pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
5468118	G	A	True	1		0.143	0.125	False	True	0.00/3	0.00/5	0.50/2			0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/1
5468151	G	A	True	1		0.125	0.125	False	True	0.00/2	0.00/4	0.50/2	0.00/2		0.25/4		0.00/2	0.00/2
5468175	G	A	True	1		0.111	0.111	False	True	0.00/2	0.00/4	0.33/3	0.00/2		0.25/4		0.00/2	0.00/3
5468183	A	G	True	1		0.083	0.091	False	False	0.00/2	0.00/5	0.25/4	0.00/3		0.20/5		0.00/2	0.00/4
5468185	G	A	True	1		0.1	0.111	False	True	0.00/2	0.00/4	0.33/3	0.00/3		0.25/4		0.00/2	0.00/3
5468198	G	T	True	1		0.091	0.2	False	False	0.00/2	0.00/4	0.33/3	0.00/4		0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.33/3
5468213	G	T	True	1		0.091	0.0	False	False	0.00/2	0.00/4	0.00/3	0.25/4		0.00/5	0.00/1	0.00/2	0.00/4
5468214	T	C	True	1		0.077	0.0	False	False	0.00/2	0.00/5	0.25/4	0.00/4		0.00/6	0.00/1	0.00/2	0.00/5
5468230	A	T	True	2		0.167	0.062	False	False	0.00/3	0.00/4	0.25/4	0.25/4		0.17/6	0.00/2	0.00/2	0.00/6
5468245	G	A	True	1	0.0	0.111	0.0	False	True	0.00/4	0.00/2	0.00/3	0.25/4		0.00/4	0.00/2	0.00/2	0.00/5
5468262	G	T	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/2	0.00/1	0.00/4		0.00/2	0.00/3	0.00/3	0.00/5
5468263	T	C	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/4		0.00/3	0.00/3	0.00/3	0.00/7
5468279	T	A	True	1		0.0	0.056	False	False	0.00/3	0.00/3	0.00/2	0.00/5		0.25/4	0.00/3	0.00/3	0.00/8
5468280	T	A	True	1		0.0	0.056	False	False	0.00/3	0.00/2	0.00/2	0.00/5		0.25/4	0.00/3	0.00/3	0.00/8
5468345	A	T	True	1		0.0	0.105	False	False	0.00/2	0.00/3	0.00/3	0.00/4	0.00/1	0.00/6	0.25/4	0.00/2	0.14/7
5468346	T	C	True	1		0.0	0.1	False	False	0.00/2	0.00/3	0.00/3	0.00/4	0.00/1	0.00/6	0.25/4	0.00/2	0.12/8
5468347	G	T	True	1		0.0	0.118	False	False	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/3	0.00/1	0.00/4	0.25/4	0.00/2	0.14/7
5468348	T	C	True	1		0.0	0.05	False	False	0.00/2	0.00/3	0.00/3	0.00/4	0.00/1	0.00/6	0.25/4	0.00/2	0.00/8
5468356	A	G	True	1	0.0	0.077	0.0	False	False	0.00/4	0.00/4	0.25/4	0.00/4	0.00/1	0.00/6	0.00/4	0.00/3	0.00/7
5468382	T	C	True	1		0.062	0.0	False	False	0.00/2	0.00/3	0.00/6	0.25/4	0.00/3	0.00/8	0.00/4	0.00/3	0.00/5
5468444	T	C	True	1	0.0	0.0	0.048	False	False	0.00/5	0.00/3	0.00/8	0.00/5	0.00/6	0.00/9	0.25/4	0.00/3	0.00/5
5468450	A	G	True	1	0.0	0.0	0.053	False	False	0.00/5	0.00/3	0.00/8	0.00/5	0.00/6	0.00/8	0.25/4	0.00/3	0.00/4
5468454	A	G	True	1	0.0	0.048	0.0	False	False	0.00/5	0.00/3	0.00/8	0.25/4	0.00/6	0.00/8	0.00/4	0.00/3	0.00/4
5468509	A	T	True	1	0.0	0.111	0.0	False	False	0.00/6	0.00/4	0.17/6	0.00/4	0.25/4	0.00/7	0.00/3	0.00/1	0.00/4
5468510	A	T	True	7	1.0	1.0	1.0	False	False	1.00/6	1.00/4	1.00/5	1.00/4	1.00/4	1.00/7	1.00/3	1.00/2	1.00/4
5468512	A	C	True	7	0.333	0.706	0.562	False	False	0.33/6	0.25/4	0.80/5	1.00/4	0.75/4	0.71/7	1.00/3	0.00/2	0.25/4
5468574	G	C	True	1	0.0	0.0	0.111	False	False	0.00/4	0.00/4	0.00/4		0.00/2		0.00/1	0.00/4	0.25/4
5468656	T	G	True	1	0.0	0.0	0.067	False	False	0.00/7	0.00/9	0.00/8	0.00/5	0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.00/4	0.25/4
5468674	G	C	True	1	0.0	0.1	0.0	False	False	0.00/4	0.00/6	0.33/6	0.00/5	0.00/3	0.00/4	0.00/2	0.00/4	0.00/2
5468717	C	T	True	0		0.0	0.25	False	True	0.00/1	0.00/3	0.00/2	0.00/2	0.00/1	0.00/2	1.00/1		0.00/1
5468750	G	C	True	1		0.0	0.1	False	False	0.00/2	0.00/7	0.00/3	0.00/8	0.00/1	0.25/4	0.00/2	0.00/3	0.00/1
5468757	A	G	True	1		0.037	0.0	False	False	0.00/3	0.00/9	0.25/4	0.00/11	0.00/3	0.00/6	0.00/2	0.00/3	0.00/2
5468762	G	C	True	1		0.105	0.0	False	False	0.00/2	0.25/8	0.00/2	0.00/8	0.00/1	0.00/3	0.00/2	0.00/3	0.00/1
5468796	A	T	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/7	0.00/4	0.00/10	0.00/4	0.00/7	0.00/4	0.00/2	0.00/3
5468825	A	T	True	1		0.091	0.0	False	False	0.00/2	0.00/7	0.00/3	0.25/8	0.00/4	0.00/5	0.00/5	0.00/1	0.00/4
5468861	C	A	True	1		0.0	0.091	False	False	0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/3	0.00/1	0.00/4	0.00/1	0.00/2	0.25/4
5468868	A	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/4	0.00/6	0.00/4	0.00/5	0.00/3	0.00/3	0.00/6
5468871	T	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/4	0.00/5	0.00/3	0.00/5	0.00/3	0.00/3	0.00/6
5468872	A	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/4	0.00/5	0.00/3	0.00/5	0.00/3	0.00/3	0.00/6
5468903	A	C	True	1	0.0	0.0	0.056	False	False	0.00/5	0.00/4	0.00/6	0.00/6	0.00/4	0.00/5	0.25/4	0.00/3	0.00/6
5468965	T	C	True	2	0.0	0.0	0.353	False	False	0.00/8	0.00/3	0.00/6	0.00/9	0.00/2	0.00/4	0.50/6	0.00/2	0.60/5
5468985	G	T	True	1		0.167	0.0	False	False	0.00/1		0.00/1	0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/3		0.00/2