CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 73401 299519 19.68 372920 2 72938 292704 19.95 365642 3 72933 293161 19.92 366094 4 72454 294959 19.72 367413 5 71925 294785 19.61 366710 6 72311 297774 19.54 370085 7 73359 297260 19.79 370619 8 74067 305093 19.53 379160 9 74068 304633 19.56 378701 10 73598 304210 19.48 377808 11 73942 303478 19.59 377420 12 73694 301936 19.62 375630 13 74344 299797 19.87 374141 14 74696 301533 19.85 376229 15 73969 298554 19.86 372523 16 73615 296698 19.88 370313 17 74568 299610 19.93 374178 18 74271 300587 19.81 374858 19 74265 302200 19.73 376465 20 74916 301626 19.90 376542 21 74085 301856 19.71 375941 22 73990 299463 19.81 373453 23 73850 300206 19.74 374056 24 74297 297709 19.97 372006 25 73827 299534 19.77 373361 26 74350 299567 19.88 373917 27 73794 300658 19.71 374452 28 73945 300471 19.75 374416 29 74208 299866 19.84 374074 30 73647 299103 19.76 372750 31 73879 299693 19.78 373572 32 74122 303643 19.62 377765 33 74678 301388 19.86 376066 34 74382 301529 19.79 375911 35 73953 300101 19.77 374054 36 74484 298593 19.96 373077 37 74193 300089 19.82 374282 38 73629 302588 19.57 376217 39 73921 301162 19.71 375083 40 74229 299964 19.84 374193 41 73987 298584 19.86 372571 42 74557 298363 19.99 372920 43 73879 298893 19.82 372772 44 74452 300091 19.88 374543 45 73641 299254 19.75 372895 46 73725 298548 19.80 372273 47 73573 298696 19.76 372269 48 73830 298893 19.81 372723 49 73453 297605 19.80 371058 50 73990 299845 19.79 373835 51 73381 297175 19.80 370556 52 73971 298135 19.88 372106 53 74066 299113 19.85 373179 54 74003 298011 19.89 372014 55 74350 297472 20.00 371822 56 73890 297743 19.88 371633 57 73860 298050 19.86 371910 58 74432 298199 19.97 372631 59 73982 297916 19.89 371898 60 74103 295407 20.05 369510 61 74042 296840 19.96 370882 62 74007 298509 19.87 372516 63 73676 295211 19.97 368887 64 73767 296158 19.94 369925 65 73936 294821 20.05 368757 66 73940 297197 19.92 371137 67 73512 296448 19.87 369960 68 74044 297801 19.91 371845 69 74802 297693 20.08 372495 70 74695 297782 20.05 372477 71 74070 295532 20.04 369602 72 74357 294977 20.13 369334 73 73367 294882 19.92 368249 74 74071 295866 20.02 369937 75 74121 293841 20.14 367962 76 73929 294378 20.07 368307 77 74052 293657 20.14 367709 78 74072 294473 20.10 368545 79 74095 293643 20.15 367738 80 73857 293979 20.08 367836 81 73887 295176 20.02 369063 82 73663 295715 19.94 369378 83 73874 295400 20.01 369274 84 74059 293671 20.14 367730 85 73757 294731 20.02 368488 86 74042 294750 20.08 368792 87 73508 293263 20.04 366771 88 73594 294799 19.98 368393 89 73903 294717 20.05 368620 90 74106 293822 20.14 367928 91 73664 293007 20.09 366671 92 74139 292673 20.21 366812 93 73914 292922 20.15 366836 94 73314 292606 20.04 365920 95 74008 294848 20.06 368856 96 73835 292121 20.18 365956 97 74159 292239 20.24 366398 98 73859 293017 20.13 366876 99 74229 291274 20.31 365503 100 74010 291893 20.23 365903 101 73835 291846 20.19 365681 102 73979 290328 