CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 163940 741632 18.10 905572 2 149575 791830 15.89 941405 3 178726 968461 15.58 1147187 4 185478 988844 15.79 1174322 5 184158 964407 16.03 1148565 6 183925 985940 15.72 1169865 7 187033 953912 16.39 1140945 8 194657 1010107 16.16 1204764 9 183717 959875 16.06 1143592 10 184469 997485 15.61 1181954 11 197666 1008678 16.39 1206344 12 186849 960581 16.28 1147430 13 177556 950377 15.74 1127933 14 179283 955067 15.80 1134350 15 181070 944585 16.09 1125655 16 186361 965191 16.18 1151552 17 185302 954799 16.25 1140101 18 185340 961269 16.16 1146609 19 185996 960476 16.22 1146472 20 187387 966854 16.23 1154241 21 188719 971665 16.26 1160384 22 187213 966378 16.23 1153591 23 187101 969364 16.18 1156465 24 188217 974265 16.19 1162482 25 187405 970322 16.19 1157727 26 186582 967641 16.17 1154223 27 187629 976503 16.12 1164132 28 187186 971610 16.15 1158796 29 188116 972995 16.20 1161111 30 189245 981600 16.16 1170845 31 187809 980063 16.08 1167872 32 187680 978985 16.09 1166665 33 188786 984355 16.09 1173141 34 188425 978692 16.14 1167117 35 189441 978704 16.22 1168145 36 190149 987373 16.15 1177522 37 187893 983402 16.04 1171295 38 187699 981714 16.05 1169413 39 189259 988493 16.07 1177752 40 189144 986317 16.09 1175461 41 189712 985828 16.14 1175540 42 191112 994546 16.12 1185658 43 189928 989620 16.10 1179548 44 190382 989432 16.14 1179814 45 190719 991534 16.13 1182253 46 189889 990509 16.09 1180398 47 189490 989941 16.07 1179431 48 190382 993180 16.09 1183562 49 189369 991604 16.03 1180973 50 189787 990839 16.08 1180626 51 190258 994771 16.06 1185029 52 190359 993893 16.07 1184252 53 190835 992919 16.12 1183754 54 190655 996638 16.06 1187293 55 190203 995869 16.04 1186072 56 190577 992705 16.11 1183282 57 190282 996655 16.03 1186937 58 190048 994006 16.05 1184054 59 189038 992505 16.00 1181543 60 190476 997630 16.03 1188106 61 189788 994096 16.03 1183884 62 188780 993279 15.97 1182059 63 190427 997795 16.03 1188222 64 190127 996003 16.03 1186130 65 189623 993102 16.03 1182725 66 189674 995968 16.00 1185642 67 188806 991828 15.99 1180634 68 188984 992543 15.99 1181527 69 189515 994306 16.01 1183821 70 187958 992147 15.93 1180105 71 189261 991203 16.03 1180464 72 188658 994673 15.94 1183331 73 188799 990308 16.01 1179107 74 187729 990306 15.94 1178035 75 188406 992858 15.95 1181264 76 188019 989337 15.97 1177356 77 187402 987422 15.95 1174824 78 187095 988467 15.92 1175562 79 187289 984517 15.98 1171806 80 187542 985076 15.99 1172618 81 187075 986481 15.94 1173556 82 187041 983717 15.98 1170758 83 186211 982888 15.93 1169099 84 187341 986946 15.95 1174287 85 185757 982007 15.91 1167764 86 186741 982646 15.97 1169387 87 185925 982329 15.91 1168254 88 185105 976637 15.93 1161742 89 184515 973078 15.94 1157593 90 184537 978374 15.87 1162911 91 184800 973036 15.96 1157836 92 183937 969905 15.94 1153842 93 183533 972834 15.87 1156367 94 183005 971290 15.85 1154295 95 182503 968114 15.86 1150617 96 182932 968520 15.89 1151452 97 182257 964612 15.89 1146869 98 181847 962816 15.89 1144663 99 182132 964099 15.89 1146231 100 181358 958391 15.91 1139749 101 179766 955706 15.83 1135472 102 179155 956498 15.78 1135653 103 178431 952460 15.78 1130891 104 178553 950800 15.81 1129353 105 178665 953915 15.78 1132580 106 177947 948069 15.80 1126016 107 176281 943505 15.74 1119786 108 177012 944050 15.79 1121062 109 176209 