CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 61127 262461 18.89 323588 2 61034 255626 19.27 316660 3 60356 255327 19.12 315683 4 60466 258310 18.97 318776 5 60004 258885 18.82 318889 6 61221 260646 19.02 321867 7 61645 260544 19.13 322189 8 61903 267361 18.80 329264 9 62629 268076 18.94 330705 10 61668 264933 18.88 326601 11 62003 267107 18.84 329110 12 62261 265007 19.02 327268 13 62693 263081 19.24 325774 14 62268 265256 19.01 327524 15 62652 263126 19.23 325778 16 61790 261225 19.13 323015 17 62021 264182 19.01 326203 18 62374 264228 19.10 326602 19 62439 265957 19.01 328396 20 62460 265543 19.04 328003 21 62381 265587 19.02 327968 22 61992 262514 19.10 324506 23 61883 264162 18.98 326045 24 62244 261480 19.23 323724 25 62107 263636 19.07 325743 26 62308 263253 19.14 325561 27 62428 263408 19.16 325836 28 62728 264023 19.20 326751 29 62117 262770 19.12 324887 30 61910 262597 19.08 324507 31 61865 263810 19.00 325675 32 62638 266246 19.05 328884 33 62331 264477 19.07 326808 34 63138 265182 19.23 328320 35 61819 264144 18.97 325963 36 62783 262943 19.27 325726 37 61999 262720 19.09 324719 38 62459 265392 19.05 327851 39 61372 264532 18.83 325904 40 62277 262807 19.16 325084 41 62328 263866 19.11 326194 42 62355 261364 19.26 323719 43 62570 263299 19.20 325869 44 62529 264461 19.12 326990 45 62320 262831 19.17 325151 46 62189 262729 19.14 324918 47 62141 262100 19.17 324241 48 62095 261599 19.18 323694 49 61731 260905 19.13 322636 50 62334 264784 19.06 327118 51 62085 259818 19.29 321903 52 62196 261834 19.19 324030 53 62444 262731 19.20 325175 54 62534 262839 19.22 325373 55 62314 261082 19.27 323396 56 62223 262071 19.19 324294 57 62193 261900 19.19 324093 58 62108 262129 19.16 324237 59 62507 262373 19.24 324880 60 61945 259792 19.25 321737 61 62048 260831 19.22 322879 62 62112 261845 19.17 323957 63 62011 259741 19.27 321752 64 62282 259319 19.37 321601 65 61816 259036 19.27 320852 66 61941 261720 19.14 323661 67 62423 260640 19.32 323063 68 62672 262301 19.29 324973 69 62968 261944 19.38 324912 70 62314 262354 19.19 324668 71 62284 260432 19.30 322716 72 62003 259981 19.26 321984 73 62381 258903 19.42 321284 74 62366 261562 19.25 323928 75 62091 258291 19.38 320382 76 62632 260729 19.37 323361 77 62255 259424 19.35 321679 78 62229 259381 19.35 321610 79 62692 257010 19.61 319702 80 62218 258331 19.41 320549 81 62720 259606 19.46 322326 82 62503 259647 19.40 322150 83 62570 259465 19.43 322035 84 62127 259552 19.31 321679 85 62053 260324 19.25 322377 86 63083 260177 19.51 323260 87 62526 257391 19.54 319917 88 62206 259448 19.34 321654 89 61789 258832 19.27 320621 90 62250 257886 19.44 320136 91 62121 257618 19.43 319739 92 62146 258258 19.40 320404 93 61696 258951 19.24 320647 94 61899 256487 19.44 318386 95 62414 259650 19.38 322064 96 62950 257473 19.65 320423 97 62509 256884 19.57 319393 98 62452 256981 19.55 319433 99 62365 256445 19.56 318810 100 62806 256013 19.70 318819 101 62560 257149 19.57 319709 102 62364 