CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 88314 358589 19.76 446903 2 88270 348777 20.20 437047 3 87598 347881 20.12 435479 4 87409 350687 19.95 438096 5 86961 351233 19.85 438194 6 87208 353515 19.79 440723 7 88311 353924 19.97 442235 8 88937 361550 19.74 450487 9 89738 363015 19.82 452753 10 88782 360504 19.76 449286 11 89003 359120 19.86 448123 12 89693 358154 20.03 447847 13 89811 356497 20.12 446308 14 90986 359050 20.22 450036 15 88933 352224 20.16 441157 16 88677 351189 20.16 439866 17 89709 354049 20.22 443758 18 89168 356975 19.99 446143 19 89930 357976 20.08 447906 20 89646 358868 19.99 448514 21 88800 357856 19.88 446656 22 88868 353643 20.08 442511 23 88678 355447 19.97 444125 24 89051 354031 20.10 443082 25 89035 353651 20.11 442686 26 89007 353915 20.10 442922 27 88794 352690 20.11 441484 28 88612 354775 19.99 443387 29 89164 353082 20.16 442246 30 89139 353809 20.12 442948 31 88459 355732 19.91 444191 32 89508 357117 20.04 446625 33 89397 353639 20.18 443036 34 89059 356464 19.99 445523 35 88421 353747 20.00 442168 36 89449 353348 20.20 442797 37 88185 354121 19.94 442306 38 89241 356129 20.04 445370 39 89208 354517 20.10 443725 40 88933 353116 20.12 442049 41 88978 353363 20.12 442341 42 88611 350971 20.16 439582 43 88975 351670 20.19 440645 44 88521 353023 20.05 441544 45 88737 351553 20.15 440290 46 88503 351466 20.12 439969 47 88207 351437 20.06 439644 48 87833 349677 20.08 437510 49 88112 348886 20.16 436998 50 88296 352999 20.01 441295 51 87874 350192 20.06 438066 52 88994 350910 20.23 439904 53 88854 351576 20.17 440430 54 88893 350983 20.21 439876 55 88481 349511 20.20 437992 56 88450 350497 20.15 438947 57 88773 350543 20.21 439316 58 87750 349778 20.06 437528 59 88337 349928 20.16 438265 60 88291 348634 20.21 436925 61 88335 350119 20.15 438454 62 88338 350224 20.14 438562 63 88497 346975 20.32 435472 64 88479 347244 20.31 435723 65 87821 346899 20.20 434720 66 88313 348725 20.21 437038 67 88490 348379 20.26 436869 68 89675 349372 20.42 439047 69 88661 350499 20.19 439160 70 89237 350303 20.30 439540 71 88029 346800 20.24 434829 72 88726 347495 20.34 436221 73 88642 346245 20.38 434887 74 88196 348539 20.19 436735 75 88214 346540 20.29 434754 76 88690 348603 20.28 437293 77 88288 345733 20.34 434021 78 87906 346713 20.23 434619 79 88313 344827 20.39 433140 80 88429 346028 20.35 434457 81 87865 347348 20.19 435213 82 88635 347235 20.34 435870 83 88082 347296 20.23 435378 84 88115 345279 20.33 433394 85 87860 345313 20.28 433173 86 88225 346741 20.28 434966 87 87694 345716 20.23 433410 88 88397 346375 20.33 434772 89 88131 347384 20.24 435515 90 87966 346301 20.26 434267 91 87582 345784 20.21 433366 92 88262 345485 20.35 433747 93 87802 344635 20.30 432437 94 87903 343529 20.37 431432 95 87855 347021 20.20 434876 96 88508 343247 20.50 431755 97 87689 344159 20.31 431848 98 88268 343693 20.43 431961 99 88552 344196 20.46 432748 100 88398 344011 20.44 432409 101 88259 343849 20.43 432108 102 88151 342962 20.45 431113 