CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 59888 259566 18.75 319454 2 59484 252967 19.04 312451 3 58987 251435 19.00 310422 4 58951 254957 18.78 313908 5 58793 254997 18.74 313790 6 59370 256988 18.77 316358 7 60026 256903 18.94 316929 8 60687 263948 18.69 324635 9 61099 264458 18.77 325557 10 60251 261826 18.71 322077 11 60223 262990 18.63 323213 12 60911 260940 18.93 321851 13 61301 258803 19.15 320104 14 60883 260978 18.92 321861 15 61127 258387 19.13 319514 16 60023 257072 18.93 317095 17 60547 260456 18.86 321003 18 60761 259397 18.98 320158 19 60662 261429 18.83 322091 20 60892 261533 18.89 322425 21 60652 261516 18.83 322168 22 60413 258469 18.95 318882 23 60242 260397 18.79 320639 24 60691 257506 19.07 318197 25 60322 259507 18.86 319829 26 60694 258333 19.02 319027 27 60641 259612 18.94 320253 28 61075 259544 19.05 320619 29 60306 258771 18.90 319077 30 60322 259060 18.89 319382 31 60526 259627 18.91 320153 32 61116 262185 18.90 323301 33 60594 260319 18.88 320913 34 61450 261079 19.05 322529 35 60460 259418 18.90 319878 36 60943 258537 19.08 319480 37 60655 258391 19.01 319046 38 60630 261278 18.83 321908 39 60001 260495 18.72 320496 40 60736 258790 19.01 319526 41 60745 258965 19.00 319710 42 60608 257512 19.05 318120 43 61115 258456 19.12 319571 44 60680 259880 18.93 320560 45 60639 258048 19.03 318687 46 60444 258230 18.97 318674 47 60217 257346 18.96 317563 48 60611 256953 19.09 317564 49 60221 256591 19.01 316812 50 60388 260489 18.82 320877 51 60579 256280 19.12 316859 52 60322 257256 18.99 317578 53 61090 258746 19.10 319836 54 60720 258336 19.03 319056 55 60273 256345 19.04 316618 56 60379 257179 19.01 317558 57 60627 257817 19.04 318444 58 60434 257951 18.98 318385 59 60622 258513 19.00 319135 60 60351 255695 19.10 316046 61 60356 256534 19.05 316890 62 60641 257264 19.08 317905 63 60334 255785 19.09 316119 64 60312 255457 19.10 315769 65 60112 254171 19.13 314283 66 60444 256919 19.05 317363 67 61107 256605 19.23 317712 68 61170 257897 19.17 319067 69 60947 258036 19.11 318983 70 60942 257694 19.13 318636 71 60591 256485 19.11 317076 72 60442 256061 19.10 316503 73 60650 254663 19.23 315313 74 60788 257094 19.12 317882 75 60621 254659 19.23 315280 76 60925 255640 19.25 316565 77 60558 255338 19.17 315896 78 60502 255137 19.17 315639 79 61006 252993 19.43 313999 80 60578 254220 19.24 314798 81 61148 255357 19.32 316505 82 60699 255482 19.20 316181 83 60749 253850 19.31 314599 84 60262 255124 19.11 315386 85 60496 255688 19.13 316184 86 61289 255773 19.33 317062 87 60811 253029 19.38 313840 88 60669 255276 19.20 315945 89 60478 255018 19.17 315496 90 60643 253522 19.30 314165 91 60256 253007 19.23 313263 92 60687 254254 19.27 314941 93 60169 254439 19.13 314608 94 60439 252768 19.30 313207 95 60692 254764 19.24 315456 96 61566 252739 19.59 314305 97 60793 252208 19.42 313001 98 60722 252190 19.41 312912 99 60597 251770 19.40 312367 100 61298 252828 19.51 314126 101 61176 253272 19.46 314448 102 