CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 43658 186820 18.94 230478 2 43396 182286 19.23 225682 3 42902 181463 19.12 224365 4 43124 184301 18.96 227425 5 42781 184789 18.80 227570 6 43540 185667 19.00 229207 7 43792 185695 19.08 229487 8 44184 190277 18.84 234461 9 44684 191346 18.93 236030 10 44160 188756 18.96 232916 11 43981 190279 18.77 234260 12 44398 188501 19.06 232899 13 44691 187488 19.25 232179 14 44324 189131 18.99 233455 15 44915 187350 19.34 232265 16 44088 186057 19.16 230145 17 44111 188481 18.96 232592 18 44567 187785 19.18 232352 19 44178 189204 18.93 233382 20 44472 189180 19.03 233652 21 44182 189330 18.92 233512 22 44144 187050 19.09 231194 23 44062 188198 18.97 232260 24 44318 186137 19.23 230455 25 44019 187803 18.99 231822 26 44307 187107 19.15 231414 27 44469 187782 19.15 232251 28 44848 187790 19.28 232638 29 44141 186958 19.10 231099 30 44018 187055 19.05 231073 31 44071 187711 19.01 231782 32 44700 189791 19.06 234491 33 44290 188599 19.02 232889 34 45066 188706 19.28 233772 35 44101 188326 18.97 232427 36 44629 187098 19.26 231727 37 44327 187180 19.15 231507 38 44361 189015 19.01 233376 39 43730 188763 18.81 232493 40 44299 187377 19.12 231676 41 44529 187584 19.18 232113 42 44442 186236 19.27 230678 43 44672 187432 19.25 232104 44 44644 188678 19.13 233322 45 44370 186746 19.20 231116 46 44254 187676 19.08 231930 47 44223 186478 19.17 230701 48 44381 186444 19.23 230825 49 43900 185924 19.10 229824 50 44263 188808 18.99 233071 51 44277 185412 19.28 229689 52 44292 186672 19.18 230964 53 44522 187077 19.22 231599 54 44397 187106 19.18 231503 55 44183 185428 19.24 229611 56 44359 186605 19.21 230964 57 44459 186649 19.24 231108 58 44155 187092 19.09 231247 59 44508 187253 19.20 231761 60 44177 184970 19.28 229147 61 44226 185731 19.23 229957 62 44407 186581 19.22 230988 63 44247 185491 19.26 229738 64 44346 185329 19.31 229675 65 44088 184621 19.28 228709 66 44114 186284 19.15 230398 67 44714 185744 19.40 230458 68 44619 187138 19.25 231757 69 44778 187032 19.32 231810 70 44477 186516 19.25 230993 71 44224 185414 19.26 229638 72 44205 185693 19.23 229898 73 44473 184580 19.42 229053 74 44405 186242 19.25 230647 75 44106 184714 19.28 228820 76 44586 185267 19.40 229853 77 44344 184746 19.36 229090 78 44305 185028 19.32 229333 79 44686 182998 19.63 227684 80 44378 183984 19.43 228362 81 44935 184913 19.55 229848 82 44621 185123 19.42 229744 83 44497 184376 19.44 228873 84 44115 184873 19.27 228988 85 44276 185389 19.28 229665 86 44822 185382 19.47 230204 87 44496 183280 19.53 227776 88 44303 185252 19.30 229555 89 44055 184711 19.26 228766 90 44379 183286 19.49 227665 91 44105 183112 19.41 227217 92 44281 183815 19.41 228096 93 43859 184365 19.22 228224 94 44058 183175 19.39 227233 95 44383 184559 19.39 228942 96 45021 183537 19.70 228558 97 44553 183123 19.57 227676 98 44535 183056 19.57 227591 99 44268 182309 19.54 226577 100 44766 182866 19.67 227632 101 44724 