CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 69770 300990 18.82 370760 2 69896 292194 19.30 362090 3 69109 292589 19.11 361698 4 69171 295434 18.97 364605 5 68599 296165 18.81 364764 6 70133 297862 19.06 367995 7 70415 298166 19.10 368581 8 70812 305898 18.80 376710 9 71728 306530 18.96 378258 10 70636 302970 18.91 373606 11 71232 305130 18.93 376362 12 71321 303551 19.03 374872 13 71773 300771 19.27 372544 14 71544 303616 19.07 375160 15 71469 300637 19.21 372106 16 70837 298872 19.16 369709 17 70998 302103 19.03 373101 18 71334 302263 19.09 373597 19 71516 303951 19.05 375467 20 71469 303877 19.04 375346 21 71396 303807 19.03 375203 22 70877 300343 19.09 371220 23 70555 302091 18.93 372646 24 71239 299154 19.23 370393 25 71040 301907 19.05 372947 26 71189 301230 19.12 372419 27 71418 301755 19.14 373173 28 71719 301643 19.21 373362 29 71168 300533 19.15 371701 30 70919 300189 19.11 371108 31 70999 301466 19.06 372465 32 71666 304407 19.06 376073 33 71277 302418 19.07 373695 34 72158 303537 19.21 375695 35 70544 301861 18.94 372405 36 71861 300870 19.28 372731 37 70817 300843 19.05 371660 38 71679 303661 19.10 375340 39 70368 302306 18.88 372674 40 71472 300708 19.20 372180 41 71315 300881 19.16 372196 42 71131 298914 19.22 370045 43 71743 301210 19.24 372953 44 71731 302615 19.16 374346 45 71395 300737 19.19 372132 46 70942 300228 19.11 371170 47 71169 299857 19.18 371026 48 70993 299028 19.19 370021 49 70736 298442 19.16 369178 50 71084 302975 19.00 374059 51 71000 297140 19.29 368140 52 71395 299386 19.26 370781 53 71406 300365 19.21 371771 54 71327 300756 19.17 372083 55 71424 298742 19.30 370166 56 71532 299439 19.28 370971 57 71279 299852 19.21 371131 58 71140 300115 19.16 371255 59 71383 299636 19.24 371019 60 70924 296927 19.28 367851 61 71012 298536 19.22 369548 62 71113 299022 19.21 370135 63 70993 297088 19.29 368081 64 71400 296936 19.38 368336 65 70651 295848 19.28 366499 66 70798 299186 19.14 369984 67 71270 298051 19.30 369321 68 71717 299887 19.30 371604 69 72127 299618 19.40 371745 70 71358 299682 19.23 371040 71 71102 297382 19.30 368484 72 71029 297289 19.28 368318 73 71147 296227 19.37 367374 74 71391 299117 19.27 370508 75 71014 295446 19.38 366460 76 71656 298017 19.38 369673 77 71275 296826 19.36 368101 78 71285 296977 19.36 368262 79 71753 294428 19.59 366181 80 71183 295697 19.40 366880 81 71637 296687 19.45 368324 82 71407 297104 19.38 368511 83 71453 296417 19.42 367870 84 71184 296825 19.34 368009 85 71171 297302 19.32 368473 86 71995 297455 19.49 369450 87 71512 294956 19.51 366468 88 71212 296453 19.37 367665 89 70769 295902 19.30 366671 90 71252 295081 19.45 366333 91 71092 294506 19.45 365598 92 71145 295503 19.40 366648 93 70894 296226 19.31 367120 94 70766 293581 19.42 364347 95 71179 296779 19.34 367958 96 71884 294245 19.63 366129 97 71596 293894 19.59 365490 98 71412 294053 19.54 365465 99 71360 293258 19.57 364618 100 71806 293163 19.67 364969 101 71522 293831 19.58 365353 102 71297 293715 