60734 252559 19.39 313293 103 60378 251206 19.38 311584 104 60782 251100 19.49 311882 105 60936 250746 19.55 311682 106 60225 251625 19.31 311850 107 61024 251065 19.55 312089 108 60783 249953 19.56 310736 109 60849 250898 19.52 311747 110 61217 252050 19.54 313267 111 60982 249515 19.64 310497 112 60708 250819 19.49 311527 113 61029 249760 19.64 310789 114 61526 250348 19.73 311874 115 61178 248044 19.78 309222 116 61051 250023 19.63 311074 117 60958 247955 19.73 308913 118 61501 248248 19.86 309749 119 61815 246746 20.03 308561 120 61243 246997 19.87 308240 121 61375 245531 20.00 306906 122 61161 246204 19.90 307365 123 60798 245487 19.85 306285 124 61605 244621 20.12 306226 125 60612 245490 19.80 306102 126 60957 243925 19.99 304882 127 60861 244593 19.92 305454 128 61097 243649 20.05 304746 129 60827 242921 20.03 303748 130 61029 242012 20.14 303041 131 60803 240756 20.16 301559 132 60703 240252 20.17 300955 133 60804 239414 20.25 300218 134 61235 241025 20.26 302260 135 60355 240209 20.08 300564 136 60728 237904 20.34 298632 137 60730 238958 20.26 299688 138 60606 238800 20.24 299406 139 60421 238121 20.24 298542 140 60377 237352 20.28 297729 141 63577 239112 21.00 302689 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1513 441009 0.34 442522 2 1120 443131 0.25 444251 3 1101 436836 0.25 437937 4 1163 436568 0.27 437731 5 1121 439999 0.25 441120 6 1109 440062 0.25 441171 7 1145 447550 0.26 448695 8 1108 446638 0.25 447746 9 1170 448159 0.26 449329 10 1092 449302 0.24 450394 11 1201 448109 0.27 449310 12 1145 450684 0.25 451829 13 1177 449172 0.26 450349 14 1104 445191 0.25 446295 15 1191 442479 0.27 443670 16 1148 442344 0.26 443492 17 1165 447824 0.26 448989 18 1197 447147 0.27 448344 19 1179 450614 0.26 451793 20 1191 449864 0.26 451055 21 1174 446722 0.26 447896 22 1151 442155 0.26 443306 23 1170 445051 0.26 446221 24 1214 445595 0.27 446809 25 1192 444618 0.27 445810 26 1217 447070 0.27 448287 27 1186 446362 0.26 447548 28 1168 446538 0.26 447706 29 1212 445921 0.27 447133 30 1161 445642 0.26 446803 31 1180 448525 0.26 449705 32 1178 450140 0.26 451318 33 1166 442370 0.26 443536 34 1206 446509 0.27 447715 35 1220 445073 0.27 446293 36 1131 443680 0.25 444811 37 1167 445869 0.26 447036 38 1189 443316 0.27 444505 39 1134 442131 0.26 443265 40 1095 444241 0.25 445336 41 1115 446065 0.25 447180 42 1211 446510 0.27 447721 43 1188 444658 0.27 445846 44 1156 442672 0.26 443828 45 1208 440966 0.27 442174 46 1303 446408 0.29 447711 47 1214 442322 0.27 443536 48 1310 447107 0.29 448417 49 1432 443529 0.32 444961 50 1373 443340 0.31 444713 51 1406 441937 0.32 443343 52 1346 444223 0.30 445569 53 1431 446871 0.32 448302 54 1426 444948 0.32 446374 55 1441 440935 0.33 442376 56 1463 440998 0.33 442461 57 1446 441901 0.33 443347 58 1454 440852 0.33 442306 59 1521 442831 0.34 444352 60 1516 441228 0.34 442744 61 1490 440371 0.34 441861 62 1592 442130 0.36 443722 63 1519 443099 0.34 444618 64 1642 441914 0.37 443556 65 1665 441913 