941309 15.77 1117518 110 175192 937993 15.74 1113185 111 174934 936950 15.73 1111884 112 174249 935375 15.70 1109624 113 174123 932538 15.73 1106661 114 173926 931370 15.74 1105296 115 172360 927684 15.67 1100044 116 172313 925440 15.70 1097753 117 172159 925763 15.68 1097922 118 170483 918803 15.65 1089286 119 170078 917213 15.64 1087291 120 169902 918952 15.60 1088854 121 169473 911327 15.68 1080800 122 168531 907656 15.66 1076187 123 167823 907930 15.60 1075753 124 167124 905751 15.58 1072875 125 167261 901898 15.64 1069159 126 166456 900831 15.60 1067287 127 164986 897474 15.53 1062460 128 165635 893345 15.64 1058980 129 165170 894034 15.59 1059204 130 162317 887402 15.46 1049719 131 162108 884696 15.49 1046804 132 162792 882692 15.57 1045484 133 162033 877606 15.59 1039639 134 160713 874968 15.52 1035681 135 160225 875003 15.48 1035228 136 159419 869861 15.49 1029280 137 158967 866079 15.51 1025046 138 158178 865172 15.46 1023350 139 157552 861194 15.47 1018746 140 156423 856145 15.45 1012568 141 156033 853245 15.46 1009278 142 154410 848045 15.40 1002455 143 153580 846100 15.36 999680 144 153151 843954 15.36 997105 145 152084 840884 15.32 992968 146 151915 837458 15.35 989373 147 151105 839628 15.25 990733 148 150916 834930 15.31 985846 149 148317 825185 15.24 973502 150 143207 822817 14.82 966024 151 126056 735849 14.63 861905 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 5231 1317502 0.40 1322733 2 7568 1461316 0.52 1468884 3 8002 1686234 0.47 1694236 4 7576 1625950 0.46 1633526 5 7598 1576939 0.48 1584537 6 7778 1617135 0.48 1624913 7 8061 1649128 0.49 1657189 8 7890 1598400 0.49 1606290 9 7725 1592520 0.48 1600245 10 8191 1635866 0.50 1644057 11 8303 1615043 0.51 1623346 12 7819 1618907 0.48 1626726 13 7567 1560490 0.48 1568057 14 7685 1563880 0.49 1571565 15 7922 1592610 0.49 1600532 16 8363 1605093 0.52 1613456 17 7938 1579664 0.50 1587602 18 7875 1585255 0.49 1593130 19 7988 1590763 0.50 1598751 20 8122 1597525 0.51 1605647 21 7924 1600664 0.49 1608588 22 7833 1600614 0.49 1608447 23 8091 1608308 0.50 1616399 24 7939 1609856 0.49 1617795 25 8132 1606328 0.50 1614460 26 8043 1608522 0.50 1616565 27 8075 1611732 0.50 1619807 28 7966 1610298 0.49 1618264 29 8081 1613347 0.50 1621428 30 8234 1620505 0.51 1628739 31 8095 1621461 0.50 1629556 32 8123 1619902 0.50 1628025 33 8202 1627706 0.50 1635908 34 7984 1625212 0.49 1633196 35 8023 1627373 0.49 1635396 36 8116 1632537 0.49 1640653 37 7981 1627209 0.49 1635190 38 7995 1630899 0.49 1638894 39 8394 1633864 0.51 1642258 40 7957 1634179 0.48 1642136 41 7989 1636573 0.49 1644562 42 8097 1641610 0.49 1649707 43 7993 1638214 0.49 1646207 44 8129 1637464 0.49 1645593 45 8174 1644989 0.49 1653163 46 8216 1638764 0.50 1646980 47 8224 1640673 0.50 1648897 48 8121 1643556 0.49 1651677 49 8161 1643372 0.49 1651533 50 7990 1643845 0.48 1651835 51 8037 1647995 0.49 1656032 52 8118 1644496 0.49 1652614 53 8198 1642555 0.50 1650753 54 7977 1647545 0.48 1655522 55 8112 1649164 0.49 1657276 56 8160 1647410 0.49 1655570 57 8069 1648546 0.49 1656615 58 7982 1643524 0.48 1651506 59 8105 1646021 0.49 1654126 60 8144 1650632 0.49 1658776 61 8025 1645266 0.49 1653291 62 7989 1645285 0.48 1653274 63 8173 1651753 0.49 1659926 64 8028 1644447 0.49 1652475 65 8060 1645808 0.49 1653868 66 8005 1647110 0.48 1655115 67 8112 1645573 0.49 1653685 68 8165 1644254 0.49 1652419 69 8082 1646945 0.49 1655027 70 8000 