20.31 364307 103 73823 291081 20.23 364904 104 73749 289696 20.29 363445 105 73951 289855 20.33 363806 106 73865 289960 20.30 363825 107 74226 291393 20.30 365619 108 73932 289416 20.35 363348 109 74203 289376 20.41 363579 110 74199 290488 20.35 364687 111 74244 288578 20.46 362822 112 74476 290002 20.43 364478 113 73951 288072 20.43 362023 114 73950 287613 20.45 361563 115 74396 287022 20.58 361418 116 74169 288619 20.44 362788 117 73952 287203 20.48 361155 118 73897 287141 20.47 361038 119 74670 285109 20.75 359779 120 74100 285397 20.61 359497 121 74327 284100 20.74 358427 122 74676 284137 20.81 358813 123 74166 283605 20.73 357771 124 74770 283054 20.90 357824 125 73990 283300 20.71 357290 126 74497 282515 20.87 357012 127 74186 281081 20.88 355267 128 74285 281216 20.90 355501 129 74606 281047 20.98 355653 130 74210 279145 21.00 353355 131 73762 278495 20.94 352257 132 74130 277788 21.06 351918 133 74103 277530 21.07 351633 134 73982 277249 21.06 351231 135 73523 276713 20.99 350236 136 73879 275968 21.12 349847 137 73807 276123 21.09 349930 138 73084 275642 20.96 348726 139 73570 273919 21.17 347489 140 73811 274390 21.20 348201 141 77671 275303 22.00 352974 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1906 515709 0.37 517615 2 1450 517210 0.28 518660 3 1422 510404 0.28 511826 4 1463 511892 0.28 513355 5 1374 514443 0.27 515817 6 1315 514420 0.25 515735 7 1369 522679 0.26 524048 8 1404 520689 0.27 522093 9 1389 522059 0.27 523448 10 1441 523832 0.27 525273 11 1416 522598 0.27 524014 12 1407 524034 0.27 525441 13 1435 525203 0.27 526638 14 1360 518635 0.26 519995 15 1324 516388 0.26 517712 16 1500 517414 0.29 518914 17 1467 524075 0.28 525542 18 1404 522333 0.27 523737 19 1482 526597 0.28 528079 20 1425 527206 0.27 528631 21 1413 522727 0.27 524140 22 1410 516977 0.27 518387 23 1491 521745 0.28 523236 24 1517 523650 0.29 525167 25 1508 521909 0.29 523417 26 1409 522323 0.27 523732 27 1419 520836 0.27 522255 28 1469 522991 0.28 524460 29 1450 519960 0.28 521410 30 1510 521891 0.29 523401 31 1475 522873 0.28 524348 32 1501 525935 0.28 527436 33 1444 518355 0.28 519799 34 1490 522735 0.28 524225 35 1485 520034 0.28 521519 36 1494 520894 0.29 522388 37 1447 521427 0.28 522874 38 1496 519019 0.29 520515 39 1452 517847 0.28 519299 40 1496 518883 0.29 520379 41 1474 521318 0.28 522792 42 1518 522130 0.29 523648 43 1491 519639 0.29 521130 44 1513 517741 0.29 519254 45 1512 517433 0.29 518945 46 1621 524309 0.31 525930 47 1613 518218 0.31 519831 48 1633 523325 0.31 524958 49 1721 518423 0.33 520144 50 1801 518053 0.35 519854 51 1829 517204 0.35 519033 52 1861 520630 0.36 522491 53 1966 522496 0.37 524462 54 1845 520433 0.35 522278 55 1915 515594 0.37 517509 56 1943 517388 0.37 519331 57 1963 516826 0.38 518789 58 2065 516919 0.40 518984 59 1924 516525 0.37 518449 60 2000 516517 0.39 518517 61 1999 515824 0.39 517823 62 2019 516236 0.39 518255 63 2041 518129 0.39 520170 64 2104 517023 0.41 519127 65 2052 519122 0.39 521174 66 2223 