pos ref alt in_target n_oysters_with_alt alt_freq_Pum alt_freq_Qui alt_freq_Rio pop_differentiated cpg_destroying Pum1 Qui1 Qui2 Qui3 Qui4 Rio1 Rio2 Rio3 Rio4 77400062 T G True 1 0.2 False False 0.00/2 0.00/2 0.00/1 0.00/1 0.25/4 77400064 T G True 1 0.2 False False 0.00/2 0.00/2 0.00/1 0.00/1 0.25/4 77400065 A G True 1 0.2 False False 0.00/2 0.00/2 0.00/1 0.00/1 0.25/4 77400106 T A True 1 0.083 0.0 False False 0.00/2 0.00/4 0.00/3 0.25/4 0.00/1 0.00/2 0.00/1 0.00/4 77400118 A G True 1 0.062 0.0 False False 0.00/2 0.00/4 0.25/4 0.00/5 0.00/3 0.00/4 0.00/2 0.00/4 77400141 A G True 1 0.0 0.1 False False 0.00/2 0.00/4 0.00/4 0.00/8 0.00/3 0.00/4 0.00/2 0.25/4 77400160 T C True 1 0.043 0.0 False False 0.00/2 0.00/5 0.25/4 0.00/8 0.00/6 0.00/4 0.00/2 0.00/4 77400215 T C True 1 0.095 False False 0.25/4 0.50/2 0.00/8 0.00/7 77400216 A C True 1 0.083 0.0 False False 0.00/5 0.25/4 0.12/8 0.00/7 0.00/3 0.00/1 0.00/1 77400217 A T True 1 0.083 0.0 False False 0.00/5 0.25/4 0.12/8 0.00/7 0.00/4 0.00/2 0.00/1 77400250 A G True 0 0.0 0.25 False False 0.00/4 0.00/7 0.00/5 0.00/6 0.33/3 0.00/1 77400251 T A True 2 0.174 0.75 False False 0.25/4 0.43/7 0.00/5 0.00/7 0.67/3 1.00/1 77400253 A G True 0 0.0 0.4 False False 0.00/4 0.00/7 0.00/4 0.00/8 0.33/3 0.50/2 77400256 C T True 0 0.25 False True 0.00/2 0.67/3 0.00/1 0.00/2 0.00/1 0.50/2 77400263 C A True 0 0.143 0.75 False False 0.00/2 0.50/2 0.00/1 0.00/2 1.00/1 0.00/1 1.00/1 1.00/1 77400265 C A True 0 0.0 0.6 False False 0.00/2 0.00/2 0.00/1 0.00/2 1.00/1 0.00/2 1.00/1 1.00/1 77400274 T A True 2 0.304 0.615 False False 0.00/3 0.20/5 0.67/6 0.22/9 0.67/3 0.60/5 0.50/2 0.67/3 77400275 A G True 1 0.0 0.071 False False 0.00/3 0.00/6 0.00/6 0.00/9 0.25/4 0.00/5 0.00/2 0.00/3 77400319 C T True 1 0.05 0.0 False True 0.00/1 0.00/5 0.00/8 0.00/3 0.25/4 0.00/4 0.00/5 0.00/1 0.00/3 77400344 A G True 1 0.059 0.125 False False 0.67/3 0.00/11 0.13/15 0.00/13 0.08/12 0.10/10 0.30/10 0.00/3 0.00/9 77400381 T A True 2 0.6 0.063 0.128 False False 0.60/5 0.00/13 0.12/17 0.00/21 0.17/12 0.09/11 0.36/11 0.00/4 0.00/13 77400423 T A True 2 0.5 0.162 0.182 False False 0.50/6 0.14/14 0.22/18 0.12/26 0.19/16 0.09/11 0.40/10 0.00/7 0.19/16 77400426 A T True 2 0.5 0.085 0.111 False False 0.50/6 0.00/13 0.11/18 0.08/25 0.13/15 0.08/12 0.40/10 0.00/7 0.00/16 77400555 T C True 7 0.667 0.246 0.469 False False 0.67/6 0.14/14 0.44/18 0.26/19 0.07/14 0.57/7 0.29/7 0.50/4 0.50/14 77400587 T C True 6 0.8 0.333 0.538 False False 0.80/5 0.15/13 0.67/18 0.32/19 0.12/16 0.57/7 0.25/4 0.50/2 0.62/13 77400667 T A True 5 0.8 0.237 0.5 False False 0.80/5 0.21/14 0.54/13 0.20/15 0.06/17 0.67/9 0.20/5 0.40/5 0.56/9 77400677 G T True 1 0.0 0.067 False False 0.00/1 0.00/6 0.00/2 0.00/7 0.00/9 0.00/3 0.00/5 0.00/3 0.25/4 77400684 G T True 1 0.0 0.062 False False 0.00/1 0.00/6 0.00/2 0.00/6 0.00/10 0.00/3 0.00/5 0.00/4 0.25/4 77400739 A G True 4 0.211 0.438 False False 0.00/1 0.28/18 0.00/9 0.23/13 0.24/17 0.33/9 1.00/5 0.67/6 0.17/12 77400760 T C True 1 0.0 0.036 False False 0.00/3 0.00/17 0.00/8 0.00/13 0.00/14 0.00/9 0.00/4 0.25/4 0.00/11 77400761 T C True 1 0.0 0.036 False False 0.00/3 0.00/17 0.00/8 0.00/13 0.00/14 0.00/9 0.00/4 0.25/4 0.00/11 77400802 A C True 1 0.0 0.031 False False 0.00/3 0.00/18 0.00/11 0.00/10 0.00/13 0.00/12 0.00/4 0.25/4 0.00/12 77400814 G T True 1 0.0 0.083 False False 0.00/1 0.00/6 0.00/1 0.00/4 0.00/6 0.00/3 0.00/3 0.00/2 0.25/4 77400818 A C True 1 0.02 0.032 False False 0.00/3 0.06/17 0.00/13 0.00/9 0.00/10 0.00/11 0.25/4 0.00/3 0.00/13 77400987 T C True 1 0.037 0.0 False False 0.00/2 0.00/9 0.00/8 0.25/4 0.00/6 0.00/1 0.00/1 0.00/1 0.00/2