183596 19.59 228320 102 44273 182764 19.50 227037 103 44053 182193 19.47 226246 104 44250 181812 19.57 226062 105 44570 181312 19.73 225882 106 43951 182596 19.40 226547 107 44606 181995 19.68 226601 108 44274 181619 19.60 225893 109 44320 181971 19.59 226291 110 44646 183323 19.58 227969 111 44424 180927 19.71 225351 112 44338 181706 19.61 226044 113 44565 181379 19.72 225944 114 44773 181683 19.77 226456 115 44542 179990 19.84 224532 116 44694 181290 19.78 225984 117 44356 180152 19.76 224508 118 44681 180631 19.83 225312 119 45043 179477 20.06 224520 120 44679 179478 19.93 224157 121 44821 177985 20.12 222806 122 44545 178752 19.95 223297 123 44154 178214 19.86 222368 124 45045 178271 20.17 223316 125 43908 178852 19.71 222760 126 44413 177284 20.03 221697 127 44227 178238 19.88 222465 128 44716 177461 20.13 222177 129 44274 176963 20.01 221237 130 44370 175978 20.14 220348 131 44345 175222 20.20 219567 132 44401 175268 20.21 219669 133 43913 173830 20.17 217743 134 44593 175877 20.23 220470 135 43911 175006 20.06 218917 136 43955 173495 20.21 217450 137 44333 174079 20.30 218412 138 44112 174567 20.17 218679 139 43966 174224 20.15 218190 140 44090 173443 20.27 217533 141 46061 174120 20.92 220181 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1023 321082 0.32 322105 2 766 322619 0.24 323385 3 739 317879 0.23 318618 4 797 317808 0.25 318605 5 759 320415 0.24 321174 6 753 320509 0.23 321262 7 738 325809 0.23 326547 8 770 325614 0.24 326384 9 754 326117 0.23 326871 10 718 327688 0.22 328406 11 799 327143 0.24 327942 12 773 328307 0.23 329080 13 797 327750 0.24 328547 14 731 324617 0.22 325348 15 785 322716 0.24 323501 16 790 322533 0.24 323323 17 758 326711 0.23 327469 18 787 325934 0.24 326721 19 788 329012 0.24 329800 20 785 328176 0.24 328961 21 792 325386 0.24 326178 22 764 322185 0.24 322949 23 799 324165 0.25 324964 24 794 325185 0.24 325979 25 805 324243 0.25 325048 26 784 326602 0.24 327386 27 791 325765 0.24 326556 28 777 325092 0.24 325869 29 821 325637 0.25 326458 30 783 324772 0.24 325555 31 778 326885 0.24 327663 32 798 328345 0.24 329143 33 754 322353 0.23 323107 34 831 326008 0.25 326839 35 825 324538 0.25 325363 36 756 323566 0.23 324322 37 761 325181 0.23 325942 38 770 323795 0.24 324565 39 767 323500 0.24 324267 40 728 324628 0.22 325356 41 727 325712 0.22 326439 42 800 326415 0.24 327215 43 775 324312 0.24 325087 44 801 322469 0.25 323270 45 792 321678 0.25 322470 46 850 325966 0.26 326816 47 795 323072 0.25 323867 48 893 326715 0.27 327608 49 976 323640 0.30 324616 50 940 323468 0.29 324408 51 956 322717 0.30 323673 52 923 323731 0.28 324654 53 949 326401 0.29 327350 54 940 324792 0.29 325732 55 974 321586 0.30 322560 56 995 321746 0.31 322741 57 995 322554 0.31 323549 58 967 322676 0.30 323643 59 1000 323326 0.31 324326 60 1031 322301 0.32 323332 61 987 321036 0.31 322023 62 1064 322538 0.33 323602 63 1008 323431 0.31 324439 64 1086 322842 0.34 323928 65 1127 322616 0.35 