103 88380 342471 20.51 430851 104 88363 342719 20.50 431082 105 88523 341876 20.57 430399 106 88172 342933 20.45 431105 107 88608 344369 20.46 432977 108 88485 341472 20.58 429957 109 88641 341160 20.62 429801 110 88600 343254 20.52 431854 111 88497 340751 20.62 429248 112 88957 343044 20.59 432001 113 88295 341009 20.57 429304 114 88285 340951 20.57 429236 115 88533 338890 20.71 427423 116 88615 341615 20.60 430230 117 88629 338312 20.76 426941 118 88846 338995 20.77 427841 119 88492 337543 20.77 426035 120 88905 338007 20.83 426912 121 89013 335645 20.96 424658 122 88355 337549 20.75 425904 123 89092 337061 20.91 426153 124 88514 335908 20.86 424422 125 88534 335873 20.86 424407 126 88517 335113 20.89 423630 127 88696 334963 20.94 423659 128 89135 333772 21.08 422907 129 89107 334126 21.05 423233 130 88630 331912 21.08 420542 131 88478 331600 21.06 420078 132 88573 330801 21.12 419374 133 88389 329542 21.15 417931 134 88244 331387 21.03 419631 135 88327 330628 21.08 418955 136 88314 327897 21.22 416211 137 88120 328901 21.13 417021 138 87680 328431 21.07 416111 139 88062 327223 21.21 415285 140 88115 327620 21.19 415735 141 92192 327894 21.95 420086 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2192 610204 0.36 612396 2 1682 610556 0.27 612238 3 1647 604518 0.27 606165 4 1676 602257 0.28 603933 5 1654 606320 0.27 607974 6 1671 604258 0.28 605929 7 1659 615169 0.27 616828 8 1654 616969 0.27 618623 9 1724 615389 0.28 617113 10 1675 616401 0.27 618076 11 1750 615439 0.28 617189 12 1809 618956 0.29 620765 13 1728 617445 0.28 619173 14 1624 608607 0.27 610231 15 1677 607209 0.28 608886 16 1681 606581 0.28 608262 17 1750 613758 0.28 615508 18 1686 611719 0.27 613405 19 1746 616665 0.28 618411 20 1730 616113 0.28 617843 21 1728 612224 0.28 613952 22 1683 608232 0.28 609915 23 1752 612449 0.29 614201 24 1759 613543 0.29 615302 25 1764 611438 0.29 613202 26 1709 612614 0.28 614323 27 1810 609730 0.30 611540 28 1749 612870 0.28 614619 29 1841 610443 0.30 612284 30 1790 612494 0.29 614284 31 1755 614522 0.28 616277 32 1770 613399 0.29 615169 33 1751 607118 0.29 608869 34 1686 611057 0.28 612743 35 1735 609235 0.28 610970 36 1767 607416 0.29 609183 37 1655 609469 0.27 611124 38 1742 606355 0.29 608097 39 1785 604246 0.29 606031 40 1746 607081 0.29 608827 41 1719 609219 0.28 610938 42 1787 608170 0.29 609957 43 1745 607560 0.29 609305 44 1835 606151 0.30 607986 45 1876 604502 0.31 606378 46 1803 611450 0.29 613253 47 1869 606338 0.31 608207 48 1933 611478 0.32 613411 49 2021 606712 0.33 608733 50 2174 608207 0.36 610381 51 2024 603651 0.33 605675 52 2142 607574 0.35 609716 53 2049 610702 0.33 612751 54 2168 609142 0.35 611310 55 2103 602496 0.35 604599 56 2251 601787 0.37 604038 57 2090 603601 0.35 605691 58 2301 604612 0.38 606913 59 2204 603443 0.36 605647 60 2313 602897 0.38 605210 61 2289 602126 0.38 604415 62 2292 605487 0.38 607779 63 2296 605484 0.38 607780 64 2483 604295 0.41 606778 65 2434 604780 0.40 607214 66 2384 603771 0.39 606155 67 