pos ref alt in_target n_oysters_with_alt alt_freq_Pum alt_freq_Qui alt_freq_Rio pop_differentiated cpg_destroying Pum1 Qui1 Qui2 Qui3 Qui4 Rio1 Rio2 Rio3 Rio4 117217001 T C True 1 0.25 0.0 0.0 False False 0.25/4 0.00/2 0.00/2 0.00/2 0.00/1 0.00/10 0.00/4 0.00/2 0.00/7 117217002 C T True 1 0.133 False True 0.00/2 1.00/1 1.00/1 0.00/6 0.00/2 0.29/7 117217060 T C True 1 0.029 0.0 False False 0.00/3 0.00/5 0.00/15 0.00/10 0.25/4 0.00/8 0.00/3 0.00/5 0.00/8 117217067 A G True 1 0.0 0.042 False False 0.00/3 0.00/6 0.00/17 0.00/10 0.00/3 0.00/8 0.25/4 0.00/4 0.00/8 117217068 A G True 1 0.0 0.042 False False 0.00/3 0.00/6 0.00/17 0.00/10 0.00/3 0.00/8 0.25/4 0.00/4 0.00/8 117217069 A G True 1 0.0 0.042 False False 0.00/3 0.00/6 0.00/15 0.00/10 0.00/3 0.00/8 0.25/4 0.00/4 0.00/8 117217071 T A True 1 0.0 0.042 False False 0.00/3 0.00/5 0.00/16 0.00/10 0.00/3 0.00/8 0.25/4 0.00/4 0.00/8 117217107 T A True 1 0.16 0.071 False False 0.33/3 0.33/3 0.07/14 0.25/8 0.08/12 0.00/3 0.20/5 0.00/8 117217128 G A True 2 0.5 0.083 False True 0.33/3 1.00/1 0.56/9 0.25/4 0.20/5 0.00/2 0.00/2 0.00/3 117217129 T C True 2 0.25 0.08 0.115 False False 0.25/4 0.20/5 0.00/14 0.17/6 0.11/9 0.00/3 0.29/7 0.00/7 117217176 G T True 2 0.4 0.429 0.167 False False 0.40/5 0.67/3 0.50/10 0.14/7 1.00/1 0.20/5 0.00/2 0.20/5 0.17/6 117217195 C A True 1 0.25 0.0 0.0 False False 0.25/4 0.00/7 0.00/2 0.00/3 0.00/1 0.00/3 0.00/4 0.00/3 117217210 G A True 2 0.286 0.444 0.158 False True 0.29/7 0.67/3 0.56/9 0.00/5 1.00/1 0.20/5 0.00/2 0.17/6 0.17/6 117217283 T A True 5 0.364 0.44 0.3 False False 0.36/11 0.50/8 0.43/7 0.14/7 1.00/3 0.33/6 0.00/3 0.50/10 0.18/11 117217287 C A True 3 0.556 0.455 False False 0.33/3 0.40/5 1.00/1 0.50/2 1.00/1 0.00/1 0.67/6 0.25/4 117217297 G C True 1 0.0 0.0 0.053 False False 0.00/5 0.00/2 0.00/4 0.00/6 0.00/3 0.00/5 0.00/3 0.25/4 0.00/7 117217314 A T True 4 0.333 0.296 0.129 False False 0.33/6 0.25/8 0.57/7 0.00/9 0.67/3 0.33/6 0.00/3 0.09/11 0.09/11 117217334 G T True 1 0.0 0.053 0.0 False False 0.00/4 0.25/4 0.00/6 0.00/7 0.00/2 0.00/6 0.00/4 0.00/7 0.00/9 117217374 C G True 1 0.0 0.0 0.091 False False 0.00/4 0.00/8 0.00/1 0.00/3 0.00/2 0.25/4 0.00/4 0.00/3 117217418 A G True 5 0.222 0.364 0.111 False False 0.22/9 0.33/12 0.33/12 0.25/12 0.62/8 