323743 66 1143 322573 0.35 323716 67 1208 322045 0.37 323253 68 1161 323673 0.36 324834 69 1130 320806 0.35 321936 70 1129 322690 0.35 323819 71 1134 322113 0.35 323247 72 1113 320171 0.35 321284 73 1237 319941 0.39 321178 74 1224 323503 0.38 324727 75 1220 322696 0.38 323916 76 1314 322990 0.41 324304 77 1305 323027 0.40 324332 78 1298 320909 0.40 322207 79 1314 320275 0.41 321589 80 1298 320668 0.40 321966 81 1330 322404 0.41 323734 82 1378 321811 0.43 323189 83 1435 320111 0.45 321546 84 1449 320966 0.45 322415 85 1424 321470 0.44 322894 86 1445 321403 0.45 322848 87 1512 319800 0.47 321312 88 1536 319519 0.48 321055 89 1602 319158 0.50 320760 90 1608 319285 0.50 320893 91 1614 318347 0.50 319961 92 1679 319700 0.52 321379 93 1772 318399 0.55 320171 94 1810 319919 0.56 321729 95 1850 319219 0.58 321069 96 1874 319377 0.58 321251 97 1899 317900 0.59 319799 98 1934 319045 0.60 320979 99 2026 317223 0.63 319249 100 2085 316674 0.65 318759 101 2178 316036 0.68 318214 102 2272 318727 0.71 320999 103 2241 315917 0.70 318158 104 2362 316366 0.74 318728 105 2317 316090 0.73 318407 106 2472 317824 0.77 320296 107 2560 316808 0.80 319368 108 2594 315617 0.82 318211 109 2720 314557 0.86 317277 110 2879 315135 0.91 318014 111 2850 313594 0.90 316444 112 2893 315541 0.91 318434 113 3055 313442 0.97 316497 114 3130 314144 0.99 317274 115 3229 313113 1.02 316342 116 3348 311599 1.06 314947 117 3349 311857 1.06 315206 118 3399 312104 1.08 315503 119 3620 311191 1.15 314811 120 3546 309442 1.13 312988 121 3830 309466 1.22 313296 122 3822 310681 1.22 314503 123 4017 308798 1.28 312815 124 3979 308072 1.28 312051 125 4143 307520 1.33 311663 126 4248 307755 1.36 312003 127 4379 305685 1.41 310064 128 4436 305132 1.43 309568 129 4540 304965 1.47 309505 130 4804 304527 1.55 309331 131 4789 303845 1.55 308634 132 4814 301602 1.57 306416 133 5035 303198 1.63 308233 134 4954 302562 1.61 307516 135 5207 301352 1.70 306559 136 5292 300078 1.73 305370 137 5752 298984 1.89 304736 138 5697 300454 1.86 306151 139 6003 298836 1.97 304839 140 8737 302297 2.81 311034 141 8583 299874 2.78 308457 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3714 1358439 0.27 1362153 2 3104 1360407 0.23 1363511 3 3142 1350846 0.23 1353988 4 3076 1352682 0.23 1355758 5 3114 1346271 0.23 1349385 6 2938 1345274 0.22 1348212 7 3146 1347646 0.23 1350792 8 3138 1359617 0.23 1362755 9 3160 1355454 0.23 1358614 10 3117 1350631 0.23 1353748 11 3089 1355875 0.23 1358964 12 3172 1344189 0.24 1347361 13 3128 1337747 0.23 1340875 14 3142 1337524 0.23 1340666 15 3108 1340393 0.23 1343501 16 3166 1341194 0.24 1344360 17 3207 1347138 0.24 1350345 18 3240 1348421 0.24 1351661 19 3221 1348842 0.24 1352063 20 3203 1352147 0.24 1355350 21 3113 1345194 0.23 1348307 22 3174 1344006 0.24 1347180 23 3202 1352934 0.24 1356136 24 3181 1344415 0.24 1347596 25 3159 1343719 0.23 1346878 26 3293 1345260 0.24 1348553 27 3174 1343897 0.24 1347071 28 3216 1344957 0.24 1348173 29 