0.38 443578 66 1675 441793 0.38 443468 67 1731 441501 0.39 443232 68 1736 443510 0.39 445246 69 1725 440296 0.39 442021 70 1676 442382 0.38 444058 71 1704 441262 0.38 442966 72 1664 438780 0.38 440444 73 1824 438104 0.41 439928 74 1772 442624 0.40 444396 75 1794 441963 0.40 443757 76 1903 441875 0.43 443778 77 1939 442496 0.44 444435 78 1919 439837 0.43 441756 79 1959 438753 0.44 440712 80 1940 439288 0.44 441228 81 1967 441348 0.44 443315 82 2067 441155 0.47 443222 83 2078 439563 0.47 441641 84 2142 440049 0.48 442191 85 2152 439289 0.49 441441 86 2159 439722 0.49 441881 87 2235 438226 0.51 440461 88 2323 437784 0.53 440107 89 2368 437447 0.54 439815 90 2394 437279 0.54 439673 91 2476 435806 0.56 438282 92 2510 438560 0.57 441070 93 2614 436393 0.60 439007 94 2646 437674 0.60 440320 95 2728 437128 0.62 439856 96 2783 436772 0.63 439555 97 2963 435675 0.68 438638 98 2884 437050 0.66 439934 99 3039 434515 0.69 437554 100 3137 433154 0.72 436291 101 3205 433882 0.73 437087 102 3377 436003 0.77 439380 103 3359 432542 0.77 435901 104 3557 433193 0.81 436750 105 3576 432675 0.82 436251 106 3744 434818 0.85 438562 107 3878 433159 0.89 437037 108 3926 431506 0.90 435432 109 4107 430320 0.95 434427 110 4348 431336 1.00 435684 111 4288 429431 0.99 433719 112 4444 430494 1.02 434938 113 4562 429467 1.05 434029 114 4784 428918 1.10 433702 115 4935 427716 1.14 432651 116 5113 426260 1.19 431373 117 5102 426629 1.18 431731 118 5320 426854 1.23 432174 119 5570 424554 1.29 430124 120 5541 422961 1.29 428502 121 5809 422705 1.36 428514 122 5972 424235 1.39 430207 123 6156 420724 1.44 426880 124 6143 420792 1.44 426935 125 6407 419773 1.50 426180 126 6697 419643 1.57 426340 127 6859 416639 1.62 423498 128 6895 416136 1.63 423031 129 7135 415181 1.69 422316 130 7424 414506 1.76 421930 131 7354 413843 1.75 421197 132 7548 410779 1.80 418327 133 7861 412538 1.87 420399 134 7870 411097 1.88 418967 135 8203 409467 1.96 417670 136 8398 407967 2.02 416365 137 8980 406931 2.16 415911 138 9084 407768 2.18 416852 139 9394 405688 2.26 415082 140 13882 410286 3.27 424168 141 13629 407093 3.24 420722 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 5518 1862493 0.30 1868011 2 4719 1864545 0.25 1869264 3 4780 1851987 0.26 1856767 4 4646 1851017 0.25 1855663 5 4681 1841951 0.25 1846632 6 4498 1840431 0.24 1844929 7 4741 1845263 0.26 1850004 8 4732 1862919 0.25 1867651 9 4780 1857199 0.26 1861979 10 4803 1851326 0.26 1856129 11 4719 1857510 0.25 1862229 12 4794 1841319 0.26 1846113 13 4665 1832388 0.25 1837053 14 4695 1831081 0.26 1835776 15 4752 1833203 0.26 1837955 16 4794 1835453 0.26 1840247 17 4886 1843622 0.26 1848508 18 4916 1846189 0.27 1851105 19 4821 1847591 0.26 1852412 20 4856 1853177 0.26 1858033 21 4769 1843182 0.26 1847951 22 4838 1840714 0.26 1845552 23 4889 1850219 0.26 1855108 24 4796 1838348 0.26 1843144 25 4801 1837291 0.26 1842092 26 4928 1839767 0.27 1844695 27 4836 1839500 0.26 1844336 28 4849 1841093 0.26 1845942 29 4739 1843200 