2439 603584 0.40 606023 68 2524 605228 0.42 607752 69 2439 604593 0.40 607032 70 2577 602119 0.43 604696 71 2498 603381 0.41 605879 72 2443 600697 0.41 603140 73 2592 600859 0.43 603451 74 2582 604603 0.43 607185 75 2623 605110 0.43 607733 76 2653 603344 0.44 605997 77 2778 603456 0.46 606234 78 2651 599927 0.44 602578 79 2779 599781 0.46 602560 80 2747 601311 0.45 604058 81 2733 603578 0.45 606311 82 2759 600933 0.46 603692 83 2935 599859 0.49 602794 84 3017 601500 0.50 604517 85 2990 600649 0.50 603639 86 3044 600491 0.50 603535 87 3175 597597 0.53 600772 88 3099 600085 0.51 603184 89 3148 597289 0.52 600437 90 3285 596673 0.55 599958 91 3382 596493 0.56 599875 92 3426 599017 0.57 602443 93 3509 596616 0.58 600125 94 3534 600014 0.59 603548 95 3630 597687 0.60 601317 96 3730 598386 0.62 602116 97 3850 595025 0.64 598875 98 3998 597823 0.66 601821 99 3876 594597 0.65 598473 100 4083 595251 0.68 599334 101 4168 593903 0.70 598071 102 4191 595791 0.70 599982 103 4474 592670 0.75 597144 104 4548 594179 0.76 598727 105 4473 591504 0.75 595977 106 4707 598352 0.78 603059 107 4780 592147 0.80 596927 108 5028 591208 0.84 596236 109 5205 589966 0.87 595171 110 5304 591933 0.89 597237 111 5491 590380 0.92 595871 112 5680 589559 0.95 595239 113 5861 587791 0.99 593652 114 6108 588318 1.03 594426 115 6096 588732 1.02 594828 116 6316 587711 1.06 594027 117 6616 585229 1.12 591845 118 6857 585590 1.16 592447 119 6866 584873 1.16 591739 120 7136 581976 1.21 589112 121 7316 582824 1.24 590140 122 7397 582588 1.25 589985 123 7642 580192 1.30 587834 124 7934 578550 1.35 586484 125 7914 579854 1.35 587768 126 8345 577674 1.42 586019 127 8678 575701 1.48 584379 128 8790 574391 1.51 583181 129 9238 573764 1.58 583002 130 9291 573159 1.60 582450 131 9384 570799 1.62 580183 132 9633 569955 1.66 579588 133 9914 569213 1.71 579127 134 10160 571321 1.75 581481 135 10448 568846 1.80 579294 136 10648 565289 1.85 575937 137 11397 564266 1.98 575663 138 11645 564631 2.02 576276 139 12155 565032 2.11 577187 140 17596 566524 3.01 584120 141 17375 563338 2.99 580713 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 8332 2563353 0.32 2571685 2 7233 2561020 0.28 2568253 3 7019 2548322 0.27 2555341 4 7057 2546428 0.28 2553485 5 7072 2530845 0.28 2537917 6 6943 2526565 0.27 2533508 7 7087 2535842 0.28 2542929 8 7014 2556522 0.27 2563536 9 7238 2550592 0.28 2557830 10 7204 2548263 0.28 2555467 11 7133 2547487 0.28 2554620 12 7069 2526759 0.28 2533828 13 6933 2518130 0.27 2525063 14 6915 2512201 0.27 2519116 15 7155 2514028 0.28 2521183 16 7160 2520028 0.28 2527188 17 7206 2528387 0.28 2535593 18 7407 2531278 0.29 2538685 19 7316 2532999 0.29 2540315 20 7206 2541758 0.28 2548964 21 7314 2529177 0.29 2536491 22 7131 2527885 0.28 2535016 23 7322 2535089 0.29 2542411 24 7287 2523362 0.29 2530649 25 7363 2519178 0.29 2526541 26 7277 2522757 0.29 2530034 27 7188 2521254 0.28 2528442 28 7510 2522249 0.30 2529759 29 7230 2528066 0.29 2535296 30 7223 2531580 0.28 2538803 31 7339 2528270 0.29 