pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
29212044	A	G	True	1		0.0	0.417	False	False	0.00/1	0.00/9	0.00/1	0.00/1	0.00/3	0.00/2	0.33/3		0.57/7
29212061	C	T	True	0		0.0	0.25	False	True	0.00/1	0.00/4	0.00/1		0.00/2	0.00/1	0.00/2		1.00/1
29212099	A	G	True	1		0.0	0.6	True	False	0.50/2	0.00/9	0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.33/3	0.33/3		1.00/4
29212156	A	T	True	1		0.0	0.071	False	False	0.00/1	0.00/7	0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/4	0.00/2	0.00/4	0.25/4
29212163	A	G	True	1		0.0	0.083	False	False	0.00/1	0.00/7	0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/4	0.00/2	0.25/4	0.00/2
29212191	T	C	True	1		0.111	0.0	False	False	0.00/1	0.25/4	0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/4	0.00/2	0.00/6	0.00/2
29212194	C	G	True	0		0.25	0.0	False	False		0.33/3		0.00/1		0.00/2	0.00/1	0.00/1	0.00/1
29212202	C	T	True	0		0.0	0.4	False	True		0.00/3		0.00/1		0.50/2	0.00/1	0.00/1	1.00/1
29212413	T	G	True	2	0.25	0.0	0.35	False	False	0.25/4	0.00/8	0.00/8	0.00/2	0.00/6	0.00/2	0.33/3	0.00/8	0.86/7
29212435	A	G	True	1	0.0	0.0	0.048	False	False	0.00/4	0.00/8	0.00/6	0.00/2	0.00/7	0.00/2	0.25/4	0.00/8	0.00/7
29212458	C	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/3	0.00/2	0.00/3		0.00/4	0.00/4	0.00/2
29212485	C	A	True	1	1.0	0.0	0.3	False	False	1.00/4	0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.00/3	0.00/2	0.67/3	0.00/4	1.00/1
29212492	A	T	True	2	0.857	0.0	0.294	False	False	0.86/7	0.00/7	0.00/5	0.00/4	0.00/9	0.00/5	0.50/4	0.00/5	1.00/3
29212590	G	A	True	0		0.0	0.333	False	True	1.00/1	0.00/2	0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.00/2	0.33/3	0.00/2	1.00/2
29212592	A	G	True	1	0.125	0.0	0.107	False	False	0.12/8	0.00/8	0.00/8	0.00/6	0.00/9	0.00/6	0.10/10	0.00/7	0.40/5
29212597	A	G	True	1	0.0	0.065	0.0	False	False	0.00/10	0.00/7	0.00/8	0.29/7	0.00/9	0.00/7	0.00/10	0.00/7	0.00/5
29212617	G	T	True	1		0.091	0.0	False	False	0.00/2	0.00/2	0.25/4	0.00/4	0.00/1	0.00/2	0.00/3	0.00/3	0.00/6
29212766	G	C	True	1		0.0	0.286	False	False	0.50/2	0.00/6	0.00/4	0.00/4	0.00/6	0.00/2		0.00/1	0.50/4
29212789	C	T	True	0		0.0	0.25	False	True	1.00/3	0.00/4	0.00/2	0.00/2		0.50/2	0.50/2	0.00/4	
29212797	C	A	True	0		0.0	0.25	False	False	1.00/3	0.00/4	0.00/2	0.00/2		0.50/2	0.50/2	0.00/4	
29212805	G	T	True	0		0.0	0.5	False	False	1.00/2	0.00/5	0.00/3	0.00/3	0.00/5	0.00/2	0.00/1		1.00/3
29212828	G	C	True	1		0.067	0.0	False	False	0.00/3	0.00/6	0.00/2	0.00/3	0.25/4	0.00/1	0.00/1		0.00/2
29212829	A	T	True	1	0.0	0.048	0.0	False	False	0.00/6	0.00/10	0.00/2	0.00/5	0.25/4	0.00/4	0.00/4	0.00/4	0.00/2
29212830	T	C	True	1	0.0	0.0	0.071	False	False	0.00/6	0.00/10	0.00/2	0.00/6	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/4	0.00/2
29212831	T	C	True	1	0.0	0.0	0.071	False	False	0.00/6	0.00/10	0.00/2	0.00/6	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/4	0.00/2
29212851	C	G	True	1		0.0	0.091	False	False	0.00/2	0.00/3		0.00/2	0.00/1	0.25/4	0.00/4	0.00/3	
29212871	T	C	True	1	0.0	0.0	0.056	False	False	0.00/4	0.00/7	0.00/2	0.00/5	0.00/2	0.00/5	0.00/6	0.25/4	0.00/3
29212874	C	A	True	2		0.0	0.286	False	False	1.00/2	0.00/3		0.00/2	0.00/1	0.25/4	0.40/5	0.00/4	1.00/1
29212933	G	A	True	0		0.0	1.0	False	True	1.00/3	0.00/5	0.00/3	0.00/4	0.00/1	1.00/1	1.00/1		1.00/2
29212944	C	A	True	1		0.111	0.071	False	False	0.00/2		0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.00/5	0.00/4	0.33/3	0.00/2
29212948	T	G	True	1	0.0	0.0	0.048	False	False	0.00/5	0.00/5	0.00/8	0.00/8	0.00/4	0.00/6	0.00/6	0.25/4	0.00/5
29212949	T	A	True	1	0.0	0.0	0.048	False	False	0.00/5	0.00/4	0.00/8	0.00/8	0.00/4	0.00/6	0.00/6	0.25/4	0.00/5
29212976	T	C	True	4	0.4	0.0	0.28	False	False	0.40/5	0.00/7	0.00/9	0.00/7	0.00/4	0.38/8	0.33/6	0.00/6	0.40/5