1642371 0.48 1650371 71 8100 1642343 0.49 1650443 72 7983 1645875 0.48 1653858 73 8144 1642192 0.49 1650336 74 8089 1638045 0.49 1646134 75 8142 1643440 0.49 1651582 76 8249 1642114 0.50 1650363 77 8210 1639082 0.50 1647292 78 8152 1641544 0.49 1649696 79 8336 1636164 0.51 1644500 80 8172 1634791 0.50 1642963 81 8143 1637204 0.49 1645347 82 8119 1633897 0.49 1642016 83 8080 1629675 0.49 1637755 84 8098 1633856 0.49 1641954 85 8222 1629415 0.50 1637637 86 8005 1628918 0.49 1636923 87 7982 1628620 0.49 1636602 88 8080 1619702 0.50 1627782 89 8042 1618942 0.49 1626984 90 7873 1618537 0.48 1626410 91 7883 1615446 0.49 1623329 92 8019 1611031 0.50 1619050 93 8057 1614006 0.50 1622063 94 7873 1608350 0.49 1616223 95 8013 1604735 0.50 1612748 96 7972 1604725 0.49 1612697 97 7816 1597834 0.49 1605650 98 7980 1595283 0.50 1603263 99 7767 1592844 0.49 1600611 100 7761 1589663 0.49 1597424 101 7800 1584977 0.49 1592777 102 7933 1581607 0.50 1589540 103 7679 1578512 0.48 1586191 104 7836 1576275 0.49 1584111 105 7708 1574896 0.49 1582604 106 7768 1568802 0.49 1576570 107 7722 1560300 0.49 1568022 108 7636 1563165 0.49 1570801 109 7552 1556556 0.48 1564108 110 7703 1552834 0.49 1560537 111 7737 1551846 0.50 1559583 112 7680 1547547 0.49 1555227 113 7520 1539899 0.49 1547419 114 7494 1540095 0.48 1547589 115 7485 1532345 0.49 1539830 116 7624 1527097 0.50 1534721 117 7562 1527701 0.49 1535263 118 7500 1523332 0.49 1530832 119 7454 1515561 0.49 1523015 120 7340 1515683 0.48 1523023 121 7423 1509431 0.49 1516854 122 7170 1507062 0.47 1514232 123 7335 1501578 0.49 1508913 124 7456 1495786 0.50 1503242 125 7288 1490692 0.49 1497980 126 7230 1487639 0.48 1494869 127 7196 1481176 0.48 1488372 128 7168 1476460 0.48 1483628 129 7157 1471983 0.48 1479140 130 7178 1464451 0.49 1471629 131 7196 1460302 0.49 1467498 132 7097 1459586 0.48 1466683 133 7242 1450501 0.50 1457743 134 7206 1444623 0.50 1451829 135 7121 1444224 0.49 1451345 136 7081 1434855 0.49 1441936 137 7223 1429237 0.50 1436460 138 7139 1426296 0.50 1433435 139 7234 1419844 0.51 1427078 140 7214 1410563 0.51 1417777 141 7013 1403897 0.50 1410910 142 7097 1401083 0.50 1408180 143 7200 1395346 0.51 1402546 144 7260 1389085 0.52 1396345 145 7531 1385198 0.54 1392729 146 8042 1383387 0.58 1391429 147 8816 1381181 0.63 1389997 148 8874 1369031 0.64 1377905 149 8765 1361589 0.64 1370354 150 7918 1354331 0.58 1362249 151 6964 1245134 0.56 1252098 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 22355 5794099 0.38 5816454 2 30289 6132757 0.49 6163046 3 34747 6674086 0.52 6708833 4 31052 6538507 0.47 6569559 5 29327 6570141 0.44 6599468 6 29713 6799091 0.44 6828804 7 29684 6777967 0.44 6807651 8 31183 6984629 0.44 7015812 9 30591 6972585 0.44 7003176 10 30326 6943875 0.43 6974201 11 31171 7041244 0.44 7072415 12 30135 6941110 0.43 6971245 13 29013 6712998 0.43 6742011 14 29521 6785622 0.43 6815143 15 29926 6836011 0.44 6865937 16 29678 6883700 0.43 6913378 17 28942 6769712 0.43 6798654 18 29122 6797086 0.43 6826208 19 28844 6802321 0.42 6831165 20 28915 6808597 0.42 6837512 21 28947 6832873 0.42 6861820 22 29281 6831591 0.43 6860872 23 29160 6825297 0.43 6854457 24 29258 6842778 0.43 6872036 25 29125 6829281 0.42 6858406 26 28995 6822431 0.42 6851426 27 29150 6838877 0.42 6868027 28 29480 6825884 0.43 6855364 29 29617 6837002 0.43 6866619 30 29185 6864914 0.42 6894099 31 29585 6859857 0.43 6889442 32 29709 6859239 0.43 