2535609 32 7448 2529139 0.29 2536587 33 7353 2520929 0.29 2528282 34 7156 2518814 0.28 2525970 35 7283 2512778 0.29 2520061 36 7240 2519219 0.29 2526459 37 7287 2523394 0.29 2530681 38 7314 2527027 0.29 2534341 39 7342 2520371 0.29 2527713 40 7399 2515129 0.29 2522528 41 7350 2516052 0.29 2523402 42 7646 2509455 0.30 2517101 43 7497 2510284 0.30 2517781 44 7586 2519872 0.30 2527458 45 7808 2515294 0.31 2523102 46 8089 2516737 0.32 2524826 47 8233 2512738 0.33 2520971 48 8650 2516924 0.34 2525574 49 8877 2515031 0.35 2523908 50 9107 2520605 0.36 2529712 51 9064 2512382 0.36 2521446 52 9342 2516303 0.37 2525645 53 9354 2515004 0.37 2524358 54 9378 2510055 0.37 2519433 55 9480 2505401 0.38 2514881 56 9696 2512657 0.38 2522353 57 9636 2508588 0.38 2518224 58 9822 2511702 0.39 2521524 59 9740 2510963 0.39 2520703 60 10307 2515537 0.41 2525844 61 9983 2505310 0.40 2515293 62 10051 2512651 0.40 2522702 63 10142 2498948 0.40 2509090 64 10519 2502133 0.42 2512652 65 10581 2504465 0.42 2515046 66 11046 2507185 0.44 2518231 67 11202 2508604 0.44 2519806 68 11021 2506425 0.44 2517446 69 10818 2496071 0.43 2506889 70 10942 2495079 0.44 2506021 71 11045 2496271 0.44 2507316 72 11051 2501195 0.44 2512246 73 11330 2496449 0.45 2507779 74 11559 2511970 0.46 2523529 75 11716 2496066 0.47 2507782 76 11939 2496407 0.48 2508346 77 12429 2493527 0.50 2505956 78 11964 2494583 0.48 2506547 79 12207 2492709 0.49 2504916 80 12238 2497455 0.49 2509693 81 12430 2487582 0.50 2500012 82 12720 2486555 0.51 2499275 83 12733 2485442 0.51 2498175 84 13103 2483308 0.52 2496411 85 13511 2487774 0.54 2501285 86 13518 2488344 0.54 2501862 87 13821 2481515 0.55 2495336 88 14037 2483470 0.56 2497507 89 14293 2486590 0.57 2500883 90 14545 2486897 0.58 2501442 91 14954 2482788 0.60 2497742 92 15424 2486746 0.62 2502170 93 15612 2483092 0.62 2498704 94 16046 2479678 0.64 2495724 95 16365 2481790 0.66 2498155 96 16883 2472643 0.68 2489526 97 17374 2472766 0.70 2490140 98 17700 2474809 0.71 2492509 99 18103 2474425 0.73 2492528 100 18830 2476877 0.75 2495707 101 19264 2475181 0.77 2494445 102 19406 2472750 0.78 2492156 103 20096 2470581 0.81 2490677 104 20573 2474022 0.82 2494595 105 21234 2466186 0.85 2487420 106 21586 2461426 0.87 2483012 107 21932 2459873 0.88 2481805 108 23297 2454648 0.94 2477945 109 24045 2452393 0.97 2476438 110 24404 2456759 0.98 2481163 111 24980 2448556 1.01 2473536 112 25951 2447097 1.05 2473048 113 26642 2447673 1.08 2474315 114 28157 2443574 1.14 2471731 115 28394 2439461 1.15 2467855 116 29252 2441044 1.18 2470296 117 30149 2432172 1.22 2462321 118 31393 2432433 1.27 2463826 119 31684 2425376 1.29 2457060 120 32476 2422330 1.32 2454806 121 33354 2416822 1.36 2450176 122 34273 2417842 1.40 2452115 123 35386 2416839 1.44 2452225 124 36209 2412464 1.48 2448673 125 37326 2410691 1.52 2448017 126 38444 2398583 1.58 2437027 127 39508 2392761 1.62 2432269 128 40486 2392473 1.66 2432959 129 41896 2385186 1.73 2427082 130 42758 2385212 1.76 2427970 131 43735 2374641 