CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 86278 346039 19.96 432317 2 85802 335499 20.37 421301 3 85799 334554 20.41 420353 4 84980 336680 20.15 421660 5 84683 336522 20.10 421205 6 84603 338070 20.02 422673 7 85500 340104 20.09 425604 8 86311 348157 19.87 434468 9 87554 349859 20.02 437413 10 87158 347184 20.07 434342 11 86934 346843 20.04 433777 12 87076 344249 20.19 431325 13 87659 343352 20.34 431011 14 87773 343962 20.33 431735 15 86823 339760 20.35 426583 16 86505 337370 20.41 423875 17 86365 340359 20.24 426724 18 87165 343405 20.24 430570 19 86571 343975 20.11 430546 20 87248 344898 20.19 432146 21 86618 343600 20.13 430218 22 85836 341649 20.08 427485 23 86713 342086 20.22 428799 24 85965 339169 20.22 425134 25 86930 339779 20.37 426709 26 86614 340959 20.26 427573 27 85905 340367 20.15 426272 28 86325 341825 20.16 428150 29 86438 340351 20.25 426789 30 87244 340310 20.41 427554 31 86373 340851 20.22 427224 32 87218 343664 20.24 430882 33 86295 342115 20.14 428410 34 86657 342282 20.20 428939 35 86848 339084 20.39 425932 36 86506 338976 20.33 425482 37 86273 339411 20.27 425684 38 86223 343689 20.06 429912 39 85375 341480 20.00 426855 40 86715 340158 20.31 426873 41 86609 339549 20.32 426158 42 86360 338147 20.34 424507 43 85943 339839 20.18 425782 44 86850 339892 20.35 426742 45 85829 339972 20.16 425801 46 86290 337527 20.36 423817 47 85715 339139 20.18 424854 48 85446 337541 20.20 422987 49 85871 336767 20.32 422638 50 86017 340200 20.18 426217 51 85744 337271 20.27 423015 52 86159 338310 20.30 424469 53 86139 338630 20.28 424769 54 86611 339637 20.32 426248 55 86354 336706 20.41 423060 56 85836 338000 20.25 423836 57 86098 336287 20.38 422385 58 85710 337248 20.26 422958 59 85931 337372 20.30 423303 60 86042 336745 20.35 422787 61 86330 336576 20.41 422906 62 86182 337813 20.33 423995 63 85780 335080 20.38 420860 64 85242 334903 20.29 420145 65 85551 333761 20.40 419312 66 85681 336699 20.29 422380 67 86279 334893 20.49 421172 68 87025 337720 20.49 424745 69 86399 337481 20.38 423880 70 85863 337563 20.28 423426 71 86337 335192 20.48 421529 72 86388 334474 20.53 420862 73 85704 334042 20.42 419746 74 86403 336588 20.43 422991 75 86233 334707 20.49 420940 76 86465 334798 20.53 421263 77 86081 333595 20.51 419676 78 85427 332909 20.42 418336 79 85796 333369 20.47 419165 80 85596 333493 20.42 419089 81 85750 335116 20.37 420866 82 85758 333969 20.43 419727 83 86544 334484 20.56 421028 84 86087 333616 20.51 419703 85 85893 332857 20.51 418750 86 86281 333680 20.55 419961 87 85794 332462 20.51 418256 88 85987 333962 20.48 419949 89 85830 334266 20.43 420096 90 86352 333675 20.56 420027 91 85965 332292 20.55 418257 92 86070 332125 20.58 418195 93 85947 332771 20.53 418718 94 85997 332610 20.54 418607 95 86049 333675 20.50 419724 96 85997 331070 20.62 417067 97 85681 330767 20.57 416448 98 86265 330549 20.70 416814 99 86602 330563 20.76 417165 100 86965 331002 20.81 417967 101 86280 331084 20.67 417364 102 86641 329775 