6888948 33 29540 6886972 0.43 6916512 34 29271 6868990 0.42 6898261 35 29413 6856840 0.43 6886253 36 29372 6878241 0.43 6907613 37 29347 6866451 0.43 6895798 38 29503 6871326 0.43 6900829 39 30022 6890789 0.43 6920811 40 29482 6875601 0.43 6905083 41 29091 6883201 0.42 6912292 42 29832 6900759 0.43 6930591 43 29587 6892404 0.43 6921991 44 29326 6898926 0.42 6928252 45 29818 6909212 0.43 6939030 46 29584 6893388 0.43 6922972 47 29774 6882273 0.43 6912047 48 29802 6900718 0.43 6930520 49 29690 6881592 0.43 6911282 50 29256 6883732 0.42 6912988 51 29314 6898584 0.42 6927898 52 29290 6887470 0.42 6916760 53 29313 6885797 0.42 6915110 54 29567 6906519 0.43 6936086 55 29214 6900241 0.42 6929455 56 29444 6898695 0.42 6928139 57 29239 6906245 0.42 6935484 58 28969 6892371 0.42 6921340 59 29533 6888513 0.43 6918046 60 29323 6902855 0.42 6932178 61 29106 6882644 0.42 6911750 62 29123 6882555 0.42 6911678 63 29273 6887248 0.42 6916521 64 29490 6882152 0.43 6911642 65 29320 6870935 0.42 6900255 66 29285 6891562 0.42 6920847 67 29025 6882051 0.42 6911076 68 29036 6874757 0.42 6903793 69 29197 6881813 0.42 6911010 70 29149 6863449 0.42 6892598 71 29546 6867317 0.43 6896863 72 29199 6876842 0.42 6906041 73 29284 6855810 0.43 6885094 74 29288 6844566 0.43 6873854 75 29350 6857116 0.43 6886466 76 29243 6845011 0.43 6874254 77 29204 6839944 0.43 6869148 78 28944 6839342 0.42 6868286 79 29046 6816928 0.42 6845974 80 28750 6806158 0.42 6834908 81 28704 6812712 0.42 6841416 82 28932 6800991 0.42 6829923 83 28606 6786114 0.42 6814720 84 28780 6793317 0.42 6822097 85 28890 6774543 0.42 6803433 86 28409 6762611 0.42 6791020 87 28542 6767145 0.42 6795687 88 28635 6750241 0.42 6778876 89 28767 6735620 0.43 6764387 90 28777 6737494 0.43 6766271 91 28469 6725325 0.42 6753794 92 28027 6705832 0.42 6733859 93 28476 6710568 0.42 6739044 94 28287 6690688 0.42 6718975 95 28019 6672428 0.42 6700447 96 27996 6668045 0.42 6696041 97 28036 6648014 0.42 6676050 98 27792 6639310 0.42 6667102 99 27979 6639185 0.42 6667164 100 27897 6614267 0.42 6642164 101 27809 6595785 0.42 6623594 102 27781 6609563 0.42 6637344 103 27543 6581766 0.42 6609309 104 27715 6568020 0.42 6595735 105 27706 6565196 0.42 6592902 106 27713 6540312 0.42 6568025 107 27506 6522391 0.42 6549897 108 27542 6522452 0.42 6549994 109 27092 6496445 0.42 6523537 110 27441 6480515 0.42 6507956 111 27522 6472858 0.42 6500380 112 27580 6452492 0.43 6480072 113 27274 6429767 0.42 6457041 114 27030 6423304 0.42 6450334 115 27188 6396616 0.42 6423804 116 26890 6386220 0.42 6413110 117 26811 6380604 0.42 6407415 118 26506 6356360 0.42 6382866 119 26786 6334748 0.42 6361534 120 26706 6325285 0.42 6351991 121 26569 6295648 0.42 6322217 122 26260 6274603 0.42 6300863 123 26568 6273166 0.42 6299734 124 26272 6240883 0.42 6267155 125 26341 6219014 0.42 6245355 126 26348 6214057 0.42 6240405 127 26268 6187796 0.42 6214064 128 26216 6166300 0.42 6192516 129 25783 6154486 0.42 6180269 130 25714 6123790 0.42 6149504 131 25925 6102569 0.42 6128494 132 26060 6094276 0.43 6120336 133 25956 6066305 0.43 6092261 134 25956 6041853 0.43 6067809 135 26063 6022177 0.43 6048240 136 26004 5992326 0.43 6018330 137 26025 5972344 0.43 5998369 138 26234 5964120 0.44 5990354 139 25888 5932678 0.43 5958566 140 25768 5907752 0.43 5933520 141 25856 5892974 0.44 5918830 142 26114 5864747 0.44 5890861 143 26343 5840725 0.45 5867068 144 26648 5830607 0.45 5857255 