pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
108546023	T	C	True	4	0.25	0.0	0.324	False	False	0.25/8	0.00/11	0.00/5	0.00/7	0.00/7	0.56/9	0.25/12	0.00/6	0.43/7
108546056	A	G	True	1	0.0	0.029	0.0	False	False	0.00/6	0.00/12	0.25/4	0.00/11	0.00/7	0.00/9	0.00/10	0.00/5	0.00/6
108546057	C	G	True	1	0.0	0.036	0.0	False	False	0.00/6	0.00/11	0.25/4	0.00/8	0.00/5	0.00/8	0.00/9	0.00/4	0.00/4
108546077	T	G	True	1	0.125	0.034	0.0	False	False	0.12/8	0.00/8	0.25/4	0.00/9	0.00/8	0.00/12	0.00/12	0.00/5	0.00/8
108546103	T	C	True	4	0.286	0.0	0.27	False	False	0.29/7	0.00/8	0.00/5	0.00/9	0.00/7	0.33/12	0.25/12	0.00/5	0.38/8
108546123	T	G	True	1	0.0	0.062	0.0	False	False	0.00/6	0.25/8	0.00/5	0.00/11	0.00/8	0.00/10	0.00/11	0.00/5	0.00/10
108546179	T	G	True	1	0.0	0.0	0.029	False	False	0.00/10	0.00/11	0.00/5	0.00/12	0.00/9	0.00/7	0.00/12	0.25/4	0.00/11
108546180	T	A	True	1	0.0	0.0	0.029	False	False	0.00/10	0.00/11	0.00/5	0.00/12	0.00/9	0.00/7	0.00/12	0.25/4	0.00/11
108546185	G	A	True	1		0.0	0.167	False	True	0.00/1	0.00/3	0.00/1	0.00/2	0.00/5	0.00/1	0.25/4	0.00/1	
108546189	G	A	True	1		0.0	0.167	False	True	0.00/2	0.00/3	0.00/1	0.00/2	0.00/5	0.00/1	0.25/4	0.00/1	
108546217	G	T	True	1		0.0	0.2	False	False	0.33/3	0.00/3	0.00/2	0.00/2	0.00/4		0.25/4	0.00/1	
108546220	C	T	True	1	0.0	0.0	0.111	False	True	0.00/7	0.00/8	0.00/1	0.00/8	0.00/4	0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.11/9
108546248	C	T	True	1	0.0	0.0	0.143	False	True	0.00/7	0.00/6	0.00/2	0.00/6	0.00/4	0.00/3	0.25/8	0.00/1	0.11/9
108546301	G	T	True	2		0.0	0.5	True	False	0.33/3	0.00/6	0.00/2	0.00/3	0.00/3		0.75/4	0.00/2	0.50/4
108546321	T	G	True	1	0.0	0.031	0.0	False	False	0.00/8	0.00/13	0.00/3	0.00/12	0.25/4	0.00/2	0.00/13	0.00/4	0.00/10
108546323	A	G	True	2	0.0	0.061	0.0	False	False	0.00/8	0.00/13	0.25/4	0.00/12	0.25/4	0.00/2	0.00/13	0.00/4	0.00/10
108546325	T	G	True	1	0.0	0.031	0.0	False	False	0.00/8	0.00/13	0.00/3	0.00/12	0.25/4	0.00/2	0.00/13	0.00/4	0.00/10
108546327	T	A	True	1	0.0	0.032	0.0	False	False	0.00/8	0.00/13	0.00/3	0.00/11	0.25/4	0.00/2	0.00/13	0.00/4	0.00/9
108546356	G	A	True	1		0.0	0.308	False	True	0.00/2	0.00/6		0.00/5		1.00/3	0.25/4	0.00/1	0.00/5
108546362	G	T	True	1		0.0	0.077	False	False	0.00/1	0.00/6		0.00/4	0.00/1	0.00/3	0.25/4	0.00/1	0.00/5
108546410	C	A	True	1		0.0	0.111	False	False	0.00/2	0.00/2	0.00/1	0.00/4	0.00/1	0.00/1	0.25/4	0.00/1	0.00/3
108546439	T	A	True	1	0.0	0.15	0.0	False	False	0.00/6	0.50/6	0.00/6	0.00/6	0.00/2	0.00/6	0.00/8	0.00/4	0.00/11