0.26 1847939 30 4862 1847745 0.26 1852607 31 4610 1843717 0.25 1848327 32 5037 1851151 0.27 1856188 33 4902 1836686 0.27 1841588 34 4805 1837467 0.26 1842272 35 4718 1831854 0.26 1836572 36 4867 1838147 0.26 1843014 37 4762 1841264 0.26 1846026 38 4847 1846041 0.26 1850888 39 5008 1838406 0.27 1843414 40 4838 1836846 0.26 1841684 41 5001 1837025 0.27 1842026 42 5051 1831695 0.27 1836746 43 5029 1832814 0.27 1837843 44 5192 1841528 0.28 1846720 45 5189 1835201 0.28 1840390 46 5444 1838033 0.30 1843477 47 5578 1836584 0.30 1842162 48 5792 1838295 0.31 1844087 49 5957 1834783 0.32 1840740 50 6061 1838276 0.33 1844337 51 6150 1834135 0.33 1840285 52 6263 1837405 0.34 1843668 53 6273 1838873 0.34 1845146 54 6173 1833582 0.34 1839755 55 6379 1827217 0.35 1833596 56 6574 1833880 0.36 1840454 57 6630 1830189 0.36 1836819 58 6437 1832690 0.35 1839127 59 6557 1832656 0.36 1839213 60 6821 1835588 0.37 1842409 61 6634 1828300 0.36 1834934 62 6775 1833467 0.37 1840242 63 6904 1823672 0.38 1830576 64 7027 1830092 0.38 1837119 65 7145 1827512 0.39 1834657 66 7340 1835078 0.40 1842418 67 7320 1831283 0.40 1838603 68 7416 1832837 0.40 1840253 69 7228 1823950 0.39 1831178 70 7459 1824153 0.41 1831612 71 7550 1824909 0.41 1832459 72 7356 1827457 0.40 1834813 73 7932 1820291 0.43 1828223 74 7990 1835062 0.43 1843052 75 7891 1824260 0.43 1832151 76 8002 1824982 0.44 1832984 77 8427 1820497 0.46 1828924 78 8303 1821462 0.45 1829765 79 8501 1820861 0.46 1829362 80 8735 1824963 0.48 1833698 81 8596 1817771 0.47 1826367 82 8964 1819084 0.49 1828048 83 9032 1816326 0.49 1825358 84 9225 1814054 0.51 1823279 85 9345 1814844 0.51 1824189 86 9863 1819704 0.54 1829567 87 9751 1810147 0.54 1819898 88 10229 1813263 0.56 1823492 89 10296 1816342 0.56 1826638 90 10653 1816184 0.58 1826837 91 11019 1810127 0.61 1821146 92 11351 1816545 0.62 1827896 93 11714 1806797 0.64 1818511 94 12002 1809489 0.66 1821491 95 12408 1810093 0.68 1822501 96 12407 1802474 0.68 1814881 97 12834 1803004 0.71 1815838 98 13562 1805003 0.75 1818565 99 13582 1800292 0.75 1813874 100 14217 1804973 0.78 1819190 101 14753 1803752 0.81 1818505 102 15219 1801345 0.84 1816564 103 15528 1800065 0.86 1815593 104 15816 1799467 0.87 1815283 105 16562 1797991 0.91 1814553 106 17072 1792376 0.94 1809448 107 17739 1791943 0.98 1809682 108 18157 1788288 1.01 1806445 109 18685 1787460 1.03 1806145 110 19234 1789856 1.06 1809090 111 20190 1782765 1.12 1802955 112 20640 1783541 1.14 1804181 113 21051 1779757 1.17 1800808 114 21998 1775588 1.22 1797586 115 22362 1773099 1.25 1795461 116 23107 1775836 1.28 1798943 117 23710 1766014 1.32 1789724 118 24549 1764920 1.37 1789469 119 25303 1760820 1.42 1786123 120 26097 1755857 1.46 1781954 121 26731 1750542 1.50 1777273 122 27225 1753614 1.53 1780839 123 28172 1751693 1.58 1779865 124 28912 1747117 1.63 1776029 125 29595 1743792 1.67 1773387 126 30801 1739682 1.74 1770483 127 31119 1732575 1.76 1763694 128 31955 1733068 1.81 1765023 129 32963 1725887 1.87 1758850 