19.53 365012 103 71029 292522 19.54 363551 104 71357 292032 19.64 363389 105 71249 291625 19.63 362874 106 70876 292444 19.51 363320 107 71752 292608 19.69 364360 108 71041 291147 19.61 362188 109 71454 292321 19.64 363775 110 71675 294156 19.59 365831 111 71480 290086 19.77 361566 112 71439 291745 19.67 363184 113 71710 290652 19.79 362362 114 71924 290125 19.87 362049 115 71157 288804 19.77 359961 116 71234 291146 19.66 362380 117 71268 289392 19.76 360660 118 71860 289352 19.89 361212 119 71844 289321 19.89 361165 120 71889 288167 19.97 360056 121 71919 286056 20.09 357975 122 71816 286892 20.02 358708 123 70892 285732 19.88 356624 124 72290 286234 20.16 358524 125 70920 286739 19.83 357659 126 71659 284621 20.11 356280 127 70991 285373 19.92 356364 128 71689 284845 20.11 356534 129 71381 283635 20.11 355016 130 71185 282427 20.13 353612 131 70980 281880 20.12 352860 132 71374 281218 20.24 352592 133 70671 279276 20.19 349947 134 71300 281376 20.22 352676 135 70558 281468 20.04 352026 136 70406 278440 20.18 348846 137 71248 279347 20.32 350595 138 70879 280391 20.18 351270 139 70541 279677 20.14 350218 140 70848 278514 20.28 349362 141 73731 279063 20.90 352794 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1637 515959 0.32 517596 2 1243 518520 0.24 519763 3 1209 510627 0.24 511836 4 1269 510521 0.25 511790 5 1265 514232 0.25 515497 6 1172 514840 0.23 516012 7 1169 523163 0.22 524332 8 1233 522669 0.24 523902 9 1243 522734 0.24 523977 10 1164 525006 0.22 526170 11 1216 524147 0.23 525363 12 1228 526321 0.23 527549 13 1231 526367 0.23 527598 14 1181 521707 0.23 522888 15 1239 518396 0.24 519635 16 1263 517475 0.24 518738 17 1273 523496 0.24 524769 18 1216 522908 0.23 524124 19 1227 527862 0.23 529089 20 1267 527527 0.24 528794 21 1272 522815 0.24 524087 22 1210 516743 0.23 517953 23 1249 521451 0.24 522700 24 1224 522348 0.23 523572 25 1251 521070 0.24 522321 26 1247 525294 0.24 526541 27 1292 523720 0.25 525012 28 1296 522162 0.25 523458 29 1312 522365 0.25 523677 30 1251 521860 0.24 523111 31 1285 524805 0.24 526090 32 1275 528045 0.24 529320 33 1266 519082 0.24 520348 34 1299 523626 0.25 524925 35 1326 521392 0.25 522718 36 1266 519848 0.24 521114 37 1235 521727 0.24 522962 38 1252 519912 0.24 521164 39 1217 519107 0.23 520324 40 1227 521040 0.23 522267 41 1259 522060 0.24 523319 42 1298 524047 0.25 525345 43 1254 520760 0.24 522014 44 1299 517986 0.25 519285 45 1301 516223 0.25 517524 46 1350 524526 0.26 525876 47 1298 519029 0.25 520327 48 1417 524384 0.27 525801 49 1542 519244 0.30 520786 50 1518 518947 0.29 520465 51 1483 517218 0.29 518701 52 1502 520564 0.29 522066 53 1563 523380 0.30 524943 54 1566 521719 0.30 523285 55 1580 516370 0.31 517950 56 1630 517238 0.31 518868 57 1627 517937 0.31 519564 58 1544 517873 0.30 519417 59 1642 517957 0.32 519599 60 1658 517038 0.32 518696 61 1606 515313 0.31 516919 62 1817 518157 0.35 519974 63 1711 518871 0.33 520582 64 1797 517672 0.35 519469 65 1813 519187 0.35 521000 66 1844 