3112 1345848 0.23 1348960 30 3220 1350353 0.24 1353573 31 3052 1346928 0.23 1349980 32 3286 1352640 0.24 1355926 33 3217 1342762 0.24 1345979 34 3136 1342725 0.23 1345861 35 3123 1339139 0.23 1342262 36 3193 1343298 0.24 1346491 37 3144 1345553 0.23 1348697 38 3188 1349050 0.24 1352238 39 3273 1342471 0.24 1345744 40 3234 1339929 0.24 1343163 41 3307 1342529 0.25 1345836 42 3391 1337127 0.25 1340518 43 3328 1338924 0.25 1342252 44 3497 1343999 0.26 1347496 45 3455 1340299 0.26 1343754 46 3578 1343021 0.27 1346599 47 3707 1342188 0.28 1345895 48 3905 1342766 0.29 1346671 49 3998 1340962 0.30 1344960 50 4020 1343211 0.30 1347231 51 4116 1338855 0.31 1342971 52 4184 1342134 0.31 1346318 53 4199 1342133 0.31 1346332 54 4108 1339880 0.31 1343988 55 4257 1334732 0.32 1338989 56 4379 1340360 0.33 1344739 57 4474 1337501 0.33 1341975 58 4348 1339692 0.32 1344040 59 4408 1339033 0.33 1343441 60 4652 1341161 0.35 1345813 61 4542 1334985 0.34 1339527 62 4568 1339616 0.34 1344184 63 4617 1331343 0.35 1335960 64 4786 1335844 0.36 1340630 65 4791 1335643 0.36 1340434 66 4977 1340881 0.37 1345858 67 4951 1338251 0.37 1343202 68 4951 1340272 0.37 1345223 69 4874 1332648 0.36 1337522 70 5019 1332410 0.38 1337429 71 5094 1332555 0.38 1337649 72 4996 1334295 0.37 1339291 73 5310 1328829 0.40 1334139 74 5393 1340354 0.40 1345747 75 5334 1332477 0.40 1337811 76 5463 1333794 0.41 1339257 77 5631 1330906 0.42 1336537 78 5562 1331458 0.42 1337020 79 5723 1329678 0.43 1335401 80 5891 1333708 0.44 1339599 81 5832 1326897 0.44 1332729 82 6000 1328068 0.45 1334068 83 6031 1326592 0.45 1332623 84 6165 1326013 0.46 1332178 85 6258 1328010 0.47 1334268 86 6587 1330309 0.49 1336896 87 6532 1323823 0.49 1330355 88 6881 1325009 0.52 1331890 89 6965 1327611 0.52 1334576 90 7124 1327397 0.53 1334521 91 7330 1322261 0.55 1329591 92 7588 1327493 0.57 1335081 93 7820 1321064 0.59 1328884 94 8068 1321976 0.61 1330044 95 8174 1323619 0.61 1331793 96 8300 1318221 0.63 1326521 97 8552 1319125 0.64 1327677 98 9009 1320602 0.68 1329611 99 9048 1317877 0.68 1326925 100 9480 1320252 0.71 1329732 101 9779 1318802 0.74 1328581 102 10132 1316919 0.76 1327051 103 10333 1315613 0.78 1325946 104 10483 1316450 0.79 1326933 105 10957 1316174 0.83 1327131 106 11238 1311684 0.85 1322922 107 11754 1312413 0.89 1324167 108 11851 1309873 0.90 1321724 109 12247 1307836 0.93 1320083 110 12718 1310913 0.96 1323631 111 13304 1304680 1.01 1317984 112 13330 1306008 1.01 1319338 113 13689 1303170 1.04 1316859 114 14370 1300002 1.09 1314372 115 14422 1298143 1.10 1312565 116 14999 1301044 1.14 1316043 117 15441 1294085 1.18 1309526 118 16040 1293078 1.23 1309118 119 16386 1291896 1.25 1308282 120 16901 1287888 1.30 1304789 121 17234 1283835 1.32 1301069 122 17586 1286801 1.35 1304387 123 18120 1285461 1.39 1303581 124 18663 1281183 1.44 1299846 125 18942 1281197 1.46 1300139 126 19662 1277800 1.52 1297462 127 19925 1272412 1.54 1292337 128 20409 1274917 1.58 1295326 