CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 69796 301159 18.82 370955 2 69584 294177 19.13 363761 3 68938 293018 19.05 361956 4 69138 294256 19.03 363394 5 68499 296644 18.76 365143 6 68897 297761 18.79 366658 7 69803 300102 18.87 369905 8 70509 307377 18.66 377886 9 71079 308768 18.71 379847 10 69814 304883 18.63 374697 11 70034 303454 18.75 373488 12 71060 301542 19.07 372602 13 70925 299720 19.14 370645 14 70907 300023 19.12 370930 15 70048 296725 19.10 366773 16 69896 296347 19.08 366243 17 69562 299361 18.86 368923 18 70449 301952 18.92 372401 19 70470 304341 18.80 374811 20 70936 303928 18.92 374864 21 70010 302629 18.79 372639 22 70129 298281 19.04 368410 23 69800 299273 18.91 369073 24 70163 296701 19.13 366864 25 70452 298586 19.09 369038 26 69985 299545 18.94 369530 27 69690 299416 18.88 369106 28 70574 299862 19.05 370436 29 69924 298452 18.98 368376 30 70591 300428 19.03 371019 31 70082 299565 18.96 369647 32 69606 302342 18.71 371948 33 69871 299422 18.92 369293 34 69988 300418 18.89 370406 35 69858 296204 19.08 366062 36 70161 297773 19.07 367934 37 69946 299210 18.95 369156 38 69711 301530 18.78 371241 39 69647 300141 18.83 369788 40 70010 299810 18.93 369820 41 69689 298644 18.92 368333 42 69997 297062 19.07 367059 43 69661 298723 18.91 368384 44 70146 298803 19.01 368949 45 69993 296390 19.10 366383 46 69455 296840 18.96 366295 47 69467 297109 18.95 366576 48 68975 296875 18.85 365850 49 69326 296041 18.97 365367 50 69695 298822 18.91 368517 51 69514 295025 19.07 364539 52 69480 297364 18.94 366844 53 70055 297881 19.04 367936 54 70118 296700 19.12 366818 55 70122 296192 19.14 366314 56 69635 296831 19.00 366466 57 69273 295193 19.01 364466 58 69413 295792 19.01 365205 59 69385 295982 18.99 365367 60 69687 296060 19.05 365747 61 69265 295851 18.97 365116 62 69748 295134 19.12 364882 63 69616 294646 19.11 364262 64 69341 293334 19.12 362675 65 69341 292976 19.14 362317 66 69335 295836 18.99 365171 67 70223 294167 19.27 364390 68 70054 295748 19.15 365802 69 69923 296733 19.07 366656 70 70379 297481 19.13 367860 71 70103 295442 19.18 365545 72 70410 293517 19.35 363927 73 70065 292883 19.30 362948 74 69475 295042 19.06 364517 75 70173 292664 19.34 362837 76 69892 293671 19.22 363563 77 69714 293071 19.22 362785 78 69747 292933 19.23 362680 79 69983 293172 19.27 363155 80 69572 293241 19.18 362813 81 69854 296388 19.07 366242 82 70229 294025 19.28 364254 83 69349 293315 19.12 362664 84 70123 292283 19.35 362406 85 69705 292877 19.22 362582 86 69896 293579 19.23 363475 87 69530 291887 19.24 361417 88 69768 292812 19.24 362580 89 69906 294338 19.19 364244 90 70287 294997 19.24 365284 91 69792 291572 19.31 361364 92 69688 293117 19.21 362805 93 69815 293243 19.23 363058 94 69745 291171 19.32 360916 95 70491 293274 19.38 363765 96 69891 290657 19.38 360548 97 69805 290207 19.39 360012 98 70633 290729 19.55 361362 99 69797 289973 19.40 359770 100 70305 290554 19.48 360859 101 70073 291282 19.39 361355 