20.81 416416 103 86124 329940 20.70 416064 104 86308 327735 20.85 414043 105 86021 328376 20.76 414397 106 85869 327848 20.76 413717 107 86521 329049 20.82 415570 108 86816 328101 20.92 414917 109 86400 327860 20.86 414260 110 86557 328408 20.86 414965 111 86189 326536 20.88 412725 112 85910 327494 20.78 413404 113 86315 326991 20.88 413306 114 86316 326296 20.92 412612 115 86516 323278 21.11 409794 116 86924 326068 21.05 412992 117 86587 324280 21.07 410867 118 86740 323733 21.13 410473 119 86895 322442 21.23 409337 120 86464 322053 21.17 408517 121 86963 321354 21.30 408317 122 86843 321190 21.28 408033 123 86461 321166 21.21 407627 124 86467 319923 21.28 406390 125 86807 318689 21.41 405496 126 86609 318687 21.37 405296 127 86456 317860 21.38 404316 128 86167 317698 21.34 403865 129 86592 315291 21.55 401883 130 86022 315785 21.41 401807 131 86027 315065 21.45 401092 132 86144 313582 21.55 399726 133 85505 312512 21.48 398017 134 86268 312235 21.65 398503 135 86248 310992 21.71 397240 136 85689 310672 21.62 396361 137 85563 310880 21.58 396443 138 85585 309582 21.66 395167 139 85638 308247 21.74 393885 140 85362 308366 21.68 393728 141 90821 310114 22.65 400935 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2266 593969 0.38 596235 2 1839 592975 0.31 594814 3 1646 584151 0.28 585797 4 1793 584632 0.31 586425 5 1793 586690 0.30 588483 6 1678 587846 0.28 589524 7 1671 596011 0.28 597682 8 1548 598570 0.26 600118 9 1667 596585 0.28 598252 10 1680 597897 0.28 599577 11 1541 598686 0.26 600227 12 1630 599473 0.27 601103 13 1725 600375 0.29 602100 14 1677 592785 0.28 594462 15 1589 589600 0.27 591189 16 1550 589038 0.26 590588 17 1997 595292 0.33 597289 18 1662 592662 0.28 594324 19 1675 596954 0.28 598629 20 1672 599496 0.28 601168 21 1638 596489 0.27 598127 22 1700 590694 0.29 592394 23 1623 593806 0.27 595429 24 1582 595006 0.27 596588 25 1643 593814 0.28 595457 26 1570 593832 0.26 595402 27 1595 592189 0.27 593784 28 1701 592250 0.29 593951 29 1596 592376 0.27 593972 30 1685 594779 0.28 596464 31 1661 596054 0.28 597715 32 1722 596622 0.29 598344 33 1611 589897 0.27 591508 34 1599 592339 0.27 593938 35 1635 592817 0.28 594452 36 1660 589640 0.28 591300 37 1609 592974 0.27 594583 38 1717 588527 0.29 590244 39 1536 587169 0.26 588705 40 1630 589294 0.28 590924 41 1659 590744 0.28 592403 42 1686 591864 0.28 593550 43 1575 590262 0.27 591837 44 1703 590822 0.29 592525 45 1720 587991 0.29 589711 46 1711 593217 0.29 594928 47 1750 588415 0.30 590165 48 1790 592093 0.30 593883 49 1879 588810 0.32 590689 50 1974 589009 0.33 590983 51 1896 587191 0.32 589087 52 1913 591755 0.32 593668 53 2016 593317 0.34 595333 54 1941 590088 0.33 592029 55 1964 586169 0.33 588133 56 2053 585830 0.35 587883 57 2193 585096 0.37 587289 58 2058 585722 0.35 587780 59 2012 586211 0.34 588223 60 2139 586618 0.36 588757 61 2109 585983 0.36 588092 62 2123 588834 0.36 590957 63 2240 587968 0.38 590208 64 2305 587196 0.39 589501 65 2269 588153 0.38 590422 66 2259 588434 