1.81 2418376 132 45106 2370159 1.87 2415265 133 46222 2363062 1.92 2409284 134 46743 2365793 1.94 2412536 135 48372 2357444 2.01 2405816 136 50229 2353039 2.09 2403268 137 52016 2357214 2.16 2409230 138 56386 2351611 2.34 2407997 139 57403 2338861 2.40 2396264 140 56557 2336916 2.36 2393473 141 60156 2323498 2.52 2383654 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 85627 325894 20.81 411521 2 84545 322370 20.78 406915 3 84081 319836 20.82 403917 4 83257 317427 20.78 400684 5 83435 316630 20.86 400065 6 82518 314263 20.80 396781 7 82856 313863 20.89 396719 8 81993 312580 20.78 394573 9 82013 311702 20.83 393715 10 81192 309427 20.79 390619 11 80607 308122 20.74 388729 12 80346 308165 20.68 388511 13 80212 306772 20.73 386984 14 79224 306141 20.56 385365 15 79398 304758 20.67 384156 16 79035 304393 20.61 383428 17 77916 303104 20.45 381020 18 77630 301235 20.49 378865 19 77211 299221 20.51 376432 20 76728 296273 20.57 373001 21 76059 295586 20.47 371645 22 75334 294106 20.39 369440 23 74897 292266 20.40 367163 24 75034 290164 20.55 365198 25 74643 290278 20.45 364921 26 73753 288183 20.38 361936 27 73301 287003 20.34 360304 28 72648 284742 20.33 357390 29 72444 281893 20.44 354337 30 71682 281034 20.32 352716 31 71111 279460 20.28 350571 32 69972 276722 20.18 346694 33 70061 275617 20.27 345678 34 69823 273430 20.34 343253 35 68851 271116 20.25 339967 36 68852 270375 20.30 339227 37 68738 269446 20.33 338184 38 67945 267506 20.25 335451 39 67295 264681 20.27 331976 40 66658 263430 20.19 330088 41 66510 260837 20.32 327347 42 65693 259276 20.22 324969 43 64937 256805 20.18 321742 44 64974 255619 20.27 320593 45 64135 253573 20.19 317708 46 63646 251522 20.19 315168 47 62883 249423 20.14 312306 48 62305 247851 20.09 310156 49 61884 246103 20.09 307987 50 61601 243594 20.18 305195 51 60864 241555 20.13 302419 52 60882 239961 20.24 300843 53 60249 239918 20.07 300167 54 59664 237322 20.09 296986 55 59133 233588 20.20 292721 56 58373 232612 20.06 290985 57 57963 231911 20.00 289874 58 57101 229244 19.94 286345 59 56716 227284 19.97 284000 60 56313 225355 19.99 281668 61 55912 222848 20.06 278760 62 55417 220819 20.06 276236 63 55357 219107 20.17 274464 64 54567 217053 20.09 271620 65 53847 216115 19.95 269962 66 53777 214114 20.07 267891 67 53318 212669 20.05 265987 68 52554 210029 20.01 262583 69 51964 208701 19.94 260665 70 51590 206752 19.97 258342 71 50786 204806 19.87 255592 72 50871 203411 20.01 254282 73 50431 201474 20.02 251905 74 50048 200038 20.01 250086 75 49206 198563 19.86 247769 76 49348 195864 20.12 245212 77 48704 195210 19.97 243914 78 48000 192675 19.94 240675 79 47409 191441 19.85 238850 80 47234 188078 20.07 235312 81 46256 187240 19.81 233496 82 46103 184351 20.01 230454 83 46074 182537 20.15 228611 84 45497 181211 20.07 226708 85 44788 180074 19.92 224862 86 44473 178452 19.95 222925 87 44008 176533 19.95 220541 88 43273 174578 19.86 217851 89 43001 172611 19.94 215612 90 42384 171515 19.81 213899 91 41900 169601 19.81 211501 