145 27480 5805358 0.47 5832838 146 28482 5797200 0.49 5825682 147 29975 5787137 0.52 5817112 148 31145 5772470 0.54 5803615 149 30486 5729815 0.53 5760301 150 29244 5677068 0.51 5706312 151 24409 5329781 0.46 5354190 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9237 1609976 0.57 1619213 2 44706 861639 4.93 906345 3 87816 656723 11.79 744539 4 114414 800481 12.51 914895 5 120932 828199 12.74 949131 6 121938 800817 13.21 922755 7 125598 805897 13.48 931495 8 124454 782424 13.72 906878 9 134179 821079 14.05 955258 10 132320 766189 14.73 898509 11 131183 792420 14.20 923603 12 140464 801994 14.90 942458 13 133908 752713 15.10 886621 14 127160 740816 14.65 867976 15 128654 742040 14.78 870694 16 129343 728549 15.08 857892 17 133984 741906 15.30 875890 18 131889 729215 15.32 861104 19 131952 729042 15.33 860994 20 131846 727274 15.35 859120 21 132836 726241 15.46 859077 22 132512 728634 15.39 861146 23 131900 721194 15.46 853094 24 132427 718004 15.57 850431 25 131960 719126 15.50 851086 26 130888 713924 15.49 844812 27 130600 706571 15.60 837171 28 131266 708796 15.63 840062 29 130244 704364 15.61 834608 30 128968 702591 15.51 831559 31 130654 700209 15.73 830863 32 129376 697802 15.64 827178 33 127939 691690 15.61 819629 34 128417 691290 15.67 819707 35 127551 684902 15.70 812453 36 127504 680586 15.78 808090 37 127764 680745 15.80 808509 38 127111 678636 15.78 805747 39 125794 670017 15.81 795811 40 125630 671372 15.76 797002 41 124768 669125 15.72 793893 42 124712 661105 15.87 785817 43 124813 664832 15.81 789645 44 123799 660015 15.79 783814 45 123113 652981 15.86 776094 46 122710 652770 15.82 775480 47 121619 647467 15.81 769086 48 121014 642236 15.86 763250 49 120921 641543 15.86 762464 50 120331 636830 15.89 757161 51 119923 633750 15.91 753673 52 119460 629797 15.94 749257 53 118653 628968 15.87 747621 54 117784 624549 15.87 742333 55 118249 621306 15.99 739555 56 116474 617554 15.87 734028 57 116195 612109 15.95 728304 58 115547 611279 15.90 726826 59 114714 606800 15.90 721514 60 114367 601245 15.98 715612 61 114316 600973 15.98 715289 62 113122 595095 15.97 708217 63 112884 591247 16.03 704131 64 112099 590602 15.95 702701 65 111812 585683 16.03 697495 66 110541 581169 15.98 691710 67 110583 580193 16.01 690776 68 109500 573136 16.04 682636 69 108880 571071 16.01 679951 70 107850 568097 15.96 675947 71 107523 562492 16.05 670015 72 107033 557745 16.10 664778 73 106565 556240 16.08 662805 74 105806 552205 16.08 658011 75 105086 549982 16.04 655068 76 104237 546068 16.03 650305 77 104189 541707 16.13 645896 78 102935 537704 16.07 640639 79 102351 535319 16.05 637670 80 101527 531491 16.04 633018 81 100571 527533 16.01 628104 82 100437 526796 16.01 627233 83 99718 520431 16.08 620149 84 98962 517555 16.05 616517 85 98890 516489 16.07 615379 86 98213 510118 16.14 608331 87 97344 508525 16.07 605869 88 96866 505112 16.09 601978 89 96230 501271 16.11 597501 90 94634 494796 16.06 589430 91 94205 495429 15.98 589634 92 93481 488145 16.07 581626 93 93594 484963 16.18 578557 94 93219 484477 16.14 577696 95 91920 479619 16.08 571539 96 91294 476083 16.09 567377 97 90631 471486 16.12 562117 98 90176 469513 16.11 559689 99 89202 463513 16.14 552715 100 88288 464614 15.97 552902 101 87486 458293 16.03 545779 102 87532 454382 16.15 541914 103 86833 451121 16.14 537954 104 86156 447396 16.15 533552 105 85116 444763 16.06 529879 106 85070 442255 16.13 