 3262 1341624 0.24 1344886 38 3338 1341066 0.25 1344404 39 3354 1339801 0.25 1343155 40 3419 1331430 0.26 1334849 41 3356 1327811 0.25 1331167 42 3252 1328601 0.24 1331853 43 3152 1328867 0.24 1332019 44 3333 1321354 0.25 1324687 45 3391 1326062 0.26 1329453 46 3343 1319408 0.25 1322751 47 3277 1307862 0.25 1311139 48 3385 1315079 0.26 1318464 49 3280 1308229 0.25 1311509 50 3338 1305595 0.26 1308933 51 3213 1300296 0.25 1303509 52 3267 1293697 0.25 1296964 53 3322 1292423 0.26 1295745 54 3408 1290236 0.26 1293644 55 3232 1293104 0.25 1296336 56 3322 1286253 0.26 1289575 57 3264 1284829 0.25 1288093 58 3316 1279695 0.26 1283011 59 3264 1271174 0.26 1274438 60 3227 1267719 0.25 1270946 61 3233 1264788 0.25 1268021 62 3309 1255854 0.26 1259163 63 3239 1257090 0.26 1260329 64 3275 1254189 0.26 1257464 65 3225 1251472 0.26 1254697 66 3304 1255156 0.26 1258460 67 3144 1253484 0.25 1256628 68 3181 1244878 0.25 1248059 69 3244 1244505 0.26 1247749 70 3164 1234430 0.26 1237594 71 3238 1224110 0.26 1227348 72 3253 1226512 0.26 1229765 73 3160 1220629 0.26 1223789 74 3145 1219000 0.26 1222145 75 3200 1219521 0.26 1222721 76 3295 1216590 0.27 1219885 77 3246 1214471 0.27 1217717 78 3353 1212458 0.28 1215811 79 3195 1207018 0.26 1210213 80 3116 1204495 0.26 1207611 81 3249 1199081 0.27 1202330 82 3107 1191281 0.26 1194388 83 3050 1182157 0.26 1185207 84 3181 1181903 0.27 1185084 85 3141 1180179 0.27 1183320 86 3039 1173299 0.26 1176338 87 3162 1175938 0.27 1179100 88 2954 1167882 0.25 1170836 89 3100 1164240 0.27 1167340 90 3032 1160734 0.26 1163766 91 2952 1155226 0.25 1158178 92 2928 1148800 0.25 1151728 93 2965 1149478 0.26 1152443 94 3018 1144959 0.26 1147977 95 3069 1135599 0.27 1138668 96 3001 1134339 0.26 1137340 97 3052 1129157 0.27 1132209 98 2816 1122091 0.25 1124907 99 3060 1124020 0.27 1127080 100 2891 1117793 0.26 1120684 101 2983 1109834 0.27 1112817 102 2883 1108375 0.26 1111258 103 2996 1100722 0.27 1103718 104 2996 1094633 0.27 1097629 105 2867 1095035 0.26 1097902 106 2897 1085880 0.27 1088777 107 2848 1080070 0.26 1082918 108 2862 1078548 0.26 1081410 109 2984 1070848 0.28 1073832 110 2807 1066246 0.26 1069053 111 2905 1063263 0.27 1066168 112 2801 1059317 0.26 1062118 113 2755 1053158 0.26 1055913 114 2814 1047721 0.27 1050535 115 2744 1044333 0.26 1047077 116 2749 1038403 0.26 1041152 117 2779 1035485 0.27 1038264 118 2763 1025906 0.27 1028669 119 2766 1025475 0.27 1028241 120 2700 1023808 0.26 1026508 121 2738 1016577 0.27 1019315 122 2859 1007824 0.28 1010683 123 2606 1003582 0.26 1006188 124 2776 997969 0.28 1000745 125 2710 992339 0.27 995049 126 2708 988994 0.27 991702 127 2713 981594 0.28 984307 128 2708 973600 0.28 976308 129 2652 968355 0.27 971007 130 2726 963418 0.28 966144 131 2688 959215 0.28 961903 132 2639 954608 0.28 957247 133 2752 947354 0.29 950106 134 2633 941826 0.28 944459 135 2615 939060 0.28 941675 136 2640 934232 0.28 936872 137 2589 925818 0.28 928407 138 2707 922671 0.29 925378 139 2782 914341 0.30 917123 140 2684 906935 0.30 909619 141 2505 905804 0.28 908309 142 2556 898613 0.28 901169 143 2569 891891 0.29 894460 144 2551 888621 0.29 891172 145 2593 881594 0.29 884187 146 2538 873241 0.29 875779 147 2623 866768 0.30 869391 148 2585 854241 0.30 856826 149 2349 785279 0.30 787628 150 1757 0 100.00 1757 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 8976 8088912 0.11 8097888 2 9602 5973168 0.16 5982770 3 10781 6499937 0.17 6510718 4 12516 7060343 0.18 7072859 5 10560 6243830 0.17 6254390 6 10311 6013720 0.17 6024031 7 10804 6203524 0.17 6214328 8 10610 6061554 0.17 6072164 9 10698 6120331 0.17 6131029 10 10816 6082432 0.18 6093248 11 11097 6070221 0.18 6081318 12 11072 6048708 0.18 6059780 13 11190 5972379 0.19 5983569 14 11159 5967667 0.19 5978826 15 11172 5993141 0.19 6004313 16 11366 6020701 0.19 6032067 17 11586 6047855 0.19 6059441 18 11378 6040974 0.19 6052352 19 11656 6049375 0.19 6061031 20 11808 