130 33433 1727118 1.90 1760551 131 34163 1719055 1.95 1753218 132 34986 1714220 2.00 1749206 133 35852 1708563 2.06 1744415 134 36698 1706187 2.11 1742885 135 37634 1702376 2.16 1740010 136 38491 1699779 2.21 1738270 137 40529 1701631 2.33 1742160 138 43348 1697632 2.49 1740980 139 44565 1687977 2.57 1732542 140 43623 1684325 2.52 1727948 141 46202 1677699 2.68 1723901 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 56500 225398 20.04 281898 2 55933 222776 20.07 278709 3 55866 223381 20.01 279247 4 55274 221993 19.94 277267 5 54780 221684 19.81 276464 6 55075 220182 20.01 275257 7 54276 220502 19.75 274778 8 54816 218920 20.03 273736 9 54043 218267 19.85 272310 10 53800 218682 19.74 272482 11 53429 217328 19.73 270757 12 53537 217211 19.77 270748 13 53075 216889 19.66 269964 14 53194 216441 19.73 269635 15 52752 215889 19.64 268641 16 52257 215652 19.51 267909 17 51880 215191 19.43 267071 18 51634 214436 19.41 266070 19 51325 211531 19.53 262856 20 51008 210791 19.48 261799 21 50042 210326 19.22 260368 22 50590 209098 19.48 259688 23 50159 207961 19.43 258120 24 49915 207270 19.41 257185 25 49227 206721 19.23 255948 26 49243 204923 19.37 254166 27 48663 203457 19.30 252120 28 48430 203076 19.26 251506 29 48064 200885 19.31 248949 30 47527 200008 19.20 247535 31 47428 199123 19.24 246551 32 46956 198061 19.16 245017 33 47278 197100 19.35 244378 34 46316 195143 19.18 241459 35 45635 194514 19.00 240149 36 46098 192992 19.28 239090 37 46118 192525 19.33 238643 38 44925 190560 19.08 235485 39 44710 189086 19.12 233796 40 44561 187908 19.17 232469 41 44107 185880 19.18 229987 42 43916 185619 19.13 229535 43 43636 185235 19.07 228871 44 43105 183631 19.01 226736 45 42356 180965 18.97 223321 46 42443 180008 19.08 222451 47 41883 178420 19.01 220303 48 41776 178405 18.97 220181 49 41107 175532 18.97 216639 50 41145 175692 18.98 216837 51 40716 173906 18.97 214622 52 40669 171852 19.14 212521 53 40130 171112 19.00 211242 54 40028 169399 19.11 209427 55 39630 168481 19.04 208111 56 39020 167620 18.88 206640 57 38880 166335 18.95 205215 58 38634 165269 18.95 203903 59 38140 163347 18.93 201487 60 37920 161914 18.98 199834 61 37798 160301 19.08 198099 62 37103 160159 18.81 197262 63 36866 158088 18.91 194954 64 36510 156540 18.91 193050 65 36245 155373 18.92 191618 66 36241 154401 19.01 190642 67 35627 153932 18.79 189559 68 35585 151871 18.98 187456 69 35129 150909 18.88 186038 70 34859 149477 18.91 184336 71 34890 148007 19.08 182897 72 34242 146906 18.90 181148 73 34368 145970 19.06 180338 74 33500 145183 18.75 178683 75 33372 143461 18.87 176833 76 33237 142495 18.91 175732 77 32915 140761 18.95 173676 78 32614 139850 18.91 172464 79 32575 138288 19.06 170863 80 32008 136898 18.95 168906 81 31436 136709 18.70 168145 82 31453 134411 18.96 165864 83 31117 132732 18.99 163849 84 30766 132932 18.79 163698 85 30659 130709 19.00 161368 86 29832 130333 18.63 160165 87 30132 128909 18.95 159041 88 29257 127541 18.66 156798 89 29417 