92 41568 168324 19.80 209892 93 41260 165925 19.91 207185 94 40810 163976 19.93 204786 95 40199 163850 19.70 204049 96 40535 161649 20.05 202184 97 39429 160392 19.73 199821 98 39055 158230 19.80 197285 99 38796 156618 19.85 195414 100 38112 154550 19.78 192662 101 37751 153476 19.74 191227 102 37630 151660 19.88 189290 103 36974 149636 19.81 186610 104 36820 148232 19.90 185052 105 36284 146649 19.83 182933 106 36063 145441 19.87 181504 107 35580 143489 19.87 179069 108 34761 141769 19.69 176530 109 34749 141161 19.75 175910 110 34220 140015 19.64 174235 111 34057 137660 19.83 171717 112 33549 136386 19.74 169935 113 33359 134900 19.83 168259 114 32666 132936 19.73 165602 115 31906 131660 19.51 163566 116 32184 130058 19.84 162242 117 31777 128501 19.83 160278 118 31397 127388 19.77 158785 119 30884 125997 19.69 156881 120 30369 125017 19.54 155386 121 29951 123282 19.55 153233 122 30047 121997 19.76 152044 123 29682 120393 19.78 150075 124 29150 119092 19.66 148242 125 28825 117113 19.75 145938 126 28587 117008 19.63 145595 127 28106 114949 19.65 143055 128 27887 113595 19.71 141482 129 27378 112153 19.62 139531 130 27396 110679 19.84 138075 131 26508 109600 19.48 136108 132 26422 108176 19.63 134598 133 26041 107207 19.54 133248 134 25885 105789 19.66 131674 135 25367 104853 19.48 130220 136 24942 102916 19.51 127858 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9355 552848 1.66 562203 2 7056 549091 1.27 556147 3 5086 543582 0.93 548668 4 4206 542649 0.77 546855 5 3538 537507 0.65 541045 6 3106 535761 0.58 538867 7 3043 533893 0.57 536936 8 2785 533136 0.52 535921 9 2359 531807 0.44 534166 10 2258 531240 0.42 533498 11 2142 528838 0.40 530980 12 2039 525793 0.39 527832 13 1981 524143 0.38 526124 14 1851 522553 0.35 524404 15 1809 520713 0.35 522522 16 1714 519644 0.33 521358 17 1675 516218 0.32 517893 18 1643 515409 0.32 517052 19 1545 511215 0.30 512760 20 1531 508889 0.30 510420 21 1509 506837 0.30 508346 22 1423 504665 0.28 506088 23 1400 502053 0.28 503453 24 1420 499890 0.28 501310 25 1390 495759 0.28 497149 26 1422 495752 0.29 497174 27 1402 492368 0.28 493770 28 1315 488490 0.27 489805 29 1342 484927 0.28 486269 30 1265 482372 0.26 483637 31 1249 479824 0.26 481073 32 1299 478066 0.27 479365 33 1272 473516 0.27 474788 34 1319 471493 0.28 472812 35 1300 467505 0.28 468805 36 1275 464874 0.27 466149 37 1229 463050 0.26 464279 38 1256 460533 0.27 461789 39 1182 456161 0.26 457343 40 1201 453049 0.26 454250 41 1194 449960 0.26 451154 42 1234 446435 0.28 447669 43 1202 442565 0.27 443767 44 1189 439878 0.27 441067 45 1155 436867 0.26 438022 46 1140 433164 0.26 434304 47 1177 429868 0.27 431045 48 1121 427216 0.26 428337 49 1104 424289 0.26 425393 50 1091 421206 0.26 422297 51 1165 418304 0.28 419469 52 1037 413769 0.25 414806 53 1104 412193 0.27 413297 54 1155 408250 0.28 409405 55 997 405188 0.25 406185 56 1096 401662 0.27 402758 57 1127 398281 0.28 399408 58 1071 394206 0.27 395277 59 1105 390477 0.28 391582 60 1005 389162 0.26 390167 