516333 0.43 518556 67 2187 516287 0.42 518474 68 2312 519119 0.44 521431 69 2059 517404 0.40 519463 70 2162 515252 0.42 517414 71 2196 516691 0.42 518887 72 2085 513416 0.40 515501 73 2197 512648 0.43 514845 74 2308 515991 0.45 518299 75 2229 517214 0.43 519443 76 2338 514824 0.45 517162 77 2399 516402 0.46 518801 78 2371 514734 0.46 517105 79 2438 513421 0.47 515859 80 2464 514333 0.48 516797 81 2478 514912 0.48 517390 82 2498 514975 0.48 517473 83 2523 514283 0.49 516806 84 2518 513273 0.49 515791 85 2658 514328 0.51 516986 86 2714 513857 0.53 516571 87 2775 509844 0.54 512619 88 2754 513561 0.53 516315 89 2869 512453 0.56 515322 90 2860 511501 0.56 514361 91 2982 510164 0.58 513146 92 3037 514699 0.59 517736 93 3081 511125 0.60 514206 94 3145 512872 0.61 516017 95 3329 510868 0.65 514197 96 3321 510769 0.65 514090 97 3524 508801 0.69 512325 98 3475 510435 0.68 513910 99 3653 507455 0.71 511108 100 3738 506500 0.73 510238 101 3752 506760 0.73 510512 102 3858 509111 0.75 512969 103 3819 505309 0.75 509128 104 4133 506232 0.81 510365 105 4233 505726 0.83 509959 106 4348 508987 0.85 513335 107 4400 506009 0.86 510409 108 4736 503353 0.93 508089 109 4577 504069 0.90 508646 110 4785 505653 0.94 510438 111 5087 504414 1.00 509501 112 5207 503906 1.02 509113 113 5295 499730 1.05 505025 114 5665 502330 1.12 507995 115 5719 501361 1.13 507080 116 5969 500170 1.18 506139 117 6064 499885 1.20 505949 118 6272 498755 1.24 505027 119 6415 497153 1.27 503568 120 6619 495745 1.32 502364 121 6750 493598 1.35 500348 122 6989 494614 1.39 501603 123 7358 492106 1.47 499464 124 7446 491994 1.49 499440 125 7634 492369 1.53 500003 126 7871 490010 1.58 497881 127 7991 488148 1.61 496139 128 8227 486772 1.66 494999 129 8519 484670 1.73 493189 130 8752 483805 1.78 492557 131 8743 483146 1.78 491889 132 9219 482044 1.88 491263 133 9359 482617 1.90 491976 134 9536 483029 1.94 492565 135 9859 480459 2.01 490318 136 9905 479238 2.02 489143 137 10647 476693 2.18 487340 138 10732 476009 2.20 486741 139 11167 475278 2.30 486445 140 16284 480566 3.28 496850 141 16310 475735 3.31 492045 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 6834 2164459 0.31 2171293 2 5900 2161813 0.27 2167713 3 5809 2154312 0.27 2160121 4 5744 2154260 0.27 2160004 5 6080 2142810 0.28 2148890 6 5830 2137104 0.27 2142934 7 5830 2145295 0.27 2151125 8 5838 2160806 0.27 2166644 9 6035 2154470 0.28 2160505 10 6053 2154325 0.28 2160378 11 5982 2158411 0.28 2164393 12 5903 2138997 0.28 2144900 13 5910 2131834 0.28 2137744 14 5942 2129355 0.28 2135297 15 5798 2133478 0.27 2139276 16 6087 2139565 0.28 2145652 17 5977 2143764 0.28 2149741 18 6130 2146390 0.28 2152520 19 6085 2147830 0.28 2153915 20 5922 2155833 0.27 2161755 21 6054 2145274 0.28 2151328 22 6165 2147721 0.29 2153886 23 6112 2153922 0.28 2160034 24 6119 2141877 0.28 2147996 25 6050 2138333 0.28 2144383 26 6179 2143009 0.29 2149188 27 6058 2141572 0.28 2147630 28 6089 2142730 0.28 2148819 29 6053 2145543 0.28 2151596 30 6089 2151452 