256354 19.57 318718 103 62124 255548 19.56 317672 104 62261 255422 19.60 317683 105 62373 255047 19.65 317420 106 61893 255779 19.48 317672 107 62552 255472 19.67 318024 108 62131 254979 19.59 317110 109 62348 255520 19.61 317868 110 62579 257087 19.58 319666 111 62599 253523 19.80 316122 112 62515 255271 19.67 317786 113 62591 254282 19.75 316873 114 63042 254086 19.88 317128 115 62498 252705 19.83 315203 116 62324 254440 19.68 316764 117 62256 253438 19.72 315694 118 62713 253270 19.85 315983 119 63038 252570 19.97 315608 120 62703 251913 19.93 314616 121 62879 250251 20.08 313130 122 62711 250681 20.01 313392 123 61990 249790 19.88 311780 124 63126 250257 20.14 313383 125 61875 250513 19.81 312388 126 62588 248964 20.09 311552 127 62066 249530 19.92 311596 128 62887 249072 20.16 311959 129 62384 248259 20.08 310643 130 62244 247059 20.12 309303 131 62188 246095 20.17 308283 132 62465 245728 20.27 308193 133 61735 243926 20.20 305661 134 62458 246153 20.24 308611 135 61585 245663 20.04 307248 136 61646 243422 20.21 305068 137 62219 244462 20.29 306681 138 61857 245216 20.14 307073 139 61711 244531 20.15 306242 140 61914 243414 20.28 305328 141 64402 244024 20.88 308426 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1441 450831 0.32 452272 2 1078 452786 0.24 453864 3 1035 446087 0.23 447122 4 1141 446368 0.25 447509 5 1079 449752 0.24 450831 6 1032 450000 0.23 451032 7 1047 457330 0.23 458377 8 1085 456894 0.24 457979 9 1092 457423 0.24 458515 10 1016 459270 0.22 460286 11 1070 458966 0.23 460036 12 1075 459952 0.23 461027 13 1083 459990 0.23 461073 14 1017 456122 0.22 457139 15 1074 453010 0.24 454084 16 1117 452175 0.25 453292 17 1110 458372 0.24 459482 18 1076 457017 0.23 458093 19 1085 461780 0.23 462865 20 1112 461051 0.24 462163 21 1122 457046 0.24 458168 22 1069 451747 0.24 452816 23 1081 455652 0.24 456733 24 1073 456305 0.23 457378 25 1084 455258 0.24 456342 26 1081 458806 0.24 459887 27 1127 457695 0.25 458822 28 1127 456484 0.25 457611 29 1141 456667 0.25 457808 30 1080 456191 0.24 457271 31 1132 458112 0.25 459244 32 1110 461850 0.24 462960 33 1074 453137 0.24 454211 34 1131 457578 0.25 458709 35 1141 455596 0.25 456737 36 1090 454199 0.24 455289 37 1100 456096 0.24 457196 38 1093 454409 0.24 455502 39 1072 453787 0.24 454859 40 1070 455760 0.23 456830 41 1079 457019 0.24 458098 42 1139 458556 0.25 459695 43 1115 455132 0.24 456247 44 1128 452870 0.25 453998 45 1107 451253 0.24 452360 46 1175 457902 0.26 459077 47 1111 453995 0.24 455106 48 1235 458271 0.27 459506 49 1361 454044 0.30 455405 50 1341 453981 0.29 455322 51 1289 452056 0.28 453345 52 1348 454968 0.30 456316 53 1356 457781 0.30 459137 54 1367 456226 0.30 457593 55 1349 451495 0.30 452844 56 1405 451742 0.31 453147 57 1430 452807 0.31 454237 58 1356 452323 0.30 453679 59 1412 453116 0.31 454528 60 1428 452197 0.31 453625 61 1410 450821 0.31 452231 62 1516 452709 0.33 454225 63 1449 453229 0.32 454678 64 1561 452693 0.34 454254 65 1580 453578 0.35 