61 1011 384022 0.26 385033 62 1056 381691 0.28 382747 63 1070 379216 0.28 380286 64 1010 375595 0.27 376605 65 1040 371688 0.28 372728 66 1023 370339 0.28 371362 67 1007 365954 0.27 366961 68 1016 364295 0.28 365311 69 988 360278 0.27 361266 70 977 357708 0.27 358685 71 1030 354186 0.29 355216 72 963 350715 0.27 351678 73 919 348944 0.26 349863 74 949 345894 0.27 346843 75 848 342003 0.25 342851 76 927 338461 0.27 339388 77 922 335003 0.27 335925 78 914 332249 0.27 333163 79 871 328762 0.26 329633 80 876 325633 0.27 326509 81 905 321805 0.28 322710 82 882 318840 0.28 319722 83 802 315879 0.25 316681 84 884 313207 0.28 314091 85 822 310465 0.26 311287 86 834 306906 0.27 307740 87 798 304032 0.26 304830 88 859 301934 0.28 302793 89 770 297812 0.26 298582 90 800 295287 0.27 296087 91 800 291239 0.27 292039 92 743 288917 0.26 289660 93 781 286264 0.27 287045 94 787 282051 0.28 282838 95 790 279120 0.28 279910 96 724 277476 0.26 278200 97 755 273628 0.28 274383 98 725 271061 0.27 271786 99 748 269131 0.28 269879 100 683 266515 0.26 267198 101 740 263545 0.28 264285 102 673 260049 0.26 260722 103 704 258467 0.27 259171 104 750 254081 0.29 254831 105 652 251828 0.26 252480 106 696 249275 0.28 249971 107 722 246390 0.29 247112 108 680 243847 0.28 244527 109 691 241581 0.29 242272 110 612 239141 0.26 239753 111 671 235641 0.28 236312 112 657 233174 0.28 233831 113 669 230325 0.29 230994 114 632 228149 0.28 228781 115 658 224969 0.29 225627 116 587 223542 0.26 224129 117 637 220175 0.29 220812 118 568 218613 0.26 219181 119 626 214918 0.29 215544 120 577 213353 0.27 213930 121 621 210602 0.29 211223 122 606 206830 0.29 207436 123 595 206126 0.29 206721 124 547 203187 0.27 203734 125 549 200362 0.27 200911 126 525 197789 0.26 198314 127 583 197192 0.29 197775 128 559 193887 0.29 194446 129 519 191014 0.27 191533 130 560 188898 0.30 189458 131 572 186812 0.31 187384 132 526 184292 0.28 184818 133 517 182602 0.28 183119 134 570 179996 0.32 180566 135 536 177970 0.30 178506 136 543 173439 0.31 173982 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 55368 2223792 2.43 2279160 2 37985 2230401 1.67 2268386 3 28145 2230855 1.25 2259000 4 21789 2235506 0.97 2257295 5 18196 2234813 0.81 2253009 6 15614 2229582 0.70 2245196 7 14211 2220762 0.64 2234973 8 13094 2211654 0.59 2224748 9 12264 2199784 0.55 2212048 10 11353 2188848 0.52 2200201 11 10578 2180345 0.48 2190923 12 10041 2170881 0.46 2180922 13 9435 2163454 0.43 2172889 14 9209 2153830 0.43 2163039 15 8569 2139901 0.40 2148470 16 8275 2128285 0.39 2136560 17 7952 2119717 0.37 2127669 18 7514 2110655 0.35 2118169 19 7378 2095045 0.35 2102423 20 7091 2082876 0.34 2089967 21 6899 2072836 0.33 2079735 22 6626 2063282 0.32 2069908 23 6400 2051538 0.31 2057938 24 6297 2041304 0.31 2047601 25 6168 2032791 0.30 2038959 26 6139 2017026 0.30 2023165 27 6142 2007628 0.31 2013770 28 5945 1993965 0.30 1999910 29 5755 1982562 0.29 1988317 30 5724 1969842 0.29 1975566 31 5663 1957418 0.29 1963081 32 5699 1945828 0.29 