0.28 2157541 31 6003 2149865 0.28 2155868 32 6268 2154588 0.29 2160856 33 6112 2138056 0.29 2144168 34 6164 2139299 0.29 2145463 35 6051 2135539 0.28 2141590 36 6212 2143934 0.29 2150146 37 6123 2145243 0.28 2151366 38 6225 2150222 0.29 2156447 39 6087 2142485 0.28 2148572 40 6180 2138858 0.29 2145038 41 6219 2139608 0.29 2145827 42 6331 2133635 0.30 2139966 43 6240 2137775 0.29 2144015 44 6628 2147281 0.31 2153909 45 6812 2138102 0.32 2144914 46 6893 2144992 0.32 2151885 47 7096 2137060 0.33 2144156 48 7445 2143407 0.35 2150852 49 7637 2136725 0.36 2144362 50 8013 2143521 0.37 2151534 51 8235 2135038 0.38 2143273 52 8072 2139996 0.38 2148068 53 8289 2140413 0.39 2148702 54 8235 2137489 0.38 2145724 55 8143 2130931 0.38 2139074 56 8427 2137433 0.39 2145860 57 8393 2133508 0.39 2141901 58 8703 2133397 0.41 2142100 59 8527 2135254 0.40 2143781 60 8613 2137803 0.40 2146416 61 8747 2129539 0.41 2138286 62 8817 2136316 0.41 2145133 63 8914 2126283 0.42 2135197 64 9159 2128979 0.43 2138138 65 9129 2126688 0.43 2135817 66 9480 2131754 0.44 2141234 67 9586 2131942 0.45 2141528 68 9485 2135368 0.44 2144853 69 9357 2125383 0.44 2134740 70 9645 2123290 0.45 2132935 71 9697 2125735 0.45 2135432 72 9686 2124705 0.45 2134391 73 9835 2119791 0.46 2129626 74 10351 2137034 0.48 2147385 75 10089 2125299 0.47 2135388 76 10176 2121293 0.48 2131469 77 10561 2119243 0.50 2129804 78 10578 2120456 0.50 2131034 79 10646 2117805 0.50 2128451 80 10823 2123900 0.51 2134723 81 10999 2113381 0.52 2124380 82 11100 2116453 0.52 2127553 83 11101 2114755 0.52 2125856 84 11485 2110361 0.54 2121846 85 11800 2112815 0.56 2124615 86 11965 2119596 0.56 2131561 87 12298 2110137 0.58 2122435 88 12381 2112423 0.58 2124804 89 12743 2112523 0.60 2125266 90 12898 2110986 0.61 2123884 91 13366 2105576 0.63 2118942 92 13897 2113844 0.65 2127741 93 13718 2104196 0.65 2117914 94 14616 2107135 0.69 2121751 95 14777 2110037 0.70 2124814 96 15310 2100387 0.72 2115697 97 15528 2099451 0.73 2114979 98 15980 2103916 0.75 2119896 99 16365 2098311 0.77 2114676 100 16896 2103503 0.80 2120399 101 17580 2100898 0.83 2118478 102 17778 2102010 0.84 2119788 103 18461 2095351 0.87 2113812 104 18995 2096956 0.90 2115951 105 19298 2092188 0.91 2111486 106 19926 2089867 0.94 2109793 107 20552 2086847 0.98 2107399 108 21203 2080799 1.01 2102002 109 22164 2079555 1.05 2101719 110 22715 2088191 1.08 2110906 111 23422 2076548 1.12 2099970 112 24164 2071508 1.15 2095672 113 24958 2074104 1.19 2099062 114 25799 2067294 1.23 2093093 115 26511 2063355 1.27 2089866 116 27055 2067273 1.29 2094328 117 27896 2055328 1.34 2083224 118 29128 2056857 1.40 2085985 119 29799 2050343 1.43 2080142 120 30277 2048731 1.46 2079008 121 31520 2042394 1.52 2073914 122 32379 2044242 1.56 2076621 123 33324 2038839 1.61 2072163 124 34243 2034788 1.66 2069031 125 35028 2033774 1.69 2068802 126 36177 2026758 1.75 2062935 127 37050 2020994 1.80 2058044 128 37987 2019212 1.85 2057199 129 38774 2010259 1.89 2049033 130 39752 2008709 