126417 18.88 155834 90 29138 125544 18.84 154682 91 29115 124637 18.94 153752 92 28475 122786 18.83 151261 93 28262 121426 18.88 149688 94 28249 121183 18.90 149432 95 27765 119785 18.82 147550 96 27490 118585 18.82 146075 97 27089 117631 18.72 144720 98 26763 115718 18.78 142481 99 26452 115188 18.68 141640 100 26552 114184 18.87 140736 101 26233 113316 18.80 139549 102 25905 112130 18.77 138035 103 25438 110578 18.70 136016 104 25338 109866 18.74 135204 105 24875 108450 18.66 133325 106 24994 107416 18.88 132410 107 24520 106210 18.76 130730 108 24379 105508 18.77 129887 109 24264 104365 18.86 128629 110 23921 103638 18.75 127559 111 23842 102575 18.86 126417 112 23260 101272 18.68 124532 113 23416 100507 18.90 123923 114 23003 99023 18.85 122026 115 22656 98071 18.77 120727 116 22376 96795 18.78 119171 117 22137 96315 18.69 118452 118 21954 95090 18.76 117044 119 21646 94175 18.69 115821 120 21397 93115 18.69 114512 121 21194 92035 18.72 113229 122 21087 91594 18.71 112681 123 20775 90574 18.66 111349 124 20910 89070 19.01 109980 125 20387 88344 18.75 108731 126 20041 87359 18.66 107400 127 19931 86469 18.73 106400 128 19680 86026 18.62 105706 129 19421 84958 18.61 104379 130 19401 84066 18.75 103467 131 19017 82692 18.70 101709 132 18580 82259 18.43 100839 133 18841 81200 18.83 100041 134 18369 80571 18.57 98940 135 18289 79257 18.75 97546 136 17800 77769 18.63 95569 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 6732 381154 1.74 387886 2 5093 379811 1.32 384904 3 3749 376913 0.98 380662 4 3046 376659 0.80 379705 5 2591 374752 0.69 377343 6 2278 374030 0.61 376308 7 2206 371911 0.59 374117 8 1902 371825 0.51 373727 9 1699 371510 0.46 373209 10 1635 370555 0.44 372190 11 1539 371089 0.41 372628 12 1375 367850 0.37 369225 13 1437 367682 0.39 369119 14 1261 367537 0.34 368798 15 1214 367176 0.33 368390 16 1162 365185 0.32 366347 17 1125 363954 0.31 365079 18 1088 363335 0.30 364423 19 1101 362019 0.30 363120 20 1042 359914 0.29 360956 21 1000 359033 0.28 360033 22 974 355538 0.27 356512 23 929 356797 0.26 357726 24 926 353236 0.26 354162 25 931 351527 0.26 352458 26 909 350855 0.26 351764 27 928 348532 0.27 349460 28 895 345631 0.26 346526 29 866 345277 0.25 346143 30 860 342686 0.25 343546 31 860 340829 0.25 341689 32 843 337767 0.25 338610 33 804 335901 0.24 336705 34 794 334283 0.24 335077 35 810 331836 0.24 332646 36 839 329867 0.25 330706 37 809 328089 0.25 328898 38 770 327361 0.23 328131 39 773 324227 0.24 325000 40 771 322264 0.24 323035 41 745 319033 0.23 319778 42 719 315737 0.23 316456 43 801 314419 0.25 315220 44 862 312265 0.28 313127 45 778 310616 0.25 311394 46 783 308050 0.25 308833 47 783 306822 0.25 307605 48 795 304392 0.26 305187 49 749 302477 0.25 303226 50 713 300286 0.24 300999 51 731 298461 0.24 299192 52 782 295402 0.26 296184 53 684 292992 0.23 293676 54 682 290571 0.23 291253 55 755 288024 0.26 288779 56 705 286794 0.25 287499 57 738 284762 0.26 285500 58 682 282062 0.24 282744 59 708 279765 