518322 0.35 520166 67 1874 516747 0.36 518621 68 1880 519705 0.36 521585 69 1827 516423 0.35 518250 70 1791 517471 0.34 519262 71 1862 517557 0.36 519419 72 1837 513992 0.36 515829 73 1985 513981 0.38 515966 74 1996 518792 0.38 520788 75 1960 518288 0.38 520248 76 2067 518680 0.40 520747 77 2059 518749 0.40 520808 78 2108 516164 0.41 518272 79 2139 513791 0.41 515930 80 2052 514588 0.40 516640 81 2191 517156 0.42 519347 82 2218 516410 0.43 518628 83 2317 513228 0.45 515545 84 2293 515925 0.44 518218 85 2311 514939 0.45 517250 86 2378 516170 0.46 518548 87 2387 513630 0.46 516017 88 2533 513700 0.49 516233 89 2617 512892 0.51 515509 90 2590 512805 0.50 515395 91 2646 510150 0.52 512796 92 2720 513500 0.53 516220 93 2871 511009 0.56 513880 94 2906 513828 0.56 516734 95 2975 512970 0.58 515945 96 3035 511995 0.59 515030 97 3092 510128 0.60 513220 98 3145 512723 0.61 515868 99 3249 508578 0.63 511827 100 3363 507986 0.66 511349 101 3505 507602 0.69 511107 102 3626 510931 0.70 514557 103 3658 506766 0.72 510424 104 3746 508197 0.73 511943 105 3840 507130 0.75 510970 106 4041 511128 0.78 515169 107 4070 507644 0.80 511714 108 4253 506411 0.83 510664 109 4393 503973 0.86 508366 110 4560 506607 0.89 511167 111 4539 503793 0.89 508332 112 4670 506463 0.91 511133 113 4878 502453 0.96 507331 114 5106 503513 1.00 508619 115 5191 502348 1.02 507539 116 5285 501003 1.04 506288 117 5373 499899 1.06 505272 118 5667 501160 1.12 506827 119 5837 499635 1.15 505472 120 5763 496773 1.15 502536 121 6055 496985 1.20 503040 122 6287 498416 1.25 504703 123 6557 495724 1.31 502281 124 6503 494632 1.30 501135 125 6730 493647 1.34 500377 126 6902 493641 1.38 500543 127 7085 489845 1.43 496930 128 7115 488726 1.43 495841 129 7429 488748 1.50 496177 130 7695 487881 1.55 495576 131 7775 486833 1.57 494608 132 7847 484379 1.59 492226 133 8174 486800 1.65 494974 134 8000 486093 1.62 494093 135 8478 483869 1.72 492347 136 8586 482202 1.75 490788 137 9268 481385 1.89 490653 138 9227 481900 1.88 491127 139 9742 479510 1.99 489252 140 14168 485019 2.84 499187 141 14060 480467 2.84 494527 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 5967 2181719 0.27 2187686 2 5042 2184137 0.23 2189179 3 5012 2169012 0.23 2174024 4 4837 2170088 0.22 2174925 5 4894 2162155 0.23 2167049 6 4763 2161064 0.22 2165827 7 5018 2162997 0.23 2168015 8 5063 2181351 0.23 2186414 9 5031 2175842 0.23 2180873 10 5038 2171321 0.23 2176359 11 4895 2175938 0.22 2180833 12 5012 2156563 0.23 2161575 13 4892 2148144 0.23 2153036 14 5073 2147376 0.24 2152449 15 4917 2152212 0.23 2157129 16 5095 2152334 0.24 2157429 17 5033 2162735 0.23 2167768 18 5171 2164003 0.24 2169174 19 5159 2166394 0.24 2171553 20 5122 2171592 0.24 2176714 21 4985 2160856 0.23 2165841 22 5083 2158552 0.23 2163635 23 5189 2171820 0.24 2177009 24 5094 2158110 0.24 2163204 25 5059 2155300 0.23 2160359 26 5263 2160521 0.24 2165784 27 5142 2157811 0.24 2162953 28 5157 2160246 0.24 2165403 29 4996 2160843 0.23 2165839 30 5149 2169614 0.24 