1.94 2048461 131 40810 1999884 2.00 2040694 132 41742 1999234 2.05 2040976 133 43143 1990802 2.12 2033945 134 43385 1990741 2.13 2034126 135 44910 1981300 2.22 2026210 136 46736 1980037 2.31 2026773 137 47798 1979186 2.36 2026984 138 51949 1976717 2.56 2028666 139 52720 1969069 2.61 2021789 140 51699 1963557 2.57 2015256 141 55529 1952080 2.77 2007609 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 68641 262485 20.73 331126 2 68321 261392 20.72 329713 3 67273 258678 20.64 325951 4 66666 256859 20.61 323525 5 66684 256804 20.61 323488 6 66781 256212 20.68 322993 7 66045 254796 20.58 320841 8 65535 254403 20.48 319938 9 65746 252967 20.63 318713 10 65303 251711 20.60 317014 11 64988 251476 20.54 316464 12 64993 251515 20.53 316508 13 64340 251287 20.38 315627 14 63529 250110 20.26 313639 15 63895 249553 20.38 313448 16 63622 249532 20.32 313154 17 63003 247287 20.30 310290 18 62772 246020 20.33 308792 19 62277 245190 20.25 307467 20 61425 242915 20.18 304340 21 61774 242770 20.28 304544 22 61219 241199 20.24 302418 23 60620 239961 20.17 300581 24 60110 239597 20.06 299707 25 60097 237968 20.16 298065 26 60003 237601 20.16 297604 27 58860 235644 19.99 294504 28 58738 233330 20.11 292068 29 58254 232290 20.05 290544 30 57587 231134 19.95 288721 31 57406 229503 20.01 286909 32 57283 227775 20.10 285058 33 56983 227602 20.02 284585 34 56518 225377 20.05 281895 35 56123 224520 20.00 280643 36 55611 222462 20.00 278073 37 55554 221488 20.05 277042 38 54552 219865 19.88 274417 39 54253 218518 19.89 272771 40 54057 216814 19.96 270871 41 53002 215044 19.77 268046 42 52937 213193 19.89 266130 43 52541 212147 19.85 264688 44 52243 210775 19.86 263018 45 51606 209115 19.79 260721 46 51679 207368 19.95 259047 47 50859 205577 19.83 256436 48 50554 203811 19.87 254365 49 50169 202976 19.82 253145 50 50080 201124 19.94 251204 51 49360 199300 19.85 248660 52 49067 198040 19.86 247107 53 48080 195589 19.73 243669 54 48038 195846 19.70 243884 55 47849 193174 19.85 241023 56 47106 192027 19.70 239133 57 46978 190920 19.75 237898 58 46733 188297 19.88 235030 59 46700 186803 20.00 233503 60 46187 185580 19.93 231767 61 44977 183594 19.68 228571 62 44960 181463 19.86 226423 63 44637 179748 19.89 224385 64 43943 178720 19.74 222663 65 43882 177634 19.81 221516 66 43679 176340 19.85 220019 67 43194 174355 19.85 217549 68 43195 173282 19.95 216477 69 42389 171616 19.81 214005 70 41999 169799 19.83 211798 71 41481 167683 19.83 209164 72 41020 167113 19.71 208133 73 41223 166299 19.86 207522 74 40691 164279 19.85 204970 75 40582 162858 19.95 203440 76 39810 161094 19.82 200904 77 39238 160189 19.68 199427 78 39221 158566 19.83 197787 79 38492 157275 19.66 195767 80 38226 155451 19.74 193677 81 38051 153619 19.85 191670 82 37414 152177 19.73 189591 83 37243 150044 19.89 187287 84 36988 148929 19.89 185917 85 36360 147883 19.73 184243 86 35724 145891 19.67 181615 87 35641 145332 19.69 180973 88 35529 144474 19.74 180003 89 35026 142292 19.75 177318 90 34882 