102 70881 291433 19.56 362314 103 70293 290076 19.51 360369 104 69806 288195 19.50 358001 105 70745 288597 19.69 359342 106 70133 288168 19.57 358301 107 70918 289648 19.67 360566 108 70496 288302 19.65 358798 109 70375 288342 19.62 358717 110 70898 289223 19.69 360121 111 70509 288244 19.65 358753 112 70346 288665 19.59 359011 113 70673 286981 19.76 357654 114 70844 287574 19.77 358418 115 71223 285422 19.97 356645 116 71334 285770 19.98 357104 117 70700 284442 19.91 355142 118 70977 284577 19.96 355554 119 71462 283365 20.14 354827 120 71015 283375 20.04 354390 121 71171 282835 20.10 354006 122 71115 282337 20.12 353452 123 71477 282496 20.19 353973 124 71514 281144 20.28 352658 125 71092 280803 20.20 351895 126 71717 279237 20.43 350954 127 71095 278197 20.35 349292 128 71174 278286 20.37 349460 129 71230 277607 20.42 348837 130 71090 276447 20.46 347537 131 70863 276031 20.43 346894 132 70894 274955 20.50 345849 133 70967 275013 20.51 345980 134 70501 273987 20.47 344488 135 71110 273456 20.64 344566 136 70925 272061 20.68 342986 137 70369 271748 20.57 342117 138 70935 270745 20.76 341680 139 70913 269475 20.83 340388 140 70937 269243 20.85 340180 141 75204 269984 21.79 345188 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1851 507152 0.36 509003 2 1473 508565 0.29 510038 3 1320 502696 0.26 504016 4 1392 501007 0.28 502399 5 1335 504992 0.26 506327 6 1312 504378 0.26 505690 7 1360 513145 0.26 514505 8 1412 512040 0.28 513452 9 1357 512368 0.26 513725 10 1411 511881 0.27 513292 11 1342 510303 0.26 511645 12 1396 513422 0.27 514818 13 1408 513940 0.27 515348 14 1355 507917 0.27 509272 15 1402 503284 0.28 504686 16 1407 506931 0.28 508338 17 1383 511663 0.27 513046 18 1367 509440 0.27 510807 19 1360 511442 0.27 512802 20 1438 513014 0.28 514452 21 1388 510118 0.27 511506 22 1416 504723 0.28 506139 23 1419 508726 0.28 510145 24 1393 508325 0.27 509718 25 1420 508769 0.28 510189 26 1346 510181 0.26 511527 27 1425 508590 0.28 510015 28 1403 509099 0.27 510502 29 1379 507988 0.27 509367 30 1332 509581 0.26 510913 31 1349 510479 0.26 511828 32 1428 512818 0.28 514246 33 1366 505577 0.27 506943 34 1360 510009 0.27 511369 35 1347 507607 0.26 508954 36 1400 507635 0.28 509035 37 1390 508062 0.27 509452 38 1373 505222 0.27 506595 39 1379 503650 0.27 505029 40 1360 505205 0.27 506565 41 1473 507028 0.29 508501 42 1358 509277 0.27 510635 43 1466 508289 0.29 509755 44 1507 505219 0.30 506726 45 1476 504128 0.29 505604 46 1513 510140 0.30 511653 47 1547 505166 0.31 506713 48 1573 508064 0.31 509637 49 1688 506106 0.33 507794 50 1779 505261 0.35 507040 51 1728 504225 0.34 505953 52 1789 507412 0.35 509201 53 1829 509105 0.36 510934 54 1832 508026 0.36 509858 55 1834 503990 0.36 505824 56 1886 502548 0.37 504434 57 1847 503959 0.37 505806 58 1864 502152 0.37 504016 59 1864 502371 0.37 504235 60 2027 502159 0.40 504186 61 1969 502774 0.39 504743 62 1979 504653 0.39 506632 63 2069 505440 0.41 507509 64 2113 504231 0.42 506344 65 2160 