129 20940 1269883 1.62 1290823 130 21393 1270476 1.66 1291869 131 21749 1264291 1.69 1286040 132 22374 1262208 1.74 1284582 133 22928 1257700 1.79 1280628 134 23200 1257390 1.81 1280590 135 24017 1254389 1.88 1278406 136 24516 1252725 1.92 1277241 137 25877 1255831 2.02 1281708 138 27632 1251577 2.16 1279209 139 28229 1246218 2.21 1274447 140 27797 1243432 2.19 1271229 141 29544 1239812 2.33 1269356 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 41520 164288 20.17 205808 2 41394 162257 20.33 203651 3 41297 163077 20.21 204374 4 40966 162398 20.14 203364 5 40735 161991 20.09 202726 6 40808 161347 20.19 202155 7 40373 161620 19.99 201993 8 40628 161021 20.15 201649 9 40268 160508 20.06 200776 10 40037 161239 19.89 201276 11 39767 160054 19.90 199821 12 40261 160449 20.06 200710 13 39648 160068 19.85 199716 14 39749 159773 19.92 199522 15 39614 160101 19.84 199715 16 39020 159774 19.63 198794 17 38896 159822 19.57 198718 18 38658 159431 19.52 198089 19 38624 157073 19.74 195697 20 38394 156467 19.70 194861 21 37608 156593 19.37 194201 22 38348 156124 19.72 194472 23 37924 155159 19.64 193083 24 37665 154916 19.56 192581 25 37265 154397 19.44 191662 26 37325 153414 19.57 190739 27 36883 152312 19.49 189195 28 36778 152474 19.43 189252 29 36505 150886 19.48 187391 30 36277 150649 19.41 186926 31 36237 150015 19.46 186252 32 35885 149051 19.40 184936 33 36070 148687 19.52 184757 34 35335 147488 19.33 182823 35 34906 147124 19.18 182030 36 35360 146048 19.49 181408 37 35360 145958 19.50 181318 38 34366 144248 19.24 178614 39 34260 143289 19.30 177549 40 34135 142615 19.31 176750 41 33939 141015 19.40 174954 42 33816 141300 19.31 175116 43 33575 141022 19.23 174597 44 33110 139729 19.16 172839 45 32666 138219 19.12 170885 46 32639 137544 19.18 170183 47 32306 136023 19.19 168329 48 32242 136407 19.12 168649 49 31895 134480 19.17 166375 50 31885 134724 19.14 166609 51 31578 133279 19.15 164857 52 31704 131848 19.38 163552 53 31078 131240 19.15 162318 54 30910 129928 19.22 160838 55 30853 129451 19.25 160304 56 30471 128764 19.14 159235 57 30461 128049 19.22 158510 58 30167 127239 19.17 157406 59 29783 125958 19.12 155741 60 29535 124786 19.14 154321 61 29441 123971 19.19 153412 62 29132 124037 19.02 153169 63 28913 122599 19.08 151512 64 28579 121313 19.07 149892 65 28375 120516 19.06 148891 66 28466 119954 19.18 148420 67 27969 119257 19.00 147226 68 27979 117866 19.18 145845 69 27686 117208 19.11 144894 70 27440 116679 19.04 144119 71 27516 115237 19.28 142753 72 27081 114423 19.14 141504 73 27294 113722 19.36 141016 74 26383 113033 18.92 139416 75 26440 112379 19.05 138819 76 26251 111494 19.06 137745 77 26021 109989 19.13 136010 78 25775 109800 19.01 135575 79 25810 107917 19.30 133727 80 25270 107243 19.07 132513 81 24969 107336 18.87 132305 82 24875 105166 19.13 130041 83 24838 104090 19.27 128928 84 24364 104355 18.93 128719 85 24265 102631 19.12 126896 86 23820 102455 18.86 126275 87 24009 101222 