140638 19.87 175520 91 34262 138901 19.79 173163 92 33940 138052 19.73 171992 93 34125 136395 20.01 170520 94 33426 135486 19.79 168912 95 32893 133844 19.73 166737 96 32330 133102 19.54 165432 97 32237 131747 19.66 163984 98 31881 130623 19.62 162504 99 31665 128750 19.74 160415 100 31108 126976 19.68 158084 101 30985 126277 19.70 157262 102 30546 125164 19.62 155710 103 29815 123375 19.46 153190 104 30093 122006 19.79 152099 105 29457 121642 19.50 151099 106 29050 119786 19.52 148836 107 28850 118219 19.62 147069 108 28772 117165 19.72 145937 109 28295 115702 19.65 143997 110 27716 114493 19.49 142209 111 27430 113268 19.50 140698 112 27172 112350 19.48 139522 113 27165 110578 19.72 137743 114 26931 110033 19.66 136964 115 26487 108362 19.64 134849 116 26372 107306 19.73 133678 117 26091 106577 19.67 132668 118 25547 105444 19.50 130991 119 25383 103424 19.71 128807 120 25273 102482 19.78 127755 121 24524 101925 19.39 126449 122 24659 100637 19.68 125296 123 24182 99279 19.59 123461 124 24103 98091 19.73 122194 125 23690 97348 19.57 121038 126 23461 95894 19.66 119355 127 22977 94843 19.50 117820 128 23063 93772 19.74 116835 129 22662 92429 19.69 115091 130 22220 91585 19.52 113805 131 22037 90462 19.59 112499 132 21755 89999 19.47 111754 133 21771 88700 19.71 110471 134 21146 87927 19.39 109073 135 21160 86570 19.64 107730 136 20789 85151 19.62 105940 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 7358 449330 1.61 456688 2 5431 446010 1.20 451441 3 3831 444874 0.85 448705 4 3254 442707 0.73 445961 5 2595 439202 0.59 441797 6 2384 439698 0.54 442082 7 2364 437709 0.54 440073 8 1954 435631 0.45 437585 9 1852 435092 0.42 436944 10 1668 434669 0.38 436337 11 1644 434235 0.38 435879 12 1501 432810 0.35 434311 13 1572 430904 0.36 432476 14 1498 429933 0.35 431431 15 1386 428751 0.32 430137 16 1460 427622 0.34 429082 17 1353 426315 0.32 427668 18 1250 425361 0.29 426611 19 1322 422053 0.31 423375 20 1231 420629 0.29 421860 21 1227 418799 0.29 420026 22 1180 417568 0.28 418748 23 1197 414982 0.29 416179 24 1156 412793 0.28 413949 25 1120 411435 0.27 412555 26 1147 409369 0.28 410516 27 1071 408564 0.26 409635 28 1110 405325 0.27 406435 29 1069 400923 0.27 401992 30 1087 399588 0.27 400675 31 985 397947 0.25 398932 32 1049 394975 0.26 396024 33 1036 393208 0.26 394244 34 1042 390661 0.27 391703 35 1001 388727 0.26 389728 36 1042 385596 0.27 386638 37 1042 383344 0.27 384386 38 1006 381266 0.26 382272 39 1025 378031 0.27 379056 40 967 375288 0.26 376255 41 1012 372025 0.27 373037 42 981 369100 0.27 370081 43 982 365504 0.27 366486 44 1018 364819 0.28 365837 45 943 362132 0.26 363075 46 910 358549 0.25 359459 47 962 357288 0.27 358250 48 910 354802 0.26 355712 49 938 351061 0.27 351999 50 892 348349 0.26 349241 51 906 347313 0.26 348219 52 870 343750 0.25 344620 53 961 340873 0.28 341834 54 927 337750 0.27 338677 55 899 334241 0.27 335140 56 908 331680 0.27 332588 57 849 329797 0.26 330646 58 890 326507 0.27 327397 59 845 323948 0.26 324793 