506033 0.43 508193 66 2167 505408 0.43 507575 67 2105 503487 0.42 505592 68 2180 504327 0.43 506507 69 2155 503951 0.43 506106 70 2171 502441 0.43 504612 71 2131 503123 0.42 505254 72 2150 500534 0.43 502684 73 2168 501428 0.43 503596 74 2377 504186 0.47 506563 75 2361 504976 0.47 507337 76 2392 502463 0.47 504855 77 2571 502722 0.51 505293 78 2451 499818 0.49 502269 79 2398 499439 0.48 501837 80 2516 500503 0.50 503019 81 2627 502627 0.52 505254 82 2586 500278 0.51 502864 83 2601 500192 0.52 502793 84 2701 501249 0.54 503950 85 2868 502159 0.57 505027 86 2895 500574 0.58 503469 87 2815 498039 0.56 500854 88 2787 500418 0.55 503205 89 3031 498739 0.60 501770 90 3208 497890 0.64 501098 91 3276 498519 0.65 501795 92 3266 500671 0.65 503937 93 3369 496472 0.67 499841 94 3446 499078 0.69 502524 95 3590 498419 0.72 502009 96 3664 495947 0.73 499611 97 3823 497083 0.76 500906 98 3980 495135 0.80 499115 99 4043 494221 0.81 498264 100 4117 492645 0.83 496762 101 4268 494845 0.86 499113 102 4346 495002 0.87 499348 103 4410 492874 0.89 497284 104 4680 494304 0.94 498984 105 4915 492527 0.99 497442 106 5028 494537 1.01 499565 107 5078 492876 1.02 497954 108 5369 490130 1.08 495499 109 5558 489470 1.12 495028 110 5715 490240 1.15 495955 111 5962 487903 1.21 493865 112 6136 487660 1.24 493796 113 6410 486873 1.30 493283 114 6694 486024 1.36 492718 115 7001 485461 1.42 492462 116 7021 484028 1.43 491049 117 7094 483348 1.45 490442 118 7662 483398 1.56 491060 119 7735 481071 1.58 488806 120 8003 479251 1.64 487254 121 8175 478373 1.68 486548 122 8444 478624 1.73 487068 123 8906 477093 1.83 485999 124 9125 475777 1.88 484902 125 9186 474146 1.90 483332 126 9670 472862 2.00 482532 127 9867 470342 2.05 480209 128 10005 471231 2.08 481236 129 10372 467163 2.17 477535 130 10608 465125 2.23 475733 131 10805 463242 2.28 474047 132 11157 464339 2.35 475496 133 11400 464459 2.40 475859 134 11626 460311 2.46 471937 135 12105 460015 2.56 472120 136 12240 457623 2.61 469863 137 12818 457130 2.73 469948 138 13604 455764 2.90 469368 139 13984 453308 2.99 467292 140 19766 457866 4.14 477632 141 19771 453776 4.18 473547 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 6711 2115420 0.32 2122131 2 5701 2111660 0.27 2117361 3 5739 2100564 0.27 2106303 4 5643 2093391 0.27 2099034 5 5771 2080585 0.28 2086356 6 5547 2076681 0.27 2082228 7 5706 2086680 0.27 2092386 8 5770 2107922 0.27 2113692 9 5748 2103120 0.27 2108868 10 5804 2100848 0.28 2106652 11 5731 2102167 0.27 2107898 12 5828 2087147 0.28 2092975 13 5622 2077675 0.27 2083297 14 5594 2069940 0.27 2075534 15 5645 2068057 0.27 2073702 16 5696 2075964 0.27 2081660 17 5795 2083488 0.28 2089283 18 5907 2089174 0.28 2095081 19 5951 2098272 0.28 2104223 20 5806 2102684 0.28 2108490 21 5858 2090441 0.28 2096299 22 5889 2087676 0.28 2093565 23 5862 2096426 0.28 2102288 24 5927 2082169 0.28 2088096 25 5824 2074695 0.28 2080519 26 5778 2082560 0.28 2088338 27 5647 2080562 0.27 2086209 28 5898 2085400 0.28 