2174763 31 5012 2161461 0.23 2166473 32 5232 2170757 0.24 2175989 33 5096 2154719 0.24 2159815 34 5043 2155321 0.23 2160364 35 5039 2151650 0.23 2156689 36 5086 2154762 0.24 2159848 37 5062 2161907 0.23 2166969 38 5140 2165750 0.24 2170890 39 5220 2155556 0.24 2160776 40 5133 2152209 0.24 2157342 41 5357 2153956 0.25 2159313 42 5394 2146168 0.25 2151562 43 5299 2147857 0.25 2153156 44 5556 2157125 0.26 2162681 45 5639 2151976 0.26 2157615 46 5745 2156691 0.27 2162436 47 5925 2153042 0.27 2158967 48 6176 2156631 0.29 2162807 49 6278 2152136 0.29 2158414 50 6504 2157376 0.30 2163880 51 6557 2151623 0.30 2158180 52 6755 2154591 0.31 2161346 53 6764 2153722 0.31 2160486 54 6616 2151191 0.31 2157807 55 6857 2144257 0.32 2151114 56 7030 2150974 0.33 2158004 57 7164 2145928 0.33 2153092 58 7051 2150088 0.33 2157139 59 7153 2149568 0.33 2156721 60 7445 2152561 0.34 2160006 61 7288 2143161 0.34 2150449 62 7346 2150795 0.34 2158141 63 7445 2138106 0.35 2145551 64 7645 2142752 0.36 2150397 65 7714 2143355 0.36 2151069 66 8038 2151647 0.37 2159685 67 7912 2150273 0.37 2158185 68 7966 2152090 0.37 2160056 69 7878 2140278 0.37 2148156 70 8061 2138167 0.38 2146228 71 8138 2140336 0.38 2148474 72 8045 2142588 0.37 2150633 73 8480 2134686 0.40 2143166 74 8594 2152291 0.40 2160885 75 8666 2138435 0.40 2147101 76 8706 2140244 0.41 2148950 77 9065 2136697 0.42 2145762 78 9030 2137650 0.42 2146680 79 9110 2134609 0.42 2143719 80 9372 2139667 0.44 2149039 81 9429 2133454 0.44 2142883 82 9676 2132444 0.45 2142120 83 9696 2129147 0.45 2138843 84 10077 2128952 0.47 2139029 85 10144 2128494 0.47 2138638 86 10533 2135096 0.49 2145629 87 10603 2125650 0.50 2136253 88 11069 2126723 0.52 2137792 89 11363 2131079 0.53 2142442 90 11439 2131352 0.53 2142791 91 11801 2122594 0.55 2134395 92 12222 2128675 0.57 2140897 93 12607 2121021 0.59 2133628 94 13057 2122335 0.61 2135392 95 13126 2125400 0.61 2138526 96 13501 2117967 0.63 2131468 97 13937 2120082 0.65 2134019 98 14661 2120126 0.69 2134787 99 14838 2116908 0.70 2131746 100 15400 2119224 0.72 2134624 101 15941 2119959 0.75 2135900 102 16325 2117174 0.77 2133499 103 16600 2112522 0.78 2129122 104 16989 2114600 0.80 2131589 105 17736 2112300 0.83 2130036 106 18129 2105180 0.85 2123309 107 18808 2106389 0.89 2125197 108 19132 2101329 0.90 2120461 109 20093 2099759 0.95 2119852 110 20722 2104868 0.97 2125590 111 21226 2094261 1.00 2115487 112 21640 2094538 1.02 2116178 113 22391 2090385 1.06 2112776 114 23406 2087962 1.11 2111368 115 23395 2082356 1.11 2105751 116 24419 2088338 1.16 2112757 117 24994 2077665 1.19 2102659 118 26013 2075659 1.24 2101672 119 26632 2073745 1.27 2100377 120 27386 2066853 1.31 2094239 121 27953 2060940 1.34 2088893 122 28591 2063955 1.37 2092546 123 29414 2062658 1.41 2092072 124 30323 2057054 1.45 2087377 125 30768 2054013 1.48 2084781 126 31874 2049674 1.53 2081548 127 32135 2043474 1.55 2075609 128 33047 2045282 1.59 2078329 129 34077 2038347 1.64 2072424 130 34558 2038610 1.67 2073168 131 