60 891 321230 0.28 322121 61 799 318726 0.25 319525 62 833 316668 0.26 317501 63 802 313061 0.26 313863 64 855 310462 0.27 311317 65 822 308782 0.27 309604 66 766 306363 0.25 307129 67 779 303107 0.26 303886 68 809 300304 0.27 301113 69 846 298726 0.28 299572 70 750 296175 0.25 296925 71 775 293064 0.26 293839 72 764 290262 0.26 291026 73 782 288194 0.27 288976 74 760 286080 0.26 286840 75 767 283300 0.27 284067 76 749 280284 0.27 281033 77 744 277567 0.27 278311 78 731 273364 0.27 274095 79 729 271652 0.27 272381 80 728 269670 0.27 270398 81 705 266410 0.26 267115 82 772 264490 0.29 265262 83 676 261773 0.26 262449 84 663 258321 0.26 258984 85 655 256086 0.26 256741 86 658 254352 0.26 255010 87 704 250906 0.28 251610 88 691 250810 0.27 251501 89 610 246293 0.25 246903 90 633 244368 0.26 245001 91 633 242229 0.26 242862 92 605 239055 0.25 239660 93 642 237289 0.27 237931 94 621 234226 0.26 234847 95 616 232964 0.26 233580 96 614 230430 0.27 231044 97 640 227797 0.28 228437 98 613 225629 0.27 226242 99 602 224126 0.27 224728 100 604 220292 0.27 220896 101 619 218514 0.28 219133 102 603 216692 0.28 217295 103 604 214403 0.28 215007 104 587 211415 0.28 212002 105 571 209504 0.27 210075 106 616 207740 0.30 208356 107 569 205185 0.28 205754 108 564 202321 0.28 202885 109 550 201088 0.27 201638 110 571 198249 0.29 198820 111 538 195801 0.27 196339 112 553 194934 0.28 195487 113 527 191667 0.27 192194 114 503 189647 0.26 190150 115 504 187156 0.27 187660 116 564 184827 0.30 185391 117 493 183947 0.27 184440 118 444 182148 0.24 182592 119 476 179774 0.26 180250 120 492 177567 0.28 178059 121 475 175877 0.27 176352 122 481 174523 0.27 175004 123 506 171851 0.29 172357 124 438 169564 0.26 170002 125 422 167159 0.25 167581 126 461 166132 0.28 166593 127 462 164046 0.28 164508 128 516 162252 0.32 162768 129 461 160948 0.29 161409 130 442 157383 0.28 157825 131 469 156445 0.30 156914 132 450 154227 0.29 154677 133 418 153304 0.27 153722 134 388 151223 0.26 151611 135 451 149944 0.30 150395 136 490 145374 0.34 145864 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 43174 1853693 2.28 1896867 2 29262 1857009 1.55 1886271 3 21188 1851529 1.13 1872717 4 16219 1851499 0.87 1867718 5 13561 1849322 0.73 1862883 6 11425 1844631 0.62 1856056 7 10434 1834168 0.57 1844602 8 9888 1828700 0.54 1838588 9 9063 1819993 0.50 1829056 10 8592 1807974 0.47 1816566 11 8133 1803451 0.45 1811584 12 7611 1796332 0.42 1803943 13 7233 1788873 0.40 1796106 14 6925 1780293 0.39 1787218 15 6492 1771900 0.37 1778392 16 6369 1762263 0.36 1768632 17 6099 1750679 0.35 1756778 18 6049 1746027 0.35 1752076 19 5828 1734459 0.33 1740287 20 5558 1723743 0.32 1729301 21 5449 1717054 0.32 1722503 22 5264 1708677 0.31 1713941 23 5183 1697635 0.30 1702818 24 5077 1690260 0.30 1695337 25 4919 1681068 0.29 1685987 26 4819 1670507 0.29 1675326 27 4743 1660672 0.28 1665415 28 4774 1650415 0.29 1655189 29 4588 1642085 0.28 1646673 30 4611 1630811 0.28 1635422 31 4570 1620047 0.28 1624617 