2091298 29 5866 2087557 0.28 2093423 30 5818 2096503 0.28 2102321 31 5935 2095750 0.28 2101685 32 5910 2093270 0.28 2099180 33 5738 2083796 0.27 2089534 34 5934 2081942 0.28 2087876 35 5804 2071890 0.28 2077694 36 5706 2077626 0.27 2083332 37 5774 2083867 0.28 2089641 38 5958 2084565 0.29 2090523 39 5889 2082641 0.28 2088530 40 5812 2082447 0.28 2088259 41 6151 2081958 0.29 2088109 42 5875 2077989 0.28 2083864 43 6026 2077637 0.29 2083663 44 6296 2084978 0.30 2091274 45 6305 2078437 0.30 2084742 46 6487 2079532 0.31 2086019 47 6847 2076952 0.33 2083799 48 7148 2082436 0.34 2089584 49 7380 2080455 0.35 2087835 50 7738 2085980 0.37 2093718 51 7819 2082409 0.37 2090228 52 7761 2083209 0.37 2090970 53 8023 2084106 0.38 2092129 54 8224 2078100 0.39 2086324 55 7902 2073100 0.38 2081002 56 8207 2075153 0.39 2083360 57 8231 2071948 0.40 2080179 58 8162 2073498 0.39 2081660 59 8345 2077006 0.40 2085351 60 8569 2079787 0.41 2088356 61 8449 2073604 0.41 2082053 62 8584 2080433 0.41 2089017 63 8646 2067681 0.42 2076327 64 8857 2070439 0.43 2079296 65 9087 2070623 0.44 2079710 66 9236 2070784 0.44 2080020 67 9355 2073551 0.45 2082906 68 9674 2071050 0.46 2080724 69 9307 2068935 0.45 2078242 70 9712 2068150 0.47 2077862 71 9663 2072776 0.46 2082439 72 9745 2070249 0.47 2079994 73 9988 2065869 0.48 2075857 74 10171 2074175 0.49 2084346 75 10121 2062840 0.49 2072961 76 10153 2061040 0.49 2071193 77 10811 2057025 0.52 2067836 78 10759 2057685 0.52 2068444 79 10839 2062076 0.52 2072915 80 11034 2066151 0.53 2077185 81 11311 2063876 0.55 2075187 82 11549 2061899 0.56 2073448 83 11736 2059288 0.57 2071024 84 11909 2052835 0.58 2064744 85 12325 2050199 0.60 2062524 86 12535 2055031 0.61 2067566 87 12815 2048413 0.62 2061228 88 13364 2050894 0.65 2064258 89 13615 2053186 0.66 2066801 90 14066 2056291 0.68 2070357 91 14481 2052171 0.70 2066652 92 14890 2053932 0.72 2068822 93 15254 2047577 0.74 2062831 94 15364 2046848 0.75 2062212 95 15949 2044933 0.77 2060882 96 16649 2040736 0.81 2057385 97 17212 2036885 0.84 2054097 98 17555 2037690 0.85 2055245 99 18189 2036780 0.89 2054969 100 18881 2039681 0.92 2058562 101 19640 2039377 0.95 2059017 102 20034 2038945 0.97 2058979 103 20926 2035329 1.02 2056255 104 21576 2032216 1.05 2053792 105 22230 2028003 1.08 2050233 106 23017 2021780 1.13 2044797 107 23756 2018961 1.16 2042717 108 24834 2012776 1.22 2037610 109 25535 2011490 1.25 2037025 110 26436 2014253 1.30 2040689 111 27345 2008248 1.34 2035593 112 28237 2010392 1.39 2038629 113 29494 2008837 1.45 2038331 114 30910 2000611 1.52 2031521 115 31085 1996435 1.53 2027520 116 32222 1994048 1.59 2026270 117 33337 1982628 1.65 2015965 118 34926 1977224 1.74 2012150 119 35422 1975782 1.76 2011204 120 36517 1970615 1.82 2007132 121 37600 1964087 1.88 2001687 122 38897 1964266 1.94 2003163 123 40146 1962801 2.00 2002947 124 41365 1957797 2.07 1999162 125 42898 1953358 2.15 1996256 126 43681 1946762 2.19 1990443 127 44875 1935442 2.27 1980317 128 45926 1932627 