455158 66 1595 452779 0.35 454374 67 1663 451831 0.37 453494 68 1644 454489 0.36 456133 69 1598 451006 0.35 452604 70 1565 453056 0.34 454621 71 1602 452466 0.35 454068 72 1614 449238 0.36 450852 73 1710 449506 0.38 451216 74 1721 454325 0.38 456046 75 1691 453302 0.37 454993 76 1807 453705 0.40 455512 77 1790 453170 0.39 454960 78 1797 450969 0.40 452766 79 1844 449005 0.41 450849 80 1778 449650 0.39 451428 81 1914 452372 0.42 454286 82 1933 451328 0.43 453261 83 2069 448908 0.46 450977 84 2012 450840 0.44 452852 85 2040 450508 0.45 452548 86 2095 451383 0.46 453478 87 2120 448911 0.47 451031 88 2215 449130 0.49 451345 89 2288 448237 0.51 450525 90 2259 448372 0.50 450631 91 2327 446025 0.52 448352 92 2388 448950 0.53 451338 93 2483 446979 0.55 449462 94 2539 449171 0.56 451710 95 2606 448121 0.58 450727 96 2685 447791 0.60 450476 97 2696 446093 0.60 448789 98 2728 448302 0.60 451030 99 2844 444593 0.64 447437 100 2928 444222 0.65 447150 101 3068 443876 0.69 446944 102 3179 446394 0.71 449573 103 3209 443110 0.72 446319 104 3325 444223 0.74 447548 105 3365 443459 0.75 446824 106 3507 446317 0.78 449824 107 3568 444464 0.80 448032 108 3706 442809 0.83 446515 109 3812 440660 0.86 444472 110 4040 442807 0.90 446847 111 3967 440305 0.89 444272 112 4056 442482 0.91 446538 113 4257 439571 0.96 443828 114 4408 440530 0.99 444938 115 4504 439103 1.02 443607 116 4679 438097 1.06 442776 117 4716 437209 1.07 441925 118 4952 438008 1.12 442960 119 5091 436577 1.15 441668 120 5028 434203 1.14 439231 121 5371 434467 1.22 439838 122 5512 436277 1.25 441789 123 5653 433796 1.29 439449 124 5636 432475 1.29 438111 125 5922 431378 1.35 437300 126 6004 431732 1.37 437736 127 6168 428336 1.42 434504 128 6242 427717 1.44 433959 129 6452 427261 1.49 433713 130 6692 426760 1.54 433452 131 6845 426050 1.58 432895 132 6817 423622 1.58 430439 133 7169 425073 1.66 432242 134 7004 424833 1.62 431837 135 7388 423044 1.72 430432 136 7522 421410 1.75 428932 137 8104 420386 1.89 428490 138 8097 421369 1.89 429466 139 8479 418960 1.98 427439 140 12281 424075 2.81 436356 141 12226 420195 2.83 432421 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 5212 1907749 0.27 1912961 2 4388 1909297 0.23 1913685 3 4357 1896327 0.23 1900684 4 4231 1897332 0.22 1901563 5 4273 1889657 0.23 1893930 6 4139 1889087 0.22 1893226 7 4368 1890636 0.23 1895004 8 4414 1906420 0.23 1910834 9 4403 1901854 0.23 1906257 10 4385 1897748 0.23 1902133 11 4244 1902350 0.22 1906594 12 4389 1886588 0.23 1890977 13 4273 1878160 0.23 1882433 14 4432 1877495 0.24 1881927 15 4342 1881302 0.23 1885644 16 4460 1882506 0.24 1886966 17 4441 1890896 0.23 1895337 18 4502 1891398 0.24 1895900 19 4514 1893976 0.24 1898490 20 4506 1898664 0.24 1903170 21 4361 1888736 0.23 1893097 22 4431 1887452 0.23 1891883 23 4550 1898452 0.24 1903002 24 4476 1886254 0.24 1890730 25 4414 1884814 0.23 1889228 26 4606 1888242 0.24 1892848 27 4472 1886551 0.24 1891023 28 4485 1888276 0.24 1892761 29 4350 1889773 0.23 1894123 