pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
5475057	C	T	True	2	0.0	0.167	0.143	False	True	0.00/9	0.00/4	0.40/10	0.00/5	0.00/5	0.00/9	0.38/8	0.00/9	0.22/9
5475059	A	G	True	1	0.0	0.074	0.0	False	False	0.00/11	0.00/4	0.00/11	0.29/7	0.00/5	0.00/9	0.00/10	0.00/10	0.00/11
5475148	G	A	True	0			0.25	False	True	0.00/1			0.00/1			0.00/1	0.00/1	0.50/2
5475163	C	T	True	2	0.0	0.158	0.125	False	True	0.00/6	0.00/9	0.10/10	0.18/11	0.38/8	0.15/13	0.14/7	0.00/12	0.25/8
5475229	C	A	True	2	0.0	0.025	0.119	False	False	0.00/5	0.00/8	0.08/12	0.00/13	0.00/7	0.00/14	0.25/8	0.08/12	0.25/8
5475290	A	C	True	2	0.0	0.027	0.176	False	False	0.00/9	0.00/8	0.08/12	0.00/10	0.00/7	0.00/10	0.38/8	0.00/8	0.38/8
5475291	T	A	True	2	0.0	0.028	0.176	False	False	0.00/9	0.00/8	0.09/11	0.00/10	0.00/7	0.00/10	0.38/8	0.00/8	0.38/8
5475300	T	C	True	1	0.0	0.152	0.0	False	False	0.00/9	0.00/8	0.00/10	0.45/11	0.00/4	0.00/10	0.00/8	0.00/8	0.00/7
5475339	C	A	True	1	0.0	0.192	0.04	False	False	0.00/8	0.00/6	0.17/6	0.11/9	0.60/5	0.00/8	0.00/6	0.00/5	0.17/6
5475373	A	G	True	1	0.0	0.038	0.0	False	False	0.00/8	0.00/7	0.00/7	0.00/8	0.25/4	0.00/7	0.00/4	0.00/3	0.00/4
5475374	A	G	True	1	0.0	0.037	0.0	False	False	0.00/8	0.00/7	0.00/8	0.00/8	0.25/4	0.00/7	0.00/4	0.00/2	0.00/4
5475429	A	C	True	1	0.0	0.045	0.0	False	False	0.00/8	0.00/5	0.25/4	0.00/8	0.00/5	0.00/4	0.00/2	0.00/2	0.00/3
5475431	T	C	True	1	0.0	0.045	0.0	False	False	0.00/8	0.00/5	0.25/4	0.00/8	0.00/5	0.00/4	0.00/2	0.00/2	0.00/3
5475477	T	A	True	1	0.0	0.056	0.0	False	False	0.00/6	0.00/3	0.25/4	0.00/6	0.00/5	0.00/2	0.00/4	0.00/2	0.00/4
5475490	G	C	True	0		0.25		False	False	0.00/1		0.00/2	1.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/2		
5475517	A	G	True	1	0.0	0.095	0.0	False	False	0.00/9	0.00/3	0.00/5	0.25/8	0.00/5	0.00/2	0.00/5	0.00/2	0.00/4
5475554	G	C	True	0		0.25		False	False	0.00/2		0.50/2	0.00/1	0.00/1		0.00/2		
5475555	G	C	True	0		0.25		False	False	0.00/2		0.50/2	0.00/1	0.00/1		0.00/2		
5475654	T	C	True	1		0.0	0.077	False	False	0.00/3	0.00/3	0.00/8	0.00/6	0.00/2	0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.00/4
5475706	A	G	True	1		0.048	0.0	False	False	0.00/3	0.25/4	0.00/7	0.00/6	0.00/4	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/5
5475707	A	G	True	1		0.048	0.0	False	False	0.00/3	0.25/4	0.00/7	0.00/6	0.00/4	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/5
5475708	T	G	True	1		0.048	0.0	False	False	0.00/3	0.25/4	0.00/7	0.00/6	0.00/4	0.00/2	0.00/3	0.00/2	0.00/5
5475764	A	G	True	1		0.0	0.067	False	False	0.00/3	0.00/5	0.00/4	0.00/6	0.00/3	0.00/2	0.25/4	0.00/1	0.00/8
5475821	T	C	True	1		0.0	0.2	False	False	0.00/3	0.00/5	0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.00/2	0.33/3	0.00/1	0.25/4
5475847	A	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/5	0.00/4	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.00/3	0.00/1	0.00/5