19.17 125231 88 23207 100288 18.79 123495 89 23379 99483 19.03 122862 90 23313 98681 19.11 121994 91 23172 98282 19.08 121454 92 22714 97016 18.97 119730 93 22606 96107 19.04 118713 94 22512 95801 19.03 118313 95 22245 94578 19.04 116823 96 21905 93459 18.99 115364 97 21801 92930 19.00 114731 98 21335 91484 18.91 112819 99 21268 91239 18.90 112507 100 21279 90580 19.02 111859 101 20952 89742 18.93 110694 102 20775 88970 18.93 109745 103 20473 87833 18.90 108306 104 20373 87325 18.92 107698 105 19919 86129 18.78 106048 106 20035 85248 19.03 105283 107 19712 84467 18.92 104179 108 19601 83819 18.95 103420 109 19471 83019 19.00 102490 110 19147 82471 18.84 101618 111 19214 81635 19.05 100849 112 18665 80629 18.80 99294 113 18916 79944 19.13 98860 114 18570 79000 19.03 97570 115 18263 78186 18.94 96449 116 18055 77348 18.92 95403 117 17844 76537 18.91 94381 118 17740 76035 18.92 93775 119 17507 74903 18.94 92410 120 17313 74480 18.86 91793 121 17278 73553 19.02 90831 122 16967 73377 18.78 90344 123 16817 72254 18.88 89071 124 17031 71435 19.25 88466 125 16497 70756 18.91 87253 126 16269 69939 18.87 86208 127 16216 69140 19.00 85356 128 16021 68916 18.86 84937 129 15804 67962 18.87 83766 130 15738 67435 18.92 83173 131 15360 66267 18.82 81627 132 15156 66195 18.63 81351 133 15326 65107 19.05 80433 134 14896 64721 18.71 79617 135 14797 63526 18.89 78323 136 14511 62493 18.84 77004 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 5091 279322 1.79 284413 2 3816 279176 1.35 282992 3 2768 278063 0.99 280831 4 2297 277675 0.82 279972 5 1934 277027 0.69 278961 6 1660 276728 0.60 278388 7 1564 275549 0.56 277113 8 1346 275943 0.49 277289 9 1207 275766 0.44 276973 10 1154 275434 0.42 276588 11 1089 276433 0.39 277522 12 951 273567 0.35 274518 13 1015 274063 0.37 275078 14 880 274311 0.32 275191 15 814 274150 0.30 274964 16 820 273359 0.30 274179 17 789 272848 0.29 273637 18 742 272551 0.27 273293 19 756 271960 0.28 272716 20 696 269959 0.26 270655 21 705 269733 0.26 270438 22 680 267762 0.25 268442 23 660 269324 0.24 269984 24 642 266181 0.24 266823 25 650 265814 0.24 266464 26 615 264990 0.23 265605 27 624 263733 0.24 264357 28 614 261398 0.23 262012 29 585 261776 0.22 262361 30 590 259973 0.23 260563 31 602 258869 0.23 259471 32 571 256452 0.22 257023 33 572 255558 0.22 256130 34 543 254603 0.21 255146 35 555 252744 0.22 253299 36 583 251257 0.23 251840 37 541 250418 0.22 250959 38 523 250406 0.21 250929 39 535 247537 0.22 248072 40 569 246511 0.23 247080 41 548 244438 0.22 244986 42 513 242281 0.21 242794 43 562 241448 0.23 242010 44 566 239942 0.24 240508 45 554 239148 0.23 239702 46 527 237136 0.22 237663 47 530 236028 0.22 236558 48 560 234269 0.24 234829 49 529 233578 0.23 234107 50 510 231489 0.22 231999 51 523 230445 0.23 230968 52 558 228613 0.24 229171 53 507 226398 0.22 226905 54 487 225025 0.22 225512 55 537 223183 0.24 223720 56 507 222779 0.23 223286 57 518 221271 0.23 221789 58 474 218709 0.22 