0.38 590693 67 2423 587613 0.41 590036 68 2486 589794 0.42 592280 69 2423 585485 0.41 587908 70 2340 585480 0.40 587820 71 2397 586630 0.41 589027 72 2472 583911 0.42 586383 73 2482 582967 0.42 585449 74 2581 586992 0.44 589573 75 2618 586815 0.44 589433 76 2624 586491 0.45 589115 77 2817 585766 0.48 588583 78 2733 582829 0.47 585562 79 2716 583650 0.46 586366 80 2874 583590 0.49 586464 81 2813 583905 0.48 586718 82 2958 584325 0.50 587283 83 3129 583372 0.53 586501 84 3112 583039 0.53 586151 85 3105 583443 0.53 586548 86 3300 584072 0.56 587372 87 3243 579678 0.56 582921 88 3315 583183 0.57 586498 89 3495 583910 0.59 587405 90 3466 580841 0.59 584307 91 3563 578515 0.61 582078 92 3710 581026 0.63 584736 93 3752 580238 0.64 583990 94 3936 580556 0.67 584492 95 4151 580612 0.71 584763 96 4178 578664 0.72 582842 97 4141 577328 0.71 581469 98 4389 578461 0.75 582850 99 4520 574710 0.78 579230 100 4650 575885 0.80 580535 101 4867 574934 0.84 579801 102 4827 575905 0.83 580732 103 4990 572675 0.86 577665 104 5201 574621 0.90 579822 105 5349 573668 0.92 579017 106 5506 576189 0.95 581695 107 5787 572866 1.00 578653 108 5985 573137 1.03 579122 109 6070 568499 1.06 574569 110 6368 571542 1.10 577910 111 6438 568846 1.12 575284 112 6727 570514 1.17 577241 113 6912 567918 1.20 574830 114 7205 566062 1.26 573267 115 7314 568527 1.27 575841 116 7473 566175 1.30 573648 117 7799 564394 1.36 572193 118 8249 562843 1.44 571092 119 8413 562439 1.47 570852 120 8623 560418 1.52 569041 121 8814 558387 1.55 567201 122 9311 560813 1.63 570124 123 9433 556834 1.67 566267 124 9756 555628 1.73 565384 125 9783 556382 1.73 566165 126 10139 553134 1.80 563273 127 10482 551718 1.86 562200 128 10624 551429 1.89 562053 129 11049 547917 1.98 558966 130 11261 545555 2.02 556816 131 11459 543780 2.06 555239 132 11705 543222 2.11 554927 133 12132 542297 2.19 554429 134 12066 541531 2.18 553597 135 12635 539305 2.29 551940 136 12747 538790 2.31 551537 137 13618 535603 2.48 549221 138 13901 536356 2.53 550257 139 14736 533704 2.69 548440 140 21629 538901 3.86 560530 141 21583 534965 3.88 556548 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9262 2509381 0.37 2518643 2 8157 2506609 0.32 2514766 3 7138 2491702 0.29 2498840 4 7178 2486142 0.29 2493320 5 7580 2474407 0.31 2481987 6 7081 2469138 0.29 2476219 7 7635 2482500 0.31 2490135 8 6845 2503448 0.27 2510293 9 7337 2499501 0.29 2506838 10 7338 2494887 0.29 2502225 11 6853 2500376 0.27 2507229 12 7447 2476358 0.30 2483805 13 6811 2465460 0.28 2472271 14 7512 2459031 0.30 2466543 15 6602 2459137 0.27 2465739 16 6899 2465552 0.28 2472451 17 7009 2475300 0.28 2482309 18 7146 2480267 0.29 2487413 19 6952 2484012 0.28 2490964 20 7180 2491878 0.29 2499058 21 6873 2480219 0.28 2487092 22 7636 2474866 0.31 2482502 23 6787 2484609 0.27 2491396 24 6760 2469935 0.27 2476695 25 6902 2464534 0.28 2471436 26 6935 2467343 0.28 2474278 27 6851 2466948 0.28 2473799 28 6988 2470764 0.28 2477752 29 6831 2475728 0.28 2482559 30 7035 2482043 