pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
1829025	T	C	True	1	0.0	0.045	0.0	False	False	0.00/9	0.00/7	0.25/4	0.00/8	0.00/3	0.00/6	0.00/7	0.00/3	0.00/8
1829028	T	C	True	1	0.0	0.045	0.0	False	False	0.00/8	0.00/7	0.25/4	0.00/9	0.00/2	0.00/6	0.00/5	0.00/3	0.00/7
1829047	A	G	True	1	0.0	0.125	0.083	False	False	0.00/9	0.00/7	0.40/5	0.11/9	0.00/3	0.00/5	0.22/9	0.00/3	0.00/7
1829105	A	G	True	2	0.0	0.235	0.027	False	False	0.00/5	0.08/12	0.50/10	0.12/8	0.25/4	0.00/7	0.07/14	0.00/5	0.00/11
1829121	G	C	True	1		0.0	0.037	False	False		0.00/6	0.00/9	0.00/4	0.00/4	0.00/5	0.00/9	0.25/4	0.00/9
1829149	C	T	True	4		0.357	0.267	False	True	0.00/2	0.40/5	0.50/2	0.33/6	0.00/1	0.00/2	0.43/7	0.00/2	0.25/4
1829202	C	G	True	1	0.0	0.053	0.056	False	False	0.00/4	0.00/4	0.20/5	0.00/6	0.00/4	0.25/4	0.00/7	0.00/3	0.00/4
1829208	C	G	True	1	0.0	0.0	0.062	False	False	0.00/4	0.00/4	0.00/5	0.00/6	0.00/4	0.25/4	0.00/6	0.00/3	0.00/3
1829212	C	G	True	1	0.0	0.0	0.059	False	False	0.00/4	0.00/4	0.00/5	0.00/6	0.00/4	0.25/4	0.00/6	0.00/3	0.00/4
1829275	G	T	True	1		0.062	0.0	False	False	0.00/2	0.00/5	0.00/3	0.00/4	0.25/4	0.00/3	0.00/9	0.00/4	0.00/6
1829281	G	T	True	1		0.0	0.048	False	False	0.00/2	0.00/3	0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.00/3	0.00/10	0.25/4	0.00/4
1829391	C	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/14	0.00/2	0.00/3	0.00/9	0.00/7	0.00/5	0.00/7
1829394	A	C	True	1	0.0	0.038	0.0	False	False	0.00/6	0.00/4	0.00/13	0.25/4	0.00/5	0.00/11	0.00/10	0.00/5	0.00/9
1829449	G	T	True	2	0.4	0.091	0.0	False	False	0.40/5	0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.25/4	0.00/5	0.00/3		0.00/5
1829484	C	T	True	2	0.053	0.213	0.161	False	True	0.05/19	0.31/16	0.21/19	0.25/12	0.07/14	0.21/19	0.20/15	0.17/6	0.06/16
1829489	C	T	True	4	0.05	0.25	0.224	False	True	0.05/20	0.38/16	0.26/19	0.23/13	0.12/16	0.25/20	0.31/16	0.17/6	0.12/16
1829533	T	C	True	2	0.44	0.103	0.071	False	False	0.44/25	0.00/23	0.13/23	0.00/17	0.25/24	0.05/22	0.00/17	0.00/7	0.17/24
1829535	G	A	True	1	0.333	0.059	0.0	False	True	0.33/6	0.00/5	0.00/5	0.00/2	0.20/5	0.00/4	0.00/3	0.00/1	0.00/5
1829559	C	T	True	6	0.105	0.299	0.286	False	True	0.11/19	0.37/19	0.29/14	0.38/13	0.19/21	0.24/17	0.25/12	0.50/4	0.31/16
1829642	C	T	True	5	0.235	0.292	0.412	False	True	0.24/17	0.44/16	0.11/9	0.33/9	0.21/14	0.31/16	0.38/8	0.67/3	0.57/7
1829644	G	T	True	1	0.0	0.077	0.0	False	False	0.00/6	0.00/3	0.00/3	0.00/3	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/1	0.00/5
1829649	T	C	True	6	0.208	0.196	0.348	False	False	0.21/24	0.38/16	0.00/11	0.25/12	0.12/17	0.26/19	0.40/10	0.50/6	0.36/11
1829658	G	T	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/3	0.00/3	0.00/3	0.00/2	0.00/5	0.00/1	0.00/3	0.00/5
1829665	A	T	True	2	0.053	0.204	0.02	False	False	0.05/19	0.14/14	0.10/10	0.27/15	0.27/15	0.00/21	0.11/9	0.00/8	0.00/12
1829681	A	T	True	9	0.65	0.625	0.617	False	False	0.65/20	0.62/13	0.50/12	0.73/15	0.62/16	0.55/20	0.62/8	0.75/8	0.64/11
1829687	T	A	True	1	0.35	0.071	0.021	False	False	0.35/20	0.00/13	0.08/13	0.00/15	0.20/15	0.00/19	0.00/8	0.10/10	0.00/11
1829698	C	T	True	9	0.786	0.622	0.576	False	True	0.79/14	0.71/7	0.43/7	0.73/11	0.58/12	0.42/12	0.62/8	0.71/7	0.67/6
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1829731	A	G	True	3	0.133	0.167	0.225	False	False	0.13/15	0.25/12	0.09/11	0.17/12	0.15/13	0.19/16	0.00/5	0.33/9	0.30/10
1829736	A	G	True	3	0.231	0.18	0.308	False	False	0.23/13	0.18/11	0.08/12	0.21/14	0.23/13	0.27/15	0.20/5	0.44/9	0.30/10
1829743	C	A	True	3	0.333	0.133	0.08	False	False	0.33/9	0.25/8	0.00/6	0.00/8	0.25/8	0.00/10	0.00/5	0.20/5	0.20/5
1829744	C	T	True	5	0.222	0.267	0.462	False	True	0.22/9	0.12/8	0.17/6	0.62/8	0.12/8	0.30/10	0.40/5	0.80/5	0.50/6
1829746	C	T	True	5	0.25	0.179	0.385	False	True	0.25/8	0.00/7	0.00/5	0.50/8	0.12/8	0.40/10	0.40/5	0.50/6	0.20/5
1829748	G	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	True	0.25/4	0.00/3	0.00/4	0.00/5	0.00/3	0.00/4		0.00/4	0.00/3
1829751	G	C	True	1	0.0	0.0	0.091	False	False	0.00/4	0.00/3	0.00/4	0.00/5	0.00/3	0.00/4		0.25/4	0.00/3
1829808	C	G	True	1	0.0	0.0	0.061	False	False	0.00/7	0.00/15	0.00/9	0.00/7	0.00/6	0.00/9	0.40/5	0.00/8	0.00/11
1829819	G	A	True	2	0.0	0.207	0.2	False	True	0.00/4	0.14/7	0.20/5	0.27/11	0.17/6	0.20/5	0.20/5	0.40/5	0.00/5
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1829877	G	T	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/15	0.00/7	0.00/17	0.00/6	0.00/8	0.00/10	0.00/7	0.00/7
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