30 4542 1895660 0.24 1900202 31 4371 1889625 0.23 1893996 32 4581 1898243 0.24 1902824 33 4479 1884594 0.24 1889073 34 4455 1883992 0.24 1888447 35 4443 1880446 0.24 1884889 36 4451 1884250 0.24 1888701 37 4440 1889210 0.23 1893650 38 4469 1893957 0.24 1898426 39 4602 1883815 0.24 1888417 40 4517 1881392 0.24 1885909 41 4663 1883876 0.25 1888539 42 4721 1876058 0.25 1880779 43 4642 1877810 0.25 1882452 44 4903 1886187 0.26 1891090 45 4912 1881003 0.26 1885915 46 5035 1885478 0.27 1890513 47 5162 1883277 0.27 1888439 48 5416 1884096 0.29 1889512 49 5501 1881137 0.29 1886638 50 5696 1885587 0.30 1891283 51 5732 1880041 0.30 1885773 52 5910 1883597 0.31 1889507 53 5904 1884267 0.31 1890171 54 5798 1879766 0.31 1885564 55 5973 1874667 0.32 1880640 56 6129 1880007 0.32 1886136 57 6252 1876686 0.33 1882938 58 6156 1880196 0.33 1886352 59 6231 1879793 0.33 1886024 60 6482 1882653 0.34 1889135 61 6403 1874002 0.34 1880405 62 6383 1881021 0.34 1887404 63 6538 1868877 0.35 1875415 64 6698 1873373 0.36 1880071 65 6719 1873706 0.36 1880425 66 6998 1880943 0.37 1887941 67 6927 1879299 0.37 1886226 68 6960 1880413 0.37 1887373 69 6853 1871185 0.36 1878038 70 6970 1869283 0.37 1876253 71 7139 1870614 0.38 1877753 72 6998 1873364 0.37 1880362 73 7415 1865997 0.40 1873412 74 7498 1881244 0.40 1888742 75 7552 1869412 0.40 1876964 76 7641 1870761 0.41 1878402 77 7935 1867092 0.42 1875027 78 7937 1868721 0.42 1876658 79 7965 1866904 0.42 1874869 80 8223 1870929 0.44 1879152 81 8202 1864318 0.44 1872520 82 8451 1863939 0.45 1872390 83 8421 1861786 0.45 1870207 84 8805 1861521 0.47 1870326 85 8802 1862195 0.47 1870997 86 9241 1866456 0.49 1875697 87 9196 1859326 0.49 1868522 88 9602 1860262 0.51 1869864 89 9903 1863263 0.53 1873166 90 10032 1863133 0.54 1873165 91 10325 1855473 0.55 1865798 92 10615 1861743 0.57 1872358 93 10997 1855064 0.59 1866061 94 11378 1855226 0.61 1866604 95 11523 1857915 0.62 1869438 96 11740 1851129 0.63 1862869 97 12130 1851890 0.65 1864020 98 12801 1853543 0.69 1866344 99 12864 1850000 0.69 1862864 100 13446 1853006 0.72 1866452 101 13834 1853359 0.74 1867193 102 14239 1850666 0.76 1864905 103 14567 1847145 0.78 1861712 104 14737 1848348 0.79 1863085 105 15512 1846665 0.83 1862177 106 15769 1840351 0.85 1856120 107 16497 1842145 0.89 1858642 108 16804 1837877 0.91 1854681 109 17415 1835428 0.94 1852843 110 18013 1840136 0.97 1858149 111 18712 1830173 1.01 1848885 112 18838 1832045 1.02 1850883 113 19408 1828448 1.05 1847856 114 20319 1824846 1.10 1845165 115 20355 1820834 1.11 1841189 116 21247 1825982 1.15 1847229 117 21810 1816567 1.19 1838377 118 22660 1814244 1.23 1836904 119 23213 1813546 1.26 1836759 120 23851 1807503 1.30 1831354 121 24458 1801548 1.34 1826006 122 24832 1804670 1.36 1829502 123 25627 1803371 1.40 1828998 124 26469 1798302 1.45 1824771 125 26759 1796317 1.47 1823076 126 27660 1792470 1.52 1820130 127 28071 1786184 1.55 1814255 128 28828 1788744 1.59 1817572 129 29661 1782934 1.64 1812595 130 30227 