0.28 2489078 31 6966 2477273 0.28 2484239 32 7196 2481237 0.29 2488433 33 6965 2468301 0.28 2475266 34 6964 2467447 0.28 2474411 35 6860 2457010 0.28 2463870 36 6929 2467580 0.28 2474509 37 6839 2470897 0.28 2477736 38 7043 2474402 0.28 2481445 39 7098 2466767 0.29 2473865 40 6920 2467220 0.28 2474140 41 7125 2465645 0.29 2472770 42 7053 2460742 0.29 2467795 43 7107 2459459 0.29 2466566 44 7303 2470830 0.29 2478133 45 7517 2462560 0.30 2470077 46 7714 2466815 0.31 2474529 47 7873 2461984 0.32 2469857 48 8187 2466125 0.33 2474312 49 8402 2462265 0.34 2470667 50 8706 2470576 0.35 2479282 51 8795 2459920 0.36 2468715 52 8588 2464954 0.35 2473542 53 9005 2463294 0.36 2472299 54 8855 2459709 0.36 2468564 55 8946 2454999 0.36 2463945 56 9152 2459213 0.37 2468365 57 9142 2457160 0.37 2466302 58 9430 2455263 0.38 2464693 59 9388 2461868 0.38 2471256 60 9708 2458526 0.39 2468234 61 9404 2458917 0.38 2468321 62 9780 2461083 0.40 2470863 63 9818 2450210 0.40 2460028 64 10084 2452348 0.41 2462432 65 10308 2453155 0.42 2463463 66 10665 2454144 0.43 2464809 67 10848 2456290 0.44 2467138 68 10857 2456090 0.44 2466947 69 10557 2450362 0.43 2460919 70 10728 2449565 0.44 2460293 71 11100 2449836 0.45 2460936 72 11069 2451304 0.45 2462373 73 11398 2448555 0.46 2459953 74 11597 2457286 0.47 2468883 75 11678 2442564 0.48 2454242 76 11955 2443838 0.49 2455793 77 12329 2440623 0.50 2452952 78 12201 2441333 0.50 2453534 79 12502 2441491 0.51 2453993 80 12768 2444367 0.52 2457135 81 12940 2441194 0.53 2454134 82 13226 2438420 0.54 2451646 83 13445 2436214 0.55 2449659 84 13892 2433400 0.57 2447292 85 14486 2433024 0.59 2447510 86 14714 2438434 0.60 2453148 87 14948 2429316 0.61 2444264 88 15261 2433745 0.62 2449006 89 15822 2431062 0.65 2446884 90 15884 2431365 0.65 2447249 91 16725 2428730 0.68 2445455 92 17208 2431957 0.70 2449165 93 17514 2423496 0.72 2441010 94 18185 2422733 0.75 2440918 95 18599 2427215 0.76 2445814 96 19289 2419773 0.79 2439062 97 19851 2416300 0.81 2436151 98 20399 2414560 0.84 2434959 99 20805 2413644 0.85 2434449 100 21487 2420242 0.88 2441729 101 22465 2418014 0.92 2440479 102 22965 2415478 0.94 2438443 103 23778 2410055 0.98 2433833 104 24689 2411798 1.01 2436487 105 25326 2406819 1.04 2432145 106 26001 2399232 1.07 2425233 107 26592 2395631 1.10 2422223 108 28060 2389147 1.16 2417207 109 28591 2388755 1.18 2417346 110 29659 2392526 1.22 2422185 111 30378 2383246 1.26 2413624 112 31457 2381978 1.30 2413435 113 32733 2380728 1.36 2413461 114 34206 2375548 1.42 2409754 115 34661 2371178 1.44 2405839 116 35765 2370540 1.49 2406305 117 36859 2358787 1.54 2395646 118 37976 2357732 1.59 2395708 119 38777 2348730 1.62 2387507 120 40290 2343429 1.69 2383719 121 41204 2336142 1.73 2377346 122 42489 2340131 1.78 2382620 123 43627 2332576 1.84 2376203 124 44557 2328974 1.88 2373531 125 45691 2324787 1.93 2370478 126 47257 2318049 2.00 2365306 127 48471 2310560 2.05 2359031 128 49551 2307873 2.10 2357424 129 51437 2297092 2.19 2348529 130 52421 2293385 