108546444	G	C	True	1	0.0	0.0	0.053	False	False	0.00/4	0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.00/1	0.00/6	0.25/4	0.00/4	0.00/5
108546456	G	T	True	1	0.0	0.0	0.111	False	False	0.00/5	0.00/2	0.00/4	0.00/3	0.00/1	0.00/6	0.33/3	0.00/5	0.25/4
108546474	G	T	True	2	0.5	0.0	0.438	False	False	0.50/4	0.00/2	0.00/4	0.00/3	0.00/1	0.83/6	0.33/3	0.00/5	0.50/2
108546485	C	T	True	2	0.25	0.0	0.25	False	True	0.25/4	0.00/1	0.00/4	0.00/2	0.00/1	0.00/1	0.33/3		0.25/8
108546490	G	T	True	1	0.0	0.0	0.059	False	False	0.00/4	0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.00/1	0.00/6	0.00/3	0.25/4	0.00/4
108546491	A	T	True	1	0.0	0.0	0.033	False	False	0.00/9	0.00/4	0.00/8	0.00/6	0.00/2	0.00/7	0.00/6	0.25/4	0.00/13
108546492	G	C	True	1	0.0	0.0	0.059	False	False	0.00/4	0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.00/1	0.00/6	0.00/3	0.25/4	0.00/4
108546493	A	C	True	1	0.0	0.0	0.033	False	False	0.00/9	0.00/4	0.00/8	0.00/6	0.00/2	0.00/7	0.00/6	0.25/4	0.00/13
108546497	T	C	True	1	0.0	0.0	0.034	False	False	0.00/9	0.00/4	0.00/7	0.00/6	0.00/2	0.00/7	0.00/6	0.25/4	0.00/12
108546498	G	C	True	1	0.0	0.0	0.059	False	False	0.00/4	0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.00/1	0.00/6	0.00/3	0.25/4	0.00/4
108546607	A	G	True	1	0.0	0.03	0.02	False	False	0.00/13	0.00/8	0.00/12	0.00/9	0.25/4	0.07/15	0.00/14	0.00/8	0.00/14
108546686	G	T	True	4	0.333	0.0	0.296	False	False	0.33/6	0.00/4	0.00/5	0.00/7	0.00/4	0.25/8	0.38/8	0.00/3	0.38/8
108546729	G	C	True	1		0.043	0.0	False	False	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/10	0.00/5	0.00/7	0.00/7	0.00/1	0.00/7
108546754	T	A	True	2	0.125	0.0	0.2	False	False	0.12/16	0.00/15	0.00/18	0.00/21	0.00/13	0.29/21	0.25/20	0.00/11	0.15/13
108546762	T	A	True	3	0.357	0.016	0.219	False	False	0.36/14	0.00/11	0.06/18	0.00/20	0.00/13	0.18/22	0.28/18	0.00/11	0.38/13
108546852	C	A	True	1	0.0	0.032	0.0	False	False	0.00/8	0.00/8	0.00/12	0.00/7	0.25/4	0.00/8	0.00/11	0.00/7	0.00/12
108546858	T	A	True	4	0.5	0.0	0.327	False	False	0.50/10	0.00/13	0.00/13	0.00/14	0.00/10	0.29/14	0.33/15	0.00/9	0.53/17
108546892	C	A	True	1	0.125	0.0	0.121	False	False	0.12/8	0.00/7	0.00/9	0.00/5	0.00/3	0.43/7	0.00/10	0.00/5	0.09/11
108546923	T	C	True	1	0.0	0.0	0.053	False	False	0.00/10	0.00/11	0.00/9	0.00/11	0.00/8	0.10/10	0.00/10	0.25/4	0.00/14
108546957	G	T	True	1		0.0	0.286	False	False	1.00/3	0.00/5		0.00/3	0.00/4	0.25/4		0.00/1	0.50/2