2.32 1978553 129 47179 1924484 2.39 1971663 130 48164 1920512 2.45 1968676 131 49435 1913449 2.52 1962884 132 51345 1907237 2.62 1958582 133 52385 1900122 2.68 1952507 134 53197 1896160 2.73 1949357 135 54741 1888477 2.82 1943218 136 56567 1884392 2.91 1940959 137 58730 1880970 3.03 1939700 138 63358 1876975 3.27 1940333 139 64351 1865319 3.33 1929670 140 63576 1856406 3.31 1919982 141 66436 1845856 3.47 1912292 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 64498 262604 19.72 327102 2 63665 259420 19.71 323085 3 63656 258104 19.78 321760 4 62710 256731 19.63 319441 5 62522 254448 19.72 316970 6 61938 253414 19.64 315352 7 61584 251280 19.68 312864 8 61899 250711 19.80 312610 9 60506 247232 19.66 307738 10 60257 245646 19.70 305903 11 59971 244954 19.67 304925 12 59008 243689 19.49 302697 13 59004 242908 19.54 301912 14 58785 241229 19.59 300014 15 58070 240379 19.46 298449 16 57938 239023 19.51 296961 17 56690 236767 19.32 293457 18 56220 234011 19.37 290231 19 55767 231390 19.42 287157 20 55295 228729 19.47 284024 21 54966 227266 19.48 282232 22 54220 225502 19.38 279722 23 53686 223351 19.38 277037 24 53060 222827 19.23 275887 25 52293 220980 19.14 273273 26 52542 219817 19.29 272359 27 51747 217734 19.20 269481 28 51278 215214 19.24 266492 29 50549 212735 19.20 263284 30 49761 211114 19.07 260875 31 49492 209200 19.13 258692 32 49291 207330 19.21 256621 33 48140 204616 19.05 252756 34 48022 203061 19.13 251083 35 47710 201954 19.11 249664 36 47356 200000 19.14 247356 37 46209 199033 18.84 245242 38 46032 197088 18.93 243120 39 45712 194649 19.02 240361 40 45447 192635 19.09 238082 41 44596 189677 19.04 234273 42 44147 188484 18.98 232631 43 43980 185700 19.15 229680 44 42923 183446 18.96 226369 45 42414 182623 18.85 225037 46 42041 180950 18.85 222991 47 41521 178759 18.85 220280 48 41247 177111 18.89 218358 49 41029 175619 18.94 216648 50 40528 173305 18.95 213833 51 40271 171724 19.00 211995 52 39917 170531 18.97 210448 53 39377 167873 19.00 207250 54 38885 166628 18.92 205513 55 38106 164423 18.82 202529 56 37963 163332 18.86 201295 57 37464 161605 18.82 199069 58 36952 159744 18.79 196696 59 36714 157961 18.86 194675 60 36460 156329 18.91 192789 61 35699 154486 18.77 190185 62 35545 152806 18.87 188351 63 34820 150816 18.76 185636 64 34735 149107 18.89 183842 65 34120 147551 18.78 181671 66 33942 146773 18.78 180715 67 33591 145113 18.80 178704 68 33244 144340 18.72 177584 69 32439 141770 18.62 174209 70 32207 140413 18.66 172620 71 32062 138657 18.78 170719 72 31650 136620 18.81 168270 73 31379 135840 18.77 167219 74 30834 134606 18.64 165440 75 30159 132779 18.51 162938 76 30537 131804 18.81 162341 77 29558 130132 18.51 159690 78 29546 128508 18.69 158054 79 29222 127064 18.70 156286 80 28903 125422 18.73 154325 81 28275 123672 18.61 151947 82 28319 121665 18.88 149984 83 27751 120485 18.72 148236 84 27491 119613 18.69 147104 85 27184 118935 18.60 146119 86 26657 116874 18.57 143531 87 26724 115242 18.82 141966 