2.23 2345806 131 53608 2285254 2.29 2338862 132 55103 2279665 2.36 2334768 133 56213 2268524 2.42 2324737 134 57366 2271211 2.46 2328577 135 59215 2262737 2.55 2321952 136 61120 2258294 2.64 2319414 137 62982 2255936 2.72 2318918 138 68056 2247607 2.94 2315663 139 69366 2236887 3.01 2306253 140 68500 2232090 2.98 2300590 141 72625 2222528 3.16 2295153 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 80591 297264 21.33 377855 2 79048 295019 21.13 374067 3 78689 292920 21.18 371609 4 77984 290075 21.19 368059 5 77647 289324 21.16 366971 6 77578 287983 21.22 365561 7 77051 286655 21.18 363706 8 76301 285653 21.08 361954 9 75572 285068 20.95 360640 10 75608 283154 21.07 358762 11 75452 281566 21.13 357018 12 74856 281254 21.02 356110 13 74356 281005 20.92 355361 14 73671 280222 20.82 353893 15 73548 279169 20.85 352717 16 72451 278235 20.66 350686 17 72076 276342 20.69 348418 18 71538 273767 20.72 345305 19 70767 271602 20.67 342369 20 70315 269470 20.69 339785 21 70456 267753 20.83 338209 22 69255 265875 20.67 335130 23 68547 264375 20.59 332922 24 68533 262533 20.70 331066 25 67884 262431 20.55 330315 26 66678 261106 20.34 327784 27 66452 257981 20.48 324433 28 66395 255362 20.64 321757 29 65147 253579 20.44 318726 30 64576 251411 20.44 315987 31 64052 249789 20.41 313841 32 63784 247524 20.49 311308 33 63459 246318 20.49 309777 34 63113 244671 20.51 307784 35 62522 241789 20.55 304311 36 61709 241564 20.35 303273 37 61368 238980 20.43 300348 38 60735 237895 20.34 298630 39 60039 234535 20.38 294574 40 59407 232700 20.34 292107 41 58806 231595 20.25 290401 42 58430 228012 20.40 286442 43 57935 227417 20.30 285352 44 57469 224282 20.40 281751 45 56743 223404 20.25 280147 46 56023 221912 20.16 277935 47 55566 219424 20.21 274990 48 55125 217671 20.21 272796 49 54646 214677 20.29 269323 50 54275 214178 20.22 268453 51 53200 211389 20.11 264589 52 52688 209609 20.09 262297 53 52902 207160 20.34 260062 54 52215 206877 20.15 259092 55 51433 204220 20.12 255653 56 50887 201538 20.16 252425 57 50526 199610 20.20 250136 58 49930 198393 20.11 248323 59 49986 197115 20.23 247101 60 49191 195002 20.14 244193 61 48415 192362 20.11 240777 62 48256 190799 20.19 239055 63 47312 187998 20.11 235310 64 46850 187230 20.01 234080 65 46749 185245 20.15 231994 66 45922 182803 20.08 228725 67 45881 181894 20.14 227775 68 45115 180314 20.01 225429 69 44509 178170 19.99 222679 70 44732 175878 20.28 220610 71 43482 174633 19.94 218115 72 43535 173317 20.08 216852 73 42666 171413 19.93 214079 74 42491 170480 19.95 212971 75 41905 167915 19.97 209820 76 41696 166050 20.07 207746 77 41159 164817 19.98 205976 78 40873 162785 20.07 203658 79 40206 160817 20.00 201023 80 39800 159638 19.96 199438 81 39345 157126 20.03 196471 82 38855 154936 20.05 193791 83 38360 153413 20.00 191773 84 37997 152447 19.95 190444 85 37571 150320 20.00 187891 86 37522 149092 20.11 186614 87 36789 147679 19.94 184468 88 36374 146192 19.92 182566 89 35929 144643 19.90 180572 90 35292 142968 