35301 2028599 1.71 2063900 132 36275 2022942 1.76 2059217 133 37140 2017839 1.81 2054979 134 37489 2017948 1.82 2055437 135 38783 2012767 1.89 2051550 136 40161 2009463 1.96 2049624 137 41706 2012439 2.03 2054145 138 45150 2007490 2.20 2052640 139 45832 1998194 2.24 2044026 140 44842 1995377 2.20 2040219 141 48118 1988216 2.36 2036334 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 66593 262631 20.23 329224 2 66318 261041 20.26 327359 3 65881 261554 20.12 327435 4 65680 259828 20.18 325508 5 65514 259973 20.13 325487 6 65238 259023 20.12 324261 7 64828 258713 20.04 323541 8 65109 258288 20.13 323397 9 64757 257762 20.08 322519 10 63994 258168 19.86 322162 11 63818 256946 19.90 320764 12 64375 257526 20.00 321901 13 63286 256488 19.79 319774 14 63784 256345 19.92 320129 15 63245 256920 19.75 320165 16 62341 256115 19.58 318456 17 62542 255447 19.67 317989 18 61875 254913 19.53 316788 19 61955 252413 19.71 314368 20 61377 251539 19.61 312916 21 60888 251284 19.50 312172 22 61152 249612 19.68 310764 23 60382 248843 19.53 309225 24 60284 248572 19.52 308856 25 59962 247080 19.53 307042 26 59657 245939 19.52 305596 27 59221 244047 19.53 303268 28 58593 243700 19.38 302293 29 58743 241415 19.57 300158 30 58048 240462 19.45 298510 31 57908 240584 19.40 298492 32 57304 238075 19.40 295379 33 57484 237796 19.47 295280 34 56683 236077 19.36 292760 35 55846 235399 19.17 291245 36 56184 233399 19.40 289583 37 56198 233707 19.38 289905 38 55235 230883 19.30 286118 39 54699 230243 19.20 284942 40 54330 228200 19.23 282530 41 54347 225689 19.41 280036 42 54096 226194 19.30 280290 43 53694 225282 19.25 278976 44 53165 222838 19.26 276003 45 52435 221647 19.13 274082 46 51721 220261 19.02 271982 47 51848 217730 19.23 269578 48 51764 217885 19.20 269649 49 51281 215435 19.23 266716 50 50837 215040 19.12 265877 51 50748 213025 19.24 263773 52 50893 210757 19.45 261650 53 49635 210387 19.09 260022 54 49455 207920 19.22 257375 55 49341 206951 19.25 256292 56 48786 205912 19.15 254698 57 48613 204493 19.21 253106 58 48263 203119 19.20 251382 59 47756 201530 19.16 249286 60 47076 199299 19.11 246375 61 47067 198434 19.17 245501 62 46878 197735 19.16 244613 63 46309 195645 19.14 241954 64 45931 193835 19.16 239766 65 45348 192208 19.09 237556 66 45589 190913 19.28 236502 67 44721 189548 19.09 234269 68 44679 188222 19.18 232901 69 44134 186944 19.10 231078 70 43890 186082 19.08 229972 71 43687 183537 19.23 227224 72 43218 182837 19.12 226055 73 43519 181424 19.35 224943 74 42294 180552 18.98 222846 75 42170 178868 19.08 221038 76 41950 176943 19.16 218893 77 41482 175490 19.12 216972 78 41084 174628 19.05 215712 79 40954 172628 19.17 213582 80 40289 171230 19.05 211519 81 39727 170992 18.85 210719 82 39727 167895 19.13 207622 83 39511 166053 19.22 205564 84 38785 165658 18.97 204443 85 38817 163447 19.19 202264 86 38288 163180 19.00 201468 87 38224 161100 19.18 199324 88 37084 159591 18.86 196675 89 37037 158598 18.93 195635 90 37081 156996 19.11 194077 91 