1782267 1.67 1812494 131 30780 1774308 1.71 1805088 132 31566 1769097 1.75 1800663 133 32380 1764814 1.80 1797194 134 32775 1765027 1.82 1797802 135 33962 1759425 1.89 1793387 136 34880 1757729 1.95 1792609 137 36421 1761696 2.03 1798117 138 39238 1755438 2.19 1794676 139 39994 1747622 2.24 1787616 140 39211 1744323 2.20 1783534 141 41882 1738839 2.35 1780721 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 58212 229854 20.21 288066 2 58042 228098 20.28 286140 3 57802 228566 20.18 286368 4 57579 227159 20.22 284738 5 57178 227526 20.08 284704 6 57032 226433 20.12 283465 7 56685 226341 20.03 283026 8 57001 225775 20.16 282776 9 56616 225518 20.07 282134 10 55869 226034 19.82 281903 11 55831 224687 19.90 280518 12 56294 225431 19.98 281725 13 55315 224450 19.77 279765 14 55661 224236 19.89 279897 15 55389 224816 19.77 280205 16 54438 224152 19.54 278590 17 54603 223712 19.62 278315 18 54169 223262 19.53 277431 19 54099 220687 19.69 274786 20 53689 220131 19.61 273820 21 53082 219468 19.48 272550 22 53467 218460 19.66 271927 23 52852 217846 19.52 270698 24 52690 216860 19.55 269550 25 52610 216054 19.58 268664 26 52231 214928 19.55 267159 27 51743 213717 19.49 265460 28 51345 213709 19.37 265054 29 51257 211377 19.52 262634 30 50842 210794 19.43 261636 31 50553 210367 19.37 260920 32 50040 208497 19.36 258537 33 50405 208204 19.49 258609 34 49612 206624 19.36 256236 35 48888 206151 19.17 255039 36 49139 204338 19.39 253477 37 49149 204980 19.34 254129 38 48261 201841 19.30 250102 39 47911 201375 19.22 249286 40 47594 199750 19.24 247344 41 47495 197812 19.36 245307 42 47250 197870 19.28 245120 43 46969 197410 19.22 244379 44 46474 195443 19.21 241917 45 45892 193694 19.15 239586 46 45566 192781 19.12 238347 47 45343 190527 19.22 235870 48 45290 190787 19.18 236077 49 44801 188602 19.19 233403 50 44536 188604 19.10 233140 51 44358 186684 19.20 231042 52 44526 184301 19.46 228827 53 43482 183978 19.12 227460 54 43265 181819 19.22 225084 55 43138 181201 19.23 224339 56 42644 180251 19.13 222895 57 42612 179216 19.21 221828 58 42269 178194 19.17 220463 59 41804 176506 19.15 218310 60 41305 174648 19.13 215953 61 41201 173611 19.18 214812 62 41010 173359 19.13 214369 63 40522 171456 19.12 211978 64 40248 169668 19.17 209916 65 39825 168578 19.11 208403 66 39917 167414 19.25 207331 67 39177 166437 19.05 205614 68 39146 164893 19.19 204039 69 38819 163871 19.15 202690 70 38352 163232 19.03 201584 71 38380 160787 19.27 199167 72 37764 159912 19.10 197676 73 38056 158886 19.32 196942 74 37008 158368 18.94 195376 75 37020 156909 19.09 193929 76 36788 155471 19.13 192259 77 36355 153721 19.13 190076 78 36038 153247 19.04 189285 79 36041 151299 19.24 187340 80 35252 149868 19.04 185120 81 34855 149791 18.88 184646 82 34804 147121 19.13 181925 83 34552 145404 19.20 179956 84 34056 145199 19.00 179255 85 33926 143379 19.13 177305 86 33486 143150 18.96 176636 87 33583 141386 19.19 174969 88 32586 140087 18.87 172673 89 32549 139052 18.97 171601 90 