0.25 280473 60 707 277569 0.25 278276 61 698 275484 0.25 276182 62 647 273702 0.24 274349 63 702 270551 0.26 271253 64 693 269184 0.26 269877 65 599 266542 0.22 267141 66 637 265596 0.24 266233 67 651 262456 0.25 263107 68 634 261983 0.24 262617 69 628 258170 0.24 258798 70 623 257150 0.24 257773 71 582 253493 0.23 254075 72 624 252994 0.25 253618 73 656 250286 0.26 250942 74 616 249607 0.25 250223 75 592 245710 0.24 246302 76 536 244111 0.22 244647 77 594 242019 0.24 242613 78 581 239366 0.24 239947 79 622 237534 0.26 238156 80 603 235217 0.26 235820 81 616 233241 0.26 233857 82 557 230720 0.24 231277 83 552 228650 0.24 229202 84 570 227272 0.25 227842 85 537 225358 0.24 225895 86 533 222192 0.24 222725 87 535 220286 0.24 220821 88 564 219173 0.26 219737 89 540 216348 0.25 216888 90 524 215221 0.24 215745 91 544 212642 0.26 213186 92 493 210969 0.23 211462 93 552 207798 0.26 208350 94 488 206518 0.24 207006 95 546 205832 0.26 206378 96 503 202835 0.25 203338 97 497 201264 0.25 201761 98 526 199001 0.26 199527 99 493 196912 0.25 197405 100 412 194980 0.21 195392 101 447 193785 0.23 194232 102 464 191432 0.24 191896 103 461 189384 0.24 189845 104 448 188231 0.24 188679 105 471 185535 0.25 186006 106 486 184475 0.26 184961 107 453 182322 0.25 182775 108 446 180037 0.25 180483 109 421 178616 0.24 179037 110 417 176389 0.24 176806 111 452 174678 0.26 175130 112 386 172642 0.22 173028 113 422 170848 0.25 171270 114 437 170040 0.26 170477 115 413 167708 0.25 168121 116 437 166384 0.26 166821 117 385 164295 0.23 164680 118 409 163348 0.25 163757 119 382 161131 0.24 161513 120 365 158409 0.23 158774 121 372 157316 0.24 157688 122 370 155590 0.24 155960 123 384 154354 0.25 154738 124 387 151868 0.25 152255 125 392 150489 0.26 150881 126 369 149437 0.25 149806 127 408 147581 0.28 147989 128 398 146144 0.27 146542 129 368 144679 0.25 145047 130 344 143132 0.24 143476 131 374 141301 0.26 141675 132 358 138810 0.26 139168 133 358 137686 0.26 138044 134 347 136427 0.25 136774 135 349 135809 0.26 136158 136 383 132172 0.29 132555 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 41225 1583942 2.54 1625167 2 28372 1585453 1.76 1613825 3 20909 1583344 1.30 1604253 4 15926 1585921 0.99 1601847 5 13365 1581824 0.84 1595189 6 11738 1577829 0.74 1589567 7 10341 1573727 0.65 1584068 8 9670 1566095 0.61 1575765 9 8855 1558393 0.57 1567248 10 8060 1551937 0.52 1559997 11 7623 1546066 0.49 1553689 12 7073 1540669 0.46 1547742 13 6590 1535876 0.43 1542466 14 6305 1527811 0.41 1534116 15 6021 1520061 0.39 1526082 16 5444 1514700 0.36 1520144 17 5335 1506486 0.35 1511821 18 5204 1498446 0.35 1503650 19 4940 1491471 0.33 1496411 20 4687 1483832 0.31 1488519 21 4618 1474839 0.31 1479457 22 4317 1468491 0.29 1472808 23 4218 1460783 0.29 1465001 24 4200 1452291 0.29 1456491 25 3899 1446374 0.27 1450273 26 3922 1438138 0.27 1442060 27 3944 1429295 0.28 1433239 28 3784 1421348 0.27 1425132 29 3714 1411745 0.26 1415459 30 3568 1405366 0.25 1408934 31 3669 