pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
5473024	G	T	True	1		0.0	0.077	False	False	0.00/3	0.00/7	0.00/13	0.00/2	0.00/2	0.00/3	0.25/4	0.00/3	0.00/3
5473084	A	G	True	1	0.0	0.021	0.027	False	False	0.00/11	0.00/10	0.00/20	0.00/13	0.25/4	0.00/9	0.00/12	0.17/6	0.00/10
5473085	A	C	True	2	0.0	0.044	0.194	False	False	0.00/11	0.00/9	0.10/20	0.00/12	0.00/4	0.00/9	0.33/12	0.00/5	0.30/10
5473154	C	A	True	1	0.0	0.0	0.071	False	False	0.00/4	0.00/7	0.00/5	0.00/4	0.00/2	0.25/4	0.00/4	0.00/2	0.00/4
5473176	C	A	True	1		0.056	0.0	False	False	0.00/3	0.00/7	0.00/5	0.25/4	0.00/2	0.00/4	0.00/2	0.00/1	0.00/4
5473201	C	G	True	1		0.062	0.077	False	False	0.00/3	0.00/6	0.25/4	0.00/4	0.00/2	0.00/5	0.00/2	0.00/1	0.20/5
5473299	T	C	True	1	0.0	0.049	0.097	False	False	0.00/10	0.00/6	0.14/14	0.00/14	0.00/7	0.10/10	0.00/7	0.00/8	0.33/6
5473301	A	C	True	1	0.0	0.071	0.069	False	False	0.00/10	0.00/6	0.20/15	0.00/14	0.00/7	0.00/9	0.00/6	0.00/8	0.33/6
5473304	A	T	True	1	0.0	0.071	0.08	False	False	0.00/11	0.00/6	0.20/15	0.00/14	0.00/7	0.00/7	0.00/6	0.00/7	0.40/5
5473305	T	A	True	1	0.0	0.071	0.074	False	False	0.00/13	0.00/6	0.20/15	0.00/14	0.00/7	0.00/9	0.00/6	0.00/7	0.40/5
5473307	T	A	True	1	0.0	0.071	0.107	False	False	0.00/13	0.00/6	0.20/15	0.00/14	0.00/7	0.10/10	0.00/6	0.00/7	0.40/5
5473309	T	A	True	1	0.0	0.071	0.069	False	False	0.00/13	0.00/6	0.20/15	0.00/14	0.00/7	0.00/10	0.00/6	0.00/8	0.40/5
5473312	G	A	True	1	0.0	0.0	0.105	False	True	0.00/8	0.00/5	0.00/6	0.00/7	0.00/4	0.00/7	0.33/6	0.00/5	0.00/1
5473343	T	C	True	1	0.0	0.0	0.037	False	False	0.00/12	0.00/3	0.00/15	0.00/12	0.00/6	0.00/9	0.25/4	0.00/7	0.00/7
5473357	G	T	True	1	0.0	0.062	0.0	False	False	0.00/7	0.00/3	0.00/5	0.25/4	0.00/4	0.00/7	0.00/4	0.00/3	0.00/2
5473360	G	T	True	1	0.0	0.062	0.0	False	False	0.00/8	0.00/3	0.00/5	0.25/4	0.00/4	0.00/7	0.00/3	0.00/3	0.00/2
5473420	T	G	True	1	0.0	0.0	0.042	False	False	0.00/11	0.00/7	0.00/18	0.00/14	0.00/4	0.00/7	0.00/7	0.25/4	0.00/6
5473421	A	G	True	1	0.0	0.0	0.042	False	False	0.00/11	0.00/7	0.00/18	0.00/14	0.00/4	0.00/7	0.00/7	0.25/4	0.00/6
5473429	C	A	True	1	0.0	0.031	0.0	False	False	0.00/4	0.25/4	0.00/11	0.00/14	0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.00/4	0.00/6
5473679	T	C	True	1	0.0	0.028	0.0	False	False	0.00/6	0.00/10	0.00/10	0.00/12	0.25/4	0.00/6	0.00/10	0.00/6	0.00/7
5473734	G	C	True	0		0.25		False	False	0.00/1	0.50/2		0.00/1	0.00/1		0.00/2		
5473772	T	C	True	1	0.0	0.0	0.045	False	False	0.00/5	0.00/1	0.00/6	0.00/6	0.00/2	0.00/3	0.00/9	0.25/4	0.00/6
5473870	T	A	True	1	0.0	0.0	0.053	False	False	0.00/4	0.00/5	0.00/8	0.00/8	0.00/5	0.00/12	0.00/11	0.00/7	0.25/8
5473901	G	C	True	0		0.25		False	False		1.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/1				
5473906	C	A	True	3	0.0	0.167	0.275	False	False	0.00/5	0.00/4	0.45/11	0.00/12	0.00/3	0.00/14	0.58/12	0.00/7	0.57/7
5473963	T	C	True	3	0.0	0.184	0.282	False	False	0.00/8	0.00/5	0.54/13	0.00/17	0.00/3	0.00/13	0.54/13	0.00/6	0.57/7