219183 59 480 217061 0.22 217541 60 519 215784 0.24 216303 61 493 214285 0.23 214778 62 482 213493 0.23 213975 63 507 211186 0.24 211693 64 478 209870 0.23 210348 65 414 208167 0.20 208581 66 451 207403 0.22 207854 67 468 205237 0.23 205705 68 452 204756 0.22 205208 69 453 202047 0.22 202500 70 450 201509 0.22 201959 71 429 198806 0.22 199235 72 454 198324 0.23 198778 73 472 196272 0.24 196744 74 436 196066 0.22 196502 75 441 192827 0.23 193268 76 396 192037 0.21 192433 77 443 190488 0.23 190931 78 420 188456 0.22 188876 79 443 187074 0.24 187517 80 468 185288 0.25 185756 81 467 184319 0.25 184786 82 404 182051 0.22 182455 83 398 180500 0.22 180898 84 413 179406 0.23 179819 85 397 178056 0.22 178453 86 389 175535 0.22 175924 87 394 174497 0.23 174891 88 394 173826 0.23 174220 89 394 171136 0.23 171530 90 366 170825 0.21 171191 91 375 168394 0.22 168769 92 354 167350 0.21 167704 93 410 165101 0.25 165511 94 374 164267 0.23 164641 95 397 163596 0.24 163993 96 372 161470 0.23 161842 97 381 160294 0.24 160675 98 393 158450 0.25 158843 99 363 156939 0.23 157302 100 313 155628 0.20 155941 101 339 154564 0.22 154903 102 330 152596 0.22 152926 103 337 150845 0.22 151182 104 330 150451 0.22 150781 105 354 148131 0.24 148485 106 347 147494 0.23 147841 107 338 145553 0.23 145891 108 365 144352 0.25 144717 109 321 142913 0.22 143234 110 311 141210 0.22 141521 111 354 140256 0.25 140610 112 291 138278 0.21 138569 113 315 136994 0.23 137309 114 323 136717 0.24 137040 115 308 134594 0.23 134902 116 320 133584 0.24 133904 117 291 131647 0.22 131938 118 305 131386 0.23 131691 119 279 129568 0.21 129847 120 269 127190 0.21 127459 121 282 126551 0.22 126833 122 273 125178 0.22 125451 123 282 124172 0.23 124454 124 315 122375 0.26 122690 125 300 121420 0.25 121720 126 281 120715 0.23 120996 127 303 119016 0.25 119319 128 320 117821 0.27 118141 129 290 116895 0.25 117185 130 247 115433 0.21 115680 131 282 113956 0.25 114238 132 263 112115 0.23 112378 133 259 111488 0.23 111747 134 272 110413 0.25 110685 135 250 109885 0.23 110135 136 290 106792 0.27 107082 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 31238 1177684 2.58 1208922 2 21526 1177745 1.79 1199271 3 15710 1176479 1.32 1192189 4 11983 1178834 1.01 1190817 5 9939 1176170 0.84 1186109 6 8630 1173061 0.73 1181691 7 7503 1171988 0.64 1179491 8 7020 1167281 0.60 1174301 9 6348 1163165 0.54 1169513 10 5783 1158804 0.50 1164587 11 5411 1156419 0.47 1161830 12 5037 1152517 0.44 1157554 13 4603 1149923 0.40 1154526 14 4481 1144666 0.39 1149147 15 4176 1139396 0.37 1143572 16 3824 1136085 0.34 1139909 17 3711 1132810 0.33 1136521 18 3664 1127790 0.32 1131454 19 3423 1124154 0.30 1127577 20 3283 1119032 0.29 1122315 21 3212 1112707 0.29 1115919 22 2995 1109009 0.27 1112004 23 2966 1103704 0.27 1106670 24 2937 1099132 0.27 1102069 25 2672 1095075 0.24 1097747 26 2730 1089485 0.25 1092215 27 2712 1083849 0.25 1086561 28 2646 1079752 0.24 1082398 29 2563 1073228 0.24 