88 26368 114809 18.68 141177 89 25980 113061 18.69 139041 90 25815 111668 18.78 137483 91 25181 109953 18.63 135134 92 24736 108903 18.51 133639 93 24634 107607 18.63 132241 94 24605 105908 18.85 130513 95 24392 105030 18.85 129422 96 23818 104537 18.56 128355 97 23455 103269 18.51 126724 98 23164 101524 18.58 124688 99 23078 100492 18.68 123570 100 22749 99586 18.60 122335 101 22675 98086 18.78 120761 102 22188 96599 18.68 118787 103 22064 95096 18.83 117160 104 21555 93808 18.68 115363 105 21483 93164 18.74 114647 106 21197 91963 18.73 113160 107 21117 90616 18.90 111733 108 20630 90361 18.59 110991 109 20528 88699 18.79 109227 110 20059 88752 18.43 108811 111 19934 86475 18.73 106409 112 19544 85660 18.58 105204 113 19260 84364 18.59 103624 114 19210 83104 18.78 102314 115 18969 83230 18.56 102199 116 18736 81724 18.65 100460 117 18396 80859 18.53 99255 118 18317 79043 18.81 97360 119 17816 79062 18.39 96878 120 17797 77988 18.58 95785 121 17420 77418 18.37 94838 122 17420 75915 18.66 93335 123 16856 74757 18.40 91613 124 16925 74472 18.52 91397 125 16578 72922 18.52 89500 126 16190 71991 18.36 88181 127 16180 70886 18.58 87066 128 15936 70301 18.48 86237 129 15811 69127 18.61 84938 130 15461 68592 18.39 84053 131 15460 67803 18.57 83263 132 14974 66960 18.28 81934 133 14934 66125 18.42 81059 134 14720 65230 18.41 79950 135 14660 64711 18.47 79371 136 14213 63642 18.26 77855 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4830 437071 1.09 441901 2 3675 432100 0.84 435775 3 2800 426998 0.65 429798 4 2417 423861 0.57 426278 5 2084 421347 0.49 423431 6 1874 417783 0.45 419657 7 2045 415474 0.49 417519 8 1824 412429 0.44 414253 9 1577 411366 0.38 412943 10 1509 409600 0.37 411109 11 1463 405618 0.36 407081 12 1448 403931 0.36 405379 13 1398 401570 0.35 402968 14 1310 399085 0.33 400395 15 1280 396090 0.32 397370 16 1176 393574 0.30 394750 17 1235 392963 0.31 394198 18 1199 390230 0.31 391429 19 1125 385523 0.29 386648 20 1143 381981 0.30 383124 21 1057 380152 0.28 381209 22 1101 377265 0.29 378366 23 1070 373300 0.29 374370 24 984 371419 0.26 372403 25 984 368513 0.27 369497 26 928 366743 0.25 367671 27 1021 362262 0.28 363283 28 964 359218 0.27 360182 29 920 356895 0.26 357815 30 968 355122 0.27 356090 31 930 349832 0.27 350762 32 901 348085 0.26 348986 33 908 344161 0.26 345069 34 878 340926 0.26 341804 35 892 339150 0.26 340042 36 887 335887 0.26 336774 37 871 331751 0.26 332622 38 879 328786 0.27 329665 39 881 326249 0.27 327130 40 896 322565 0.28 323461 41 811 319446 0.25 320257 42 859 316771 0.27 317630 43 830 312500 0.26 313330 44 764 309396 0.25 310160 45 814 306305 0.27 307119 46 810 304775 0.27 305585 47 732 300818 0.24 301550 48 811 297984 0.27 298795 49 764 295865 0.26 296629 50 726 292156 0.25 292882 51 733 289195 0.25 289928 52 760 287006 0.26 287766 53 757 283333 0.27 284090 54 734 280040 0.26 280774 55 697 276991 0.25 277688 56 760 273717 0.28 274477 57 729 271312 0.27 272041 58 711 269124 0.26 269835 