32526 137913 19.08 170439 91 32367 137352 19.07 169719 92 31797 135519 19.00 167316 93 31677 134116 19.11 165793 94 31347 133553 19.01 164900 95 31179 132190 19.09 163369 96 30422 130792 18.87 161214 97 30363 129642 18.98 160005 98 29963 127930 18.98 157893 99 29930 127468 19.02 157398 100 29683 126459 19.01 156142 101 29299 125323 18.95 154622 102 29142 124013 19.03 153155 103 28628 122387 18.96 151015 104 28361 121738 18.89 150099 105 27810 119870 18.83 147680 106 27880 118772 19.01 146652 107 27407 117940 18.86 145347 108 27400 116919 18.99 144319 109 27054 116024 18.91 143078 110 26715 114912 18.86 141627 111 26764 113815 19.04 140579 112 26201 112475 18.89 138676 113 26302 111349 19.11 137651 114 25878 109942 19.05 135820 115 25465 109133 18.92 134598 116 25364 107683 19.06 133047 117 24978 106979 18.93 131957 118 24624 105953 18.86 130577 119 24317 104319 18.90 128636 120 24090 103709 18.85 127799 121 23880 102757 18.86 126637 122 23652 101948 18.83 125600 123 23427 100746 18.87 124173 124 23562 99579 19.13 123141 125 22987 98808 18.87 121795 126 22601 97253 18.86 119854 127 22627 96425 19.01 119052 128 22238 95858 18.83 118096 129 21917 94566 18.82 116483 130 22009 93641 19.03 115650 131 21590 92310 18.96 113900 132 21289 92112 18.77 113401 133 21261 90507 19.02 111768 134 20700 90042 18.69 110742 135 20534 88613 18.81 109147 136 20169 87292 18.77 107461 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 7208 392022 1.81 399230 2 5348 391137 1.35 396485 3 3914 390239 0.99 394153 4 3227 389394 0.82 392621 5 2631 388439 0.67 391070 6 2339 387988 0.60 390327 7 2237 386370 0.58 388607 8 1897 387150 0.49 389047 9 1682 386480 0.43 388162 10 1600 386435 0.41 388035 11 1481 387570 0.38 389051 12 1331 383721 0.35 385052 13 1411 384143 0.37 385554 14 1250 384490 0.32 385740 15 1147 383911 0.30 385058 16 1171 383080 0.30 384251 17 1071 382867 0.28 383938 18 1079 381883 0.28 382962 19 1041 381220 0.27 382261 20 943 378585 0.25 379528 21 983 378896 0.26 379879 22 913 375772 0.24 376685 23 919 376813 0.24 377732 24 907 373386 0.24 374293 25 923 372055 0.25 372978 26 842 370575 0.23 371417 27 853 369810 0.23 370663 28 869 366640 0.24 367509 29 834 366312 0.23 367146 30 817 363646 0.22 364463 31 841 363029 0.23 363870 32 790 359508 0.22 360298 33 787 358704 0.22 359491 34 781 356895 0.22 357676 35 808 354973 0.23 355781 36 815 352407 0.23 353222 37 793 350554 0.23 351347 38 756 350256 0.22 351012 39 738 346655 0.21 347393 40 781 345757 0.23 346538 41 779 342501 0.23 343280 42 728 339459 0.21 340187 43 768 337977 0.23 338745 44 791 335848 0.23 336639 45 750 334761 0.22 335511 46 738 332789 0.22 333527 47 716 330737 0.22 331453 48 774 327738 0.24 328512 49 748 326559 0.23 327307 50 693 324240 0.21 324933 51 711 322921 0.22 323632 52 755 320150 0.24 320905 53 690 316900 0.22 317590 54 678 315141 0.21 315819 55 756 312496 0.24 313252 56 719 311639 0.23 312358 57 729 309202 0.24 309931 58 647 306227 0.21 306874 59 665 303674 0.22 304339 60 