6024430 0.20 6036238 21 11842 5992568 0.20 6004410 22 11656 5943752 0.20 5955408 23 11780 5918322 0.20 5930102 24 11737 5877110 0.20 5888847 25 11856 5879663 0.20 5891519 26 12082 5877215 0.21 5889297 27 11943 5904431 0.20 5916374 28 12231 5926625 0.21 5938856 29 12039 5909503 0.20 5921542 30 12267 5881002 0.21 5893269 31 12109 5863140 0.21 5875249 32 12428 5821478 0.21 5833906 33 11928 5789385 0.21 5801313 34 11843 5754796 0.21 5766639 35 12034 5752887 0.21 5764921 36 11937 5756048 0.21 5767985 37 12129 5767215 0.21 5779344 38 12054 5770465 0.21 5782519 39 12039 5764158 0.21 5776197 40 12250 5757007 0.21 5769257 41 12078 5729637 0.21 5741715 42 12131 5702242 0.21 5714373 43 12047 5679608 0.21 5691655 44 11876 5639293 0.21 5651169 45 11896 5621697 0.21 5633593 46 12191 5621076 0.22 5633267 47 12115 5622601 0.22 5634716 48 12321 5629475 0.22 5641796 49 12279 5627197 0.22 5639476 50 12077 5617621 0.21 5629698 51 12146 5580740 0.22 5592886 52 11950 5562870 0.21 5574820 53 12165 5550012 0.22 5562177 54 11869 5514296 0.21 5526165 55 11789 5501229 0.21 5513018 56 12217 5485726 0.22 5497943 57 11867 5470660 0.22 5482527 58 11793 5475881 0.21 5487674 59 11993 5466887 0.22 5478880 60 11979 5462764 0.22 5474743 61 11685 5453188 0.21 5464873 62 11978 5415059 0.22 5427037 63 11923 5390570 0.22 5402493 64 11576 5374811 0.21 5386387 65 11557 5348700 0.22 5360257 66 11476 5339006 0.21 5350482 67 11799 5344538 0.22 5356337 68 11570 5318827 0.22 5330397 69 11525 5305375 0.22 5316900 70 11515 5294431 0.22 5305946 71 11906 5272145 0.23 5284051 72 11597 5262619 0.22 5274216 73 11593 5244914 0.22 5256507 74 11488 5209709 0.22 5221197 75 11252 5187359 0.22 5198611 76 11472 5186907 0.22 5198379 77 11272 5174329 0.22 5185601 78 11288 5174795 0.22 5186083 79 11432 5174512 0.22 5185944 80 11257 5148413 0.22 5159670 81 11432 5134048 0.22 5145480 82 11137 5116206 0.22 5127343 83 11200 5085931 0.22 5097131 84 11026 5057515 0.22 5068541 85 10935 5039132 0.22 5050067 86 10936 5024911 0.22 5035847 87 10915 5011493 0.22 5022408 88 10748 5004746 0.21 5015494 89 10659 5001270 0.21 5011929 90 10686 4989435 0.21 5000121 91 10825 4972308 0.22 4983133 92 10709 4943845 0.22 4954554 93 10681 4923708 0.22 4934389 94 10628 4896599 0.22 4907227 95 10419 4851528 0.21 4861947 96 10642 4836940 0.22 4847582 97 10386 4829676 0.21 4840062 98 10380 4821224 0.21 4831604 99 10275 4809542 0.21 4819817 100 10410 4795547 0.22 4805957 101 10421 4771450 0.22 4781871 102 10378 4755642 0.22 4766020 103 10226 4736881 0.22 4747107 104 10003 4710396 0.21 4720399 105 10139 4681044 0.22 4691183 106 10365 4656891 0.22 4667256 107 10175 4630526 0.22 4640701 108 10143 4613823 0.22 4623966 109 9948 4607910 0.22 4617858 110 10069 4601565 0.22 4611634 111 9822 4593066 0.21 4602888 112 9952 4569665 0.22 4579617 113 10007 4542626 0.22 4552633 114 9755 4516159 0.22 4525914 115 9784 4483591 0.22 4493375 116 9699 4460434 0.22 4470133 117 9597 4435895 0.22 4445492 118 9765 4414618 0.22 4424383 119 9508 4395087 0.22 4404595 120 9569 4387391 0.22 4396960 121 9467 4374835 0.22 4384302 122 9482 4353711 0.22 4363193 123 9493 4329752 0.22 4339245 124 9237 4306476 0.21 4315713 125 9452 4272494 0.22 4281946 126 9397 4247231 0.22 4256628 127 9315 4228641 0.22 4237956 128 9528 4198521 0.23 4208049 129 9265 4176997 0.22 4186262 130 9396 4166163 0.23 4175559 131 9381 4152431 0.23 4161812 132 9469 4128324 0.23 4137793 133 9443 4104378 0.23 4113821 134 9619 4079225 0.24 4088844 135 9589 4051299 0.24 4060888 136 9332 4023766 0.23 4033098 137 9402 4001581 0.23 4010983 138 9396 3974743 0.24 3984139 139 9188 3952418 0.23 3961606 140 9250 3929873 0.23 3939123 141 9309 3912877 0.24 3922186 142 9286 3891791 0.24 3901077 143 9540 3865578 0.25 3875118 144 9212 3834952 0.24 3844164 145 9204 3808045 0.24 3817249 146 9452 3777316 0.25 3786768 147 9747 3739491 0.26 3749238 148 9587 3690552 0.26 3700139 149 8895 3400242 0.26 3409137 150 6560 0 100.00 6560