36963 156596 19.10 193559 92 36314 154601 19.02 190915 93 36079 153229 19.06 189308 94 35844 152295 19.05 188139 95 35532 150992 19.05 186524 96 34815 148894 18.95 183709 97 34775 147713 19.06 182488 98 34261 146050 19.00 180311 99 33969 145133 18.97 179102 100 33857 144053 19.03 177910 101 33233 142799 18.88 176032 102 33202 141321 19.02 174523 103 32643 139788 18.93 172431 104 32421 138748 18.94 171169 105 31719 136838 18.82 168557 106 31757 135413 19.00 167170 107 31372 134330 18.93 165702 108 31166 133210 18.96 164376 109 30919 131804 19.00 162723 110 30462 131025 18.86 161487 111 30516 129714 19.05 160230 112 29855 128226 18.89 158081 113 30016 126923 19.13 156939 114 29443 125204 19.04 154647 115 29094 124307 18.97 153401 116 28824 122545 19.04 151369 117 28424 121960 18.90 150384 118 28061 120813 18.85 148874 119 27707 119033 18.88 146740 120 27643 118251 18.95 145894 121 27239 117318 18.84 144557 122 26904 116295 18.79 143199 123 26598 114752 18.82 141350 124 26847 113463 19.13 140310 125 26315 112783 18.92 139098 126 25773 110865 18.86 136638 127 25835 109569 19.08 135404 128 25354 108993 18.87 134347 129 25063 107667 18.88 132730 130 24962 106460 18.99 131422 131 24566 104970 18.96 129536 132 24209 104802 18.77 129011 133 24185 103231 18.98 127416 134 23501 102465 18.66 125966 135 23435 100787 18.87 124222 136 23015 99392 18.80 122407 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 8257 448341 1.81 456598 2 6110 447016 1.35 453126 3 4459 446071 0.99 450530 4 3682 444831 0.82 448513 5 3039 444284 0.68 447323 6 2675 443386 0.60 446061 7 2562 442095 0.58 444657 8 2165 442379 0.49 444544 9 1925 441797 0.43 443722 10 1820 441440 0.41 443260 11 1680 443523 0.38 445203 12 1566 439334 0.36 440900 13 1591 439587 0.36 441178 14 1451 439756 0.33 441207 15 1341 438777 0.30 440118 16 1362 437631 0.31 438993 17 1215 437992 0.28 439207 18 1228 436676 0.28 437904 19 1179 436132 0.27 437311 20 1070 433148 0.25 434218 21 1115 432935 0.26 434050 22 1060 429417 0.25 430477 23 1054 429927 0.24 430981 24 1003 427157 0.23 428160 25 1064 425549 0.25 426613 26 971 423366 0.23 424337 27 954 422379 0.23 423333 28 975 419615 0.23 420590 29 983 418441 0.23 419424 30 920 415537 0.22 416457 31 951 414646 0.23 415597 32 911 411896 0.22 412807 33 891 410019 0.22 410910 34 904 407556 0.22 408460 35 920 406139 0.23 407059 36 914 402833 0.23 403747 37 928 400607 0.23 401535 38 872 399881 0.22 400753 39 862 396157 0.22 397019 40 903 394827 0.23 395730 41 896 391233 0.23 392129 42 816 388108 0.21 388924 43 879 386307 0.23 387186 44 896 383488 0.23 384384 45 857 382382 0.22 383239 46 859 380053 0.23 380912 47 822 377708 0.22 378530 48 856 374597 0.23 375453 49 836 372964 0.22 373800 50 783 370335 0.21 371118 51 826 368403 0.22 369229 52 845 365328 0.23 366173 53 798 362005 0.22 362803 54 773 359858 0.21 360631 55 845 356861 0.24 357706 56 815 355661 0.23 356476 57 839 353404 0.24 354243 58 748 349435 0.21 350183 59 756 346904 0.22 347660 60 812 344987 0.23 