527325 107 84433 438596 16.14 523029 108 82995 433746 16.06 516741 109 82906 432231 16.09 515137 110 81630 427481 16.03 509111 111 81006 423829 16.05 504835 112 80795 420770 16.11 501565 113 80127 417444 16.10 497571 114 79319 414815 16.05 494134 115 78650 413177 15.99 491827 116 78255 409062 16.06 487317 117 77247 404398 16.04 481645 118 77096 401759 16.10 478855 119 76195 397819 16.07 474014 120 75938 395227 16.12 471165 121 74322 392327 15.93 466649 122 74307 388203 16.07 462510 123 73694 384771 16.07 458465 124 73107 383047 16.03 456154 125 72641 378127 16.11 450768 126 72246 375385 16.14 447631 127 71260 373497 16.02 444757 128 71048 370357 16.10 441405 129 70219 367605 16.04 437824 130 69680 364944 16.03 434624 131 68974 360905 16.04 429879 132 67892 356901 15.98 424793 133 66907 355459 15.84 422366 134 66448 350624 15.93 417072 135 66118 348484 15.95 414602 136 65650 346302 15.94 411952 137 65271 343003 15.99 408274 138 64244 339610 15.91 403854 139 64024 336937 15.97 400961 140 63481 334424 15.95 397905 141 63013 330260 16.02 393273 142 62165 327105 15.97 389270 143 61646 323067 16.02 384713 144 60155 320786 15.79 380941 145 60328 319356 15.89 379684 146 59969 314560 16.01 374529 147 59055 311228 15.95 370283 148 58418 309465 15.88 367883 149 57170 301279 15.95 358449 150 55024 266168 17.13 321192 151 45116 0 100.00 45116 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3094 1177370 0.26 1180464 2 6707 1828325 0.37 1835032 3 6901 1223997 0.56 1230898 4 9923 1139366 0.86 1149289 5 5901 1345310 0.44 1351211 6 5255 1335294 0.39 1340549 7 5287 1261761 0.42 1267048 8 5547 1281314 0.43 1286861 9 5800 1304376 0.44 1310176 10 5489 1249921 0.44 1255410 11 5270 1230119 0.43 1235389 12 5524 1263751 0.44 1269275 13 5559 1242130 0.45 1247689 14 5144 1241697 0.41 1246841 15 5127 1187739 0.43 1192866 16 5195 1181161 0.44 1186356 17 5255 1194350 0.44 1199605 18 5465 1211174 0.45 1216639 19 5258 1181449 0.44 1186707 20 5267 1182208 0.44 1187475 21 5183 1178592 0.44 1183775 22 5374 1176161 0.45 1181535 23 5356 1174489 0.45 1179845 24 5399 1171844 0.46 1177243 25 5251 1168812 0.45 1174063 26 5451 1165551 0.47 1171002 27 5127 1158180 0.44 1163307 28 5212 1151503 0.45 1156715 29 5196 1152600 0.45 1157796 30 5281 1145507 0.46 1150788 31 5169 1139943 0.45 1145112 32 5307 1138930 0.46 1144237 33 5053 1134508 0.44 1139561 34 5227 1124513 0.46 1129740 35 5286 1120886 0.47 1126172 36 5154 1120195 0.46 1125349 37 5022 1112741 0.45 1117763 38 4966 1111027 0.44 1115993 39 4965 1104281 0.45 1109246 40 5141 1094877 0.47 1100018 41 5076 1096713 0.46 1101789 42 5074 1087535 0.46 1092609 43 4963 1080807 0.46 1085770 44 4963 1080065 0.46 1085028 45 4992 1074513 0.46 1079505 46 4983 1066377 0.47 1071360 47 4944 1066845 0.46 1071789 48 4816 1055587 0.45 1060403 49 4797 1050795 0.45 1055592 50 4918 1047938 0.47 1052856 51 4896 1042010 0.47 1046906 52 4839 1034702 0.47 1039541 53 4853 1029766 0.47 1034619 54 4710 1024332 0.46 1029042 55 4622 1017974 0.45 1022596 56 4721 1016232 0.46 1020953 57 4675 1008986 0.46 1013661 58 4689 1003736 0.46 1008425 59 4539 996720 0.45 1001259 60 4568 991012 0.46 995580 61 4560 982209 0.46 986769 62 4688 979345 0.48 984033 63 4513 975413 0.46 979926 64 4453 964733 0.46 969186 65 4476 963817 0.46 968293 66 4408 957997 0.46 962405 67 4420 950482 0.46 954902 68 4416 948229 0.46 952645 69 4466 939693 0.47 944159 70 4390 934550 0.47 938940 71 4298 