704 302167 0.23 302871 61 702 299623 0.23 300325 62 686 298736 0.23 299422 63 716 295584 0.24 296300 64 647 293508 0.22 294155 65 584 291498 0.20 292082 66 639 289669 0.22 290308 67 658 287124 0.23 287782 68 647 286555 0.23 287202 69 641 282834 0.23 283475 70 620 281426 0.22 282046 71 606 278528 0.22 279134 72 646 277191 0.23 277837 73 639 274461 0.23 275100 74 594 273820 0.22 274414 75 590 269635 0.22 270225 76 563 268408 0.21 268971 77 632 265750 0.24 266382 78 609 262938 0.23 263547 79 643 261793 0.25 262436 80 636 258539 0.25 259175 81 623 257410 0.24 258033 82 593 254292 0.23 254885 83 578 252513 0.23 253091 84 568 250730 0.23 251298 85 566 248216 0.23 248782 86 526 245165 0.21 245691 87 538 243754 0.22 244292 88 556 242450 0.23 243006 89 566 239098 0.24 239664 90 514 238164 0.22 238678 91 523 234758 0.22 235281 92 525 233747 0.22 234272 93 580 230461 0.25 231041 94 521 229981 0.23 230502 95 558 228070 0.24 228628 96 511 225153 0.23 225664 97 514 223569 0.23 224083 98 502 221028 0.23 221530 99 488 219196 0.22 219684 100 486 217321 0.22 217807 101 463 215315 0.21 215778 102 463 213026 0.22 213489 103 487 210904 0.23 211391 104 467 209686 0.22 210153 105 503 206232 0.24 206735 106 490 205671 0.24 206161 107 464 203705 0.23 204169 108 478 201156 0.24 201634 109 454 198818 0.23 199272 110 444 197087 0.22 197531 111 476 195398 0.24 195874 112 423 193148 0.22 193571 113 435 191294 0.23 191729 114 428 189713 0.23 190141 115 429 187644 0.23 188073 116 448 185796 0.24 186244 117 400 183569 0.22 183969 118 422 183006 0.23 183428 119 393 180419 0.22 180812 120 406 177621 0.23 178027 121 396 176475 0.22 176871 122 385 174609 0.22 174994 123 391 173312 0.23 173703 124 450 170700 0.26 171150 125 411 169200 0.24 169611 126 410 168111 0.24 168521 127 428 165535 0.26 165963 128 447 164176 0.27 164623 129 413 162654 0.25 163067 130 384 160266 0.24 160650 131 392 158628 0.25 159020 132 363 156844 0.23 157207 133 352 155264 0.23 155616 134 398 153702 0.26 154100 135 370 152857 0.24 153227 136 408 148745 0.27 149153 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 43564 1650911 2.57 1694475 2 30149 1650422 1.79 1680571 3 22029 1649861 1.32 1671890 4 17037 1652885 1.02 1669922 5 13945 1649361 0.84 1663306 6 12046 1646436 0.73 1658482 7 10572 1643644 0.64 1654216 8 9895 1635757 0.60 1645652 9 8913 1629617 0.54 1638530 10 8227 1623863 0.50 1632090 11 7588 1620607 0.47 1628195 12 7072 1615594 0.44 1622666 13 6478 1611205 0.40 1617683 14 6381 1605062 0.40 1611443 15 5874 1597394 0.37 1603268 16 5461 1592656 0.34 1598117 17 5263 1586760 0.33 1592023 18 5045 1579763 0.32 1584808 19 4764 1574144 0.30 1578908 20 4557 1567353 0.29 1571910 21 4498 1559738 0.29 1564236 22 4220 1553914 0.27 1558134 23 4162 1548106 0.27 1552268 24 4117 1540781 0.27 1544898 25 3811 1533175 0.25 1536986 26 3840 1524949 0.25 1528789 27 3749 1518247 0.25 1521996 28 3686 1511854 0.24 1515540 29 3605 1503554 0.24 1507159 30 3482 1498143 0.23 1501625 31 3582 1489890 0.24 1493472 