345799 61 787 342109 0.23 342896 62 792 340914 0.23 341706 63 814 337579 0.24 338393 64 727 335466 0.22 336193 65 664 332746 0.20 333410 66 729 331028 0.22 331757 67 748 327827 0.23 328575 68 736 327173 0.22 327909 69 729 322846 0.23 323575 70 704 321399 0.22 322103 71 680 317564 0.21 318244 72 727 316517 0.23 317244 73 732 313445 0.23 314177 74 680 312597 0.22 313277 75 667 307812 0.22 308479 76 667 306075 0.22 306742 77 693 303423 0.23 304116 78 668 299923 0.22 300591 79 715 298166 0.24 298881 80 707 294600 0.24 295307 81 700 293552 0.24 294252 82 682 290017 0.23 290699 83 642 287869 0.22 288511 84 653 286429 0.23 287082 85 663 283437 0.23 284100 86 616 280172 0.22 280788 87 622 278319 0.22 278941 88 625 276512 0.23 277137 89 648 273014 0.24 273662 90 613 271496 0.23 272109 91 600 268050 0.22 268650 92 613 266019 0.23 266632 93 632 262817 0.24 263449 94 604 262349 0.23 262953 95 626 260017 0.24 260643 96 580 256782 0.23 257362 97 578 254793 0.23 255371 98 593 252528 0.23 253121 99 550 249872 0.22 250422 100 559 248160 0.22 248719 101 533 245049 0.22 245582 102 526 242888 0.22 243414 103 552 240491 0.23 241043 104 548 239238 0.23 239786 105 564 235540 0.24 236104 106 557 234237 0.24 234794 107 531 232130 0.23 232661 108 536 229548 0.23 230084 109 522 226640 0.23 227162 110 527 224557 0.23 225084 111 538 222760 0.24 223298 112 496 220068 0.22 220564 113 502 218282 0.23 218784 114 486 216442 0.22 216928 115 504 213937 0.24 214441 116 512 211786 0.24 212298 117 461 209044 0.22 209505 118 479 208234 0.23 208713 119 456 205684 0.22 206140 120 458 202546 0.23 203004 121 454 201027 0.23 201481 122 436 198987 0.22 199423 123 463 197223 0.23 197686 124 517 194217 0.27 194734 125 462 192644 0.24 193106 126 471 191755 0.25 192226 127 482 188626 0.25 189108 128 505 187021 0.27 187526 129 474 185106 0.26 185580 130 445 182792 0.24 183237 131 463 180577 0.26 181040 132 411 178823 0.23 179234 133 410 176956 0.23 177366 134 459 175137 0.26 175596 135 424 173816 0.24 174240 136 476 169376 0.28 169852 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 49851 1887602 2.57 1937453 2 34330 1886813 1.79 1921143 3 25170 1886522 1.32 1911692 4 19492 1889311 1.02 1908803 5 15989 1885743 0.84 1901732 6 13741 1883495 0.72 1897236 7 12101 1878572 0.64 1890673 8 11316 1869905 0.60 1881221 9 10194 1862925 0.54 1873119 10 9379 1856411 0.50 1865790 11 8701 1851780 0.47 1860481 12 8093 1846793 0.44 1854886 13 7430 1841858 0.40 1849288 14 7304 1835379 0.40 1842683 15 6783 1825909 0.37 1832692 16 6231 1820798 0.34 1827029 17 5924 1814164 0.33 1820088 18 5713 1806292 0.32 1812005 19 5408 1799467 0.30 1804875 20 5193 1790460 0.29 1795653 21 5135 1782630 0.29 1787765 22 4805 1775609 0.27 1780414 23 4754 1769148 0.27 1773902 24 4655 1760872 0.26 1765527 25 4372 1751687 0.25 1756059 26 4347 1743025 0.25 1747372 27 4294 1736043 0.25 1740337 28 4214 1727372 0.24 1731586 29 4092 1718352 0.24 1722444 30 3981 1711154 0.23 1715135 31 4101 1702111 0.24 1706212 32 4022 1692628 0.24 