32 4554 1611176 0.28 1615730 33 4405 1602177 0.27 1606582 34 4424 1591061 0.28 1595485 35 4334 1580635 0.27 1584969 36 4379 1571314 0.28 1575693 37 4472 1561629 0.29 1566101 38 4415 1548062 0.28 1552477 39 4332 1538622 0.28 1542954 40 4321 1526956 0.28 1531277 41 4216 1517702 0.28 1521918 42 4148 1506011 0.27 1510159 43 4277 1495657 0.29 1499934 44 4216 1483583 0.28 1487799 45 4105 1474315 0.28 1478420 46 4047 1462592 0.28 1466639 47 4076 1452950 0.28 1457026 48 4021 1440861 0.28 1444882 49 3973 1430991 0.28 1434964 50 3913 1419922 0.27 1423835 51 3911 1408852 0.28 1412763 52 3864 1399060 0.28 1402924 53 3975 1387581 0.29 1391556 54 3896 1377491 0.28 1381387 55 3839 1369052 0.28 1372891 56 3739 1355996 0.27 1359735 57 3852 1345798 0.29 1349650 58 3744 1334834 0.28 1338578 59 3794 1321657 0.29 1325451 60 3680 1313468 0.28 1317148 61 3645 1300525 0.28 1304170 62 3714 1290781 0.29 1294495 63 3711 1280998 0.29 1284709 64 3642 1270454 0.29 1274096 65 3566 1259897 0.28 1263463 66 3736 1248298 0.30 1252034 67 3526 1239047 0.28 1242573 68 3536 1228177 0.29 1231713 69 3535 1218101 0.29 1221636 70 3499 1207511 0.29 1211010 71 3471 1195817 0.29 1199288 72 3502 1185976 0.29 1189478 73 3400 1174795 0.29 1178195 74 3387 1163239 0.29 1166626 75 3305 1154826 0.29 1158131 76 3387 1145138 0.29 1148525 77 3188 1133650 0.28 1136838 78 3209 1122072 0.29 1125281 79 3250 1110299 0.29 1113549 80 3227 1103213 0.29 1106440 81 3148 1092024 0.29 1095172 82 3118 1079923 0.29 1083041 83 3117 1068855 0.29 1071972 84 3030 1061922 0.28 1064952 85 3124 1050624 0.30 1053748 86 3113 1042191 0.30 1045304 87 3068 1030225 0.30 1033293 88 2960 1020997 0.29 1023957 89 2924 1011014 0.29 1013938 90 2888 998329 0.29 1001217 91 3082 991253 0.31 994335 92 2888 980135 0.29 983023 93 2985 969260 0.31 972245 94 2775 960439 0.29 963214 95 2848 951077 0.30 953925 96 2812 942807 0.30 945619 97 2714 930126 0.29 932840 98 2800 921928 0.30 924728 99 2796 912430 0.31 915226 100 2871 903626 0.32 906497 101 2698 893137 0.30 895835 102 2644 884750 0.30 887394 103 2671 875930 0.30 878601 104 2776 864787 0.32 867563 105 2548 855409 0.30 857957 106 2744 846730 0.32 849474 107 2636 838867 0.31 841503 108 2591 830347 0.31 832938 109 2703 821040 0.33 823743 110 2624 813170 0.32 815794 111 2471 803518 0.31 805989 112 2465 794623 0.31 797088 113 2509 786202 0.32 788711 114 2473 777242 0.32 779715 115 2696 769473 0.35 772169 116 2439 759445 0.32 761884 117 2445 749838 0.33 752283 118 2434 743812 0.33 746246 119 2461 735001 0.33 737462 120 2548 725932 0.35 728480 121 2290 718432 0.32 720722 122 2329 709616 0.33 711945 123 2304 701864 0.33 704168 124 2354 693336 0.34 695690 125 2344 684784 0.34 687128 126 2321 677609 0.34 679930 127 2191 670931 0.33 673122 128 2257 662840 0.34 665097 129 2320 655419 0.35 657739 130 2267 647187 0.35 649454 131 2342 638147 0.37 640489 132 2278 631662 0.36 633940 133 2130 624219 0.34 626349 134 2261 616713 0.37 618974 135 2293 610009 0.37 612302 136 2417 596731 0.40 599148