19.80 178260 91 35113 141658 19.86 176771 92 34779 139030 20.01 173809 93 34483 137357 20.07 171840 94 33873 136390 19.89 170263 95 33653 134479 20.02 168132 96 33115 133919 19.83 167034 97 32651 132004 19.83 164655 98 32433 130853 19.86 163286 99 32026 129455 19.83 161481 100 31385 127967 19.70 159352 101 31334 125766 19.95 157100 102 31135 124690 19.98 155825 103 29914 123281 19.53 153195 104 29801 121912 19.64 151713 105 29871 120217 19.90 150088 106 29510 118875 19.89 148385 107 28891 118076 19.66 146967 108 28535 116197 19.72 144732 109 28209 115167 19.67 143376 110 27958 114100 19.68 142058 111 27881 112185 19.91 140066 112 27333 110881 19.78 138214 113 26837 109132 19.74 135969 114 26652 108549 19.71 135201 115 26605 107096 19.90 133701 116 25991 105577 19.75 131568 117 25457 104335 19.61 129792 118 25284 103645 19.61 128929 119 25051 101741 19.76 126792 120 24951 101382 19.75 126333 121 24548 100210 19.68 124758 122 24194 98430 19.73 122624 123 23982 97776 19.70 121758 124 23677 95960 19.79 119637 125 23414 95585 19.68 118999 126 22862 93957 19.57 116819 127 22692 92666 19.67 115358 128 22278 91945 19.50 114223 129 22127 90061 19.72 112188 130 21908 89674 19.63 111582 131 21627 87837 19.76 109464 132 21279 86852 19.68 108131 133 20756 86440 19.36 107196 134 20628 84486 19.62 105114 135 20476 83872 19.62 104348 136 19813 82700 19.33 102513 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9974 510786 1.92 520760 2 7674 504874 1.50 512548 3 5725 501852 1.13 507577 4 4826 499813 0.96 504639 5 3977 496510 0.79 500487 6 3516 495116 0.71 498632 7 3432 493321 0.69 496753 8 2814 489976 0.57 492790 9 2542 489398 0.52 491940 10 2417 487638 0.49 490055 11 2306 484954 0.47 487260 12 2127 484630 0.44 486757 13 2026 481549 0.42 483575 14 1871 478665 0.39 480536 15 1806 477375 0.38 479181 16 1734 476057 0.36 477791 17 1586 473987 0.33 475573 18 1536 470315 0.33 471851 19 1509 468208 0.32 469717 20 1429 464815 0.31 466244 21 1398 463417 0.30 464815 22 1362 459566 0.30 460928 23 1282 454823 0.28 456105 24 1317 454594 0.29 455911 25 1263 450971 0.28 452234 26 1286 448622 0.29 449908 27 1253 444412 0.28 445665 28 1199 441884 0.27 443083 29 1238 438854 0.28 440092 30 1092 434621 0.25 435713 31 1150 432001 0.27 433151 32 1163 429983 0.27 431146 33 1173 426875 0.27 428048 34 1086 422206 0.26 423292 35 1103 420073 0.26 421176 36 1064 416979 0.25 418043 37 1099 414488 0.26 415587 38 1003 410274 0.24 411277 39 1036 407860 0.25 408896 40 1075 402456 0.27 403531 41 1002 399980 0.25 400982 42 978 395321 0.25 396299 43 1008 392504 0.26 393512 44 1083 389949 0.28 391032 45 1068 385820 0.28 386888 46 997 382818 0.26 383815 47 1046 380827 0.27 381873 48 1005 375729 0.27 376734 49 971 373352 0.26 374323 50 946 370155 0.25 371101 51 990 367390 0.27 368380 52 1009 364460 0.28 365469 53 917 360337 0.25 361254 54 914 356527 0.26 357441 55 859 353773 0.24 354632 56 908 350168 0.26 351076 57 887 346689 0.26 347576 58 930 342234 0.27 343164 59 886 340427 0.26 341313 