930689 0.46 934987 72 4330 924287 0.47 928617 73 4263 915013 0.46 919276 74 4218 913732 0.46 917950 75 4349 908747 0.48 913096 76 4125 900672 0.46 904797 77 4088 896319 0.45 900407 78 4176 889484 0.47 893660 79 4110 882500 0.46 886610 80 4069 880071 0.46 884140 81 4150 874142 0.47 878292 82 4122 866473 0.47 870595 83 4047 862732 0.47 866779 84 3967 855905 0.46 859872 85 4059 850374 0.48 854433 86 3840 845920 0.45 849760 87 3909 837451 0.46 841360 88 3884 833173 0.46 837057 89 3696 828386 0.44 832082 90 3820 821459 0.46 825279 91 3663 814865 0.45 818528 92 3833 812370 0.47 816203 93 3759 804882 0.46 808641 94 3692 796540 0.46 800232 95 3724 792974 0.47 796698 96 3636 788365 0.46 792001 97 3632 781600 0.46 785232 98 3556 777533 0.46 781089 99 3486 772783 0.45 776269 100 3485 761589 0.46 765074 101 3553 759814 0.47 763367 102 3529 752953 0.47 756482 103 3322 745563 0.44 748885 104 3491 741152 0.47 744643 105 3287 737051 0.44 740338 106 3334 729752 0.45 733086 107 3302 727699 0.45 731001 108 3298 717390 0.46 720688 109 3356 712691 0.47 716047 110 3220 709536 0.45 712756 111 3308 702772 0.47 706080 112 3149 697145 0.45 700294 113 3251 692269 0.47 695520 114 3156 687855 0.46 691011 115 3176 679833 0.47 683009 116 3152 675709 0.46 678861 117 3074 669740 0.46 672814 118 3067 664118 0.46 667185 119 3064 658468 0.46 661532 120 3000 655235 0.46 658235 121 3019 649228 0.46 652247 122 2992 645484 0.46 648476 123 2919 638253 0.46 641172 124 2993 632331 0.47 635324 125 2887 628399 0.46 631286 126 2902 622242 0.46 625144 127 2913 617727 0.47 620640 128 2820 613148 0.46 615968 129 2818 606898 0.46 609716 130 2813 601596 0.47 604409 131 2797 594418 0.47 597215 132 2741 591834 0.46 594575 133 2772 584917 0.47 587689 134 2716 580775 0.47 583491 135 2718 575806 0.47 578524 136 2717 570178 0.47 572895 137 2740 565939 0.48 568679 138 2688 560135 0.48 562823 139 2657 554502 0.48 557159 140 2665 549505 0.48 552170 141 2502 544284 0.46 546786 142 2640 539456 0.49 542096 143 2652 534830 0.49 537482 144 2616 528826 0.49 531442 145 2462 523491 0.47 525953 146 2514 519667 0.48 522181 147 2442 513936 0.47 516378 148 2519 507343 0.49 509862 149 2402 497922 0.48 500324 150 2332 448508 0.52 450840 151 1520 0 100.00 1520 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 14046 5458911 0.26 5472957 2 17803 5333863 0.33 5351666 3 21059 5401452 0.39 5422511 4 22521 5801379 0.39 5823900 5 20937 5793219 0.36 5814156 6 20211 5795200 0.35 5815411 7 20177 5705347 0.35 5725524 8 20058 5550575 0.36 5570633 9 20680 5613678 0.37 5634358 10 19675 5290153 0.37 5309828 11 19554 5268902 0.37 5288456 12 20003 5249471 0.38 5269474 13 19340 5090301 0.38 5109641 14 19369 5157735 0.37 5177104 15 19738 5121273 0.38 5141011 16 19124 5020526 0.38 5039650 17 19785 5038778 0.39 5058563 18 19392 5042569 0.38 5061961 19 20201 5062838 0.40 5083039 20 19855 5036956 0.39 5056811 21 19999 5025813 0.40 5045812 22 19680 5012730 0.39 5032410 23 19663 4975936 0.39 4995599 24 19535 4954566 0.39 4974101 25 19778 4946194 0.40 4965972 26 19955 4916004 0.40 4935959 27 20332 4897457 0.41 4917789 28 19572 4884895 0.40 4904467 29 19704 4859465 0.40 4879169 30 19582 4847942 0.40 4867524 31 19605 4830117 0.40 4849722 32 19525 4803146 0.40 4822671 33 19168 4772392 0.40 4791560 34 19333 4757378 0.40 4776711 35 19470 4728637 0.41 4748107 36 19353 4703700 0.41 4723053 37 19293 4693884 0.41 4713177 38 19015 4663809 0.41 4682824 39 