1696650 33 3949 1683471 0.23 1687420 34 3962 1672877 0.24 1676839 35 3907 1666341 0.23 1670248 36 3974 1655632 0.24 1659606 37 3815 1647935 0.23 1651750 38 3812 1639560 0.23 1643372 39 3748 1631345 0.23 1635093 40 3768 1618132 0.23 1621900 41 3716 1608917 0.23 1612633 42 3658 1599645 0.23 1603303 43 3820 1589807 0.24 1593627 44 3714 1579223 0.23 1582937 45 3676 1570296 0.23 1573972 46 3661 1559291 0.23 1562952 47 3526 1551151 0.23 1554677 48 3737 1540566 0.24 1544303 49 3610 1530492 0.24 1534102 50 3419 1523319 0.22 1526738 51 3587 1511516 0.24 1515103 52 3463 1502073 0.23 1505536 53 3516 1495007 0.23 1498523 54 3507 1483128 0.24 1486635 55 3573 1473253 0.24 1476826 56 3397 1461355 0.23 1464752 57 3363 1451020 0.23 1454383 58 3332 1441768 0.23 1445100 59 3480 1431113 0.24 1434593 60 3369 1421131 0.24 1424500 61 3303 1412317 0.23 1415620 62 3300 1402474 0.23 1405774 63 3167 1394313 0.23 1397480 64 3307 1381218 0.24 1384525 65 3328 1371643 0.24 1374971 66 3346 1361707 0.25 1365053 67 3246 1350302 0.24 1353548 68 3003 1342240 0.22 1345243 69 3423 1331965 0.26 1335388 70 3153 1320670 0.24 1323823 71 3137 1312496 0.24 1315633 72 3058 1301165 0.23 1304223 73 3202 1290982 0.25 1294184 74 3252 1279618 0.25 1282870 75 3000 1270488 0.24 1273488 76 3155 1258876 0.25 1262031 77 3016 1250345 0.24 1253361 78 3124 1240042 0.25 1243166 79 3100 1231778 0.25 1234878 80 3093 1218217 0.25 1221310 81 2930 1209895 0.24 1212825 82 2876 1198474 0.24 1201350 83 2950 1187079 0.25 1190029 84 2898 1179132 0.25 1182030 85 2844 1166910 0.24 1169754 86 2831 1160030 0.24 1162861 87 2888 1148224 0.25 1151112 88 2807 1138281 0.25 1141088 89 2864 1128935 0.25 1131799 90 2816 1118772 0.25 1121588 91 2845 1109919 0.26 1112764 92 2694 1096508 0.25 1099202 93 2907 1087932 0.27 1090839 94 2704 1079122 0.25 1081826 95 2644 1070638 0.25 1073282 96 2688 1059094 0.25 1061782 97 2532 1050450 0.24 1052982 98 2607 1039355 0.25 1041962 99 2746 1030212 0.27 1032958 100 2747 1020731 0.27 1023478 101 2575 1011540 0.25 1014115 102 2526 1002932 0.25 1005458 103 2603 992874 0.26 995477 104 2700 982877 0.27 985577 105 2612 974512 0.27 977124 106 2597 965351 0.27 967948 107 2485 956720 0.26 959205 108 2537 947030 0.27 949567 109 2607 937911 0.28 940518 110 2683 927420 0.29 930103 111 2442 918669 0.27 921111 112 2527 909872 0.28 912399 113 2438 899755 0.27 902193 114 2507 892304 0.28 894811 115 2606 884165 0.29 886771 116 2511 875013 0.29 877524 117 2406 864874 0.28 867280 118 2357 856589 0.27 858946 119 2376 846328 0.28 848704 120 2625 839648 0.31 842273 121 2289 830862 0.27 833151 122 2385 820243 0.29 822628 123 2380 810777 0.29 813157 124 2377 802400 0.30 804777 125 2301 794722 0.29 797023 126 2339 786735 0.30 789074 127 2259 777703 0.29 779962 128 2295 768546 0.30 770841 129 2311 761098 0.30 763409 130 2272 752936 0.30 755208 131 2321 746400 0.31 748721 132 2222 736861 0.30 739083 133 2169 728102 0.30 730271 134 2265 720617 0.31 722882 135 2352 712474 0.33 714826 136 2635 699744 0.38 702379