1951527 33 5722 1933795 0.30 1939517 34 5501 1922552 0.29 1928053 35 5407 1912841 0.28 1918248 36 5605 1901252 0.29 1906857 37 5370 1885132 0.28 1890502 38 5201 1875694 0.28 1880895 39 5160 1863630 0.28 1868790 40 5127 1849504 0.28 1854631 41 5111 1835905 0.28 1841016 42 5288 1823971 0.29 1829259 43 5280 1810682 0.29 1815962 44 5148 1799591 0.29 1804739 45 5088 1785970 0.28 1791058 46 5107 1773424 0.29 1778531 47 4983 1760056 0.28 1765039 48 4978 1745263 0.28 1750241 49 4885 1735112 0.28 1739997 50 4896 1723623 0.28 1728519 51 4936 1707115 0.29 1712051 52 4894 1696512 0.29 1701406 53 4881 1681106 0.29 1685987 54 4909 1669251 0.29 1674160 55 4744 1655223 0.29 1659967 56 4708 1645490 0.29 1650198 57 4587 1631213 0.28 1635800 58 4657 1619460 0.29 1624117 59 4695 1606407 0.29 1611102 60 4592 1591982 0.29 1596574 61 4538 1578841 0.29 1583379 62 4503 1566668 0.29 1571171 63 4563 1552233 0.29 1556796 64 4584 1541145 0.30 1545729 65 4474 1528309 0.29 1532783 66 4577 1514292 0.30 1518869 67 4405 1503464 0.29 1507869 68 4343 1492211 0.29 1496554 69 4473 1479693 0.30 1484166 70 4309 1465325 0.29 1469634 71 4282 1453430 0.29 1457712 72 4311 1440287 0.30 1444598 73 4314 1426886 0.30 1431200 74 4431 1413061 0.31 1417492 75 4190 1402726 0.30 1406916 76 4133 1390602 0.30 1394735 77 4086 1376385 0.30 1380471 78 4238 1365936 0.31 1370174 79 4053 1352956 0.30 1357009 80 3996 1336174 0.30 1340170 81 3984 1327628 0.30 1331612 82 3932 1315766 0.30 1319698 83 4014 1302735 0.31 1306749 84 3908 1287135 0.30 1291043 85 3892 1275605 0.30 1279497 86 3956 1264263 0.31 1268219 87 3777 1251145 0.30 1254922 88 3657 1239721 0.29 1243378 89 3895 1228420 0.32 1232315 90 3537 1215968 0.29 1219505 91 3884 1202647 0.32 1206531 92 3529 1188953 0.30 1192482 93 3889 1174834 0.33 1178723 94 3667 1163974 0.31 1167641 95 3603 1154901 0.31 1158504 96 3542 1141416 0.31 1144958 97 3307 1132275 0.29 1135582 98 3394 1119284 0.30 1122678 99 3370 1107196 0.30 1110566 100 3594 1094985 0.33 1098579 101 3356 1082864 0.31 1086220 102 3333 1070840 0.31 1074173 103 3297 1060271 0.31 1063568 104 3519 1049588 0.33 1053107 105 3197 1037246 0.31 1040443 106 3355 1027176 0.33 1030531 107 3146 1016323 0.31 1019469 108 3366 1006507 0.33 1009873 109 3223 994020 0.32 997243 110 3320 983762 0.34 987082 111 3210 971172 0.33 974382 112 3088 960949 0.32 964037 113 3093 949111 0.32 952204 114 3101 938784 0.33 941885 115 3228 927454 0.35 930682 116 3165 918259 0.34 921424 117 3037 907006 0.33 910043 118 2986 896989 0.33 899975 119 2925 887398 0.33 890323 120 3253 875792 0.37 879045 121 2941 865484 0.34 868425 122 2900 853818 0.34 856718 123 2870 843915 0.34 846785 124 2767 834841 0.33 837608 125 2863 824264 0.35 827127 126 2977 813730 0.36 816707 127 2784 805059 0.34 807843 128 2865 796433 0.36 799298 129 2901 786754 0.37 789655 130 2821 777882 0.36 780703 131 2781 767527 0.36 770308 132 2846 759177 0.37 762023 133 2696 750336 0.36 753032 134 2730 739890 0.37 742620 135 3030 731188 0.41 734218 136 3121 714646 0.43 717767