1075791 30 2431 1069090 0.23 1071521 31 2576 1064465 0.24 1067041 32 2490 1058079 0.23 1060569 33 2496 1052168 0.24 1054664 34 2501 1045245 0.24 1047746 35 2508 1042421 0.24 1044929 36 2475 1034834 0.24 1037309 37 2350 1029540 0.23 1031890 38 2400 1024739 0.23 1027139 39 2317 1019210 0.23 1021527 40 2310 1012206 0.23 1014516 41 2377 1005993 0.24 1008370 42 2301 998881 0.23 1001182 43 2377 993850 0.24 996227 44 2321 987784 0.23 990105 45 2327 981411 0.24 983738 46 2317 974574 0.24 976891 47 2204 969711 0.23 971915 48 2344 963602 0.24 965946 49 2194 955828 0.23 958022 50 2189 953207 0.23 955396 51 2237 945001 0.24 947238 52 2175 939279 0.23 941454 53 2191 934785 0.23 936976 54 2194 927659 0.24 929853 55 2207 922475 0.24 924682 56 2133 913111 0.23 915244 57 2060 907375 0.23 909435 58 2089 901897 0.23 903986 59 2168 895684 0.24 897852 60 2080 889732 0.23 891812 61 2118 884211 0.24 886329 62 2067 878143 0.23 880210 63 1942 871897 0.22 873839 64 2074 864669 0.24 866743 65 2090 859308 0.24 861398 66 2135 852555 0.25 854690 67 2014 846109 0.24 848123 68 1852 841028 0.22 842880 69 2109 834284 0.25 836393 70 1983 827556 0.24 829539 71 1955 822298 0.24 824253 72 1924 815479 0.24 817403 73 2002 808813 0.25 810815 74 2038 801354 0.25 803392 75 1903 796364 0.24 798267 76 1987 787905 0.25 789892 77 1873 783839 0.24 785712 78 1994 778133 0.26 780127 79 1992 773064 0.26 775056 80 1950 763533 0.25 765483 81 1799 759017 0.24 760816 82 1835 751909 0.24 753744 83 1852 744392 0.25 746244 84 1819 739600 0.25 741419 85 1818 732052 0.25 733870 86 1760 728610 0.24 730370 87 1814 721206 0.25 723020 88 1783 713474 0.25 715257 89 1832 708564 0.26 710396 90 1809 702323 0.26 704132 91 1746 696936 0.25 698682 92 1670 688291 0.24 689961 93 1811 683430 0.26 685241 94 1736 677733 0.26 679469 95 1660 672637 0.25 674297 96 1666 664604 0.25 666270 97 1600 659904 0.24 661504 98 1622 653415 0.25 655037 99 1725 646540 0.27 648265 100 1703 641602 0.26 643305 101 1595 635649 0.25 637244 102 1624 630122 0.26 631746 103 1638 624011 0.26 625649 104 1707 617661 0.28 619368 105 1665 612655 0.27 614320 106 1609 606838 0.26 608447 107 1590 601681 0.26 603271 108 1574 595014 0.26 596588 109 1679 589707 0.28 591386 110 1713 582520 0.29 584233 111 1532 577804 0.26 579336 112 1592 571913 0.28 573505 113 1539 565018 0.27 566557 114 1562 560494 0.28 562056 115 1651 556527 0.30 558178 116 1553 549995 0.28 551548 117 1471 543989 0.27 545460 118 1473 539249 0.27 540722 119 1503 533275 0.28 534778 120 1665 529096 0.31 530761 121 1455 523637 0.28 525092 122 1539 516344 0.30 517883 123 1499 509963 0.29 511462 124 1507 505725 0.30 507232 125 1433 500709 0.29 502142 126 1508 496525 0.30 498033 127 1444 490783 0.29 492227 128 1452 484251 0.30 485703 129 1458 479718 0.30 481176 130 1438 474986 0.30 476424 131 1494 471052 0.32 472546 132 1377 464220 0.30 465597 133 1370 459267 0.30 460637 134 1477 454514 0.32 455991 135 1484 449028 0.33 450512 136 1674 440940 0.38 442614