59 719 266308 0.27 267027 60 701 261768 0.27 262469 61 674 260224 0.26 260898 62 707 258160 0.27 258867 63 696 254942 0.27 255638 64 652 252803 0.26 253455 65 648 250073 0.26 250721 66 648 246209 0.26 246857 67 643 244572 0.26 245215 68 644 241996 0.27 242640 69 629 240305 0.26 240934 70 634 238059 0.27 238693 71 641 234482 0.27 235123 72 605 233144 0.26 233749 73 595 230830 0.26 231425 74 605 227619 0.27 228224 75 575 225135 0.25 225710 76 579 222168 0.26 222747 77 595 219824 0.27 220419 78 543 216555 0.25 217098 79 585 214243 0.27 214828 80 565 211819 0.27 212384 81 578 209264 0.28 209842 82 527 206053 0.26 206580 83 541 204549 0.26 205090 84 541 201629 0.27 202170 85 482 199069 0.24 199551 86 501 197832 0.25 198333 87 534 195220 0.27 195754 88 482 191952 0.25 192434 89 517 191186 0.27 191703 90 473 188197 0.25 188670 91 520 186508 0.28 187028 92 480 183914 0.26 184394 93 499 181576 0.27 182075 94 471 179560 0.26 180031 95 435 177348 0.24 177783 96 453 175046 0.26 175499 97 472 173607 0.27 174079 98 441 171220 0.26 171661 99 428 169183 0.25 169611 100 463 167904 0.27 168367 101 427 165332 0.26 165759 102 432 163754 0.26 164186 103 428 161398 0.26 161826 104 485 159088 0.30 159573 105 433 157246 0.27 157679 106 436 155856 0.28 156292 107 381 153821 0.25 154202 108 423 151860 0.28 152283 109 390 150156 0.26 150546 110 414 147952 0.28 148366 111 399 147051 0.27 147450 112 398 145135 0.27 145533 113 378 143297 0.26 143675 114 359 141486 0.25 141845 115 400 139817 0.29 140217 116 354 136735 0.26 137089 117 394 136312 0.29 136706 118 361 134512 0.27 134873 119 370 132056 0.28 132426 120 384 130366 0.29 130750 121 351 129220 0.27 129571 122 365 127432 0.29 127797 123 363 125314 0.29 125677 124 343 123358 0.28 123701 125 311 122529 0.25 122840 126 345 121688 0.28 122033 127 313 119481 0.26 119794 128 330 117988 0.28 118318 129 317 116559 0.27 116876 130 340 115021 0.29 115361 131 315 113322 0.28 113637 132 296 111879 0.26 112175 133 312 110067 0.28 110379 134 298 109037 0.27 109335 135 334 107622 0.31 107956 136 304 105516 0.29 105820 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 28027 1733125 1.59 1761152 2 18964 1738023 1.08 1756987 3 14216 1736854 0.81 1751070 4 11578 1737055 0.66 1748633 5 10116 1729335 0.58 1739451 6 9228 1720413 0.53 1729641 7 8862 1709916 0.52 1718778 8 8670 1694648 0.51 1703318 9 8105 1681973 0.48 1690078 10 7788 1666816 0.47 1674604 11 7358 1657465 0.44 1664823 12 7011 1648597 0.42 1655608 13 6794 1638227 0.41 1645021 14 6305 1628127 0.39 1634432 15 6044 1617189 0.37 1623233 16 5745 1599607 0.36 1605352 17 5586 1586944 0.35 1592530 18 5237 1574222 0.33 1579459 19 5089 1560414 0.33 1565503 20 4959 1548760 0.32 1553719 21 4863 1536827 0.32 1541690 22 4635 1524646 0.30 1529281 23 4492 1514662 0.30 1519154 24 4506 1500107 0.30 1504613 25 4380 1489400 0.29 1493780 26 4304 1473098 0.29 1477402 27 4236 1462606 0.29 1466842 28 4162 1446552 0.29 1450714 29 3991 1435665 0.28 1439656 30 4061 1420840 0.29 