32 3514 1481638 0.24 1485152 33 3505 1472959 0.24 1476464 34 3451 1463939 0.24 1467390 35 3433 1458589 0.23 1462022 36 3444 1449144 0.24 1452588 37 3323 1442209 0.23 1445532 38 3346 1434917 0.23 1438263 39 3263 1427967 0.23 1431230 40 3271 1416766 0.23 1420037 41 3248 1409179 0.23 1412427 42 3251 1399512 0.23 1402763 43 3329 1392064 0.24 1395393 44 3237 1382607 0.23 1385844 45 3226 1373756 0.23 1376982 46 3198 1364885 0.23 1368083 47 3106 1357546 0.23 1360652 48 3298 1348730 0.24 1352028 49 3122 1338969 0.23 1342091 50 3014 1334036 0.23 1337050 51 3155 1323609 0.24 1326764 52 3040 1315200 0.23 1318240 53 3066 1308614 0.23 1311680 54 3093 1298965 0.24 1302058 55 3128 1290997 0.24 1294125 56 2979 1278883 0.23 1281862 57 2926 1270361 0.23 1273287 58 2931 1262510 0.23 1265441 59 3032 1253214 0.24 1256246 60 2923 1245057 0.23 1247980 61 2925 1237110 0.24 1240035 62 2916 1227711 0.24 1230627 63 2786 1219687 0.23 1222473 64 2938 1209898 0.24 1212836 65 2918 1201684 0.24 1204602 66 2983 1192153 0.25 1195136 67 2831 1182393 0.24 1185224 68 2637 1175841 0.22 1178478 69 2970 1166800 0.25 1169770 70 2767 1156895 0.24 1159662 71 2753 1149194 0.24 1151947 72 2702 1140013 0.24 1142715 73 2787 1130843 0.25 1133630 74 2853 1120286 0.25 1123139 75 2628 1113257 0.24 1115885 76 2772 1101827 0.25 1104599 77 2634 1094919 0.24 1097553 78 2747 1086152 0.25 1088899 79 2754 1078992 0.25 1081746 80 2653 1066998 0.25 1069651 81 2529 1060388 0.24 1062917 82 2540 1049767 0.24 1052307 83 2601 1040447 0.25 1043048 84 2564 1033024 0.25 1035588 85 2486 1022740 0.24 1025226 86 2446 1016786 0.24 1019232 87 2537 1007097 0.25 1009634 88 2501 997318 0.25 999819 89 2540 989595 0.26 992135 90 2480 980511 0.25 982991 91 2483 973279 0.25 975762 92 2344 960962 0.24 963306 93 2545 953656 0.27 956201 94 2378 945527 0.25 947905 95 2285 938949 0.24 941234 96 2349 927877 0.25 930226 97 2226 920947 0.24 923173 98 2264 911941 0.25 914205 99 2430 902743 0.27 905173 100 2400 894642 0.27 897042 101 2267 886588 0.26 888855 102 2246 879285 0.25 881531 103 2281 870674 0.26 872955 104 2364 861671 0.27 864035 105 2309 854459 0.27 856768 106 2276 846711 0.27 848987 107 2188 839073 0.26 841261 108 2229 829998 0.27 832227 109 2269 822587 0.28 824856 110 2376 812772 0.29 815148 111 2163 806253 0.27 808416 112 2257 797766 0.28 800023 113 2137 788854 0.27 790991 114 2204 782494 0.28 784698 115 2298 775811 0.30 778109 116 2213 767439 0.29 769652 117 2123 758641 0.28 760764 118 2059 751456 0.27 753515 119 2087 742483 0.28 744570 120 2327 736776 0.31 739103 121 2005 729074 0.27 731079 122 2126 719116 0.29 721242 123 2092 711475 0.29 713567 124 2072 704301 0.29 706373 125 2032 697631 0.29 699663 126 2049 691026 0.30 693075 127 1974 682432 0.29 684406 128 2016 675212 0.30 677228 129 1998 668170 0.30 670168 130 2037 661311 0.31 663348 131 2063 655457 0.31 657520 132 1946 646133 0.30 648079 133 1921 639124 0.30 641045 134 1993 632624 0.31 634617 135 2075 626061 0.33 628136 136 2313 614006 0.38 616319