1397575 0.26 1401244 32 3609 1387724 0.26 1391333 33 3598 1379482 0.26 1383080 34 3580 1370161 0.26 1373741 35 3540 1364224 0.26 1367764 36 3544 1354690 0.26 1358234 37 3458 1345099 0.26 1348557 38 3374 1338192 0.25 1341566 39 3394 1328593 0.25 1331987 40 3326 1319742 0.25 1323068 41 3316 1310858 0.25 1314174 42 3298 1300066 0.25 1303364 43 3357 1291949 0.26 1295306 44 3303 1282887 0.26 1286190 45 3353 1273883 0.26 1277236 46 3239 1263930 0.26 1267169 47 3192 1257014 0.25 1260206 48 3325 1248526 0.27 1251851 49 3129 1237333 0.25 1240462 50 3072 1232513 0.25 1235585 51 3138 1221007 0.26 1224145 52 3090 1213511 0.25 1216601 53 3120 1204684 0.26 1207804 54 3089 1195039 0.26 1198128 55 3135 1187462 0.26 1190597 56 3041 1176499 0.26 1179540 57 2900 1167507 0.25 1170407 58 2997 1159639 0.26 1162636 59 3032 1150138 0.26 1153170 60 2924 1141609 0.26 1144533 61 2933 1133275 0.26 1136208 62 2856 1125040 0.25 1127896 63 2758 1117105 0.25 1119863 64 2842 1106765 0.26 1109607 65 2874 1099113 0.26 1101987 66 2951 1089408 0.27 1092359 67 2806 1080703 0.26 1083509 68 2642 1073198 0.25 1075840 69 2974 1065148 0.28 1068122 70 2740 1054612 0.26 1057352 71 2761 1046892 0.26 1049653 72 2645 1037996 0.25 1040641 73 2732 1029185 0.26 1031917 74 2816 1019170 0.28 1021986 75 2658 1012001 0.26 1014659 76 2773 1001609 0.28 1004382 77 2577 994513 0.26 997090 78 2757 987189 0.28 989946 79 2679 979385 0.27 982064 80 2643 968234 0.27 970877 81 2497 960887 0.26 963384 82 2485 951124 0.26 953609 83 2553 942088 0.27 944641 84 2501 935266 0.27 937767 85 2543 925645 0.27 928188 86 2430 920198 0.26 922628 87 2445 910664 0.27 913109 88 2416 900294 0.27 902710 89 2453 892836 0.27 895289 90 2447 884827 0.28 887274 91 2389 877216 0.27 879605 92 2289 866042 0.26 868331 93 2439 859228 0.28 861667 94 2324 851848 0.27 854172 95 2257 844630 0.27 846887 96 2282 835112 0.27 837394 97 2178 828160 0.26 830338 98 2238 820232 0.27 822470 99 2296 810619 0.28 812915 100 2285 804210 0.28 806495 101 2179 796490 0.27 798669 102 2196 789151 0.28 791347 103 2198 780627 0.28 782825 104 2234 773229 0.29 775463 105 2212 766199 0.29 768411 106 2163 758583 0.28 760746 107 2140 751466 0.28 753606 108 2093 743611 0.28 745704 109 2240 736394 0.30 738634 110 2279 726683 0.31 728962 111 2109 720347 0.29 722456 112 2104 712806 0.29 714910 113 2042 704411 0.29 706453 114 2085 698541 0.30 700626 115 2178 692923 0.31 695101 116 2070 684253 0.30 686323 117 2009 676548 0.30 678557 118 1964 669799 0.29 671763 119 1989 663328 0.30 665317 120 2178 657013 0.33 659191 121 1950 649758 0.30 651708 122 2011 641331 0.31 643342 123 1984 632727 0.31 634711 124 1994 627106 0.32 629100 125 1886 620839 0.30 622725 126 1970 615472 0.32 617442 127 1892 607857 0.31 609749 128 1923 599253 0.32 601176 129 1919 594146 0.32 596065 130 1878 588657 0.32 590535 131 1926 583151 0.33 585077 132 1849 573990 0.32 575839 133 1825 568006 0.32 569831 134 1862 562005 0.33 563867 135 1949 555128 0.35 557077 136 2158 544988 0.39 547146