0.40/5 0.00/8 0.08/13 0.10/10 117217558 G C True 1 0.062 0.0 False False 0.00/4 0.00/3 0.25/4 0.00/5 0.00/2 0.00/7 0.00/1 117217592 G A True 1 0.778 0.167 False True 0.50/2 1.00/1 1.00/4 0.50/2 0.00/2 0.33/3 0.00/1 117217601 G A True 0 0.75 0.0 False True 1.00/1 1.00/1 1.00/3 0.33/3 0.00/1 0.00/2 0.00/1 117217602 T C True 7 0.8 0.588 0.194 False False 0.80/10 0.80/10 0.62/13 0.44/18 0.60/10 0.29/7 0.00/5 0.17/12 0.25/12 117217612 G A True 0 0.857 False True 1.00/1 1.00/1 1.00/3 0.50/2 0.00/1 0.00/2 117217619 C T True 2 0.091 0.038 0.204 False True 0.09/11 0.12/8 0.00/16 0.00/19 0.10/10 0.11/9 0.33/6 0.14/14 0.25/20 117217689 C T True 2 0.083 0.06 0.25 False True 0.08/12 0.14/7 0.05/19 0.00/14 0.10/10 0.18/11 0.29/7 0.15/13 0.33/21 117217693 C T True 2 0.083 0.061 0.25 False True 0.08/12 0.17/6 0.05/19 0.00/14 0.10/10 0.17/12 0.29/7 0.17/12 0.33/21 117217698 A G True 1 0.25 0.056 0.148 False False 0.25/12 0.17/6 0.05/21 0.07/15 0.00/12 0.08/12 0.14/7 0.14/14 0.19/21 117217703 T C True 2 0.083 0.056 0.245 False False 0.08/12 0.17/6 0.05/21 0.00/15 0.08/12 0.18/11 0.33/6 0.14/14 0.32/22 117217710 G A True 0 0.25 False True 0.50/2 0.00/2 0.00/1 117217763 C T True 7 0.333 0.34 0.293 False True 0.33/9 0.60/5 0.21/14 0.38/16 0.33/12 0.26/19 0.12/8 0.25/12 0.42/19 117217767 C T True 1 0.0 0.064 0.179 False True 0.00/9 0.20/5 0.07/14 0.00/16 0.08/12 0.11/18 0.12/8 0.18/11 0.26/19 117217812 G A True 0 0.25 False True 0.00/1 0.33/3 0.00/1 1.00/1 117217821 T C True 1 0.0 0.094 0.071 False False 0.00/9 0.29/7 0.15/13 0.00/21 0.08/12 0.05/19 0.00/8 0.08/12 0.12/17 117217847 T A True 2 0.125 0.17 0.074 False False 0.12/8 0.33/6 0.00/9 0.26/19 0.08/13 0.15/20 0.00/8 0.11/9 0.00/17 117217874 T A True 1 0.0 0.025 0.0 False False 0.00/11 0.25/4 0.00/9 0.00/16 0.00/11 0.00/18 0.00/9 0.00/10 0.00/14 117217915 T C True 1 0.0 0.061 0.023 False False 0.00/10 0.25/4 0.00/9 0.08/13 0.00/7 0.00/13 0.00/7 0.12/8 0.00/15 117217923 T C True 1 0.0 0.033 0.0 False False 0.00/9 0.25/4 0.00/9 0.00/12 0.00/5 0.00/13 0.00/7 0.00/7 0.00/14 117217931 C G True 1 0.0 0.04 0.0 False False 0.00/9 0.00/2 0.00/8 0.00/11 0.25/4 0.00/13 0.00/7 0.00/5 0.00/14 117217932 C A True 1 0.0 0.043 0.0 False False 0.00/9 0.00/2 0.00/7 0.00/10 0.25/4 0.00/13 0.00/7 0.00/6 0.00/14