18829 4640387 0.40 4659216 40 18900 4629026 0.41 4647926 41 19046 4595737 0.41 4614783 42 18711 4573663 0.41 4592374 43 18645 4551885 0.41 4570530 44 18609 4523766 0.41 4542375 45 18535 4496641 0.41 4515176 46 18528 4473295 0.41 4491823 47 18572 4455939 0.42 4474511 48 18478 4430641 0.42 4449119 49 17991 4415346 0.41 4433337 50 18031 4386388 0.41 4404419 51 17942 4361898 0.41 4379840 52 17933 4341299 0.41 4359232 53 17858 4311113 0.41 4328971 54 17475 4290900 0.41 4308375 55 17475 4274759 0.41 4292234 56 17462 4242659 0.41 4260121 57 17340 4212736 0.41 4230076 58 17302 4201284 0.41 4218586 59 17103 4162641 0.41 4179744 60 17047 4136122 0.41 4153169 61 17075 4121602 0.41 4138677 62 17040 4090855 0.41 4107895 63 16790 4070060 0.41 4086850 64 16471 4045803 0.41 4062274 65 16497 4019456 0.41 4035953 66 16278 4000492 0.41 4016770 67 16352 3976595 0.41 3992947 68 16349 3947744 0.41 3964093 69 16163 3926439 0.41 3942602 70 16070 3898083 0.41 3914153 71 16035 3873620 0.41 3889655 72 15702 3848931 0.41 3864633 73 15648 3829428 0.41 3845076 74 15472 3804484 0.41 3819956 75 15341 3773642 0.40 3788983 76 15163 3755887 0.40 3771050 77 15090 3728069 0.40 3743159 78 15352 3701231 0.41 3716583 79 14971 3683040 0.40 3698011 80 14709 3661990 0.40 3676699 81 14665 3636606 0.40 3651271 82 14552 3618239 0.40 3632791 83 14650 3592030 0.41 3606680 84 14321 3570323 0.40 3584644 85 14392 3549285 0.40 3563677 86 14276 3519654 0.40 3533930 87 14165 3492330 0.40 3506495 88 13883 3473618 0.40 3487501 89 13987 3447402 0.40 3461389 90 13889 3426289 0.40 3440178 91 13763 3405304 0.40 3419067 92 13678 3381216 0.40 3394894 93 13472 3360644 0.40 3374116 94 13156 3340155 0.39 3353311 95 13053 3313325 0.39 3326378 96 12986 3290660 0.39 3303646 97 12738 3268660 0.39 3281398 98 12768 3240781 0.39 3253549 99 12913 3220441 0.40 3233354 100 12560 3197819 0.39 3210379 101 12631 3171729 0.40 3184360 102 12574 3149475 0.40 3162049 103 12242 3127531 0.39 3139773 104 12221 3103248 0.39 3115469 105 12031 3079877 0.39 3091908 106 11863 3061747 0.39 3073610 107 11813 3034211 0.39 3046024 108 11918 3012669 0.39 3024587 109 11759 2988274 0.39 3000033 110 11598 2965453 0.39 2977051 111 11488 2944484 0.39 2955972 112 11711 2923612 0.40 2935323 113 11377 2902673 0.39 2914050 114 11303 2880651 0.39 2891954 115 11073 2859962 0.39 2871035 116 11165 2840135 0.39 2851300 117 11002 2815923 0.39 2826925 118 11105 2791590 0.40 2802695 119 11124 2765996 0.40 2777120 120 10819 2742414 0.39 2753233 121 10719 2721984 0.39 2732703 122 10597 2698168 0.39 2708765 123 10578 2674711 0.39 2685289 124 10432 2657124 0.39 2667556 125 10425 2636083 0.39 2646508 126 10352 2616381 0.39 2626733 127 10087 2595931 0.39 2606018 128 9992 2573391 0.39 2583383 129 10102 2549433 0.39 2559535 130 10217 2531162 0.40 2541379 131 10196 2507262 0.41 2517458 132 10067 2483701 0.40 2493768 133 9978 2464392 0.40 2474370 134 9753 2440177 0.40 2449930 135 9666 2421625 0.40 2431291 136 9523 2406672 0.39 2416195 137 9824 2380935 0.41 2390759 138 9700 2361964 0.41 2371664 139 9577 2341146 0.41 2350723 140 9405 2321497 0.40 2330902 141 9372 2297679 0.41 2307051 142 9434 2278043 0.41 2287477 143 9288 2255403 0.41 2264691 144 9368 2234979 0.42 2244347 145 9338 2215325 0.42 2224663 146 9261 2191709 0.42 2200970 147 9399 2171802 0.43 2181201 148 9180 2143988 0.43 2153168 149 9085 2104516 0.43 2113601 150 8700 1901003 0.46 1909703 151 5710 0 100.00 5710