60 883 336816 0.26 337699 61 872 335145 0.26 336017 62 828 330996 0.25 331824 63 832 327406 0.25 328238 64 835 325029 0.26 325864 65 876 321097 0.27 321973 66 831 318250 0.26 319081 67 811 315733 0.26 316544 68 830 313287 0.26 314117 69 822 310551 0.26 311373 70 766 305778 0.25 306544 71 777 303008 0.26 303785 72 764 300630 0.25 301394 73 730 297134 0.25 297864 74 747 293882 0.25 294629 75 747 292396 0.25 293143 76 755 288499 0.26 289254 77 823 285074 0.29 285897 78 719 281222 0.26 281941 79 705 279242 0.25 279947 80 709 275669 0.26 276378 81 707 272433 0.26 273140 82 740 269945 0.27 270685 83 662 266894 0.25 267556 84 646 263328 0.24 263974 85 677 260594 0.26 261271 86 677 258097 0.26 258774 87 688 255000 0.27 255688 88 679 252896 0.27 253575 89 662 250298 0.26 250960 90 631 247664 0.25 248295 91 618 243956 0.25 244574 92 652 241774 0.27 242426 93 666 238329 0.28 238995 94 626 235270 0.27 235896 95 578 233710 0.25 234288 96 539 230870 0.23 231409 97 578 228482 0.25 229060 98 603 225998 0.27 226601 99 573 223352 0.26 223925 100 616 220081 0.28 220697 101 559 218662 0.25 219221 102 527 215255 0.24 215782 103 564 213269 0.26 213833 104 598 210579 0.28 211177 105 534 207851 0.26 208385 106 567 205852 0.27 206419 107 545 203001 0.27 203546 108 562 201251 0.28 201813 109 517 198533 0.26 199050 110 503 196298 0.26 196801 111 522 193816 0.27 194338 112 507 191350 0.26 191857 113 502 189574 0.26 190076 114 464 186878 0.25 187342 115 548 184693 0.30 185241 116 478 182554 0.26 183032 117 452 180253 0.25 180705 118 481 177752 0.27 178233 119 475 176100 0.27 176575 120 462 173651 0.27 174113 121 442 171936 0.26 172378 122 403 169097 0.24 169500 123 426 167335 0.25 167761 124 460 165040 0.28 165500 125 458 163100 0.28 163558 126 461 161077 0.29 161538 127 423 158457 0.27 158880 128 433 157195 0.27 157628 129 412 155448 0.26 155860 130 395 152923 0.26 153318 131 393 151599 0.26 151992 132 478 149313 0.32 149791 133 404 147986 0.27 148390 134 386 145387 0.26 145773 135 438 143741 0.30 144179 136 436 140161 0.31 140597 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 60851 2073682 2.85 2134533 2 42792 2080920 2.01 2123712 3 32232 2083207 1.52 2115439 4 25253 2088123 1.19 2113376 5 20950 2085953 0.99 2106903 6 17800 2078148 0.85 2095948 7 16012 2070425 0.77 2086437 8 14826 2062759 0.71 2077585 9 13409 2048582 0.65 2061991 10 12370 2035574 0.60 2047944 11 11642 2028196 0.57 2039838 12 10800 2015651 0.53 2026451 13 10052 2007939 0.50 2017991 14 9429 1996434 0.47 2005863 15 8952 1988074 0.45 1997026 16 8504 1970430 0.43 1978934 17 7966 1960370 0.40 1968336 18 7548 1947074 0.39 1954622 19 7143 1935516 0.37 1942659 20 6921 1922296 0.36 1929217 21 6602 1909211 0.34 1915813 22 6409 1896370 0.34 1902779 23 6033 1885826 0.32 1891859 24 5730 1875343 0.30 1881073 25 5511 1861363 0.30 1866874 26 5468 1849217 0.29 1854685 27 5549 1837308 0.30 1842857 28 5299 1822465 0.29 1827764 29 4991 1808999 0.28 1813990 30 5150 1794209 0.29 1799359 31 4892 1781735 0.27 1786627 