1424901 31 3902 1409326 0.28 1413228 32 3880 1398471 0.28 1402351 33 3936 1388434 0.28 1392370 34 3969 1376948 0.29 1380917 35 3696 1366800 0.27 1370496 36 3980 1352660 0.29 1356640 37 3705 1341652 0.28 1345357 38 3699 1328731 0.28 1332430 39 3691 1313487 0.28 1317178 40 3540 1301399 0.27 1304939 41 3609 1289228 0.28 1292837 42 3538 1275070 0.28 1278608 43 3636 1266034 0.29 1269670 44 3527 1253916 0.28 1257443 45 3494 1241184 0.28 1244678 46 3388 1230837 0.27 1234225 47 3378 1219917 0.28 1223295 48 3394 1207867 0.28 1211261 49 3418 1196080 0.28 1199498 50 3185 1183535 0.27 1186720 51 3296 1170238 0.28 1173534 52 3295 1159712 0.28 1163007 53 3394 1146392 0.30 1149786 54 3221 1136327 0.28 1139548 55 3099 1125953 0.27 1129052 56 3102 1114846 0.28 1117948 57 3139 1103674 0.28 1106813 58 3021 1091304 0.28 1094325 59 3175 1078976 0.29 1082151 60 2987 1067714 0.28 1070701 61 2905 1056541 0.27 1059446 62 2982 1045010 0.28 1047992 63 2919 1034129 0.28 1037048 64 2966 1024566 0.29 1027532 65 2986 1014744 0.29 1017730 66 3011 1005913 0.30 1008924 67 2728 994069 0.27 996797 68 2743 984162 0.28 986905 69 2860 973354 0.29 976214 70 2764 962490 0.29 965254 71 2723 949048 0.29 951771 72 2713 939737 0.29 942450 73 2824 931930 0.30 934754 74 2737 924727 0.30 927464 75 2642 914553 0.29 917195 76 2707 905906 0.30 908613 77 2692 895634 0.30 898326 78 2644 883934 0.30 886578 79 2539 873240 0.29 875779 80 2488 862312 0.29 864800 81 2468 851871 0.29 854339 82 2438 843044 0.29 845482 83 2463 832406 0.30 834869 84 2601 822903 0.32 825504 85 2439 816418 0.30 818857 86 2543 807440 0.31 809983 87 2399 796801 0.30 799200 88 2238 787684 0.28 789922 89 2266 776291 0.29 778557 90 2335 769763 0.30 772098 91 2365 758378 0.31 760743 92 2235 750130 0.30 752365 93 2328 740890 0.31 743218 94 2185 732893 0.30 735078 95 2148 724768 0.30 726916 96 2149 717354 0.30 719503 97 2050 707160 0.29 709210 98 2040 698823 0.29 700863 99 2148 691244 0.31 693392 100 2168 681815 0.32 683983 101 1980 674435 0.29 676415 102 1999 665960 0.30 667959 103 1989 657727 0.30 659716 104 2089 650748 0.32 652837 105 2011 641202 0.31 643213 106 2060 635383 0.32 637443 107 1999 628501 0.32 630500 108 2004 620302 0.32 622306 109 1902 611750 0.31 613652 110 1978 603842 0.33 605820 111 1886 596152 0.32 598038 112 1824 587947 0.31 589771 113 1873 581037 0.32 582910 114 1777 573918 0.31 575695 115 2063 567101 0.36 569164 116 1941 561112 0.34 563053 117 1813 552940 0.33 554753 118 1820 547123 0.33 548943 119 1695 541260 0.31 542955 120 1899 533446 0.35 535345 121 1613 525775 0.31 527388 122 1776 518292 0.34 520068 123 1667 510957 0.33 512624 124 1714 504759 0.34 506473 125 1771 498645 0.35 500416 126 1719 492944 0.35 494663 127 1665 486244 0.34 487909 128 1623 480239 0.34 481862 129 1742 473981 0.37 475723 130 1725 468440 0.37 470165 131 1672 461626 0.36 463298 132 1615 455836 0.35 457451 133 1553 449684 0.34 451237 134 1583 443534 0.36 445117 135 1718 438284 0.39 440002 136 1867 428330 0.43 430197