32 4988 1767277 0.28 1772265 33 5068 1755867 0.29 1760935 34 4971 1744606 0.28 1749577 35 4719 1730847 0.27 1735566 36 4828 1720131 0.28 1724959 37 4729 1704498 0.28 1709227 38 4710 1693007 0.28 1697717 39 4688 1680073 0.28 1684761 40 4524 1664871 0.27 1669395 41 4455 1649599 0.27 1654054 42 4414 1635541 0.27 1639955 43 4548 1621258 0.28 1625806 44 4424 1608112 0.27 1612536 45 4445 1597994 0.28 1602439 46 4441 1583002 0.28 1587443 47 4500 1570546 0.29 1575046 48 4410 1554083 0.28 1558493 49 4317 1541982 0.28 1546299 50 4094 1529544 0.27 1533638 51 4303 1515489 0.28 1519792 52 4212 1499547 0.28 1503759 53 4116 1488226 0.28 1492342 54 4182 1473833 0.28 1478015 55 4214 1461375 0.29 1465589 56 4037 1450843 0.28 1454880 57 3913 1437092 0.27 1441005 58 4028 1424460 0.28 1428488 59 3973 1411081 0.28 1415054 60 3989 1395631 0.29 1399620 61 3850 1382360 0.28 1386210 62 3773 1371921 0.27 1375694 63 3745 1358259 0.27 1362004 64 3845 1347706 0.28 1351551 65 3742 1333450 0.28 1337192 66 3902 1321161 0.29 1325063 67 3700 1307705 0.28 1311405 68 3644 1296331 0.28 1299975 69 3834 1281860 0.30 1285694 70 3530 1268915 0.28 1272445 71 3536 1257998 0.28 1261534 72 3545 1244582 0.28 1248127 73 3558 1231722 0.29 1235280 74 3583 1219713 0.29 1223296 75 3428 1205198 0.28 1208626 76 3513 1197355 0.29 1200868 77 3370 1181982 0.28 1185352 78 3336 1171829 0.28 1175165 79 3384 1158379 0.29 1161763 80 3319 1144074 0.29 1147393 81 3271 1134574 0.29 1137845 82 3218 1121569 0.29 1124787 83 3233 1109427 0.29 1112660 84 3358 1096634 0.31 1099992 85 3263 1086714 0.30 1089977 86 3127 1075379 0.29 1078506 87 3202 1062138 0.30 1065340 88 3102 1050527 0.29 1053629 89 3024 1039138 0.29 1042162 90 3028 1026983 0.29 1030011 91 3192 1016871 0.31 1020063 92 2958 1006421 0.29 1009379 93 3043 993886 0.31 996929 94 2924 983874 0.30 986798 95 2788 971714 0.29 974502 96 2788 961429 0.29 964217 97 2799 949358 0.29 952157 98 2792 939554 0.30 942346 99 2782 927949 0.30 930731 100 2799 918303 0.30 921102 101 2673 909608 0.29 912281 102 2749 897630 0.31 900379 103 2610 885994 0.29 888604 104 2884 877423 0.33 880307 105 2734 865483 0.31 868217 106 2740 856323 0.32 859063 107 2654 845506 0.31 848160 108 2572 834686 0.31 837258 109 2636 825393 0.32 828029 110 2674 816180 0.33 818854 111 2484 806912 0.31 809396 112 2500 797000 0.31 799500 113 2469 787394 0.31 789863 114 2492 777712 0.32 780204 115 2702 768769 0.35 771471 116 2519 758725 0.33 761244 117 2453 750479 0.33 752932 118 2336 739799 0.31 742135 119 2494 731225 0.34 733719 120 2494 721940 0.34 724434 121 2298 713233 0.32 715531 122 2278 703466 0.32 705744 123 2252 695721 0.32 697973 124 2258 685777 0.33 688035 125 2321 678389 0.34 680710 126 2295 670139 0.34 672434 127 2277 661540 0.34 663817 128 2278 651495 0.35 653773 129 2286 644146 0.35 646432 130 2217 636635 0.35 638852 131 2304 627421 0.37 629725 132 2159 620567 0.35 622726 133 2140 612896 0.35 615036 134 2113 603567 0.35 605680 135 2353 596094 0.39 598447 136 2463 583830 0.42 586293